LIGAMIENTOLIGAMIENTOLIGAMIENTOLIGAMIENTO

PPW. Bateson y W. Bateson y

R. C. Punnett (1906)R. C. Punnett (1906)

FF11

Observado EsperadoObservado Esperado

296 240296 240

FF2219 8019 80FF22

27 8027 80

85 27 85 27

427 427427 427

Morgan (D. melanogaster)color de ojos: pr+(rojos), pr(púrpura)largo de alas: vg+(normal), vg(vestigial)largo de alas: vg (normal), vg(vestigial)

P : pr+pr+/vg+vg+ X prpr/vgvg

pr vg pr vg

xF1: pr+pr/vg+vg X prpr/vgvg

Gametos: pr+vg+, pr+vg, prvg+, prvg prvg

pr+ vg+ pr vg

p g p g

F2: pr+pr/vg+vg (rojos, normales) = 1067 (parental)pr+pr/vgvg (rojos, vestigiales) = 157 (recombinante)prpr/vg+vg (púrpuras, normales) = 146 (recombinante)prpr/vgvg (púrpuras, vestigiales) = 965 (parental)prpr/vgvg (púrpuras, vestigiales) 965 (parental)

Genes A y B en cromosomas diferentes (2da Ley de Mendel)

A B bA

a

B

b

a

a

b

bx

ABABAbaB

ab

ab

F1 A Bb (P t l) 1F1: AaBb (Parental) 1Aabb (Recombinante) 1aaBb (Recombinante) 1

50% FENOTIPO PARENTAL

50% FENOTIPO( )aabb (Parental) 1

50% FENOTIPORECOMBINANTE

Genes A y B en el mismo cromosoma (Ligamiento)Genes A y B en el mismo cromosoma (Ligamiento)A B a b

x sin crossing-overa b a b

AB b

g

ABab

ab

F1: AaBb (Parental) 1aabb (Parental) 1

100% FENOTIPOPARENTAL

GENES COMPLETAMENTE LIGADOS

Genes A y B en el mismo cromosoma (Ligamiento)

con crossing-over

<50% FENOTIPO PARENTAL

>50% FENOTIPO>50% FENOTIPORECOMBINANTE

PARCIALMENTE LIGADOS

acoplamientoacoplamientoA BA B

acop a e toacop a e to(cis)(cis)

a ba b

A bA brepulsiónrepulsión

(trans)(trans)a Ba B

Generación de gametos recombinantes

A B

A B

A B

A b

B

A b

A b

A b

A B

a b

a b a b

a Ba B

a B

a b

a B

b

Acoplamiento o Cis Repulsión o Trans

ProporcionalidadProporcionalidad entreentre lala distanciadistancia cromosómicacromosómica yy lala frecuenciafrecuencia dede apariciónaparición dederecombinantesrecombinantes.. DuranteDurante lala meiosis,meiosis, laslas cromátidascromátidas homólogashomólogas sese entrecruzanentrecruzan dedemaneramanera aleatoriaaleatoria aa lolo largolargo deldel cromosomacromosoma.. LosLos lociloci TT yy UU estánestán másmás distantesdistantes entreentresísí queque loslos lociloci VV yy WW LasLas cromátidascromátidas sese entrecruzanentrecruzan entreentre TT yy UU concon mayormayorsísí queque loslos lociloci VV yy WW.. LasLas cromátidascromátidas sese entrecruzanentrecruzan entreentre TT yy UU concon mayormayorfrecuenciafrecuencia queque entreentre VV yy W,W, dede modomodo queque lala frecuenciafrecuencia dede recombinantesrecombinantes eses mayormayorparapara elel intervalointervalo TT--UU queque parapara elel intervalointervalo VV--WW

Grupos de Ligamiento: Cada uno corresponde a uno de los pares de p g p pcromosomas homólogos en el genoma de una especieD.melanogaster tiene 4 grupos de ligamiento

Mapas de Ligamiento: Se pueden construir usando la frecuencia deMapas de Ligamiento: Se pueden construir usando la frecuencia de recombinación de los genes, para ubicarlos en forma lineal a lo largo de los cromosomas. La probabilidad de que ocurra un crossing-over entre 2 loci es una función del largo del intervalo que separa ambos loci.

Sturtevant: La frecuencia de gametos recombinantes producidos entre 2 loci en un cromosoma puede ser usado como un índice de distancia entre ambos loci

Una unidad mapa o cM corresponde a la distancia que permite un 1% de progenie recombinante

Drosophila melanogaster

gen: largo de alas: normales (vg+) o vestigiales (vg)gen: color del cuerpo: gris (b+) o negro (b)

P: largas gris (vg+vg+/b+b+) X vesigial negro (vgvg/bb)P: largas, gris (vg+vg+/b+b+) X vesigial, negro (vgvg/bb)

F1: largas,gris (vg+vg/b+b) X vest.,negro(vgvg/bb)

F2: largas, gris (vg+vg/b+b) : 41%vest., negro (vgvg/bb) : 41%largas, negro (vg+vg/bb) : 9%vest gris (vgvg/b+b) : 9%vest., gris (vgvg/b+b) : 9%

Vg+ b+

18 unidades mapa o cM18 unidades mapa o cM

Las unidades mapa son aditivas. La relación directa entre frecuencia de recombinantesy distancia de hasta 20 unidades mapa o cM Debido a que ha distancias mayoresy distancia de hasta 20 unidades mapa o cM. Debido a que ha distancias mayorespueden ocurrir másde un crossing-over entre ambas cromátidas.

Mapeo por ligamiento del cromosoma X humano

θ= 1/16 = 0,17 = 17% de recombinantes = 17cMθ = 0 sin recombinación ambos loci estarían completamente ligadosθ = 0, sin recombinación, ambos loci estarían completamente ligadosθ = 0,5, distribución aleatoria, no hay ligamiento entre ambos loci

H1: La distancia entre ambos loci es tal que produce una frecuencia de recombinación de θ= 1/16 Verosimilitud de que la H1 explique los datos (5NR y 1R): L(H1)=θR x (1-θ)NRVerosimilitud de la hipótesis nula : L(H0)=θ (R+NR)Verosimilitud de la hipótesis nula : L(H0)=θ (R NR)

Cuociente de verosimilitudes (likelihood ratio): Cuantas veces es más verosimil la H1 que la H0. Para que sea significativo al 95% debe ser mayor o igual a 1.000

Lod score (“Z”, puntuación lod), Z=log10 cuociente de verosimilitudesSi el valor es 1000 entonces Z=3, este es el valor mínimo de lod score que se requiere para afirmar que existe ligamiento entre dos loci

En humanos se analizan los lod score en varias familias, hasta encontrar la fracción de recombinación a la que se obtiene el lod score máximo en el conjunto de familias analizadas Este valor permite afirmar si existe o no ligamientoanalizadas. Este valor permite afirmar si existe o no ligamiento.

FISH : Fluorescence in situ hibridization

Sonda marcada con fluorescencia: AGTAGCATGG Fluoróforo

Denaturación del DNA de los cromosomasHibridación con sonda marcadaTinción fluorescente de los cromosomasObservación con microscopio de fluorescencia

Ligamiento con marcadores moleculares de DNA

Neurospora crassa : 1 unidad mapa = 2,7 kbHumanos: 1 unidad mapa = 1 megabase o 1000 kb

cha1

cha1

glk1

cha1

glk1his4 his4

SUP53leu2 SUP53leu2 SUP53

leu2

pgk1

kpgk1

pet18pet18

cry1MAT

cry1MAT

MAT

th 4 th 4thr4 thr4

Mapa Físico Mapa GenéticoMapa Físico Mapa Genético