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如何使用SciFinder获取医药信息
--文献部分
中国药科大学
2018.06.07
ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute
朱传娴
客户顾问
hzhu@acs-i.org
ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 2
提纲
• 美国化学文摘社及SciFinder简介
• SciFinder中的文献检索
• 文献检索案例分析
• 文献检索上机练习
ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 3
美国化学文摘社—Chemical Abstracts Service
•ACS的分支机构
•创建于1907年,简称”CAS”
•最早创立了《化学文摘》
•密切关注,索引和提炼着全球化学相关的文献和专利
•总部座落于俄亥俄州的哥伦布市
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CAS——构建最高质量的化学数据库
CAS Scientists
Patents, journals,
web, catalogs, etc.
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CAS——构建最高质量的化学数据库
CHEMLIST>34.6万个化学管制品
目录15个国际和国家目录
CHEMCATS
>1.02亿商用化学品>3300万独特的物质>660 个全球化学品供应商>750 化学品目录
CAS REGISTRY>1.18亿个独特物质
>6600百万个基因序列>68亿条物质属性值
CASREACT>7660万条单步多步反
应>1400万条合成制备信
息
MARPAT>113万代表有机或者
金属有机的马库什结构
CAplus>4300万篇杂志,专利,
论文等63家专利授权机构的专
利 CIN化学工业札记>170万条记录,包
括:摘要;题录;CAS 号;化学名
CAS数据库——源于化学,超越化学
生物化学:农化产品管控信息,生化遗传学,发酵,免疫化学,药理学
有机化学各领域:氨基酸,生物分子,碳水化合物,有机金属化合物,类固醇
大分子化学各领域:纤维素、木质素、造纸;涂料、墨水染料、有机颜料 ;合成橡胶 ;纺织品、纤维
应用化学各领域 :大气污染,陶瓷,精油、化妆品,化石燃料,黑色金属、合金
物理、无机、分析化学各领域:表面化学,催化剂,相平衡,核现象,电化学
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Tips:1. 98%以上的文献,都经过人工索引2. 用Index Term标引文献中的重要技术术语3. 用CAS RN标引出文献中的重要物质4. 用CAS Role标引文献中重要物质的研究领域
CAS数据库最具价值的内容——人工索引
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CAS人工标引解决的问题
检索词的同义词拓展:解决不同科研人员由于教育背景、语言、表达
习惯不同导致的对同一个技术术语描述的差异。
用名称、分子式等检索化合物,会导致检索不全、不准的问题。CAS
RN很好的解决了该问题,帮助检索人员实现精准定位化合物的目标。
利用SciFinder中的标引信息(Index Term,CAS RN,CAS Role),
提高效率,启发思路。
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SciFinder覆盖的数据库
CHEMLIST>34.6万个化学管制品
目录15个国际和国家目录
CHEMCATS
>1.02亿商用化学品>3300万独特的物质>660 个全球化学品供应商>750 化学品目录
CAS REGISTRY>1.18亿个独特物质
>6600百万个基因序列>68亿条物质属性值
CASREACT>7660万条单步多步反
应>1400万条合成制备信
息
MARPAT>113万代表有机或者
金属有机的马库什结构
CAplus>4300万篇杂志,专利,
论文等63家专利授权机构的专
利Medline
>2200万篇生命科学尤
其是生物医学方面的期刊文献
>5600种期刊文献
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SciFinder登录网址: https://scifinder.cas.org/
输入SciFinder帐号和密码
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SciFinder主界面
工具栏
检索入口
检索完,请点击退出
已保存的结果集
定题追踪
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提纲
• 美国化学文摘社及SciFinder简介
• SciFinder中的文献检索
• 文献检索案例分析
• 文献检索上机练习
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SciFinder检索——文献检索
文献检索方法– 主题检索
– 作者名检索
– 机构名检索
– 文献标识符检索
– 期刊名称和专利信息(公开号,申请号等)
– 从物质,反应获得文献
检索策略推荐– 关注某特定领域的文献:主题检索
– 关注物质有关的文献:先获得物质,再获得文献
– 关注某科研人员的文献:作者名检索
– 关注某机构科研进展:机构名检索
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文献检索——主题
主题检索: 纳米技术在癌症免疫疗法中的应用
检索式:nano with Immunotherapy of cancer
关键词之间用介词连接:in, with, of...
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主题检索的候选项
“Concepts”表示对主题词做了同义词的扩展;
“Closely associated with one another”表示同时出现在一个句子中;
“were present anywhere in the reference”表示同时出现在一篇文献中;
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按被引次数排序— Citing References
Citing Reference: 帮助找到最重要的文献
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文献检索结果
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文献分析工具
获取原文
SciFinder提供强大的文献处理工具,帮助处理文献
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文献检索结果的Analyze
本领域研究人员本领域研究机构、
合作伙伴、竞争对手 期刊 涉及学科领域
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文献检索结果的AnalyzeIndex Term:
帮助用户了解涉及到的重要技术术语,并修正检索词
选择感兴趣的内容,点击Apply
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文献检索结果的Analyze
Publication Year: 分析领域发展趋势
0
20
40
60
80
100
120
140
160
180
1999 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 2018
文献数量
ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 21
文献检索结果的Refine
Refine:帮助用户迅速获得需要的文献
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文献检索结果的Categorize
Categorize学科分类功能,基于Index Term,根据大学科方向对文献进行自动分类。
学科领域主分类
学科领域副分类
Index Term 选中的Index Term
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结果集的保存— Save, Print, Export
Citation manager: 保存成RIS等格式,可导入
EndNote 等文献管理工具
Offline Review:保存成PDF,RTF等格式,
用于脱机浏览
Save:保存在服务器上,方便以
后登陆查看,每次可存1万条记录。
Export:导出至本地电脑。
Print:打印成PDF格式文献详细信息
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文献信息—题录、摘要、索引
ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute
重要概念 重要物质
文献详情界面包括:1. 标题2. 摘要3. 文献中重要的技术术语4. 文献中重要的物质5. 书目信息6. 获得文献中的物质,反应7. 参考文献8. 链接原文
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文献检索小结
主题检索时,使用介词 in, with, of 等作为连接词
跟据检索要求选择合适的候选项
通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围
尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用,会有更多的收益
使用Categorize可以让系统来实现自动分类
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提纲
• 美国化学文摘社及SciFinder简介
• SciFinder中的文献检索
• 文献检索案例分析
• 文献检索上机练习
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主题检索:阿奇霉素的结构修饰
检索式: Modification of Azithromycin
关键词之间用介词连接:in, with, of...
浏览结果集发现关键词
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获得检索结果集之后首先要随机浏览记录,判断是否是相关文献、是否符合检索要求、是否有更好的关键词,如有必要需要调整检索式
Save:保存结果集于服务器上,方便随时查看浏览结果集发现关键词
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获得重要相关词,可再次检索
浏览结果集发现关键词
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浏览结果集发现关键词
ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 31
文献分析工具
获得全面的结果集是做好文献调研的首要条件SciFinder提供强大的文献处理工具,帮助处理文献
浏览结果集发现关键词
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利用Inder Term选词
主题检索:植物中天然活性成分的抗癌研究
检索式: Natural Active Component with Anti Cancer
关键词之间用介词连接:in, with, of...
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“Concepts”表示对主题词做了同义词的扩展;
“Closely associated with one another”表示同时出现在一个句子中;
“were present anywhere in the reference”表示同时出现在一篇文献中;
主题检索的候选项
只有153篇吗?
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利用Index Term选词
文献分析工具
ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 35
利用Index Term选词
Index Term基于内容的分析工具,发现natural products, Pharmaceutical 这个和天然活性成分很相关的词
是否用这个词去检索,效果会更好?
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利用Index Term选词
新的检索式:
Natural Product with anti cancer
更换检索词后,结果放大近70倍
灵活运用Analyze与Categorize
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经常遇到的问题:
1. 如何检索药物的剂型方面的文献?
2. 如何获得药物药代动力学方面的文献?
3. 如何获得药物药理学相关的文献?
4. 如何获得药物分析方面的文献?
……
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灵活运用Analyze与Categorize
有哪些分析阿莫西林组份的方法?Amoxicillin
物质标示符包括CAS RN.和化学名称。化学名称可以是通用名称、商品名、俗名
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灵活运用Analyze与Categorize
毒理副作用
药分
药物晶形
由物质信息获得特定或全部文献,
然后在文献结果集中筛选相关研
究领域的文献
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灵活运用Analyze与Categorize
如何准确获得分析阿莫西林成分的文献?
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灵活运用Analyze与Categorize
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灵活运用Analyze与Categorize
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STN中的CAS Role
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STN中的CAS Role
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巧用CAS Role
查找纯化双氧水(7722-84-1)的文献
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巧用CAS Role
噪音信息
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巧用CAS Role
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巧用CAS Role
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巧用CAS Role
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巧用CAS Role
浏览记录,判断是否符合要求
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巧用CAS Role
都是需要的文献
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善用Categorize
检索文献:
1. 去除N-甲基甲酰胺(123-39-7)的文献?
2. 用N-甲基甲酰胺(123-39-7)作洗脱剂的文献?
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善用Categorize
去除N-甲基甲酰胺(123-39-7)
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善用Categorize
需要的文献
55
善用Categorize
噪音信息更多,如何去除?
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善用Categorize
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善用Categorize
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避免标引时差引起的漏检
对核心期刊及核心专利机构发布的专利的标引在2-3周内完成
9大核心专利机构发布的专利2日内收录进SciFinder
核心期刊的文献7日内收录进SciFinder
在收录至标引期间的文献可能会漏检!
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避免标引时差引起的漏检
检索治疗肝病的药物Daclatasvir的相关文献
通过检索物质获得文献准确,但是不够新
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避免标引时差引起的漏检
通过主题直接检索物质名称,发现最新的文献
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避免标引时差引起的漏检
通过PY限定最新的文献,与通过物质检索获得的结果集合并
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避免标引时差引起的漏检
标引未完成
目标物质未做重点研究
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中药的检索
从主题检索:中药的拉丁学名和中文名都要检
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中药的检索
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提纲
• 美国化学文摘社及SciFinder简介
• SciFinder中的文献检索
• 文献检索案例分析
• 文献检索上机练习
检索“多功能载药蛋白纳米粒”的文献。被引次数最高的文献来自哪
份期刊?发文最多的研究机构是哪家?该研究领域专利多还是期刊
多?在中国发文最多的机构是哪一家?其中研究紫杉醇(paclitaxel)
的有多少文献?
检索阿莫西林有哪些剂型?
检索中药五味子的相关文献。找出分析五味子素( Schisandrin)的
相关文献
检索你导师发表的文章,并判断他的主要研究方向。
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文献检索练习
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美国化学文摘社北京代表处
010-62508026
china@acs-i.org
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