Anotao funcional e anlise em larga escala utilizando o
Blast2GO
Anotao baseada em Gene Ontology
Molecular Function Biological Process Cellular Component
more general
more specific
Principais funes do Blast2GO
Manual Curation BLAST MAPPING ANNOTATION Validation Annotation
(GO,KEGG,EC) InterProScan Statistics Graph Visualization KEGG maps
Enrichment
Iniciando o Blast2GOwww.blast2go.orgAplicao para Desktop
Requer conexo com a Internet
possvel utilizar com banco de dados local possvel rodar em linha
de comando
Interface
Carregando Sequncias
Rodando o BLAST
Resultados do BLAST
Grficos do Blast
Mapeamento
Mapeamento Banco de dados completo do GO NCBI - NR PIR Banco de
dados de protenas de referncia noredundantes: incluindo PSD,
UniProt, Swiss-Prot, TrEMBL, RefSeq, GenPept e PDB
EC Hit ACC/GI Mapping Resources GO-Terms
AnotaoGO Validao Annex GOSlim EC/KEGG InterPro
Anotao - Gene Ontology
Mudar anotao manualmente
GO-Term ACC EC-Codes
Seq. Description
Grficos da Anotao
Menu da sequncia
Anotao enzimtica e Mapas KeggGO Enzyme Codes KEGG maps
InterproScan
VisualizaoVisualizao de grficos GO como uma ferramenta para
explorao de dados Grficos interativos e com possibilidade de zoom
Grficos coloridos indicando reas de interesse
Node Score of Annotation Content1 1
2.5 1 2.4
3 3
Visualizao:PizzaGrficos multinveis
Anlise funcional com B2G
Exerccio1
Carregar o Blast2GO Abrir um arquivo FASTA (exemplo.fasta)
Desmarcar todas as sequncias Selecionar 3 sequncias Rodar blast
contra o nr NCBI (alterar parmetros se desejar) Abrir
blast_exemplo.dat Examinar os grficos de distribuio
Exerccio 2
Selecionar as 10 primeiras sequncias Rodar Mapeamento e anotao
Carregar anotacao_exemplo.dat Visualizar resultados nos grficos de
Mapeamento/Anotao Selecione uma sequncia e use o menu: Gerar grfico
de anotao Ver anotao Editar/mudar anotao
Exerccio 3
Selecione algumas sequncias utilizando a funo selecionar por
nomes (use test.exemplo.txt) Criar um grfico GO combinado Criar
pizzas no nvel 4 e pizza multinvel com score 3 Exportar grfico GO
como tabela e visualizar
