Ana Indrayati

Lokasi

ekspresi gen

� Produk rekombinan:

� Interferon

� Insulin

� Superoksida dismutase (SOD)

� Streptokinase

� Eritropoetin (EPO)

� Bone morphogenetic 2 (BMP2)

� Amilase

� DNA REPLIKASI ATAU DNA SINTESIS: PROSES

PENGGANDAAN MOLEKUL DNA/MATERI GENETIK

� MENJAMIN SETIAP SEL MENGANDUNG KROMOSOM

YANG IDENTIK DENGAN SEL ASAL

� TERJADI SEBELUM SEL MEMBELAH

� Semi konservatif

� Konservatif

� Dispersif

Eksperimen

Meselson -Stahl

DNA (replikon)

� DNA HELIKASE: MEMBUKA UNTAI GANDA DNA

� PRIMER: MENYEDIAKAN UJUNG 3’ OH BEBAS UNTUK DNA POLIMERASE

� ORI (ORIGIN OF REPLCATION): TITIK ASAL DIMULAINYA REPLIKASI DNA DI DALAM SEL

� dNTP (DEOKSI NUKLEOTIDA TRIFOSFAT): dATP, dGTP, dCTP, dTTP

� TERMINUS: TEMPAT REPLIKASI BERAKHIR

PROTEIN

� SSB: SINGLE STRANDED BINDING PROTEIN

� DNA POLIMERASE: POLIMERISASI

� RNA POLIMERASE/PRIMASE: MENSINTESIS PIMER

� DNA LIGASE: SEALING DNA NICK

KETERBATASAN DNA POL:

1. HANYA DAPAT MENAMBAHKAN NUKLEOTIDA BILA TERDAPAT GUGUS

HIDROKSI (OH) BEBAS PADA KARBON 3’ PADA NUKLEOTIDA SEBELUMNYA

2. BERJALAN DARI ARAH 5’ KE 3’

3. MEMBUTUHKAN PRIMER (OLIGONUKLEOTIDA, MERUPAKAN MOLEKUL

RNA) MENYEDIAKAN GUGUS HIDROKSI BEBAS

LEADING STRAND

SINTESIS DNA DARI ARAH 5’ KE 3’ TERJADI SECARA KONTINU

LAGGING STRAND

SINTESIS DNA DARI ARAH 3’ KE 5’ SECARA DISKONTINU

MENGHASILKAN FRAGMEN OKAZAKI

� E. coli

� Ukuran genom: 4,7 x 106 pb

� Origin of replication (ori): 1

� 1000 nukleotida/detik-40

menit

� Kesalahan replikasi: 1/109

nukleotida

� Mekanisme: proof-reading

� Manusia: 150 x 106 pb

� 50 basa/detik

� Banyak ori

Sintesis RNA

� PROSES PEMBENTUKAN RNA DARI DNA SEBAGAI TEMPLAT

� HASIL: RNA TRANSFER (tRNA), RNA RIBOSOM (rRNA), RNA MESSENGER (mRNA)

� PROSES ENZIMATIK DIKATALIS OLEH RNA POLIMERASE

� TRANSCRIPTION UNIT: BAGIAN DARI DNA YANG DITRANSKRIPSI MENJADI RNA

� UNTAI SENSE (TEMPLATE STRAND): UNTAI TUNGGAL DNA YANG DIGUNAKAN SEBAGAI CETAKAN UNTUK SINTESIS RNA

� UNTAI NON-SENSE (NON-TEMPALTE STRAND): UNTAI TUNGGAL DNA YANG TIDAK DIGUNAKAN SBG CETAKAN UTK SINTESIS RNA.

� ARAH SINTESIS RNA DARI 5’ KE 3’

� PROKARIOT TERJADI DI SITOPLASMA

� EUKARIOT TERJADI DI NUKLEUS (INTI SEL)

� PROMOTOR: URUTAN TERTENTU PADA MOLEKUL DNA YANG MENANDAI TEMPAT AWAL TRANSKRIPSI

� RNA POLIMERASE: MENGAKATALIS TRANSKRIPSI

� FAKTOR SIGMA (σ): PROTEIN MEMBANTU RNA POLIMERASE MENGENALI PROMOTOR

� HOLOENZIM: KOMPLEKS ANTARA RNA POL DGN FAKTOR σ

� TERMINATOR: URUTAN TERTENTU PADA MOLEKUL DNA YANG MENANDAI TRANSKRIPSI BERAKHIR.

� TERMINATOR: PROTEIN RHO DAN STEM-LOOP

� KECEPATAN SINTESIS RNA SEKITAR 30 SAMPAI 60 NUKLEOTIDA/DETIK

� ASAM RIBONUKLAEAT TRIFOSFAT (rNTP)

� RIFAMPIN MENGHAMBAT PERTUMBUHAN MIKROBA DENGAN CARA MENGGANGGU PROSES TRANSKRIPSI

INISIASI1. KOMPLEKS RNA POL DGN FAKTOR SIGMA BERJALAN

SEPANJANG MOLEKUL DNA MENCARI PROMOTOR2. KOMPLEKS BERIKATAN DENGAN PROMOTOR3. UNTAI GANDA DNA TERPISAH4. FAKTOR SIGMA DILEPASKAN5. INISIASI TRANSKRIPSI TERJADIELONGASI1. RNA POL MEMPERPANJANG rNTP DENGAN ARAH 5’ KE 3’2. rNTPYANG DITAMBAHKAN HARUS KOMPLEMEN DENGAN

URUTAN DNA CETAKANTERMINASI1. TRANSKRIPSI BERAKHIR: PROTEIN RHO/STEM-LOOP

© 2005 W. H. Freeman Pierce, Benjamin.

Genetics: A Conceptual Approach, 2nd ed.

(New York: W. H. Freeman and Company),

357. Used with permission. All rights reserved.

Sintesis protein

� PROSES SINTESIS PROTEIN BERDASARKAN INFORMASI PADA

mRNA

� BERLANGSUNG DI DALAM SITOPLASMA

� UJUNG 5’ mRNA MEMPUNYAI URUTAN TERTENTU YANG

MENGENALI RIBOSOM

� URUTAN INI DISEBUT RIBOSOM BINDING SITE (RBS)

� ANTIBIOTIK AMINOLIKOSIDA, KLINDAMISIN, TETRASIKLIN,

KLORAMFENIKOL BEKERJA MENGHAMBAT SINTESIS PROTEIN

PADA BAKTERI

� RIBOSOM (SUBUNIT 30S DAN 50S): TEMPAT TRANSLASI

� KODON INISIASI/START: AUG (Metionin

� KODON STOP: UAA, UGA, UAG

� FAKTOR INISIASI

� FAKTOR ELONGASI

� tRNA, GTP, ATP, mRNA

� RIBOSOM BINDING SITE (RBS): TEMPAT AWAL TRANSLASI

� RELEASE FACTOR

Struktur

ribosom