Embed Size (px)
DESCRIPTION
AA
Citation preview
ASAM AMINO,PROTEIN
&ASAM NUKLEAT
Kuliah Biomedik 1
Fakultas Kedokteran
Universitas Tarumanagara
MAKANAN NORMAL
campuran kompleks bahan-bahan tumbuhan dan
binatang
PROTEIN, LEMAK, KARBOHIDRAT
DEFINISI
PROTEIN PROTEIOS
Il
Pertama
POLIAMIDA
Asam-asam amino = 20 macam
STRUKTUR UMUM
H2N CH C
R
OH
O
H2N CH C
R OH
O+H3N CH C
R O -
O
ION DIPOLAR
ZWITTER ION
RANTAI SAMPING
• R = alifatik gly, ala, val, leu, ile, pro
• R = hidrosiklik ser, thr
• R = aromatik phe, tyr, trp
• R = asam asp, glu
• R = amida asn, gln
• R = basa lys, arg, his
• R = mengand. S cys, met
KONFIGURASI
CHO
HO
CH 2
OH
L-Gliseraldehid
H C
H N C H
COOH
R
asam L-amino
..
2
ALANIN = ALA
CH3 C
NH3 +
COO -
H pKa =
pKb =
2,3
9,7
HCOOH C
NH3 +
CH3OH
-
H +
HCOO
-C
NH3 +
CH3OH
-
H+
HCOO
-C
NH2
CH3
2,3 9,7 + 1 0 -1
pI = ½ ( 2,3 + 9,7) = 6
ASAM AMINO PROTEIN
- ALANIN m/ Co – Enzym A (asetilasa)
d/ as, pantotenat vitaminC – C – CO2
-
NH3
+
• TAURIN t.d/ sel, terikat pd as. Empedu
C – C – SO3- diturunkan dari sistein
TAURO CHOLAT
NH3+
ASAM AMINO PROTEIN• As. - AMINO BUTIRAT (GABA)
C – C – C – CO2- m/ decarboksilasi A.
GLUTAMAT
NH3+ d/ jar. Otak, ragi, bakteri
• As. - AMINO ISO BUTIRAT m/ hasil
H3N+ – C – C – CO2- katabolisme pirimidin d/ otot tnt
CH3
Penentuan a.a.
• kromatografi daya partisi a.a terhadap
fasa diam dan fasa gerak
• mikrobiologi mikroorganisme
• kolorimetri perband. warna p. suatu Rx.
REAKSI WARNA
Rx warna asam amino
NAMA PEREAKSI a.a. WARNA
NIN-HIDRIN Nin-hidrin Ungu Ruheman
NITRO PRUSID
Na-nitroprusid/NH4OH encer
SISTEIN Merah
HOPKINS-COLE
As. glioksilat/ H2SO4
TRIPTOFAN Ungu
MILLON HgNO3 / HNO3 TIROSIN Merah
KSANTO PROTEIN
HONO2 pekat Tir, trp, phe(inti benzen)
Kuning
SAKAGUCHI Alfa-naftol + Na-hipoklorit
ARGININ Merah
SULLIVAN Na-naftokuinon-1,2-sulfonat-4
SISTEIN Merah
Rx warna asam amino
NAMA PEREAKSI a.a. WARNA
SULLIVAN Na-naftokuinon-1,2-sulfonat-4
SISTEIN Merah
PAULY Na-hipoklorit, As.Sulfanilat yang didiazokan d. basa
TIROSINHISTIDIN
Merah
EHRLICH p-dime-amino-benzaldehid/ HCl 12N
TRIPTOFAN Biru
FOLIN-CASCALTEU
As. fosfomolibdo-tungstat
TIROSIN Merah
PEPTIDAPEPTIDA
H2N CH C
R1
OH
O
H2N CH C
R2
OH
O
+
a.a. 1 a.a 2
H2N CH C
R1
O
H N
CH C
R2
OH
O
Residu NIkatanpeptida
Residu C
TATA NAMA
• INA IL
• Dari ujung kiri kanan, atau ujung C ujung C
Glutation = γ - glutamil – sisteil – glisin
Glu - cys - gly
• TRF = piroglutamil-histidil-prolinamida
NH
CH C
CH2 OH2C
CO HN CH C
CH2
O
N
NH
NC
NH2
O
PENENTUAN STRUKTUR PEPTIDA
• JENIS DAN BANYAK ASAM AMINO
(AMINO ACID ANALYZER).
• URUTAN ASAM AMINO
▨ ANALISIS RESIDU UJUNG N
1. PEREAKSI SANGER 2,4-DINITROFLUOROBENZEN (DNP) FLUORO BEREAKSI DENGAN GUGUS NH2 PADA RANTAI
▨ 2. PEREAKSI EDMAN FENIL ISOTIOSIANAT
PENANDAAN DAN PEMBEBASAN AA UJUNG N HETEROSIKLIK FENILTIOHIDANTOIN + A A BERIKUT
• PEMUTUS POLIPEPTIDA SPESIFIK
ENZIM PROTEOLITIK
ENZIM PROTEOLITIK
No.
PEREAKSI SISI PEMUTUS
1. KIMOTRIPSIN Phe, Tyr, Trp
2. PEPSIN Tyr, Phe, Trp
3. TERMOLISIN Ile, Leu, Val
4. TRIPSIN Lys, Arg
5. SIANOGEN BROMIDA (CNBr) Met
6. KARBOKSI PEPTIDASE ASAM AMINO UJUNG C
PROTEIN POLIAMIDA PEPTIDA
PROTEIN POLIAMIDA PEPTIDA > 100 a.a. < 100 a.a.
H2O
a. a.a. Prot. Sederhana a.a. + bukan a.a. Prot. Majemuk
hem, k.h., l, as. nukleat
SIFAT-SIFAT PROTEIN
1. LARUT DENATURASI» BER (-) KELARUTAN
» HILANGNYA KEAKTIFAN ENZIM, HORMON
» # DIHABLURKAN KEMBALI
PERUB. STR.
PEMECAHAN IKATAN
KOAGULASI DENATURASI PERMANEN
SIFAT-SIFAT PROTEIN
2. KOLOID HIDROFIL
( -NH2, -COOH, -OH )
3. AMFOTER
4. PROTEIN (-) mengikat KATION
PROTEIN (+) mengikat ANION
5. BERDIALISIS
6. Rx. PRESIPITASI:– As. Mineral <<< mengendap, >>> larut– Basa H2O mengendap– Pereaksi alkaloid mengendap. Bila pH = pI– (trikloro asetat, as. tanat, dll) – garam dr. logam berat, mengendap tgt. PH, suhu,
e-lit– alkohol, mengendap, >>> efektif pada pI– pemanasan koagulasi # larut– suhu eff. 38 oC - 75 oC
KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS
a. PROTEIN SERAT pembentuk otot, kulit, rambut, (Fibrous protein) dinding pembuluh darah,
tdd. Molekul yang panjang, erat dan larut
– Contoh:• Kolagen jar. Penyambung kaya OH-prolin• Elastin urat & pembuluh darah• Keratin rambut, kuku, bulu burung kaya
sistein & sistin
KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS
b. PROTEIN GLOBULAR melakukan berbagai fungsi
(tipe fungsional) larut d. air
– Contoh:• Hb pembawa oksigen ke sel• Insulin berperan dalam metabolisme karbohidrat• Antibodi membentuk protein asing menjadi tidak aktif• Fibrinogen memb. serat2 tdk larut yg menggump.
darah• Hormon membawa pesan keseluruh tubuh
KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS
• ENZIM KATALIS BIOLOGIK
• HORMON PEMBAWA BERITA KIMIA
• PROT. TRANSPOR PEMBAWA MOLEKUL KECIL
• PROT. CADANGAN , Seperti : Kasein susu
Ovalbumin putih telur
KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS
• PROTEIN KONYUGASI bersenyawa dengan non (conyugate protein) protein
– Contoh: - as nukleat nukleo protein• - > 4% karbohidrat muko protein• - < 4% karbohidrat gliko protein• - lipid lipoprotein pospolipid kolesterol
• - zat warna kromo protein• - asam pospat fosfo protein• - ion logam metalo protein
STRUKTUR PROTEIN
• STRUKTUR PRIMER– m/ rentetan a.a. molekul protein, akibat ik. PEPTIDA– PENENTU IDENTITAS PROTEIN
• STRUKTUR SEKUNDER– Ik. HIDROGEN– Ik. DISULFIDA MELILITNYA RANTAI POLIPEPTIDA
• STRUKTUR TERSIER
– Ik. HIDROGEN– GAYA VAN DER WALLS PELIPATAN LAPISAN
• STRUKTUR KUARTERNER SEP. BOLA-BOLA
ASAM NUKLEAT ASAM NUKLEAT
(DNA , RNA)polimer
NUKLEOTIDA
BASA NITROGEN NUKLEOSIDA1 UNIT GULA NUKLEOTIDA1 GUGUS FOSFAT
ik. Kovalen
hetero atom pada P & P dari C 1’ pada Gula
• Misal nukleosida:
ADENIN + β D.2 DEOKSI RIBOSA
9
1'
5'
N
NN
N
NH2
O
HOH
HH
HH
HO
Misal Nukleotida pirimidin:URIDIN TRIPOSPAT(UTP)
O
NH
O
ON
O
OHOH
HH
HH
OP
O-
O
P
O
O
O-
P
O
HO
O-
1'
2'3'
4'
5'
NUKLEOTIDA MONOPOSPAT UTAMA
NUKLEOTIDA NAMABASA UNSUR NUKLEOSIDA
RIBO NUKLEOTIDA- AMP- GMP- CMP- UMP
ADENINGUANINSITOSINURASIL
ADENOSINGUANOSINSITIDINURIDIN
DEOKSI RIBO NUKLEOTIDA- d AMP- d GMP- d CMP- d TMP
ADENINGUANINSITOSIN
TIMIN
deoksi ADENOSIN deoksi GUANOSIN deoksi SITIDINdeoksi TIMIDIN
