Filogenia Molecular

Es el estudio de la evolución y

desarrollo de las especies. La

comparación de secuencias de algunas

macromoléculas, es la forma mas

precisa y confiable para inferir en las

relaciones filogenéticas.

Clasificación de Organismos

Estos estudios podemos hacerlos

estudiando la secuencia total de

nucleótidos del genoma del

microorganismo, pero actualmente se

utilizan los estudios del rRNA 16S o

18S, porque son secuencias que se han

mantenido bastante uniformes a lo

largo de la evolución, y por eso se ven

claramente las diferencias entre los

distintos

microorganismos-.

Bacterias Rojas Fototroficas

Bacterias capaces de producir energía

atreves de la fotosíntesis.

Son organismos anaerobios o microaerófilos

y se encuentran principalmente en

manantiales sulfurosos o en agua estancada.

Se dividen en dos familias,

Chromatiaceae y Ectothiorhodospiracea

e

Bacterias Nitrificantes

Bacterias que consumen amoniaco,

como su única y exclusiva fuente de

energía, y producen nitritos mediante la

oxidación del oxigeno. Son bacterias

bastante grandes, entre 0.4 y 0.6 micras,

"Gram-negativas", autótrofas.

La temperatura óptima para su

crecimiento ronda entre 25º y 30º C y el

rango óptimo de pH está entre 7.8 y

8.0. Se dividen en dos Nitrosomonas y

Nitrobacter.

Bacterias Oxidantes del Azufre y

del Hierro

Son bacterias Gram negativas en forma de

Bacilo y donadoras de Electrones H2O, So y

S2O3-

Se encuentra en la naturaleza en habita ricos

en H2S, tales como manantiales

sulfurosos, depósitos de algas en

descomposición, capas de lodos y en aguas

residuales.

Existen tres géneros:

Thiobacillus: Es termófila y prefiere

temperaturas de 45-50 grados

centígrados, es acidófilo, prefiriendo un

pH de 1,5 a 2,5.

Archomatium:

Beggiaton: Son organismos

filamentosos, deslizantes, forman largas

cadenas de células bacilares unidas

extremo con extremo.

Bacterias Oxidantes del

HidrogenoSe conocen bacteria oxidantes de hidrogeno tanto

Gram – como Gra +

Todas la bacterias del hidrogeno contiene dos o mas

hidrogenasas que funciona uniendo hidrogeno y lo

usan para producir ATP

Son quimiotroficos facultativos

Existen dos generos:

Rastolnia:

Alcaligenes:

METOFILOS

Obtienen carbono y energía del metabolismo

de compuestos de C1.

Procarióticos:

o metanótrofos

o metilótrofos.

METANOTROFOSCrecen a expensas del CH4.

algunos usan metanol, formaldehído o dimetil eter.

Gram negativos

Aerobios

Bacilos unicelulares, vibrios, cocos

Móviles por flagelos polares

Poseen un sistema de enzimas específico; la metanooxigenasa

Forman un complejo sistema de membranas internas cuando crecen en metano

PRINCIPALES GENEROS

Methylomonas(bacilos

rectos, curvados o

ramificados con un

único flagelo polar)

Methylococcus (células

esféricas e inmóviles).

metilomona metánica

HABITAT

Ambientes acuáticos terrestres

Fuentes estables de metano

Termoclina de lagos y embalses

Prefieren habitatmicroaerofílicos

METILOTROFOS

Crecen a expensas de uno o varios componentes

utilizados típicamente por los metófilos, pero, NO

USAN METANO.

Pueden ser Gram + o Gram -

Ninguno produce cistes ni esporas, como los

metanotrofos

No poseen sistemas complejos de membranas como

los Metanótrofos.

Pseudomonas

Bacilos rectos o ligeramente curvados,

Gramnegativos, oxidasa positivos, aeróbi

cos estrictos aunque en algunos casos

pueden utilizar el nitrato como aceptor

de electrones.

Las cepas del

género Pseudomonas son capaces de

procesar, integrar y reaccionar a una

amplia variedad de condiciones

cambiantes en el medio ambiente, y

muestran una alta capacidad de

reacción a señales físico-químicas y

biológicas.

Acetobacteria

Bacilos Gram negativos, móviles

y aeróbicos, que realizan una oxidación

incompleta de alcoholes, produciendo

una acumulación de ácidos orgánicos

como productos finales.

Una propiedad de este tipo de

microorganismos es su alta tolerancia a

la acidez, la mayoría de las cepas

pueden crecer a pH inferiores a 5.

Bacterias Aeróbicas de Vida

Libre Fijadoras de Nitrógeno

Azotobacter• Fija nitrógeno aeróbicamente

• Tamaño de 2-4 micras, forma oval o bacilar.

• Colonias de aspecto mucoso(cápsula polisacárida).

• Alta tasa de respiración.

• Forma quistes, aunque su tasa metabólica no se reduce a cero.

• A. chrococcum, tiene una nitrogenasa con cofactor vanadio-hierro, en vez de molibdeno-hierro.

Neisseria

Grupo de bacterias Gram-negativas.

Forma

de diplococos, inmóviles, catalasa y

oxidasa positivos. El tamaño es de 1µ

de diámetro y son aerobios estrictos.

Chromobacterium

Bacterias Gram-negativas , anaerobias

facultativas, no

sporing cocobacilo . Forma parte de la

flora normal del agua y el suelo de las

regiones tropicales y subtropicales del

mundo.

Aquifex

Este género de bacterias acuáticas es

capaz de soportar temperaturas

cercanas al punto de ebullición del

agua.

Existen dos especies

A. pyrophilus y A. aeolicus.

El rango de temperaturas óptimas para su

crecimiento está entre los 85 y 95 grados

centígrados.

Se pueden encontrar en las cercanías de

volcanes submarinos o en fuentes

hidrotermales.

Tiene forma de bacilo con una longitud

de 2 a 6 µm y un diámetro de alrededor

0,5 µm. Son autótrofos Gram-

negativos y no forman esporas.

Thermodesulfobacteria

Bacterias reductoras de

sulfato termófilas. Según la clasificación

actual podemos encontrar dos géneros

dentro de este filo de bacterias,

Thermodesulfobacterium y Thermodesulf

atator.

Su hábitat de Thermodesulfobacterium

generalmente es acuático.

Se pueden aislar en chimeneas

volcánicas calientes, en fuentes

hidrotermales de alta mar, y otros

ambientes marítimos

Thermotoga

Son termófilos o hipertermófilos.

Metabolizan carbohidratos.

Las distintas especies tienen distintas

tolerancias a la sal y al oxígeno.

Es anaerobio y reduce cistina

y tiosulfato a sulfuro de hidrógeno

Thermotoga maritima (verde / amarillo barras) Que Crece en

co-Cultivo con Methanococcus jannaschii (Esferas rojas). T.

maritima fermenta los azúcares en Hidrógeno y M. jannaschii

convierte el metano en Hidrógeno. (Crédito: North Carolina

State University)

Bacterias Verdes Chloroflexi

obtienen energía mediante fotosíntesis

son aerobias facultativas, pero no

producen oxígeno durante la

fotosíntesis.

Algunas especies son termófilas.

Deinococci

Bacterias Gram positivas altamente

resistentes a los cambios en el medio

ambiente.

Hay dos grupos principales.

Deinococcales y Thermales.

Deinococcales

Son resistentes a la radiación: tienen la

capacidad para comer la basura

nuclear y otros materiales tóxicos, por

sobrevivir en el vacío del espacio y

soportar el calor y frío extremos.

Thermales

Son resistentes al calor.

Tienen membranas celulares

gruesas Gram-positivas, pero incluyen

una segunda membrana y así están

más próximas en estructura a las

bacterias Gram-negativas.

Espiroquetas

Bacterias Gram-negativas que tienen

células alargadas y enrolladas.

Casi todas son unicelulares.

Poseen una membrana externa

formada por múltiples capas llamada

"envoltura celular" o "vaina externa" que

rodea completamente el cilindro

protoplasmático.

Se distingue de los demás filos

bacterianos por la presencia de unos

flagelos especializados denominados

filamentos axiales situados entre la

envoltura celular externa y el cilindro

protoplasmático

Bacterias Verdes Chlorobi

Bacterias que realizan

la fotosíntesis anoxigénica.

Son fotolitoautótrofas

Se encuentran en las zonas ricas

en azufre y anaerobias de los lagos.

Son de diversas morfológicamente y se

pueden presentar

como bacilos, cocos y vibrios.

Algunas crecen solas, otras en cadenas y

pueden ser de color verde grama o

marrón chocolate.

Flavobacterias

Bacterias medioambientales que

incluye un

único orden, Flavobacteriales.

Comprende tres familias:

Flavobacteriaceae (15 géneros),

Myroidaceae (2 géneros) y

Blattabacteriaceae (un género).

Defferibacter

El género comprende 4 especies

D. abyssi

D. autotrophicus

D. desulfuricans

D. thermophilus

Cytophaga

Bacterias Gram-negativas, en forma de

bastoncillos, capaz de moverse por sus

propios medios.

Algunas de las especies:

Cytophaga columnaris

Cytophaga johnsonae

Cytophaga psychrophila