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23 févier 2007
Myodoc
Réunion réseau doc/Evry/13-02-2007
Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Le contexte :
L’AFM
Présentation rapide du service documentation, Myodoc La base de données Myobase
Historique
Contenu
Les interfaces web
Les perspectives
23 févier 2007
Myodoc
Réunion réseau doc/Evry/13-02-2007
Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Le contexte :
L’AFM : missions
http://www.afm-france.org• aider :
– médecine : amélioration diagnostic, prise en charge médicale efficace (70 consultations MNM)
– vie autonome : aides techniques innovantes, aides humaines
– Vie sociale : rompre isolement, aide aux projets de vie• guérir :
– recherche étendue à l’ensemble des maladies génétiques rares
» Développement de thérapies : génique, cellulaire, pharmacologie
» Comprendre l’origine des maladies génétiques» Mieux comprendre le fonctionnement du muscle
23 févier 2007
Myodoc
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Le contexte :
Généthon : http://www.genethon.fr
Thérapie génique, vecteurs, essais cliniques• 2004, GenoSafe : sécurité des produits de transfert de
gènes (vecteurs) – aide porteur de projet th. génique
L’AIM (Institut de Myologie, créé par l’AFM en 1997)
http://www.institut-myologie.org• la recherche fondamentale et clinique• la prise en charge médicale, avec une consultation
pluridisciplinaire sur les maladies neuromusculaires• l'enseignement de la myologie.
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Myodoc
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Myodoc : service documentation de l’AFM 2 sites
Evry : service documentation interne• Réseau AFM
– siège Evry : salariés – en région : services régionaux, délégations,
coordinations
Paris AIM : bibliothèque ouverte au public– malades et leur famille– médecins du centre de référence, chercheurs,
psychologues– étudiants des DU accompagnement des personnes
atteintes de maladies génétiques et de leur famille, DIU myologie
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Les missions de Myodoc
Collecter, traiter et diffuser la documentation sur la myologie • Les maladies neuromusculaires
– Clinique, diagnostic, prise en charge, recherches médicale et scientifique, génétique, thérapeutique
• Tout ce qui a trait aux problèmes du handicap moteur• Rééducation, intégration, droit, aides techniques• La psychologie des maladies neuromusculaires et
génétiques • La bioéthique • L’étude du muscle sain
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Myodoc
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Bref historique
Service documentation créé en 1988• Banque de données interne littérature et images
– dBase III au début– Archis Doc, repris par Alexandrie en 1994
• Thésaurus créé en 1996 à partir de celui de Medline• Base de données interne -> 2003• Mise en ligne de Myobase :
– sur intranet : 2003– sur ToutAFM : oct. 2004, version définitive mai
2005– sur le site internet IDM : sept 2006
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Acquisition des documents : près de 30 000
Dépouillement de toutes les revues (centrale d’achats – 120 abonnements)
Veille bibliographique scientifique à partir de base de données extérieures
(Pubmed)• « Profil » maladies neuromusculaires • Choix articles avec équipe Myoinfo• Bibliographies ponctuelles
Veille internet : législation, rapports…
-> 180 documents nouveaux par mois
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Contenu de Myobase : tout le fonds documentaire
Références bibliographiques : • Résumés :
– livres, thèses récentes, sélection d’articles généraux, « brèves » des articles scientifiques
• Texte intégral (module GEIDE)– Publications libres de droit : publications AFM,
rapports publiques, textes de loi
• Liens vers des page web– Ex : lien vers le résumé pubmed– Ex : lien vers le texte des articles du VLM (droits
d’auteur)
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Thésaurus
Refonte depuis mars 2006• Plus de 6 000 termes• Santé, biologie terminées
– Encore 4 mois de travail : social, psychologie…• But : mise en ligne – spécifique maladies
neuromusculaires, mais incomplet dans autres domaines
• démonstration
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Critères d’accessibilité des documents sur internet
Limites techniques : • niveau autorisation 0• Choix des types de documents
– Différents sur ToutAFM (intranet) et sur myobase.org (internet)
Limites loi pour le texte intégral (GEIDE)• Droits d’auteurs
– Ex : lien vers résumés pubmeb (articles scientifiques)
– Ex : liens vers textes des articles du VLM sur le site AFM (droits auteur journalistes)
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Développement informatique
Interface Web développée en partie en interne, et surtout par GB Concept
2 versions : • ToutAFM : charte graphique de l’intranet
• Myobase.org : – charte graphique du site de l’Institut de Myologie– Nom de domaine myobase.org, .fr, .net, .com
• Perspectives : Version 6 d’alexandrie– Développement à refaire– Charte propre à myobase
• Synchronisation entre le serveur Alexandrie et le serveur web : difficultés de mise en place, contrôle
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Myobase toutAFM (intranet)
Mise en ligne version définitive : mai 2005
Formation de tous les services régionaux (25) et des salariés du siège
Tout le fonds documentaire est accessible et ouvert à l’emprunt à tout le
réseau AFM : – Sauf fonds ancien (8 000 articles, livres…) à trier et
indexer– Sauf documents confidentiels (niveau
d’autorisation>0 –> mot de passe)» Ex : CR de réunions : que pour les participants
(en cours)
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Myobase.org
En ligne depuis septembre 2006
Accessible à tous sans mot de passe
AFM ne fournit pas les documents• Documents cités
– se trouvent dans bibliothèque universitaire– en texte intégral : publications AFM, rapports
publiques, textes de loi– liens vers internet quand possible
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Spécificité du contenu de Myobase
Articles scientifiques, livres : saisie et indexation à jour
Législation : textes de loi, réponses à des questions par les juristes AFM
Littérature grise : • Thèses• Rapports publics• Compte rendu de colloques
– Abstracts de toutes les communications de myologie 2005 (AFM)
– Compte rendu rédigés par scientifiques AFM
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
La recherche dans Myobase
• Recherche simple sur tous les champs– FSH– Fsh & thérapie génique
• Recherche avancée : choix du champ, des limites• Sauvegarde : le panier• Affiner la recherche• Visualisation
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Statistiques d’utilisation : xiti
Nombre de pages vues
Nombre de visites
Nombre de visiteurs
Origine des visites
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Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie
Perspectives
Techniques • prochaine version alexandrie V6
– Nouvelle charte graphique propre à Myobase
– Facilité de saisie : exportation des références de pubmed
– Fils RSS, alertes…
Promotion• Communication dans revues, listes de diffusion,
présentation, stands colloques…
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