10. Bahan Kimia Materi Genetik

Embed Size (px)

Citation preview

AGENDA PETANI

BAHAN KIMIA MATERI GENETIKMateri GenetikMateri yang bertanggungjawab atas pewarisan informasi genetik makhluk hidup dari suatu generasi ke generasi berikutnya Unit fungsional materi genetik ialah gen, berasal dari kata genos, artinya asal-usul. Sedangkan unit struktural atau unit kimiawi gen ialah DNA (deoxyribo nucleic acid). INDIKASI DNA SEBAGAI MATERI GENETIKPercobaan Frederick Griffith1923 Griffith mempelajari bakteri Streptococcus pnemoniae, dibedakannya dua bakteri : Smooth (S) & Rough (R)1928 Griffith melaporkan bahwa informasi genetik dari sel bakteri mati dapat ditransfer ke sel hidup.Griffith meneliti dua jenis bakteri (S dan R) yang disuntikan pada tikus

Konfirmasi Percobaan Oswald Averi (1931) :Transformasi tidak menggunakan hewan sbg inang (in vitro). Bakteri tipe R hidup + S mati, selanjutnya terbentuk bakteri tipe S hidup.

Komponen apa yang berpengaruh pada fenomena tsb?1944, Avery, MacLeod and McCarty melakukan serangkaian pengujian prinsip transformasi Hanya komponen DNA yang berpengaruh terhadap proses transformasiDisimpulkan bahwa materi genetik (gen) disusun atas DNA

2. Percobaan Martha Chase and Alfred HersheyMenginfeksi sel bakteri dengan virus bacteriophages Bacteriophage sangat kecil, dan tersusun (hanya) dari protein and DNA.Dia tergantung pada sel inang untuk melakukan replikasi diri. Pertanyaannya: Materi apa yang secara langsung diproduksi olehnya, DNA atau protein? Skema Percobaan Chase dan Hershey:

Fakta bahwa gen adalah DNA:phage tidak masuk dalam sel bakteri, tapi menyuntikankan materi untuk replikasi dan meninggalkan cangkang diluar sel. Diduga: Cangkang (protein), materi (DNA)

GenGen merupakan unit pewaris sifat yang keberadaannya dapat diketahui terhadap sifat fenotipenya. Gen adalah substansi hereditas yang terletak di dalam kromosom. Gen disusun oleh suatu substansi yang disebut dengan deoxyribo nucleat acid (DNA).

DNA DNA merupakan materi genetik gen. Asam ini disebut juga asam nukleat, berasal dari kata asam yang terdapat dalam nukleus, karena sebagian besar (99,9 persen) asam ini terdapat dalam inti sel. Sisanya yang 0,1 persen terdapat dalam organel. Organel yang mengandung DNA ialah mitokondria dan kloroplas. Asam nukleat merupakan bahan dasar kehidupan. DNA bertanggungjawab atas pewarisan informasi genetik dari suatu generasi ke generasi berikutnya. DNA merupakan molekul yang mengkode informasi genetik.

DNAMonomer DNA ialah nukleotida. Satu gen disusun oleh satu molekul DNA, dan satu molekul DNA disusun oleh ribuan sampai puluhan ribu nukleotida. Satu nukleotida terdiri dari tiga gugus senyawa: 1) gula deoksiribosa; 2) fosfat; 3) basa nitrogen. Gula yang menyusun DNA tergolong gula pentosa, yaitu gula yang atom karbonnya lima. Glukosa merupakan sebagian besar bentuk gula dalam tubuh manusia dan yang menjadi sumber energi utama. Basa nitrogen terdiri dari dua kelompok yaitu basa: 1) purin dan 2) pirimidinPurin terdiri dari adenin (A) dan guanin (G)Pirimidin terdiri dari timin (T) dan citosin (C).

Komposisi Kimia DNA Polymer (polinukleotida), Nukleotida, terdiri dari:Gula pentoseBasa nitrogen:Purin: Adenin dan GuaninPirimidin: Sitosin dan TiminGugus Fosfat

Molekul DNA ditemukan pada tahun 1951 oleh Francis Crick, James Watson dan Maurice Wilkins dengan menggunakan difraksi sinar-X. Struktur molekul DNA seperti tangga berpilin berhasil digambarkan oleh ahli biokimia Amerika James Watson dan ahli biofisika Inggris Francis Crick pada tahun 1953. Atas keberhasilan tersebut, Crick, Watson dan Wilkins mendapat hadiah Nobel pada tahun 1962 untuk penemuan struktur molekul DNA. Penemuan struktur molekul DNA menjadi tonggak terpenting perkembangan biologi molekuler. Model temuan mereka memiliki arti penting dalam memahami sintesis protein, replikasi DNA dan mutasi gen.Model DNA Watson and CricksDNA disusun dua rantai polinukleotida yang basanya berpasangan dengan ikatan hidrogen, dengan aturan A-T dan G-C. Pasangan A-T diikat oleh dua ikatan hidrogen, sedangkan G-C oleh tiga ikatan. Perpasangan dengan ikatan hidrogen ini selain mengikat juga mempertahankan jarak antara dua basaAntara dua utasan membentuk pasangan anti paralel, yaitu antara kedua utasan terdapat arah yang berlawanan; ujung 5P akan berhadapan dengan ujung 3OHAntara dua pasangan basa terdapat jarak sebesar 3.4 AoPasangan dua utasan DNA membentuk suatu pilinan di sekitar suatu sumbu dengan arah pilinan ke kanan atau searah dengan jarum jam. Setiap sepuluh pasang basa (34 Ao akan membentuk satu piilinan atau memutar 360o . Pilinan ini mempunyai diameter sebesar 20o .Model DNA Watson and Cricks

Mekanisme Kerja Materi GenetikMolekul DNA yang menyusun gen merupakan cetak biru genetik untuk setiap sel dan faktor penentu setiap karakteristik tertentu pada organisme hidup. Gen mengatur kehidupan sel dan individu suatu makhluk. Gen bekerja mengatur kehidupan lewat dua proses:replikasitranskripsi

Replikasi DNAReplikasi atau penggandaan, yaitu menggandanya sepasang DNA yang double-helix anti-paralel menjadi dua pasang yang susunan basanya persis sama. Replikasi bertujuan untuk menyediakan copy materi genetik dalam pembelahan sel. Pembelahan sel bertujuan untuk: perbiakan, pertumbuhan sejak embrio, lahir dan sampai dewasa, regenerasi bagian tubuh yang lepas dan untuk menyembuhkan bagian tubuh yang rusak. Tiga hipotetik replikasi DNA

Replikasi DNA mengikuti pola semikonservatifSemikonservatif : dalam pembentukan baru kedua utas polinukleotida tidak disintesis, tetapi hanya satu yang disintesis sedangkan utasan yang lainnya berasal dari molekul DNA terdahuluHal yang terpenuhi dari pola semikonservatif:Fungsi pewarisan, yaitu dalam replikasi satu utasan DNA tetua secara fisik akan terbawa ke dalam DNA baru.Fungsi pemeliharaan sifat, yaitu struktur DNA baru akan sama dengan struktur DNA generasi sebelumnyaProses replikasi DNATranskripsiTranskripsi ialah pencetakan RNA. Transkripsi bertujuan untuk sintesis (menghasilkan) protein. Jika gen aktif bereplikasi atau transkripsi, ikatan hidrogen menjadi lepas dan tiap utas menjadi terentang lurus. Sintesis protein merupakan proses yang mengendalikan mekanisme ekspresi gen.DNA (deoxyribo nucleic acid) RNA (Ribonucleic Acid)DNA (deoxyribo nucleic acid) RNA (Ribonucleic Acid)Perbedaan DNA dan RNA pada gula dan basa yang dikandungnyaDNA gula Dioksiribosa; RNA gula ribosaDNA basa Adenin, Guanin, Sitosin dan Timin ; RNA basa Adenin, Guanin, Sitosin dan UrasilDNA5---AGTACGTAACTTGAGCCGTGATG ---3 utas pendamping 3---TCATGCATTGAACTCGGCACTAC ---5 utas cetakanRNA 5---AGUACGUAACUUCACGGCUCAUC ---3

RNA diterjemahkan berdasarkan basa triplet menjadi asam amino asam amino dirangkaikan oleh ikatan peptida membentuk rantai protein memunculkan suatu sifat

Sebagai ringkasan dari proses transkripsi dan translasi adalah sebagai berikut:DNA di transkripsi menjadi mRNA (mesenger RNA)mRNA keluar dari inti menuju sitoplasmasatu ribosom melekat pada mRNA pada ujung 5tRNA dengan asam amino tertentu melekat pada ribosom yang bekerja sepanjang mRNA. pemilihan tRNA yang membawa asam amoni tergantung dari urutan kode mRNAribosom bergerak sepanjang pita mRNA dari 5 ke 3 membawa tRNA dengan antikodon tertentu untuk berpasangan dengan kodon dari mRNA. Basa triplet tRNA melekat pada basa triplet mRNA. Hal ini yang menjamin bahwa asam amino dibawa ke ribosom dengan urutan yang ditentukan oleh mRNA (yang berarti pula ditentukan oleh DNA).Asam amino dirangkaikan oleh ikatan peptida membentuk rantai protein.tRNA yang terdahulu dilepaskan oleh ribosom ke dalam sitoplasma untuk bergabung dengan asam amino lain. Ini memberi tempat bagi tRNA lain dengan asam aminonya bergerak sepanjang pita mRNA.