29
Биология за 1 пару Николай Вяххи [email protected] Computer Science клуб Екатеринбург, 2012 пятница, 5 октября 12 г.

20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Биология за 1 пару

Николай Вяххи[email protected]

Computer Science клубЕкатеринбург, 2012

пятница, 5 октября 12 г.

Page 2: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Геном Человека

3,000,000,000 букв

13 лет (1990 - 2003)

3,000,000,000 $

пятница, 5 октября 12 г.

Page 3: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Геном Человека

3,000,000,000 букв

13 лет (1990 - 2003)

3,000,000,000 $

пятница, 5 октября 12 г.

Page 4: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Геном Человека

3,000,000,000 букв

2 недели

5,000 $

пятница, 5 октября 12 г.

Page 5: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

пятница, 5 октября 12 г.

Page 6: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

ДНК

пятница, 5 октября 12 г.

Page 7: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

ДНК

Двойная спираль

Нуклеотиды:

А — Т

С — G

bp = Base Pairs

пятница, 5 октября 12 г.

Page 8: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Направление ДНК

пятница, 5 октября 12 г.

Page 9: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Направление ДНК

пятница, 5 октября 12 г.

Page 10: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Комплементарность

пятница, 5 октября 12 г.

Page 11: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Комплементарность

1. CCCAGAACUGAGAUCAAU

2. AGUACCCGUAUUAACGGG

пятница, 5 октября 12 г.

Page 12: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

ДНК → 2 x ДНК

Репликацияпятница, 5 октября 12 г.

Page 13: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

РНК

Одна цепочка

Рибонуклеотиды:

А — U

С — G

пятница, 5 октября 12 г.

Page 14: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

ДНК → РНК

Транскрипция

T → U

пятница, 5 октября 12 г.

Page 15: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Белки / Протеины

Аминокислоты (20):

ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY

Функции: структурная, ферментативная, рецепторная, гормональная, транспортная, сократительная, защитная.

пятница, 5 октября 12 г.

Page 16: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Структура Белка

Последовательность

α-спираль / β-лист

Трёхмерная структура

Комплекс

пятница, 5 октября 12 г.

Page 17: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

РНК → Белок

Трансляция

Кодон (3 нуклеотида) → 1 аминокислота

пятница, 5 октября 12 г.

Page 18: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

РНК → Белок

1. CCCAGAACUGAGAUCAAU

2. AGUACCCGUAUUAACGGG

пятница, 5 октября 12 г.

Page 19: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Центральная Догма

пятница, 5 октября 12 г.

Page 20: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Гены

пятница, 5 октября 12 г.

Page 21: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Омики

пятница, 5 октября 12 г.

Page 22: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

ГеномикаAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGTGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCACCTGGTGGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGCCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTTTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGGTTCCCGCTGGCGCAATTGAAAACTTTCGTCGATCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATTAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTATGGCCGGCGTATTAGAAGCGCGCGGTCACAACGTTACTGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGGCATTACCTCGAATCTACCGTCGATATTGCTGAGTCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGATCACATGGTGCTGATGGCAGGTTTCACCGCCGGTAATGAAAAAGGCGAACTGGTGGTGCTTGGACGCAACGGTTCCGACTACTCTGCTGCGGTGCTGGCTGCCTGTTTACGCGCCGATTGTTGCGAGATTTGGACGGACGTTGACGGGGTCTATACCTGCGACCCGCGTCAGGTGCCCGATGCGAGGTTGTTGAAGTCGATGTCCTACCAGGAAGCGATGGAGCTTTCCTACTTCGGCGCTAAAGTTCTTCACCCCCGCACCATTACCCCCATCGCCCAGTTCCAGATCCCTTGCCTGATTAAAAATACCGGAAATCCTCAAGCACCAGGTACGC

пятница, 5 октября 12 г.

Page 23: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Геномика

пятница, 5 октября 12 г.

Page 24: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Геномы

пятница, 5 октября 12 г.

Page 25: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Сборка Генома

пятница, 5 октября 12 г.

Page 26: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Comparative Genomics

пятница, 5 октября 12 г.

Page 27: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Протеомика

пятница, 5 октября 12 г.

Page 28: 20121005 algorithmsinbioinformatics vyahhi_lecture01

Протеомика

пятница, 5 октября 12 г.