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现代生物技术试验四 绿色荧光蛋白工程菌株的构建与表达调控 黄绍松. 实验目的. 掌握 质粒 DNA 的分离纯化、酶切连接、电泳分析,感受态的制备,质粒的热激转化与电击转化,转化子的筛选与目的基因的诱导表达 等一系列分子生物学基础实验方法 通过实验深入理解实验原理和相关理论 充分理解操纵子模型在表达调控中的作用机理 在实验体会掌握实验过程的安排与控制,微量操作和避免污染在分子生物学实验中的重要性。. 实验原理 在体外用酶学方法将不同来源的 DNA 进行切割、连接,组成一个新的 DNA 分子 (DNA 重组 ) ; - PowerPoint PPT Presentation
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现代生物技术试验四 绿色荧光蛋白工程菌株的构建与
表达调控
黄绍松
实验目的• 掌握质粒 DNA 的分离纯化、酶切连接、电泳
分析,感受态的制备,质粒的热激转化与电击转化,转化子的筛选与目的基因的诱导表达等一系列分子生物学基础实验方法
• 通过实验深入理解实验原理和相关理论• 充分理解操纵子模型在表达调控中的作用机理• 在实验体会掌握实验过程的安排与控制,微量
操作和避免污染在分子生物学实验中的重要性。
实验原理 在体外用酶学方法将不同来源的 DNA进行切割、连接,组成一个新的 DNA分子 (DNA重组 ) ;
将重组 DNA分子导入到合适的受体细胞中,使其扩增和繁殖,以获得大量的同一目的 DNA分子 ( 基因克隆 ) ;
目的基因在受体细胞、重组载体和外界因素的共同作用下表达,达到大量生产其编码的保持生物活性的蛋白质或实现受体细胞新的生物学特征的目的的过程(基因工程)。
主要内容及实验流程
含 gfp 基因的
菌 株 A CT-gfp
具有表达元件质粒的菌株 B pEV-32
质粒提取电泳检测
质粒纯化酶切 ,获 得 gfp 基因
回收 gfp 基因片段
质粒提取电泳检测
质粒纯化酶切获得插入缺口
回收能插入外源片段的表达载体 V
片段的连接 gfp+V=pEV-gfp
大肠杆菌 DH5-a
挑取单菌落过夜培养
液体接种培养4-6小时
氯化钙处理制备感受态
热激转化,筛选
转化子的鉴定与诱导表达
实验过程控制
1. 试剂,耗材清洗灭菌,培养基的制备 4h
2. 三株菌的活化培养 过夜 :12h
3. 质粒提取纯化、电泳检测 4h
4. 感受态的制备 3h
5. 质粒的酶切 过夜
6. 酶切片段的电泳分离与回收 3h
7. 筛选与诱导表达培养基的制备 4h
8. 回收片段的连接 过夜
9. 热激转化 2h
10. 转化子的筛选 12h
11. 诱导表达与鉴定 12~16h
第一天
第二天
第三天
第四天
第五天
具体操作参见1. 分子生物学实验指导 刘进元 张淑平 武耀廷 第二
版(教材)基础实验部分2. 分子克隆实验指南 J. 萨姆布鲁克 D.W 拉塞尔
主编 黄培堂译 p1~103 1564~1616
3. 关于蛋白结构、质粒图谱查阅网址:www.ncbi.nlm.gov
4. 各种试剂性能特征参见 ;www.biosupplynet.com
5. 试剂盒及各种酶在使用之前请详细阅读其附带的说明书
实验的理想结果
转化前 转化后
DNA重组基本过程
表达载体 目的基因构建的表达质粒
1 、获取片段及重组
TTT
TAAA A
ligase
TTAA TTAA
AATT
“ ”退火
AATT
2 、转化
(转化到宿主细胞中 如E. coli)
宿主细胞染色体DNA
重组质粒
重组质粒
3 、筛选
筛选含有重组质粒的菌株
宿主细胞染色体DNA
重组质粒
含有外源DNA “ ”的 工程菌
4 、表达及表达产物的纯化
表达产物分离纯化表达产物分离纯化
DNA重组基本程序包括下列过程
分—获取目的基因和载体
切— 使用工具酶把目的基因和载体切割成可连接的片段
接—目的基因与载体的连接
转—重组 DNA导入宿主细胞
筛—重组 DNA的筛选与鉴定
表—目的基因在受体细胞内的表达
一、目的基因的获取(分)目的基因
是指所要研究或应用的基因,也是需要克隆或表达的基因。
目的基因来源 1 ) 制备基因组 DNA
2 ) 制备 cDNA
3 ) 聚合酶链反应
4 ) 人工合成基因
(一)制备基因组 DNA(基因文库)分离、纯化基因组 DNA 条件:温和,在 EDTA 或 SDS等存在下
↓ RE 用蛋白酶 K 消化细胞、酚抽提
大小不同酶切片段 片段分离:常用蔗糖梯度或电泳分离
↓
分别与同样 RE消化的载体连接 常用噬菌体载体或质粒载体
↓ DNA连接酶连接。
导入细胞 进入宿主细胞内培养扩增。
↓
筛选鉴定 用分子杂交、凝胶电泳
等方法鉴定。
(二)制备 cDNA ( cDNA文库)( 1 )合成 cDNA 第一条链
反应体系只有 mRNA 、逆转录酶、 4 种 dNTP 、引物。
引物是与 mRNA3ˊ 端 polyA 互补的寡聚 dT( 12~ 18dT 片段)
( 2 )合成 cDNA 第二条链
RNase 去掉模板 mRNA
( 3 )构建 cDNA 文库
① cDNA 两端加接头或衔接头
接头是人工合成的双链寡核苷酸两端平头,含有限制酶切位点。
衔接头是另一种人工合成的双链寡核苷酸一端平头,另一端为粘性末端。
② cDNA 与载体相连。
③ 导入宿主细胞进行克隆,这些菌体内保存 cDNA 集合体便是 cDNA文库。
(二)制备 cDNA ( cDNA 文库) 分离目的基因 的 mRNA
逆转录生成 cDNA单链
水解去除 mRNA,
合成 cDNA双链
水解回折处单链得到平端双链 cDNA
导入宿主细胞克隆 , 构建 cDNA文库
(三)聚合酶链反应 ( PCR)
在模板 DNA、引物、 dNTP、 TaqDNA聚合酶等条件下,体外经 94℃ 变性、 54℃ 退火及 72℃ 延伸 3 个步骤的反复多次循环( 2530次),扩增目的基因。
(四)人工合成基因
引用 DNA测序仪测出某一基因的碱基序列,或根据某一蛋白质的氨基酸组成反推核苷酸序列,再用 DNA 合成仪通过化学合成原理合成目的基因。
一般先合成短片断 DNA,然后再拼接成长片段。
二、 目的基因与载体的连接(接)
(主要有以下 4 种连接方式)
1) 粘性末端连接
2 ) 平头末端连接
3 ) 人工接头法
4 ) 同源多聚尾连接法
(一) 粘性末端连接
将目的基因和载体用同一种限制酶酶切,产生
相同粘性末端,再通过 DNA连接酶作用将两者连接起来,构成重组 DNA分子。
(二)平头末端连接
某些限制酶只能将目的基因和载体 DNA切割成
平端,此时在 T4DNA连接酶的作用下同样能连接起
来。
(三) 人工接头法
合成连接子→与 DNA平头末端连接→限制酶切割 , 产生粘性末端→连接,构建重组 DNA。
(四)同源多聚尾连接法
三、重组 DNA导入宿主细胞(转) 无性繁殖 体外重组后的 DNA导入受体细胞,形成转化子。然后随受体细胞生长、增殖,使重组 DNA发生复制、扩增,这一过程称为无性繁殖。
克隆 从上述无性繁殖细胞中进一步筛选出含目的 DNA的重组体分子即为无性繁殖系或克隆。
宿主细胞 进行无性繁殖时所采用的受体细胞 .
重组 DNA导入宿主细胞的类型转化 以质粒作载体构建的重组体导入受体细胞的过程;转染 以病毒作载体构建的重组体导入受体细胞的过程;转导 以噬菌体作载体构建的重组体导入受体细胞的过程。
感受态细胞 用特殊方法处理后,受体细胞才具备接受外源 DNA 的能力, 这种细胞称感受态细胞。 感受态细胞有原核细胞和真核细胞两大类。
四、重组 DNA 的筛选与鉴定(筛)
(筛选含重组体的阳性菌落,一般有下列几种方法)
1 ) 平板筛选
2 ) 限制酶切图谱筛选
3 ) PCR 筛选重组体
4 ) 原位杂交技术
插入失活
蓝-白筛选
(一) 平板筛选 是指利用载体的遗传性标记直接筛选的方
法。
如,具有抗药性标记的载体,转化宿主细胞后,能
在含抗生素( Amp 或 Tet )的培养平板上生长;未转
化的则不能生长。
1. 插入失活
当外源 DNA 序列插入质粒中某一抗药基因内,使
该基因失活,转化细胞就不能生长在含相应抗生素的
培养平板上。
抗生素平板筛选(插入失活)
( 2 )蓝 - 白筛选 它是一种利用蓝色化合物的形成作为指示剂的筛选方法,筛选含有编码 β-半乳糖苷酶的基因。 载体:编码 β-半乳糖 宿主: 编码 β-半乳糖 苷酶 N 端序列 苷酶 C 端序列
α-互补
细菌表达: β-半乳糖苷酶活性蛋白↑
5- 溴 -4- 氯 -3-吲哚( X-gal ) → 形成蓝色菌落
当在质粒中插入外源 DNA→β-半乳糖苷酶的 N 端基因失活→不能与宿主 β-半乳糖苷酶的 C 端进行 α-互补→产生白色菌落。
( IPTG 存在下)
蓝-白筛选示意图
2. 限制性内切酶图谱鉴
3. PCR筛选重组体 抽提少量重组 DNA→PCR扩增→电泳鉴定→序列分析。
4. 原位杂交技术
五、重组体在宿主细胞中的表达和调控
基因工程的最终目的是通过载体将外源基因导入合适的宿主细胞中高效表达,产生有重要价值的蛋白质产品。 克隆基因表达有三个条件⑴ 基因的编码区不能被插入序列所中断 ;
⑵ 基因转录要有启动子,而启动子必须能被宿主 细胞的 RNA聚合酶有效地识别 ;
mRNA⑶ 必须相当稳定,并有效地被翻译,产生的外 源蛋白质必须不为宿主细胞的蛋白酶所降解。
基因工程生产胰岛素的原理(示意图)
三、制备基因工程疫苗 基因工程疫苗可以帮助解决传统技术难以解决的 一些特殊的病原体疫苗。如,( 1 ) 乙型肝炎病毒疫苗( HBV)、丙型肝炎病毒疫 苗( HCV)等;( 2 ) 有诱发致癌或产生免疫病理作用的疫苗,如人 T 细胞免疫缺陷病毒( HITV-1)等;( 3 ) 常规效果较差的疫苗,如霍乱和痢疾疫苗等( 4 ) 制备一些多价疫苗等。
四、改良物种特性
动物药厂通过转基因动物生产感兴趣的基因
↓把 YFG放在 β—乳球蛋白的启动子下
↓注入羊卵细胞→植入借腹怀孕的母羊体内
↓YFG 在乳腺中表达
↓乳汁中提纯 YFG 蛋白。
1. 分离体细胞
( 先 处 于 “ 饥饿”的“静止状态”) →使“关闭”的基因全部“打开”。
2. 植入去核的卵细胞中→胚胎细胞
3. 将胚胎细胞植入寄养母体内。
五、动物克隆