View
218
Download
0
Category
Preview:
Citation preview
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
1/46
Facultad de Ciencias Qumicas
Universidad Autnoma de Coahuila
Microbiologa Molecular
del Medio Ambiente
Jos Gerardo Gaona Lozano
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
2/46
Microbiologa
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
3/46
100 m
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
4/46
20 m
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
5/46
0.5 m
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
6/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
7/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
8/46
Medio Ambiente
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
9/46
Prestige
Exxon - Valdez
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
10/46
Procesos fsicos, qumicos y biolgicos que actuansobre el destino ambiental de una marea negra
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
11/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
12/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
13/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
14/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
15/46
ME. Transmisin ME. Barrido Tincin Gram (-)
Pseudomonas sp
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
16/46
Pseudomonas sp
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
17/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
18/46
Toluene 2-hydroxy Toluene 3-methyl cathecol
cis,cis-2-Hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate
cis-2-Hydroxypenta-2,4-dienoate
4-Hydroxy-2-oxo-
valerate
Acetaldehyde + Pyruvate
Toluene 2-monooxygenase
Catechol | 2,3-dioxygenase
cis,cis-2-hydroxy- 6-oxohepta-2,4-dienoate |hydrolase
4-hydroxy-2-oxo-valerate aldolase
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
19/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
20/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
21/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
22/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
23/46
Cdigo Gentico
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
24/46
Dogma central
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
25/46
+ / -
algU mucA mucB mucC mucD
alg8algD alg44 algK algJ algG algF algAalgX algL algI algV
WE
WS
gacS
GacSGacS
GacAalgR
algC
Anti-WE
?
Genes estructurales y reguladores.
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
26/46
Secuencia del Genoma Microbiano
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
27/46
Target gene
NahAc
phnAc, nahAc, andglutathione-S-transferase
Phenol hydroxylase(LmPH)
RHD
PAH dioxygenase
nahAc
nahAc
nah
tfdC
PAH dioxygenaseand catechol dioxygenase
phnAc, nahAcandPAH dioxygenase
RHD
RT-PCR with degenerateprimers
PCR with several primers
PCR-DGGE withdegenerate primers
PCR with degenerateprimers
PCR with several primers
PCR with degenerateprimers
PCR with degenerateprimers
PCR with degenerateprimers
PCR with degenerate
primers
PCR with degenerateprimers
PCR with severaldegenerate primers
PCR- DGGE with
degenerate primers
Soil samples(culture-independent)
Activated sludge(culture-independent)
Prestine- and aromatichydrocarbon-contaminatedsoils (culture-independent)PAH soil bacteria(culture-dependent)
Marine sediment bacteria(culture-dependent)
Marine sediment bacteria(culture-dependent)
Soil bacteria(culture-dependent)
Soil bacteria
(culture-dependent)
Wastewater andsoil bacteria(culture-dependent)
River water, sediment,and soil bacteria(culture-dependent)
Rhodococus sp.S
train RHA1(culture-dependent)
Groundwater(culture-independent)
Wilson et al. 1999
Llyod-Jones et al. 1999
Watanabe et al. 1998
Yeates et al. 2000
Llyod-Jones et al.1999
Allison et al. 1998
Hedlund et al. 1999
Hamann et al. 1999
Cavalca et al. 1999
Meyer et al. 1999
Widada et al. 2002a
Kitagawa et al. 2001
Molecular approach Source Reference
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
28/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
29/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
30/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
31/46
Biologa Molecular del Gen
Bioinformtica
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
32/46
Primer (5-ATGCTGACCGGCAGCCACAATCCG- 3)
Primer R (5-CAGGGGAGTGG
TGTTGGAGGCGCG- 3)
regiones conservadas de protenas nahAc
DNAPCR
975 pb
(nahAc)
Amplificacin del gen nahAc
P. putida
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
33/46
Desnaturalizacin Hibridacin (primers) Extensin (sntesis DNA)
REACCINEN CADENA DE LA POLIMERASA (PCR)REACCINEN CADENA DE LA POLIMERASA (PCR)
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
34/46
Amplificacin de ADNAmplificacin de ADN
Reaccin de la polimerasa en cadena (PCR)Reaccin de la polimerasa en cadena (PCR)
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
35/46
Termociclador para PCRTermociclador para PCR
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
36/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
37/46
Secuenciador de ADN
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
38/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
39/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
40/46
BLAST
Basic Local Alignment Search Tool
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
41/46
Alineamiento de Secuencias
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
42/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
43/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
44/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
45/46
8/8/2019 Microbiologia Molecular Del Medio Ambiente
46/46
Recommended