BPKM-BIOMOL-2013

Buku Pedoman Kerja Mahasiswa (BPKM), Modul Biologi & Molekuler, PSPD UNIB, 2012-2013 1

Puji dan syukur ke hadirat Tuhan Yang Maha Kuasa bahwa Buku Rancangan Pengajaran Modul Biologi Molekul ini telah dapat direvisi tepat waktu. Mudah-mudahan buku ini bermanfaat bagi kemajuan pendidikan dokter di Indonesia umumnya, dan juga bagi keberhasilan pendidikan dokter di PSPD UNIB khususnya, serta dapat digunakan oleh para mahasiswa dan staf pengajar dalam menjalankan dan menyelenggarakan proses belajar - mengajar. Pada modul Biologi Molekuler tahun 2013 ini telah dilakukan beberapa penyempurnaan berupa pengurangan terjadinya tumpang tindih dalam kuliah interaktif. Selain materi utama biologi molekuler, untuk memperluas wawasan pada bidang ini, diberikan pula materi Kapita selekta yang pada tahun ini akan diberikan oleh Departemen Patologi Anatomi, Departemen Ilmu Forensik dan Medikolegal, Departemen Mikrobiologi dan Departemen Ilmu Kesehatan Anak. Modul ini diharapkan dapat membuka dan memberikan pemahaman awal serta menanamkan pondasi berpikir yang kuat dalam pembelajaran pada modul selanjutnya dan dalam praktek sebagai dokter kelak maupun dalam menekuni jenjang pendidikan lebih lanjut. Terima kasih kepada Tim Penyusun Modul Biologi Molekuler Tahun Akademik 2005-2006 yang telah mengawali penyusunan Modul dan segenap pihak yang memberi asupan dan fasilitas bagi revisi untuk Tahun Akademik 2012-2013 ini. Tim Penyusun juga berterima kasih atas dukungan MEU PSPD UNIB serta semua pihak yang telah turut serta menyusun buku ini, meskipun namanya tidak tertera dalam Tim Penyusun. Kami tetap menunggu kritik dan saran untuk penyempurnaan buku ini di saat-saat mendatang.

Bengkulu , Maret 2013

PENGANTAR


1.Latar Belakang Kemajuan dalam cabang biologi molekuler akhir-akhir ini tidak lepas dari ketekunan para peneliti dalam mengembangkan berbagai alat dan metode penelitian. Sedikit demi sedikit, alat dan metode penelitian yang sederhana berubah menjadi alat dan metode peralatan yang modern. Dengan ditemukannya berbagai alat dan metode penelitian modern itu, analisis terhadap berbagai komponen sel dapat dilakukan dengan lebih teliti dan terarah. Saat ini telah dapat dilakukan analisis tentang mekanisme kerja di tingkat molekul berbagai komponen sel di dalam sel saraf dan sel-sel jenis lain. Untuk setiap jenis sel, ada organel-organel yang mempunyai fungsi umum dan sama, ada pula organel-organel yang mempunyai fungsi khusus. Kemajuan di bidang biologi molekuler telah memungkinkan dipelajarinya setiap komponen di berbagai jenis sel. Apalagi kemajuan itu telah mencapai tingkat nanoteknologi, yang tentunya akan lebih mendorong lagi kemajuan di bidang biologi molekuler di saat mendatang. Analisis sampai ke tingkat molekul pada setiap komponen sel di dalam tubuh saat ini sangat diperlukan untuk mendiagnosis penyakit, pencegahan, terapi. Biologi molekuler menjadi esensi dalam ilmu biomedik untuk memahami agen penyakit, patofisiologi dan patogenesis penyakit, pencegahan,pengobatan dan epidemiologi penyakit. Oleh karena itu mahasiswa kedokteran perlu mempelajari mata ajaran ini melalui modul Biologi Molekuler yang merupakan bagian dari kurikulum pendidikan dokter umum berdasarkan KURFAK FKUI 2005 yang diterapkan di PSPD UNIB. 2.Tujuan Umum Modul Biologi Molekuler yang akan berlangsung pada semester II selama 6 minggu dengan beban 6 sks ini, merupakan modul kedua pada tahap 2 pendidikan dokter, yakni tahap medical sciences, dengan kegiatan pembelajaran Problem-based Learning (PBL) yang mendorong mahasiswa untuk belajar aktif dan mandiri sehingga ketrampilan belajar diperoleh, dan dicapai kompetensi derajat 1 menurut KURFAK 2005 di bidang biologi molekuler, yang wajib dimiliki seorang dokter dan merupakan modal dasar dalam penanganan masalah kesehatan. Berdasarkan Kurikulum Nasional (KIPDI III) yang berbasis kompetensi, pendidikan kedokteran diarahkan untuk menguasai 7 area kompetensi ditambah 3 kompetensi untuk lulusan PSPD UNIB. Modul Biologi Molekuler ditujukan untuk menguasai mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya berbagai penyakit/ masalah kesehatan terkait. Cabang ilmu yang berkaitan dengan pembelajaran modul biologi molekuler, yaitu : Biologi, Biokimia, Kimia Kedokteran, Fisika Kedokteran, Mikrobiologi, Patologi Klinik, Patologi Anatomi, Farmakologi, ilmu Kedokteran Forensik.

PENDAHULUAN


1. Mahasiswa yang dapat mengikuti modul ini ialah mahasiswa yang telah melalui tahap I Pendidikan Dasar Perguruan Tinggi (PDPT) dan yang telah melalui modul sel dan genetika

2. Berkemauan keras menjalani proses pendidikan kedokteran dengan tekun dan bersemangat dengan tetap menjaga nilai-nilai kepantasan yang berlaku di dunia pendidikan pada umumnya dan di Program Studi Pendidikan Dokter Universitas Bengkulu khususnya.

3. Mampu bekerja sendiri maupun dalam kelompok dengan tetap menerapkan prinsip-prinsip berkomunikasi berdasarkan empati, baik dengan sesama mahasiswa, fasilitator, narasumber, dan semua karyawan dan sivitas akademika di lingkungan PSPD UNIB.

KARAKTERISTIK MAHASISWA


Kompetensi Yang Harus Dicapai: Sesuai dengan kompetensi derajat I yang berkaitan dengan Ilmu Dasar dalam Praktik Kedokteran, yaitu: Mahasiswa mampu menjelaskan keadaan sehat dan keadaan sakit dengan menggunakan ilmu biomedik, klinik, perilaku, dan komunitas dalam bentuk simulasi. Sasaran Pembelajaran Terminal Setelah menyelesaikan modul ini, bila dihadapkan pada data sekunder klinik, laboratorium dan epidemiologik, mahasiswa PSPD UNIB semester II (dua) mampu menjelaskan mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya berbagai penyakit/ masalah kesehatan yang terkait. Sasaran Pembelajaran Penunjang Setelah menyelasaikan modul ini, bila diberi data sekunder mengenai masalah klinik, laboratorium dan epidemiologik mahasiswa mampu:

1. Menjelaskan prinsip-prinsip hukum fisika dalam diagnostik molekuler. 2. Menjelaskan sifat kimia karbohidrat dan lipid dalam menunjang fungsi hidup 3. Menjelaskan struktur dan fungsi protein dalam melaksanakan fungsi hidup 4. Menjelaskan struktur dan peran asam nukleat dalam melaksanakan fungsi hidup 5. Menjelaskan mekanisme transfer informasi genetik, ekspresi gen, gene rearrangement,

serta kelainan-kelainan yang dapat terjadi 6. Menjelaskan mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya perubahan sifat-sifat

mikroorganisme di dalam tubuh 7. Menjelaskan mekanisme molekuler patogenesis infeksi mikroorganisme 8. Menjelaskan mekanisme onkogenesis 9. Dapat menjelaskan prinsip dan aplikasi berbagai teknik molekuler yang digunakan dalam

diagnosis, terapi, dan rekayasa genetika

SASARAN PEMBELAJARAN


No Sasaran pembelajaran

(TIK)

LINGKUP BAHASAN

Pokok Bahasan SUB POKOK BAHASAN Rujukan (keterangan:

lihat tabel berikutnya)

1. Memahami peran biologi Molekuler dalam Ilmu Kedokteran Modern

Pengantar Modul Biologi molekuler

1.1. Definisi dan peranan Biologi Molekuler

1. Definisi Biologi Molekuler 1.

1.2. Peran Biologi Molekuler dalam ilmu kedokteran modern

1. Peranan Biologi Molekuler dalam pekembangan ilmu ikedokteran dan aplikasinya

2.

2. Menjelaskan prinsip-prinsip hukum fisika dalam diagnostik molekuler.

Aspek Fisika dalam Biologi Molekuler

2.1. Terapan hukum Stoke pada gerak partikel makromolekul dan elektron

1. Hukum Stoke 2. Terapan hukum Stoke

2.2. Prinsip dasar kromatografi, elektroforesis dan teknik esei

1. Prinsip kromatografi 2. Prinsip elektroforesis

3. Menjelaskan sifat-sifat kimia lipid dan karbohidrat, serta metabolismenya dalam menunjang fungsi hidup

Sifat kimia lipid dan karbohidrat dan metabolismenya

3.1. Karbohidrat 1. Klasifikasi karbohidrat 2. Stereoisomer dan reaksi kimia

karbohidrat 3. Aminomonosakarida sebagai

bagian dari struktur antibiotika 1. Heteropolisakarida 2. Ikatan Kimia

2

3.2. Lipid 1. Klasifikasi lipid 2. Senyawa steroid 3. Lipid pembentuk membran sel 4. Ikatan Kimia

2

4. Menjelaskan struktur dan fungsi protein dalam melaksanakan fungsi hidup

Peran protein dalam melaksanakan fungsi hidup

4.1. Struktur dan fungsi protein

1. Definisi protein secara kimia, biologi dan biokimia

2. Konsep building block dan backbone bound dalam penyusunan protein.

3. Universalisme asam amino penyusun protein sebagai salah satu fenomena universalisme dalam mahluk hidup.

4. Klasifikasi asam amino 5. Struktur asam amino & peptida:

gaya-gaya yang menstabilkan struktur protein dan membran

6. Asam basa dan dapar: peranan asam amino dan protein dalam sistem dapar

7. Struktur sekunder dan tertier protein: protein folding

2

LINGKUP BAHASAN



(TIK)

LINGKUP BAHASAN



8. Hubungan antara keragaman protein dengan jumlah jenis asam amino pembentuk protein.

9. Hubungan antara besarnya peran protein dalam mendukung fenomena hidup dengan keragaman struktur dan asam amino penyusun protein.

10.Hubungan antara gen dengan protein.

11.Kodon dan asam amino. 12.Sifat umum asam amino

pembentuk protein. 13.Asam amino esensial. 14.Konsep struktur protein dalam

berbagai tingkat. 15. Struktur dan fungsi protein. 16.Konsep “denaturasi”. 17.Fungsi fisiologis protein 18.Kerja protein secara umum dalam

bentuk azas interaksi protein-ligand.

20.Hubungan protein spesifik dengan tingkat perkembangan dan deferensiasi sel

21. Dasar penggunaan pengukuran protein intrasel sebagai dasar untuk mendukung atau menyingkirkan suatu diagnosis penyakit.

22.Konsep turn over protein dan hubungannya dengan pertumbuhan dan pemeliharaan.

4.2. Peran enzim sebagai protein katalis pengatur proses intra-sel

1. Definisi enzim 2. Mengapa sel mutlak memerlukan

enzim 3. Distribusi enzim dalam sel dan

hubungan antara fungsi bagian dari sel dengan jenis enzim yang dikandungnya.

4. Konsep substrat dan persamaan serta perbedaan sifat enzim dengan katalis organic

5. Cara menyatakan jumlah enzim dalam bentuk aktivitas enzim.

6. Pengaruh enzim terhadap nilai Keq dan menafsirkannya dengan hukum termodinamika I (Hukum kekekalan energi dari Hess) dan hukum kekekalan massa (Hukum Lavoisier).

7. Konsep energi aktivasi, sawar energi dan bentuk serta keadaan transisi dalam rangka kerja enzim.

8. Jenis dan spesifisitas enzim. 9. Konsep dan peran apoenzim,

koenzim, kofaktor, gugus prostetik, holoenzim, proenzim



(TIK)

LINGKUP BAHASAN



dan otokatalisis. 10.Vitamin dan koenzim. 11. Klasifikasi enzim. 12.Kelas-kelas enzim 13.Pengaruh faktor lingkungan

terhadap laju reaksi enzimatik. 14. Persamaan Michaelis-Menten,

Km, Vmaks, afinitas dan bilangan pergantian (turn over number) serta persamaan Lineweaver-Burk, persamaan Scatchard dan persamaan Eadie-Hofstee.

15.Penghambatan kerja enzim secara reversible dan irreversible dan arti fisiologis masing-masing.

16.Konsep dan fungsi anti enzim dalam tubuh.

17.Penggunaan asas penghambatan kerja enzim untuk pengobatan, pengendalian hama dan toksikologi lingkungan.

18.Model kerja enzim (model lock and key dari Fisher, induce fit dari Koshland dan allosteric dari Monod-Wyman-Changeux).

19.Pengaturan kerja enzim pada tingkat gen dan molekul enzim.

20.Fungsi fisiologis enzim. 21.Kegunaan enzim dalam

pengobatan. 22.Kegunaan enzim dalam diagnosis. 23.Aspek mutakhir dalam perkembangan enzim (abzim, ribozim, dan hibrizim)

4.3. Peran protein dalam membentuk dan mempertahankan struktur organisme.

1. Menyebutkan jenis-jenis protein pembentuk struktur organisme.

2. Ciri-ciri fisikokimia dan fungsi biologis kolagen

3. Ciri-ciri fisikokimia dan fungsi biologis elastin.

4. Ciri-ciri fisikokimia dan fungsi biologis fibronektin.

5. Ciri-ciri fisikokimia dan fungsi biologis spektrin dan mikrotubulin.

6. Ciri-ciri fisikokimia dan fungsi biologis kadherin.

5. Menjelaskan struktur dan peran asam nukleat dalam melaksanakan fungsi hidup

Struktur dan peran asam nukleat dalam menjalankan fungsi hidup

5.1. Jenis,Struktur dan sifat-sifat asam nukleat

1. DNA dan RNA: struktur kimia dan komposisinya

2. Konsep penyusunan pasangan basa pada asam nukleat berdasarkan teori Watson dan Crick dan hukum Chargaff.

3. Struktur DNA dan RNA. 4. Sifat-sifat fisikokimia asam nukleat

5.2. Lokasi dan peran asam nukleat dalam

1. Istilah: “Gene “dan “Genome”. 2. Lokasi DNA dan RNA di dalam sel

prokariotik dan eukariotik.



(TIK)

LINGKUP BAHASAN



sel. 3. Pengemasan DNA di dalam inti sel (histon, linker-DNA, nukleosom, kromosom)

4. Besar genom manusia dan organisme lain ( E. coli, ragi, dll.)

5. Peran DNA sebagai pembawa informasi genetik dalam sel.

6. Alur perpindahan informasi genetik yang terdapat dalam DNA hingga terjadinya ekspresi gen.

7. Peran mRNA, tRNA, dan rRNA pada proses ekspresi gen.

6. Menjelaskan mekanisme transfer informasi genetik, ekspresi gen, gene rearrangement, serta kelainan-kelainan yang dapat terjadi

Mekanisme transfer informasi genetik, ekspresi gen, gene rearrangement, serta kelainan-kelainan yang dapat terjadi

6.1. Replikasi DNA

1.Menjelaskan teori semi-conservative yang berlaku untuk replikasi DNA 2.Komponen-komponen yang berperan pada proses replikasi DNA serta fungsi masing-masing komponen 3.Titik muai pada replikasi DNA 4.Terbentuknya leading strand, lagging strand dan fragmen Okazaki pada proses replikasi DNA. 5.Tahap-tahap replikasi DNA pada prokariot dan eukariot. 6.Mekanisme perbaikan pada proses replikasi DNA

6.2. Transkripsi dan regulasi ekspresi gen

1.Proses sintesis RNA 2.Untai cetakan dan bukan cetakan pada DNA untuk proses transkripsi gen. 3.Coding strand dan non-coding strand pada DNA. 4.Komponen-komponen yang berperan pada proses transkripsi gen prokariotik dan eukariotik serta fungsi masing-masing komponen tsb 5.Situs inisiasi pada proses transkripsi gen. 6.Tahap-tahap transkripsi gen( inisiasi, elongasi, dan terminasi) pada prokariot dan eukariot. 7.Proses modifikasi pasca transkripsi gen pada prokariot dan eukariot, lokasi pematangan mRNA hingga

transpor mRNA yang matang ke ribosom.

8.Inhibitor transkripsi gen pada prokariot dan eukariot.

6.3. Sintesis dan Transport Protein

1. Pandangan umum 2. Perangkat translasi: Kode genetik.

t-RNA, sandi genetik, proses aminoasilasi ribosom

3. Mekanisme sintesis protein 4. Modifikasi pasca translasi 5. Transport protein setelah sintesis

1,

6.4 Gene rearrangement

1. Organisasi gen bentuk germline 2. Organisasi gen fungsional setelah

4,5,6



(TIK)

LINGKUP BAHASAN



rearrangement 3. Manfaat gene rearrangement

dalam Kedokteran 4. Organisasi gen imunoglobulin (Ig)

dan reseptor sel T (TCR) non- fungsional dan fungsional

5. Rearrangement gen Ig dan TCR pada maturasi sel B dan sel T.

3.Rearrangement gen Ig dan TCR pada beberapa tipe leukemia, penyakit autoimun dan infeksi.

6.5 Mutasi genetik 1.Mutasi genetik sebagai dasar berbagai kelainan organisma 2.Jenis-jenis mutasi dan penyebab terjadi mutasi. 3.Mutasi genetik pada berbagai kelainan 4.Bahan-bahan mutagen 5.Genetic polymorphism 6. Deteksi mutasi genetik

4,5,6

7. Menjelaskan mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya perubahan sifat-sifat mikroorganisme di dalam tubuh

Mikrobiologi molekuler

7.1.Regulasi ekspresi gen pada eukariot, prokariot dan virus

1.Perbedaan ekspresi gen pada eukariot, prokariot dan eukariot

2.Proses regulasi ekspresi gen (promoter, enhancer, trnsacting factor, operon) 3.Perubahan ekspresi gen pada bakteri dan virus dan implikasinya (mutasi, genetic reassortment, antigenic shift, antigenic drift) 4.Transfer gen antar bakteri, sel high frequency recombinant 5.Movable genetic element 6.Prion

8,9,10,11

7.2.. Resistensi mikroorganisme terhadap antibiotik,antivirus dan antijamur

1.Definisi resistensi bakteri terhadap antibiotik 2.Molekul target dan mekanisme kerja antibiotik, antivirus, anti jamur 3. Mekanisme terjadinya resistensi

terhadap obat antimikroba 4. Transfer sifat resistensi antar

bakteri 5. Dinamika genetik pada satu

populasi bakteri yang mengalami perubahan sifat resistensi terhadap antibiotik

6. Peran biofilm dalam terjadinya resistensi



(TIK)

LINGKUP BAHASAN



8. Menjelaskan mekanisme molekuler patogenesis infeksi

Mekanisme molekuler patognesis infeksi

8.1. Host parasite relationship

1. Konsep dasar infeksi 2. Mekanisme molekuler pada fagositosis 3. Invasi bakteri dan virus ke sel 4. Kemampuan sitopatik bakteri dan virus 5. Kemampuan bakteri dan virus

menghindar dari sistem imun 6. Interferon pada infeksi virus

8,9, 10,11

8.2. Faktor virulensi 1. Pemahaman tentang berbagai faktor virulensi penyebab infeksi

2. Pathogenicity island 3. Faktor kolonisasi, faktor inflamasi,

faktor invasi 4. Jenis dan mekanisme kerja toksin

bakteri 5. Superantigen

9. Menjelaskan mekanisme onkogenesis

Mekanisme onkogenesis

9.1. Gen yang berperan dalam onkogenesis

1.Jenis-jenis gen pengatur pertumbuhan tumor ganas dan fungsinya 2. Konsep molekuler onkogenesis akibat infeksi virus

12,19

9.2. Karsinogenesis

1.Multistep carsinogenesis 2.Faktor pertumbuhan 3.Karsinogen dan ko-karsinogen

9.3. Proses invasi dan metastasis pada tumor ganas

1.Invasi 2.Metastasis Imunohistokimia

9. 4 . Deteksi perubahan molekuler pada neoplasma

10. Dapat menjelaskan prinsip dan aplikasi berbagai teknik molekuler yang digunakan dalam diagnosis, terapi, dan rekayasa

Teknik molekuler dalam diagnosis, terapi dan kedokteran forensik, dan rekayasa genetik.

10.1. Diagnostik molekuler

1. Prinsip deteksi asam nukleat 2. Prinsip deteksi antigen (ELISA,

Westrn blot, Imunohistokimia) 3. Antibodi monoklonal dan antibodi

poliklonal dalam diagnostik 4. Deteksi mutasi 5. Aplikasi diagnostik molekuler 6. Diagnostik molekuler pada

penyakit menurun

15



(TIK)

LINGKUP BAHASAN



genetika

10.2. Rekayasa Genetika

1. Definisi rekayasa genetika 2. Aplikasi rekayasa genetika 3. Enzim yang digunakan dalam

rekayasa genetika (polimerase, endonuklease, ligase)

4. Prinsip kloning DNA, rekayasa protein

5. Teknik dasar dalam rekayasa genetika (PCR, pemotongan gen, ligasi, seleksi dan deteksi hasil kloning, directed mutagenesis)

11

11. Menjelaskan prinsip interaksi antara obat dengan senyawa biomolekuler

Farmakodinamik (Interaksi obat – senyawa biomolekuler)

11.1. Konsep farmakodinamika

11.2. Reseptor

1. Definisi farmakodinamik 2. Konsep agonis - antagonis 3. Hubungan modifikasi struktur

molekul - aktivitas biologis 4. Ikatan Reseptor – obat 5. Regulasi reseptor 6. Mekanisme kerja obat tanpa

melalui reseptor

18

12. Menjelaskan pengaruh genetik pada variasi respons obat

Farmakogenetik 12.1. Konsep farmakogenetik

12.2. Polimorfisme genetik

1. Definisi farmakogeneik 2. Hubungan polimorfisme genetik

dengan variasi efikasi/ toksisitas obat

3. Aplikasi farmakogenetik dalam farmakoterapi

18

13. Mengetahui perkembangan aplikasi Biologi molekuler dalam berbagai bidang ilmu kedokteran

Kapita selekta 13.1. Aplikasi tenik molekuler dalam I. Kedokteran Forensik

1. Aplikasi biomolekuler dalam bidang kedokteran forensik 2. Aspek medikolegal pemeriksaan biomolekuler 3. Konsep STR dan CODIS 13

17

13.2. Biologi molekuler dalam pengembangan vaksin

1.Berbagai jenis vaksin 2.Aspek Biologi Molekuler dalam pengembangan vaksinasi

13.3. Aspek molekuler pada enzyme replacement therapy

Aspek molekuler pada enzyme replacement therapy


DAFTAR RUJUKAN : No JUDUL BUKU PENULIS PENERBIT TAHUN/EDISI 1 Molecular Biology of the

Gene

Watson et al 2008

2 Dasar-Dasar Biokimia jilid 1, 2 dan 3

Albert L Lehninger (penj. Maggy Thenawidjaja

Erlangga, Jakarta 2004

3. Physiological Chemistry Trudy McKee Ed. McGraw - Hill, Inc 2003

4. Principles of Genetic. 3 rd ed Peter Snustad & Michael

J. Cimmons 2007

5. Molecular Biology of the Cell, 5th ed

Albert B, et al. 2008

6. Genetic Medicine. 6th ed.

Nussbaum et al 2001

7. Genetic control of immune response, in Principles of Genetics,

P Gardner EJ, Simmons MJ, and Snustad D

John Willey & Sons Inc New York

1991,

8. Medical Microbiology, 5th ed. PR Murray, KS Rosenthal, MA Pfaller

Elsevier Mosby 2005

9. Jawetz, Melnick and Adelbergg”s Medical Microbiology, ed 24

GE Brooks,JS Butel,SA Morse

Appleton and Lange, California.

2007

10. Mim’s Pathogenesis of Infectious Diseases. Ed 4,

C.Mims et.al Academic Press Inc, San Diego

1995

11 Foundations in Microbiology, ed 6

Talaro KP McGraw Hill International Edition

2008

12 General and Systematic Pathology. Ed 4

J C E Underwood Churchill Livingstone, Toronto

2004

15 Emery’s Elements of Medical Genetics.

Robert F. Mueller, Ian D Young

Churchill Livingstone 2003

16 Immunology A Short Course 5’ ed

Benyamin E, Sunshine G, Leskowtz S

John Wiley, New York

17 Forensic DNA typing Second ed

Butler JM Amsterdarm,Elsevier Ac.Press

2005

18 The Pharmacological basis of Therapeutic. 11th ed

Goodman & Gilnmans

McGraw-Hill, NewYork

2005

19 Buku Ajar Patologi Sudarto Pringgoutomo Sutisna Himawan Achmad Tjarta

Sagung Seto 2008


A. METODE PENGAJARAN Metode pengajaran yang digunakan ialah pengajaran aktif (student centered) dengan pendekatan Pembelajaran Berdasarkan Masalah (BDM) yang meliputi

1.Tahap Orientasi: a.Kuliah b.Kegiatan laboratorium c.E-learning (Reading material, Quiz, Assignment)

2.Tahap Latihan:

a.Diskusi kelompok dengan BDM (Pembelajaran Berdasarkan Masalah) b.Kegiatan Praktikum c.Presentasi kasus (Pleno) d.E-learning

3.Tahap Umpan Balik

a.Presentasi kasus (Pleno) b.Umpan balik pleno c.Ujian formatif d.Laporan kegiatan laboratorium e.Buku catatan mahasiswa f.Evaluasi diskusi kelompok g.Evaluasi fasilitator oleh mahasiswa h.Evaluasi narasumber oleh mahasiswa

Secara keseluruhan metoda pengajaran mahasiswa meliputi:

Kuliah 57 jam Diskusi kelompok 20 jam Praktikum 17 jam Diskusi Pleno dan umpan balik 14 jam Belajar mandiri 37 jam ujian 8 jam

Coaching 6jam B. SUMBER PEMBELAJARAN

Sumber pembelajaran berupa : -Buku teks -Narasumber -Hand out -Pedoman Praktikum -Internet

METODE PENGAJARAN


C. MEDIA INSTRUKSIONAL Media instruksional yang digunakan :

-Slide projector -LCD -White Board -Flip Chart -Mikroskop -Sediaan makroskopik dan mikroskopik serta bahan praktikum lainnya -Komputer

-Buku gambar, alat tulis, buku catatan


A. SUMBER DAYA MANUSIA 1.TIM PENANGGUNG JAWAB MODUL LOKAL

2.Narasumber

No Nama Mata Ajar

1 Dr.Sumpono Biokimia 2 Dr.Choirul Muslim Biologi

3 Dr.Aceng Ruyani Biolog 4 Drs.Suwarsono,MS Fisika 5 Drs.Welly,MS Mikrobiologi

6 dr.Kartikasari,Sp.PA Patologi Anatomi

7 Dr.Morina Adfa Kimia

8 Dwita O,M.Si Biokimia

3.Pembimbing jawab praktikum

No Nama Departemen 1. Dr.Sumpono dan Dwita O,M.Si Biokimia 2. Eka Angasa,M.Si Kimia 3. Dr.Aceng Ruyani dan Dr.Choirul

Muslim Biologi

4.Fasilitator :

No Nama 1 Dr.Irfan Gustian 2 Helmiyetti ,MS 3 Eka Angasa,Msi 4 Ghufira,M.si 5 Devi,M.si 6 Dr.Sal Prima Yudha

Ketua : dr. Ahmad Azmi Nasution

SUMBER DAYA


B. SARANA FISIK Ruang Kuliah : Ruang Kuliah I lantai 2 PSPD UNIB Ruang Diskusi : Ruang Diskusi Lantai 2 PSPD UNIB Ruang Praktikum : Laboratorium Basah PSPD UNIB C.SEKRETARIAT: Suprianto,S.si

Buku Pedoman Kerja Mahasiswa (BPKM), Modul Biologi & Molekuler, PSPD UNIB, 2012 -2013 17

C

MINGGU 1

WAKTU SENIN 25 Maret 2013

SELASA 26 Maret 2013

RABU 27 Maret 2013

KAMIS 28 Maret 2013

JUMAT 29 Maret 2013

08.00-09.00 Penjelasan dan Pengantar Modul

Biomol ( K1 ) LIPID (K2) BM

Protein secara Umum (K5)

LIBUR WAFAT ISA ALMASIH

09.00-10.00

Praktikum Kimia (Pr 1) 10.00-11.00

BM Karbohidrat (K3) Enzim (K6)

11.00-12.00

12.00-13.00 istirahat Istirahat Istirahat Istirahat

13.00-14.00

Dk 1 P1 Struktur Asam

Nukleat dan Gen (K4) DK 2 P2 BM 14.00-15.00

15.00-16.00 BM

UNIB Dept. Kimia Dept. Biokimia

K1 Dr.Ahmad Azmi Nasution K2 – K4 Dr.Morina Adfa Pr 1 Dr.Morina Adfa ( praktikum kimia ) K5 Dwita O ,MSi K6 Dwita O ,MSi

Matriks Kegiatan Biologi Molekuler 2013


MINGGU 2

WAKTU SENIN 1April 2013

SELASA 2 April 2013

RABU 3 April 2013

KAMIS 4 April 2013

JUMAT 5 April 2013

08.00-09.00

Aspek Fisika dalam Biomol ( K7)

Replikasi transkripsi (K8)

BM

Farmakokinetik (K11)

09.00-10.00

10.00-11.00 Aspek Fisika dalam Biomol ( K8)

Translasi dan transport protein (K9)

Interaksi Protein & ligand (K10)

Farmakodinamik ( K12 )

11.00-12.00 BM

12.00-13.00 Istirahat Istirahat Istirahat Istirahat Istirahat

13.00-14.00

Pleno Pemicu I

Dk 1 P2

Praktikum Biokimia (Pr 2)

( Praktikum Enzim )

DK2 Pemicu2

Pleno P2 14.00-15.00

15.00-16.00

Dept.Fisika Biokimia Dept. Farmakologi

K7-K8 Drs.Suwarsono.MS PLeno P1 Dr.Morina Adfa dan Dwita O,Msi K8 – K10 Dr.Sumpono . MS Pr 2 Dr.Sumpono . MS / Dwita O.M.Si (Prakt. Enzim)

K11 FKUI K12 FKUI Pleno P2 Dr.Sumpono.MS dan FKUI


MINGGU 3

WAKTU SENIN 8 April 2013

SELASA 9 April 2013

RABU 10 April 2013

KAMIS 11 April 2013

JUMAT 12 April 2013

08.00-09.00 Praktikum Biokimia

( Pr 3 ) (Prakt. Biokimia - Isolasi

Protein ) BM

Mutasi Genetik (K13)

Patogenesis molekuler Penyakit Infeksi (K15)

Mikrobiologi molekuler (K17) FORMATIF I

09.00-10.00

10.00-11.00 Diagnosis molekuler

dan Terapi Gen (K14)

Protein Engineering (K16)

Regulasi ekspresi gen eukariot, prokariot dan virus

(K18 )

Gen Rearrangement ( K 19 )

11.00-12.00


13.00-14.00 DK1 P3

BM DK2 P3

Pleno P3

Umpan Balik

Teori Praktikum PCR ( K 20 )

14.00-15.00

15.00-16.00 BM

Dept Biokimia Dept.Biologi Dept.Mikrobiologi BIOLOGI

Pr 3 Dr.Sumpono . MS / Dwita O.M.Si K13 Dr.Choirul Muslim K14 Dr.Choirul Muslim K15 Drs.Welly.MS K16 Drs.Welly.MS K17 Drs.Welly.MS K18 Drs.Welly.MS Pleno P3 Drs.Welly.MS, Dr.Choirul Muslim K 19 Dr. Aceng Ruyani K 20 Dr.Aceng Ruyani


MINGGU 4

WAKTU SENIN 15 April 2013

SELASA 16 Mei 2013

RABU 17 Mei 2013

KAMIS 18 Mei 2013

JUMAT 19 Mei 2013

08.00-09.00

Sumatif I

Praktikum PCR ( Pr 3 )

Deteksi perubahan fungsi gen pada

proses onkogenesis ( K 22 )

BM

Pleno Pemicu 4

09.00-10.00

10.00-11.00

BM

Pengobatan pada keganasan

hubungan dg karsinogenesis

( K 23 )

Stem Cell ( K 24 )

11.00-12.00 Umpan Balik


13.00-14.00 DK1 P4

Onkogenesis dasar ( K 21 )

DK2 P4

Kapita Selekta : Aplikasi Forensik

( K 25 )

BM 14.00-15.00

15.00-16.00 BM BM

UNIB BIOLOGI Dept.Patologi Anatomi Dept.Forensik

Pr 3 Dr.Choirul Muslim, Dr.Aceng Ruyani dan Sifriadi,M.si(Teori Prakt. PCR)

K21 – K23 Dr.Kartikasari,Sp.PA

K 24 – K25 FKUI

Pleno P4 FKUI, dr.Kartikasari,Sp.PA


MINGGU 5

WAKTU SENIN 22 Mei 2013

SELASA 23 Mei 2013

RABU 24 Mei 2013

KAMIS 25 Mei 2013

JUMAT 26 Mei 2013

08.00-09.00 Formatif II

EBP3KH ( K 27 )

Ujian Praktikum

Biologi Kimia

Biokimia

Ujian Sumatif II Pengumuman Nilai

09.00-10.00

10.00-11.00

11.00-12.00


13.00-14.00

Modul Riset ( K 26 ) 14.00-15.00

15.00-16.00

UNIB Biokimia UNIB UNIB Riset PSPD UNIB EBP3KH PSPD UNIB


MINGGU 6

WAKTU SENIN 29 Mei 2013

SELASA 30 Mei 2013

RABU 1 Mei 2013

KAMIS 2 Mei 2013

JUMAT 3 Mei 2013

08.00-09.00

Remedial Praktikum BM Remedial Sumatif I

Koreksi Ujian

09.00-10.00

10.00-11.00

11.00-12.00


13.00-14.00

Remedial Sumatif II

14.00-15.00

15.00-16.00

UNIB

Buku Pedoman Kerja Mahasiswa (BPKM), Modul Biologi & Molekuler, PSPD UNIB,2012 -2013 23

JADWAL PLENO : Pleno Hari/Tanggal Narasumber

Reguler

I 13 – 4 - 2012 Moderator = dr.Sri Y Narasumber:

- Dwita O,Msi -Eka Angasa,M.Si

II 20 – 4 - 2012

Moderator = : dr.Novriantika L Narasumber. 1. Dr.Sumpono,MS 2. Farmako FKUI

III 26 – 4 -2012

Moderator = dr.Lala F Narasumber: 1. Dr.Choirul Muslim 2 . Drs.Welly,MS

IV 4 – 5 - 2012

Moderator = dr.Ahmad Azmi Nasution Narasumber: 1. dr.Kartika , Sp.PA 2. Forensik FKUI



1. Evaluasi Hasil Pembelajaran Evaluasi dilakukan terhadap 2 aspek :

1.Kognitif dan praktikum dengan bobot 60% 2.Proses sikap dan attitude dengan bobot 40%

KISI-KISI Bentuk instrumen Bobot A.Kognitif Ujian Teori : 40 % Ujian Praktikum : 20%

Soal Pilihan Berganda Soal Pilihan Berganda/ Jawaban singkat

60%

B.Proses Diskusi kelompok : 25% Buku tugas/buku catatan: 10% Laporan praktikum : 5%

Lembar penilaian Buku catatan mahasiswa yang dikumpulkan setelah pleno setiap pemicu

40%

Sebelum ujian tulis sumatif, dilakukan ujian formatif . Kriteria kelulusan modul Biologi Molekul adalah nilai akhir minimal 55 (C) tanpa nilai komponen kurang dari 55. Mahasiswa harus mengikuti minimal 80% Kegiatan Diskusi Kelompok, Pleno dan Praktikum. 2. Evaluasi Program pendidikan Evaluasi Program Baik apabila 80% mahasiswa lulus dengan nilai minimal B minus dan rata- rata 3,0

Evaluasi Proses Program -Semua Kegiatan berlangsung sesuai waktu dan rencana -Perubahan jadwal, waktu dan kegiatan tidak lebih dari 10% -Setiap kegiatan dihadiri minimal 90% mahasiswa, tutor, narasumber dan fasilitator.

EVALUASI


KUMPULAN PEMICU Pemicu I Pada satu pagi bulan Mei 2010 terjadi kecelakaan kapal di sungai Citarum dengan korban 6 orang hilang. Empat hari kemudian diberitakan 2 jenasah ditemukan dalam keadaan rusak sehingga identitasnya sulit dikenali lagi. Polisi/penyidik meminta dokter forensik untuk mengidentifikasi kedua korban tersebut. Identifikasi personal dilakukan dengan mengumpulkan informasi identitas jenazah melalui pemeriksaan antropologi, sidik jari, gigi dan DNA. Untuk membantu identifikasi korban, polisi meminta sampel darah dari keluarga tersangka korban untuk diperiksa sebagai pembanding. Pemicu II Seorang wanita datang ke Puskesmas dengan keluhan buang air kecilnya berwarna merah. Beberapa hari sebelumnya pasien tersebut sudah datang karena nyeri pada waktu haid dan oleh dokter Puskesmas, pasien tersebut diberi obat asetosal untuk menghilangkan nyeri tersebut. Pemeriksaan laboratorium menunjukkan adanya hemoglobin di dalam urin. Pemeriksaan lebih lanjut di rumah sakit, pasien didiagnosis menderita defisiensi G6PD.

Pemicu III Virus influensa A H5N1 yang amat patogen pertama kali ditemukan pada angsa di Ghuang Dong- Cina pada tahun 1996. Kasus pneumonia akibat infeksi oleh virus ini pada manusia dilaporkan pertama kali di Hongkong pada tahun 2003, sampai sekarang kasus flu burung telah tersebar di 15 negara termasuk Indonesia dengan mortalitas yang tinggi. Metoda diagnostik laboratorium menggunakan Reverse Transcriptase Real Time PCR merupakan metode yang diandalkan pada saat ini. Pengobatan dilakukan dengan oseltamivir. Meskipun sampai saat ini penyebaran antar manusia belum ditemukan dan resistensi terhadap oseltamivir masih amat jarang, ancaman pandemi H5N1 serta kemungkinan terjadinya resistensi masih terus diwaspadai. Pemicu IV Seorang wanita berumur 40 tahun datang memeriksakan diri ke dokter dengan keluhan benjolan di payudara kiri yang dalam 6 bulan terakhir membesar dengan cepat serta teraba pula benjolan kecil di bagian ketiak kiri. Dokter segera melakukan biopsi dan hasil pemeriksaan histopatologi menyatakan wanita tersebut menderita karsinoma payudara yang sudah menyebar ke KGB. Wanita ini sangat ketakutan karena almarhum ibunya juga meninggal akibat karsinoma payudara. Untuk merencanakan terapi yang tepat dokter meminta dilakukan pemeriksaan imunohistokimia di bagian Patologi Anatami berupa pemeriksaan Estrogen reseptor, Progesteron reseptor , HER2, dan mutan p53.

LAMPIRAN 1


TUGAS DAN LATIHAN A. Diskusi kelompok

Mahasiswa dibagi dalam 20 kelompok kecil dengan jumlah anggota masing-masing kelompok 9-10 orang. Tiap kelompok diberi pemicu dan ditugaskan memecahkan masalah menurut langkah-langkah Pembelajaran Berdasarkan Masalah (Problem Based Learning = PBL). Terdapat 5 macam pemicu yang akan didiskusikan selama 5 minggu. Tiap mahasiswa harus membuat catatan diskusi mengenai pertanyaan-pertanyaan yang timbul selama diskusi. (Catatan diskusi menjadi salah satu bahan penilaian). Catatan mahasiswa harus meliputi : Langkah-langkah yang dilalui dalam proses diskusi menurut pembelajaran Berdasarkan Masalah (PBL) beserta hal-hal yang ditemukan/didiskusikan dalam setiap langkah. Hasil diskusi dibuat dalam bentuk presentasi (MS Powerpoint atau yang lain) untuk dipresentasikan tiap kelompok dalam pleno.

B. Praktikum:

1.Departemen Kimia : -Identifikasi molekul karbohidrat.lipid dan protein -Penetuan kadar protein dengan metode biuret 2.Departemen Biologi Kedokteran dan Biokimia - Isolasi DNA - PCR & Elektroforesis 3.Departemen dan Biologi Molekuler - Protein - Enzim

LAMPIRAN 2


PROBLEM BASED LEARNING :

PANDUAN PELAKSANAAN PEMBELAJARAN BERDASARKAN MASALAH (BDM) A. FALSAFAH DASAR Sebagai calon ilmuwan, mahasiswa senantiasa wajib menggunakan ilmu pengetahuan dalam menjelaskan terjadinya suatu masalah serta penanggulangannya. Oleh karena itu dalam pembelajaran mahasiswa, perolehan ilmu pengetahuan perlu dilatihkan bersama dengan ketrampilan berpikir analitik yang diperlukan untuk mengidentifikasi dan menanggulangi masalah sesuai dengan metode ilmiah disiplin ilmu tertentu. Seorang dokter akan senantiasa menanggulangi masalah kedokteran pasien/masyarakat, karena itu penerapan langkah penanggulangan masalah secara ilmiah perlu menjadi satu kemahiran, di samping pembinaan sikap kepedulian terhadap lingkungan sejak awal. Secara khusus metode belajar berdasarkan masalah (BDM/PBL) bertujuan memantapkan pembelajaran dengan cara menghubungkan apa yang telah diketahui mahasiswa dengan pengetahuan baru, yang dapat menunjukkan kesinambungan pengetahuan yang dipelajarinya. Cara pembelajaran ini sebenarnya akan selalu dapat digunakan bahkan setelah seseorang lulus dari pendidikan dokter, karena seorang dokter senantiasa akan menghadapi masalah, dan melakukan langkah penanggulangan masalah dengan menerapkan ilmu pengetahuan dasar kedokteran. Pemantapan pembelajaran terjadi kalau mahasiswa dapat mengadakan elaborasi pengetahuan yang telah dikuasainya. B. LANGKAH BDM

1. Identifikasi masalah yang terdapat pada pemicu. Istilah yang tidak jelas diklarifikasi. 2. Analisis masalah, yaitu dengan menguraikan kemungkinan faktor penyebabnya. 3. Penyusunan pertanyaan yang berkaitan dengan tiap faktor penyebab yang memerlukan

penjelasan, yang dilanjutkan dengan membuat hipotesis yang sesuai. 4. Menetapkan ilmu pengetahuan yang diperlukan untuk menjawab tiap pertanyaan. 5. Menjawab pertanyaan yang sudah dapat dijawab langsung berdasarkan pengetahuan yang

sudah dimiliki. 6. Untuk pertanyaan yang belum diketahui jawabannya, dilakukan identifikasi sumber

pembelajaran yang sesuai. 7. Belajar mandiri. Hasil belajar mandiri/tugas baca dicatat dalam buku catatan. 8. Menyusun pengetahuan baru berdasarkan berbagai hal yang telah dipelajari (pengetahuan

lama dan baru). 9. Langkah BDM dapat diulang seluruhnya atau sebagian sebagaimana dibutuhkan. 10. Mengidentifikasi hal-hal yang belum dipelajari. 11. Merangkum hal-hal yang telah dipelajari. 12. Bila mungkin, menguji pemahaman pengetahuan yang didapat dengan menerapkannya pada

masalah lain.

LAMPIRAN 3


C. PANDUAN UNTUK MAHASISWA Berdasarkan Langkah BDM dalam butir B, Diskusi dapat dibagi menjadi Diskusi Kelompok-1 (DK-1) untuk penerapan langkah 1 s/d 7, serta Diskusi kelompok-2 untuk penerapan langkah 9 s/d 12.

Panduan Diskusi Kelompok-1 (DK-1)

1. Untuk setiap diskusi kelompok, pilihlah Ketua dan Sekretaris secara bergilir. 2. Bacalah dengan seksama setiap uraian pemicu. Masing-masing mahasiswa membaca sendiri. 3. Identifikasi berbagai masalah dalam pemicu tersebut. 4. Buatlah analisis masalah, yaitu kemungkinan hubungan antara berbagai isu bila ada, atau

kemungkinan mekanisme yang mendasari berbagai hal yang teridentifikasi di butir (3). Selanjutnya disusun suatu hipotesis berdasarkan analisis masalah.

5. Susunlah sejumlah pertanyaan yang berkaitan dengan berbagai kemungkinan hubungan tersebut, atau yang berkaitan dengan kemungkinan mekanisme yang mendasari hal tersebut yang Saudara belum ketahui.

6. Urutkan pertanyaan tersebut secara sistematik berdasarkan pertanyaan kunci: apa, mengapa, bagaimana dan seterusnya.

7. Tetapkan pengetahuan yang dibutuhkan untuk menjawab tiap pertanyaan. 8. Pilih pertanyaan yang sudah dapat dijawab langsung berdasarkan ilmu pengetahuan yang

Saudara miliki. 9. Untuk pertanyaan yang belum terjawab, rencanakan pencarian jawaban secara mandiri. Jika

tugas belajar mandiri dibagi dalam kelompok, setiap pertanyaan sedikitnya dijawab oleh 2-3 mahasiswa.

10. Saudara harus mencatat proses diskusi mulai dari analisis masalah (langkah 3) sampai dengan tugas belajar mandiri (langkah 9).

Belajar mandiri (BM) Belajar mandiri merupakan kegiatan belajar mahasiswa secara mandiri, yang dilaksanakan setiap selesai diskusi kelompok. Hasil pencarian dalam belajar mandiri dicatat dalam buku catatan Saudara. Rujukan yang digunakan dalam belajar mandiri wajib dicantumkan, yang dapat disusun dengan sistem nomor rujukan.

Panduan Diskusi Kelompok-2 (DK-2)

1. Pilihlah Ketua dan Sekretaris Diskusi Kelompok. 2. Tiap mahasiswa melaporkan hasil tugas belajar mandirinya dengan menyebut sumber

bacaannya. Mahasiswa lainnya menyimak dan mencatat seperlunya bila ada yang perlu dibahas.

3. Setelah semua melaporkan hasil tugas baca, dilakukan pembahasan bersama. Dalam pembahasan, kaitkan selalu pembahasan dengan pertanyaannya.

4. Gunakan jawaban yang Saudara peroleh untuk menjelaskan masalah yang teridentifikasi dalam pemicu.

5. Setelah seluruh kegiatan diskusi selesai, seluruh peserta kelompok menyusun/merapikan catatan hasil tugas baca yang dikumpulkan dari masing-masing peserta (rangkuman), dalam buku catatan masing-masing.


LAMPIRAN 4

EVALUASI HASIL PEMBELAJARAN KURFAK PSPD 2009

TATA LAKSANA UJIAN MODUL Penilain modul dinilai dari 2 aspek :

1. Kognitif dan praktek dengan bobot 60% 2. Proses sikap dan attitude dengan bobot 40%

Tindak Lanjut di modul Jika tidak lulus modul, dilakukan remedial pada akhir semester. Nilai modul sesudah remedial maksimal C, dan nilai ini merupakan angka yang dibawa ke rapat yudisium. Tidak ada perbaikan angka pada rapat yudisium dan tidak ada remedial pasca yudisium. TINDAK LANJUT YUDISIUM semester genap

1. Lulus 2. Mengulang modul 3. DO

PREDIKAT KELULUSAN

IP/IPK YUDISIUM TINGKAT YUDISIUM SARJANA KEDOKTERAN 2.00 – 2.75 Memuaskan Memuaskan

2.76 – 3.50 sangat memuaskan sangat memuaskan

3.51 – 4.00 Penghargaan cum laude

IP/IPK YUDISIUM PROFESI 2.50 – 3.00 Memuaskan

3.01 – 3.50 sangat memuaskan

3.51 – 4.00 cum laude

Keterangan:

1. Lulus modul : nilai akhir ≥ 55 (C) untuk setiap modul dengan nilai setiap komponen tidak kurang dari 55

2. Mengulang modul : Bila nilai modul kurang dari C a. Modul yang tidak lulus harus diulang terlebih dahulu pada kesempatan pertama

sesuai jadwal KURFAK 2005 b. Mahasiswa dapat melanjutkan ke modul semester selanjutnya c. Rencana waktu pengulangan modul pada satu tahun akademik diatur oleh Ketua Sub

Program 3. DO- putus studi (sesuai dengan peraturan akademik UNIVERSITAS)

a. Apabila pada evaluasi 2 (dua) semester pertama tidak memperoleh IP minimal 2,0 (dua koma nol) dari sekurang-kurangnya 24 SKS terbaik

b. Apabila pada evaluasi 4 semester pertama tidak memperoleh IP minimal 2,0 (dua koma nol) dari sekurang-kurangnya 48 SKS terbaik


c. Apabila pada evaluasi 8 semester pertama tidak memperoleh IP minimal 2,0 (dua koma nol) dari sekurang-kurangnya 96 SKS terbaik

d. Apabila pada evaluasi akhir masa studi tidak memeproleh indeks prestasi minimal dari beban studi yang dipersyaratkan dengan nilai terendah C

e. Apabila masa studi tidak dapat diselesaikan dalam waktu ”1 ½ n”


PANDUAN PENETAPAN NILAI MODUL SUB PROGRAM ILMU KEDOKTERAN TERINTEGRASI/

INTEGRATED MEDICAL SCIENCES KURFAK 2009 PSPD UNIB

• Perbandingan nilai Proses : Pengetahuan = 40 : 60 • Nilai minimum yang harus dicapai di setiap komponen penilaian = 55, dengan ketentuan sbb:

– Nilai Proses dapat terdiri atas nilai diskusi PBL, praktikum, buku catatan, dengan masing-masing nilai minimum = 55

– Nilai Pengetahuan dapat terdiri atas berbagai nilai hasil ujian (mis ujian sumatif1, ujian sumatif 2, ujian praktikum, dsb) dengan masing-masing ujian nilai minimum = 55

• Nilai modul ditetapkan berdasarkan perhitungan bobot masing-masing nilai, sesuai ketentuan modul yang tercantum dalam BRP

TINDAK LANJUT APABILA NILAI MINIMUM KOMPONEN TIDAK TERCAPAI • Apabila nilai minimum komponen penilaian tidak tercapai, penghitungan nilai modul tidak dapat

dilakukan. • Mahasiswa dengan nilai seperti diatas diberi kesempatan mengikuti program perbaikan nilai

(remedial). Penjadwalan remedial ditetapkan oleh ketua modul, dengan memperhatikan bahwa mahasiswa diberi kesempatan untuk menyiapkan diri dan tidak mengganggu keikutsertaan mahasiswa di modul lain. Program remedial diselenggarakan satu kali

• Proses perbaikan nilai (remedial) akan menghasilkan nilai komponen sebagai pengganti nilai sebelumnya, dengan ketentuan nilai maksimum hasil remedial adalah 55.

• Selanjutnya nilai modul dihitung berdasarkan ketentuan penghitungan nilai modul seperti yang tercantum dalam BRP.

• Apabila telah dilaksanakan proses perbaikan nilai (remedial) dan masih belum dapat mencapai nilai minimal, maka nilai modul diadministrasikan dengan nilai <C, yang berarti modul harus diulang di semester lain sesuai pengaturan Koordinator Tahun.

MANAJEMEN PEROLEHAN NILAI NILAI PROSES Nilai proses dapat terdiri atas satu/lebih penilaian berikut ini: • NILAI DISKUSI

Penilaian proses diskusi dilaksanakan oleh fasilitator, yang melakukan observasi terhadap mahasiswa atas keseluruhan proses diskusi sepanjang pelaksanaan modul. Nilai diskusi ditetapkan setelah pelaksanaan diskusi yang terakhir berdasarkan borang penilaian diskusi yang ditetapkan oleh MEU (terlampir).

• NILAI PRAKTIKUM Penilaian proses praktikum dilaksanakan oleh supervisor praktikum, berdasarkan pengamatan supervisor atas mahasiswa dalam kegiatan praktikum. Metoda yang digunakan untuk menetapkan nilai praktikum merupakan tanggung jawab penyelenggara praktikum, atas kesepakatan dengan tim inti modul. Nilai praktikum kemudian diserahkan kepada ketua modul.

• NILAI BUKU CATATAN Penilaian terhadap buku catatan dilaksanakan oleh fasilitator, berdasarkan Panduan penilaian buku catatan mahasiswa dalam PBL (Problem-Based Learning) yang ditetapkan oleh MEU


NILAI PENGETAHUAN Nilai pengetahuan dapat terdiri atas satu/lebih ujian berikut ini: • UJIAN TULIS MCQ (MULTIPLE CHOICE QUESTION) • UJIAN TULIS ESSAY atau MODIFIED ESSAY • UJIAN PRAKTIKUM (KETERAMPILAN; PENGUATAN PENGETAHUAN) TATA CARA PENETAPAN NILAI PADA UJIAN MCQ • Lembar jawaban mahasiswa dipindai di MEU dengan panduan kunci jawaban dari modul • Proses pemindaian akan menghasilkan

– Nilai mentah (raw score) – Indeks diskriminasi (discrimination index) dan faktor kesukaran (difficulty factor) masing-

masing soal ujian yang akan diserahkan MEU kepada Ketua Modul • Apabila ada permintaan penghitungan nilai dengan meng-omit (membuang) soal dengan

karakteristik tertentu, ketua modul harus mengajukan permohonan tertulis ke MEU • Keputusan tentang nilai mahasiswa ditetapkan oleh ketua modul beserta tim-nya,

berdasarkan standard setting masing-masing naskah ujian. LAIN-LAIN Evaluasi formatif dilaksanakan 2 kali per modul pada minggu ke-2 dan ke-4 meliputi assessment lingkup yang sama dengan evaluasi sumatif (butir 1a dan 1b)

Progress test akan dilaksanakan 2 kali per tahun, bersifat formatif di semester 3 dan 4. Pada akhir semester 6 akan ada ujian komprehensif yang bersifat sumatif sebelum dapat melanjutkan ke semester 7. Progress test dilaksanakan oleh Penanggung Jawab pengelola pendidikan dokter KURFAK 2005.

NO Nilai Bobot Kisaran Nilai 1 A 4.0 80-100 2 B 3.0 70-79 3 C 2.0 55-69 4 D 1.0 40-54 5 E 0 <40

Nilai Batas Lulus = C


PROGRAM STUDI PENDIDIKAN DOKTER UNIVERSITAS BENGKULU

HASIL DISKUSI – 1

Kelompok : .......................... Nama Fasilitator : .......................... Hari/Tanggal : ..........................

Modul : .......................... Semester : .......................... Waktu : ..........................

Anggota kelompok: 1. ............................................. 6. ............................................. 2. ............................................. 7. ............................................. 3. ............................................. 8. ............................................. 4. ............................................. 9. ............................................. 5. ............................................. 10. ...........................................

Definisi masalah (PBL) Hal yang perlu diketahui :

Hal yang sudah diketahui:

Materi bahasan yang harus dipelajari :

Tanda tangan Fasilitator

[Form ini diparaf oleh fasilitator setelah memeriksa kesesuaian isinya dengan tugas diskusi, setelah diparaf dikembalikan kepada tiap kelompok]



HASIL DISKUSI – 2

Kelompok : .......................... Nama Fasilitator : .......................... Hari/Tanggal : ..........................

Modul : .......................... Semester : .......................... Waktu : ..........................

Anggota kelompok: 1. ............................................. 6. ............................................. 2. ............................................. 7. ............................................. 3. ............................................. 8. ............................................. 4. ............................................. 9. ............................................. 5. ............................................. 10. ...........................................

Partisipasi anggota kelompok terhadap setiap presentasi yang dilakukan anggota Materi presentasi anggota yang masih belum jelas adalah tentang :

Apa yang akan dilakukan :

Tugas/pertanyaan yang masih belum diketahui dan dibahas :

Apa yang akan dilakukan :

Tanda tangan Fasilitator [ Borang ini diparaf fasilitator setelah memeriksa kesesuaian isinya dengan tugas diskusi. Setelah diparaf

dikembalikan kepada kelompok. Seluruh anggota menyetujui isi borang ini].



LEMBAR EVALUASI PESERTA DALAM DISKUSI KELOMPOK (UNTUK EVALUASI FORMATIF OLEH FASILITATOR)

Kelompok : ______________ Modul : ______________ Nama Fasilitator : ______________ Tahun akademik : ______ – ______ Trigger : 1/ 2/ 3/ 4/ 5/ 6

No Nama Peran Serta Perilaku Sharing

Argumentasi

Aktivitas

Dom

inan

Disiplin/

Kehadiran

Komunikasi

1 2 3 4 5 6 7 8 9

10 11 Keterangan:

Nilai Nilai 0-5 6-7 8-10 -5 -3 0

Sharing Kurang Kadang2 Selalu Dominasi Ya Kadang2 Tidak

Argumentasi Kurang Cukup Baik Disiplin/Kehadiran Terlambat > 15’

Terlambat < 15’

Tepat Waktu

Aktivitas Kurang Cukup Baik Komunikasi Kurang Cukup Baik Definisi butir evaluasi : Sharing : berbagi pendapat/ pengetahuan yang sesuai dengan lingkup

bahasan di antara anggota kelompok Argumentasi : memberikan pengetahuan dan tanggapan yang logis

berdasarkan literatur yang dibacanya Aktivitas : giat dalam diskusi tanpa didorong fasilitator Dominan : sikap menguasai forum pada saat diskusi kelompok Komunikasi : menyimak, menjelaskan dan bertanya dengan menggunakan

bahasa yang baik dan benar serta sistematis

Bengkulu_______________200 (________________________) nama jelas fasilitator



LEMBAR EVALUASI PESERTA DALAM DISKUSI KELOMPOK

(UNTUK DISERAHKAN KEPADA PENGELOLA MODUL) Kelompok : ______________ Modul : ______________ Nama Fasilitator : ______________ Tahun akademik : ______ – ______ Tanggal : ______________ No Nama Peran Serta Perilaku

Jumlah (Max= 40)

Sharing

Argumentasi

Aktivitas

Dom

inan

Disiplin/

Kehadiran

Komunikasi

1 2 3 4 5 6 7 8 9

10 11 Keterangan:

Nilai Nilai 0-5 6-7 8-10 -5 -3 0

Sharing Kurang Kadang2 Selalu Dominasi Ya Kadang2 Tidak

Argumentasi Kurang Cukup Baik Disiplin/Kehadiran Terlambat > 15’

Terlambat < 15’

Tepat Waktu

Aktivitas Kurang Cukup Baik Komunikasi Kurang Cukup Baik Definisi butir evaluasi : Sharing : berbagi pendapat/ pengetahuan yang sesuai dengan lingkup

bahasan di antara anggota kelompok Argumentasi : memberikan pengetahuan dan tanggapan yang logis

berdasarkan literatur yang dibacanya Aktivitas : giat dalam diskusi tanpa didorong fasilitator Dominan : sikap menguasai forum pada saat diskusi kelompok Komunikasi : menyimak, menjelaskan dan bertanya dengan menggunakan

bahasa yang baik dan benar serta sistematis

Bengkulu_______________200 (________________________) nama jelas fasilitator I



EVALUASI FASILITATOR OLEH MAHASISWA ( EFOM )

Fakultas : Blok / Modul : Nama Dosen Fasilitator : Semester : Gasal / Genap Tanggal : Angkatan tahun mahasiswa:

No Komponen yang dinilai Angka( skor )

1 2 3 4 A Pelaksanaan 1 Fasilitator menunjukkan antusiasme 2 Fasilitator hadir tepat waktu 3 Fasilitator berada di kelas selama proses diskusi 4 Fasilitator proaktif memantau proses diskusi 5 Fasilitator mengajukan pertanyaan yang memicu mahasiswa untuk berpikir kritis 6 Fasilitator memberi kesempatan pada tiap mahasiswa untuk mengekspresikan

pendapatnya

7 Fasilitator berperan aktif mengingatkan kelompok apabila diskusi menyimpang dari topik

8 Fasilitator berperan aktif mendorong mahasiswa mengevaluasi dan meringkas hasil diskusi

9 Fasilitator mengevaluasi proses diskusi dan memberi umpan balik yang berkaitan dengan proses diskusi tersebut

B Evaluasi 10 Fasilitator selalu memeriksa dan mengembalikan buku catatan/log book tepat

waktu

Saran dan Kritik

Keterangan : Berikan tanda silang (X) pada kotak yang sesuai 1 = sangat tidak sesuai 2 = kurang sesuai 3 = cukup sesuai 4 = sangat sesuai


Keterangan : 1. Fasilitator menunjukkan kegembiraan, semangat dan bersikap akrab 2. Fasilitator hadir tepat waktu

1. Terlambat pada 100 % pertemuan 2. Terlambat pada ≥ 50 % pertemuan 3. Terlambat pada < 50 % pertemuan 4. Selalu tepat waktu

3. Fasilitator berada di kelas selama proses diskusi 1. Hanya di awal dan akhir 2. Keluar masuk ruangan ≥ 3 kali 3. Keluar masuk ruangan < 3 kali 4. Tetap di tempat

4. Fasilitator pro aktif memantau proses diskusi: memastikan diskusi berjalan sesuai dengan rencana, dan tiap anggota diskusi menjalankan perannya dengan baik

5. Fasilitator mengajukan pertanyaan yang memicu mahasiswa untuk berpikir kritis: menstimulasi tanpa mengarahkan

6. Fasilitator memberi kesempatan pada setiap mahasiswa untuk mengekspresikan pendapatnya: memotivasi mahasiswa yang kurang aktif berpartisipasi dalam diskusi dan meredam mahasiswa yang terlalu mendominasi dengan cara yang bijaksana

7. Fasilitator berperan aktif mengingatkan melihat kembali tujuan yang ingin dicapai melalui pemicu apabila diskusi menyimpang dari topik.

8. Fasilitator berperan aktif mendorong mahasiswa mengevaluasi dan meringkas hasil diskusi 9. Fasilitator mengevaluasi proses diskusi dan memberi umpan balik yang berkaitan dengan

proses diskusi tersebut. 10. Fasilitator selalu memeriksa dan mengembalikan buku catatan / logbook dengan tepat waktu


Program Studi Pendidikan Dokter (PSPD) UNIVERSITAS BENGKULU

LEMBAR PENILAIAN LAPORAN PRAKTIKUM

MODUL BIOLOGI MOLEKULER

Praktikum ………………. Hari/Tgl: …………/……………… 2013, pk. … – …

Kelompok ....... Pembimbing: ………………..

NAMA MAHASISWA PENILAIAN *

PEDOMAN PENILAIAN

Angka Faktor Nilai 1 Kelengkapan Laporan

(lihat pedoman penilaian)

X

15

2 Isi laporan : a. Sistematis b. Analisis hasil c. Acuan sahih

X X X

25 25 25

3 Penampilan laporan a. Rapi b. indah

5 5

Nilai Akhir

Rentang Angka : 60 - 100

Tanda Tangan Pembimbing,


Modul: Kelompok:

Beri tanda [ x ] pada garis di samping nama, sesuai dengan nilai yang Anda berikan untuk diri sendiri dan untuk teman Anda, menyangkut kehadiran dan aktivitas dalam kegiatan kelompok ketika menyelesaikan tugas.

0 Tidak pernah datang10 Tidak hadir 2 x, kalau hadir tidak berpartisipasi aktif, dan menyelesaikan tugas sekedarnya25 Tidak hadir 2 x, kalau hadir mau berpartisipasi, tetapi menyelesaikan tugas sekedarnya, ATAU

Tidak hadir 1 x, kalau hadir tidak berpartisipasi, dan menyelesaikan tugas sekedarnya40 Tidak hadir 1 x, kalau hadir berpartisipasi aktif, dan menyelesaikan tugas sekedarnya60 Selalu hadir, tetapi kurang berpartisipasi, dan menyelesaikan tugas sekedarnya80 Selalu hadir, berpartisipasi aktif, tetapi kadang menyelesaikan tugas sekedarnya100 Selalu hadir, selalu berpartisipasi aktif, kooperatif, dan selalu menyelesaikan tugas dengan baik dan persiapan mantap

NAMA ANGGOTA KELOMPOK 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70 75 80 85 90 95 100*2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

Catatan: Tidak ada nilai yang sama untuk lebih dari 3 orang* Pemberi nilai

LEMBAR PENILAIAN DIRI & TEMAN


Module: Group

Mark [ x ] in the appropriate place on the line beside each name to mark yourself and your peer concerning discipline, participation in group discussion and performance in doing task/homework

0 No attendance at all10 2 x absence, no active participation, doing homework/task inadequately25 2 x absence, active participation but doing homework/task inadequately, OR

1 x absence, no active participation and doing homework/task inadequately40 1 x absence, active participation but doing homework/task inadequately60 No absence, active participation but doing homework/task inadequately80 No absence, active participation but sometimes doing homework/task inadequately100 No absence, active participation and always doing homework/task adequately (perfectly)

GROUP MEMBERS 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70 75 80 85 90 95 100*2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

Note: No same marks for more than 3 people

* Evaluator

PEER- AND SELF-ASSESSMENT SHEET

Buku Pedoman Kerja Mahasiswa (BPKM), Modul Biologi & Molekuler, PSPD UNIB, 2012 - 2013 43

Dr. Tjahjani Mirawati Sudiro PhD

Dra. Rawina Winita,MS

Dra. Ria Kodariah,MS

Dr. Dwi Anita Suryandari, M.Biomed

DR.dr.Ani Retno Prijantni , MS

Dr.rer.Physiol.dr. Septelia Inawati Wanandi

Dr.rer.nat. Dra. Asmarinah, MS

Drs. Surya Dwira, MS

Dra. Melva Louisa,Apt MBiomed

Dr. Djaja Surya Atmadja, SpF, PhD, SH, DFM

Penanggung Jawab Modul Lokal:

Ketua : dr.Ahmad Azmi Nasution

Sekretaris : dr.Novriantika L

Sekterariat : Suprianto,S.si

No.Contact :

081390996346

PENYUSUN MODUL BIOLOGI MOLEKULER

Documents

BPKM-BIOMOL-2013