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ACIDOS NUCLEICOS METABOLISMO DEL ADN METABOLISMO DEL ARN SINTESIS DE PROTEINAS

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ACIDOS NUCLEICOS

METABOLISMO DEL ADN

METABOLISMO DEL ARN

SINTESIS DE PROTEINAS

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NUCLEÓTIDOS Y ÁCIDOS NUCLEICOS

ALGUNOS CONCEPTOS GENERALES

Funciones de los nucleótidos:

Compuestos ricos en energía que dirigen los procesos metabólicos en todas las células.

También actúan como señales químicas respondiendo a estímulos extracelulares (hormonas).

Componentes estructurales de ADN y ARN.

La información necesaria para construir las secuencias de

ARN o de proteínas se encuentra en la secuencia de

nucleótidos del ADN.

GEN: segmento de ADN que contiene la información

necesaria para la síntesis de un producto biológico funcional

(proteína o RNA).

En las células hay varias clases de ARN: ARN ribosómicos,

ARN mensajeros, ARN de transferencia y RNA pequeños

nucleares.

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NUCLEÓTIDOS

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Los nucleótidos sucesivos de ADN y ARN

están unidos covalentemente por puentes de

grupos fosfatos.

Se une el OH 5’ de un nucleótido con el

OH 3’ del siguiente por un enlace

fosfodiéster.

El esqueleto covalente: unidades alternas

de grupos fosfatos y residuos de pentosa.

Las bases son grupos laterales

Los esqueletos covalentes son

hidrofílicos.

Los fosfatos tienen un pK cercano a 0,

están completamente ionizados cargados

negativamente a pH 7 el DNA es un

ácido.

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ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS (Watson y Crick, 1953)

La formación de enlaces de hidrógeno entre los grupos amino y carbonilo de las bases permiten la

asociación de dos o, a veces, tres cadenas de ácidos nucleicos.

Existen patrones de enlaces de hidrogeno específicos definidos por Watson y crick, 1953.

La estructura primaria de un ácido nucleico es su estructura covalente y su secuencia de nucleótidos.

la estructura secundaria es cualquier estructura regular y estable adoptada por algunos o todos los

nucleótidos de un ácido nucleico.

Se denomina estructura terciaria al plegamiento complejo de grandes cromosomas en el nucleoide

bacteriano o en la cromatina eucariótica.

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El ADN es una doble hélice

Rosalin Franklin y Maurice Wilkins, utilizando el método de difracción de rayos X, llegaron a las

siguientes conclusiones:

- Los polímeros de ADN son helicoidales

- Tiene dos periodicidades alrededor de su eje longitudinal, una primaria de

0.34 nm y otra secundaria de 3.6 nm.

- La molécula está formada por dos hebras.

El modelo tridimensional debía estar de acuerdo con estos datos y con las leyes de Chargaff.

Modelo tridimencional de Watson y Crick, 1953

10

residuos

Puentes H

Interacciones por

apilamiento

Doble hebra Complementaria y antiparalelas

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Es posible desnaturalizar el ADN y el ARN de doble

hebra

Las soluciones de ADN, en estado nativo, son muy viscosas a pH 7 y temperatura ambiente (20 a 25

ºC), pero si se las somete a valores extremos de pH y temperaturas superiores a 80 o 90 ºC, su

viscosidad desciende el ADN ha sufrido un cambio en su estado físico.

Desnaturalización o fusión del ADN por T o pH

extremos:

• Rotura de los enlaces H entre las bases.

• Rotura de las interacciones hidrofóbicas entre las

bases apareadas.

• No se rompe ningún enlace covalente del ADN.

La re-naturalización consta de uno o dos pasos según la

desnaturalización sea parcial o total, respectivamente:

• Paso 1: Las dos hebras deben encontrarse, mediante

colisiones al azar y formar un fragmento corto de doble

hélice complementaria. (no es necesario si persiste un

fragmento de doble hélice de 12 o más residuos)

• Paso 2: Las dos hebras se comportan como una

cremallera, formando la doble hélice completa.

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Micrografía electrónica de un ADN

parcialmente desnaturalizado

Temperatura de fusión del ADN

Cada especie de ADN tiene una temperatura de fusión que depende de su composición.

Cuanto más alto sea el contenido de bases G-C, más elevada será la temperatura de fusión.

Si se controlan las condiciones de desnaturalización, se puede desnaturalizar las regiones ricas en

A-T específicamente, mientras la mayor parte del ADN seguirá en la forma de doble hebra.

Las moléculas duplex de ARN

son más estables que las de

ADN y las formas híbridas

(ARN-ADN) son intermedias.

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Los ácidos nucleicos de especies diferentes pueden formar

híbridos La capacidad de dos hebras complementarias de ADN para aparearse entre ellas puede usarse para

detectar secuencias similares de ADN en dos especies diferentes o en el genoma de una misma

especie.

Este fenómeno indica que:

Los diferentes organismos comparten un cierto grado de herencia evolutiva común.

Poseen un cierto número de proteínas y ARN con funciones similares y a menudo estructuras

similares.

Los ADN y ARN de estas proteínas tienen secuencias homólogas.

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GENES Y CROMOSOMAS Las moléculas de ADN que contienen los genes celulares son

las mayores macromoléculas.

Normalmente se encuentran empaquetadas en estructuras

llamadas CROMOSOMAS

Las bacterias y virus tienen en general un solo cromosoma.

Los organismos eucarióticos tienen muchos más.

Un cromosoma suele tener miles de genes.

El conjunto de los genes y del ADN intergénico de todos los

cromosomas se conoce como GENOMA celular.

Los ADN cromosómicos son, a menudo, varios órdenes de

magnitud más largos que las estructuras biológicas (Células o

Virus) que los contienen.

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Los virus requieren una cantidad menor de información

genética que las células.

Los genomas víricos pueden ser de ARN o ADN.

DNA virico

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Las bacterias contienen más ADN que los virus. Ej E.

Coli tiene 200 veces más que el bacteriófago . El ADN de

una E. Coli es una única molécula de ADN circular de 4,7 x

106 pares de bases y tiene un contorno de 1,7 mm (850

veces el tamaño de la célula).

Además del gran cromosoma circular (nucleoide),

muchas bacterias contienen una o más moléculas pequeñas

de ADN circular, libres en el citosol: estos elementos

extracromosómicos se denominan PLÁSMIDOS.

DNA bacteriano

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Plásmidos Portan información genética y se

replican generando nuevos plásmidos

que se incorporan en las células hijas

en la división celular.

Generalmente, se encuentran

separados y no unidos al cromosoma.

En algunos casos, no aportan

ninguna ventaja al organismo que los

contienen.

Algunos plásmidos son portadores de

genes que confieren resistencia a

antibióticos al huésped que los

contiene.

Los plásmidos son de gran utilidad

para el estudio de muchos procesos del

metabolismo del ADN y son un

componente central en la aplicación de

la tecnología del ADN recombinante.

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Células eucariotas

DNA nuclear eucariota es

linear.

La longitud de contorno de

DNA de una célula humana es

de 2 m.

La observación

microscópica demostró que el

materia genético se subdivide

en cromosomas.

El numero de cromosomas

depende de cada especie.

n=numero haploide;

2n=diploide.

Una célula de levadura (eucariotas inferiores) tiene 4 veces mas

ADN que una bacteria, Drosophila 25 veces mas. Las células

humanas tienen unas 600 veces mas y las de algunas plantas y

anfibios mucho mas.

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Mitocondrias y cloroplastos contienen DNA

El ADN mitocondrial presente en células

somáticas típicas es menor al 0.1% total.

Células en división DNA mitocondrial > DNA

total.

DNA mitocondrial contiene unas 20.000 bp y es

duplex circular=cloroplastos.

DNA cloroplastos>DNA mitocondrial.

El DNA mitocondrial codifica para los tRNA y

rRNA mitocondriales y unas pocas proteínas

mitocodriales. 95% de las proteínas mitocondriales

esta codificado en el ADN nuclear.

Mitocondrias y cloroplastos se dividen al

dividirse las células. Antes y durante la división

celular el ADN se replica y las moléculas hijas pasan

a los orgánulos generados.

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Los genes son segmentos de ADN que codifican cadenas polipeptídicas y ARN

Desde una visión biológica, un GEN es aquella

parte de un cromosoma que determina o afecta a

un solo carácter o fenotipo .

Un gen-una enzima (Beadle y Tatum, 1940)

Un gen- una proteína

Un gen – un polipéptido

Finalmente, se observó que algunos genes

codifican diferentes clases de ARN, como tARN o

rARN.

Los genes que codifican para polipéptidos o ARN

se denominan genes estructurales.

El ADN también contiene otros segmentos que

tienen una función puramente reguladora:

secuencias reguladoras.

Colinealidad de las secuencias de nucleótidos de ADN y

mARN y de las secuencias de aminoácidos.

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Los intrones

interrumpen

la

colinealidad

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CROMATINA Y ESTRUCTURA NUCLEAR

En las células eucarióticas que no se hallan en proceso de división, el material

cromosómico, denominado CROMATINA, es amorfo y se halla disperso y

desordenado en el núcleo.

Cuando las células se preparan para dividirse la cromatina se condensa y se

estructura en cromosomas bien definidos.

La cromatina consiste en fibras que contienen tanto ADN como proteínas.

El ADN se encuentra asociado a pequeñas proteínas básicas llamadas

HISTONAS, que empaquetan y ordenan el ADN en pequeñas unidades

estructurales llamadas NUCLEOSOMAS.

ADN de enlace

Núcleo de

HISTONA del

nucleosoma

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2 cromátidas

(10 vueltas c.u.)

1 vuelta

(3 rosetas)

1 roseta

(6 bucles)

1 bucle

(75.000 pb)

Fibras 30 nm

Cromatina en

forma de cuentas

de rosario

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CARIOTIPO

clasificación de los cromosomas para identificar las

anormalidades morfológicas y numéricas

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METABOLISMO DEL ADN

Metabolismo del ADN Replicación: produce una replica exacta.

Reparación Existe una baja tolerancia biológica a

cambios en la secuencia del ADN.

Es la única molécula para la que

existen mecanismos de reparación.

Recombinación: se produce por la necesidad de un grado de

diversidad genética nuevas combinaciones de ALELO (sin

alterar la disposición génica)

Forma alternativa de un

mismo GEN

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Las enzimas que degradan el ADN se llaman NUCLEASAS o

DNasa.

exonucleasas: degradan el ADN desde los extremos, puede haber

específicas: 5’3’ o 3’ 5’.

• endonucleasas: actuan en el interior. Algunas cortan en

secuencias específicas. Ej. Las endonucleasas de restricción.

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DNA POLIMERASA

Reacción catalizada por la ADN polimerasa

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Replicación del ADN de E. Coli

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Eliminación de los cebadores de RNA y unión de fragmentos

(procariotas)

Eucariotas: eliminación de fragmentos ARN por ARNasa H

(exonucleasa 5’—3’), huecos: polimerasa δ y luego ADN ligasa

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Acción de las topoisomerasas durante la replicación del DNA

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Modelo de la horquilla de replicación de E. Coli

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Las ADN polimerasas son muy precisas

CORRECCIÓN DE PRUEBAS

-Las ADN polimerasas tienen una actividad

exonucleasa 3’5’ separad