Embed Size (px)
Citation preview
Volume 5, Numéro 3 1
DEPARTEMENT DE BIOCHIMIE, DE MICROBIOLOGIE ET DE BIO-INFORMATIQUE - OCTOBRE 2019 -
TABLE DES MATIERES
Mot du directeur 2
Les gros dossiers! 2
Chronique de la bibliothécaire 4
Nouvelles du mois 5
Le rayonnement des membres du département au cours des dernières semaines 6
Les événements à venir pour le département et ses membres 7
Articles publiés par les différentes équipes de recherche du département 8
Manon Couture, future directrice du département
Volume 5, Numéro 3 2
MOT DU DIRECTEUR
LES GROS DOSSIERS!
La première directrice du département Pour la première fois de toute l’histoire du Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, une femme occupera le poste de directrice de celui-ci. Manon Couture, spécialiste en l’enzymologie et professeure titulaire au département, prendra le relais de Steve Charette dont le mandat se terminera le 22 novembre prochain. La nomination de Manon a été confirmée lors de la séance du 25 septembre dernier du conseil d’administration de l’Université Laval. Steve et Manon travaillent ensemble afin d’assurer une transition efficace. Bravo Manon pour cette nomination importante et très symbolique! En rappel, voici le profil de chercheure de Manon publié en 2016 dans l’infolettre : Tout d’abord voici quelques mots pour me présenter. Je suis professeure au département BCM-MCB-BIF depuis l’été 2001. J’ai fait mes études de baccalauréat en microbiologie ici à l’université Laval. Je me suis ensuite spécialisée en biochimie des protéines et en biophysique pendant mes études graduées au sein même du département, sous la direction du professeur Michel Guertin, ainsi qu’au post-doctorat, que j’ai réalisé à New York au Albert Einstein College of Medicine dans le département de Physiologie et de Biophysique avec le professeur Denis Rousseau. Mon laboratoire de recherche est situé à l’IBIS (Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes localisé au pavillon Charles-Eugène-Marchand) et est affilié à PROTEO (le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines).
Volume 5, Numéro 3 3
Le programme de recherche que je dirige vise à comprendre le fonctionnement et la régulation de métallo-enzymes impliquées dans des processus liés au pouvoir pathogène des bactéries, notamment les oxyde nitrique synthases, les cytochromes P450 et les oxygénases de l’hème. Au fil des ans, nos études structure-fonction des oxyde nitrique synthases ont permis de mieux comprendre comment la synthèse de l’oxyde nitrique (NO) s’effectue, le rôle du NO par rapport aux stress oxydatif et d’investiguer l’importance du NO pour la résistance bactérienne envers divers antibiotiques. Plus récemment, nous nous sommes intéressés au métabolisme du fer chez les bactéries pathogènes, plus particulièrement aux protéines impliquées dans l’importation ainsi que le métabolisme de l’hème comme source de fer pour la croissance (figure ci-dessous). Afin de comprendre les mécanismes réactionnels de ces métallo-enzymes, nous utilisons des méthodes spectroscopiques (optique et Raman) pour investiguer le site actif à l’état stationnaire et en condition cinétique. Dans ce dernier cas, la caractérisation d’intermédiaires réactionnels est faite sur l’échelle de temps de la nanoseconde à la seconde à l’aide d’appareils de type "stopped-flow" et de photolyse laser. Pour les projets actuels et futurs de mon laboratoire, je suis allée acquérir récemment une expertise en microfluidique pendant mon année d’étude et de recherche. Cette technologie permet de créer des puces ayant des canaux et d’autres structures à l’échelle du micron (Figure ci-contre). Ces puces seront utilisées pour investiguer et modifier le métabolisme secondaire chez des bactéries produisant des composés naturels, en utilisant de grandes banques d’enzymes modifiées par exemple. Les travaux que je dirige sont multidisciplinaires de par leur nature et mon laboratoire collabore régulièrement avec des chercheurs d’ici et d’un peu partout dans le monde. Il me fait toujours plaisir de partager nos expertises en études cinétiques, en spectroscopie Raman et maintenant, en microfluidique également. Que vous soyez étudiants gradués ou chercheurs, si notre expertise ou nos équipements peuvent être utiles pour vos travaux de recherche, je vous invite bien simplement à en discuter avec moi.
Volume 5, Numéro 3 4
Prix du Québec pour Sylvain Moineau Le 11 octobre dernier, le gouvernement du Québec a annoncé les lauréats pour les Prix du Québec 2019. Sylvain Moineau fait partie de la liste des récipiendaires de cette année. Le 6 novembre prochain, il se verra remettre le Prix Marie-Victorin du gouvernement du Québec. Le prix Marie-Victorin est décerné depuis 1977 à une personne qui a mené une carrière remarquable en recherche dans le domaine des sciences naturelles et du génie, mais dont les travaux ne relèvent pas du domaine biomédical. Les disciplines reconnues pour ce prix sont les sciences exactes et naturelles, les sciences de l’ingénierie et technologiques ainsi que les sciences agricoles. Il s’agit donc d’une nouvelle récompense nettement méritée de la part de Sylvain dont les travaux de recherche sont à la base d’une révolution à plusieurs niveaux, mais plus particulièrement pour l’édition de génome qui peut avoir des applications dans de nombreuses sphères des sciences biologiques et de la médecine. Félicitations à Sylvain pour cette récompense très prestigieuse!
CHRONIQUE DE LA BIBLIOTHECAIRE Bienvenus à tous pour cette nouvelle année scolaire 2019-2020. Je suis votre spécialiste en ressources documentaires, Anne-Marie Duchesneau, disponible pour vous aider dans tous vos travaux universitaires ainsi que pour vos projets de longue haleine. Vous éprouvez des difficultés à trouver des documents de qualité et de niveau universitaire pour vos travaux évalués? Vous vous sentez perdus devant l’offre incroyable que vous propose la Bibliothèque (environ 2,5 millions de documents physiques et électroniques)? Nos 900 bases de données vous donnent le tournis? Vous devez produire une recension des écrits et souhaitez développer une stratégie de recherche efficace? Vous prévoyez publier votre premier article scientifique et ne savez pas par où commencer? Ne cherchez plus! Votre bibliothécaire-conseil arrive à la rescousse! En plus des services courants (prêts-retours, réserve des professeurs, collections spéciales, etc.) rappelez-vous que la Bibliothèque est le point de départ par excellence pour votre réussite académique et professionnelle! Alors n’hésitez pas à solliciter le soutien de toute l’équipe en personne, par courriel, par téléphone ou par chatt. C’est un rendez-vous!
Volume 5, Numéro 3 5
NOUVELLES DU MOIS
Cabaret ad Lab
Le 17 septembre dernier, sept étudiants du département ont relevé le défi de ce concours extrême de vulgarisation scientifique. Ce fut une édition très amusante et enrichissante qui s’est tenue devant la plus grosse foule pour une soirée de Cabaret. Pour ceux ou celles qui n’ont pas eu la possibilité d’assister au Cabaret et qui souhaiteraient voir les présentations, il est possible de les visionner via les liens ci-dessous :
Maria Lebeuf : présentation de l’événement
Anthony Bilodeau (Flavie Lavoie-Cardinal, CERVO) : L’intelligence artificielle appliquée
aux neurosciences
Rachel Morin-Pelchat (Sylvain Moineau, GREB) : Interactions phage-bactérie 101
Stéphanie Nollet (Sylvain Moineau, GREB) : Bob le phage bricoleur
Pierre-Étienne Marcoux (Steve Charette, IBIS) : Vers un auto-vaccin atténué efficace pour
prévenir la furonculose chez les salmonidés (Willie Vaccine 2000)
Carla Bautista Rodriguez (Christian Landry, IBIS) : L’hybridation comme moteur adaptatif
en conditions de stress?
Andréanne Deschênes (Flavie Lavoie-Cardinal, CERVO) : Petit neurone deviendra grand
Florian Echelard : présentation du groupe étudiant IGEM qui participe à la compétition
internationale de biologie synthétique
Le mot de passe pour avoir accès aux séquences vidéo est cabaret2019. Soyez indulgent avec la
qualité de l’enregistrement. Dans certains cas, il a fallu choisir entre voir l’écran ou le présentateur! Félicitations à nos gagnants : Pierre-Étienne et ses histoires de poissons (1er prix) et Rachel pour le cours sur les phages (2e prix). Merci à Moïra, Philippe, Alicia, Maria et François pour l'organisation de la soirée! À l'an prochain!
Volume 5, Numéro 3 6
IGEM Les membres de l'Équipe iGEM s’apprêtent à quitter pour leur voyage à Boston qui se tiendra du 31 octobre au 4 novembre prochain. Ils seront 12 étudiants accompagnés par Hélène Deveau à y aller pour représenter l’Université. De plus, leur campagne de financement est toujours en cours. Du chocolat est aussi vendu au département (VCH-3261) au coût de 3 $ pour le financement de leur voyage. Merci pour votre soutien!
LE RAYONNEMENT DES MEMBRES DU DEPARTEMENT AU COURS DES DERNIERES
SEMAINES
Un c’est bien, deux c’est parfois mieux Pour paraphraser le titre de l'article publié par le Fil de l’Université Laval, un c'est super, deux c'est fantastique! Deux articles viennent de paraître dans Nature Communications présentant le travail de deux équipes du département. D'un côté l'étude de Claude Lemieux, Monique Turmel et collaborateurs et de l'autre de Christian Landry avec des membres de son équipe. En plus de ce doublé, il s'avère que les deux articles abordent un élément commun: la duplication de génome chez une algue dans un cas et dans la levure dans l'autre cas. Félicitations pour ce magnifique succès!
Journée de la Recherche 2019 organisée par l’AEGSEG
Félicitations aux étudiants du département qui se sont démarqués lors de la Journée de la Recherche 2019 organisée par l'Association des étudiants gradués en sciences et génie de l’Université Laval (AEGSEG) le 4 octobre dernier.
1er cycle : affiche : o 2e place : Stéphanie Nollet o 3e place : Christina Boudreau
2e cycle : affiche :
o 2e place : Marika Drouin o Prix coup de cœur : Pamela Morrissette
Volume 5, Numéro 3 7
LES EVENEMENTS A VENIR POUR LE DEPARTEMENT ET SES MEMBRES Séminaires du département – 28 et 29 octobre Comme chaque session d’automne et d’hiver, les 28 et 29 octobre prochains auront lieu les séminaires du département. Vous êtes tous invités à assister aux présentations faites par des étudiants gradués qui sont dans le dernier droit de leur programme de formation. C’est une magnifique opportunité pour eux d’exercer leurs talents de présentateur et pour ceux qui y assistent d’apprécier la recherche qui se fait au département. L’activité aura lieu au local VCH-2830 selon l’horaire ci-dessous.
Volume 5, Numéro 3 8
Bienvenue à tous! Activité de recrutement du département – 12 novembre
Encore cette année, l’ACEBMUL organisera en collaboration avec la direction du département l’activité de recrutement pour les stages et projets de recherche de l’été 2020. Oui, on parle déjà de l’été prochain! Il s’agit de L’ÉVÉNEMENT pour trouver son stage, son projet de recherche ou sa maîtrise avec un des professeurs du département ou avec les professeurs qui y sont associés. Vous êtes tous invités à cet événement qui aura lieu le mardi 12 novembre de 16 h 30 à 20 h 30. Il y aura de la science sous la forme de présentations orales et par affiche par les équipes de recherche recherchant des stagiaires et des étudiants gradués ainsi que de la bouffe et de la bière gratuite! Tous les détails vous seront transmis via Facebook et par courriel dans les jours à venir.
ARTICLES PUBLIES PAR LES DIFFERENTES EQUIPES DE RECHERCHE DU
DEPARTEMENT Voici la liste des articles publiés par les professeurs réguliers et associés au département pour la période allant du 1er au 30 septembre 2019. Si une de vos publications n’apparaît pas dans la liste ci-dessous, merci de nous le signaler et nous la présenterons dans la prochaine publication de l’Infolettre. 1: Dandage R, Landry CR. Paralog dependency indirectly affects the robustness of human cells. Mol Syst Biol. 2019 Sep;15(9):e8871. 2: Labrie SJ, Mosterd C, Loignon S, Dupuis MÈ, Desjardins P, Rousseau GM, Tremblay DM, Romero DA, Horvath P, Fremaux C, Moineau S. A mutation in the methionine aminopeptidase gene provides phage resistance in Streptococcus thermophilus. Sci Rep. 2019 Sep 25;9(1):13816. 3: Fong K, Tremblay DM, Delaquis P, Goodridge L, Levesque RC, Moineau S, Suttle CA, Wang S. Diversity and Host Specificity Revealed by Biological Characterization and Whole Genome Sequencing of Bacteriophages Infecting Salmonella enterica. Viruses. 2019 Sep 14;11(9). pii: E854.
Volume 5, Numéro 3 9
4: Charron G, Marsit S, Hénault M, Martin H, Landry CR. Spontaneous whole-genome duplication restores fertility in interspecific hybrids. Nat Commun. 2019 Sep 11;10(1):4126. 5: Lemieux C, Turmel M, Otis C, Pombert JF. A streamlined and predominantly diploid genome in the tiny marine green alga Chloropicon primus. Nat Commun. 2019 Sep 6;10(1):4061. 6: Andersson MN, Keeling CI, Mitchell RF. Genomic content of chemosensory genes correlates with host range in wood-boring beetles (Dendroctonus ponderosae, Agrilus planipennis, and Anoplophora glabripennis). BMC Genomics. 2019 Sep 2;20(1):690. 7: Wang Y, Liu B, Grenier D, Yi L. Regulatory Mechanisms of the LuxS/AI-2 System and Bacterial Resistance. Antimicrob Agents Chemother. 2019 Sep 23;63(10). pii: e01186-19. 8: Vogeleer P, Vincent AT, Chekabab SM, Charette SJ, Novikov A, Caroff M, Beaudry F, Jacques M, Harel J. Regulation of waaH by PhoB during P(i) Starvation Promotes Biofilm Formation by Escherichia coli O157:H7. J Bacteriol. 2019 Aug 22;201(18). pii: e00093-19.
