عنوان فارسي درس (تيتر 14)ui.ac.ir/Dorsapax/userfiles/Sub16/Syasatgozari... · 2 يلاعتهمسب:همدقم.دزادرپیم یلوکلوم حطس رد لولس

1

باسمه تعالي

دانشگاه اصفهان دانشکده علوم

گروه زيست شناسي

سرفصلمشخصات کلي برنامه و

کوليلسلولي موزيست شناسي (Ph.D) دروس دکتري

گروه زيست شناسي -دانشگاه اصفهان

نوزدهمین جلسه شورای دانشگاهمصوب 62/11/39

2

تعالي سمهب

:قدمهم. پردازد می یهای جديد سلول در سطح مولکول های تحصيلی آموزش عالی است که به مطالعه يافته از جمله دوره یمولکول یسلولزيست شناسی یتخصص یدوره دکتر

اين رشته تأسيس. شود و پژوهشگران با ارائه آموزشهای الزم و آشنايی با روشهای علمی، تحقيقاتی تأسيس می نياين رشته با هدف گسترش دانش و تربيت متخصص

های شغلی نيروهای مستعد و با هوش انسانی خواهد شد و اين رشته قادربه افزايش توانايی، پيشرفت و مهارت. را برطرف خواهد کرد یمولکول یفقدان متخصصان سلول

اکنون در جهان اين رشته از آنجائيکه هم. خواهد داد ارائهمنظور ارتقاء سطح آموزشی و پژوهشی دانشگاهها و مراکز آموزشی به جامعه التحصيالن توانمند را به فارغ

های تحصيلی مؤسسات روز کردن رشته تواند گامی مؤثر در جهت به اندازی آن در دانشگاه اصفهان می تحصيلی در بسياری از دانشگاههای پيشرفته دنيا وجود دارد، راه

علت محدود بودن ظرفيت پذيرش اين رشته عالقه وافری به ادامه تحصيل در اين رشته دارند که به تگاناکنون بسياری از دانش آموخ هم. آموزش عالی در کشور باشد

. باشند رغبتی دررشته های تقريبا نزديك می مجبور به تحصيل با کم

:دفه

در . می باشد سلولی مولکولیم وله های مختلف عتربيت افرادی توانا در مطالعه و تحقيق در جنب یمولکول یسلولزيست شناسی دوره دکتری از راه اندازی رشته هدف

به پژوهش در يکی (رساله دکتری) شنا شده و با انجام پايان نامهآهای تحقيق در اين زمينه نيز با روش سلولاين رشته دانشجويان عالوه بر بررسی سازماندهی و عملکرد

.می پردازند سلولیاز پديده های

،با استفاده از دانش و پژوهش کسب شده در اين زمينه بتوانند در موسسات تحقيقاتی وکسب کنند اواهند بود مهارتهای علمی الزم رانش آموختگان اين رشته قادر خد

.به تحقيق و خدمت به پردازند و ساير موسسات آموزشی

یمولکول یزيست شناسی سلول یتخصص یدوره دکتررنامه های دروس ب

واحد به شرح جداول زير 61جمعا در مرحله آموزشیانشجويان د. واجد دو مرحله آموزشی و پژوهشی می باشد یمولکول یسلولدوره دکتری زيست شناسی

2درس سمينار . باشند می( اختياری) 3واحد از دروس جدول شماره 1و ( تخصصی -اصلی) 2دانشجويان ملزم به گذراندن تمام دروس جدول شماره . گذرانند می

پس از موفقيت در اين دروس و نيز امتحان جامع مرحله پژوهشی شروع می شود که با انجام پژوهش، (. 2جدول )واحد می باشد و از دروس الزامی محسوب می شود

6ی در جدول مولکول یسلولتری زيست شناسی مشخصات کلی دروس دوره دک. واحد می باشد 22ارزش پايان نامه . تدوين پايان نامه و دفاع از آن به پايان می رسد

.آورده شده است

3

یمولکول یمشخصات کلی دروس دوره دکتری زيست شناسی سلولـ 6جدول

تعداد واحد نام درس رديف

8 دروس الزامی 6

1 دروس اختياری 2

2 سلولی مولکولیسمينار دکتری 3

22 مولکولی پايان نامه دکتری سلولی 4

31 جمع 5

لزامیدروس ا -2جدول


2 ژنوم یمولکول یشناس ستيز 6

2 ساختاری سلولی یشناس ستيز 2

2 مهندسی ژنتيك تکميلی 3

2 تنظيم بيان ژن 4

8 جمع

2 سمينار دکتری سلولی مولکولی 5

22 پايان نامه دکتری سلولی مولکولی 1

اختياریدروس -3جدول


2 مولکولی زيست پزشکی سلولی و 6

2 زيست شناسی اندامك ها 2

2 مولکولیسلولی زيست فناوری 3

2 و مدل سازی سلولی مهندسی پروتئين 4

2 کشت سلول و بافت پيشرفته 5

2 مهندسی بافت و سلولهای بنيادی 1

2 پيشرفته یمولکول یسلول یشناس یمنيا 7

2 تمايز سلولیو مکانيسم های رشد 8

2 مکانيسم سلولی مولکولی سرطان 9

2 کاربردی پروتئوميکس و ژنوميکس 62

2 سلول درمانی 66

2 زيست شناسی سلولی مولکولی مباحث ويژه 62

مولکولها و شبيه سازی درشت بيوفيزيك 63

مولکولی

2

4

دروس الزامي

زيست شناسي سلولي مولکولي( Ph.D)دکتري

5

ژنوم يمولکول يشناس ستيز

Molecular Biology of the Genome

ـــ: عملي واحد تعداد

ــ: تمرين حل

واحد نظری 2: واحد تعداد

الزامی: درس نوع ــ : پيشنياز

: درس هدف

آخرين پيشرفتهای موجود در معرفیو در موجودات زنده DNAمطالعه و بررسی آخرين پيشرفت های مرتبط با ساختار، سازمان دهی ژنوم، سيستم های همانند سازی

. علوم سلولی و مولکولیدر تحقيقات علوم زيستی و خصوصاً زيست شناسی مولکولی با تاکيد بر کاربرد

: مطالب رئوس

سازماندهی و ساختار ژنوم در سلولهای يوکاريوتی و پروکاريوتی -

ابزارهای مطالعه ژنوم و نقشه های ژنومی -

، اصول و کاربردژنوميکس -

ساختارهای ژنوميك در ياخته های يوکاريوتی و پروکاريوتی مانند نوکلئوزوم ها و بررسی مکانيسمهای بسته بندی آنها -

با تکيه بر مباحث نوين پردازش ژنیمکانيسم های تعمير و -

و اسيدهای نوکلئيك RNAزيست شناسی -

در فناوری( RNAو DNA)ساختارهای ژنومی استفاده -

نوترکيبی سوماتيك و باز آرايی ژنی -يژهنوترکيبی و -نوترکيبی هومولوگوس: های ژنی يبینوترک -

مکانيسم و عملکرد:ترانسپوزونها -

تکامل ژنوم -

: ارزيابي روش

ي مستمرارزشياب ترم ميان نهايي آزمون پروژه

+ + - +

- : بازديد

: اصلي منابع1- R. F. Weaver, “Molecular Biology”, McGraw-Hill, 2010.

2- J.E. Krebs, B. Lewin, E.S. Goldstein, S.T. Kilpatrick, “Lewin`s Gene XI”, Jones & Bartlett

publisher, 2014.

3- J.D. Watson, “Molecular Biology of the Gene”, Pearson Education, 2013.

4- B. Albert, “Molecular Biology of the cell”, Academic Internet, 2013.

5- H. Lodish, “Molecular Cell Biology”, W.H. Freeman, 2013.

6

ساختاري يسلول يشناس ستيز

Structural Cellular Biology

ــ: عملي واحد تعداد


واحد 2: نظري واحد تعداد

الزامی: درس نوع ــ : پيشنياز

: درس هدف

های آخرين پيشرفت معرفیو ها سلولسلولی و سرطان در یها اميپ کننده کنترلهای غشا، مکانيسم یده سازمانمرتبط با ساختار، یها شرفتيپمطالعه و بررسی آخرين

. در تحقيقات علوم زيستی و خصوصاً علوم سلولیسلولی با تاکيد بر کاربرد یشناس ستيزموجود در


موجود در ساختارهای سلولی با تکيه بر عملکرد فيزيولوژيك یها نيپروتئبررسی انواع : وتيوکاريو وتيپروکاری سلول هایساختار یده سازمان -

در غشا یرسان اميپ یها سامانهارتباطی و یها کاناليونی و یها پمپبررسی نحوه عملکرد : انتقال یها ستميسی و سلول یها ساختار غشاء -

مکانيسم و عملکرد، رسان اميپ یها مولکولمجاور، ساختار یها سلولبه ها سلولنحوه انتقال پيام از ، یسلول نيارتباطات ب -

بر مرگ سلولی، سيستم آبشاری انتقال پيام مرگ سلولی رگذاريتأث، عوامل یسلول شده یزير برنامهو مرگ یسلول ميتقس -

، سيستمهای فسفريالسيون سلولی جهت انتقال پيام ها هورمون، نحوه عملکرد و عملکردسلول تمايز جهت پيام در سلولانتقال مسيرهای -

نهای خفته سيگنالهی سلولی بر روی اونکوژ یاثرگذارنيك، اونکوژ یها اميپانتقال ساختار و مکانيسم فعاليت اونکوژنها در سلول، : و تکثير سلولی ها آنکوژن -

در قلمرو يوکاريوتها و پيدايش اندامکهای سلولی تکامل سلول -


ي مستمرارزشياب ترم انيم نهايي آزمون پروژه

+ + - +

-: بازديد

: اصلي منابع

1- J.D. Watson, “Molecular Biology of the Gene”, Pearson Education, 2013.

2- B. Albert, “Molecular Biology of the cell”, Academic Internet, 2013.

3- H. Lodish, “Molecular Cell Biology”, W.H. Freeman, 2013.

7

يليتکم کيژنت يمهندس

Supplementary Genetic Engineering




الزامي: درس نوع -: پيشنياز

: درس هدف

نوين تغيير بيان ژن و توليد محصوالت جديد یها روشداخل سلول و ابداع یها ژنجهت دست ورزی ، تکنيك ها و کاربردهای جديدها شرفتيپمطالعه آخرين

محصوالت دست ورزی شده کشاورزی و پزشکی و دارويی یساز نهيبهو مهندسی ژنتيك نوترکيب با فناوری


.در حوزه زيست فناوری ها ژنو به دام اندازی ها ژنويرايش ابزارهای نوين در پردازش و -

دست ورزی شده DNAبه منظور توليد نسل جديدی از RNA PCRشامل PCRنوين یها روش -

در جهت ابداع اورگانيسمهای ترا ريختجديد توليد همسانه سازی ژنی یها روش -

يوکاريوتی و پروکاريوتی مانند وکتورهايی با یها سلول به داخلژنی جهت انتقال سريع و موثر نوين یها حاملو وکتورهاطراحی، ساخت و توليد -

ای ويروسیساختاره

نوترکيب و داروهای زيستی یها نيپروتئ، سيستمهای نوين انتقال ژن و توليد از جمله توليد جانداران تراريخت مهندسی ژنتيكدر مباحث جديد مطالعه -

پزشکی و صنعتی یکاربردهاو طراحی و ساخت زيست حسگرهای نوين -

ژن های کوچك جهت تنظيم بيان RNAتوليد و طراحی -

در تحقيقات و علوم زيستی ها آنها و کاربرد Ribozymeو DNAzymeتوليد و طراحی -



+ + - +

دارد :بازديد


1. Sandy B. Primrose, Richard Twyman, “Principles of Gene Manipulation and Genomics”, John Wiley & Sons, 2013.

2. Desmond S. T. Nicholl, “An Introduction to Genetic Engineering”, Cambridge University Press, 2008. 3. Brown T. A., “Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction”, Wiley-Blackwell, 2010.

8

تنظيم بيان ژن Regulation of Gene Expression




الزامي: درس نوع ــ: پيشنياز

: درس هدف

با در سلول ها ژنبيان و پردازش کننده ميتنظو عوامل های کوچك و بزرگ غير کد کننده RNA اعم از دخيل در بيان ژن نوين شناخت عوامل و مکانيسم های

.يوکاريوتی یها سلولفرايند تمايز و نمو تکيه بر


با تکيه بر عملکرد فاکتورهای دخيل در اين فرايند پروکاريوتی و يوکاريوتی یها سلولدر مقايسه ساختاری بيان ژن -

از هسته به سيتوپالسم شده پردازش RNA، انتقال يوکاريوتی یها سلولدر RNAنحوه تنظيم پردازش -

. ريبوزوم ها و فاکتورهای دخيل در اين فرايند ، مکانيسم و عملکردسنتز پروتئين -

به خارج سلول و اندامك های سلولی ها نيپروتئ، پردازش پروتئين در شبکه آندوپالسمی و هدايت پروتئين تاخوردگی پروتئين و کنترل کيفی -

، بررسی ساختار و عملکرد پروتئوزومپايداری پروتئينپروتئوليزيز و تنظيم -

جهت تنظيم بيان ژن RNAi و ابداع Micro RNAs توليد و فعاليت ،RNAپردازش -

کروماتين و یها رشتهکروموزوهای جنسی، تغييرات ساختاری یها ژنسوماتيك، نحوه خاموشی یها ژن بر بيان ريتأثو تغييرات ساختاری در ژنوم و اپی ژنتيك -

آن بر بيان ژن راتيتأث

ها یماريبو پيدايش یسلولو ايجاد اختالالت ها اندامارتباط تغييرات بيان ژن در تمايز و نمو -



+ + - +

-: بازديد : اصلي منابع

1. G.H. Perdew, J. P. V. Heuvel, J. M. Peters, “Regulation of Gene Expression: Molecular Mechanisms”, Infectious

disease Springer, 2010.

2. K.V. Morris, “RNA and the Regulation of Gene Expression: A Hidden Layer of Complexity”,

Horizon Scientific Press, 2012.

3. K.V. Morris, “Non-coding RNAs and Epigenetic Regulation of Gene Expression: Drivers of Natural Selection”,

Horizon Scientific Press, 2012.

4. B. Albert, “Molecular Biology of the cell”, Academic Internet, 2013.

5. J.E. Kerebs, “Lewin’s Gene XI”, Jones & Bartlett publisher, 2013.

9

سلولي مولکولي يشناس ستيزسمينار دکتري Cell and Molecular Biology Ph.D Seminar





: درس هدف

در ارائه سخنرانی يیتواناو پردازش مطالب، همراه با افزايش یآور جمعسلولی و مولکولی در موضوعی معيين و جديد، یشناس ستيزبررسی آخرين منابع علمی رشته

. و نگارش مقاله به زبان انگليسی


سلولی مولکولی به عنوان سمينار توسط دانشجو زير نظر استاد مربوطه انتخاب و پس از تصويب در تاريخ یشناس ستيزموضوعات تخصصی جديد و مطرح در زمينه

.شود یمو دانشجويان به صورت سخنرانی به زبان انگليسی ارائه ( داوران)معين و با حضور اعضای هيات علمی



+ - - -


.اينترنتی مرتبط یها گاهيپادر منابع معتبر و منتشرشدهمقاالت جديد

11

سلولي مولکولي يشناس ستيزدکتري (رساله) نامه انيپا Ph.D Thesis in The Field of Cell and Molecular Biology





: درس هدف

سلولی مولکولی با در نظر گرفتن اهداف عاليه دانشگاه و وزارت علوم تحقيقات و فناوری و نيز اسناد باالدستی نظام یشناس ستيزانجام پژوهشی اصيل در قلمرو

الزم و کافی تخصصی را در زمينه مورد نظر فراگرفته و با انجام پژوهشی هدفمند در گسترش مرزهای یها مهارتجمهوری اسالمی ايران به طوری که دانشجو بتواند

یها جنبهشده و قادر به توليد دانش فنی در دار عهدهو مراکز علمی پژوهشی تدريس و تحقيق را ها دانشگاهعالوه بر اين دانشجو بايد بتواند در . اين علم مشارکت نمايد

. مختلف باشند

11

دروس اختياري

سلولي مولکولي يشناس ستيز( Ph.D)دکتري

12

يزيست پزشکي سلولي و مولکول Cellular and Molecular Biomedicine




اختياری : درس نوع ــ: پيشنياز

: درس هدف

در اين درس مکانيسم های سلولی . استانسانی یها یماريببدن انسان در شرايط طبيعی و اختالالت و یها سلول هدف از ارائه اين درس بررسی اهميت فيزيولو ژيك

. گردد یمبررسی ها سلولو مولکولی موثر در شرايط التهابی و استرس زا به


یها سلولو ايمنی و ساز خون یها سلول، یا چهيماهعصبی ، قلبی و یها سلول، فعاليت یولوژيزيو پاتوف یولوژيزيآن در ف یو عملکرد یسلول و مشخصات ساختمان -

انسانی یها بافتدر ها آن کنش برهمپوستی و

بر روی متابوليسم سلولی ريتأثبا تکيه بر in vivo آن در سطح یامدهايو پ یسلولسطوح در یمولکول یها کنش انيم بررسی -

و درمان ها یماريب يیدر شناسا یمولکول-یسلول یولوژيکاربرد ب -

یطيمح یبا استرسها سميمقابله ماکروارگان یمولکول یسلول یسمهايمکان -

ميتوکندريها در ايجاد پيری سلول، نحوه مقابله سلول با عوامل استرس زا ، نقش اندامکهای سلولی مانند یسلول یريپ یمولکول یسمهايمکان -

ژنوم به داخلبيگانه DNAو عوامل پاتوژن و جلوگيری از هجوم ها روسيوايمنی ژنتيکی سلول در مقابله با -

خود ايمنی یها یماريبو وراثتی یها یماريبمختلف از جمله متابوليك و یها یماريبسلولی در یها واکنشبررسی -



+ + - +

دارد: بازديد


1. Z. Du and M. Jin, “Human Health and Medical Engineering”, WIT press, 2014.

2. R.J. Trent,” Molecular Medicine: Genomics to Personalized Healthcare”, 4 ed, Elsevier Inc, 2012.

3. D. Tan , H. T. Lynch , “Principles of Molecular Diagnostics and Personalized Cancer Medicine” Lippincott Williams

& Wilkins, 2013.

4. S.R. Goodman, “Medical cell biology”, 3e, Elsevier Inc, 2010.

5. P. Coveney, V. Diaz, P. Hunter, M. Viceconti, “Computational Biomedicine”, Oxford, 2014.

13

ي سلولياندامک ها يشناس ستيز

Biology of Cellular Organelles





: درس هدف

. استمرتبط یها یماريببر هيتکبا ها آنو ارتباطات متقابل يوکاريوتی یها سلولاندامك های و عملکرد مطالعه پيشرفته ساختار هدف از اين درس


، بين هسته وسيتوپالسم RNAمکانيسم تبادالت ،ارتباطات متقابل هسته با سيتوپالسم ،یا هستههستك و ديگر اجسام و بررسی ساختار و عملکرد هسته -

و پاکت هسته، یا هسته، منافذ ترابری هسته

ميتوکندريائی یها یماريبميتوکندريها، یبند بستهبيوژنز و ، ساختار، عملکرد، انتقال پروتئين، ميتوکندری -

مرتبط یها یماريب و ها نيپروتئانتقال ، بيوژنز، ساختار، تکامل،(گليکوزوم، گلی اکسيزوم، هيدروژنوزوم) پروکسيزوم و ميکروبادی ها -

ليزوزوم یا رهيذخ یها یماريبدر سلول، يیغذاگوارش سلولی و ترابری مواد و واکوئل اندوزوم، هضم مواد داخل سلولی، ليزوزوم و -

، ها یچرب شدن ساخته، ها نيپروتئو فراوری یبند بسته، ، ساختار عملکرد، انتقال وزيکول ها، مکانيسم مولکولیشبکه اندوپالسميك و دستگاه گلژی -

نحوه عمل کالترينلوکون، ترانس



+ + - +

- :بازديد

: اصلي منابع1. A. Terrazas, “Cell Biology: Cellular Organelles and Function: Organelles, Structure, Function”, Super Smart

Science Stuff, 2012.

2. R.A. Bradshaw, E.A. Dennis, “Regulation of Organelle and Cell Compartment Signaling”, Academic Press,

2011.

3. B. Albert, “Molecular Biology of the cell”, Academic Internet, 2013.

4. H. Lodish, “Molecular Cell Biology”, W.H. Freeman, 2013.

5. L. Cassimeries, et al., “Lewin’s Cells” , Jones and Bartlett Publisher, 2011.

14

زيست فناوري سلولي مولکولي

Cellular and Molecular Biotechnology





: درس هدف

هدف های پروکاريوتی و يوکاريوتی زيستی با استفاده از سلول یها فراوردهو توليد مهندسی ژنتيك در زيست فناوری ژهيبه ومطالعه کاربرد علوم سلولی و مولکولی

. باشد یمارائه اين درس


ها چالش، تکنيکها، پروکاريوتی و يوکاريوتی یها سلولبا استفاده از ( نوترکيب یها نيپروتئ)زيستی یها فراوردهتوليد اصول و کاربرد -

، تغيير ساختار، پايداری و کاربرد در پزشکی و صنعتمهندسی پروتئين -

مرتبط یها حاملو ( ، يوکاريوتیسيستمهای بيانی پروکاريوتی) های نوترکيب های بيانی برای توليد پروتئين معيارهای انتخاب سيستم -

پستانداران یها سلولو مخمر و مانند اشريشيا کلی، پيکيا پاستوريس، ساکارومايسس سرويزيه، آسپرژيلوس نيدوالنس ی مناسبها های نوترکيب در ميزبان پروتئين -

HEK، CHO، HeLaمانند

کارها راهو ها چالشبيوراکتور ها و بيو فرمانتور ها، ، زيستی یها فراوردهتوليد انبوه -

آزمايشگاهی یها تيکتهيه ، و کاربردهای صنعتی آنزيم ها -

ها آن، طراحی و توسعه نوترکيب یها واکسن -

آينده انداز چشمو ها چالش هترولوگوس در يوکاريوتها یها نيپروتئتوليد و موجودات تراريخت -



+ + - +


: اصلي منابع1. S.B. Primrose, “Molecular Biotechnology”, Blackwell Scientific Publication, 2008.

2. J.M. Walker, R. Rapley, “Molecular Biology and Biotechnology”, Royal Society of Chimistry Publication, 2009.

3. B.R. Glick, J.J. Pasternak, C.L. Patten, “Molecular Biotechnology: Principles and Applications of Recombinant

DNA”, ASM Press, 2010. 4. D. Robertson, J. Noel, “Protein engineering”, Academic Press, 2004.

15

سلولي يساز مدلمهندسي پروتئين و Protein Engineering and Cell Modelling





: درس هدف

و اصول کلی مربوطه های نوترکيب های توليد پروتئين ها و اهميت و روش های شناسايی پروتئين روشفناوری پروتئين از قبيل در اين درس مباحث مربوط به زيست

.گردد یمارائه


NMR، جرمی، الکتروفورز، وسترن بالت یسنج فيطکروماتوگرافی، : ها شامل ، جداسازی و تعيين هويت پروتئينيیشناسا یها روش -

شدنهای نوترکيب تجاری شده و در حال تجاری های نوترکيب، تاريخچه، اهميت اقتصادی، پروتئين پروتئين -

حذف اين اجسام یها روشو ها آن، مزايا و معايب (Inclusion Bodies)نحوه توليد اجسام درون سيتوپالسمی -

های نوترکيب و اهميت آن در توليد پروتئين( Protein refolding)تاخوردگی مجدد پروتئين -

مقياس بزرگها در پروتئين یساز خالصها، پروتئين یساز خالص واستخراج یها روش -

خالص شده یها نيپروتئپس از توليد بر روی یندهايفرا -

ها نيپروتئافزايش ترشح ، مهندسی پپتيدها و نانوفناوری، مهندسی متابوليك -

سلولی، طراحی و کاربرد غشاهای زيستی یساز مدل -



+ + - +

- :بازديد

: اصلي منابع1. D. Whitford, “Proteins, Structure and Function”, Wiley; 2013.

2. G. Gellisen, "Production of Recombinant Proteins", Wiley-VCH, 2006.

3. C. Chakraborty, "Production Technology of Recombinant Therapeutic Proteins", Biotech Books, 2004.

4. A. Kumar, “Protein Biotechnology”, Discovery Publishing House, 2006.

5. S. J. Park, J. R. Cochran, “Protein engineering and design”, CRC Press, 2009.

6. N. Budisa, “Engineering the Genetic Code: Expanding the Amino Acid Repertoire for the Design of Novel

Proteins”, Wiley, 2006.

7. J. Cavanagh, W. J. Fairbrother, A. G. Palmer, N. J. Skelton, “Mark Rance Protein NMR Spectroscopy”, Academic

Press, 2007.

16

کشت سلول و بافت پيشرفته

Advanced Cell and Tissue Culture





: درس هدف

، جداسازی شده دادههای کشت انتقال ژن به سلول یها روشهای تمايز سلولی، های نوين کشت سلول و بافت مانند روش هدف از ارائه اين درس بررسی و مطالعه روش

. باشد یمها و تعيين هويت سلول


مورفولوژیو نشانگرها ستيز) های سلولی و مولکولی فاده از انواع روشتسابا ها سلول ، تعيين هويت و خصوصياتسلولی یها دودمانواکشت و ، کشت اوليه -

(سلولی

سلول و نگهداری یجداساز یها روش، همسانه سازی و انتخاب سلولیهای بررسی انواع روش -

در تحقيقات و درمان شده دادههای کشت و معرفی شرايط موثر در تمايز سلول يیزدا، عيب فراوری سلولی یها روش، ( ها چالشتکنيکها ، ) تمايز سلولی - -

سلولی یها دودمانو پايدار نمودن بيان ژنی در سلول و ايجاد ها به داخل سلول و ايجاد تغييرات ژنتيك و پروتئين DNA ،RNAانتقال یها روش -

(سلول درمانی)جهت مطالعات بنيادی و پزشکی ها و کاربردها ، روشها سلول یساز راينامترانسفورماسيون و -

مختلف در تحقيقات و درمان یها روش، بررسی و مقايسه توموری یها سلولو مختلف یها بافتاز جنين و بنيادی یها سلولکشت جداسازی و نحوه -

ها آنبا سازگاری باالی زيستی و بررسی تخريب پذيری سلولی یها داربست هيو تهطراحی و ، ها سلولکشت سه بعدی مهندسی بافت، -



+ + - +

دارد: بازديد : اصلي منابع

1- R. I. Freshney, “Culture of Animal Cells: A Manual of Basic Technique and Specialized

Applications”, John Wiley & Sons, 2011.

2- C. D. Helgason, “Basic Cell Culture Protocols”, Humana Press, 2012.

3- John M. Davis, “Animal Cell Culture: Essential Methods”, John Wiley & Sons, 2011.

4- S. P. Langdon, “Cancer Cell Culture: Methods and Protocols”, Springer, 2004.

17

بنيادي يها سلولمهندسي بافت و

Tissue Engineering and Stem Cells





: درس هدف

یها بافتحياتی با تاکيد بر ترميم و درمان یها بافتجهت ساخت و توليد بنيادی یها سلولو سلولی یها داربستدر طراحی و استفاده از پيشرفتهمباحث یريکارگ به

.دهيد بيآس


(Regenerative Medicine)در پزشکی ترميمی دهيد بيآس یها بافتدرمان ترميم و بافت در یمهندس تياهم -

مختلف یها روشبه شده هيته یها داربست بيو معا ايساختار و مزا یو بررسزيست سازگار یها داربست و طراحی انواع ساخت یها روش -

بافت یدر مهندس ها آن تيو اهم ی زيستی، کاربردهاراکتورهااصول و طراحی -

بافت یدر مهندس تيو کاربرد کامپوز تيکامپوز یاساس فيو تعار یمبان -

و بررسی و مقايسه تکنيکهای بکار رفته( کليه،کبد،نای و قلب)حياتی انسانی یها بافتتوليد -

، زيست حسگرهاحياتی و سيگنال های سلولی یها مولکولو انسانی، بنيادی جنينی یها سلولريز محيط -

پر توان القا شده یها سلول، جداسازی ها آن، مکانيسم مولکولی، شناخت نشانگرها و عوامل ها سلولالقاء پرتوانی در -

ها آن یکاربردهابنيادی و یها سلول، بانك بنيادی یها سلولمسائل اخالقی و تجاری در -

ها آن یريکارگ بهو های اختصاصی بافتاز بالغ یاديبن یها سلولجداسازی ، بالغ یاديبن یها سلولخصوصيات -

پيش رو یها چالشو دهايامدر پزشکی ترميمی، یاديبن یها سلولکاربردهای -



+ + - +

-: بازديد


1. F. Guilak, D.L. Butler, S.A. Goldstein, D. Mooney, “Functional Tissue Engineering”, Springer, 2008.

2. C. Kasper, M. Van Griensven , R. Portner " Bioreactor Systems for Tissue Engineering" , Springer, 2008.

3. G.M. Artmann, S. Chien,"Medical, Bioengineering in Cell and Tissue Research" , Springer Verlag , 2008.

4. J.P. Fisher, A.G. Mikos, J.D. Bronzino, D.R. Peterson “Tissue Engineering: Principles and Practices”, Taylor and

Francis, 2012.

5. H. Hauser, M.M. Fussenegger, “Tissue Engineering”, Humana Press, 2012.

6. B. Obradovi, “Cell and Tissue Engineering”, Springer, 2011.

7. C. Mummery, I. S. Wilmut, A. Van De Stolpe, B. Roelen, “Stem Cells: Scientific Facts and Fiction”, Academic

Press, 2010.

8. B. Hogan, D. Melton, R. Pedersen, “Essentials of Stem Cells Biology”, Academic Press, 2009.

18

پيشرفته ايمني شناسي سلولي مولکولي Advanced Cellular and Molecular Immunology





: درس هدف

در ، سيستم های ايمنولوژيكمولکولی و ژنتيك توليد آنتی باديها، مکانيسم های خونی یها سلولايمنی و توليد آنتی باديهای مختلف توسط یها پاسخبررسی

.پستانداران، مقايسه در انسان با ساير پستانداران


و نحوه فعال شدن لمفوسيتها و ايجاد آنتی بادی مکانيسم های سيتولوژيك ايمنی هومورال -

RNAو DNA، بررسی مکانيسمهای مختلف در سطح (ها یبادآنتی ) ها پادتنژنتيکی در توليد یآرائ خود -

، تکامل و سازگاری سلولیمنيا خود یها یماريبو TLR ليگاندهای بررسی ساختاری و عملکردی -

، نحوه پيدايش و پاسخ سلولی آناليز ژنتيکی ايمنی ذاتی -

، مکانيسم و عملکرد در تحمل سلولی(تولرانس)و تحمل TIM یها ژن -

التهابی یها پاسخمهار کانيسم سرکوب و التهابی به مواد و ترکيبات خارج سلولی، م یها پاسختحريك -

-MHC یها سلولآنتی ژن به ی عرضه ی نحوهو B وT

، رد پيوند روايمنی شناسی توم، ايمنی شناسی پيوند-

IgEايمنی مرتبط با یها پاسخحساسيت و داختالالت ازديا -

سلولی و مولکولی ، مکانيسم خون ايمنی شناسی انعقاد -



+ + - +

-: بازديد : اصلي منابع

1. A. K. Abbas, A. H. H. Lichtman, , Sh.Pillai , “Cellular and Molecular Immunology”, 8e, Saunders, 2014.

2. J . Owen, J.Punt, Sh. Stranford, “Kuby Immunology” ,7 ed, W. H. Freeman & Company, 2013.

3. D. Male, J. Brostoff, D. Roth, I. Roitt , “Immunolgy”, 8 ed, Saunders, 2012.

4. L. M. Sompayrac, “How the Immune System Works”,4 ed ,Wiley-Blackwell, 2012.

5. F.W. Alt, “Advances in Immunology”, Academic Press, 2006.

19

تمايز سلوليمکانيسم رشد و

Cell Differentiation Mechanism





: درس هدف

.زيستی یها مولکولو بررسی سيگناهای دخيل در اين فرايند و کنترل اين فرايند با استفاده از ريز يوکاريوتی یها سلولرشد و تمايز موثر در مطالعه مکانيسم های


سيگنالهای مرتبط داخل سلول تمايز سلولی،مکانيسم مولکولی در -

اين عوامل کنش برهمو عوامل داخل سلولی، عوامل خارج سلولی، (بنيادی بالغ یها سلولبنيادی جنينی و یها سلول) عوامل موثر در تمايز سلولی -

در تمايز سلولیو ترکيبات طبيعی نوئيدها ينقش رت -

، کورتون ها و مواد ساختگی در تمايز سلولیها هورموناز زيست مواد طبيعی، عوامل رشد، کاربردی استفاده -

در سلول کنترل تمايز سلولی، شناسايی مکانيسم های درگيرنحوه -

و کاربردهای درمانی ها افتيره، بنيادی سرطانی یها سلولتمايز -

و اهميت بالينی کوچك یها مولکولبا استفاده از بنيادی یها سلولدر انواع (Transdifferentiation) دگر تمايزی -

ها چالشو یراهکارهاو کاربرد، و مکانيسم ها سلولسوماتيك به ساير یها سلولتمايز مستقيم -

بنيادی یها سلولتمايز سه بعدی -



+ + - +

-: بازديد

: اصلي منابع1. A.M. Wobus, “Stem Cells”, Springer, 2008.

2. A. Bongso, E.H. Lee, “Stem Cells: From Bench to Bedside”, World Scientific, 2010.

3. M. Kim, “Embryonic Stem Cell Differentiation in Defined Medium”, ProQuest, 2008.

4. H. Saitama, “New Cell Differentiation Research Topics”, Nova Publishers, 2007.

5. K. Roy, “Biomaterials as Stem Cell Niche”, Springer, 2010.

21

سرطان يمولکولسلولي و سميمکان

Cellular and Molecular Mechanism of Cancer





: درس هدف

سلولی و های سميمکان ضمناً . شود یمبررسی گردند یم به سرطان تبديل آنفرايندهای خارج و داخل سلولی که منجر به تغيير سرنوشت سلولی و درس نيدر ا

.گردد یمارائه ندهايفرااين یمولکول


در شرايط مختلف سلولی ها آنبررسی خصوصيات و مکانيسم سرطانزائی مرتبط، یها ژنو باز آرايی یژن ساختار، تومورزا یها روسيوانکوژن ها و -

طبيعی یها بافتدر سلولی ايجاد تومور یها اميپفاکتورهای رشد و -

و مطالعه عملکرد ر و مهار رشدومهارکننده توم یها ژن-

، عوامل خارج و داخل سلولی، آبشارهای داخل سلولی(سلولی شده یزير برنامهمرگ ) اپاپتوزکنترل -

مختلف، یها بافتسرطانی به یها سلول، تهاجم متاستازمکانيسم سلولی و مولکولی -

سرطانی توسط سيستم ايمنی یها سلول، عدم شناخت سرطان درايمنی نقش دستگاه-

(Cell Cycle Check point)، فاکتورها در گير در نقاط بررسی چرخه سلولیکنترل چرخه سلولی -

ضد سرطان یها واکسنتکنولوژی ساخت : آينده یها افقسرطان و -



+ + - +

-: بازديد


1. J. Mendelsohn, P.M. Howley, M. A. Israel, J.W. Gray.” The Molecular Basis of Cancer, 4e, Saunders, 2014 .

2. R. A. Weinberg, “The Biology of Cancer”,2e, Garland Science, 2013.

3. L. Pecorino, “Molecular Biology of Cancer: Mechanisms, Targets, and Therapeutics”, 3e, Oxford, 2012.

4. R. Hesketh,” Introduction to Cancer Biology”, Cambridge, 2013.

5. S. Pelengaris, M. Khan, “The Molecular Biology of Cancer: A Bridge from Bench to Bedside”, Wiley-

Blackwell, 2013.

21

کاربردي وميکس و ژنوميکسئپروت Applied Proteomics and Genomics

-: تعداد واحد عملي

-: حل تمرين

2: تعداد واحد نظري

اختياری: نوع درس -: نياز پيش

:هدف درس

مختلف یها بافتو یها سلولو بررسی پروتئوم از ژنوم، مطالعه ژنوم انواع موجودات، پروتئوم و موارد مربوطه یبردار نقشه، انواع کاربرد اسيدهای نوکلئيك یچگونگ

.و مقايسه حاالت طبيعی و پاتولوژيك

:رئوس مطالب

اهميت پروتئوميکس و ژنوميکس و کاربرد آن -

RNAو DNAعملکرد زيستی اسيدهای نوکلئيك با تکيه بر ساختار -

آپتامرها، ريبوسوئيچ ها و ريبوزيم ها -

ترانس کريپتوم و پروتئوم -

ژنتيکی، مزايا و معايب آن یبردار نقشه یها روشژنتيکی، یبردار نقشه –از ژنوم یبردار نقشه -

فيزيکی، مزايا و معايب آن یبردار نقشه یها روشفيزيکی، یبردار نقشه -

ها روش، مزايا و معايب هر کدام از ها روش، مقايسه DNAتوالی يابی یها روششناخت -

ها آنژنوم های پروکاريوتی، نحوه مطالعه و شناخت -

آن یها روشسنتز و پردازش پروتئوم، -

پروتئوميکس و ارتباط آن با ژنوميکس و بيوانفورماتيك -

انسانی و پزشکی یها یماريبپروتئوميکس، -

:روش ارزيابي

ترم انيم ارزشيابی مستمر پروژه آزمون نهايی

- - + +

ـ: بازديد


1. T. A. Brown, “Genomes three”, Garland Science Pub., 2007.

2. N. C. Mishra, “Introduction to Proteomics: Principles and Applications”, John Wiley and Sons, 2010.

3. A. M. Campbell, L. J. Heyer, “Discovering Genomics, Proteomics & Bioinformatics”, 2nd Edition, Benjamin

Cummings, 2006.

4. F. T. Stathopoulou, “Genome & Proteome in Oncology”, Nova Biomedical, 2005.

5. R. R. Sinden, “DNA: Structure & Function”, Elseiver Science & Technology, 2006.

22

سلول درماني

Cell Therapy





: درس هدف

یها چالش ضمناً.باشد یمسخت درمان یها یماريبمختلف برای درمان یها سلولبا استفاده از پيوند بهبوددهندههدف از اين درس ارائه راهکارهای جديد درمانی و

.گردند یماين روش نيز بررسی


، استفاده از منابع و فاکتورهای مختلفکشت سلول جهت پيوند به بدن -

مرتبط یها شيآزما انجام و یها سلولو ژنتيکی اين ، بررسی آلودگی و ايمنی شناسیشده دادهکشت یها سلولبررسی سازگاری بافتی -

ها روشاين یها چالشو شده ارائهمختلف، مقايسه تکنيکهای یها بافتبه شده دادهکشت یها سلولپيوند یها روش-

مختلف بدن انسان و حيوانات آزمايشگاهی یها بافتپيوند شده به یها سلولفيزيولوژيك و پاتولوژيك و پيگيری بررسی -

تا کنون و مقايسه اين نتايج شده ارائهبررسی نتايج . ...(بافت عصبی، خون، و )بدن یها بافتسلول درمانی -

سلول مصنوعی ، توليد و کاربرد در سلول درمانی -

(العالج صعب)سخت درمان یها یماريبجهت درمان ها سلولانواع ساخت فناوری: آينده یها افقو سلول درمانی -



+ + - +



1. Y. Ikeda, J. Hata, S. Koyasu, Y. Kawakami, Y. Hattori, “Cell Therapy”, Springer London, Limited, 2012. 2. E.V. Greer, “Stem Cell Therapy”, Nova Publishers, 2006.

3. J. F. Stoltz, “Regenerative Medicine and Cell Therapy”, IOS Press, 2012.

23

سلولي مولکوليزيست شناسي مباحث ويژه

Special Topics in Cellular and Molecular Biology





: درس هدف

کالسـيك ارائـه نگرديـده یهـا درسدر اين درس کليه موضـوعات نـوين کـه در .اخير در علوم سلولی مولکولی با توجه به زمينه و نياز دانشجويان یها شرفتيپبررسی

. گردد یماست با توجه به نياز روز دانشجويان و در راستای مرزهای دانش و فناوری ارائه


از شيپ ديسرفصل درس با. شود یممختلف و مرتبط و بر اساس تشخيص گروه آموزشی و فراخور نيازها اين درس ارائه یها نهيزمعلمی در یها شرفتيپبر اساس

.برسد ای تحصيالت تکميلی بخششور دييتأو به هيتوسط استاد درس ته یليتحص مساليشروع ن



+ + - +

-: بازديد


.آخرين مطالب مرتبط با علوم سلولی و مولکولی و مجالت مرتبط

24

مولکولي يساز هيشبو ها مولکولدرشت بيوفيزيک

Macromolecular Biophysics and Molecular Simulation





: درس هدف

حيـاتی و یهـا مولکـول درشـت ، در اين درس کليه موضوعات مرتبط با اخير در علوم سلولی مولکولی با توجه به زمينه و نياز دانشجويانمولکولی یها شرفتيپبا توجه

.رديگ یممورد مطالعه قرار ها سلولدر ها آن یريکارگ بهدانش


(ها یچربو ها نيپروتئاسيدهای نوکلئيك، ) حياتی یها مولکولزيستی، درشت یها طيمحبررسی نيروهای مولکولی در -

ها مولکولدرشت ختهير درهممکانيسم انتقال بين ساختارهای منظم و -

(X-Ray, NMR) ها مولکولزيستی درشت یساختارهاتجربی تعيين یها روش-

مختلف در عرصه سلولی یها تيفعال، پايداری زيستی و ها مولکولمکانيك درشت -

در عرصه تحقيقات سلولی یا انهيرا یساز مدل، ها آن کنش برهماسيدهای نوکلئيك، ساختارهای مختلف و -

در عرصه تحقيقات سلولی یا انهيرا یساز مدل، ها آن کنش برهم، ساختارهای مختلف و ها نيپروتئ -

در عرصه تحقيقات سلولی یا انهيرا یساز مدل، ها نيپروتئبا خود و ها آن کنش برهم، ساختارهای مختلف و ها یچرب -

ها مولکولنظری در پيشگويی ساختار و عملکرد درشت یها روشو ، طراحییساز هيشب-

تشابهات و تنوعات طراحی شيميايی، اپيلوگ، (مونته کارلو) یساز هيشبتکنيکهای -



+ + - +

-: بازديد


1. D. Herschlag, “Biophysical, Chemical, and Functional Probes of RNA Structure, Interactions and Folding”,

Academic Press, 2009.

2. N. M. Allewell, L. O. Narhi, I. Rayment, “Molecular Biophysics for the Life Sciences”, Springer Science &

Business Media, 2013.

3. O. M. Becker, et al., “Computational Biochemistry and Biophysics”, CRC Press, 2010.

4. N Igor, et al., “Methods in Molecular Biophysics: Structure, Dynamics, Function”, Cambridge University

Press, 2007.

5. T. Schlick, “Molecular Modeling and Simulation: An Interdisciplinary Guide: An Interdisciplinary Guide”,

Springer Science & Business Media, 2010.

25

.

(6378)وزارت علوم یزير برنامهسلولی مولکولی با دروس شورای عالی یشناس ستيزدوره دکتری رشته دروس تطبيق -4جدول

برنامه )عنوان درس فعلی

(قديم

نوع ) حاتيتوض عنوان درس جديد

(راتييتغ

دياسات اينام استاد

کننده هر نيتدو

درس

و یمرتبه علم

تخصص

استادان/ امضاء استاد

یمولکول یشناس ستيز

پروکاريوت ها شرفتهيپ

- - - حذف درس -

یمولکول یشناس ستيز

يوکاريوت ها شرفتهيپ


سلولی یشناس ستيز

6يوکاريوتی



2يوکاريوتی



مولکولی سرطان

مکانيسم سلولی مولکولی

سرطان

تغيير محتوای درسی

و سرفصل درس،

درس از الزامی به

اختياری تغيير يافته

.است

دکتر رهگذر، دکتر

قائدی، دکتر

اسماعيلی

استاديار

،(هماتولوژی)ژنتيك ) دانشيار

، (سلولی مولکولی

زيست ) دانشيار

،(شناسی مولکولی

تغيير محتوای درسی مهندسی ژنتيك تکميلی مهندسی ژنتيك تکميلی

سرفصل درس و

دکتر قائدی، دکتر

اسماعيلی، دکتر

زاده امام

دانشيار، دانشيار،

(بيوشيمی) استاديار

دکتر اسماعيلی، درس جديد تنظيم بيان ژن -


رهگذر، دکتر

زاده امام


، استادياراستاديار

سلولی یشناس ستيز -

ساختاری

اسماعيلی، دکتر درس جديد


رهگذر


استاديار

ی مولکول یشناس ستيز -

ژنوم

دکتر قائدی، دکتر درس جديد


جوادی، دکتر

زاده امام


زيست ) استاديار

، (شناسی مولکولی

استاديار

زيست پزشکی سلولی و ژنتيك مولکولی پزشکی

مولکولی

دکتر رهگذر، دکتر تغيير محتوا و عنوان


اسماعيلی

دانشيار، ،استاديار

دانشيار

مولکولی یشناس ستيز

ميتوکندری و کلروپالست

دکتر قائدی، دکتر تغيير محتوا و عنوان اندامك ها یشناس ستيز


رهگذر


استاديار

زيست فناوری سلولی بيوتکنولوژی مولکولی

مولکولی

دکتر اسماعيلی، تغيير محتوا و عنوان

دکتر قائدی

دانشيار، دانشيار

26

بيوفيزيك ماکرومولکولها و

یساز مدل

درشت بيوفيزيك

یساز هيشبو ها مولکول

مولکولی

دکتر قائدی، دکتر تغيير محتوا و عنوان

اسماعيلی

دانشياردانشيار،

کشت سلول و بافت کشت سلول و بافت

پيشرفته

دکتر اسماعيلی، تغيير محتوا و عنوان

دکتر قائدی


یسلول یشناس یمنيا

ی مولکول

یسلول یشناس یمنيا

ی پيشرفتهمولکول

دکتر رهگذر، دکتر تغيير محتوا و عنوان


اسماعيلی

دانشيار، ،استاديار

دانشيار

مکانيسم های رشد و تمايز مکانيسم سلولی رشد و نمو

سلولی



رهگذر


استاديار

مهندسی پروتئين و مهندسی پروتئين

سلولی یساز مدل

،یائياول ريدکتر م تغيير محتوا و عنوان

زاده، دکتر دکتر امام



قائدی

استاديار، دانشيار،

دانشيار، استاديار،

استاديار

یشناس ستيزمباحث ويژه مباحث ويژه

سلولی مولکولی


اسماعيلی


- - - حذف درس - ها روسيوژنتيك

- - - حذف درس - ژنتيك عملیمهندسی

غشاها و یشناس ستيز

ترابری سلولی


- - - حذف درس - سيتوشيمی پيشرفته

مولکولی یشناس ستيز

گياهی


- - - حذف درس - ژنتيك قارچ ها

- - - حذف درس - ميکروسکوپ الکترونی

یها سلولمهندسی بافت و -

بنيادی

دکتر اسماعيلی، جديد درس

دکتر قائدی


پروتئوميکس و ژنوميکس -

کاربردی

،یائياول ريدکتر م درس جديد

زاده، دکتر دکتر امام



قائدی

دانشيار، استاديار،

استاديار، دانشيار،

دانشيار

دکتر رهگذر، دکتر درس جديد سلول درمانی -


اسماعيلی

استاديار، استاديار،

دانشيار

Documents

عنوان فارسي درس (تيتر 14)ui.ac.ir/Dorsapax/userfiles/Sub16/Syasatgozari... · 2 يلاعتهمسب:همدقم.دزادرپیم یلوکلوم حطس رد لولس