Definisi Biokimia, Sel dan fungsi organel

Muhammad Fakhri, S.Pi, MP, M.Sc

Tim Pengajar Biokimia

Budidaya Perairan

FPIK UB

BIOKIMIA ????

• BIOKIMIA: suatu ilmu yang mempelajari ten-tang kumpulan molekul/senyawa pada jasad hidup yang saling berinteraksi untuk menam-pakkan ciri hidup.

• CIRI HIDUP :1. Sangat terorganisir, kompleks, tiap-tiap komponen

berfungsi spesifik

2. Mampu mengekstrak energi dari lingkungan sekelilingnya

3. Mampu mereplikasi diri dengan tepat dan terencana.

1. Organisasi Molekuler Sel Hidup

SENYAWA DASAR

CO2, H2O, N2, PO4, Na dll

Satuan

Penyusun

Ikatan

Kovalen

Asam

Amino

Gula

Sederhana

As.Lemak/

Gliserol

Mono-

Nukleotida

Asam

NukleatPolisakarida Lipida

Makro-

molekulProtein

SUPRAMOLEKUL

JASAD HIDUP

ORGAN

SEL

ORGANEL

Ikatan

Kovalen

SENYAWA ANTARA

Ikatan

Non- kovalen

RUANG LINGKUP

BIOKIMIA AKUAKULTUR

• AQUACULTURE PRODUCTION

• CAUSE OF VARIATION GROWTH:– FISH:

• Species

• Sexes

• Health

• History (age, weight, body composition)

– ENVIRONMENT• Husbandry

– Stocking density

– Handling

– Feeding Methods

• Water quality– Temperature

– Oxygen

– Metabolites

– FEED• Feed Composition

• Feed Formulation (ingredients)

• Feeding Level

• Feed Type (physical aspect)

GROWTH

StressFasility system, Fertlizer

Digestives enzym

Peran biokimia dalam akuakultur

Pengetahuan tentang ilmu biokimia dapat diaplikasikan dalam memahami pertumbuhan, perkembangan, dan reproduksi ikan atau hewan akuatik lainnya.

Pertumbuhan, perkembangan, dan reproduksi ikan atau hewan akuatik lainnya sangat ditentukan oleh adanya keseimbangan asupan nutrisi pakan dan kebutuhan metabolisme tubuh.

Asupan nutrisi pakan yg kurang berdampak pada tidak terpenuhinya kebutuhan metabolisme tubuh, sebaliknya asupan nutrisi pakan yg berlebih menyebabkan ketersedian nutrien melebihi kebutuhan metabolisme sehingga tidak efisien.

Sel ????

• Kumpulan materi paling sederhana yang dapat hidup dan merupakan unit penyusun semua makhluk hidup

• Organisme hidup yang paling kecil adalah sel tunggal,

• Sel adalah unit fungsional dari organisme multiselular

Jaringan ????

sekumpulan sel yang memiliki bentuk dan fungsi yang sama

Perbedaan sel tumbuhan, hewan dan bakteri

Source: http://www.biologi-sel.com

Struktur Sel Hewan

(www.uvm.edu, 2011)

Struktur Sel Tumbuhan

(www.micro.magnet.fsu.edu, 2011)

Bagian-bagian sel dan fungsi

Membran sel

• Sistem membran berbentuk kantong pipih yg bertumpuk

• Konstruksi : protein – lipid • Fungsi: mengatur transportasi

zat dari dan ke dalam sel, memisahkan bagian dalam sel dari lingkungan ekstraselular & membatasi kompartemen internal yg terdiri dari inti sel dan organel-organel sitoplasmik

• Zat-zat yang bisa melalui membran: air, oksigen, CO2, asam nukleat, dan vitamin

Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)

Sitoplasma

• Bagian sel yang terbungkus membran sel(bagian non-nukleus)

• Pada sitoplasma terdapat sitoskeleton, berbagai organel dan sitosol.

Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)

Inti sel

• tempat terjadinya replikasi senyawa genetik (DNA).

• tempat sintesa NAD (nicotinamide adenin dinucleotide).

• terdapat enzim yang akan mengkatabolisasi glikogen menjadi glukosa, membentuk piruvat dan senyawa-senyawa lainnya.

Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)

Cytosol atau plasma sel

• larutan media yang terletak di dalam sel di antara organel-organel.

• merupakan gudang karbohidrat, yaitu glikogen pada hewan dan pati pada tanaman.

• terdapat enzim yang akan mengkatabolisasi glikogen menjadi glukosa, membentuk piruvat dan senyawa-senyawa lainnya.

Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)

Lisosom

• mensekresi berbagai jenis enzim pencerna, seperti enzim yang akan menghidrolisa protein, polisakarida dan lipid sel

• menghancurkan organel yg rusak

Ribosom

• mengandung asam ribonukleat yang berfungsi mensintesa protein sel

Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)

Mitokondria

• merupakan pabrik energi sel (sintesa ATP: Adenosin Tri Phosphat).

• mengandung berbagai enzim yang akan mengkatalisis zat makanan organik oleh molekul oksigen untuk menghasilkan karbondioksida dan air serta energi kimia.

Plastida3 macam :

• Leukoplas : tempat penyimpan; elaioplas :minyak, amiloplas : amilum, aleuroplas : protein

• Kromoplas : plastida, pigmennya bukan utk fotosintesis (xantofil & karoten)

• Kloroplas: plastida, pigmennya utk fotosintesis(Klorofil)

Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)

Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)

Chloroplasts

• tempat berlangsungnya proses fotosintesis (thylacoid vesicle) dan fiksasi karbondioksida, CO2 (stroma)

Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)

Retikulum endoplasmik (RE)

• Retikulum endoplasmik kasar Permukaan membran dipenuhi oleh ribosom yang terlibat dalam biosintesa protein.

• Retikulum endoplasmik halus Tidak dilengkapi ribosom, berperan di dalam biosintesa lipid dan tempat menyimpan enzim yang belum aktif seperti zymogen (prekusor enzim).

Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)

Golgi komplek

• Menerima protein hasil sintesa dari RE untuk diteruskan ke membran plasma atau ke organel lain.

Peroksisome

• menghasilkan enzim yang memecah asam lemak dan asam amino.

Terima Kasih

QUOTE FOR TODAY :

“SESUATU YANG BESAR DIMULAI DARI

SESUATU YANG KECIL “-Andrew Wood-