利用CiteSpace进行课题背景及发展态势分析library.shanghaitech.edu.cn/_upload/article/files/... · 1. G-index （k=5） G index is the largest number that equals the

利用CiteSpace进行课题背景及发展态势分析

上科大图信中心常江

上科大图信中心

拿到课题不知所措？

• 对课题一无所知，如何快速了解课题（学科）背景和发展历程？

• 有什么方法在短时间内阅读大量文献吗？

• 怎么找到领域内时下研究的热点？

例：TS=(“stem cell” OR “stem cells” AND PY= ( 1990 to current ) = 302,903 篇


010203040506070

USA

ENG

LAN

D

GER

MA

NY

JAP

AN

CA

NA

DA

FRA

NC

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PEO

PLE

S R

…

NET

HER

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ITA

LY

SPA

IN

SWIT

ZER

LAN

D

AU

STR

ALI

A

SWED

EN

SCO

TLA

ND

ISR

AEL

SIN

GA

PO

RE

BEL

GIU

M

AU

STR

IA

SOU

TH K

OR

EA

干细胞研究领域各国发文量百分比

0

500

1000

1500

2000

2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016

干细胞研究2006-2015年间发文量趋势图

• Web of Science自带的

分析功能基本都是基

于数据统计的分析。

• 如何进行引文的网络

分析？

• 如何深度挖掘/提取领

域关键词/方向/特征

词

• 有没有可视化的图谱？

做到一目了然。

Web of Science 不是有数据分析功能吗？


绘制科学知识图谱

• 通过数据挖掘、信息处理、分析计量和图形绘制，把复杂的信息

直观地在图形上展现出来。

• 分析方法：引文分析、聚类分析、网络分析、多维度分析等。

• 软件：CiteSpace、Pajek、Ucinet、Gephi、Vosviewer等。

Vosviewer

TDAUcinet CiteSpace

• 学科：热点、前沿领域，

新兴子领域，学科交叉；• 水平：国家、机构、作者

（领军人物）；• 文献：高被引论文、期刊；上

科大图信中心

What is CiteSpace for？

CiteSpace是一款基于Java语言编写

的可视化文献分析软件，能够分析和

显示一个主题或一个学科在一定时期

发展的趋势与动向，形成若干研究前

沿领域的演进历程。

CiteSpace is a freely available computer

program written in Java for visualizing and

analyzing the literature of a knowledge domain.

A knowledge domain is broadly defined to

capture the notion of a logically and cohesively

organized body of knowledge.


CiteSpace的下载安装

CiteSpace是一个免费软件

下载地址：

http://cluster.cis.drexel.edu/~cchen/citespace

系统要求：需要安装Java 8 JRE。

下载解压缩文件包，运行StartCiteSpace.bat即可。


主要内容 Contents

如何发现领域内的核心论文？

如何发现领域内不同时期的研究热点？

如何发掘出子领域或学科间的交叉关系？

如何发掘发文国家或机构间的合作关系?上科大图信中心

Data Collection 数据源的确定

Although only Web of Science and

PubMed are displayed, CiteSpace

allows you to analyze data set from a

variety of sources.

• Data input was initially based on the format of Web of Science, while

CiteSpace is now able to converting the data format of PubMed, Scopus,

ADS, arXiv, Derwent, etc.


How to prepare your dataset？

1. 在Web of Science中进行

指定课题的检索，并精

炼所需检索结果；

Make a general search in

Web of Science；

2. 将检索结果中的所有记

录添加到标记结果列

表；

Mark all search results；

Web of Science


How to prepare your dataset？

Web of Science

3. 导出相应记录的字段（一定要有参考文献字段！！！）保存为纯文本(txt)格式；

Save the records, including

Cited References, in field

tagged format.

4. 将文件均重命名为download*.txt，并保存至同一文件夹中。

Name your files as

download*.txt.上科大图信中心

Web of Science data format

[AU]:Zheng, CX; Yang, Q; Xu, CL; Shou, PS; Cao, JC; Jiang, MH; Chen, Q;Cao, G; Han, YY; Li, FY; Cao, W; Zhang, LY; Zhang, L; Shi, YF; Wang, Y[TI]:CD11b regulates obesity-induced insulin resistance via limitingalternative activation and proliferation of adipose tissue macrophages[SO]:PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THEUNITED STATES OF AMERICA[DE]:integrin CD11b; macrophage proliferation; alternative activation;obesity; insulin resistance[C1]:[Zheng, Chunxing; Yang, Qian; Xu, Chunliang; Shou, Peishun; Cao,Jianchang; Jiang, Menghui; Chen, Qing; Cao, Gang; Han, Yanyan; Li,Fengying; Cao, Wei; Shi, Yufang; Wang, Ying] Shanghai Jiao Tong Univ,Sch Med, Chinese Acad Sci, Key Lab Stem Cell Biol,Inst HlthSci,Shanghai In, Shanghai 200031, Peoples R China; [Zhang, Liying; Shi,Yufang] Soochow Univ, Inst Translat Med, Affiliated Hosp 1, Suzhou215006, Peoples R China; [Zhang, Li] Univ Maryland, Sch Med, DeptPhysiol, Ctr Vasc & Inflammatory Dis, Baltimore, MD 21201 USA; [Shi,Yufang] Rutgers Robert Wood Johnson Med Sch, Child Hlth Inst NewJersey, New Brunswick, NJ 08901 USA

c

作者

标题

期刊

关键词

地址

Web of Science全记录信息解读


CiteSpace window display —界面介绍

指令窗口（双击“StartCiteSpace.bat”）

主窗口可视化窗口上科大图信中心

CiteSpace window display —界面介绍

项目设置

时间设置

节点类型

取词来源

阙值选择

进度框

连线类型

菜单栏

数据模块

分析角

度设置

参数设

置区域

可视化设置上科大图信中心

例1 害虫抗药性领域发展态势（2011-2015）


0

5

10

15

20

25

30

35

各国发文量对比


00.5

11.5

22.5

33.5

44.5

各机构发文量对比

16.5

17

17.5

18

18.5

19

19.5

20

20.5

21

21.5

2011 2012 2013 2014 2015

年发文量百分比

20%

17%

11%6%6%

5%5%

5%

5%4%

4%3%

3%3%3%

出版物分布

PEST MANAGEMENT SCIENCE

JOURNAL OF ECONOMIC ENTOMOLOGY

PESTICIDE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY

ENTOMOLOGIA EXPERIMENTALIS ET APPLICATA

BIOLOGICAL CONTROL

ENVIRONMENTAL ENTOMOLOGY

JOURNAL OF MEDICAL ENTOMOLOGY

JOURNAL OF INSECT PHYSIOLOGY

INSECT BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY

JOURNAL OF INSECT SCIENCE

FLORIDA ENTOMOLOGIST

JOURNAL OF APPLIED ENTOMOLOGY

BIOCONTROL SCIENCE AND TECHNOLOGY

EXPERIMENTAL AND APPLIED ACAROLOGY

ARTHROPOD PLANT INTERACTIONS



CiteSpace的设置及使用

1. 打开CiteSpace，新建Project命名为

Pesticide Resistance。

2. 设置Project Home及Data Directory的路

径，其中Data Directory的路径地址为

下载保存Web of Science检索结果(txt)

的文件夹。

3. 其余参数均保留为默认设置即可，Look

Back Years可根据实际需要更改。

4. 一键式“GO！”按钮开启数据读取和分

析，并反馈统计结果。



在可视化窗口中，可查找聚类并提取聚类关键词（反映一类研究的主题），发现研究热点，新

兴点。也能一目了然高被引论文，以及引文间的相互关系，被引频率高低等。

CiteSpace的设置及使用

节点信息列表

图谱展示窗口

参数调节窗口


CiteSpace可视化窗口工具栏

开始布局

停止布局

背景颜色

查找聚类

查找聚类（SQL）

摘要选取

关键词选取

标题选取

节点大小、颜色等调节

聚类标签内容



Time Slicing

1. 在一组数据集中，时间切片可以是数据

集整体，也可以是任意时间子集。

2. 时间切片默认按照每一年进行切片，也

可按照N年切片。

Term Source

• CiteSpace设置了四个取词来源，Title，

Abstract，Keywords以及Keywords Plus，

建议全部勾选。

Term Type

• 如果只分析共

引关系，此步

骤可省略。

**Node Types 四种运算方法：

1. Co-author 共作关系

2. Co-citation 共引关系

3. Co-occurring 共现关系

4. Bibliography coupling 参考文献耦合上科大图信中心


Selection Criteria:

1. G-index （k=5）

G index is the largest number that

equals the average number of

citations of the most highly cited g

publications.

2. Top N = 50

Top N is 50 most cited or occurred

items from each slice.

√

√





Co-citation

共引关系

Node Type:

Cited Reference

Selection Criteria:

G-index （k=5）

Look back Years = 8

Link Retaining Factor = 2

**

**

**



Co-citation

共引关系

Node Type:

Cited Reference

Selection Criteria:

G-index （k=5）

Look back Years = 8


Betweennesscentrality

Citation tree-rings



基本概念

Betweenness Centrality 中

介中心性是CiteSpace测度节点

在网络中重要性的一个指标, 并

用紫色圈对该类文献（或作者、

期刊以及机构等）进行重点进

行标注。

Citation tree-rings 引文年

环代表着某篇文章的引文历史。

引文年轮的颜色代表相应的引

文时间，一个年轮厚度和与相

应时间分区内引文数量成正比。上科大图信中心


基本概念

Burst 检测突发主题（或文献、作者以及期刊引证信息等）。CiteSpace中使用Kleinberg在2012

年提出的算法进行检测。



Citation Burst

Dinsdale A, 2010, ANN ENTOMOL SOC AM



• Find Clusters

• Label Clusters

• 节点、连线、

字体等在右侧

控制面板调节

1 2

Clusters View



隐藏较小的聚类

• 使用Filter out Small Clusters功能，

隐藏小聚类，方便阅读分析结果。


领域内主要的研究方向和热点


• 0# pesticide resistance

• 1# ddt resistance

• 2# biochemical

characterization

• 3# culex-pipiens diptera,

acetylcholinesterase gene

• 4# haematobia irritan,

xenopus oocyte expression

system

• 5# leptinotarsa decemlineata，

carbamoyl phosphate

• 6# life history characteristics,

pancreatic lipase

氨甲酰磷酸





领域内近期的新兴主题（可能是未来的热点）

对照Citation Burst使用


领域内主要的研究方向和热点（按年份切片）


2011-2012 2013-2014 2015

溴氰菊酯

生态毒性

甲氧虫酰肼

解毒作用

苏云金芽孢杆菌

缩合丹宁



Co-occurring terms

共现关系

1. Create POS Tags

2. Choose Node Type

Induced resistance

maize



Co-occurring terms

共现关系

Node Type:

Keyword

Selection Criteria:

Top N (50)



Co-occurring terms

共现关系

Node Type:

Keyword

Selection Criteria:

Top N (50)



Co-occurring terms

共现关系

Node Type: Keyword

氰戊菊酯瓢甲科

鞘翅目


Co-occurring terms

共现关系

Node Type:

Term

Selection Criteria:

Top N (50)




Co-author

Node Type:

Country

Selection Criteria:

Top N (50)

发现国家间的合作关系



Co-author

Node Type:

Country

Selection Criteria:

Top N (50)

发现国家间的合作关系:点

击单个节点可高亮显示具体

合作关系



Co-author

Node Type:

Institution

Selection Criteria:

Top N (50)

发现机构间的合作关系


不同参数设置下的图谱对比

调节参数

• G-index

• Top N

• Link

Retaining

Factor

• Look Back

Years



Timeline View



Timezone View

真菌分类学学科态势发展（1996-2015）上科大图信中心


Geographical Overlays

Authors’ geographic locations in their publication records can be mapped to a

geospatial map in KML. You can use Google Earth as the interface to explore the

authors’ locations and links to their collaborators.



• 可以查看全面的合作网络，也可以查看单个地区的合作情况；

• 移动到红点的位置，可以查看该文献记录并直接打开。

Geographical Overlays

位置：可在复选框中勾选单个、多个或全部



Dual-Map Overlays

• This function

allows you to

add overlays

(maximum 12

layers) on

JCR Journal

Maps.


例2 干细胞领域近5年发展态势

Co-occurring

共现关系

Node Type:

Keyword

Selection Criteria:

G-index （k=5）


例2 干细胞领域近5年发展态势

Co-occurring

共现关系

Node Type:

Keyword

Selection Criteria:

G-index （k=5）


例3 真菌分类学领域发展态势（1996-2015）

Co-citation

共引关系

Node Type:

Cited Reference

Selection Criteria:

G-index （k=5）

Look back Years = 8



CiteSpace可以分析中文文献吗？

• CNKI和CSSCI的数据可以导入CiteSpace进行分析，但导入之前需要进行数

据格式的转换，具体方法是：

*CNKI输出格式选择Refworks格式


用CiteSpace分析CNKI中文文献

• 中文文献分析使用4.2.R3之前的版本！使用4.2.R3之前的版本！使用4.2.R3

之前的版本！重要的事情说三遍！！！

共现关系


数据的导入：

• WoS直接导入

• PubMed在线检索

• 多种数据库格式转换

四种运算方法：

• 共引关系

• 共现关系

小结：巧用CiteSpace快速解读课题信息

时刻注意节点的选择！

• 导致聚类的意义不一样！

巧用工具栏参数设置调节图谱

适时选用Timeline和Timezone视图

CiteSpace帮你理清学科发展，找出精品文章来阅读。


CiteSpace官网

http://cluster.cis.drexel.edu/~cchen/citespace


常江[email protected]上

科大图信中心

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利用CiteSpace进行课题背 景及发展态势分析library.shanghaitech.edu.cn/_upload/article/files/... · 1. G-index （k=5） G index is the largest number that equals the

利用CiteSpace进行课题背景及发展态势分析library.shanghaitech.edu.cn/_upload/article/files/... · 1. G-index （k=5） G index is the largest number that equals the