21
Biometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai és Elméleti Biológiai Tsz. BEVEZETŐ

Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

  • Upload
    others

  • View
    4

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Biometria, alapozó biostatisztika

Könnyű BalázsELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai és Elméleti Biológiai Tsz.

BEVEZETŐ

Page 2: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Előadás (biometb17va) Déli Tömb, 0-822 Mogyoródi József terem Kedd: 10.00-11.00

Gyakorlatok (biometb17va) Déli tömb, 7-424 (BI számítógépes labor)

Szerda 10.00-11.00 - Paczkó Mátyás Szerda 11.00-12.00 - Hubai AndrásSzerda 12.00-13.00 - Hubai AndrásSzerda 14.00-15.00 - Vörös DánielCsütörtök 8.00- 9.00 - Könnyű BalázsCsütörtök 9.00-10.00 - Radványi ÁdámPéntek 10.00-11.00 - Konrád KrisztinaPéntek 11.00-12.00 - Kovács Bálint

Page 3: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

TananyagKombinatorika

Valószínűségszámítás

Valószínűségi változók(2-3. hét)

R

Leíró statisztika(4-5. hét)

Hipotézisvizsgálat(6-7. hét)

Egymintás próbák (8-9. hét)

Kétmintás próbák(10.hét)

ANOVA(11. hét)

Függetlenség, korreláció(12.hét)

Lineáris regresszió(13. hét)

Page 4: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Előfeltételek, irodalom

Solt György: Valószínűségszámítás (Bólyai sorozat)

● Reiczigel-Harnos-Solymosi: Biostatisztika, nem statisztikusoknak● Könyv (+ ebook + gyf)

4000 Ft (ELTE-s ár)● ebook+gyakorló

feladatok https://e-akademia.hu/ féléves előfizetés!!!2000 Ft

● A honlapról letölthető előadás, feladatsor

Előfeltételek● Matematika (kombinatorika,

valószínűségszámítás )● Informatika (R)Irodalom:

Page 5: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

http://plantsys.elte.hu/drupal/hu/oktatas/biometria

Page 6: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Gyakorlat● Kötelező a részvétel (max. 3 hiányzás)● Két sikeres (>50%) évközi ZH

KövetelményekElőadás

● Elméleti kérdések a gyakorlati ZH-ban (>80% → GY jegy előfeltétel)

I. ZH: 6-7. hét II. ZH: 15. hét (Vizsgaidőszak 1. hét)

március 18. 18.00-20.00 – Hubai András május 18. 16.00-18.00 – Könnyű Balázs

március 19. 18.00-20.00 – Hubai András május 18. 18.00-20.00 – Radványi Ádám

március 20. 18.00-20.00 – Konrád Krisztina május 19. 16.00-18.00 – Konrád Krisztina

Március 23. 19.00-21.00 – Radványi Ádám május 19. 18.00-20.00 – Kovács Bálint

március 24. 19.00-21.00 május 20. 16.00-18.00 – Hubai András

március 25. 18.00-20.00 – Könnyű Balázs május 20. 18.00-20.00 – Hubai András

március 26. 18.00-20.00 – Vörös Dániel május 21. 18.00-20.00

március 27. 18.00-20.00 – Kovács Bálint május 22. 18.00-20.00 – Vörös Dániel

Déli tömb, 7-424 (BI számítógépes labor)

Page 7: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Gyakorlat● Kötelező a részvétel (max. 3 hiányzás)● Két sikeres (>50%) évközi ZH

I. ZH: 6-7. hét II. ZH: 15. hét (vizsgaidőszak 1. hete)

● Házi feladatok:● A rész: adott heti anyagrészből● B rész: következő heti anyagrészből

● Pótolási lehetőségA vizsga időszak 2. hetében elméletből is, és gyakorlatból is

JegyZH1 + ZH2 + HF

pl. 40% + 40% + 20% → Pont → ponthatárok → Jegy

KövetelményekElőadás

● Elméleti kérdések a gyakorlati ZH-ban (>80% → GY jegy előfeltétel)

Page 8: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Gyakorlatra

OlvasniTK: 6-12. oldal

Page 9: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Miért érdemes statisztikát tanulni?egy szubjektív válasz

Page 10: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

A cikk főszereplője: anticianidok

Bevezető:Anticiánok szerepe a növényi stresszben

Stressz indukált antocianidokKépzése (hipotézis:

reaktív oxigén gyökök semlegesítése)

Felhalmozódása különböző szövetekben

Cél:

„do different anthocyanins accumulate in response to different stress conditions?”

Antocián ujjlenyomat

Page 11: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

AnthocyaninInductiveCondition

Page 12: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

0.11

0.04 0.060.1 0.12 0.15

0.28

0.49 0.560.11 =?= 0.100.11 =?= 0.120.11 =?= 0.15

Page 13: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

0.11

0.04 0.060.1 0.12 0.15

0.28

0.49 0.560.11 =?= 0.040.11 =?= 0.06

Page 14: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

0.11

0.04 0.060.1 0.12 0.15

0.28

0.49 0.560.11 =?= 0.280.11 =?= 0.490.11 =?= 0.56

Page 15: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

Antocianid tartalom(statisztika)

Kontroll vs. Kezelés

0.11 < 0.04*

0.11 < 0.06*

0.11 = 0.100.11 = 0.120.11 = 0.150.11 > 0.28*

0.11 > 0.49*

0.11 > 0.56*

* szignifikáns különbség ~ sztochasztikus (véletlen) ingadozásnál nagyobb eltérés

Page 16: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

„2x2 néha 5”avagy miért

van sztochasztikus

ingadozás?

mérési korlátok

Page 17: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Kutatástervezés

Page 18: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Kutatástervezés

● Kérdés → alapkutatás (ismeretszerzés), alkalmazott kutatás (az ismeretek alkalmazhatóságának felderítése)

● A rendszer megismerése, elővizsgálatok, alapos irodalmazás● Kérdés pontosítás, tudományos hipotézis(ek) („prekoncepció”)● Statisztika megválasztása és a statisztikai hipotézisek felállítása

● Válaszváltozók, háttérváltozók, becslés, kontroll● Megfelelő mérési technika kiválasztása● Következetesség● Adatminőség● Közlés formája: ábrák, táblázatok, statisztikai vizsgálatok

tudományos hipotézis ≠ statisztikai hipotézis

Page 19: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Mintavétel

Hányféleképpen vehető ki n elemű halmazból k elem?

kombináció

Figyelem! A minta jelentése a

statisztikában eltér a biológiai kíséreltekben

megszokottól: 1 mérés ↔ az

objektumok egy csoportja

Page 20: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Mintavétel

● Reprezentativitás

● Randomitás

● Elemszám

● Variancia

Page 21: Biometria, alapozó biostatisztikaplantsys.elte.hu/oktatas/Biometria/prezentaciok/01_02.pdfBiometria, alapozó biostatisztika Könnyű Balázs ELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai

Gyakorlatra

OlvasniTK: 13-32. oldal

Gyakorlathttp://plantsys.elte.hu/drupal/hu/oktatas/biometriaFeladatsor:● Bevezető gyakorlatok