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Álgebra y aplicaciones: análisis de señales biomédicas Marisol Gómez

Workshop completo.Jornada Biomed XXI

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Page 1: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Álgebra y aplicaciones: análisis de señales

biomédicas

Marisol Gómez

Page 2: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Álgebra y Aplicaciones

Teoría de gruposEstudio de autómatas finitosProcesado de imágenes médicasAnálisis de señales biomédicasBrain Computer Interface (BCI)

Page 3: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Análisis de señales biomédicas. Sistemas ambulatorios de medida

Sistema de medida bajo coste. Uso ambulatorio y domiciliario. Promover la recuperación funcional y mejorar la calidad de vida.

Análisis de datos: adquisición, recuperación, comparación y procesado de señales de acelerometría.

Page 4: Workshop completo.Jornada Biomed XXI
Page 5: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Bacterias reprogramadas

Íñigo Lasa

Page 6: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Bacterias reprogramadas

Insulina (diabetes)Hormona de crecimiento (enanismo)Factores de coagulación (hemofilia)Interleukinas (inmunoterapia del cancer)Interferon a (leucemias, hepatitis)Eritropoyetina (anemia)DNAse I (fibrosis cistica)Anticuerpos (inmunoterapia)

1. Factorías de producción de proteínas terapeúticas

Page 7: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Bacterias reprogramadas

2. Factorías para síntesis de fármacos

Biosíntesis de fármacos en células como alternativa al reactor químico (artemisina, aspirina)(Sanofi, Codexis,….)

Plataformas para la mejora de fármacos existentes (anticuerpos con mejor afinidad)(Gen9)

Síntesis de nuevos fármacos(Glaxo SK)

Page 8: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Bacterias reprogramadas

3. Bacterias y células terapeúticas

Bacterias y fagos capaces de destruir bacterias patógenas(EnBioTix, Bgene)

Bacterias como plataformas de expresión de vacunas(Prokarium, Recombina,…..)

Ingeniería de tejidos (Impresión 3D de materiales biológicos) (OxSyBio)

Bacterias para tratamiento de enfermedades (Fenilcetonuria)(Synlogic)

Page 9: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Dispositivos de detección de sustancias pirógenas alternativo al test LAL

Sergio Arana

Page 10: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

UBIQUITUOUS!!

Detection of pyrogenic agents based on electrochemical techniques

MEDICAL ISSUE

Presence of pyrogenic agents in implantable medical devices or parenteral drugs

REGULATION AGENCIES: FDA, EMA, Pharmacopoeias

Mortality rate: 30% - 50%

> Prostate cancer + Breast cancer + AIDS Heart attack

DEMANDING control of endotoxin

Gold Standard: LAL Test

Pharmacological productsMedical devicesProducts produced in hospitals

Endotoxin: pyrogen molecule embedded in the outer membraneof Gram-negative bacteria

SEPSIS

SEPTICSHOCK

MULTIORGANFAILURE DEATH

ENDOTOXIN CONCENTRATION

PhD. Sergio Arana

Page 11: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Electrochemical measurements: setups and electronics

Cuvette (6m

l)D

roplet (100µl)µfluidic cell (40µl)

Final sensor

prototypes

Potentiostat/Galvanostat

PhD. Sergio Arana

Page 12: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Integration of the whole detection system, first steps for validation

I. Fully miniaturized electrochemical sensor

II. Specific and optimized biofunctionalization protocol

III. Microfluidic chamber to homogenise assay conditions

and to minimize contamination riskIV. Portable potentionstat/galvanostat

INTEGRAL SOLUTION

End user customable

DUAL APPLICATION

PORTABLE EQUIPMENT/USER CONTROL

» Commercial solutions available» Main difference: OPERATING PRINCIPLE

Sensible and robustPortableFlexible designEase for use

» INNOVATIVE SOLUTION for industrial applications» Integration into routine processes

Test routineCost reductionFlexible designNo need for qualified users

AUTOMATED EQUIPMENT

PhD. Sergio Arana

Page 13: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Economía de la salud: evaluación económica de

tecnologías sanitarias, efectividad y costes

Juan Manuel Cabasés

Page 14: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Departamento de Economía

Economía de la salud Evaluación económica de tecnologías

sanitarias, efectividad y costes

BIOMED XXI “WORKSHOP CIENCIA, CONOCIMIENTO Y

EMPRENDIMIENTO” Juan M Cabasés

Grupo de investigación Economía de la Salud

Departamento de Economía, UPNA

Page 15: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Departamento de Economía

EQIS 2.0 USER GUIDE Eduardo Sanchez-Iriso

María Errea

Page 16: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Departamento de Economía

Page 17: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Expresión génica

Ignacio Encío

Page 18: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Regulación de la Expresión de Genes del Metabolismo de Esteroides

Análisis del Mecanismo de Acción de Nuevos Compuestos con Actividad Antitumoral

Tumores Endocrinos 17β-Deshidrogenasas de Esteroides

(HSD17B8, HSD17B10, HSD17B11, AKR1C3)

Nuevos Compuestos con Actividad Antitumoral:

Mecanismos de Acción

Grupo de Investigación

Expresión GénicaDepartamento

Ciencias de la SaludUniversidad Pública de Navarra

HSD17B8Hígado y

Mama

Derivados de Bezotiofeno 1,1 dióxido

Compuestos Selenados Selenodiazoles, Selenoglicoles, Selenocarbamatos, Diseleniuros, etc.

HSD17B11AKR1C3Próstata

Neuroblastoma Diferenciación Inducidada por Ácido Retinoico

Page 19: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Estrategias de Terapia Celular para el tratamiento de la Diabetes Tipo 1:

Terapia sustitutoria (iPS) & Inmunomodulación (MSCs)

Terapia sustitutoria: obtención de células b a partir de iPS

Terapia inmunomoduladora: células madre mesenquimales

células pluripotentes inducidas (iPS)

células madre

Mesenquimales (MSCs)

Diabetes tipo 1

Page 20: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Ensa

yos p

re-c

línic

os

Papel de los simbióticos (Probisan®) en la prevención y desarrollo de diabetes y enfermedades

inflamatorias intestinales en modelos animales de experimentación

Objetivo 1.

Diab

etes

tipo

1

(rató

n N

OD)

Objetivo 2.

DT2

y O

besi

dad

(rata

ZDF

)

Objetivo 3.

Enf.

infla

mat

oria

s in

testi

nale

s

CaracterizaciónMicrobiota

Plataforma genómica

Ensayos clínicos en humanos

Prob

isan®

(PEN

TABI

OL

S.L.

)

Page 21: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Inteligencia artificial y razonamiento aproximado

Humberto Bustince

Page 22: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Grupo de Inteligencia Artificial y Razonamiento AproximadoGIARA

Departamento: Automática y ComputaciónOrganismo: Universidad Pública de Navarra

Web: http://giara.unavarra.esResponsable: Humberto Bustince [email protected]

Líneas de Investigación

Sistemas expertos (clásicos y difusos). Aprendizaje automático y reconocimiento de patrones. Procesamiento de imagen. Funciones de agregación. Teoría de conjuntos difusos y sus extensiones. BIG DATA

Page 23: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Líneas de Investigación

Información Conocimiento

Inteligencia Artificial. Minería de datos

Extracción de conocimiento en conjuntos de datos para:

Técnicas de clasificación mediante aprendizaje automático

Procesamiento de imagen

Sistemas de ayuda para la toma de decisiones

Base de

datos

Selección

Preprocesado

Selección de

características

Extracción de

conocimiento

Evaluación

ModeloClasificad

orConocimi

ento

Page 24: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Proyectos Desarrollados• Elaboración de un sistema inteligente para la predicción de eventos adversos

relacionados con la polimedicación en atención primaria.

• Análisis de la base de datos Major Trauma de Navarra 2010-2012, validación como

sistema de vigilancia epidemiológica, predicción de la morbi-mortalidad y calidad

asistencial del Sistema de emergencia de Navarra.

• Aplicación de los conjuntos intervalo-valorados fuzzy al tratamiento de imágenes de

manchas en la piel para diagnosticar melanomas.

• Centro de Autentificación Biométrico Multimodal.

Page 25: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Sensores: Optisensing

Ignacio del VillarCarlos Ruiz Zamarreño

Page 26: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

OPTICSENSING: UNA NUEVA INICIATIVA EMPRESARIAL

Desarrollo de equipos fotónicos y ópticos para aplicaciones biomédicas

WAVELENGTHOP

TIC

AL

PO

WE

R

OP

TIC

AL P

OW

ER

WAVELENGTH

INPUT LIGHTREFLECTED OUTPUT

WAVELENGTHOP

TIC

AL

PO

WE

R

TRANSMITTED OUTPUT

ESQUEMA SENSOR

Page 27: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Detección de anticuerpos de celiaquía

RECOVERY

RECOVERY

RECOVERY

RECOVERY728

733

738

743

748

753

0 20 40 60 80 100 120 140

Res

onan

ce w

avel

engt

h (n

m)

Time (min)

BINDING

BUFFER

THROMBIN

100nMBINDING

BUFFER

THROMBIN

100nMBINDING

BUFFER

APLICACIONES ESTUDIADAS

Una solución integrada en el móvil

Detección de VOCs, gases, …

Detección de Trombina, proteínas, …

Objetivo a corto-medio plazo:

Page 28: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Biacore T200Resolution: 3x10-8

OWLS 210Resolution: 3x10-6

EVA 2.0Resolution: 5x10-8

EQUIPOS COMERCIALES

DISPOSITIVO DESARROLLADO EN LA UPNA

-34

-29

-24

-19

-14

-9

-4

1150 1250 1350 1450 1550 1650

Tran

smitt

anci

a(dB

)

Wavelength (nm)

n=1.434n=1.4357n=1.4373n=1.438

TM

1300

1340

1380

1420

1460

1500

1,4335 1,4345 1,4355 1,4365 1,4375 1,4385

Reso

nanc

eW

avel

engt

h(n

m)

Wavelength (nm)

Resolución: 1x10-9

Objetivo a medio-largo plazo:

EquipoComercial

ultrasensible

Page 29: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Tecnología de THz para biosensado e imagen

médica

Íñigo Ederra

Page 30: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Grupo de Antenas, UPNA: Soluciones

• Desarrollo de sensores “ad-hoc” • Basados en metamateriales para

mejorar la sensibilidad

THz (0.1-1THz) para sensado y toma de

imágenes

• Sistemas para toma de imágenes: Detección de objetos

extraños/defectos Contenido de agua Grosor de películas

Grupo de Antenas

Page 31: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Grupo de Antenas, UPNA: Aplicaciones

90095010001050110011501200Wavenumber cm-1

0.05

0.10

0.15

0.20

Abs

orba

nce

Uni

ts

Candida guillermondiiCandida albicansCandida tropicalisCandida parapsilosisCandida lipolytica

ESPECTROS DE ESPECIES DEL GÉNERO CANDIDA

90095010001050110011501200Wavenumber cm-1

0.05

0.10

0.15

0.20

Abso

rban

ce U

nits

Rhodotorula mucilaginosaCandida albicansSaccharomyces cerevisiaeEscherichia coliStaphyloccocus epidermidis

ESPECTROS DE DIFERENTES GÉNEROS Y FAMILIAS DE MICROORGANISMOS

EIFFEL: Early invasive fungal infection detection with Terahertz sensor systems, IIS14618.RI1

Grupo de Antenas

CURVA REFLEXIÓN VS CURVA CRECIMIEMTO L.MONOCYTOGENES 10^2 UFC/ml

-26,4

-26,3

-26,2

-26,1

-26

-25,9

-25,8

-25,7

0 5 10 15 20 25 30 35 40

horas

dB

1,5

2,5

3,5

4,5

5,5

6,5

7,5

8,5

9,5

NANOSENS: Desarrollo de nuevos sensores multiaplicación

VITICS: Modelo de viticultura de precisión basado en dispositivos TIC de bajo coste para la monitorización del estado hídrico

Page 32: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Grupo de Antenas, UPNA: Capacidades

Sala limpia ISO7

• Diseño, fabricación y caracterización de componentes

• Caracterización espectral

Grupo de Antenas

0 – 0.5 THz 0.1 – 3.5 THz IR

Page 33: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Bionanoplus

Ricardo Palacios

Page 34: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Tecnología

patentada

Liberación controlad

a

Escalado industrial

Requisitos regulatori

os

Nanoparticulas poliméricas para la administración de fármacos y vacunas

Page 35: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Como puede la tecnología de Bionanoplus mejorar tus productos

Bionanoplus ComercialAumentar la solubilidad

Potenciar la respuesta inmune

Aumentar la biodisponibilidad

Page 36: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Condiciones favorables para la colaboración

Ricardo [email protected]

Desarrollo de nanoparticulas poliméricas

a la carta

Servicios

Caída cabello

Psoriasis

Onicomicosis

Vacunas veterinarias

Productos propios

Page 37: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

InnoUp Farma

Maite Agüeros

Page 38: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Ikan Biotech

Roberto Díez-Martínez

Page 39: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

19961980’s

2013…. 2015

Servicios específicosPrimeros

estudios conPeces cebra

Estudios preclínicos

DesarrolloSistema Nervioso

Modelos regeneración de heridas

Modelos antimicrobianos

(Patente nacional)

Mutantes

….2000BIOSANITARIA MEDIOAMBIENTAL

Page 40: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Ahorro económico

5 veces más económico

t

Ahorrotiempo

7días

2-3días

Q/m

Cantidad de moléculapor ensayo

mg-μg

g

Directiva 2010/63/UE ------ Real Decreto 53/2013

Page 41: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Roberto Díez-Martínez, Ph.D.CSO

[email protected]

Rubén Díez Punzano, MBA.CEO

[email protected]

Prof. Vincent Fischetti

Juan A. Ruano Ruiz, MD, Ph.D.

Promotores Asesores Externos

Chad W. Euler, Ph.D.

Page 42: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

LQTAI

Alfonso Baquero

Page 43: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Servicio de telemonitorización para el seguimiento de pacientes crónicos • Plug & Play y Accesible• Ubicuo y en Tiempo Real• Servicio Integral de eSalud

Características

Personalizable Glucos

a

Tensión y Ritmo

SpO2 Peso Temp.PeakFlow

(PEF, FEV1…)

Diabetes

Enfermedades CardiacasEnfermedades RespiratoriasMultipatología

Punto de Cuidado Inteligente

Page 44: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Servicios de Ingeniería Diseño electrónico, sistemas

embebidos y procesado de señal

Integración de tecnologías inalámbricas

Desarrollo de aplicaciones móviles

Desarrollo de aplicaciones web J2EE

Desarrollo de soluciones llave-en-mano de Servicios Socio-Sanitarios

Page 45: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Desarrollos Actuales

• Servicio de monitorización electrocardiográfica HOLTIN

• Detección y diagnóstico de arritmias paroxísticas y episodios de FA

• Mejora de las soluciones clínicas actuales (Holter convencional y holter implantable)

Page 46: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Making Genetics

Javier Campión

Page 47: Workshop completo.Jornada Biomed XXI
Page 48: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

BIOMARCADORES EPIGENÉTICOS

ACCIDENTE CEREBROVASCULAR (2019)

ARTRITIS REUMATOIDE (2018)

ENFERMEDAD CELIACA INFANTIL (2019)

DIABETES GESTACIONAL (2019)

Page 49: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

PRODUCTOS GENÉTICOS A LA CARTA

0g 1g

2g 1+1g

Piel

Page 50: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Pharmamodelling

Lorea Bueno

Page 51: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Equipo MultidisciplinarPersonal altamente cualificado

Bioe

quiv

alen

cia

Resc

ate

Ensa

yos

Clín

ica

Prec

línic

a

Bioe

stad

ística

Esca

lado

, 1ª D

osis

IIV, I

SV, c

ov.

Page 52: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Investigación Básica

Diseño Prototipo

Desarrollo Preclínico Desarrollo Clínico Aprobación FDA

y lanzamiento

Ruta crítica

Técnica avalada por la FDA en un informe elaborado en 20041

1Challenge and Opportunity on the Critical Path to New (FDA 2004)

Page 53: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Desarrollo Preclínico Desarrollo Clínico

¿Qué puede hacer Pharmamodelling?

Lorea Bueno, [email protected] Nave T3

Ahorro

Page 54: Workshop completo.Jornada Biomed XXI

Networking lunch

¡Contacta e interactúa!