10
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ФОРМЫ ДНК Рычакова Жанна Гусева Ульяна

конформационные формы днк

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: конформационные формы днк

КОНФОРМАЦИОННЫЕ ФОРМЫ ДНК

Рычакова Жанна

Гусева Ульяна

Page 2: конформационные формы днк

2

Параметры спиралей

Закрученность: правая/левая Количество пар оснований на виток Шаг спирали Диаметр спирали Угол между плоскостями оснований и

осью спирали Коформация гликозидной связи Конформация дезоксирибозы.

Page 3: конформационные формы днк

3

Z-форма ДНК

Левозакрученная спираль с длиной витка 4,4 нм, на который приходится 12 нуклеотидных пар

Page 4: конформационные формы днк

4

Чередование конформаций оснований в Z-ДНК

В каждой из комплементарных нитей Z-ДНК происходит чередование син- и анти-конформаций нуклеотидных звеньев, а в каждой паре оснований одно всегда находится в син-конформации относительно гликозидной связи, другое - в анти-конформации.

У гуанозина сахар находится в С3'-эндо-конформации, основание - в син-ориентации 

Page 5: конформационные формы днк

5

С-форма ДНК

Число пар оснований на виток составляет 9,33

Дезоксирибоза имеет конформацию С3'-экзо 

Выявлена у ряда вирусов и в составе надмолекулярных структур хроматина

Участвует в хранении информации.

Page 6: конформационные формы днк

6

D-форма ДНК

Природные ДНК не образуют двойных спиралей D-типа

Фуранозные кольца находятся в конформации С3'-экзо Poly(dA-dT)*poly(dA-dT)

Page 7: конформационные формы днк

7

T-ДНК

ДНК фага Т2 - единственная из известных природных ДНК, находящаяся в D-форме.

Page 8: конформационные формы днк

8

Page 9: конформационные формы днк

9

eDNAextracellular DNA or environmental DNA

Extracellular- биопленки

Environmental- определение наличия или отсутствия организма

Page 10: конформационные формы днк

10

Список использованной литературы

Мокульский М.А. , Капитонова К.А. , Мокульская Т.Д. Вторичная структура ДНК фага Т2, Мол. биол. , 6 ( 1972 ).

«Англо русский толковый словарь генетических терминов». Арефьев В.А., Лисовенко Л.А., Москва: Изд во ВНИРО, 1995 г

Life after death: the critical role of extracellular DNA in microbial biofilms N.S. Jakubovics1,*, R.C. Shields1, N. Rajarajan2 and J.G. Burgess2

Structural Stability of Burkholderia cenocepacia Biofilms Is Reliant on eDNA Structure and Presence of a Bacterial Nucleic Acid Binding Protein Novotny, Laura A.; Amer, Amal O.; Brockson, M. Elizabeth; Goodman, Steven D.; Bakaletz, Lauren O.

http://www.environmental-dna.nl/en-us/environmentaldna.aspx