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Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

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Departamento de Genética

DEPARTAMENTO DE GENÉTICA:perspectivas

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DEPARTAMENTO DE GENÉTICA

Unidade de Citogenética

Unidade de Genética Médica

Unidade de Genética Molecular

Unidade de Bioquímica

Genética

Unidade de Investigação e

Desenvolvimento

Núcleo deApoio

Departamento de Genética

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Núcleo de Apoio

• Articulação com as assessorias de apoio técnico especializado

• Gestão de recursos humanos do Departamento

• Gestão do plafond financeiro atribuído ao departamento

• Melhoria contínua da qualidade

• Registo de bases de dados

• Colaboração com o site do INSA, coordenação da formação (…)

• Apoio administrativo e laboratorial (…)

Funções:

Departamento de Genética

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Recursos Humanos

Recursos humanos por carreira

Auxiliar7%

Administrativa6%

Enfermagem2%

Técnico de diagnóstico e terapêutica

20%

Técnica Superior de Saúde+Técnica

superior25%

Médica Hospitalar4%

Investigação Cientifica

6%Bolseiros, estagiários

e voluntários30%

Distribuição por carreira e área geográfica

05

101520253035

InvestigaçãoCientifica

MédicaHospitalar

TécnicaSuperior de

Saúde+Técnicasuperior

Enfermagem Técnico dediagnóstico eterapêutica

Administrativa Auxiliar Bolseiros,estagiários evoluntários

Lisboa Porto

Departamento de Genética

Page 5: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Genética Médica-Patologia genética-Diagnóstico pré-natal,…

Nutrição Psicologia Assistente Social

Enfermagem

Unidade de Genética Médica

Unidade de Genética MédicaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

Page 6: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Citogenética clássica:cariotipos Hibridação in situ

(FISH)

Hibridação Genómica Comparativa (CGH)

21

21

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21

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211813

X

Ex.: Trissomia 21

MLPA

Unidade de Citogenética Alterações cromossómicas: da convencional à molecular

Departamento de Genética

Unidade de CitogenéticaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

Page 7: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Unidade de Citogenética Oferta de serviços

Departamento de Genética

• Estudo cromossómico na população e no feto (DPN cromossómico);

• Estudo cromossómico de neoplasias (tumores sólidos e doenças hematológicas malignas);

• Análise molecular rápida de aneuploidias permite uma tomada de decisão terapêutica mais precoce;

• Estudos por hibridação in situ (FISH) contribuem para uma caracterização mais precisa em muitos casos de anomalia citogenética constitucional e oncológica.

Unidade de CitogenéticaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

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1 - Realizar testes genéticos de base molecular em diferentes doenças genéticas, no período pré-natal e pós-natal; Testes de diagnóstico, preditivos e de rastreio populacional

2 – Participação em programas de avaliação externa da qualidade laboratorial, prestação de assessoria científica e técnica

3 – Participação em actividade de formação e disseminação da cultura científica

4 – Implementação/manutenção da certificação de qualidade e acreditação dos ensaios laboratoriais

5 - Valorização científica dos resultados dos testes genéticos em conjugação com outras Unidades do DG, predominantemente com a I&D

Objectivos / Missão

Unidade de Genética Molecular

Departamento de Genética

Unidade de Genética MolecularFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

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Cancro da mama Cancro do cólonDiferenciação sexual e Inf. masculinaDoenças hemorrágicas hereditárias Doenças priónicasFactores genéticos de risco trombóticoFibrose quísticaHemocromatoseHemoglobinopatiasMalignidade hematológicaNeuroblastomaSíndrome de Lowe e doença de NorrieSíndrome de imunodef. por hiper IgMTrombofilias hereditárias,…

PortoLisboa

Atrofia muscular espinhalCardiomiopatiasDistrofias muscularesDeterminação de zigotiaHipertermia malignaHipotiroidismo congénitoMiopatias congénitasNeuropatiasAtraso mental ligado ao cromossoma XRastreio rápido de aneuploidiasSínd. Schwachman-Bodian-DiamondSínd. de Gilbert e de Crigler-NajjarSínd.de Cornélia de Lange,…

Departamento de Genética

Unidade de Genética MolecularFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

Unidade de Genética Molecular

PortoLisboa

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Departamento de Genética

Unidade de Bioquímica GenéticaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

Doenças Hereditárias do Metabolismo (DHM)

lisossomal peroxissomal energético intermediário

Mucopolis-sacaridoses

Biogénese Défices da cadeia

respiratória mitocondrialAminoacidopatias

Oligos-sacaridoses

Défice enzimático ou de

proteínaGlicogenoses

Acidúrias orgânicas e défices da beta-oxidação

Esfingo-lipidoses

Défices da glicosilação

LipidosesDéfices da biosíntese do

colesterol

Défices do metabolismo dos neurotransmissores

Caracterização genotípica, haplotipica e fenotípica

Rastreio neonatal para terapêutica de restrição dietética

Diagnóstico pós-natal para terapêutica de suplementação enzimática

Estabelecimento de repositório de linhas celulares de DHM

Unidade de Bioquímica Genética

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Departamento de Genética

Laboratório de Proteómica

Unidade de Bioquímica GenéticaFunção para cumprimento da Missão: Prestação de serviços

(em implementação)

IP: Deborah Penque

Laboratório de Proteómica

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

InvestigaçãoInvestigação

• Doenças Crónicas Pulmonares (Fibrose quística, Asma, DPOC) (Projectos FCT: POCTI/MGI/40878/2001, POCI/ESP/44720/2002, POCTI/SAU-MMO/56163/2004))

• Doenças Hepáticas (Projecto APDF, Projecto FCT: POCTI/SAU-IMI/55112/2004 )

• Colabora em outros projectos (externos/internos ao INSA)

Serviços (em implementação)Serviços (em implementação)

• Análise de proteínas por gel 2D

• Identificação de proteínas por MALDI/TOF/TOF

• Diagnóstico/Prognóstico de doenças pela proteómica (Projecto QCAIII, Saude XXI/2005)

Page 12: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Modelos biológicos

Linhas celulares

Plataforma TecnológicaPlataforma TecnológicaPlataforma TecnológicaPlataforma Tecnológica

Soro/plasma

Fibrose Quística, Asma, DPOC

Sistema

respiratório

Identificar proteínas diferencialmente expressas nestas doenças como potenciais biomarcadores de diagnóstico/prognóstico ou alvos terapêuticos alternativos

Identificar proteínas diferencialmente expressas nestas doenças como potenciais biomarcadores de diagnóstico/prognóstico ou alvos terapêuticos alternativos

Geís 2D/ MSGeís 2D/ MS SELDI-TOFSELDI-TOF LC/MSLC/MS

Modelos animais

Material biológico nativo

Departamento de Genética

Estratégias utilizadas no Estudo de Doenças Pulmonares Crónicas pela Proteómica

Unidade de Bioquímica GenéticaFunção para cumprimento da Missão: Prestação de serviços

(em implementação)

Page 13: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Unidade de Investigação e Desenvolvimento (I&D)

Departamento de Genética

• Compreender a acção dos genes, as interacções entre si e com o ambiente, como se expressam e regulam e como contribuem para a variação fenotípica normal e patológica.

• Estabelecer correlações genótipo/fenótipo, visando descobrir novos biomarcadores com potencial valor diagnóstico, prognóstico ou terapêutico e proceder à respectiva validação analítica e clínica.

• Esclarecer os mecanismos moleculares e celulares do cancro, assim como os efeitos genotóxicos associados à exposição ambiental, ocupacional ou acidental a agentes físicos, químicos e biológicos.

• Estudar a genética da susceptibilidade a doenças frequentes.

• Realizar estudos de epidemiologia genética nas populações residentes em Portugal ou outras populações de interesse.

• Identificar e priorizar necessidades de I&D em genética, de acordo com as prioridades estratégicas nacionais e internacionais.

Unidade de Investigação e DesenvolvimentoFunção para cumprimento da missão: Laboratório de Estado

Page 14: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

• Estabelecimento de plataformas instrumentais de análise multiplex e mecanismos analíticos recorrendo a nanotecnologias

• Aplicação de inteligência artificial na gestão do processo analítico e no diagnóstico diferencial

• Genotipar SNP para identificação do Varioma humano nas doenças hereditárias do metabolismo – contribuição para o registo e criação de bases de dados de nível global e de consulta universal

• Metabolómica na identificação de biomarcadores em fluidos fisiológicos humanos

• Proteómica na identificação de proteínas, modificações pós-translacionais, análise de péptidos e moléculas, no estabelecimento de mecanismos patofisiológicos em modelos in vitro (culturas celulares)

• Estudo da disfunção celular na etiologia das formas variantes ou atípicas versus formas clássicas das doenças

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da missão: Laboratório de Estado

IP: Lucia Lacerda

Doenças Hereditárias do Metabolismo

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Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Estudo dos mecanismos fisiopatológicos primários e secundários de doenças lisossomais de sobrecarga (DLS)

Departamento de Genética

IP: Sandra Alves

Substrato

Produtos

1

2

Resultados:• Caracterização das variações genéticas causais de DLS na população portuguesa: Mucopolissacaridoses tipo II, IIIA, IIIB e IIIC, Mucolipidoses II e III, Sialidose e Galactosialidose;• Impacto das mutações encontradas ao nível do RNA mensageiro e na estrutura e função da proteína;• Correlações genótipo-fenótipo;• Desenvolvimento de métodos analíticos para detecção de alelos mutantes com vista à implementação de estratégias de diagnóstico molecular (Ex: diagnóstico pré-natal molecular e rastreio de portadores nas famílias em risco).

Bases celulares e bioquímicas das doenças de sobrecarga lisossomais 1. Enzima lisossomal com actividade catalítica reduzida ou mesmo nula.2. Falhas no transporte de enzimas lisossomais do complexo de Golgi para o lisossoma.

Objectivo: Estudar os factores genéticos que afectam a formação e/ou transporte de enzimas lisossomais – estudos moleculares, bioquímicos e funcionais

Alves S et al. (2006) J Inherit Metab Dis, 29:743-54.

Mangas M et al. (2008) Clin Genet, 73:251-6.

Coutinho MF et al.(2008) Clin Genet, 74:194-5.

Page 16: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Investigação em doenças raras: Doenças lisossomais de sobrecarga

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Olga Amaral

Dvir et al; Premkumar et al

Mutações com origens comuns em doenças raras? Fundadores portugueses?

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Portugal

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Objectivo: >compreender mecanismos patogénicos > potencial para novas abordagens > melhorar a capacidade de prognóstico e de resposta

• Caracterizar as mutações encontradas nos genes dos doentes e a disfunção proteica originada• Epidemiologia genética

Investigar as disfunções a nível proteico

Esclarecer mecanismos patológicos e permitir prever as consequências fenotípicas

Frisch et al, 2004 ; Diaz et al, 2000 e 1999; Colombo, 2000 ; Amaral et al, 1997, 1999 e 2000; Marí et al, 2001

Page 17: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Investigação na Lipofuscinose Ceróide Neuronal

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Maria Gil Ribeiro

COPII

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CLN1/ CLN2/ CLN5/ CLN7/ CLN10

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CLN2/ CLN3

CLN2/ CLN3

CLN6/CLN8

CLN2/ CLN3/ CLN6/ CLN8

CLN2/ CLN3/ CLN6/ CLN5/ CLN8LR

Grupo de doenças genéticas neurodegenerativas progressivas e fatais que apresentam semelhanças clínicas e patológicas (acumulação de um lipopigmento no lisossoma)

Estas doenças estão associadas a 8 proteínas (lisossomais e não lisossomais) com função celular desconhecida

Estudo dos mecanismos moleculares patogénicos primários e análise funcional:

Caracterização de mutações e estudos de expressão génica ao nível do RNA e proteína (processamento, modificações pós-traducionais, localização, tráfego intracelular e interacção com outras proteínas CLN)

Bessa et al. (2008) Mol Genet Metab 93:67-73

Identificação de alterações moleculares secundárias (ao nível da transdução de sinal mediada por lípidos) com importância fisiopatológica e/ou terapêutica

Teixeira et al. (2006) Biochim Biophys Acta 1762:637-646

Objectivo:

Ferramentas:- Análise in silico- PCR, RT-PCR, qRT-PCR, Sequenciação- Silenciamento de genes (RNAi)- Análise por Western blot- Imunocitoquímica- Análise lípidos (TLC e microscopia de fluorescência) - Análogos lipídicos fluorescentes

Golgi

Endosomes

C

CLN6

Page 18: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Grupo heterogéneo de doenças clínicas, que têm na sua origem alterações do metabolismo energético celular

autosómica recessiva autosómica dominante

X-linked maternal

esporádica

A cadeia respiratória mitocondrial é o resultado da interacção de dois genomas física e funcionalmente separados, ADN nuclear (nADN) e ADN mitocondrial (mtADN)

Estas doenças afectam pessoas em qualquer idade, com quaisquer sintomas e qualquer modo de hereditariedade

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Doenças Mitocondriais

Departamento de Genética

IP: Laura Vilarinho

Page 19: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Polineuropatia Amiloidótica Familiar

Departamento de Genética

IP: Paulo Pinho e Costa

Foco

Epidemiologia PAF Outras amiloidoses hereditárias

Fisiopatologia Anemia e função renal

Novas abordagens Prevenção - DGPI Terapêutica – Ensaios Clínicos

Foco

Epidemiologia PAF Outras amiloidoses hereditárias

Fisiopatologia Anemia e função renal

Novas abordagens Prevenção - DGPI Terapêutica – Ensaios Clínicos

Investigadores Doutorados

Paulo Pinho e Costa, MD, PhD Luisa Lobato, MD, PhD

Outros Idalida Beirão, MD Luciana Moreira, MSc

Investigadores Doutorados

Paulo Pinho e Costa, MD, PhD Luisa Lobato, MD, PhD

Outros Idalida Beirão, MD Luciana Moreira, MSc

Internacionalização

U. Florença, IT P. Romagnani – Centro DENOthe

H. Univ. Charité, Berlim, DE C. Bachmann - Institut für Vegetative Anatomie

Internacionalização

U. Florença, IT P. Romagnani – Centro DENOthe

H. Univ. Charité, Berlim, DE C. Bachmann - Institut für Vegetative Anatomie

Colaborações Institucionais

Universidade do Porto UMIB – ICBAS F. Medicina

Centro Hospitalar do Porto HGSA

Colaborações Institucionais

Universidade do Porto UMIB – ICBAS F. Medicina

Centro Hospitalar do Porto HGSA

Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional Numerosas comunicações em congressos

Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional Numerosas comunicações em congressos

Page 20: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Doenças crónicas e degenerativas de genética complexa

Departamento de Genética

IP: Paulo Pinho e Costa

Foco Doenças neurológicas, inflamatórias

e auto-imunes seleccionadas Esclerose Múltipla Epilepsia Lúpus Eritematoso Sistémico Artrite Reumatóide Dislipidemia e aterosclerose

Imunogenética MHC e extra-MHC

Biologia dos sistemas Análise de redes de interacção genética

Foco Doenças neurológicas, inflamatórias

e auto-imunes seleccionadas Esclerose Múltipla Epilepsia Lúpus Eritematoso Sistémico Artrite Reumatóide Dislipidemia e aterosclerose

Imunogenética MHC e extra-MHC

Biologia dos sistemas Análise de redes de interacção genética

Investigadores Doutorados

Berta Martins da Silva, PhD Paulo Pinho e Costa, MD, PhD

Outros Pedro Lacerda Cláudia Carvalho, MSc

Investigadores Doutorados

Berta Martins da Silva, PhD Paulo Pinho e Costa, MD, PhD

Outros Pedro Lacerda Cláudia Carvalho, MSc

Internacionalização SLE

Karolinska Institute, SE – Marta Alárcon U. Tel-Aviv, IL – Y. Schoenfeld

EM U. Cambridge, UK – Alastair Compston U. Navarra, ES – Pablo Villoslada

Epilepsia U. Utrecht, NL – Dick Lindhout

Bioinformática – Biologia dos sistemas U. Geneve, CH – José M Nunes, Alicia Mawas U. Navarra, ES – Pablo Villoslada

Internacionalização SLE

Karolinska Institute, SE – Marta Alárcon U. Tel-Aviv, IL – Y. Schoenfeld

EM U. Cambridge, UK – Alastair Compston U. Navarra, ES – Pablo Villoslada

Epilepsia U. Utrecht, NL – Dick Lindhout

Bioinformática – Biologia dos sistemas U. Geneve, CH – José M Nunes, Alicia Mawas U. Navarra, ES – Pablo Villoslada

Colaborações Institucionais Universidade do Porto

UMIB - ICBAS F. Farmácia

Centro Hospitalar do Porto HGSA

IGC

Colaborações Institucionais Universidade do Porto

UMIB - ICBAS F. Farmácia

Centro Hospitalar do Porto HGSA

IGC

Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional 1 capítulo de livro Numerosas comunicações em congressos

Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional 1 capítulo de livro Numerosas comunicações em congressos

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Departamento de Genética

Investigação em Atraso Mental ligado ao cromossoma X

O atraso mental (AM) afecta ~2% da população mundial. Foram já identificados mais de 25 genes associados a formas de atraso mental ligado ao cromossoma X sindrómico (MRX) e não sindrómico (XLMR). Deste grupo salienta-se o gene FMR1 responsável pela Síndrome de X-Frágil e a Síndrome de ataxia e tremor (FXTAS). A maioria das formas de AM continua ainda por caracterizar molecularmente.

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Paula Jorge

OBJECTIVOS

Criação/implementação de base de dados de doentes com atraso mental

Gene FMR1:• Análise do tripleto repetitivo [CGG];• Pesquisa de outras mutações;

Gene FMR2:• Caracterização dos alelos intermédios e pré-mutados na população Portuguesa;

Identificação de outros genesIn: Hagerman PJ and Hagerman RJ (2007) Fragile X-associated tremor/ataxia syndrome—an older face of the fragile X gene, Nat Clin Pract Neurol 3: 107–112

Page 22: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Objectivo: Em células eucarióticas, o processo de expressão génica envolve múltiplos passos, desde a transcrição até às modificações pós-traducionais da proteína nascente, em que os RNA mensageiros (mRNAs) são o intermediário fulcral. O pré-mRNA é transcrito a partir do DNA e processado, com excisão dos intrões e adição da estrutura cap e cauda poli(A). O mRNA maduro é então transportado para o citoplasma, onde é traduzido para proteína e finalmente degradado. Sabe-se hoje que a maioria dos passos do processo de expressão génica, se não todos, podem ser regulados, o que permite o controlo espácio-temporal da expressão génica.

A grande complexidade da expressão génica torna o processo vulnerável a erros. No entanto, existem mecanismos celulares de controlo de qualidade que asseguram a fidelidade da expressão génica.

No âmbito das nossas actividades de I&D, estamos interessados em estudar um destes mecanismos - o mecanismo de nonsense-mediated mRNA decay, e de que modo este mecanismo reflecte a complexidade da maquinaria traducional.

Estudo do mecanismo de nonsense-mediated decay (NMD) do mRNA da a-globina humana

IP: Luísa Romão

Page 23: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Estudo do mecanismo de nonsense-mediated decay (NMD) do mRNA da a-globina humana

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Luísa Romão

Pereira FJC, et al. (2006). Brit J Haematol, 133: 98-102. Silva AL, et al. (2006), RNA, 12: 2160-2170.

Qual o efeito da sequência e comprimento da grelha de leitura do mRNA da a-globina Qual o efeito da sequência e comprimento da grelha de leitura do mRNA da a-globina humana no mecanismo de NMD? humana no mecanismo de NMD?

Resultados:

• Mutações nonsense perto do codão de iniciação da tradução inibem o NMD do mRNA da a-globin humana.

• A inibição da re-iniciação da tradução inibe parcialmente o NMD da a-globin humana, contrariamente ao que acontece com a b-globina.

• Os transcritos da a-globina humana portadores de uma mutação nonsense na região 3’ do exão 1, escapam parcialmente ao NMD,

supostamente devido a um efeito combinado da re-iniciação da tradução e do tamanho e sequência da grelha de leitura do transcrito.

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Page 24: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Objectivos: Aprofundar o conhecimento sobre a fisiopatologia das hemoglobinopatias e sobre os factores genéticos moduladores dos fenótipos hematológico e clínico.

A compreensão das relações genótipo / fenótipo pode contribuir para a tomada de decisão clínica, orientação de tratamento e adopção de medidas preventivas de algumas manifestações clínicas.

Exemplo de resultados:- Os doentes drepanocíticos que co-herdem um número elevado de

repetições TA no promotor do gene UGT-1A1 têm elevada probabilidade de desenvolverem hiperbilirrubinémia e colelitíase, mesmo em idade jovem.

- Concluímos que o polimorfismo de repetição TA no promotor UGT-1A1 representa um modificar importante das manifestações clínicas desta patologia.

Referências :Martins R et al . Early modification of sickle cell disease clinical course by UDP-glucurosyltransferase 1A1 gene promoter polymorphism. Journal of Human Genetics 2008, 53:524-8.

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Estudo de factores genéticos modificadores dos fenótipos das hemoglobinopatias (talassémias e drepanocitose)

Departamento de Genética

IP: Paula Faustino

Page 25: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Estudo de epidemiologia molecular, de caracterização de novas mutações e de regulação da expressão de genes associados a Hemocromatose Hereditária

Objectivos: Aprofundar o conhecimento sobre a base molecular da Hemocromatose Hereditária em Portugal, efectuar estudos funcionais de novas mutações e contribuir para o conhecimento do envolvimento da HFE no metabolismo do ferro e, quando mutada, no desenvolvimento da patologia. Pretende-se, ainda, contribuir para o conhecimento dos mecanismos envolvidos na regulação génica pós-transcricional.

Exemplo de resultados:- A análise mutacional efectuada nos genes HFE, TFR2, HJV e

HAMP, num grupo de 215 indivíduos portugueses com hemocromatose hereditária não-clássica revelou algumas mutações novas nestes genes. Apesar disso, dada a sua baixa frequência, concluiu-se que a pesquisa dessas mutações na corrente prestação de serviços laboratoriais de apoio à clínica apresenta um baixo nível custo-benefício.

Referências :Mendes A. I. et al . Non-classical hereditary hemochromatosis in Portugal: novel mutations identified in iron metabolism-related genes.Ann Hematol 2008, in press (DOI 10.1007/s00277-008-0572-y)

H63D

C282Y

Y230F

(adaptado de Fleming & Sly, 2002)

Representação esquemática da proteína HFE e localização de uma das mutações novas encontradas (Y230F)

Departamento de Genética

IP: Paula Faustino

Page 26: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Departamento de Genética

Sinalização em células tumorais

GrowthFactor

Receptor

ReceptorFactor

Crescimento

EG

F

Ras

B-RafMEK

ERK1/2

Rasmut

BRafmut

Rac1b

adenoma carcinoma

adenoma serreado carcinoma

Via clássica de progressão tumoral

Via alternativa de progressão tumoral

Proliferação celular

Foi identificado um novo subgrupo de tumores do cólon ( ~15%) que contem uma mutação oncogénica em BRAF associada à sobre-expressão da GTPase Rac1b (Matos et al. (2008) Gastroenterology, in press). A combinação destas alterações constitui uma via de tumorigénese alternativa à via clássica do oncogéne KRAS e representa um alvo terapêutico específico para este subgrupo de tumores.

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Peter Jordan

Page 27: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas

Departamento de Genética

Toxicologia Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Maria João Silva

Projectos

Metafase mostrando uma translocação recíproca, um cromossoma dicêntrico e um fragmento acêntrico ()

• Caracterização dos efeitos mutagénicos da deficiência da poli(ADP-ribose) polimerase em ratinhos transgénicos

• Minas de urânio e seus resíduos. Efeitos genotóxicos na população e influência de polimorfismos genéticos

• Avaliação dos efeitos na saúde associados à exposição crónica a contaminantes da água com potencial genotóxico

• Exposição ambiental ao fumo do tabaco em estabelecimentos de restauração: efeitos genotóxicos e mecanismos moleculares subjacentes a doenças respiratórias

Micronúcleos em linfócitos com bloqueio da citocinese ()

Lesões no DNA evidenciadas pelo “comet assay”

Equipa 1 investigador, 1 TSS, 2 estudantes mestrado, 1 estudante doutoramento

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Análise aprofundada de mutações no gene CFTR • Caracterização das mutações encontradas no gene CFTR• Estratégias para recuperar a função da CFTR mutada• Identificação de proteínas com um papel no tráfego e activação da CFTR

Análise da CFTR ao nível celular e fisiológico• Caracterização de mutações do gene CFTR (localização, tráfego e actividade)

Dase de dados para Mutações no CFTR (EuroCareCF)

Estudo do “Folding proteico” utilizando C. elegans• Produção de linhas trangénicas de nematodos (identificação de factores responsáveis pela degradação/”folding da CFTR)• Rastreios por RNAi do genoma completo• Construção de proteínas humanas quiméricas (ex. CFTR e proteínas multi-resistentes a drogas )• Identificação de ortologos humanos

Controlo de qualidade proteica• “Folding” e tráfego da proteína CFTR• Tráfego membranar• Degradação pelo proteassoma

DNA chips• Extracção, purificação e amplificação• Sensor magnético para detecção por single nucleotide polymorphism (SNP)

Ferramentas Genéticas e Moleculares-“Microarray” / análise in silico-Mutagénese-Silenciamento de genes (RNAi)-PCR & RT-PCR

Ferramentas ao nivel celular e fisiológico-Confocal e Vídeo Fluorescence Mic-Imunohistoquímica-Electrofisiologia (patch-clamp e câmaras de Ussing)

Investigação em Fibrose Quística

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Margarida Amaral

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Investigação em Patologias do Desenvolvimento Sexual

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Infertilidade masculina: caracterização do padrão de metilação das regiões CpG dos genes DAZL(3p24) e DAZ(Yq11.23) em espermatozóide provenientes de homens normozoospérmicos e oligozoospérmicos.

Projectos a decorrer:

Diferenciação sexual: pesquisa de alterações moleculares no gene CYP11B1 em doentes com hiperplasia supra-renal congénita e com suspeita de deficiência em 11 beta-hidroxilase.

IP: João Gonçalves

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