Viroloogia 15

Viroloogia 15Viroloogia 15

Positiivse polaarsusega RNA Positiivse polaarsusega RNA genoomsed viirused: alpha-genoomsed viirused: alpha-

sarnaste viiruste supersugukond.sarnaste viiruste supersugukond.

Sugukond Sugukond Togaviridae:Togaviridae: virion. virion.

Sugukond Sugukond TogaviridaeTogaviridae: perekondade : perekondade AlphavirusAlphavirus ja ja RubivirusRubivirus esindajate genoomid. esindajate genoomid.

SFV

coated vesicle

42S RNA++

++

++

--

ns-proteins

++++

++++

26S RNA structural proteins

endosomenucleus

ER

Golgi complex

membrane proteins

capside protein

coated pit

Alphaviiruste geeniekspressiooni Alphaviiruste geeniekspressiooni skeem.skeem.

Semliki Forest viiruse replikatsiooni Semliki Forest viiruse replikatsiooni kompleksidkompleksid

Semliki Forest viiruse replikatsiooni Semliki Forest viiruse replikatsiooni kompleksidkompleksid

nsP1nsP1 nsP2nsP2 nsP3nsP3 nsP4nsP4

KiireKiire

nsP4nsP4nsP1nsP1 nsP2nsP2 nsP3nsP3

m7GpppA AAAAAAAAA

capcap polyApolyA (+) 42S RNA(+) 42S RNA

nsP4nsP4P123P123

““Varajane replikaas”Varajane replikaas”

Infektsiooni esimesed 2-4 tundi

nsP4nsP4P123P123 (+)42S RNA(+)42S RNA

““varajane replikaas” kasutab maatritsina varajane replikaas” kasutab maatritsina genoomseid RNAsidgenoomseid RNAsid ((42S RNA42S RNA) ja sünteesib ) ja sünteesib

negatiivseid ahelaidnegatiivseid ahelaid

Infektsiooni esimesed 2-4 tundi

(–)42S RNA(–)42S RNA

(+)42S RNA(+)42S RNA

nsP1nsP1 nsP2nsP2 nsP3nsP3

AeglaneAeglane

nsP2nsP2 nsP3nsP3nsP1nsP1

cis

Hilisem infektsioon

nsP4nsP4PP112323

nsP1nsP1

P23P23

P23

nsPnsP33nsP2nsP2 nsP4nsP4

nsP1nsP1

KiireKiire

nsP2nsP2 nsP3nsP3

trans

nsP2nsP2 nsP3nsP3

Hilisem infektsioon

nsPnsP33nsP2nsP2 nsP4nsP4

nsP1nsP1

Toimub replikaasi spetsiifilisuse muutus: Toimub replikaasi spetsiifilisuse muutus: positiivsete RNAde positiivsete RNAde asemel kasutatakse maatritsina negatiivseid ahelaidasemel kasutatakse maatritsina negatiivseid ahelaid

Hilisem infektsioon

(–)42S RNA

(+)42S RNA

(+)26S RNA

nsPnsP33nsP2nsP2 nsP4nsP4

nsP1nsP1

““hiline replikaashiline replikaas” ” kasutab maatritsina negatiivseid RNA ahelaid ja kasutab maatritsina negatiivseid RNA ahelaid ja

toodab genoomseid ja subgenoomseid (26S) RNAsid.toodab genoomseid ja subgenoomseid (26S) RNAsid.

Hilisem infektsioon

Alphaviiruste struktuursete Alphaviiruste struktuursete valkude protsessing ja virionide valkude protsessing ja virionide

moodustumine.moodustumine.

Alphaviiruse membraanvalgud: Alphaviiruse membraanvalgud: paiknemine membraanis ja paiknemine membraanis ja

protsessing.protsessing.

SFV

coated vesicle

42S RNA++

++

++

--

ns-proteins

++++

++++

26S RNA structural proteins

endosomenucleus

ER

Golgi complex

membrane proteins

capside protein

coated pit

Rubella viirus – infektsioonitsükli Rubella viirus – infektsioonitsükli skeem.skeem.

Kollatõve viiruse E (HEV) genoomi Kollatõve viiruse E (HEV) genoomi organisatsioon.organisatsioon.

Tubaka mosaiiktõbi – haigus, mille Tubaka mosaiiktõbi – haigus, mille uurimisest algas viroloogia.uurimisest algas viroloogia.

Virionide spiraalne sümmeetria. Virionide spiraalne sümmeetria.

Tubaka mosaiigiviiruse (TMV) virion.Tubaka mosaiigiviiruse (TMV) virion.

TMV infektsioonitsükkel rakus.TMV infektsioonitsükkel rakus.

TMV genoomi 3’-otsas asuv TMV genoomi 3’-otsas asuv järjestus omab tRNA sarnast järjestus omab tRNA sarnast

ruumilist struktuuri.ruumilist struktuuri.

TMV infektsioonitsükkel rakus.TMV infektsioonitsükkel rakus.

TMV pakkimissignaal (origin of TMV pakkimissignaal (origin of assembly) ja virionide moodustumise assembly) ja virionide moodustumise

skeem skeem

BMV genoom ja infektsioonitsükkel.BMV genoom ja infektsioonitsükkel.

BMV replikatsioonisüsteem pärmis.BMV replikatsioonisüsteem pärmis.

BMV subgenoomse promooteri ehitus.BMV subgenoomse promooteri ehitus.

Closteroviirused – suurima genoomiga Closteroviirused – suurima genoomiga positiivse polaarsusega RNA genoomsed positiivse polaarsusega RNA genoomsed

taimeviirused.taimeviirused.

Marfiviiruse genoom ja geeniekspressiooni Marfiviiruse genoom ja geeniekspressiooni skeem. Marfiviirused replitseeruvad nii skeem. Marfiviirused replitseeruvad nii

taimedes kui ka putukates.taimedes kui ka putukates.