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Analyse Bayesienne Analyse Bayesienne de l’héritabilité de l’héritabilité de de la dysplasie de la la dysplasie de la hanche hanche chez le chez le Berger Allemand. Berger Allemand. Roy Emmanuelle Lacreusette Marlène Groupe 2

Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche chez le Berger Allemand

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Roy Emmanuelle Lacreusette Marlène Groupe 2. Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche chez le Berger Allemand. Le Berger Allemand : race de chien très populaire très prisée comme chien de travail. fortement prédisposé à la dysplasie de la hanche. - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

Analyse Bayesienne de Analyse Bayesienne de l’héritabilitél’héritabilité de la dysplasie de la dysplasie de la hanchede la hanche chez le Berger chez le Berger

Allemand.Allemand.

Roy Emmanuelle

Lacreusette Marlène

Groupe 2

Page 2: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

Le Berger AllemandLe Berger Allemand : : race de chien très populaire race de chien très populaire très prisée comme chien de travail. très prisée comme chien de travail. fortement prédisposé à la dysplasie de la hanche. fortement prédisposé à la dysplasie de la hanche.

Dysplasie de la hancheDysplasie de la hanche : : Maladie dégénérative de l’articulation coxo-Maladie dégénérative de l’articulation coxo-

fémorale. fémorale. Entraîne des boiteries à froid.Entraîne des boiteries à froid. paralysie ou parésie du train postérieur avec paralysie ou parésie du train postérieur avec

douleur. douleur. H. Hamann et al.H. Hamann et al. : test la significativité de : test la significativité de

différents effets sur l’apparition de la différents effets sur l’apparition de la pathologie.pathologie.

Page 3: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

I.I. OBJECTIFSOBJECTIFS Etude de la dysplasie de l’articulation coxo-fémorale.Etude de la dysplasie de l’articulation coxo-fémorale. Diagnostic : repose sur des examens radiographiques Diagnostic : repose sur des examens radiographiques

et conduit à une classification selon 5 degrés de et conduit à une classification selon 5 degrés de gravité. gravité.

Etiologie polygénétique et plutifactorielle. Etiologie polygénétique et plutifactorielle. ObjectifObjectif : estimer l’héritabilité et les composants de la  : estimer l’héritabilité et les composants de la

variance des lésions de dysplasie dans une population variance des lésions de dysplasie dans une population allemande de bergers allemands. allemande de bergers allemands.

Page 4: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

II.II. RAPPELSRAPPELS Prédisposition de certaines racesPrédisposition de certaines races : Terre- : Terre-

neuve, Berger Picard, Setter Gordon, neuve, Berger Picard, Setter Gordon, Berger Berger AllemandAllemand, … (attention aux variations intra-, … (attention aux variations intra-race). race).

Facteurs environnementaux prédisposantsFacteurs environnementaux prédisposants :  : obésité, traumatisme, effort intense pendant la obésité, traumatisme, effort intense pendant la croissance, … croissance, …

Lésions pathognomoniques à la RX. Lésions pathognomoniques à la RX.

Page 5: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

III.III. MATERIELMATERIELA. LES CHIENSA. LES CHIENS Etude rétrospective sur 21371 Bergers allemands Etude rétrospective sur 21371 Bergers allemands

testés pour la dysplasie de la hanche :testés pour la dysplasie de la hanche : 10591 femelles/10780 mâles.10591 femelles/10780 mâles. Répartis dans 3755 chenils et provenant de 9704 portées. Répartis dans 3755 chenils et provenant de 9704 portées.

Animaux nés entre le 1er janvier 1998 et le 31 Animaux nés entre le 1er janvier 1998 et le 31 décembre 2000. décembre 2000.

On étudie le pedigree sur 6 générations. On étudie le pedigree sur 6 générations.

Page 6: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

B. L’EXAMEN B. L’EXAMEN RADIOGRAPHIQUE.RADIOGRAPHIQUE.

Attention car un chien qui ne présente aucune Attention car un chien qui ne présente aucune boiterie et qui paraît normal à la palpation peut boiterie et qui paraît normal à la palpation peut tout de même présenter des lésions de dysplasie tout de même présenter des lésions de dysplasie de la hanche !de la hanche !

Les examens sont réalisés par 1 seul groupe de Les examens sont réalisés par 1 seul groupe de vétérinaires faisant parti de la même commission. vétérinaires faisant parti de la même commission.

On classe les résultats selon 5 degrés. Le score On classe les résultats selon 5 degrés. Le score moyen dans ces élevages est de 1,51 ± 0,83.moyen dans ces élevages est de 1,51 ± 0,83.

Page 7: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

Grade Grade Symptômes Symptômes AA Aucun signe de dysplasieAucun signe de dysplasie

coaptation parfaite tête fémorale/acétabulum et angle N-O > 105°coaptation parfaite tête fémorale/acétabulum et angle N-O > 105°

BB Stade intermédiaireStade intermédiairemauvaise coaptation tête fémorale/acétabulum et angle N-O > 105°mauvaise coaptation tête fémorale/acétabulum et angle N-O > 105°ou bienou bienbonne coaptation tête fémorale/acétabulum mais angle N-O compris bonne coaptation tête fémorale/acétabulum mais angle N-O compris entre 100° et 105°entre 100° et 105°

CC Dysplasie légèreDysplasie légèremauvaise coaptation tête fémorale/acétabulum et angle N-O compris mauvaise coaptation tête fémorale/acétabulum et angle N-O compris entre 100° et 105°entre 100° et 105°

DD Dysplasie moyenneDysplasie moyennemauvaise coaptation tête fémorale/acétabulum et angle N-O compris mauvaise coaptation tête fémorale/acétabulum et angle N-O compris entre 90° et 100°entre 90° et 100°signes d'arthrosesignes d'arthrose

EE Dysplasie graveDysplasie graveluxation ou subluxation de la tête fémorale/acétabulum et angle N-O < luxation ou subluxation de la tête fémorale/acétabulum et angle N-O < 90°90°arthrosearthrose

Page 8: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

IV.IV. METHODESMETHODESA. METHODE STATISTIQUE.A. METHODE STATISTIQUE. Dans 1 premier temps on utilisera une analyse Dans 1 premier temps on utilisera une analyse

statistique pour déterminer si les effets fixes sont statistique pour déterminer si les effets fixes sont significatifs ou non : sexe, âge lors de l’examen, significatifs ou non : sexe, âge lors de l’examen, taille de la portée par rapport au nombre de chiens taille de la portée par rapport au nombre de chiens examinés par portée, le nombre de chiens examinés examinés par portée, le nombre de chiens examinés par vétérinaire. On teste les mâles et les femelles par vétérinaire. On teste les mâles et les femelles fondateurs pour leur significativité. fondateurs pour leur significativité.

C’est un modèle linéaire généralisé (GLM). C’est un modèle linéaire généralisé (GLM).

Page 9: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

B. MODELE ANIMAL.B. MODELE ANIMAL. Modèle linéaire. Modèle linéaire. 6 modèles animaux.6 modèles animaux. h²= σ²A /(σ²A + σ²E)h²= σ²A /(σ²A + σ²E) On utilisera une analyse bayésienne On utilisera une analyse bayésienne

utilisant un échantillonnage de Gibbs. Les utilisant un échantillonnage de Gibbs. Les équations seront résolues à l’aide du équations seront résolues à l’aide du programme informatique MTGSAM programme informatique MTGSAM version 1.1. version 1.1.

Page 10: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

V.V. RESULTATS.RESULTATS. A. ANALYSE STATISTIQUE.

Page 11: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

B. MODELE ANIMAL.B. MODELE ANIMAL.

Page 12: Analyse Bayesienne de l’héritabilité de la dysplasie de la hanche  chez le Berger Allemand

ConclusionConclusion Que montre cette étude???Que montre cette étude??? Effets fixes significatifs (vs effet sexe) mais peu Effets fixes significatifs (vs effet sexe) mais peu

d’influence sur les paramètres génétiques. d’influence sur les paramètres génétiques. Effets environnementaux portée et élevage sont Effets environnementaux portée et élevage sont

significatifs mais importance faible. significatifs mais importance faible. Effets génétiques additifs significatifs: Effets génétiques additifs significatifs:

effet maternel faible mais non négligeable (à prendre en effet maternel faible mais non négligeable (à prendre en compte dans la sélection). compte dans la sélection).

Effet génétique additif propre à l’animal important. Effet génétique additif propre à l’animal important. Effets résiduels très importants Effets résiduels très importants grande part grande part

d’inconnues ???d’inconnues ???

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Utilisations en pratique Utilisations en pratique vétérinaire:vétérinaire:

Ne pas se baser uniquement sur le Ne pas se baser uniquement sur le phénotype de l’animal. Ne pas jouer que phénotype de l’animal. Ne pas jouer que sur la sélection des mâles. sur la sélection des mâles.

Instaurer un système de RX obligatoire Instaurer un système de RX obligatoire chez les espèces à risque. chez les espèces à risque.

Mise en place d’un registre national. Mise en place d’un registre national. Communication accrue entre le Communication accrue entre le

vétérinaire et les acheteurs et éleveurs. vétérinaire et les acheteurs et éleveurs. Mise en garde contre la consanguinité. Mise en garde contre la consanguinité. Mise en place d’une prophylaxie.Mise en place d’une prophylaxie.

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CritiqueCritique Echantillonnage plus important. Echantillonnage plus important. Nécessité d’un programme Nécessité d’un programme

informatique sophistiqué. informatique sophistiqué. Importance de la composante résiduelle Importance de la composante résiduelle il reste beaucoup de paramètres il reste beaucoup de paramètres inconnus empêchant une éradication inconnus empêchant une éradication efficace de la dysplasie de la hanche. efficace de la dysplasie de la hanche.

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HAMMAN H., KIRCHHOF T., DISTL O. Bayesian HAMMAN H., KIRCHHOF T., DISTL O. Bayesian analysis of heritability of canine hip dysplasia in analysis of heritability of canine hip dysplasia in German Shepherd Dogs. J. Anim. Breed. Genet., German Shepherd Dogs. J. Anim. Breed. Genet., 2003, 2003, 120120: 258-268.: 258-268.

DETILLEUX J.Cours de génétique quantitative de DETILLEUX J.Cours de génétique quantitative de 1er doctorat, année 2004-22051er doctorat, année 2004-2205

http://www.omvq.qc.ca/Chroniques/hanche/http://www.omvq.qc.ca/Chroniques/hanche/hanche.htmlhanche.html

http://www.chien-guide.org/ad/asantedysplasie.htmhttp://www.chien-guide.org/ad/asantedysplasie.htm http://www.labradors.org/dysplasie.htmhttp://www.labradors.org/dysplasie.htm http://http://www.bergerallemand-duvaldaulnoy.comwww.bergerallemand-duvaldaulnoy.com http://http://www.hund.chwww.hund.ch

BIBLIOGRAPHIE