Mezőgazdasági biotechnológusMSc szak

dr. Kiss Erzsébet

SZIE Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar

Genetika és Biotechnológiai Intézet

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak

SzakvezetőDr. Kiss Erzsébet

egyetemi tanárkiss.erzsebet @mkk.szie.hu

Szakvezető-helyettesDr. Veres Anikóegyetemi docens

veres.aniko@mkk.szie.hu

Genetika és Biotechnológiai IntézetIgazgató

Dr. Varga László

Egyetemi docens

Varga.laszlo@mkk.szie.hu

Titkár

Katona Melinda

katona.melinda@mkk.szie.hu

Genetika és Biotechnológiai Intézet

Telefonszám

+36 28 522 069

+36 28 522 000/1691

Fax

+36 28 522 069

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak

Alapítás

2006

Dr. Heszky László

MTA rendes tagja

Genetika és Biotechnológiai Intézet akkori igazgatója

Genetika és Biotechnológiai Intézet

A hazai nemesítő utánpótlás képzésének meghatározó bázisa;

Három fő diszciplina oktatásának felelőse: Genetika

Növénynemesítés

Növénybiotechnológa

Genetika és Biotechnológiai Intézet

Elsőként indított Magyarországon mezőgazdasági biotechnológusmesterképzést 2008-ban

Nappali és levelező tagozaton

Ez a mesterszak- az országban egyedülállóan – két szakirányt foglal magában: növénybiotechnológia és állatbiotechnológia szakirányokat.

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak

Hallgatószáma jelenleg 52 fő

49 fő diplomázott eddig

Az Agricultural Biotechnology angol nyelvű MSc szakot külföldi hallgatókkal (12 fő) 2012-ben indította a genetika és Biotechnológiai Intézet.

14 új hallgató 2014-ben

A Mg. Biotech. MSc Szakonkét szakirány között lehet

választani

Növénybiotechnológia Állatbiotechnológia

Program

1. félév: azonos tantárgyak

2. félév: szakirány-választás / diplomamunka

2-4. félév közös és szakirány-specifikus tantárgyak

Diplomamunka

Saját kísérletek!

Ízelítő a választható témákból Gyujtoványfű, cickafark, imola és csodatölcsér fajok

molekuláris vizsgálata taxonómiai pontosítás céljából

Az Orange gén öröklődése karalábé és karfiol hibridpopulációkban

Emlős embriók in vitro előállítása vágóhídról származó petesejtekből

Transzpozon alapú transzgenezissel előállított transzgénikus nyulak molekuláris jellemzése

Mikrobiológiai témát is lehet választani

Szakirány -választás Az 1. szemeszter végén!

Molekuláris markerek alkalmazása szántóföldi és kertészeti növények

nemesítésében

Kiss E., Gyulai G., Veres A., Szőke A., Tóth-Lencsés K.,

Kerekes A., Heszky L.

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak

Ízelítő a diplomamunka- témákból korábbi dolgozatok és publikációk alapján

Molekuláris markerek alkalmazása

Genotipizálás

Pedigré elemzés

Hibridazonosítás

Kapcsolt markerek

Miért van szükség a genotipizálásra? Nem elegendő a morfológiai

összehasonlítás?

Perenne évelő rozs

Kárpát-medencei szőlőfajták mikroszatellit

elemzése

Szőlő fajták összehasonlító elemzése mikroszatellit /SSR

primerekkel

SSR allél adatok átalakítása vonalkóddá

MAGYAR SZŐLŐ MIKROSZATELLIT / SSR ADATBÁZIS

HUNGARIAN VITIS MICROSATELLITE / SSR DATABASE

KISS, Erzsébet; HALÁSZ, Gábor; *KOZMA, Pál; HESZKY,

László

Szent István Egyetem, Genetika és Növénynemesítés Tanszék

Szent István University, Department of Genetics and Plant

Breeding H-2103, Gödöllő, Magyarország / Hungary *FVM

Szőlészeti és Borászati Kutatóintézet (FVM-SZBKI) Institute

for Viticulture and Enology H-7634, Pécs, Magyarország /

Hungary

Primerek / Primers:

Fajták / Varieties:

A-B - C-CS - D-E - É-F - G-H - I-J - K - L-

M -

N-NY - O-Ó - Ö-Ő - P-Q - R-S - SZ-T - U-Ú

- Ü-Ű - V-Z - ZS

List of Varieties / Teljes fajtalista

European Vitis Database: közel 6 000 fajta/klón mikroszatellit/SSR és ampelográfiai

adata

259 magyarországi fajta/klón

European Vitis DatabaseN-coded SSR values in 9 loci

Accession name Allél_1 Allél_2

HUN045-P14#30 - APROFEHÉR N+8 N+18

HUN045-P14#49 - AGASFARK N+8 N+8

HUN045-P14#60 - BAJOR, KÉK N+8 N+8

HUN045-P14#61 - BAJOR, SZÜRKE N+8 N+8

HUN045-P14#62 - BAKARKA N+18 N+18

HUN045-P14#63 - BAKATOR, KÉK N+8 N+18

HUN045-P14#64 - BAKATOR, PIROS N+8 N+22

HUN045-P14#65 - BAKATOR, PIROS

TÜDOSZINU * N+8 N+22

HUN045-P14#66 - BAKSZEM N+16 N+22

HUN045-P14#68 - BALAFANT N+18 N+18

Almafajták mikroszatellit mintázata és allélmérete a CH03G07 primerpárral

CULTIVARSCH03g07 CH04g10 CH04e03 CH05c02 CH05d11 CH05e03

Ozark Gold 119 129 135 168 196 196 168 172 173 173 168 179

JerseyMac 165 165 135 137 184 198 160 176 165 173 197 163 173

Piros 165 179 135 135 196 198 168 176 173 175 173 173

Gala 119 129 135 135 196 198 168 170 173 173 173 185

Pioana 129 129 135 137 190 198 170 174 169 171 163 185

Gloster 123 129 127 137 198 198 160 168 195 197 160 191

Julyred 165 165 123 135 143 184 198 160 176 175 197 163 163

Wellspur Delicious 127 127 137 168 198 202 168 168 173 197 191 191

Judeline 123 129 135 135 196 198 168 174 173 173 163 185

Jonagold 119 123 129 135 135 186 198 168 174 200 169 173 175 163 179 185

Jonathan 119 123 135 135 186 196 168 200 173 175 163 185

Pinova 119 127 129 127 135 198 222 168 174 169 173 163 179 185

Mutsu 129 179 135 135 198 198 168 168 173 173 173 179

Akane 123 179 123 135 143 196 210 216 170 200 173 173 185 185

Sampion 119 129 135 135 190 198 170 174 169 173 179 193

Charden 119 129 135 135 198 198 168 174 200 169 173 175 175 179 185

Jonager 123 127 135 135 196 196 170 200 173 175 168 185

Summerred 129 165 135 135 184 208 168 176 173 177 170 185

Goldstar 119 129 123 135 143 190 198 168 170 173 173 185 193

Golden Delicious 119 129 135 135 198 198 168 174 169 173 179 185

Angold 119 129 135 135 198 198 168 170 171 173 173 185

Granny Smith 129 153 127 137 196 198 160 172 171 173 168 181

Kró óriás 129 129 123 137 143 196 202 168 172 173 197 168 191

Liberty 123 129 137 137 178 198 168 168 173 211 163 176

Mizsei 123 129 135 135 186 208 160 168 173 173 163 185

Reglindis 129 179 135 135 198 198 168 168 169 173 173 173

Sir Prize 119 123 129 135 135 198 204 168 168 169 173 173 179

Red Stayman 127 129 127 135 196 204 168 172 169 173 163 191

Rewena 119 123 135 135 178 210 168 168 173 173 164 185

Rubinola 129 129 135 135 184 198 168 176 173 173 179 193

Braeburn 127 129 168 168 198 202 168 168 171 173 191 191

Rajka 119 129 135 135 190 196 160 170 174 171 173 177 164 176 185

Idared 123 129 135 135 186 198 168 200 173 197 172 185

Fuji 119 127 123 143 168 196 198 168 168 173 197 163 191

Florina 123 127 135 168 196 198 168 200 173 197 163 191

Prima 129 165 123 135 143 184 204 168 176 169 173 179 185

Elstar 119 119 135 135 190 198 168 170 173 187 164 179

Remo 119 123 135 135 178 190 168 170 173 173 163 172

Red Rome Van Well 123 129 135 135 186 198 168 168 173 173 163 163

Topaz 119 129 135 135 190 198 168 168 169 173 185 193

Pink Lady 129 129 135 137 198 204 160 168 169 171 168 179

Relinda 123 129 123 135 143 196 208 168 172 173 173 172 185

Greensleeves 129 129 123 135 143 190 198 170 174 171 173 173 185

Reanda 119 129 135 137 196 208 168 168 173 181 173 185

Pilot 129 179 135 135 196 196 168 168 173 173 164 185

Fiesta 119 123 135 135 186 196 168 168 173 197 164 185

Snygold 129 129 135 135 198 198 170 174 173 205 173 179

65 kereskedelmi és

38 tájfajta

Dinnyegenotipizálás

Szamócafajták molekuláris összehasonlítása

M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 M

3000

500 OPE 02

Adh 1f/ Adh1r

WFRVC

RAPD

AP-PCR

Gén-specifikus

Diploid, oktoploid szamóca fajták SSR adatai

Fajta SSR / UDF-004 (bp)

Fragaria vesca‘Rügen’

133:133

F. ananassa‘’Hakras romata’

129:143

F. ananassa‘Avalon classique’

125:131:137

F. ananassa‘Frapendula’

125:129:143:149

F. ananassa‘Fertődi 5’

125:127:129:133:149

F. ananassa‘Gorella’

125:129:133:139:143:149

Repce genotipizálás SSR markerekkel

GKH 724 162:166:174:192

TPES 7 166:192

TPR 24 162:174

Tetraploiditás repcében

Származás, pedigré

Szőlő

Alma

Évelő rozs

Az SSR allélek méretezése/ALF-Express/

Lokusz ♀ Izsáki Mátraimuskotály

♂Ottonel muskotály

Scu08vv 185:185 185:185 185:185

Scu10vv 208:214 214:214 208:214

VVMD21 244:250 244:267 267:267

VVMD36 254:276 276:264 264:276

ssVrZAG62 191:207 191:191 191:197

ssVrZAG64 139:161 139:161 139:161

ssVrZAG79 240:246 240:258 258:262

ssVrZAG83 197:203 197:203 193:203

ssVrZAG112 237:245 237:237 237:245

VVMD5 226:232 232:226 226:228

VVMD7 242:252 242:246 242:246

VVMD32 258:274 274:266 242:266

ssVrZAG21 208:208 208:208 208:208

Vmc4f3 170:170 170:204 170:204

VVMD28 234:258 258:269 258:269

VVMD31 206:208 206:206 206:210

VMC4c6 157:166 157:163 162:163

VMC4g6 123:127 123:135 125:135

VVS2 143:143 143:143 133:143

SSR allélek méretei bp-ban

SSR lokusz Leányka Királyleányka

Scu10vv 202:208 208:214

Scu08vv 185:185 185:185

VVMD21 250:250 244:250

VVMD36 266:276 254:266

VrZag64 161:165 161:161

VrZag79 240:254 252:254

VrZag62 195:197 197:207

Zalagyöngye

Csabagyöngye

X

Seyve-Villard 12375

NEM!

Perenne évelő rozs

Kapcsolt markerek

Ivar

kender

Rezisztencia

Paradicsom: nematóda

Szőlő: lisztharmat és peronoszpóra

Hímsterilitás

repce

Szín

Karfiol: rózsa

Szőlő: bogyó

Ivarspecifikus marker fejlesztése RAPD fragmentumból kenderben

Nematóda rezisztens paradicsom genotípusok azonosítása molekuláris markerekkel

Restrikciós emésztés után ahomozigóta és a heterozigótarezisztens genotípusokelkülöníthetőek

A heterozigóta és homozigóta rezisztens genotípusok megkülönböztetése CAPS markerrel

Rezisztens és fogékony genotípusok domináns markerrel

RUN1, REN1 lisztharmatrezisztenciagénekkel kapcsolt

SSR markerekalkalmazása szelekcióra

Egyszeres PCRMultiplex PCR

A RUN1 gén jelenlétét a (RUN1+ növényeket) a 160 bp méretű csúcs jelzi

95 bp méretű külső, ill. belső

sandard

275 bp méretű külső, ill.

belső standard

A BC4, a Kismis vatkana (szülők) és érzékeny fajta (Cardinal)alléljei a VMC8g9 markerrel R: Run1+ Sz: run1-

Multiplex PCR 4%-os Metaphor agarózon (BMA) elválasztva

2. Kismis vatkana: Run1-/Ren1+ 3. BC4: Run+/Ren1-, Az utódpopuláció egyedei 601: Run1-/Ren1- 90: Run1+/Ren1+, 6: Run1+/Ren1-, 36: Run1-/Ren1+

286 bp 286 bp 286 bp

160 bp 160 bp 160 bp

VMC9h4.2

VMC8g9

Hímsterilitás

Csak a hímsteril növényekben jelenik meg a 278 bp fragmentum

Színes karfiol

Kárpát-medencei bogyószín variánsok

Lisztes piro Lisztes fehér Bakator piros Bakator tüdőszínű

Gohér piros Gohér fehér Gohér változó Piros Sárga

muskotály muskotály

Csíkos muskotály Furmint piros Furmint fehér

Antocyanin biosynthesis

White berried grapes No UFGT expression

Reason: Gret-1 insertion into the promoter of VvMybA1

transcription factor gene

SNP a VvMybA2 kódoló szekvenciában

VvMybA1 allél-variációk

M: MW marker, 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4. Lisztes piros,5. Lisztes fehér, 6. Bakator piros, 7. Bakator tüdőszínű, 8. Gohér piros, 9.Gohér fehér, 10. Gohér változó, 11. Piros muskotály, 12. Fekete muskotály,13. Sárga muskotály, 14. Csíkos muskotály, 15. Furmint piros, 16. Furmintfehér, 17. Furmint változó, 18. Kék barátcsuha, 19. Szürke barátcsuha

VvMybA1a

VvMybA1b

VvMybA1c

20D18CB9 markerVvMybA1 linked CAPS marker

PCR product

DdeI digestion

M: molecular weight m., 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4.Bakator piros, 5. Bakator tüdőszínű, 6. Gohér piros, 7. Gohér fehér, 8.Gohér változó, 9. Sárga muskotály, 10. Csíkos muskotály, 11. Furmintfehér, 12. Furmint változó, 13. Kék barátcsuha, 14. Szürke barátcsuha

329 bp

248 bp

329 bp

248 bp329 bp

213 bp

329 bp

213 bp329 bp

248 bp

213 bp

Munkatársak, együttműködők

SZIE GBIHeszky LászlóGyulai Gábor

Szőke AntalVeres AnikóGalli ZsoltGalbács ZsuzsannaHalász GáborKatuláné Debreceni DiánaKerti BalázsKovács LászlóLencsés Andrea KittiMolnár StellaPilinszky KatalinWichmann Barnabás

PTE SZBIKozma PálHoffmann SaroltaGK KhtFalusi JánosGyümölcskutató FertődDénes Ferenc

Proplant Kft DánszentmiklósSipos ElvíraLehoczky Péter

Gyümölcskutató ÚjfehértóSzabó TiborInántsy Ferenc

MGSZH BudapestPernesz GyörgyHarangozó Tamás

Köszönöm a figyelmet!