Antagonisme/Antibiosis/AmensalismeAntagonisme merupakan hubungan antara dua spesies dimana salah satu akan terhambat atau terbunuh pertumbuhannya karena senyawa yang dihasilkan oleh spesies yang lain. Contoh : pigmen biruPsedomonas deruginosae.SinergismeSinergisme merupakan hubungan antara spesies dimana kegiatan masing-masing berupa suatu urut-urutan yang saling menguntungkan.contoh : pembuatan tape yang mengandungAspergillus, Saccharomyces, Candida, HansenuladanAcetobacter.f.KompetisiKompetisi merupakan bentuk hubungan antar spesies dimana terjadi persaingan karena adanya keperluan akan zat makanan yang sama. spesies yang dapat bertahan yang akan mengalami pertumbuhan paling subur. Misalnya bila persediaan oksigen dalam suatu medium berkurang, maka bakteri aerob akan dikalahkan oleh bakteri aerob fakultatif. Jika persediaan oksigen habis, maka pertumbuhan bakteri anaerob fakultatif akan berhenti sedang bakteri anaerob akan tumbuh subur.

a. NetralismeNetralisme adalah hubungan antara dua populasi yang tidak saling mempengaruhi. Hal ini dapat terjadi pada kepadatan populasi yang sangat rendah atau secara fisik dipisahkan dalam mikrohabitat, serta populasi yang keluar dari habitat alamiahnya. Sebagai contoh interaksi antara mikrobaallocthonous(nonindigenous) dengan mikrobaautochthonous(indigenous), dan antar mikrobanonindigenousdi atmosfer yang kepadatan populasinya sangat rendah. Netralisme juga terjadi pada keadaan mikroba tidak aktif, misal dalam keadaan kering beku, atau fase istirahat (spora, kista).b. KomensalismeHubungan komensalisme antara dua populasi terjadi apabila satu populasi diuntungkan tetapi populasi lain tidak terpengaruh. Contohnya adalah:- BakteriFlavobacterium brevisdapat menghasilkan ekskresi sistein. Sistein dapat digunakan olehLegionella pneumophila.- Desulfovibrio mensuplai asetat dan H2 untuk respirasi anaerobicMethanobacterium.c. SinergismeSuatu bentuk asosiasi yang menyebabkan terjadinya suatu kemampuan untuk dapat melakukan perubahan kimia tertentu di dalam substrat. Apabila asosiasi melibatkan 2 populasi atau lebih dalam keperluan nutrisi bersama, maka disebut sintropisme. Sintropisme sangat penting dalam peruraian bahan organik tanah, atau proses pembersihan air secara alami.d. Mutualisme (Simbiosis)Mutualisme adalah asosiasi antara dua populasi mikroba yang keduanya saling tergantung dan sama-sama mendapat keuntungan. Mutualisme sering disebut juga simbiosis. Simbiosis bersifat sangat spesifik (khusus) dan salah satu populasi anggota simbiosis tidak dapat digantikan tempatnya oleh spesies lain yang mirip. Contohnya adalah BakteriRhizobiumsp. yang hidup pada bintil akar tanaman kacang-kacangan. Contoh lain adalahLichenes(Lichens), yang merupakan simbiosis antara algae sianobakteria dengan fungi. Algae (phycobiont) sebagai produser yang dapat menggunakan energi cahaya untuk menghasilkan senyawa organik. Senyawa organik dapat digunakan oleh fungi (mycobiont), dan fungi memberikan bentuk perlindungan (selubung) dan transport nutrien / mineral serta membentuk faktor tumbuh untuk algae.Lichenese. KompetisiHubungan negatif antara 2 populasi mikroba yang keduanya mengalami kerugian. Peristiwa ini ditandai dengan menurunnya sel hidup dan pertumbuhannya. Kompetisi terjadi pada 2 populasi mikroba yang menggunakan nutrien / makanan yang sama, atau dalam keadaan nutrien terbatas. Contohnya adalah antara protozoaParamaecium caudatumdenganParamaecium aurelia.f. Amensalisme (Antagonisme)Satu bentuk asosiasi antar spesies mikroba yang menyebabkan salah satu pihak dirugikan, pihak lain diuntungkan atau tidak terpengaruh apapun. Umumnya merupakan cara untuk melindungi diri terhadap populasi mikroba lain. Misalnya dengan menghasilkan senyawa asam, toksin, atau antibiotika. Contohnya adalah bakteri Acetobacter yang mengubah etanol menjadi asam asetat.Thiobacillus thiooxidansmenghasilkan asam sulfat. Asam-asam tersebut dapat menghambat pertumbuhan bakteri lain. Bakteri amonifikasi menghasilkan ammonium yang dapat menghambat populasiNitrobacter.g. ParasitismeParasitisme terjadi antara dua populasi, populasi satu diuntungkan (parasit) dan populasi lain dirugikan (host / inang). Umumnya parasitisme terjadi karena keperluan nutrisi dan bersifat spesifik. Ukuran parasit biasanya lebih kecil dari inangnya. Terjadinya parasitisme memerlukan kontak secara fisik maupun metabolik serta waktu kontak yang relatif lama. Contohnya adalah bakteriBdellovibrioyang memparasit bakteriE. coli. JamurTrichodermasp. memparasit jamurAgaricussp.h. PredasiHubungan predasi terjadi apabila satu organisme predator memangsa atau memakan dan mencerna organisme lain (prey). Umumnya predator berukuran lebih besar dibandingkan prey, dan peristiwanya berlangsung cepat. Contohnya adalah Protozoa (predator) dengan bakteri (prey). ProtozoaDidinium nasutum(predator) denganParamaecium caudatum(prey), dapat dilihat di gambar sebagai berikut. Sintrofisme adalah hubungan mikroorganisme yang tidak terlalu dekat tetapi keduanya memberikan keuntungan secara timbal balik kompetensi adalah interaksi dalam mikroorganisme yang merupakan persaingan akibat keterbatasan zat makanan serta energy yang tersedia.ada pula organism yang menghasilkan berbagai substansi yang menghambat mikroorganisme lain. simbiosis adalah hubungan yang dekat antara dua bentuk kehidupan,berlangsung lama atau sebentar dan memerlukan kontak fisik.pada endosimbiosis suatu organism berada di dalam organism yang lain sedangkan pada ekotosimbiosis organisme berada dipermukaan yang lain.terdapat tiga jenis simbiosis yaitu:

a.mutualisme adalah bentuk hubungan yang saling menguntungkan kedua belah pihak.sebagai contoh adanya kerja sama antara Rhizobium Leguminosarum dengan tanaman Leguminosae dan sebagai gantinya mengikat nitrogen udara menjadi senyawa nytrogen yang dapat dimanfaatkan oleh tanaman tersebut.b.komensalisme,pada bentukinteraksiini,satu organism mendapatkan keuntungan sedangkan yang lain tidak dirugikan ataupun mendapat keuntungan.sebagai contoh adalah staphylococcus epderimis yang hidup sebagai komersal pada kulit manusia.c.Parisitisme,suatu interaksi dikatakan sebagai parasitisme bila salah satu pihak mendapat keuntungan sedangkan pihak lain dirugikan.organisme yang mengandung parasit disebut hospes.interaksitersebut dapat terjadi dalam bentuk gejala-gejala penyakit.mikroorganisme ini akan tumbuh dan berkembang pada sel dan jaringan yang akan mengakibatkan kerusakan pada sel dan jaringan tersebut.bila gejala mereda tapi parasit masih ada,ini berarti telah mencapai keseimbangan biologic antara parasit dan hospes.dalam hal ini hospes dapat bertindak sebagai carrierAntibiosis adalah interaksi antarorganisme dimana salah satu organisme menghasilkan zat antibiotik atau racun yang berbahaya bagi organisme lainnya,Misalnya interaksi antara jamur Penicillium dengan jenis mikroorganisme lain,jamur Penicillium mengeluarkan antibiotik yang dapat menghambat atau mematikan mikroorganisme lain yang hidup di sekitarnya.