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高分子科学中的理论与模拟 罗开富 软物质与生物物理课题组 中国科学技术大学高分子科学与工程系 Tel:63607936 Email: [email protected]

高 分 子 世 界 Polymer World · ORIGAMI RNA 10 to 1000 Secondary structure, annealed branched, folding Proteins 20 to 1000 Proteomics, random/designed heteropolymer, HP ,

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  • 高分子科学中的理论与模拟

    罗开富 软物质与生物物理课题组

    中国科学技术大学高分子科学与工程系 Tel:63607936

    Email: [email protected]

    Tel:63607936

  • 1. 高分子的柔顺性及柔性机理

    合成聚合物;天然高分子;聚合度;单体单元数

    How straight is a polymer?

  • 高分子链的柔性

    (a) 蠕虫状链(DNA) (b) 刚性棒自由连接(铰链,对高分子很难存在)

  • 链的柔性机理

    不同机理: 主链上C-C化学键的内旋转; DNA双螺旋链键角涨落

  • 2. 高分子链的尺寸

  • 自由连接链

  • 花粉颗粒布朗运动的轨迹vs.理想链的构象

    均方位移:

    理想链的均方末端距:

  • 3. 高分子链的熵弹性

  • 与弹簧类比

  • 不同拓扑结构的高分子

  • 4. 高分子科学中的模拟方法

  • 1. Computer Simulation of Liquids. --- M. P. Allen and D.J. Tildesley, Oxford University (1987)

    2. The Art of Molecular Dynamics Simulation. --- D. C. Rapaport, Cambridge University (1995) 3. Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to

    Applications. ---- D. Frenkel and B. Smit, Academic (1996)

    主要的学习参考书籍

  • 格子Monte Carlo 模拟方法

  • Metropolis Monte Carlo方法的算法:

    a) 给出一个初始状态,并计算系统的能量Eold

    b) 随机产生一个新状态,并计算新系统的能量Enew c) 如果ΔE=(Enew−Eold)0, 则计算Boltzman因子: kTE

    e∆−

    e) 在(0, 1)区间上产生一个均匀分布的随机数ζ ;

    f) 如果 ,kTE

    e∆−

  • 分子动力学模拟方法

  • 朗之万(或布朗)动力学

  • 耗散粒子动力学模拟方法

  • 5. 模拟实例1—自组装

  • 5. 模拟实例2—高分子穿越纳米通道

    朗之万动力学模拟动画

  • 谢谢!

    幻灯片编号 1幻灯片编号 2幻灯片编号 3幻灯片编号 4幻灯片编号 5幻灯片编号 6幻灯片编号 7幻灯片编号 8幻灯片编号 9幻灯片编号 10幻灯片编号 11幻灯片编号 12幻灯片编号 13幻灯片编号 14幻灯片编号 15幻灯片编号 16幻灯片编号 17幻灯片编号 18幻灯片编号 19幻灯片编号 20幻灯片编号 21幻灯片编号 22幻灯片编号 23幻灯片编号 24幻灯片编号 25幻灯片编号 26幻灯片编号 27幻灯片编号 28幻灯片编号 29幻灯片编号 30幻灯片编号 31幻灯片编号 32幻灯片编号 33幻灯片编号 34幻灯片编号 35幻灯片编号 36幻灯片编号 37幻灯片编号 38幻灯片编号 39幻灯片编号 40幻灯片编号 41幻灯片编号 42幻灯片编号 43幻灯片编号 44幻灯片编号 45幻灯片编号 46幻灯片编号 47幻灯片编号 48幻灯片编号 49幻灯片编号 50幻灯片编号 51幻灯片编号 52幻灯片编号 53幻灯片编号 54幻灯片编号 55幻灯片编号 56幻灯片编号 57幻灯片编号 58幻灯片编号 59