Corso esperti, febbraio 20051 Test day model e Indici Genetici: cosa significano Ufficio Ricerca & Sviluppo ANAFI

Corso esperti, febbraio 2005 1

Test day model Test day model e Indici Genetici: cosa e Indici Genetici: cosa

significanosignificano

Ufficio Ricerca & SviluppoANAFI


Selezione - i principi baseSelezione - i principi base

F = G + A

G è trasmissibile alla progenie

esiste variabilità genetica


Miglioramento genetico in Miglioramento genetico in aziendaazienda

Scelta dei tori da utilizzare sulle vacche per produrre le vacche del futuro

Per ottimizzare i risultati della scelta occorre decidere:

Che cosa ho bisogno di migliorare sulle mie vacche? (OBIETTIVO)

Quali caratteristiche mi permettono di raggiungere l’obiettivo?

Quali tori hanno queste caratteristiche?


Gli indici geneticiGli indici genetici

Gli strumenti per scegliere• I padri di toro• Le madri di toro• I tori da utilizzare in azienda

Calcolare gli indici = ripulire il dato misurato dagli effetti ambientali = stimare G


Indici produttivi: I datiIndici produttivi: I dati

ControlliA.P.A.

Singoli Controlli

A.I.A.

Lattazione

DATA BASE

Verifica

A.N.A.F.I. Controlli utili(05/02:115.000.000)

Verifica


Indici produttivi - l’editingIndici produttivi - l’editing

SI ELIMINANO :

02/2005: 66.000.000 controlli

controlli a meno di 5 giorni controlli a più di 305 giorni cellule superiori a 20 milioni latte inferiore a 1 kg latte superiore a 100 kg grasso inferiore a 2% e superiore a 6% proteina inferiore a 1,5% e superiore a 5% età inferiore a 18 mesi e superiore a 120 mesi ordine di parto superiore a 3 Controlli anomali


Controlli anomali (1)Controlli anomali (1)

Programma fortran che stima le curve di lattazione dai controlli ed elimina i controlli “fuori curva”


Controlli anomali (2)Controlli anomali (2)

AG 000002053 19970904 17 33.4AG 000002053 19971006 49 40.4AG 000002053 19971106 80 38AG 000002053 19971204 108 3.7AG 000002053 19980105 140 37.5AG 000002053 19980205 171 33.5AG 000002053 19980305 199 28.4AG 000002053 19980406 231 27.2

AG 000004151 20001106 17 25.4AG 000004151 20001205 46 17.4AG 000004151 20010104 76 29.8AG 000004151 20010205 108 42AG 000004151 20010305 136 27.8AG 000004151 20010404 166 34AG 000004151 20010504 196 29.4AG 000004151 20010605 228 33.2AG 000004151 20010704 257 22.8

AL 000034961 19880413 12 5AL 000034961 19880513 42 20.4AL 000034961 19880613 73 25.2AL 000034961 19880714 104 28.2AL 000034961 19880912 164 25AL 000034961 19881011 193 26AL 000034961 19881111 224 20.4AL 000034961 19881209 252 21.6AL 000034961 19890109 283 17.8


Indici produttivi – Indici produttivi – preaggiustamenti (1)preaggiustamenti (1)

CONTROLLI OK

Aggiustamento per eterogeneita'della varianza

Gruppi di contemporanee

si confrontano fra loro animali che hanno prodotto nelle stesse condizioni


ContemporaneeContemporanee

Gennaio Febbraio Marzo Aprile Maggio

15/01 15/0418/0321/02 10/05

Xa

b

d

c

e


Effetti ambientali nel modelloEffetti ambientali nel modello

Allevamento-anno-giorno di controllo TRAPS:

• Tempo• Regione = area di produzione• Age = età al parto• Parity = ordine di parto• Stagione di parto

Funzione per:• Giorni di lattazione


Gli effetti fissi - latteGli effetti fissi - latte

-15

-10

-5

0

5

10

155

25

45

65

85

10

5

12

5

14

5

16

5

18

5

20

5

22

5

24

5

26

5

28

5

30

5

gg lattazione

latte

kg

-15

-10

-5

0

5

10

15

5

25

45

65

85

10

5

12

5

14

5

16

5

18

5

20

5

22

5

24

5

26

5

28

5

30

5

gg lattazione

latte

kg


Indici produttivi - calcoloIndici produttivi - calcolo

latte, grasso e proteina, cellule kg grasso e proteina %

ANIMAL MODEL

PedigreeGenealogia

INDICI GENETICI PRODUTTIVIvalutazione genetica per :

Gruppi di contemporanee


Indici produttivi: come Indici produttivi: come combinare le informazioni ?combinare le informazioni ?

0

2

4

6

8

6

36

66

96

12

6

15

6

18

6

21

6

24

6

27

6

gg di lattazione

Kg

la

tte 1 latt

2 latt

3 latt

0

2

4

6

8

6 36

66

96

12

6

15

6

18

6

21

6

24

6

27

6

gg di lattazione

KG

la

tte 1 latt

2 latt

3 latt

-2

0

2

4

6

8

6 36 66 96 126

156

186

216

246

276

gg di lattazione

KG

latt

e 1 latt

2 latt

3 latt


Indici produttivi ufficialiIndici produttivi ufficiali

Indice latte grasso e proteina (a 305 gg) EBV305tot= 0,333 x EBV3051 + 0,333 x EBV3052

+ 0,333 x EBV3053

Indice per le cellule (media giornaliera)EBVtot= 0,333 x EBV1 + 0,333 x EBV2 + 0,333 x EBV3

Indice per la persistenzaPERStot= 0,50 x PERS1 + 0,25 x PERS2 + 0,25 x PERS3


Pubblicazione IGTPubblicazione IGT

Toro provato con 70% di attendibilità e 20 allevamenti

Pubblicazione nella lista ufficiale con 75% di attendibilità e 20 allevamenti

TORI DI IMPORTAZIONE• Dato Italiano se l’indice ha almeno il 75% di

attendibilità e figlie in 20 allevamenti

• Dato Interbull in assenza del dato italiano


Pubblicazione IGVPubblicazione IGV

Almeno 2 controlli

Almeno 1 controllo oltre i 60 giorni

Almeno 30% di attendibilità


Indice longevità - espressioneIndice longevità - espressione

0 1 2 3 4 5

49.5%

7 8

49.5%

47.5% 47.5%

34% 34%

6

Inversione del segno toro positivo = meno eliminazioni


Indice longevità – cosa significaIndice longevità – cosa significa

Livello genetico Numero medio di lattazioni figlie

Numero medio di lattazioni figlie eliminate

Inferiore a 2 2,3 2,1

Intorno a 4 2,58 2,3

Superiore a 6 3,2 2,9


Indici cellule somatiche - scaleIndici cellule somatiche - scale

Cellule Somatiche Linear Score12.000 025.000 150.000 2100.000 3200.000 4400.000 5800.000 6

1.600.000 73.200.000 86.400.000 9


Indici cellule somatiche - Indici cellule somatiche - espressioneespressione

0 1 2 3 4 5

49.5%

7 8

49.5%

47.5% 47.5%

34% 34%

6

Inversione del segno toro positivo = diminuzione cellule


Indice cellule somatiche – Indice cellule somatiche – cosa cosa significasignifica

livello genetico media di punteggio relativa concentrazione lineare di cellule di cellule somatiche

inferiore a 2 3.5 141,000intorno a 4 2.9 93,000superiore a 6 2.3 62,000


Gli indici geneticiGli indici genetici

PFT PROTEINA KG ICM LATTE KG TIPO ...

Produzione+

Funzionalità

PFT(indice di selezione)

Classifiche per :


Gli indici genetici - produzioneGli indici genetici - produzione

GP = (0,41x grasso kg + 1,75 x proteina kg +0,095 x gr% x 100 + 0,33 x pr% x 100)

Produzione

L G P G% P%

0 : 1 : 3 : 0,2 : 0,3


Gli indici genetici - funzionalitàGli indici genetici - funzionalità

ICMTipo + + IAP

Longevità + Cellule


Gli indici genetici - ICMGli indici genetici - ICM

ICM

ICM = ((0,19 x forza attacco anteriore) + (0,17 x altezza attacco posteriore) +

(0,21 x legamento) +(0,26 x profondità mammella) +

(0,17 x posizione capezzoli))


Gli indici genetici - IAPGli indici genetici - IAP

IAP = 0,50 funzionalità arti e piedi + 0,50 (0,48 altezza tallone + 0,37 arti posteriori visti da dietro + -0,15 arti posteriori visti di lato)

IAP


Gli indici genetici - PFTGli indici genetici - PFT

PFTPFT = 12,3 x (GP + 5 x Tipo + 12,15 x ICM +

8 x IAP + 8 x (longevità –4) + 10 x (cellule - 4))

Produzione Funzionalità59 : 41

Indice di selezione per la Frisona Italiana

determina la classifica ufficiale di vacche e tori


Capire gli indici test dayCapire gli indici test day

Non si assume una persistenza media ma calcola la persistenza vera in base ai dati

Si cerca di prevedere in anticipo il valore del toro nelle tre lattazioni


Previsione lattazioni successivePrevisione lattazioni successive

Quando il toro ha solo primipare:• Padre e madre ci aiutano a stimare la direzione• Le primipare ci aiutano a stimare il livello

Quando si aggiungono le secondipare:• C’è una prima verifica dell’attendibilità del

pedigree• Ci aiutano a stimare il livello delle terzipare

Quando si aggiungono le terzipare:• Non si prevede più nulla


Un esempio…Un esempio…

0

100

200

300

400

500

600

700

800

900

nov03 feb04 mag04 ago04 nov04 feb05

n.

co

ntr

oll

i

0

500

1000

1500

2000

2500

n1 n2 n3 LAtt1 latt2 latt3


Second cropSecond crop

All’arrivo delle figlie di second crop la stima di ogni lattazione è verificata:• Le primipare perfezionano il livello delle

primipare;• Le secondipare perfezionano il livello delle

secondipare;• Le terzipare perfezionano il livello delle

terzipare.

La variabilità totale dell’indice e’ più ALTA rispetto al modello a lattazioni


Un esempio Un esempio

0

2000

4000

6000

8000

10000

12000

14000

nov03 feb04 mag04 ago04 nov04 feb05

0

200

400

600

800

1000

1200

1400

1600

n1

n2

n3

LAtt1

latt2

latt3


Gli IGT (1)Gli IGT (1)


Gli IGT (2)Gli IGT (2)


Capire gli indici (2)Capire gli indici (2)

CARATTERE MINIMO MEDIA MASSIMO PFT -108 1192 2201

LATTE -767 940 2380 KG PROTEINE -8 37 83 KG GRASSO -15 34 92 % PROTEINE -0,26 0,03 0,33 % GRASSO -0,66 0,02 0,70

PERSISTENZA 65 71 77 INDICE MATURITA’ 62 99 120

TIPO -1,24 0,80 2,56 ICM -1,63 0,78 2,80

ARTI & PIEDI -1,6 0,8 3,3 CELLULE SOMATICHE 1,6 4,2 6,3

LONGEVITA’ 2,3 4,3 6,2 DIFFICOLTA’ PARTO -2,85 0,09 3,44

MUNGIBILITA’ -3,45 -0,16 8,12


Cosa significa l’indice?Cosa significa l’indice?

Livello genetico

INDICE LATTE

Produzione figlie

Superiore a 1800 104 q.li EVM

9938 kg

Tra 300 e 900 94 q.li EVM

8947 kg


INDICE GRASSOINDICE GRASSO

Livello genetico

INDICE Grasso

Produzione figlie

Superiore a 60 kg 378 kg EVM

3,96%

Tra 15 e 35 kg 337 kg EVM

3,71%


INDICE PROTEINAINDICE PROTEINA

Livello genetico

INDICE PROTEINA kg

Produzione figlie

Superiore a 50 331 kg EVM

3,35%

Tra 10 e 30 302 kg EVM

3,34%


INDICE PROTEINA %INDICE PROTEINA %

Livello genetico

INDICE PROTEINA %

Produzione figlie

Superiore 0,20 304 kg

3,43%

Tra 0 e –0,20 304 kg

3,27%


INDICE GRASSO %INDICE GRASSO %

Livello genetico

INDICE GRASSO %

Produzione figlie

Superiore 0,20 350 kg

3,84%

Tra 0 e –0,20 331 kg

3,58%


ICMICM

Livello genetico

INDICE ICM

Morfologia figlie

Superiore a 3 32 legamento

31 prof. Mammella

29 altezza att. Post.

Tra –1 e 0.0 28 legamento

27 prof. Mammella

25 altezza att. Post.


IAPIAP

Livello genetico

INDICE IAP

MORFOLOGIA figlie

Superiore a 3 25 arti di lato

28 arti da dietro

26 funzionalità

Tra -1 e 0.0 27 arti di lato

24 arti da dietro

22 funzionalità


Il pieghevole – user guideIl pieghevole – user guide

Classifiche per piu’ caratteri

Attendibilità

Schema riassuntivo

Statistiche sui nuovi tori e i dati utilizzati

Documents

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