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Universidades de Alcalá, Complutense y S. Pablo-CEUDoctorado en Química Médica
DISEÑO DE FÁRMACOS
Beatriz de Pascual-Teresa
Programa de Doctorado: Química MédicaUSP-CEU
Programa de doctorado verificado por la ANECA conforme al RD
1393/2007 y resuelto favorablemente por el consejo de coordinación
universitaria en su sesión de 6 de Julio de 2009.
Denominación de las materias (todas de 6 ECTS):Química Médica Avanzada (UCM)
DiseDiseñño de Fo de Fáármacos (CEU)rmacos (CEU)Metodologías químicas en el descubrimiento de nuevos fármacos (UA)
MetodologMetodologíías para la determinacias para la determinacióón estructural de fn estructural de fáármacos y el estudio rmacos y el estudio de fende fenóómenos de reconocimiento molecular (CEUmenos de reconocimiento molecular (CEU--CIB)CIB)
Estrategias en síntesis de fármacos (UA-IQO)Síntesis de fármacos heterocíclicos (UCM)
Aspectos químicos y tecnológicos del desarrollo de los fármacos (UA-CEU)
Programa adherido al Paul Ehrlich European PhD in Medicinal ChemistryLabel to PhD Graduates in Medicinal Chemistry.
www.MedChem Euro-PhD.net
AL DISEÑO RACIONAL DE FÁRMACOS
DEL DESCUBRIMIENTO CASUAL
Objetivos: Diseño de Fármacos
Suministrar al alumno las bases químicas para el diseño racional de fármacos mediante la utilización de
técnicas computacionales.
USP-CEU
Química Computacional, Diseño de Fármacos:
Molecular Modeling, Modelado molecular, Modelización molecular.
CADD (Computer Aided Drug Design)[Quimioinformatica, Bioinformática]
PrácticasTeoría
USP-CEU
CompetenciasUSP-CEU
• Conocer las bases químicas teóricas para el diseño racional de fármacos
mediante la utilización de técnicas computacionales.
• Ser capaz de poner en práctica algunos de los conocimientos adquiridos
a través de la realización de talleres.
• Ser capaz de seleccionar las diferentes técnicas y metodologías
empleadas más frecuentemente en el diseño de fármacos, dependiendo
del sistema objeto de estudio.
Programa de Clases Teóricas y PrácticasUSP-CEU
Hora Lunes, 9 de Mayo Martes, 10 de Mayo Miércoles, 11 de Mayo Jueves, 12 de Mayo Viernes, 13 de Mayo
9:00B. Pascual-Teresa
(USP-CEU)Introducción
B. Pascual-TeresaDiseño de FármacosB. Pascual-Teresa
Diseño de Fármacos S. Martín-Santamaría
QM/MM
F. J. González (U. Oviedo)Química Cuántica
Aula 014
F. J. González (U. Oviedo)Química Cuántica
Aula 011
10:00 B. Pascual-TeresaDiseño de Fármacos
11:00
S. Martín-Santamaría (USP-CEU)
Modelado de Proteínas (I)
B. Pascual-TeresaPrácticas (PDB,
PoseView DrugBank, Molinspiration)
12:00 Pausa Pausa Pausa Pausa Pausa
12:30S. Martín-Santamaría
Modelado de Proteínas (II)
A. Ramos (USP-CEU)REA Danièle Altschuh
(CNRS)“The binding
modes of sequence-based peptido-mimetics: real or imaginary
mimicry?“
F. J. González (U. Oviedo)Prácticas Gaussian
Aula AF. J. González (U. Oviedo)
Química CuánticaAula 011
13:30S. Martín-Santamaría
Prácticas (formatos xyz, mol, smiles y PDB)
A. Ramos“MMP-2 y el Receptor
de Estrógenos: dos dianas para el diseño de nuevos agentes
antitumorales”
F. J. González (U. Oviedo)Prácticas Gaussian
Aula A
F. J. González (U. Oviedo)Prácticas Gaussian
Aula A
Teoría Aula 103 A Prácticas Aula 101, 014, 011 y Aulas A y B
Programa de Clases Teóricas y PrácticasUSP-CEU
Teoría Aula 103 A Prácticas Aula 004
Hora Lunes, 16 de Mayo Martes,17 de Mayo Miércoles, 18 de Mayo Jueves, 19 de Mayo Viernes, 20 de Mayo
9:009:30-11:00- M.
Martín (IQM-CSIC)“Aminoácidos no proteinogénicos
como inductores de giros inversos”
Case Study Janssen(Toledo)
10:00
Conferencia Glaxo
(Tres Cantos)
10:30-12:30- M. Pastor (UPF)
ADME-Tox11:00-12:00- A.
Morreale (CBM-CSIC)Virtual Screening
Aula 01111:00
A. Ramos“MMP-2 y el Receptor de
Estrógenos: dos dianas para el
diseño de nuevos agentes
antitumorales”
12:00 Pausa Pausa Pausa Pausa Pausa
12:30 a
14:30
Visita Glaxo(Tres Cantos)
A. Gradillas (USP-CEU)“Caso: Gleevec”
Visita Janssen(Toledo)
12:45-14:45-C. Pérez Martínez (Lilly)
Docking
12:30-14:00- A. Morreale (CBM-CSIC)
Virtual Screening (taller)Aula B
ContenidosUSP-CEU
Propiedades de los productos drug-like. Relación estructura-actividad.
Química Computacional. Mecánica molecular. Métodos semiempíricos.
Métodos ab initio. Cálculos DFT.
Análisis conformacional. Dinámica molecular.
Diseño de fármacos basado en la estructura.
Diseño de fármacos basado en el ligando.
QSAR-3D. Identificación de farmacóforos.
Modelado de proteínas. Modelado de ácidos nucleicos.
Predicción de estructura.
Docking. Screening virtual. Diseño de novo.
Programa de clases prácticas
Prácticas 1 y 2. Visualización 3D, manipulación de complejos fármaco-receptor,
construcción y modelado de ligandos y receptores:
PDB, DrugBank, Molinspiration, Rasmol, Chime, Sybyl,
ChemSketch, Corina, Moviemaker, etc.
Práctica 3. Estudio ab initio de un proceso enzimático: Gaussian, Gaussview
Prácticas 4. Diseño de Fármacos Basado en la estructura. Docking
USP-CEU
Profesores participantes de la USP-CEU
Dra. Beatriz de Pascual-Teresa
Catedrática
Departamento de Química.
Diseño de Fármacos, ADME-Tox y practicas
Dra. Sonsoles Martín Santamaría.
Profesora Adjunta.
Departamento de Química.
Modelado de proteínas. QSAR-3D y prácticas
Dra. Ana Ramos González.
Catedrática
Departamento de Química
Relación Estructura Actividad y seminario
Dra. Ana Gradillas Nicolás
Profesora Adjunta
Departamento de Química
Caso
USP-CEU
Dr. Javier González Fernández. Profesor Titular. Departamento de Química. Universidad de Oviedo.
Química Computacional. Prácticas.
Dr. Carlos Pérez Martínez. Computational Drug Discovery (DCRT). Eli Lilly and Company
Docking en el diseño de fármacos (Glide). Prácticas.
Dra. Danièle Altschuh. CNRS(France)
Surface Plasmon Resonance and applications
Dr. Manuel Pastor. Universidad Pompeu Fabra
“ADME-Tox”
Dra. Mercedes Martín. IQM-CSIC
“Aminoácidos no proteinogénicos como inductores de giros inversos”
Dr. A. Morreale. CMB (CSIC)
“Virtual Screening”
Dr. M. Cacho. Glaxo
Visita
Dr. J. Fernández Gadea. Janssen
Visita
USP-CEUProfesores participantes de otras instituciones
Bibliografía general
Andrew R. Leach, Molecular Modelling, Principles and Applications, 2nd Edition, Pearson,
Prentice Hall, 2001.
Grant, G.H.; Richards, W.G.; Computational Chemistry. Oxford University Press, 1996
U. Burkert and N.L. Allinger, Molecular Mechanics, ACS Monograph 177. Washington D.C.,
American Chemical Society, 1982.
P. R. Schleyer and P. R. Schreiner. Eds. Encyclopedia of Computational Chemistry. Wiley,
1998
Kenny B. Lipkowitz and Donald B. Boyd. Eds. Reviews in Computational Chemistry. Wiley.
1996
Hugo Kubinyi, Gerhard Müller. Chemogenomics In Drug Discovery: A Medicinal Chemistry
Perspective, Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2004
Dr. David C. Young Computational Drug Design Wiley interscience 25 Feb 2009. Print ISBN:
9780470126851
USP-CEU
JOIN US!Apply to the SEQT-sponsored grants before April7thhttp://www.seqt.org/englinf/grants.asp
Young Researchers Searched for the Second SEQT –Janssen Summer SchoolEFMC Sponsored
Promoting education and research training of PhD students in Medicinal Chemistry.
In this congress PhD students are encouraged to present their research and interact within the multidisciplinary field of Pharmaceutical Sciences, and foster professional and personal networks throughout Europe.
1st Meeting of the Paul Ehrlich MedChem Euro-PhD Network 7th Meeting of the European Network of Doctoral Studies in Pharmaceutical Sciences
Deadlines:- Communications and registration: 22nd April, 2011.- More information: paul.ehrlich@ceu.ess; bpaster@ceu.es
1st Meeting of the Paul Ehrlich MedChem Euro-PhD Network 7th Meeting of the European Network of Doctoral Studies in Pharmaceutical Sciences
COLEGIO MAYOR SAN PABLO CEU
“De un doctor bien formado, lo menos importante es el resultado
específico de sus trabajos, lo importante es que la gente así formada:
•ha aprendido el proceso de pensamiento crítico
•sabe que las cosas importantes por pequeñas que sean
requieren un esfuerzo grande y a largo plazo
•sabe reconocer que se ha equivocado y sabe rectificar
•sabe comunicarse y comunicar
•sabe formular ideas
•sabe discutir y defender racionalmente sus posiciones
•sabe extraer lo esencial de problemas complejos”
Pedro Miguel Echenique Landiríbar. “Lo Útil de Conocer” Salamanca 2001
USP-CEU
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