Cinetica Enzimatica y Microbiana

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reacciones químicas

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AO DE LA DIVERSIFICACION PRODUCTIVA Y FORTALECIMIENTO DE LA EDUCACION UNIVERSIDAD NACIONAL

DEL CENTRO DEL PER

FACULTAD DE INGENIERA QUMICAESCUELA ACADMICA PROFESIONAL DE INGENIERA QUMICA INDUSTRIAL CINETICA ENZIMATICA Y MICROBIANA

CATEDRTICO:Ms. HUGO SUASNABAR BUENDIACTEDRA:INENIERIA DE LAS REACCIONES QUIMICASINTEGRANTE: ESPINOZA HUAMAN, SAUL

VII SEMESTRE

Huancayo Per 2015Ing. De las Rx Qumicas

i

INTRODUCCINPara poder analizar y saber de qu se hablara a lo largo de este documento se darn a conocer algunos de los conceptos bsicos que se manejaran y sus significados.La Cintica es la parte de la Mecnica encargada de definir y calcular los atributos cinticos de un sistema material arbitrario X en un movimiento dado.Recalcar el hecho de que no existe ninguna restriccin sobre el tipo de movimiento, y eso incluye al referente del mismo, hasta el punto de que ser habitual usar un movimiento genrico que satisfaga las ligaduras geomtricas. El movimiento real que tenga el sistema vendr determinado a posteriori por las ecuaciones generales de la Dinmica.Con el movimiento, adems de las magnitudes de la geometra de masas, hacemos intervenir el tiempo, por lo que ya tenemos las tres magnitudes fundamentales de la Dinmica: masa, longitud y tiempo.Los atributos cinticos de inters van a ser: Cantidad de movimiento, Momento cintico y Energa cintica.La cintica qumica es la parte de la qumica que trata de la velocidad con que suceden las reacciones, de los factores que influyen en ella y del mecanismo a travs del cual los reactivos se transforman en productos. Velocidad de reaccin: representa la rapidez con que tiene lugar la transformacin qumica de unas sustancias, los reactivos, en otras distintas, los productos. Velocidad media de una reaccin se mide a partir de la disminucin de la concentracin de un reactivo o el aumento de la concentracin de un producto en un intervalo de tiempo. La cintica de crecimiento microbiano constituye una de las operaciones ms utilizadas por la ingeniera alimentaria y la biotecnologa, por lo tanto, es necesario conocer los diferentes mecanismos, sus formas de aplicacin, ventajas y desventajas de los diferentes mtodos, y sobre todo el monto econmico de cada uno de ellos. Por tanto, el siguiente documento trata de proporcionar una informacin general acerca de losDiferentes mecanismos de reproduccin bacteriana, as como de dar una idea acerca de la utilizacin de los mismos, sus caractersticas, especificaciones, y un anlisis de las ventajas y desventajas de cada uno de ellos.Las enzimas son protenas (RNA) que catalizan reacciones qumicas en las clulas. Cada enzima es altamente especfica para la reaccin que cataliza.

2. CATALISIS ENZIMATICA Existen molculas biolgicas capaces de aumentar bastante la velocidad de reacciones qumicas, i.e., son los llamados catalizadores. Estas molculas son genricamente denominadas enzimas y son (en casi su totalidad) protenas. Las enzimas no proteicas conocidas son constituidas por RNA. Las enzimas son altamente especficas: cada enzima apenas reacciona con un conjunto muy restringido de molculas (sus sustratos). Las enzimas no alteran el equilibrio qumico de las reacciones catalizadas, apenas disminuyen su energa de activacin.

El mecanismo ms simple para explicar la accin enzimtica es el modelo de Michaelis-Menten:

E +S ES -> E + P

En este modelo la enzima (E) se liga al sustrato (S) para formar un complejo enzima-sustrato (ES). Este puede separarse nuevamente en enzima y sustrato libre o transformar el sustrato en producto (P). Como en cualquier reaccin elemental (i.e. una reaccin que ocurre por simple colisin entre reactivos), la velocidad de cada paso ser proporcional a la concentracin de los reactivos de ese paso. En cada caso, la constante de proporcionalidad ser una funcin de la energa de activacin de ese paso.

En la mayor parte de las enzimas se verifica que el equilibrio E +S ES se alcanza muy rpidamente (en pocas decenas de milisegundos). Una vez alcanzado el equilibrio, la concentracin de ES se mantiene constante, una vez que siempre que un complejo ES se disocia en producto y enzima libre, esta se liga muy rpidamente a una nueva molcula de sustrato regenerando el complejo ES. En estas condiciones es obvio que la velocidad de degradacin ES es igual a la velocidad de su formacin o sea:En principio, no nos es dado saber en cada momento cual ser la concentracin de enzima que se encuentra libre o bajo la forma de complejo enzima sustrato. Sin embargo, sabemos que la suma de las dos concentraciones debe igualar la concentracin de enzima total (Et). Sustituyndola en (1)

Si el paso limitante de la reaccin fuese la transformacin del complejo ES en enzima libre y producto, la velocidad de reaccin enzimtica ser:

La expresin puede ser simplificada si juntamos todas las constantes presentes e el denominador en una nueva constante:, que es conocida como constante de Michaelis. Cuandoque es tambin la constante de disociacin del complejo ES. Km es por tanto una medida de la estabilidad del complejo enzima-sustrato. Substituyendo en la expresin (2), esta toma as la forma:

Cuando

, que es por tanto la velocidad mxima de reaccin enzimtica. Sustituyendo nuevamente se obtiene la forma familiar de la ecuacin de Michaelis-Menten:

La representacin grfica de la velocidad de reaccin en funcin de la concentracin de sustrato es por tanto una hiprbola, que se representa debajo. La asntota horizontal corresponde a vmax. El valor de Km tambin puede ser obtenido a travs del grfico, una vez que cuando la [S]=KM , la ecuacin de Michaelis-Menten prev que la velocidad sea

La constante de Michaelis Menten es por tanto la concentracin de sustrato para la cual la velocidad de la reaccin es la mitad de la velocidad mxima.

2.1. EL EFECTO DE INHIBIDORES COMPETITIVOS EN LA ACTIVIDAD ENZIMTICAUn inhibidor competitivo de una enzima es una molcula capaz de enlazarse a la enzima e impedir el enlace de la misma al sustratoPara que esto suceda es necesario que el inhibidor se enlace al lugar de la enzima normalmente ocupado por el sustrato (este lugar se denomina centro activo), lo que obviamente solo es posible cuando el inhibidor tiene una estructura qumica bastante semejante a la del sustrato.Aplicando un tratamiento matemtico anlogo al utilizado anteriormente, se prueba que en la presencia de un inhibidor competitivo, la velocidad de la reaccin enzimtica es dada por:

La comparacin de esta ecuacin con la ecuacin de Michaelis-Menten muestra que: en la presencia de un inhibidor competitivo, la velocidad de reaccin es inferior a la de la reaccin no inhibida (de ah el nombre de inhibidor).La concentracin de sustrato para la cual la velocidad es mitad de la velocidad mximaEs:

Este valor (llammosleKMaparente) es siempre superior al valor de KMen la ausencia del inhibidor.Cuando, la velocidad de reaccin se aproxima asintoticamente del vmax, tal como en la reaccin no inhibida.

2.2 EL EFECTO DE INHIBIDORES NO COMPETITIVOS EN LA ACTIVIDAD ENZIMTICA

Un inhibidor no competitivo de una reaccin enzimtica a una sustancia que se enlaza a la enzima en un lugar diferente del centro activo y que, mas all de que no impide el enlace del sustrato al centro activo, impide su transformacin en producto: la reaccin solo puede ocurrir luego que el sustrato se desenlace de la enzima.Aplicando un tratamiento matemtico anlogo al utilizado anteriormente, se prueba que en la presencia de un inhibidor no competitivo, la velocidad de reaccin enzimtica esta dada por:

La comparacin de esta ecuacin con la ecuacin de Michaelis-Menten muestra que: en la presencia de un inhibidor no competitivo, la velocidad de reaccin es inferior a la de la reaccin no inhibida (de ah el nombre de inhibidor)La concentracin de sustrato para la cual la velocidad es mitad de la velocidad mxima es igual a la observada en ausencia de inhibidor.Cuando, la velocidad de la reaccin se aproxima asintticamente de, que es siempre inferior al de la reaccin no inhibida.3. CLASIFICACION DE LAS ENZIMAS En funcin de su accin cataltica especfica, las enzimas se clasifican en 6 grandes grupos o clases:

Clase 1: OXIDORREDUCTASASClase 2: TRANSFERASASClase 3: HIDROLASASClase 4: LIASASClase 5: ISOMERASASClase 6: LIGASAS3.1.- OXIDORREDUCTASAS.- Catalizan reacciones de oxidorreduccin, es decir, transferencia de hidrgeno (H) o electrones (e-) de un sustrato a otro, segn la reaccin general:AH2+ BA + BH2

Ared+BoxAox+ Bred

Ejemplos son la succinato deshidrogenasa o la citocromo c oxidasa.3.2.-TRANSFERASASCatalizan la transferencia de un grupo qumico (distinto del hidrgeno) de un sustrato a otro, segn la reaccin:A-B + CA + C-B

Un ejemplo es la glucoquinasa, que cataliza la reaccin representada en la Figura de la derecha:glucosa + ATP ADP + glucosa-6-fosfato

3.3.- HIDROLASASCatalizan las reacciones de hidrlisis:A-B + H2OAH + B-OH

Un ejemplo es la lactasa, que cataliza la reaccin:

lactosa + aguaglucosa + galactosa

3.4.- LIASASCatalizan reacciones de ruptura o soldadura de sustratos:

A-BA + B

Un ejemplo es la acetacetato descarboxilasa, que cataliza la reaccin:

cido acetacticoCO2+ acetona

3.5.- ISOMERASASCatalizan la interconversin de ismeros:

AB

Son ejemplos la fosfotriosa isomerasa y la fosfoglucosa isomerasa, que catalizan las reacciones representadas en la tabla inferior:

fosfotriosa isomerasafosfoglucosa isomerasa

gliceraldehdo-3-fosfatodihidroxiacetona-fosfato

glucosa-6-fosfatofructosa-6-fosfato

3.6.- LIGASASCatalizan la unin de dos sustratos con hidrlisis simultnea de un nucletido trifosfato (ATP, GTP, etc.):

A + B + XTPA-B + XDP + Pi

Un ejemplo es la piruvato carboxilasa, que cataliza la reaccin:

piruvato + CO2+ ATPoxaloacetato + ADP + Pi

4. CINETICA DE REACCIONES ENZIMATICAS

4.1.-EACCIONES CON UN SUSTRATOLas enzimas que presentan un mecanismo de nico sustrato incluyen isomerasas, tales como la triosafosfato isomerasa o la bisfosfoglicerato mutasa, y liasas intramoleculares, tales como la adenilato ciclasa o la ribozima ARN-liasa.6 Sin embargo, existen ciertas reacciones enzimticas de nico sustrato que no pertenecen a esta categora de mecanismos, como es el caso de la reaccin catalizada por la catalasa. La catalasa reacciona inicialmente con una molcula de perxido de hidrgeno (agua oxigenada) y queda en un estado oxidado tras liberar el producto (agua), y, posteriormente, es reducida por una segunda molcula de sustrato. Aunque durante la reaccin solo participa un sustrato, la existencia de un intermediario enzimtico modificado permite incluir al mecanismo de la catalasa en la categora de mecanismos de ping-pong, un tipo de mecanismo discutido ms adelante.4.2.-CINTICA DE MICHAELIS-MENTENComo las reacciones catalizadas por enzimas son saturables, la velocidad de catlisis no muestra un comportamiento lineal en una grfica al aumentar la concentracin de sustrato. Si la velocidad inicial de la reaccin se mide a una determinada concentracin de sustrato (representado como [S]), la velocidad de la reaccin (representado como V) aumenta linealmente con el aumento de la [S], como se puede ver en la figura. Sin embargo, cuando aumentamos la [S], la enzima se satura de sustrato y alcanza su velocidad mxima (Vmax), que no sobrepasar en ningn caso, independientemente de la [S].El modelo de cintica michaeliana para una reaccin de nico sustrato se puede ver en la figura de la izquierda. Primeramente, tiene lugar una reaccin qumica bimolecular entre la enzima E y el sustrato S, formndose el complejo enzima-sustrato ES. Aunque el mecanismo enzimtico para una reaccin unimolecular ES \rightarrow E + P puede ser bastante complejo, existe una etapa enzimtica limitante que permite que el mecanismo sea simplificado como una etapa cintica nica cuya constante es k2.A bajas concentraciones de sustrato, la enzima permanece en un equilibrio constante entre la forma libre E y el complejo enzima-sustrato ES. Aumentando la [S] tambin aumentamos la [ES] a expensas de la [E], desplazando el equilibrio de la reaccin hacia la derecha. Puesto que la velocidad de reaccin depende de la [ES], la velocidad es sensible a pequeos cambios en la [S]. Sin embargo, a altas [S], la enzima se satura y solo queda la forma unida al sustrato ES. Bajo estas condiciones, la velocidad de la reaccin (v k2[E]tot = Vmax) deja de ser sensible a pequeos cambios en la [S]. En este caso, la concentracin total de enzima ([E]tot) es aproximadamente igual a la concentracin del complejo ES:.(3)

Representacin grfica de la curva de saturacin de una enzima donde se puede observar como evoluciona la relacin entre la concentracin de sustrato y la velocidad de la reaccin.Laecuacin de Michaelis-Mentendescribe cmo la velocidad de la reaccin depende del equilibrio entre la [S] y la constantek2.Leonor MichaelisyMaud Mentendemostraron que sik2es mucho menor quek1(aproximacin del equilibrio) se puede deducir la siguiente ecuacin:

(Ecuacin 4)Esta famosa ecuacin es la base de la mayora de las cinticas enzimticas de sustrato nico.La constante de MichaelisKmse define como la concentracin a la que la velocidad de la reaccin enzimtica es la mitad de la Vmax. Esto puede verificarse sustituyendo la concentracin de sustrato por dicha constante ([S] =Km). Si la etapa limitante de la velocidad de la reaccin es lenta comparada con la disociacin de sustrato (k2