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中国生物医学文献数据库

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中国生物医学文献数据库. 张春晓 2007.10. 概况. 中国生物医学文献数据库 (CBM) 是中国医学科学院医学信息研究所开发研制的综合性医学文献数据库。 中国生物医学文献数据库收录 1978 年以来 1600 多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录,年增长量约 40 万条。学科覆盖范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。 - PowerPoint PPT Presentation

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中国生物医学文献数据库

张春晓2007.10

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概况

• 中国生物医学文献数据库 (CBM) 是中国医学科学院医学信息研究所开发研制的综合性医学文献数据库。

• 中国生物医学文献数据库收录 1978 年以来 1600 多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录,年增长量约 40 万条。学科覆盖范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。

• 中国生物医学文献数据库全部题录均根据美国国立医学图书馆最新版《医学主题词表》、中国中医研究院中医药信息研究所《中国中医药学主题词表》,以及《中国图书馆分类法 · 医学专业分类表》进行主题标引和分类标引。

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收录时间与收录数量

• 收录时间 文摘: 1978 年 - 全文: 1989 年 - • 收录数量 1600 种 ( 册 )/3790000 篇

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如何打开数据库

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点击“电子资源”

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输入“中国生物医学文献数据库”,或单击“ Z”

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选择“中国生物医学文献数据库”

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点击进入

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《中国生物医学文献数据库》检索界面

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检索运算符

• 布尔逻辑运算符• 字段限定符• 范围运算符• 通配符• 优先级运算

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布尔逻辑运算符

• 本系统使用的逻辑运算符有 3 种,分别为: AND 、 OR 和 AND NOT 。

• AND 表示逻辑关系“与”• OR 表示逻辑关系“或”• AND NOT 表示逻辑关系“非”

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字段限定符

• 本系统使用的字段限定符为 IN 或 = ,该运算符可以将检索指定在某个字段中。

• IN 的格式为:检索词 IN 字段标识符,表示在某个字段中检索,如:“肝炎 IN TI”

• = 的格式为:字段标识符 = 检索词,如“ AU= 张力”

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范围运算符

• 范围运算符仅用于数字字段的检索,包括: = 、 < 、 > 、 >= 、<= 、 - 。例如:“ PY>=2005” 表示 2005 年以后出版的文献。

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通配符

• 表示方法为“?”和“ *”• “ ?”表示代替一个字符或汉字• “*” 表示代替任意字符

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优先级运算

• 当一个检索表达式含有多个逻辑运算符时,系统将按 AND NOT>AND>OR 的顺序排列,但可以用括号改变顺序。

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检索方法

• 基本检索• 主题检索• 分类检索• 期刊检索• 索引检索• 限定检索• 检索史• 帮助

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(一)基本检索

• 基本检索是本数据库最为灵活的检索方式,可以进行以下检索方式:• 任意字词检索• 命令式字段限定检索• 逻辑运算• 二次检索

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任意字词检索

• 在检索式输入框可以输入任意中英文字、词、带有通配符的字词和检索史中的序号。

• 检索的范围由左边的下拉菜单中的选项决定。系统的默认选项是“缺省”,缺省字段包括题目、主题词、关键词、文摘、刊名等字段。此外还有全部字段(表示在所有可以检索的字段中查找用户输入的检索词)和各种指定字段(指仅在某一指定字段内检索用户输入的检索词,如中文标题、作者等)。

基本检索界面

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命令式字段限定检索

• 用户可以不通过左边的下拉菜单选择检索字段,而是在检索子窗口中输入带有字段限定符或范围运算符的检索式进行检索。例如:“马智 IN AU” ,此为非精确检索。再如:“ AU=马智”,此为精确检索。

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逻辑运算

• 逻辑运算符可以在检索式输入框用命令方式进行,也可以用按钮方式进行,命令方式是直接输入用逻辑运算符连接的检索式,例如:“ HLA AND 肝炎”,按钮方式则是先在检索史中选择检索式,然后再选“ AND” 或“ OR” 按钮进行“与”、“或”逻辑运算。用按钮进行逻辑“非”的运算方法是,首先用按钮“ NOT” 排除掉不要的内容,再用“ AND”组合另一检索式。

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二次检索

• 二次检索是指对最后一个检索式检索结果的范围内进行进一步查询,两个检索式之间的关系为“ AND” 运算。

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(二)主题检索

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• 联机主题词表收录了美国国立医学图书馆《医学主题词表》(即MeSH词表),中国中医研究院医学信息研究所出版的《中医药学主题词表》中的所有词条。

• 《主题词表》是对医学术语的一种规范化。• 由于主题词对医学术语进行了规范化处理,所以大大提高了检索

的全面性和准确性。• 该途径通常用于检索某个专题的文献。• 由于存在术语规范化的处理过程,所以某些新出现的术语可能不

在主题词表中出现,在这种情况下可使用基本检索。

如MESH

癌(非主题词)   见 肿瘤(主题词)

艾滋病(非主题词) 见 获得性免疫缺陷综合征(主题词)

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• 检索举例:门静脉高血压的药物治疗

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操作步骤• 输入检索词

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• 点击查找,出现主题词表

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• 在出现的词表中,找到“高血压,门静脉”

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• 点击“高血压,门静脉”,出现副主题词表。选择药物疗法,中药疗法等。再点击“主题检索”。

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• 树状结构表体现了主题词之间的语义关系

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• 检索结果

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(三)分类检索

• 分类检索是利用《中国图书馆图书分类法》来进行文献检索。• 《中图法》采用汉语拼音字母与阿拉伯数字相结合的混合制进行

编号,《中图法》分为 5 大部类, 22 个基本大类,每个大类用一个大写的字母表示。

• 分类检索通常用于对某个学科领域内文献的检索,实际运用中较少使用。

• 检索举例:小儿糖尿病的遗传学

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中国图书馆分类法( R 类)

R 医药、卫生 1 预防医学、卫生学 2 中国医学 3 基础医学 4 临床医学 5 内科学 6 外科学 71 妇产科学 72 儿科学 73 肿瘤学 74 神经病与精神病学 75 皮肤病学与性病学 76 耳鼻咽喉科学 77 眼科学 78 口腔科学 79 外国民族医学 8 特种医学 9 药学

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可细分至六、七级类目,R 医药、卫生(一级)R6 外科学 (二级)R65 外科学各论(三级)R656 腹部外科学(四级)R656.1 急腹症R656.2 腹部疝R656.3 腹壁 (五级)R656.31 腹壁炎症 (六级)R656.32 腹壁损伤

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操作步骤• 点击分类检索

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• 选择类名或者分类号

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• 输入“糖尿病”,并点击“查找”按钮

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• 点击“小儿糖尿病”,出现复分表。

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• 复分表是对分类的进一步限制,在出现的复分表中找到“遗传学”,并选中它。

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• 点击“分类检索”按钮,出现检索结果。

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(四)期刊检索

• 期刊检索是用来查找某个期刊是否在数据库中收录,以及查找发表在该期刊上的文章的。

• 通过“期刊导航”逐级浏览、或者直接从刊名、出版地、出版单位及期刊主题词等入口检索到期刊,即可浏览该刊的基本信息并进行检索。

• 通过设置年代及刊期(默认为全部),点击“检索”按钮,即可检索该刊的题录信息。

• 检索举例:中华内科杂志

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操作步骤• 点击“期刊检索”

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• 选择左边的检索途径,并输入期刊名称。

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• 点击“查找”按钮后出现查找结果。

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• 点击期刊名称,出现期刊的相关信息,并可设定年代和期数。

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• 输入“ 2006”

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• 点击“期刊检索”按钮后出现检索结果。

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(五)作者检索

• 通过作者检索,可以查找某个作者发表的文献,从而追踪该作者最近的研究情况。

• 可以检索以第一作者发表的文献。• 检索举例:钟南山作为第一作者发表的文献

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操作步骤• 点击“作者检索”,输入作者姓名,点击“查找”按钮,出现作者列表。

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• 点击“第一作者”图标,出现检索结果。

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(六)索引检索

• 索引词表包括数据库中所有可检索字段中的所有单个字和部分词组,以及主题词、期刊名称等词组。

• 该表有助于用户通过浏览方式选词检索。• 索引词表减速仅在默认字段中进行,而索引词表显示的命中文献

数为所有字段的检出结果,故索引表的检出文献数与索引表中显示的命中文献数有时不一致。

• 检索举例:小儿糖尿病的遗传学

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操作步骤• 点击索引检索,输入检索词,并点击查找。

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• 在出现的列表中,选择合适的词,本例选择“小儿糖尿病”。点击该行后出现检索结果。

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(七)定题检索

• 定题检索用于定期跟踪某一课题的最新文献。 • 定题检索步骤:①初次使用请首先注册。②制订检索策略并保存。③定期调用检索策略,获取最新信息。

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操作步骤• 点击“定题检索”,出现定题用户登录页面,新用户请注册。

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• 登录以后出现存储过的检索策略。

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• 点击策略名称,出现检索策略中的检索表达式。

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• “ 最新文献检索” 是对末次检索后至今数据库中新添加文献进行检索。 跟踪新文献请选择“更新检索”。

• “重新检索” 是对数据库中的所有文献再次进行检索,“重新检索”是定题检索的一个附加功能。

• “删除检索策略” 是删除不再需要的检索策略文件。

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定义新的检索策略• 首先清除检索史中不需要的检索表达式。

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• 然后进行相应的检索。本例使用主题词检索“门静脉高血压的治疗”。

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• 选择副主题词“治疗”

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• 检索结果

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• 点击“定题检索”。输入检索策略名称。

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• 点击存储策略。

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• 欲查看检索策略中的检索表达式,可以点击检索策略名称即可。

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限定条件

• 特定文献类型,如:综述、病例报告等。• 年龄组:婴儿、新生儿等。• 性别:男、女等。• 实验对象:人类、动物等。

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PDF文件

• 本数据库中全文为 PDF文件,可以使用 Acrobat Reader打开。

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(五)综合应用

• 例:乙酰胆碱类受体和平滑肌生理功能之间的关系。 乙酰胆碱类受体 acetylcholine-receptors 平滑肌 smooth-muscle

• 分别采用基本检索和主题检索

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操作步骤

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• 基本检索可直接输入 :乙酰胆碱受体 AND 平滑肌

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主题检索

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•选择副主题词:全部副主题词

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• 乙酰胆碱受体的检索结果

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输入:平滑肌,未发现相应主题词

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• 修改检索词,输入:平滑,找到:肌,平滑

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• 点击该行以后,选择副主题词

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• 平滑肌的检索结果

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• 打开检索史,选择这两条检索式

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• 点击 AND 按钮

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• 检索结果