55
3. Variabilidad genética

3. Variabilidad genética

  • Upload
    others

  • View
    9

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: 3. Variabilidad genética

3. Variabilidad genética

Page 2: 3. Variabilidad genética

3. Variabilidad genética

• 3.1 Genotipo. Fenotipo.• 3.2 Causas de la variabilidad.• 3.2 Interacciones ambientales determinantes.

Page 3: 3. Variabilidad genética

Genotipo y Fenotipo

• Genotipo: es la identidad de los genes (constitución genética) de un individuo– Especifica asimismo las

"formas" (alelos) de los genes• Fenotipo: son los rasgos

observados• (Medio) Ambiente: es el mundo

exterior en el que el organismo vive

3

Page 4: 3. Variabilidad genética

Genotipo y fenotipo• En 1909, Wilhelm Johannsen utilizó semillas de porotos en sus trabajos

científicos. Las pesó y separó en dos grupos: las "livianas", cuyo peso individual estaba alrededor de los 0,15 gramos; y las "pesadas", cuyo peso era de 0,9 gramos, aproximadamente.

• Sembró semillas de cada grupo, y permitió que ocurriera la autopolinización en ellas, así aseguró que fueran líneas puras para cada rasgo.

• Luego las separó en dos grupos, y cultivó las plantas que producían semillas livianas, y las que producían semillas pesadas. En cada grupo, durante una serie de generaciones, permitió la autopolinización, y luego pesó las semillas obtenidas.

• Los resultados que obtuvo revelaban que había pequeñas diferencias dentro de cada grupo (intragrupales), y grandes diferencias entre los dos grupos (intergrupales).

Page 5: 3. Variabilidad genética

• Esto lo llevó a inferir que las diferencias intragrupales se debían al ambiente, ya que todos los individuos tenían la misma constitución genética. En tanto que las diferencias intergrupales se debían a las diferencias en la información genética

• A partir de esta información, Johannsen acuñó los términos genotipo y fenotipo.

• El genotipo es la constitución genética de un organismo, representada por todos los genes que posee como miembro de una especie.

• El fenotipo es una característica observable, identificable e individualizada del organismo, que expresa un genotipo específico en un ambiente determinado.

Page 6: 3. Variabilidad genética

Fenotipo = Genotipo + Ambiente + (G+A)• A veces, la contribución de medio ambiente al fenotipo es insignificante

– Fenotipo está determinado por el genotipo• A veces, la contribución genética al fenotipo es insignificante

– Fenotipo es determinado por el medio ambiente• La mayoría de las veces, tanto el genotipo y el medio ambiente

contribuyen al fenotipo– Fenotipo está determinado tanto por el genotipo y el medio ambiente

Page 7: 3. Variabilidad genética
Page 8: 3. Variabilidad genética

• La expresión de un gen es influida por aspectos internos y externos al individuo.– Internos: los hereditarios, los

cuales se transmiten por la información genética

– Externos: el ambiente que rodea el individuo, lo cual influye en su desarrollo. Ejemplos: los efectos de la temperatura, la luz, la alimentación, los nutrientes y otros.

Page 9: 3. Variabilidad genética

Efectos ambientales

• Los genotipos de dos individuos de la misma especie nunca son exactamente iguales, excepto los mellizos univitelinos y clones que tienen genotipos idénticos.

• A las diferencias que pueden presentar en el fenotipo dos individuos que poseen genotipos semejantes, se les llama variaciones ambientales.

Page 10: 3. Variabilidad genética

Efectos de la temperatura• En el tipo de conejo llamado

Himalaya varía el color de su pelo (fenotipo) de acuerdo con las temperaturas. – A temperaturas altas los

conejos son completamente blancos.

– Si se crían a temperaturas bajas estos conejos (con igual genotipo) presentan cola, nariz y patas de color negro.

Page 11: 3. Variabilidad genética

Efecto de la luz• Cuando dos plantas de genotipo

similar se desarrollan una en presencia de luz y otra en ausencia de luz, se observan diferentes características.

• La que se desarrolla en presencia de luz es normal, de color verde, erecta; mientras que la que se desarrolla en la ausencia de luz crece arrastrándose por el suelo, con un tallo alargado, de color amarillo por falta de clorofila.

Page 12: 3. Variabilidad genética

Efecto del sitio• Si una planta se desarrolla

en un suelo rico en nutrientes, su desarrollo será normal y su rendimiento será abundante

• Si se desarrolla en un suelo pobre en nutrientes, su desarrollo será menor.

• La disponibilidad de agua es un factor muy importante.

• El color de sus flores, hojas y la altura pueden variar según el suelo.

Page 13: 3. Variabilidad genética
Page 14: 3. Variabilidad genética
Page 15: 3. Variabilidad genética

Ensayo de 3 variedades de arroz en 3 localidades

Page 16: 3. Variabilidad genética

Reducir el espaciamiento entre surcos, de manera de lograr una mayor cobertura y aprovechamiento de la radiación incidente. Resultados de esta alternativa son mostrados por Bragachini et al. Utilizar grupos de madurez (GM) adaptados, en general GM V y VI, que presenten un buen crecimiento. Esta alternativa fue propuesta y evaluada por Tellería. Realizar fertilización fosforada y azufrada, previo análisis de suelo, para lograr incrementar el crecimiento del cultivo y la eficiencia de intercepción de la radiación. Mejorar todos los aspectos relacionados a la economía del agua, especialmente, incrementar la entrada de agua al suelo y disminuir la evaporación directa. Para ello, una alternativa puede ser la realización de cultivos cobertura. Combinar modelos de siembra y fertilización azufrada para aumentar el crecimiento del cultivo y la captura de radiación (Pergolini, 2003).

Factores que Explican las Variaciones de Rendimiento del Cultivo de Soja entre los Sectores de Bajo y Loma

Ing. Agr. Sergio Pergolini

Page 17: 3. Variabilidad genética

Factores Endocrinos• La expresión de algunos genes

depende de ciertos factores internos del individuo.

• Ejemplo, las glándulas endocrinas segregan hormonas a la sangre y éstas actúan como componentes del ambiente interno, necesarios para que se expresen características fenotípicas como el crecimiento, la aparición de caracteres sexuales, la reproducción y el equilibrio del ambiente.

Factores Mutagénicos• Existen factores mutagénicos que

pueden hacer cambiar los genes.• Estos cambios que se producen

en el medio pueden producir alteraciones definitivas en el carácter hereditario.

• Entre esos agentes que pueden originar cambios por mutaciones tenemos:– Continuas exposiciones a los

rayos X u otra radiación. – Contacto directo continuo

con sustancias químicas presentes en el medio (agroquímicos, mercurio, cobalto, uranio).

Page 18: 3. Variabilidad genética

Fenotipo potencial y el fenotipo real• Ninguna forma de vida expresa más de lo que su constitución genética le

permite. • Conocer el genotipo de un individuo permite conocer su fenotipo

potencial; sin embargo, ello no es suficiente para conocer su fenotipo real.• El fenotipo potencial de un individuo es el que podría tener si todo su

genotipo se expresara, lo cual sería posible sólo si el individuo se desarrollara bajo las condiciones ambientales para ello.

• El fenotipo real es el que expresa al individuo como producto de la interacción de su genotipo con el ambiente donde se ha desarrollado, lo cual se puede expresar mediante la siguiente ecuación:

• Fenotipo real = genotipo + ambiente• La diferencia entre el fenotipo potencial y el fenotipo real está

determinada fundamentalmente por la influencia del ambiente sobre el genotipo del individuo.

• Esta flexibilidad del fenotipo de las especies es importante para su adaptación al ambiente.

Page 19: 3. Variabilidad genética

• Penetrancia: Proporción de genotipos que manifiestan un fenotipo esperado.

• Expresividad: El grado en que los individuos expresan un fenotipo dado

Page 20: 3. Variabilidad genética

Comparación entre herencia poligenética (o multifactorial) y monogenética

• En la herencia poligenética los rasgos son de variación continua, en cambio, en la herencia monogenética o mendeliana, los rasgos son de variación discontinua.

• En la herencia poligenética intervienen varios genes (poligenes), en cambio en la herencia monogenética intervienen dos genes alelos.

• Los estudios realizados al respecto demuestran que en la herencia poligenética el ambiente juega un papel importante; en la herencia monogenética, en cambio, no es importante.

• El estudio de los rasgos controlados por poligenes necesita un análisis estadístico, en tanto que los rasgos de variación discontinua se interpretan usando solamente proporciones.

Page 21: 3. Variabilidad genética

• Conceptos básicos – el individuo no cambia y muere– la descendencia varía– la población cambia y no muere– la población crece en progresión geométrica y los alimentos en

progresión aritmética– Sobrevivirán los más aptos

Page 22: 3. Variabilidad genética
Page 23: 3. Variabilidad genética
Page 24: 3. Variabilidad genética
Page 25: 3. Variabilidad genética

Teorías de la variación¿cuánta variabilidad hay en las poblaciones?

• Ausencia de variación• Genotipo silvestre es óptimo• Selección purificadora• Muller (laboratorio)• Eugenesia

• Variación ubicua• No existe un genotipo silvestre• Selección equilibradora • Dobzhansky (naturalista)•¡Viva la diversidad!, no interferencia

modelo equilibradomodelo clásico

Page 26: 3. Variabilidad genética

Medida de la variabilidad genética

Para el polimorfismo 2 y 3 son iguales

Para la heterocigosidad todas cuentan, pero la 3 tiene más variabilidad que 2 y ésta más que 1

AA Aa aa p q

1 0,9409 0,0582 0,0009 0,97 0,03

2 0,7744 0,2112 0,0144 0,88 0,12

3 0,2916 0,4968 0,2116 0,54 0,46

Ejemplo:

Page 27: 3. Variabilidad genética

Variabilidad genética hay en poblaciones naturales

Page 28: 3. Variabilidad genética

1 gen con dos alelos (‘versiones’) 3 genotipos

21 genes con dos alelos: 321 = 10.000.000.000 genotipos

2 genes con dos alelos

32 = 9 genotipos

Page 29: 3. Variabilidad genética

Diversidad Biológica o Biodiversidad

Page 30: 3. Variabilidad genética

Cristián SamperDirector of the Smithsonian Museum of Natural History in Washington DC, United States

Concepto

• La Diversidad Biológica, más conocida como Biodiversidad, describe la totalidad y variedad de vida sobre la tierra. En adición a los organismos individuales y su variabilidad genética, el término cubre los ecosistemas en que ellos viven, o sea, las variadas maneras en que interactúan las especies cada una con la otra y con el medio ambiente que las rodea.

Page 31: 3. Variabilidad genética

• ¿Qué es la Biodiversidad?La biodiversidad se refiere a la enorme variedad de plantas y animales que existe en los ecosistemas.

• ¿Por qué es importante?Plantas y animales conviven en una red compleja de interdependencia. La pérdida de hábitats y la extinción de especies pueden amenazar a otras especies, y hasta ecosistemas enteros.

Page 32: 3. Variabilidad genética

Convenio de Diversidad Biológica

Page 33: 3. Variabilidad genética
Page 34: 3. Variabilidad genética

La biodiversidad es vital para la conservación de la base ecológica de todos los seres vivos, su pérdida socava la estabilidad y resistencia de los ecosistemas.

La biodiversidad hace una aportación decisiva a la alimentación a través de los millones de genes, las miles de plantas y animales que pueblan la Tierra(variación genética en especies silvestres), y las interacciones de organismos que componen los ecosistemas naturales.

Masa Iwanaga & Dave Watson (2003) CIMMYT, México.

Page 35: 3. Variabilidad genética

La biodiversidad mundial puede superar 14 millones de especies, con alrededor de 1.4 millones de especies vegetales y animales.

De acuerdo a estimados el 80% reside en las selvas tropicales pluviales, en menos del 10% de la superficie de la tierra.

Riqueza de la biodiversidad

Se considera que las especies por ser descubiertas andan entre los 10 a los 30 millones.

Masa Iwanaga & Dave Watson (2003) CIMMYT, México. / FAO (2004)

Page 36: 3. Variabilidad genética

La pérdida de especies es la principal preocupación para la preservación de la biodiversidad. Los records fósiles revelan que han ocurrido al menos cinco extinciones en los pasados 500 millones de años con un 90% de las especies desaparecidas.

Hay evidencia que demuestra que estamos impulsando otra gran extinción, más especies, yendo de 5,000 a 150,000 por año, en los últimos 500 años de la historia humana (la historia de la humanidad inició hace 10,000 años con la agricultura).

Masa Iwanaga & Dave Watson (2003) CIMMYT, México.

Page 37: 3. Variabilidad genética

FAO (2004)

Sólo 14 especies de mamíferos y aves componen el 90% de suministros de alimento de origen animal.

Más del 90% de las necesidades calóricas de la humanidad las suplen 103 especies de plantas, y más de la mitad de la ingesta energética mundial proviene sólo de tres cultivos principales: arroz, trigo y maíz.

Page 39: 3. Variabilidad genética

La investigación científica en los países en desarrollo puede enriquecer el conocimiento de los agricultores para: • Proteger los ecosistemas e incrementar la producción en general. • Ayudar a conservar mejor los recursos genéticos y detectar enfermedades. • Frenar la degradación de las tierras agrícolas.

Hay que difundir la información científica para proteger la biodiversidadmediante la utilización de las mejores prácticas agrícolas.

FAO (2004)

Page 40: 3. Variabilidad genética

Las fuerzas evolutivas

Selección natural Deriva genética

Flujo genético

Pool génico

Mutaciones

Factores que cambian las frecuencias génicas en las poblaciones

Page 41: 3. Variabilidad genética
Page 42: 3. Variabilidad genética

N

pt = 0.5

pobl

ació

nt

N

pt+1 = 0.6

pobl

ació

nt+

1p = 0.5

Pool alélico

Binomial sampling (N, pt)

Deriva genética

Page 43: 3. Variabilidad genética

Distribución binomial

N=18, p=0.5, q=0.5

P(k = 9) = 0.185

P(k ≠ 9) = 0.815

E(k) = Np = 9

V(k) = Np(1-p) = 4.5

IC (95%) = 9 E1.96 x 2.12 = 9 E 4

Page 44: 3. Variabilidad genética

IC (95%)

Page 45: 3. Variabilidad genética

Linajes en poblacionesModelo de Wright – Fisher

Generaciones

Panmixia:Sistema de apareamiento en el que la elección de pareja se realiza al azar.

Misma probabilidad de dejar descendencia

Page 46: 3. Variabilidad genética

Generaciones

Mutación Mutación

Page 47: 3. Variabilidad genética

Generaciones

Tasa de mutación uu

1- u

Page 48: 3. Variabilidad genética

)1)1(()1( 21 N

JJuJ ttt −+−=+

Deriva genética + mutaciones

tt JN

uN

J )121(11 −−+≈+

Equilibrio:

tt JJ =+1 121+

=⇒Nu

J

1221

+=−=

NuNuJH

1+=θθH

La diversidad genética depende de N y u

θ=Nu2Por convención: y

Page 49: 3. Variabilidad genética

100 ha1000 m

Interior = 64 ha

1000 m

100m100m 800 m

8.7 ha

8.7 ha 8.7 ha

8.7 ha

Interior: 8.7 ha x 4 = 34.8 ha

camino

camino

Pérdidas de variabilidad genética : fragmentación de hábitats y efecto borde

Page 50: 3. Variabilidad genética

Primera etapa:

pérdida de diversidad por eliminación directa

Page 51: 3. Variabilidad genética

Durante un cuello de botella:

Se pierden en primer lugar los alelosde baja frecuencia

Hauser et al. 2002. PNAS 99(18):11742-7

1950 1998

Ho 0.766 0.724

 12.5 9.5

Page 52: 3. Variabilidad genética

Sin bottleneck

Con bottleneck

Pérdida de alelos de baja frecuencia

Frecuencia

alel

os

Luikart et al 1998J. Hered. 89:238–247

Page 53: 3. Variabilidad genética

Pérdida de diversidad por deriva genética

La deriva genética o deriva génica es una fuerza evolutiva que actúa junto con la selección natural cambiando las características de las especies en el tiempo. Es un efecto estocástico que emerge del rol del muestreo aleatorio en la reproducción. Se trata de un cambio aleatorio en la frecuencia de alelos de una generación a otra. Normalmente se da una pérdida de los alelos menos frecuentes y una fijación (frecuencia próxima al 100%) de los más frecuentes, resultando una disminución en la diversidad genética de la población.

Page 54: 3. Variabilidad genética

Corto plazo: ¿Cómo la pérdida de diversidad genética afecta la susceptibilidad de una población a la extinción?

Largo plazo: ¿Cuánta diversidad genética es necesaria para que una especie continúe evolucionando en respuesta a los cambios ambientales?

Aplicaciones en conservación

TIEMPO

TAMAÑO CRÍTICO

EXTINCIÓN

SOBREEXPLOTACIÓN

INTRODUCCIÓN DE ESPECIES

DESTRUCCIÓNY FRAGMENTACIÓN

DEL HÁBITAT

EFECTOS GENÉTICOSY DEMOGRÁFICOS

Page 55: 3. Variabilidad genética

Expansión demográfica