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Curriculum vitae Impreso normalizado Número de hojas que contiene: 23 Nombre: Marcos de la Peña del Rivero

Fecha: 1 de Noviembre de 2010

MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACIÓN

SECRETARÍA DE ESTADO DE UNIVERSIDADES DIRECCIÓN GENERAL DE PROGRAMAS Y TRANSFERENCIA DE CONOCIMIENTO

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DATOS PERSONALES

Apellidos: de la Peña del Rivero Nombre: Marcos DNI: 20159585Q Fecha de nacimiento : 27/09/1972 Sexo: V Nacionalidad: Española

SITUACIÓN PROFESIONAL ACTUAL Organismo: CSIC Facultad, Escuela o Instituto: IBMCP (CPI-UPV) Depto./Secc./Unidad estr.: Departamento de investigación de la biología del estrés Dirección postal: Av. de los Naranjos, s/n

46022 Valencia España

Teléfono (indicar prefijo, número y extensión): 963877861 Fax: 963877859 Correo electrónico: rivero@ibmcp.upv.es Especialización (Códigos UNESCO): 2415.01, 2415.02 Categoría profesional: Titulado superior (Doctor) Fecha de inicio: 01/04/2010 Situación administrativa Plantilla Contratado Interino Becario Otras situaciones especificar: Dedicación A tiempo completo A tiempo parcial

LINEAS DE INVESTIGACIÓN Breve descripción, por medio de palabras claves, de la especialización y líneas de investigación actuales. Virología y Biotecnología de Plantas, RNA, Ribozimas, Biología Estructural.

FORMACIÓN ACADÉMICA Titulación Superior Centro Fecha

Ciencias Químicas Universidad de Valencia 30/06/1995

Obtención del grado de licenciado, modalidad tesina, en el Dep. de Genética, Facultad de Ciencias Biológicas,

Universidad de Valencia, con el título “Determinación de la eficacia biológica de poblaciones experimentales del colifago de RNA MS2”, resultando como nota final SOBRESALIENTE (9-07-1996)

Doctorado Centro Fecha

Ciencias Biológicas Universidad de Valencia 14/12/2001

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ACTIVIDADES ANTERIORES DE CARÁCTER CIENTÍFICO PROFESIONAL

Puesto Centro Organismo (*) Fecha de

inicio Fecha de

finalización

Estudiante Erasmus Gorlaeus Laboratories Universidad de Leiden, Paises Bajos

01/07/1993 15/12/1993

Alumno colaborador Departamento de Genética Molecular

Universidad de Valencia

01/10/1994 30/06/1995

Investigador predoctoral Departamento de Genética Molecular

Universidad de Valencia

01/07/1995 28/02/1997

Investigador predoctoral (MEC)

IBMCP CSIC-UPV 01/03/1997 31/12/2001

Investigador postdoctoral (UPV)

IBMCP CSIC-UPV 01/01/2002 30/06/2002

Investigador postdoctoral (MEC, EMBO, HFSPO)

Grenoble outstation EMBL Grenoble outstation, Francia

01/07/2002 31/03/2005

Investigador RyC (MCyT)

IBMCP CSIC-UPV 01/04/2005 31/08/2005

Investigador posdoctoral (HFSPO)

IBMCP y Grenoble Outstation

CSIC-UPV / EMBL 01/09/2005 31/08/2006

Investigador RyC (MCyT)

IBMCP CSIC-UPV 01/09/2006 31/03/2010

Investigador IBMCP CSIC-UPV 01/04/2010 31/03/2011

(*) Si el Organismo es un centro mixto deberá indicarse tal situación con mención expresa de todos los centros que participan en su gestión.

IDIOMAS (R = REGULAR, B = BIEN, C = CORRECTAMENTE)

Idioma Habla Lee Escribe

Inglés C C C

Francés C C R

Catalán C C C

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PARTICIPACION EN PROYECTOS DE INVESTIGACION TITULO DEL PROYECTO: Análisis molecular de un conjunto de RNAs de tipo viroidal de plantas: estructura, variabilidad de secuencia y complejos de replicación y acumulación. ENTIDAD FINANCIADORA: DGICyT DURACION DESDE: 01/11/1996 HASTA: 01/11/1999 INVESTIGADOR/A PRINCIPAL: Ricardo Flores Pedauyé TITULO DEL PROYECTO: Secuencias en cis y factores del huésped implicados en el ciclo replicativo de los viroides. ENTIDAD FINANCIADORA: DGICyT DURACION DESDE: 01/10/1999 HASTA: 01/10/2001 INVESTIGADOR/A PRINCIPAL: Ricardo Flores Pedauyé TITULO DEL PROYECTO: RNAs viroidales: interacciones con sus huéspedes implicadas en replicación y patogénesis, y desarrollo de herramientas biotecnológicas para su control. ENTIDAD FINANCIADORA: MEyC DURACION DESDE: 01/12/2005 HASTA: 01/12/2008 INVESTIGADOR/A PRINCIPAL: Ricardo Flores Pedauyé TITULO DEL PROYECTO: Desarrollo de nuevas estrategias en la lucha frente a virus y otros patógenos moleculares de plantas por resistencia mediada a traves de RNA. ENTIDAD FINANCIADORA: Generalitat Valenciana DURACION DESDE: 29/03/2006 HASTA: 29/03/2008 INVESTIGADOR/A PRINCIPAL: Marcos de la Peña del Rivero TITULO DEL PROYECTO: RNAs viroidales: interacciones con sus huéspedes implicadas en replicación y patogénesis, y desarrollo de herramientas biotecnológicas para su control. ENTIDAD FINANCIADORA: MEyC DURACION DESDE: 01/12/2008 HASTA: 01/12/2011 INVESTIGADOR/A PRINCIPAL: Ricardo Flores Pedauyé TITULO DEL PROYECTO: El autocorte catalítico del RNA como una actividad biológica universal: a la caza de ribozimas desde bacterias a humanos. ENTIDAD FINANCIADORA: MEyC (EXPLORA) DURACION DESDE: EN EVALUACIÓN HASTA: INVESTIGADOR/A PRINCIPAL: Marcos de la Peña del Rivero TITULO DEL PROYECTO: Self-cleaving RNAs in eukaryotic genomes: new ribozymes, roles and biotechnological applications ENTIDAD FINANCIADORA: ERC (Starting Grants)) DURACION DESDE: EN EVALUACIÓN HASTA: INVESTIGADOR/A PRINCIPAL: Marcos de la Peña del Rivero

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PATENTES Y MODELOS DE UTILIDAD INVENTORES/AS (p.o. de firma): Marcos de la Peña del Rivero, Jesús Angel Sánchez Navarro, Inmaculada García Robles TITULO: Incremento de la expresión de secuencias recombinantes en eucariotas Nº DE SOLICITUD: P0201030569 PAÍS DE PRIORIDAD: FECHA DE PRIORIDAD: ESPAÑA 19/04/2010 ENTIDAD TITULAR: CSIC-UPV-UVEG PAISES A LOS QUE SE HA EXTENDIDO: EMPRESA/S QUE LA ESTÁ/N EXPLOTANDO:

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PUBLICACIONES

Indicar volumen, páginas inicial y final (año) y clave. CLAVE: L= libro completo, CL.= capítulo de libro, A= artículo, R= revisión/”review”, E= editor/a (*) En el caso de aquellas publicaciones que estén en tramitación y aún no hayan sido publicadas, indicar únicamente la situación en la que se encuentra la publicación. (**) Con carácter opcional, se podrán indicar los aspectos que considere más destacados de cada publicación para evaluar su calidad (p.ej. el índice de impacto de la revista, posición de la revista en los listados de los campos correspondientes, citas recibidas u otros indicadores de repercusión).

AUTORES (p.o. de firma): Flores, R., De la Peña, M., Navarro, J. A., Ambrós, S., Navarro, B. TITULO: Molecular Biology of Viroids. REF. REVISTA/LIBRO: Molecular Biology of Plant Viruses (Ed: C.L. Mandahar). Chapter 11, pp. 225-239. Kluwer Academic Publishers, Norwell, MA, USA CLAVE: CL FECHA PUBLICACIÓN (*): 1999 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., Navarro, B., Flores, R. TITULO: Mapping the molecular determinant of pathogenicity in a hammerhead viroid: A tetraloop in the in vivo branched RNA conformation. REF. REVISTA/LIBRO: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, Vol. 96, pp. 9960-9965 FECHA PUBLICACIÓN (*): 1999 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 33. Índice de impacto 10,260 AUTORES (p.o. de firma): Flores, R., Navarro, J. A., De la Peña, M., Navarro, B., Ambrós, S., Vera, A. TITULO: Viroids with hammerhead ribozymes: some unique structural and functional aspects with respect to other members of the group. REF. REVISTA/LIBRO: Biological Chemistry, Vol. 380, pp. 849-854 CLAVE: R FECHA PUBLICACIÓN (*): 1999 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 8. Índice de impacto 3,356 AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., Elena, S.F., Moya, A. TITULO: Effect of deleterious mutation-accumulation in the fitness of RNA bacteriophage MS2. REF. REVISTA/LIBRO: Evolution, Vol. 54, pp. 686-691 CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): 2000 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 32. Índice de impacto 3,632 AUTORES (p.o. de firma): Flores, R., Hernández, C., De la Peña, M, Vera, A., Daròs, J.A. TITULO: Hammerhead Ribozyme Structure and Function in Plant RNA Replication. REF. REVISTA/LIBRO: Methods in Enzymology, Vol. 341, pp. 540-552 CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): 2001 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 21. Índice de impacto 2,340

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AUTORES (p.o. de firma): Elena, S.F., Dopazo, J., De la Peña, M., Flores, R., Diener, T., Moya, A. TITULO: Phylogenetic analysis of viroids and viroid-like satellite RNAs from plants: a reassessment. REF. REVISTA/LIBRO: Journal of Molecular Evolution, Vol. 53, pp. 155-159 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2001 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 12. Índice de impacto 4,011 AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., Flores, R. TITULO: An extra nucleotide in the consensus catalytic core of a viroid hammerhead ribozyme: Implications for a more efficient ribozyme design. REF. REVISTA/LIBRO: Journal of Biological Chemistry, Vol. 276, pp.34586-93 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2001 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 10. Índice de impacto 7,258 AUTORES (p.o. de firma): van Meerten, D., Groeneveld, H., Miller, D.M., Marechal, G.B., Tsareva, N.V., Olsthoorn, R.C., De la Peña, M., van Duin, J. TITULO: In vivo generation of hybrids between different species of RNA phages. REF. REVISTA/LIBRO: Journal of General Virology, Vol. 83, pp. 1223-1235 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2002 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 1. Índice de impacto 3,300 AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., Flores, R. TITULO: Chrysanthemum Chlorotic Mottle Viroid RNA: Dissection of the Pathogenicity determinant and Comparative Fitness of Symptomatic and Non-symptomatic Variants. REF. REVISTA/LIBRO: Journal of Molecular Biology, Vol. 321, pp. 411-421 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2002 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas recibidas: 19. Índice de impacto 5,359 AUTORES (p.o. de firma): Flores, R., De la Peña, Navarro, B. TITULO: Chrysanthemum Chlorotic Mottle Viroid. REF. REVISTA/LIBRO: Viroids (Eds: A. Hadidi, R. Flores, J.W. Randles and J.S. Semancik) pp. 224-227. CSIRO Publishing, Collingwood, Australia CLAVE: CL FECHA PUBLICACIÓN (*): 2003 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**):

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AUTORES (p.o. de firma): Côté, F., De la Peña, M., Flores, R., Perreault, J.P. TITULO: Ribozyme reactions of viroids. REF. REVISTA/LIBRO: Viroids (Eds: A. Hadidi, R. Flores, J.W. Randles and J.S. Semancik) pp. 350-356. CSIRO Publishing, Collingwood, Australia CLAVE: CL FECHA PUBLICACIÓN (*): 2003 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M. TITULO: Relaciones estructura-función en un viroide con ribozimas de cabeza de martillo. REF. REVISTA/LIBRO: Tesis Doctoral. Universitat de València, ISBN: 84-370-5584-9 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2003 CLAVE: L ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Premio Extraordinario de Doctorado por la Universidad de Valencia. AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., Gago, S., Flores, R. TITULO: Peripheral regions of natural hammerhead ribozymes greatly increase their self-cleavage activity REF. REVISTA/LIBRO: EMBO Journal, Vol. 22, pp. 5561-5570 CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): 2003 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 82, entre las que destacan trabajos publicados en Nature, Science, Cell, Plant Cell, PLoS Biology, PNAS, NSMB o diversos Nature Reviews entre otros. Decir que de forma simultánea, un trabajo muy similar al nuestro fue publicado por Khvorova et al. en Nat Struct Mol Biol, con 151 citas hasta la fecha. Índice de impacto 10,456 AUTORES (p.o. de firma): Flores, R., Delgado, S., Gas, M.E., Carbonell, A., Molina, D., Gago, S., De la Peña, M. TITULO: Viroids: the minimal non-coding RNAs with autonomous replication. REF. REVISTA/LIBRO: FEBS Letters, Vol. 567, pp. 42-48 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2004 CLAVE: R ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 36. Índice de impacto 3,843 AUTORES (p.o. de firma): Gago, S.*, De la Peña, M.*, Flores, R. (* igual contribución) TITULO: A kissing-loop interaction in a hammerhead viroid RNA critical for its in vitro folding and in vivo viability. REF. REVISTA: RNA, Vol. 11, pp. 1073-1083 CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): 2005 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 15. Índice de impacto 6,145 AUTORES (p.o. de firma): Carbonell, A., De la Peña, M., Flores, R., Gago S. TITULO: Effects of the trinucleotide preceding the self-cleavage site on eggplant latent viroid hammerheads: differences in co- and post-transcriptional self-cleavage may explain the lack of trinucleotide AUC in most natural hammerheads. REF. REVISTA: Nucleic Acids Research, Vol. 34(19), pp. 5613-5622 CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): 2006 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 4. Índice de impacto 7,552

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AUTORES (p.o. de firma): Flores, R., Navarro, B., Gago, S., De la Peña, M. TITULO: Chrysanthemum Chlorotic Mottle Viroid: a System for Reverse Genetics in the Family Avsunviroidae. REF. REVISTA: Plant Viruses, (ISSN: 1749-6209), Vol. 1(1), pp. 27-32 CLAVE: R FECHA PUBLICACIÓN (*): 2007 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., Kyrieleis, O., Cusack S. TITULO: Structural insights into the mechanism and evolution of the cap methyl-transferase sub-complex of the vaccinia virus. REF. REVISTA: EMBO Journal, Vol. 26(23), pp. 4913-4925 CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): 2007 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 8. Índice de impacto 8,662 AUTORES (p.o. de firma): Flores, R., Carbonell, A., De la Peña, M., Gago S. TITULO: RNAs autocatalíticos: ribozimas de cabeza de martillo REF. REVISTA: Herramientas Biotecnológicas en Fitopatología (Eds. C. Fenoll, J. Marcos, V. Pallás y P. Rodríguez-Palenzuela) ISBN: 978-84-8476-319-2 CLAVE: CL FECHA PUBLICACIÓN (*): 2008 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): AUTORES (p.o. de firma): Dufour, D.*, De la Peña, M.*, Gago, S., Flores, R., Gallego, J. (* igual contribución) TITULO: Structure-function relationships in viroid ribozymes reveal a loop-loop interaction mode conserved in most natural hammerheads. REF. REVISTA: Nucleic Acids Research, Vol. 37(2), pp. 368-381. FECHA PUBLICACIÓN (*): 2009 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 4. Índice de impacto 7,479 AUTORES (p.o. de firma): Wulff, B.B.H., Heese, A., Tomlinson-Buhot, L., Jones, D.A., De la Peña, M., Jones, J.D.G. TITULO: The major specificity-determining amino acids of the tomato Cf-9 disease resistance protein are at hypervariable solvent-exposed positions in the central leucine-rich repeats REF. REVISTA: Molecular Plant-Microbe Interactions, Vol. 22(10), pp. 1203-1213. FECHA PUBLICACIÓN (*): 2009 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 3. Índice de impacto 4,407. Este trabajo, y más concretamente el modelo tridimensional propuesto, fue seleccionado como portada del número de Octubre-2009 de Molecular Plant-Microbe Interactions.

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AUTORES (p.o. de firma): Verhoeven, J.Th.J., Jansen, C.C.C., Roenhorst, J.W., Flores, R., de la Peña, M. TITULO: Pepper chat fruit viroid: biological and molecular properties of a proposed new species of the genus Pospiviroid. REF. REVISTA: Virus Research, Vol. 144(1-2), pp. 209–214. FECHA PUBLICACIÓN (*): 2009 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 1. Índice de impacto 2,429 AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., Dufour, D., Gallego, J. TITULO: Three-way RNA junctions with remote tertiary contacts: A recurrent and highly versatile fold. REF. REVISTA: RNA, Vol. 15(11), pp. 1943-1958. FECHA PUBLICACIÓN (*): 2009 CLAVE: R ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 6. Índice de impacto 5,198 AUTORES (p.o. de firma): Flores, R., Gas, M.E., Molina-Serrano, D., Nohales, M.A., Carbonell, A., Gago, S., De la Peña, M., Daròs, J.A. TITULO: Viroid Replication: Rolling-Circles, Enzymes and Ribozymes. REF. REVISTA: Viruses, Vol. 1(2), pp. 317-334. FECHA PUBLICACIÓN (*): 2009 CLAVE: R ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Número de citas: 2 AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., García-Robles, I. TITULO: Intronic hammerhead ribozymes are ultraconserved in the human genome. REF. REVISTA: EMBO Reports, Vol. 11(9), pp. 711-716 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2010 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Índice de impacto 7,099. Este trabajo constituye la identificación por primera vez de ribozimas hammerhead o de cabeza de martillo en los genomas de organismos amniota (reptiles, aves y mamíferos, incluido humanos) como motivos intrónicos ultraconservados. AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., García-Robles, I. TITULO: Ubiquitous presence of the hammerhead ribozyme motif along the tree of life. REF. REVISTA: RNA, Vol. 16(10), pp. 1943-1950 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2010 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): Índice de impacto 5,198. En este trabajo se describe la presencia ubicua de ribozimas de cabeza de martillo en genomas de bacterias, protistas, plantas y metazoos inferiores, lo que combinado con los resultados encontrados previamente por los mismos autores en vertebrados, nos permite avanzar que estos ribozimas se encontrarían en todos los reinos de la vida.

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AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., Kyrieleis, O., Cusack S. TITULO: Structure of the whole mRNA capping machinery of a DNA virus. REF. REVISTA: CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): En preparación, 2010 ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): AUTORES (p.o. de firma): De la Peña, M., Cusack S. TITULO: A key role for ligands and proteases during crystallization of the vaccinia virus mRNA capping enzyme. REF. REVISTA: Acta Crystallographica, Section D FECHA PUBLICACIÓN (*): En preparación, 2010 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**): AUTORES (p.o. de firma): Sánchez-Navarro, J.A., De la Peña, M. TITULO: Dramatic enhancement of mRNA splicing and gene expression in eukaryotes through intronic self-cleaving ribozymes. REF. REVISTA: FECHA PUBLICACIÓN (*): En preparación, 2010 CLAVE: A ASPECTOS MÁS RELEVANTES (**):

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PUBLICACIONES MÁS RELEVANTES (de las publicaciones incluidas en el apartado anterior, indicar las 5 publicaciones que considere

más relevantes y acompañar de un breve resumen con los objetivos y resultados más destacados de cada una de ellas)

AUTORES (p.o. de firma): De la Peña M., Elena S.F., Moya A. TITULO: Effect of deleterious mutation-accumulation in the fitness of RNA bacteriophage MS2. REF. REVISTA/LIBRO: Evolution, Vol. 54, 686-691 CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): 2000 ASPECTOS MÁS DESTACADOS (máximo 150 palabras): En este trabajo se puso a punto una nueva técnica que permitió cuantificar diferencias de eficacia biológica en poblaciones experimentales del virus de RNA MS2. Gracias a dicha técnica se pudo estudiar el efecto de los cuellos de botella poblacionales en la eficacia biológica de las poblaciones de este virus, que tal y como propone la hipótesis del trinquete de Muller, provocaron un marcado descenso de dicha eficacia debido a la elevada tasa de acumulación de mutaciones deletéreas para este virus. Número de citas: 32, entre los que destacan trabajos publicados en Science, PNAS USA, Nature Reviews Microbiology y varios Nature Reviews Genetics entre otros. Índice de impacto 3,632. AUTORES (p.o. de firma): De la Peña M., Gago S., Flores R. TITULO: Peripheral regions of natural hammerhead ribozymes greatly increase their self-cleavage activity REF. REVISTA/LIBRO: EMBO Journal, Vol. 22, pp. 5561-5570 CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): 2003 ASPECTOS MÁS DESTACADOS (máximo 150 palabras): Con este trabajo, publicado simultáneamente con el de Khvorova et al. (Nat Struct Mol Biol, 2003; 156 citas hasta la fecha) se puso de manifiesto la existencia de interacciones terciarias clave en los ribozimas de cabeza de martillo naturales que les dotan de una actividad catalítica muy superior, especialmente en condiciones fisiológicas. Este descubrimiento permitió explicar posteriormente todas las discrepancias y resultados bioquímicos en el campo al llegar a descubrir el mecanismo catalítico de estos ribozimas, tras más de 25 años de investigaciones. El trabajo ha dado lugar a más de 80 citas durante los últimos años, entre las que destacan trabajos publicados en Nature, Science, Cell, Plant Cell, PLoS Biology, PNAS USA, Nat Struct Mol Biol y varios Nature Reviews entre otros. Índice de impacto 10,456. AUTORES (p.o. de firma): De la Peña M., Kyrieleis O., Cusack S. TITULO: Structural insights into the mechanism and evolution of the cap methyltransferase sub-complex of the vaccinia virus. REF. REVISTA/LIBRO: EMBO Journal, Vol. 26(23), pp. 4913-4925 CLAVE: A FECHA PUBLICACIÓN (*): 2007 ASPECTOS MÁS DESTACADOS (máximo 150 palabras): En este trabajo se resolvió la estructura cristalográfica del dominio proteico responsable de la metilación del cap de los mRNAs en el virus modelo vaccinia. Dicho dominio es un subcomplejo dentro del enzima responsable del “capping” en el virus de DNA vaccinia que es el enzima tipo sobre el que más estudios bioquímicos y moleculares se han realizado. La estructura obtenida, combinada con experimentos de mutagénesis dirigida y ensayos bioquímicos, mostró un papel catalítico clave de residuos del extremo N-terminal de la metilasa que permanecen conservados en todas las metilasas del cap de mRNAs eucarióticos. También se encontró que el enzima viral une el sustrato de la metilación (SAM) en una conformación única dentro de este tipo de enzimas, lo que permitirá utilizar dicho sitio de unión como diana para el diseño de fármacos específicos contra poxvirus humanos o animales. Número de citas: 8. Índice de impacto 8,662. AUTORES (p.o. de firma): De la Peña M., García-Robles I. TITULO: Intronic hammerhead ribozymes are ultraconserved in the human genome REF. REVISTA/LIBRO: EMBO Reports, Vol. 11(9), pp. 711-716 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2010 CLAVE: A ASPECTOS MÁS DESTACADOS (máximo 150 palabras): Este trabajo constituye la identificación por primera vez hasta la fecha de ribozimas hammerhead o de cabeza de martillo en los genomas de organismos amniota (reptiles, aves y mamíferos, incluido el ser humano) como motivos intrónicos ultraconservados en genes tales como un supresor tumoral (RECK), un antígeno tumoral (C10orf118) o la beta-distrobrevina neuronal. La importancia del descubrimiento no sólo radica en confirmar que este sencillo ribozima ampliamente estudiado como RNA modelo existiría en el genoma de organismos tan complejos como el hombre, sino también en adelantar que dichos motivos de RNA estarían implicados en la biogénesis de los mRNAs que los contienen. De hecho, la utilización de dichos ribozimas en intrones de plantas ha permitido diseñar una aplicación biotecnológica que ha sido posteriormente patentada. Índice de impacto 7,099.

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AUTORES (p.o. de firma): De la Peña M., García-Robles, I. TITULO: Ubiquitous presence of the hammerhead ribozyme motif along the tree of life. REF. REVISTA: RNA, Vol. 16(10), pp. 1943-1950 FECHA PUBLICACIÓN (*): 2010 CLAVE: A ASPECTOS MÁS DESTACADOS (máximo 150 palabras): En este trabajo se describe la presencia ubicua de ribozimas de cabeza de martillo, tanto en genomas de procariotas como de eucariotas (protistas, plantas y metazoos). Estos resultados combinados con los encontrados previamente por los mismos autores en vertebrados (EMBO Rep, 2010) permiten avanzar que los ribozimas de cabeza de martillo se encontrarían en todos los reinos de la vida y fundamentalmente involucrados en fenómenos de retrotransposición. Resultados similares descritos simultáneamente para la ribozima del agente Hepatitis-delta (Webb et al., Science 2009) permiten concluir que los pequeños ribozimas de autocorte pasarían de ser considerados como simples rarezas a constituir una actividad universal en la biosfera que deberá ser estudiada con detalle en el futuro. Índice de impacto 5,198

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ESTANCIAS EN CENTROS EXTRANJEROS DE RECONOCIDO PRESTIGIO INTERNACIONAL

CLAVE: D=doctorado, P=postdoctoral. Y= invitado/a, C=contratado/a, O=otras (especificar) CENTRO: Laboratorios Gorlaeus. Universidad de Leiden. LOCALIDAD: Leiden PAIS: Países Bajos AÑO: 1993 DURACIÓN: 6 meses TEMA: A study of the relationship between the MS2 RNA 5’ domain and the regulation of the A protein gene translation INVESTIGADOR PRINCIPAL: Drs. J. van Duin y H. Groeneveld CLAVE: O (Beca Erasmus) CENTRO: Protein-RNA group. EMBL Grenoble Outstation LOCALIDAD: Grenoble PAIS: Francia AÑO: 2002-2005 DURACIÓN: 36 meses TEMA: Structural studies of the mechanism and regulation of RNA capping and decapping factors INVESTIGADOR PRINCIPAL: Dr. S. Cusack CLAVE: P

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TESINAS Y TESIS DOCTORALES DIRIGIDAS

TITULO: Degradación in vitro de un viroide nucleolar mediada por una ribozima de cabeza de martillo incluida en un pequeño RNA nucleolar que actúa como vector de transporte al nucleolo. AUTOR/A: Proyecto fin de carrera de Alberto Carbonell Olivares DIRECTOR/ES: Drs. Ricardo Flores Pedauyé y Marcos de la Peña del Rivero UNIVERSIDAD: Universidad Politécnica de Valencia FACULTAD/ESCUELA: Escuela Técnica Superior de Ingenieros Agrónomos. AÑO: 2001 CALIFICACION: Matrícula de Honor

TITULO: Propiedades autocatalíticas de las ribozimas de cabeza de martillo del viroide del manchado solar del aguacate (ASBVd). AUTOR/A: Proyecto fin de carrera de Marina García Beyaert DIRECTOR/ES: Drs. Marcos de la Peña del Rivero y Ricardo Flores Pedauyé UNIVERSIDAD: Universidad Politécnica de Valencia FACULTAD/ESCUELA: Escuela Técnica Superior de Ingenieros Agrónomos. AÑO: 2009 CALIFICACION: Matrícula de Honor

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CONGRESOS AUTORES/AS: De la Peña, M., Navarro, B., Flores, R. TITULO: Identificación de determinantes de patogenicidad en el viroide del moteado clorótico del crisantemo. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral CONGRESO: IX Congreso de la Sociedad Española de Fitopatología LUGAR DE CELEBRACIÓN: Salamanca, España. AÑO: 1998 AUTORES/AS: Flores, R., Ambrós, S., Hernández, C., Navarro, J.A., De la Peña, M., Navarro, B. TITULO: Propiedades de la familia de viroides con ribozimas de cabeza de martillo. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral CONGRESO: XXI Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Sevilla, España. AÑO: 1998 AUTORES/AS: De la Peña, M., Navarro, B., Flores, R. TITULO: The pathogenicity determinant of chrysanthemum chlorotic mottle viroid maps at a tetraloop. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster CONGRESO: XI International Congress of Virology. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Sydney, Australia. AÑO: 1999 AUTORES/AS: De la Peña, M., Flores, R. TITULO: Análisis por mutagénesis dirigida del determinante de patogenicidad del viroide del moteado clorótico del crisantemo. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral. CONGRESO: X Congreso de la SEF. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Valencia, España. AÑO: 2000 AUTORES/AS: De la Peña, M., Flores, R. TITULO: Un nucleótido extra en la ribozima de cabeza de martillo. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral. CONGRESO: XXV Congreso de la SEBBM. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Valencia, España. AÑO: 2001

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AUTORES/AS: Carbonell, A., De la Peña, M., Flores, R. TITULO: Degradación in vitro de un viroide nucleolar mediada por una ribozima de cabeza de martillo incluida en un pequeño RNA nucleolar que actúa como vector de transporte al nucleolo. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster. CONGRESO: VII Congreso de la SEV. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Valencia, España. AÑO: 2001 AUTORES/AS: De la Peña, M., Flores, R. TITULO: Chrysanthemum chlorotic mottle viroid: Dissection of the pathogenicity determinant, comparative fitness of symptomatic and non-symptomatic variants, and characterization of a kissing-loop interaction in the in vivo RNA conformation. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster. CONGRESO: XIV International Congress of Virology. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Paris, Francia. AÑO: 2002 AUTORES/AS: Gago, S., De la Peña, M., Flores, R. TITULO: Un pseudonudo en la estructura de un RNA viroidal es crítico para su infectividad: evidencias in vivo. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral. CONGRESO: VII Congreso Nacional de Virología. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Barcelona, España. AÑO: 2003 AUTORES/AS: Gago, S., De la Peña, M., Flores, R. TITULO: Las ribozimas de cabeza de martillo naturales han sido moldeadas por la evolución para actuar en cis con actividad catalítica superior a la de sus derivados en trans. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral. CONGRESO: Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. LUGAR DE CELEBRACIÓN: La Coruña, España. AÑO: 2003 AUTORES/AS: De la Peña, M., Seraphin, B., Cusack, S. TITULO: Structural basis for 5' mRNA modifying enzymes: capping and decapping factors in human cells. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster. CONGRESO: IV HFSP Awardees Meeting. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Hakone, Japón. AÑO: 2004

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AUTORES/AS: Flores R., De la Peña, M., Gago, S., Delgado, S., Gas, ME, Carbonell, A., Martínez de Alba, E., Hernández, C., Daròs, J.A. TITULO: Viroid replication. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Comunicación oral. CONGRESO: Second European Congress of Virology Euro Virology 2004 LUGAR DE CELEBRACIÓN: Madrid, España. AÑO: 2004 AUTORES/AS: De la Peña, M., Cusack, S. TITULO: Structural basis of the mRNA capping machinery fom Vaccinia virus TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster. CONGRESO: V HFSP Awardees Meeting. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Bethesda, MD, USA. AÑO: 2005 AUTORES/AS: Gago, S., De la Peña, M., Flores, R. TITULO: A kissing-loop interaction in Chrysanthemum chlorotic motle viroid critical for its in vitro folding and in vivo viability. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster. CONGRESO: XIII International Congress of Virology LUGAR DE CELEBRACIÓN: San Francisco, CA USA. AÑO: 2005 AUTORES/AS: De la Peña, M., Cusack, S. TITULO: Crystal structure of the mRNA cap 7-N-methyltransferase from vaccinia virus TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster. CONGRESO: VI HFSP Awardees Meeting. LUGAR DE CELEBRACIÓN: Paris, France. AÑO: 2006 AUTORES/AS: De la Peña, M., Cusack, S. TITULO: Crystal structure of the Guanine N7-methyltransferase sub-complex from vaccinia virus mRNA capping enzyme. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Oral. CONGRESO: 11th RNA society meeting LUGAR DE CELEBRACIÓN: Seattle, WA, USA. AÑO: 2006

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AUTORES/AS: Carbonell, A., De la Peña, M., Flores, R. y Gago, S. TITULO: Differences in co- and post-transcriptional self-cleavage may explain the lack of trinucleotide AUC preceding the self-cleavage site in most natural hammerheads TIPO DE PARTICIPACIÓN: Oral. CONGRESO: VI RANN (Reunión sobre Ácidos Nucleicos y Nucleótidos) LUGAR DE CELEBRACIÓN: Valencia, España. AÑO: 2007 AUTORES/AS: Verhoeven, J.Th.J., Jansen, C.C.C., Roenhorst, J.W., Flores, R., de la Peña, M. TITULO: Pepper chat fruit viroid: biological and molecular properties of a proposed new species of the genus Pospiviroid TIPO DE PARTICIPACIÓN: Oral. CONGRESO: International Symposium 2008: Viroids and Viroid-Like RNAs LUGAR DE CELEBRACIÓN: Berlín, Alemania. AÑO: 2008 AUTORES/AS: Dufour, D., de la Peña, M., Gago, S., Flores, R., Gallego J. TITULO: Structural and Biochemical Dissection of the Atypical Hammerhead Ribozymes of Chrysanthemum Chlorotic Mottle Viroid TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster. CONGRESO: 13th RNA society meeting LUGAR DE CELEBRACIÓN: Berlín, Alemania. AÑO: 2008 AUTORES/AS: Verhoeven, J.Th.J., Jansen, C.C.C., Roenhorst, J.W., Flores, R., de la Peña, M. TITULO: Pepper chat fruit viroid: propiedades biológicas y moleculares de una nueva especie viroidal TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster. CONGRESO: X Congreso Nacional de Virología LUGAR DE CELEBRACIÓN: Salamanca, España. AÑO: 2009 AUTORES/AS: Dufour, D., de la Peña, M., Gago, S., Flores, R., Gallego J. TITULO: A loop-loop RNA tertiary interaction motif shared by most natural hammerhead ribozymes TIPO DE PARTICIPACIÓN: Oral CONGRESO: VII RANN (Reunión sobre Ácidos Nucleicos y Nucleótidos) LUGAR DE CELEBRACIÓN: Jaca, Huesca. AÑO: 2009

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AUTORES/AS: de la Peña, M. TITULO: Ubiquitous Presence of the Hammerhead Ribozyme Motif along the Tree of Life: From Bacterial Genomes to Human Antioncogenes. TIPO DE PARTICIPACIÓN: Poster (invitado por la RNA society). CONGRESO: 15th RNA society meeting LUGAR DE CELEBRACIÓN: Seattle, WA, USA. AÑO: 2010

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INVESTIGADORES DE REFERENCIA (Se podrán aportar hasta 3 nombres de investigadores que puedan dar referencias del solicitante.

Este apartado no es de obligado cumplimiento para el solicitante) APELLIDOS, NOMBRE: Cusack, Stephen RELACIÓN PROFESIONAL CON EL SOLICITANTE: Director de investigación durante la etapa posdoctoral (Profesor-tutor, Director de investigación, Empleador-jefe, Colaborador, Otros) DURACIÓN DE LA RELACIÓN (indicar fechas): 07/2002-07/2005 ORGANISMO AL QUE PERTENECE EN LA ACTUALIDAD: EMBL-Grenoble Outstation, Francia (Institución y país) CARGO: Director del EMBL-Grenoble Outstation y Jefe del Grupo de Biología Estructural de Complejos Proteína-RNA y Proteínas Virales TELÉFONO: +33 476207238 CORREO ELECTRÓNICO: cusack@embl.fr

APELLIDOS, NOMBRE: Flores Pedauyé, Ricardo RELACIÓN PROFESIONAL CON EL SOLICITANTE: Director de Tesis Doctoral/Ramón y Cajal (Profesor-tutor, Director de investigación, Empleador-jefe, Colaborador, Otros) DURACIÓN DE LA RELACIÓN (indicar fechas): 01/1997-12/2001, 04/2005-03/2009 ORGANISMO AL QUE PERTENECE EN LA ACTUALIDAD: IBMCP-CSIC, España (Institución y país) CARGO: Profesor de Investigación del CSIC TELÉFONO: +34 963877861 CORREO ELECTRÓNICO: rflores@ibmcp.upv.es

APELLIDOS, NOMBRE: Moya Simarro, Andrés RELACIÓN PROFESIONAL CON EL SOLICITANTE: Director de Tesina de licenciatura (Profesor-tutor, Director de investigación, Empleador-jefe, Colaborador, Otros) DURACIÓN DE LA RELACIÓN (indicar fechas): 06/1995-07/1996 ORGANISMO AL QUE PERTENECE EN LA ACTUALIDAD: Departamento de Genética de la Universidad de .Valencia, España (Institución y país) CARGO: Catedrático de la Universidad TELÉFONO:+34 963543480 CORREO ELECTRÓNICO: andres.moya@uv.es

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OTROS MÉRITOS O ACLARACIONES QUE SE DESEE HACER CONSTAR

(utilice únicamente el espacio de una página DIN A4)

DATOS SOBRE BECAS Y CONTRATOS DE INVESTIGACIÓN OBTENIDOS: ORGANISMO FECHAS PAÍS PROGRAMA

Universidad de Valencia 1-VII a 1-XII de 1993 Paises Bajos Erasmus

Bancaixa (Obra social) 1-VII a 1-XII de 1993 Paises Bajos Bancaixa-Erasmus

M.E.C. 1997 a 2000 España Beca de doctorado

U.I.M.P 13-X-1998 a 16-X-1998 España Curso UIMP

M.C.y T. 1-VII a 31-XII de 2002 Francia Beca de especialización

E.M.B.O. 1-I a 31-III de 2003 Francia Beca Posdoctoral

H.F.S.P.O. 1-IV-2003 a 1-IV-2005 Francia Beca Posdoctoral

H.F.S.P.O. 1-IX-2005 a 31-VIII-2006 Esp/Fra Beca Posdoctoral

M.E.C. 2005 a 2010 España Contrato Ramón y Cajal

CURSOS DE ESPECIALIZACIÓN RECIBIDOS

- Curso APLICACIONES CLÍNICAS E INDUSTRIALES DE LA BIOTECNOLOGÍA. Dirigido por el Dr. Carlos Gómez-Moreno Calera. Universidad de Verano de Teruel (1994).

- Cursos de doctorado en el Departamento de Genética de la Universidad de Valencia, 1994-95, 1995-96 (33 créditos).

- Curso BIOLOGÍA MOLECULAR DEL SISTEMA NERVIOSO. Dirigido por los Drs. Mariano Barbacid e Inmaculada Silos, UIMP de Santander (1995).

- Curso JORNADAS SOBRE PATENTES DE BIOTECNOLOGÍA Y PRODUCTOS QUÍMICOS Y FARMACÉUTICOS. OTRI, Universidad de Valencia (1995).

- Curso EMBL LECTURE COURSE ON MOLECULAR BIOLOGY. Dirigido por los Drs. Cayetano González y Gareth Griffiths, EMBL. Jávea, Alicante (1996).

- Curso de Aptitud Pedagógica (CAP), Universidad de Valencia (1997)

- Curso SOBRE LA EVOLUCIÓN: DE DARWIN A LOS ÚLTIMOS AVANCES DE LA GENÉTICA. Impartido por el Dr. Francisco Ayala, UIMP de Valencia (1998)

- Curso EL ORIGEN DE LA VIDA, ¿EN LA TIERRA Y EN OTROS PLANETAS?. Dirigido por los Drs. Lynn Margulis y Juli Peretó, UIMP de Valencia (1998).

- Conferencias MOLECULAR BIOLOGY OF RNA: STRUCTURE AND FUNCTION OF RNAs AND RNPs organizadas por los Drs. Iain Mattaj y Kiyoshi Nagai, ESF-Euresco, Granada (2001)

- Curso BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY organizado por los Drs. Roderic Guigó y Alfonso Valencia, FundaciÓn BBVA, Madrid (2002)