Ejemplo de homología: extremidades anteriores en algunos mamíferos

Homología parcial - homoplasia

Homologías ancestrales y derivadas: el método del grupo externo

Otros: por ontogenia, por el registro fósil

Criterios para distinguir homología de homoplasia:

Un carácter homólogo debe tener la misma estructura fundamental.

Las homologías deben tener las mismas relaciones con los caracteres de su alrededor.

Las homologías deben tener el mismo desarrollo embrionario en los diferentes grupos.

La convergencia está causada por la selección natural, si tienen los mismos requerimientos funcionales puede haber sospechas de homoplasia.

Derived homologies (synapomorphies=shared, derived characters) are new to a clade of interest (first seen in ancestor of clade). Ancestral homologies (symplesiomorphies=shared, ancestral characters) arose before the common ancestor of the clade.

Archosauria

* hard-shelled eggs * single openings in each side of the skull in front of the eyes (antorbital fenestrae) * openings in the lower jaw (the mandibular fenestra) * a high narrow skull with a pointed snout * teeth set in sockets

Dinosauria

* reduced fourth and fifth digits on the hand * foot reduced to three main toes * three or more vertebrae composing the sacrum * an open hip socket

Saurischia

* a grasping hand * asymmetrical fingers * long, mobile neck * pelvis with a pubis that points downward and forward

Therapoda

* hollow, thin-walled bones

Coelurosauria

* elongated arms * well-developed hinge-like ankles * (some coelurosaurs have open nests like birds in which eggs were brooded)

Maniraptora

* the semilunate carpal present in wrist * modified forelimb (elevated forelimb capable of folding) * a fused collar bone and sternum * pelvis with a pubis that points downwards

Aves

* feathers * wings * wishbone * opposable big toe

Homología en secuencias de amino ácidos

A sequence alignment, produced by ClustalW, of two human zinc finger proteins, identified on the left by GenBank accession number.Key: Single letters: amino acids. Red: small, hydrophobic, aromatic, not Y. Blue: acidic. Magenta: basic. Green: hydroxyl, amine, amide, basic. Gray: others. "*": identical. ":": conserved substitutions (same colour group). ".": semi-conserved substitution (similar shapes).

Árboles construidos con base en secuencias de:

a) 4700 mtDNA

b) proteína específica de los testículos del cromosoma Y

c) regiones no codificantes del gen de la globulina.

Duplicación de un gen y reconstrucción filogenética: secuencias ortólogas y secuencias parálogas

Tarea

Obtener secuencias de humano, perro, mapache, vaca, elefante de algún gen y tratar de alinear usando ClustalW2 o PhyLYP

o hacer el mismo ejercicio con un grupo de interés, al menos 5 taxa

Ver http://www.ebi.ac.uk/Tools/sequence.html