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第十章 DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

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第十章 DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA). 第一节 DNA 复制的特点 第二节 DNA 复制的条件 第三节 DNA 生物合成过程 第四节 DNA 的损伤与修复 第五节 反转录作用. DNA 是由四种脱氧核糖核酸所组成的长链大分子,是遗传信息的携带者。生物体的遗传信息就贮存在 DNA 的四种脱氧核糖核酸的排列顺序中。 - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

第十章 DNA 的生物合成 (Biosynthesis of DNA)

第一节 DNA 复制的特点

第二节 DNA 复制的条件

第三节 DNA 生物合成过程

第四节 DNA 的损伤与修复

第五节 反转录作用

Page 2: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

•DNA 是由四种脱氧核糖核酸所组成的长链大分子,是遗传信息的携带者。生物体的遗传信息就贮存在 DNA的四种脱氧核糖核酸的排列顺序中。•DNA 的复制 : 指以原来 DNA 分子为模板合成出相同分子的过程。 DNA 通过复制将遗传信息由亲代传递给子代;通过转录和翻译,将遗传信息传递给蛋白质分子,从而决定生物的表现型。 •DNA 复制时每个子代 DNA 分子的一条链来自亲代 DNA,另一条链是新合成的,这种复制方式称半保留复制。 •意义:半保留复制说明 DNA 在代谢上的稳定性。经过许多代的复制, DNA 链仍可保持完整,这在生物的遗传上是十分重要的。•DNA 的复制、转录和翻译过程就构成了遗传学的中心法则。

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DNA dependent DNA polymerase——DDDPDNA dependent RNA polymerase——DDRPRNA dependent RNA polymerase——RDRPRNA dependent DNA polymerase——RDDP

Page 4: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

在 RNA 病毒中,其遗传信息贮存在 RNA

分子中。因此,在这些生物体中,遗传信息

的流向是 RNA 通过复制,将遗传信息由亲代

传递给子代,通过反转录将遗传信息传递给

DNA ,再由 DNA 通过转录和翻译传递给蛋白

质,这种遗传信息的流向就称为反中心法

则。

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第一节 DNA 复制的特点一、半保留复制 DNA 在复制时,以亲代 DNA 的每一股作模板,合成完全相同

的两个双链子代 DNA ,每个子代 DNA 中都含有一股亲代 DNA 链,这种现象称为 DNA 的半保留复制 (semi-conservative replication) 。

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DNA 以半保留方式进行复制,是在 1958 年由

M. Meselson 和 F. Stahl 所完成的实验所证

明。该实验首先将大肠杆菌在含 15N 的培养基中

培养约十五代,使其 DNA 中的碱基氮均转变为

15N 。将大肠杆菌移至只含 14N 的培养基中同步

培养一代、二代、三代。分别提取 DNA ,作

CsCl 密度梯度离心,可得到下列结果:

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DNA 在复制时,需在特定的位点起始,这是一些具有特定核苷酸排列顺序的片段,即复制起始点。

细菌的 Ori C 结构特点: 串联重复序列 (tandem repeat):A-T 回文结构 (palindrome)

二、有一定的复制起始点、复制子和方向( 1)复制起始点 (Ori C)

A--TA--GTGT AATAGGT--TDnaA

在原核生物中,复制起始点通常为一个,而在真核生物中则为多个。最早研究 DNA 复制起点和方向的是 J.Cairns ( 1963 年)。

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Replication Fork

DNA 复制时,局部双螺旋解开形成两条单链,这种叉状结构称为复制叉。

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基因组能独立进行复制的功能单位称为复制子

(replicon),每个复制子都含有控制复制起始的起点

(origin),可能还有终止复制的终点 (terminus)。每个起

始点产生两个移动方向相反的复制叉,复制完成时,复

制叉相遇并汇合连接。习惯上把两个相邻起始点之间的

距离定为一个复制子。

( 2 )复制子

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DNA 复制时,以复制起始点为中心,向两个方向进行复制 . 但在低等生物中 , 也可进行单向复制(如滚环复制)

①. 原核细胞:染色体和质粒 固定起点 真核细胞:细胞器 DNA 双向复制, 环状 DNA 复制形成 θ 形结构。②. 真核生物:染色体 DNA ,复制时多个起始点。

( 3 )复制方向

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θ 型

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单向复制i

双向复制

观察到的放射自显影图象

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单链环状 DNA 主要采用滚环式复制

5′

3′

5′3′

5′

① 滚环式复制是某些低等生物的复制形式.

② 在入侵细胞后,病毒在胞内的繁殖方式(复制型)为双链 DNA ,环状双链 DNA 受有核酸内切酶活性的 A 蛋白作用,在复制起始点打开一个缺口,形成有 3 ,- OH 和 5 , -P的开环单链.

③ 复制不需引物而在开链的 3 , -OH 延伸,保持闭环的对应单链为模版,一边滚动一边进行连续的复制.

④ 滚动的同时,外环 5 ,端逐渐离环向外伸出.完成一次复制后, A 蛋白把母链和子链切断,外环母链再重新滚动一次, 3 ,端沿母链延长,最后合成两个子双环.

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D 环复制 ① D 环复制是线粒体 DNA ( mtDNA )的复制形式.

② 复制时需要合成引物.

③mtDNA 为双链,第一个引物以内环模板延伸.

④ 至第二个复制起始点时,又合成另一个反向引物,以外环为模板进行反向的延伸.

⑤ 复制中呈字母 D 形状而得名.

⑥ D 环复制的特点:复制起始点不在双链 DNA 同一位点,内、外环复制时序有差异.

⑦ 真核生物的 DNA-pol γ 是线粒体催化 DNA 复制的 DNA 聚合酶.

⑧ mtDNA 容易发生突变,损伤后的修复又较困难.

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真核生物 DNA 的多起点复制

Page 19: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

三、需要引物 参与 DNA 复制的 DNA 聚合酶,必须以一段具有 3’

端自由羟基( 3’-OH )的 RNA 作为引物 (primer) ,才能开始聚合子代 DNA 链。

RNA 引物的大小,在原核生物中通常为 50 ~ 100 个

核苷酸,而在真核生物中约为 10 个核苷酸。 RNA 引物的碱基顺序,与其模板 DNA 的碱基顺序相配对。

四、双向复制 DNA 复制时,以复制起始点为中心,向两个方向进行

复制。但在低等生物中,也可进行单向复制(如滚环复制)。

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五、半不连续复制(( semidiscontinuous replicationsemidiscontinuous replication ))

由于 DNA 聚合酶只能以 5’→3’ 方向聚合子代 DNA 链,即模板 DNA链的

方向必须为 3’→5’ 。因此,分别以两条亲代 DNA 链作为模板聚合子代 DNA链

时的方式是不同的。

定义:在定义:在 DNADNA 复制过程中,复制过程中,亲代亲代 DNADNA 分子中以分子中以 3’3’→→5’5’ 方向的母链作为方向的母链作为模板指模板指

导导新的链以新的链以 5’5’→→ 3’3’ 方向连续合成方向连续合成 ;; 另一股以另一股以 5’5’→→ 3’ 3’ 为方向的母链则为方向的母链则指指

导新合成导新合成的链以 的链以 5’5’→→ 3’3’ 方向合成方向合成 1000—20001000—2000 个核苷酸长度的许多不连个核苷酸长度的许多不连续续

的片段(岗的片段(岗崎片段)崎片段)。这种复制方式称之为。这种复制方式称之为半不连续复制半不连续复制。。

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PPPOH + OH

PPP

OHPPP

PPPOHOH + P

DNA 合成方向不可能是 3′→5′ 的解释

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5’5’

5’3’3’

3’3’

5’5’

5’5’

3’3’

3’3’

5’5’

5’5’

3’3’

3’3’

前导链前导链

随从链随从链

岗崎片段岗崎片段

半不连续复制半不连续复制

以 3'→5' 方向的亲代 DNA 链作模板的子代链在复制时基本上是连续进行的,其子代链的聚合方向为 5'→3' ,这一条链被称为领头链 (leading strand) 。而以 5'→3' 方向的亲代 DNA 链为模板的子代链在复制时则是不连续的,其链的聚合方向也是 5'→3' ,这条链被称为随从链 (lagging strand)。

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前导链:在引物的 3’ 端按 5’→3’ 方向连续不断地合成的 DNA 链。

随从链:在引物的 3’ 端按 5’→3’ 方向不连续合成的 DNA 链。

冈崎片段:随从链上不连续合成的 DNA 短片段(不包括引物)

由于亲代 DNA 双链在复制时是逐步解开的,因此,随从链的合成是一段一段的。 DNA 在复制时,由随从链所形成的一些子代 DNA短链称为冈崎片段 (Okazaki fragment) 。 冈崎片段的大小,在原核生物中约为 1000 ~ 2000 个核苷酸,而在真核生物中约为 100 个核苷酸。

Page 24: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

第二节 DNA 复制的条件一、底物 以四种脱氧核糖核酸 (deoxynucleotide triphosphate) 为底物,即 dATP, dGTP, dCTP, dTTP。

二、模板 (template) DNA 复制是模板依赖性的,必须要以亲代 DNA 链作为模板。亲代 DNA 的两股链解开后,可分别作为模板进行复制。

Page 25: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

三、引物酶 (primase) 、引发体 (primosome) 、引 发前体和 RNA 引物

DNA 聚合酶只能在引物的 3’- 末端起始 DNA 链合成,合成

这些引物的酶统称为引物酶。

引发体 (primosome):

引发体由引物酶( primase )与引发前体组装而成的复合

物,催化引物 RNA 的合成。由引发前体六种蛋白( dnaB, dnaC, I, n,

n’, n” )组成。

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引物酶本质: DDRP Ecoli : 60kD , DnaG 编码)引发体 (primosome)

引物酶

引发前体 i 、 n 、 n” 、 dnaC n’ 、 dnaB

5´RNA primer

5´ 3´

5´3´

DnaA

5´ 3

3´ 5´primase

DnaC

primosome

Helicase(DnaB)

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引发前体是由若干蛋白因子聚合而成的复合体。在原核生物

中,引发前体至少由六种蛋白因子构成。蛋白 i(DnaT) 、蛋白

n(PriA) 、蛋白 n”(PriC) 、蛋白 dnaC 与引物预合成有关,蛋白

n’ (PriB) 与蛋白 dnaB 与识别复制起始点有关,并具有

ATPase 活性。   引物酶本质上是一种依赖 DNA 的 RNA 聚合酶 (DDRP) ,该

酶以 DNA 为模板,聚合一段 RNA 短链引物 (primer) ,以提供

自由的 3'-OH ,使子代 DNA 链能够开始聚合。

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四、 DNA 聚合酶 (DDDP)

( 一 )共同性质

•以 dNTP 为前体催化合成 DNA•需要模板和引物的存在•不能起始合成新的 DNA链•催化 dNTP 加到生长中的 DNA链的 3’-OH末端

•催化 DNA合成的方向是 5’→3’

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(二)种类和生理功能1. 原核生物的 DNA 聚合酶 在原核生物中,目前发现的 DNA 聚合酶有三种,分别命名为

DNA 聚合酶Ⅰ (polⅠ) , DNA 聚合酶Ⅱ (polⅡ) , DNA 聚合酶

Ⅲ(pol Ⅲ) ,这三种酶都属于具有多种酶活性的多功能酶。参与

DNA 复制的主要是 polⅠ和 pol Ⅲ。 polⅠ为单一肽链的大分子蛋白质,可被特异的蛋白酶水解为

两个片段,其中的大片段称为 Klenow fragment ,具有 5’→3’

聚合酶活性和 3’→5’ 外切酶的活性。

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3’ 5’ 5’ 3’3’ 5’ 5’ 3’ 外切酶 聚合酶外切酶 聚合酶

NN CC 5’ 3’5’ 3’外切酶外切酶

小片段小片段 大片段( 大片段( klenowklenow 片段)片段)

切除切除 RNARNA 引物引物损伤修复损伤修复 校读功能校读功能

((常用的工具酶)常用的工具酶)

(1) DNA(1) DNA 聚合酶Ⅰ(聚合酶Ⅰ( DNA DNA PolymeraseⅠPolymeraseⅠ))

聚合功能聚合功能

• KornbergKornberg 酶(酶( 19561956 年)年)• 100 个酶分子 /每个细胞• 单链多肽( 109kD )• 大小二个片段 (枯草杆菌蛋白酶处理)

34kD 76kD

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5’-3’聚合酶活性•模板•引物-3’-OH

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DNA 聚合酶的校对功能

聚合酶

错配硷基

复制方向

正确

核苷酸

5´ 5´ 5´3´ 3´ 3´

切除错配核苷酸

3’-5’ 外切酶活性

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5'→3' 外切酶活性

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• 从 5’-P端依次切除,可连续切除• 只切配对的 5’-P末端核苷酸• 既可切除脱氧核苷酸也可切除核苷酸

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(2) 大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅱ (DNA polⅡ)

• MW 为 120KD• 100 个酶分子 /每个细胞•聚合作用 :只有 DNA polⅠ的 5%• 3’→5’外切酶活性•无 5’→3’外切酶活性。•对作用底物的选择性较强,•不是复制的主要聚合酶

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(3)pol Ⅲ: 由十种共 22个亚基组成• α亚基具有 5’→3’聚合 DNA 的酶活性• ε 亚基具有 3’→5’外切酶的活性• θ 亚基具有促进 ε亚基外切酶的活性

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大肠杆菌三种 DNA 聚合酶特性比较DNA

聚合酶Ⅱ

分子量每个细胞的分子统计数

5’-3 ’ 聚合酶作用

3’-5’ 核酸外切酶作用

5’-3’ 核酸外切酶作用

转化率

生理功能

DNA聚合酶Ⅰ

DNA 聚合酶Ⅲ(复合物)

109 , 000

400

+

+

+

1

去除引物填补缺口修复损伤校正错误

120 , 000

100

+

+

-

0 .05

未知

400 , 000

10-20

+

+

+

50

DNA 复制校正错误

比较项目

Page 40: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

2. 真核细胞的 DNA 聚合酶

• 五种五种• DNADNA 聚合酶聚合酶 αα• DNADNA 聚合酶聚合酶 δδ 和和 PCNAPCNA• DNADNA 聚合酶聚合酶 γγ• DNADNA 聚合酶聚合酶 ββ 、、 εε

• 参与随从链的合成参与随从链的合成• 参与前导链的合成参与前导链的合成• 参与线粒体参与线粒体 DNADNA 的合成的合成• 参与参与 DNADNA 的修复的修复

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真核细胞几种主要 DNA 聚合酶的性质

DNA 聚合酶 α β γ δ ε

蛋白质分子量( KD ) > 250 36-38 160-300 170 256

细胞定位 核 核 线粒体 核 核5’ →3’ 聚合酶 有 有 有 有 有3’ →5’ 外切酶 无 无 有 有 有引物酶 有 无 无 无 无

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DNA 连接酶

五、 DNA 连接酶 DNA 连接酶 (DNA ligase) 可催化两段 DNA片段之间磷酸二

酯键的形成,而使两段 DNA 连接起来。

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DNA 连接酶催化的条件是:

① 需一段 DNA片段具有 3'-OH ,而另一段 DNA片段具有 5'-Pi基;

② 未封闭的缺口位于双链 DNA 中,即其中有一条链是完整的;

③ 需要消耗能量,在原核生物中由 NAD+供能,在真核生物中由 ATP供能。

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六、解螺旋酶 (unwinding enzyme/ helicase/ rep 蛋白)

解螺旋酶( unwinding enzyme ),又称 DNA解链酶 (DNA helicase)或

rep 蛋白,是用于解开 DNA 双链的酶蛋白。通过水解 ATP 获得能量,来打开 DNA

双链, DNA 双螺旋解开形成单链,暴露出碱基,便于复制,每解开一对碱基,

需消耗两分子 ATP。

目前发现存在至少存在两种解螺旋酶。

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七、单链 DNA 结合蛋白单链 DNA 结合蛋白( single strand binding protein, SSB)又称螺旋反稳

蛋白( HDP)。这是一些能够与单链 DNA 结合的蛋白质因子。其作用为:

① 使解开双螺旋后的 DNA 单链能够稳定存在,即稳定单链 DNA ,便于以其为模板复制子代 DNA;

② 保护单链 DNA ,避免核酸酶的降解。

Page 46: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

八、拓扑异构酶 (topoisomerase) 拓扑异构酶Ⅰ可使 DNA 双链中的一条链切断,松开双螺旋后再将 DNA 链连接起来,从而避免出现链的缠绕。

拓扑异构酶Ⅱ可切断 DNA 双链,使 DNA 的超螺旋松解后,再将其连接起来。

大肠杆菌拓朴异构酶Ⅰ的结构

Page 47: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

基本步骤:1 、双链的解开(起始)

2 、引发: RNA 引物的合成

3 、 DNA 链的延长

4 、切除 RNA 引物,填补缺口,连接相邻的 DNA 片段

5 、切除和修复掺入 DNA 链的 dUMP 和错配碱基。

第三节 DNA 生物合成过程

Page 48: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

一、复制的起始

复制起点上四个 9bp重复序列为 DnaA 蛋白的结合位点,大约 20-40 个 DnaA 蛋

白各带一个 ATP 结合在起点位点上,并聚集在一起, DNA缠绕其上,形成起始复

合物. Hu 蛋白是细胞的类组蛋白质,可与 DNA 结合,使双链 DNA弯曲.受其影

响,邻近三个成串富含 AT 的 13bp 序列被变性,成为开链复合物,所需能量由ATP

提供. DnaB六聚体随即在 DnaC帮助下结合于解链区. DnaB借助水解 ATP产生的

能量,沿 DNA 链 5’-3’ 方向移动,解开 DNA 双链,此时称为前引发复合物. DNA

双链的解开还需要 DNA旋转酶(拓扑异构酶Ⅱ)和 SSB.  至此,即可由引物合

成酶 (DnaG) 合成 RNA 引物并开始 DNA 的复制.

Page 49: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

复制的起始,要求 DNA 呈负超螺旋,并且起点附近的基因处于转录状态. RNA 聚合酶对复制起始的作用,可能是因为其在起始点附近合成一段 RNA ,形成 RNA 突环,影响起点的结构,因而有利于 DnaA 的作用.

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结合 Ori 区,具 ATP 酶活性促进 DnaB 形成起始复合物

DNA螺旋酶

运输 DnaB

DNA 引发酶

促进起始复合物形成

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二、复制的延长(一)聚合子代 DNA 由 DNA 聚合酶催化,以 3‘→5’ 方向的亲代 DNA 链为模板,从 5‘→3’ 方向聚合子代 DNA 链。 在原核生物中,参与 DNA 复制延长的是 DNA 聚合酶Ⅲ;而在真核生物中,是 DNA 聚合酶 α( 延长随从链 ) 和 δ( 延长领头链 ) 。

Page 53: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

(二)引发体移动 引发体向前移动,解开新的局部双螺旋

,形成新的复制叉,随从链重新合成 RNA 引

物,继续进行链的延长。

Page 54: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

Topoisomerase

Okazaki fragments

复制过程中的复制叉

Page 55: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

三、复制的终止

Page 56: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

Origin

Terminus

DaughterDNA

structure

( 一 ) 去除引物,填补缺口 在原核生物中,由 DNA 聚合酶Ⅰ来水解去除 RNA 引物,并由该酶催化延长引物缺口处的 DNA ,直到剩下最后一个磷酸酯键的缺口。而在真核生物中, RNA 引物的去除,由一种特殊的核酸酶来水解,而冈崎片段仍由 DNA 聚合酶来延长。

( 二 ) 连接冈崎片段 在 DNA 连接酶的催化下,形成最后一个磷酸酯键,将冈崎片段连接起来,形成完整的 DNA长链。

Page 57: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

• 去除引物• 填补缺口 • 连接冈崎片段• 链的分离

end

startDNA pol I

DNA pol I

ligase

ligation of leading strand

RNA primerDNA pol I

DNA pol I

DNA ligase

Ligation of laging strand

Page 58: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

(三)真核生物端粒的形成 端粒 (telomere) 是指真核生物染色体线性 DNA 分子

末端的结构部分,通常膨大成粒状。其共同的结构特征是

由一些富含 G、 C的短重复序列构成可重复数十次至数百

次。

线性 DNA 在复制完成后,其末端由于引物 RNA 的水

解而可能出现缩短。故需要在端粒酶( telomerase )的

催化下,进行延长反应。

端粒酶是一种 RNA- 蛋白质复合体,它可以其 RNA 为

模板,通过逆转录过程对末端 DNA 链进行延长。

Page 59: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

• 端粒( telomere ) 染色体线性 DNA 分子末端 通常膨大成粒状 共同的结构特征 : 富含 TG 短重复序列 维持染色体稳定• 端粒酶( telomerase ) RNA- 蛋白质复合体 逆转录酶 延长末端 DNA 链进行

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各种生物端粒酶 RNA 组分序列和长度

四膜虫 TTGGGG CAACCCCAA 150Euplotes TTTTGGGG CAAAACCCCAAAACC 190Oxytricha TTTTGGGG CAAAACCCCAAAACC 190 人 TTAGGG CAAUCCC 450 小鼠 TTAGGG CAAUCCC 450啤酒酵母 TG(1-3) CACCACACCCACACAC 130

生物体 端粒 端粒酶 RNA 大小 DNA 序列 RNA 序列 ( nt ) 5’ → 3’ 3’ →5 ’

TxGy

Page 61: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

DNA 聚合酶DNA 连接酶

DNA 核酸酶

Page 62: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

第四节 DNA 的损伤与修复一、 DNA 的损伤(突变) 由自发的或环境的因素引起 DNA 一级结构的任何异常的改变称为 DNA 的

损伤,也称为突变( mutation )。常见的 DNA 的损伤包括碱基脱落、碱基修

饰、交联,链的断裂,重组等。

(一)引起突变的因素1 .自发因素(1) 自发脱碱基:由于 N-糖苷键的自发断裂,引起嘌呤或嘧啶碱基的脱落。

每日可达近万个核苷酸残基。(2) 自发脱氨基:胞嘧啶自发脱氨基可生成尿嘧啶,腺嘌呤自发脱氨基可生成

次黄嘌呤。每日可达几十到几百个核苷酸残基。(3) 复制错配:由于复制时碱基配对错误引起的损伤,发生频率较低。

Page 63: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

2 .物理因素

由紫外线、电离辐射、 X 射线等引起的 DNA 损伤。其中, X 射线和电离辐

射常常引起 DNA 链的断裂,而紫外线常常引起嘧啶二聚体的形成,如 TT, TC

, CC等二聚体。这些嘧啶二聚体由于形成了共价键连接的环丁烷结构,因而

会引起复制障碍。

Page 64: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)
Page 65: 第十章         DNA 的生物合成 ( Biosynthesis of DNA)

3 .化学因素

(1) 脱氨剂:如亚硝酸与亚硝酸盐,可加速C脱氨基生成 U, A脱氨基生成 I。

(2) 烷基化剂:这是一类带有活性烷基的化合物,可提供甲基或其他烷基,引起碱基或磷酸基的烷基化,甚至可引起邻近碱基的交联。

(3) DNA加合剂:如苯并芘,在体内代谢后生成四羟苯并芘,与嘌呤共价结合引起损伤。

(4) 碱基类似物:如 5-FU 等,可掺入到 DNA 分子中引起损伤或突变。

(5) 断链剂:如过氧化物,含巯基化合物等,可引起 DNA 链的断裂。

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(二) DNA 突变的类型

碱基的转换

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(三) DNA 突变的效应

1 .同义突变:基因突变导致mRNA暗码子第三位碱基的改变但不引起暗码子意义的改变,其翻译产物中的氨基酸残基顺序不变,但有时可引起翻译效率降低。

2.误义突变:基因突变导致mRNA暗码子碱基被置换,其意义发生改变,翻译产物中的氨基酸残基顺序发生改变。

3 .无义突变:基因突变导致mRNA暗码子碱基被置换而改变成终止暗码子,引起多肽链合成的终止。

4 .移码突变:基因突变导致mRNA暗码子碱基被置换,引起突变点之后的氨基酸残基顺序全部发生改变。

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二、 DNA 损伤的修复 DNA 损伤的修复方式可分为直接修复和取代修复两大类。

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• ⌒ hv ⌒

UV → TT → 光复活酶→ 修复 TT

(一)直接修复

1 .光复活( light repairing) 这是一种广泛存在的修复作用。光复活能够修复任何嘧啶二聚体的损伤。

其修复过程为: 光复活酶( photo-lyase)识别嘧啶二聚体并与之结合形成复合物→在 300 ~ 600nm 可见光照射下,酶获得能量,将嘧啶二聚体的丁酰环打开,使之完全修复→光复活酶从 DNA上解离。

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2 .转甲基作用

在转甲基酶的催化下,将 DNA上的被修饰的甲基去除。此时,转甲基酶自身被甲基化而失活。

3 .直接连接

DNA断裂形成的缺口,可以在 DNA 连接酶的催化下,直接进行连接而封闭缺口。

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(二)取代修复1 .切除修复 (excision repairing) 这也是一种广泛存在的修复机制,可适用于多种 DNA 损伤的

修复。该修复机制可以分别由两种不同的酶来发动,一种是核酸内

切酶,另一种是 DNA 糖苷酶。       ⌒

可修复 TT ,电离辐射,某些化学诱变剂造成的 DNA 结构的破坏  参加的酶有:特异的核酸内切酶;外切酶;聚合酶;连接酶。

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2.重组修复 (recombination repairing) 这是 DNA 的复制过程中所采用的一种有差错的修复方式。 ( 重重

组修复,复制后修复组修复,复制后修复 )

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3 . SOS 修复 由 DNA 损伤或抑制复制的处理所引起的一系列复杂的诱导效

应,称为应急反应( SOS )。这是一种在 DNA 分子受到较大范围损

伤并且使复制受到抑制时出现的修复机制,以 SOS借喻细胞处于危

急状态。    DNA 分子受到长片段高密度损伤,使 DNA 复制过程在损伤部

位受到抑制。损伤诱导一种特异性较低的新的 DNA 聚合酶,以及

重组酶等的产生。由这些特异性较低的酶继续催化损伤部位 DNA的

复制,复制完成后,保留许多错误的碱基,从而造成突变。

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SOS 反应诱导的二种修复作用

• 1) 避免差错修复• 诱导切除修复和重组修复中,某些酶和 protein 产生,含量增加,从而加强修复功能,且修复过程不引入错配碱基。

• 2) 倾向差错修复• 诱导出缺乏校对功能的 DNA 聚合酶,能在 DNA 损伤部

位进行复制而避免了死亡,却带来高的变异率。

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DNA 复制的保真性:•遵守严格的碱基配对规律• DNA 聚合酶在复制时对碱基的正确选择• DNA 聚合酶本身具有校对作用• DNA 合成起始时及冈崎片段合成开始时都有 RNA 引物

• DNA 自我修复机制( DNA直接修复、碱基切除修复、核苷酸切除修复、错配修复等)

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一 .概念

• 以 RNA 为模板、按照 RNA 中的核苷酸顺序合成 DNA ,与通

常转录过程中遗传信息流从 DNA 到 RNA 的方向相反,故称为

反转录 (reverse transcription) ,即在 RNA 指导下

DNA 的合成。

第五节 反转录作用

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二 . 反转录酶( reverse transcription )

• 1 、发现

• 1970 年 , Temin 、 Mizufani 、 Baltimore 分别从致癌 RNA 病毒中发现。

• 1964 年, Temin 提出前病毒学说:

单链 RNA 病毒 →→→ 双链 DNA 病毒 → 宿主细胞

•          (前病毒)• → 恶性转化

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2 、性质:• 致癌 RNA 病毒反转录酶,一个 α 亚基,一个 β亚基,含 Zn2+

反应特点:1 ) 要求引物,与模板互补,具有游离 3’—OH

2 )模板(自身 RNA病毒,带有适当引物的其他 RNA )

3) dNTP 底物, Mg2+和 Mn2+,还原剂

4) DNA 链的延长方向 5 ,→ 3 ,

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3 、多功能酶1 ) RNA→cDNA ,形成 RNA—DNA 杂交分子( RNA 指导的 DNA 聚合

酶)

2)水解杂种分子中的 RNA , 5’→3’或 3’→5’ 核酸外切酶作用

3 )以新合成 DNA 模板,合成互补 DNA→ 双链 DNA (前病毒)( DNA 指导的 DNA 聚合酶)

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三 . 逆转录病毒的生活周期

四 . 反转录酶发现的意义1 、对中心法则的补充和修正;

2 、逆转录酶: RNA →cDNA ;

3 、导致了“癌基因” 发现,并使致癌的分子机制研究有了重大进展。

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附 真核生物 DNA 的复制 1 、拓扑异构酶代替解旋酶 ;

2 、 RNA 引物短( 10b ) ;

3 、冈崎片段也短( 400b ),(原核 1000-2000 ) ;

4 、复制速度慢: 2600 b/min ,与组蛋白存在有关 ;

5 、多起点复制 ;

6 、 DNA 聚合酶 αβγ 及线粒体 DNA 聚合酶,仅有聚合而无外切作用 ;

7 、连接酶靠 ATP 而不是 NAD.

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1 、复制是半保留的 ;

2 、细菌、病毒起始于特定位点,真核生物有多个起始位点 ;

3 、可以单向复制,也可以双向复制,后者更常见 ;

4 、两条新合成的 DNA 链延伸方向均为 5,→ 3

,;

5 、复制是半不连续的 ;

6 、 DNA 的复制是需要引物的 .

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结合 Ori区,具 ATP 酶活性促进 DnaB形成起始复合物 运输 DnaB