x

y

Cieto riekstu vācelīte

Jānis Liepiņš

11/12/2004

x

y

1 nm2 mm3 cm4 km5 m6 pm

a) 10-3 m

b) 103 mc) 10-6 md) 10-12 me) 10-2 mf) 10-9 m

Sakārtojiet kreisās kolonnas lielumusar tiem atbilstošajām otrās kolonnas vērtībām

1

x

y

OD (Optical Density) ir lielums, kasraksturo dotā šķīduma "caurspīdīgumu",pēc kā savukārt var spriest par tajā suspendēto vielu/daļiņu koncentrāciju.OD600 izmanto šūnu kultūras blīvuma mērīšanai. OD600 atkarība no šūnu skaita ml ir lineāra (grafiks taisne);OD600= 0 atbilst izejas šķīdumam bez šūnām, OD600=1 šūnu skaits/ml =106/ml

2

x

yCik šūnu ir 100 l šūnu suspensijas, ja nomērītais OD600= 0,21 ?

OD (Optical Density) ir lielums, kas raksturo dotā šķīduma "caurspīdīgumu", pēc kā savukārt var spriest par tajā suspendēto vielu/daļiņu koncentrāciju.OD600 izmanto šūnu kultūras blīvuma mērīšanai. OD600 atkarība no šūnu skaita ml ir lineāra (grafiks taisne); OD600= 0 atbilst izejas šķīdumam bez šūnām,OD600=1 šūnu skaits/ml =106/ml

2

x

y

Lai uzsētu biezu (liels OD600) suspensiju uz barotnēm un varētu atlasīt atsevišķas šūnas lieto atšķaidījumu metodi. Atšķaida izejas kultūru 10 reižu, to vēlreiz 10x, to atkal utt.... Tādā veidā iegūtos atšķaidījumus sauc par pirmo, otro, 3-o...utt atšķaidījumiem.

3

x

y

Lai uzsētu biezu (liels OD600) suspensiju uz barotnēm un varētu atlasīt atsevišķas šūnas lieto atšķaidījumu metodi. Atšķaida izejas kultūru 10 reižu, to vēlreiz 10x, to atkal utt.... Tādā veidā iegūtos atšķaidījumus sauc par pirmo, otro, 3-o...utt atšķaidījumiem.

Cik kolonijas iegūst uz plates (teorētiski jāizaug) no 100 l 5-tā atšķaidījuma (izejas kultūras OD600=5).

Pieņem, ka viena kolonija veidojas no vienas šūnas.

3

x

y

Izdzīvotība ir lielums, kas raksturo dzīvo indivīdu īpatsvaru populācijā, apzīmē SR (Survival Rate), aprēķina SR=nlive/n, kur nlive – dzīvo īpatņu skaits, n – kopējais īpatņu skaitsParasti SR izsaka procentos

4

x

y

Izdzīvotība ir lielums, kas raksturo dzīvo indivīdu īpatsvaru populācijā, apzīmē SR (Survival Rate), aprēķina SR=nlive/n, kur nlive – dzīvo īpatņu skaits, n – kopējais īpatņu skaits

Uzsējot 100 l šūnu kultūras ar OD600=4, 4-o atšķaidījumu, izauga 30 kolonijas.Kāda ir šūnu kultūras izdzīvotība?Pieņem, ka viena kolonija veidojas no vienas dzīvās šūnas.

4

x

y

Kādā palielinājumā redzami dotie objekti?

Kas ir apzīmēts ar A un B?

5 cm

BA

5

x

y

6

Homoloģija (H) ir lielums, kas raksturo cik līdzīgas ir dotās DNS, RNS, proteīnu u.c sekvences. Sekvenču homoloģija ir relatīvs lielums, parasti to izsaka %

Aprēķina: H = nsim/n, kur

nsim = vienādo atbilstošo elementu skaits(elementi atrodas vienādās pozīcijās)

n = kopējais fragmenta garums (elementu skaits virknē)

x

y

Aprēķina: H = nsim/n, kur nsim = vienādo atbilstošo elementu skaits(elementi atrodas vienādās pozīcijās)n = kopējais fragmenta garums

(elementu skaits virknē)

Kāda ir doto DNS sekvenču homoloģija:

6

Seq1 tgagtcctttgggattgtccactcctgatg Seq2cgagtcctttgggactgtcctctgcaaatg

x

y

Drīz sekos atbildes!