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hacong
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Em cristalografia: resoluçãofator-Rfatores-B atômicosocupação
Em NMR: RMSD da cadeia principal e da molécula toda(antigamente) RMSD de segmentos estruturados
resultados precisos porém não necessariamente acurados
Em NMR: nível de completeza de NOEs baseado na estruturas obtidas(atualmente) grau de coerência entre estruturas e restrições experimentais
qualidade das propriedades geométricas
sistemática nos critérios de análise de estruturas publicadas(AQUA e PROCHECK-NMR)
Restrições experimentais: coerência entre modelos finais e restrições experimentais,dada na forma de número e tamanho de restrições violadas.
erros randômicosdifusão de spinerros sistemáticos introduzidos por diferentes seqüências de pulsosdesconhecimento da função de densidade espectral ( NOE const.J( ).r-6 )
Qualidade estereoquímica: são analisadas propriedades geométricas da proteína (comprimento e ângulo de ligação, ângulos diedrais e impróprios, etc.), com base em dados obtidos por comparação das várias estruturas resolvidas por raios-X, de alta resolução, depositadas no PDB.
gráfico de RamachandranRMSD da cadeia principal e cadeias lateraisvariância circularacessibilidade ao solventefator-Gresolução equivalente