BASI MOLECOLARI DELLA PATOLOGIA PROGNOSI...

BASI MOLECOLARI DELLA PATOLOGIA

PROGNOSI

COUNSELING GENETICO

CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE

DNA PROTEINE

Met Val Trp Ala Phe Lue Phe Cys Gly Gln Glu Trp ……..

SEQUENZIAMENTO DIRETTO DNA

ACGTGTGCGTCGACTGCTAAAAACTGACTGATTCGAGTACTGTGTCATCGTATATAGGGGGAGA

GENE

X

X X

Difetti del metabolismo eritrocitario

Difetti di membrana del globulo rosso

PNH

Malattie mieloproliferative

Anemie diseritropoietiche congenite

Esochinasi

Glcosio fosfato isomerasi

Fosfofrutto chinasi

Aldolasi

Triosofosfato isomerasi

Gliceraldeide fosfato isomerasi Gliceraldeide 3 fosfato isomerasi

Fosfoglicerato chinasi

Fosfoglicerato mutasi

Enolasi

Piruvato chinasi

GLICOLISI

30 (1)

500 (125)

20

40 (6)

30 (1)

40 (6)

Paris, 02-02- 2012

82 1

1

2

13

11

1 1 1

Direct/recent contacts

8

Caratterizzazione molecolare deficit di piruvato chinasi eritrocitaria

PKLR

Zanella et al , 2007

Wang et al, 2001; Valentini et al, 2002 Zanella et al , 2007

Correlazione genotipo fenotipo

Diagnosi prenatale: deficit di trioso fosfato isomerasi

Fermo et al, 2011

InsG cod 10/Glu104Asp 2008

Phe240Ser/wt 2012

Glu104Asp/wt 2009

Gene responsabile della CDAII

1997

CDAN2

locus

candidate genes

exclusion

2008

RBC

Preoteome

Mycro array

SNPs

2009

SEC23B

Crom 20

Hb

98%

Proteoma «nascosto» (Low-abundance proteome)

2008 -Studio del proteoma del globulo rosso

N° spots: 950 (640 g) N° spots: 80 (1300 g)

Untreated

Proteomica del globulo rosso

1578 proteine identificate

unknown

other tissues

apoptosis

ion binding

cell cycle

cytokine/immunity

cytoskeleton

DNA/RNA

Golgi

Hemoglobin

erythroid precursors

metabolism

intracell transports

oxidative stress

1578 proteine identificate

Metabolism

Intracellular transports

DNA/RNA Cytoskeleton

Cytokine/Immunity

Golgi

20pter-q12 eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 b

20cen-q13.1 S-adenosylhomocysteine hydrolase

20q11.22 acyl-CoA synthetase short-chain family member 2

20q11.2 glutathione synthetase

20q12 eukaryotic translation initiation factor 6

20q11.22 copine I

20q11.2-q12 erythrocyte membrane protein band 4.1-like 1

20q11.21-q12 chromosome 20 open reading frame 77

20q12 transglutaminase 2 (C polypeptide,

protein-glutamine-gamma-glutamyltransferase)

20q11.22 Chromatin modifying protein 4B

20q11.1-q11.23 Microtubule-associated protein, RP/EB family,

20q11.21 BCL2-like 1

20p11.21 GINS complex subunit 1 (Psf1 homolog)

20p11.23 N-acetyltransferase 5

20p11.23 D-tyrosyl-tRNA deacylase 1 homolog (S. cerevisiae)

20p11.23 Sec23 homolog B (S. cerevisiae) SEC23B

DTD1

NAT5

GINS1

BCL2L1

MAPRE1

CHMP4B

EIF2S2

AHCY

ACSS2

GSS

EIF6

CPNE1

EPB41L1

C20orf77

TGM2

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

Arg14Trp Glu109Lys Arg497Cys Ser603Leu Arg701Cys Asp348Ala

Arg554STOP

c.1821delT c.428A>CG

Arg190STOP

IVS6+1 g>a

Arg217STOP

SEC23B: CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE CDAII

Bianchi et al, 2009

UNIVERSITA’ PAVIA

UNIVERSITA’

DI ULM

UNIVERSITA’ DI UTRECHT

UNIVERSITA’ DI BRISTOL

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New York

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2013-2016

Progetto europeo

2013-2016

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