8/17/2019 enzim 3.ppt

1/28

May 16, 2016   1

mRNA protein   Sifat

translasi

transkripsi

ekspresi

8/17/2019 enzim 3.ppt

2/28

May 16, 2016   2

• 30 % dari total berat kering sel tumbuhan adalah

 protein

• Merupakan penyusun sitoskeletal sel, atau dapat pula sebagai cadangan makanan: misalnya dalam

biji 

•

Terdiri atas rantai asam amino yang panjang yangdihubungkan oleh ikatan peptida

Protein (1)

8/17/2019 enzim 3.ppt

3/28

May 16, 2016   3

•  20 asam amino penyusun protein memiliki sifat yang

beragam seperti hydrophylic (polar) danhydrophobic (non polar), gugus polar bermuatan

atau netral, atau gugus yang bersifat asam maupun

basa

Protein (2)

8/17/2019 enzim 3.ppt

4/28

May 16, 2016   4

• isintesis sebagai sebuah rantai linier   dalam

ribosom, namun ketika protein tersebut dilepaskan

dari ribosom, secara spontan akan melipat

membentuk struktur 3 dimensi yang dikenal sebagainati!e state, dan dikenal sebagai  "onformasi 

• Denaturasi adalah hilangnya siat tiga dimensi yang

unik ini, dan berakibat pada hilangnya akti!itaskatalitik ini

Protein (3)

8/17/2019 enzim 3.ppt

5/28

May 16, 2016   "

Struktur primer:  sekuen asam#asam aminopenyusunprotein

Struktur sekunder: unit#unit struktural lokal dan reguler

yang dihubungkan dengan ikatan hidrogen

Struktur tersier:  struktur tiga dimensi dari polipeptida

yang merupakan asosiasi dari beberapa struktur

sekunder yang disertai dengan pelepasan pelarut$

Struktur kuarter:  asosiasi dua atau lebih dari strukturtersier polipeptida %sub unit& membentuk sebuah

kompleks

Struktur protein

8/17/2019 enzim 3.ppt

6/28

May 16, 2016   6

o 'ungsi utama protein dalam metabolisme adalah

sebagai enzim

o (n)im adalah katalis biologi yang mampu

meningkatkan laju reaksi#reaksi biokimia*i

o (n)im terlibat dalam reaksi tetapi se+ara

undamental tidak berubah selama reaksi tersebut

ENZIM (1)

8/17/2019 enzim 3.ppt

7/28May 16, 2016  

-iri utama en)im adalah.

#$ pesifitas. yaitu kemampuan en)im untuk

membedakan molekul yang sangat mirip, karena

tahap pertama reaksi yang dikatalisis oleh en)im

adalah pembentukan kompleks en)im#substrat

 2$ &fisiensi   katalisis yang jauh melebihi katalis biasa,

dan mampu meningkatkan ke+epatan reaksi

sampai 108#1012 kali reaksi biasa

3$ Dipengaruhi oleb beberapa ma+am kontrol

pengaturan %regulatory +ontrol&

ENZIM (2)

8/17/2019 enzim 3.ppt

8/28May 16, 2016   /

(n)im biasanya bekerja eekti pada suhu dan

tekanan atmoser ruang, dengan range p yangsempit dan mendekati netral

8/17/2019 enzim 3.ppt

9/28May 16, 2016  

Penamaan enzim 

1$ erdasarkan nama substrat dan diberi akhiranase

2$ Didasarkan pada reaksi yang dikatalisis

-ontoh.

malat dehidrogenase

5(5 karboksilase

8/17/2019 enzim 3.ppt

10/28May 16, 2016   10

eluruh en)im adalah protein, meskipun demikian

ada beberapa kompleks 789#protein yang bersiat

seperti en)im pada prosesing 789 5ada umumnya en)im hanya memiliki satu tipe

akti!itas katalitik  yang terkait dengan protein yang

sama

8/17/2019 enzim 3.ppt

11/28

May 16, 2016   11

:soen)im;iso)im  adalah beberapa ensim yang

dikodekan oleh beberapa gen berbeda, tetapimemiliki ungsi katalisis yang mirip

8/17/2019 enzim 3.ppt

12/28

May 16, 2016   12

(n)im sering kali mengandung gugus prostetik non

protein %disebut koaktor&

eberapa koaktor.

1& :on logam. oen)im.  biasanya !itamin atau turunan

!itamin yang berungsi sebagai karier;

pemba*a 89D;89D, '9D;'9D2

8/17/2019 enzim 3.ppt

13/28

May 16, 2016   13

Katalis mempercepat sebuah reaksidengan cara menurunkan energy

barrier   antara substrat denganproduk, tetapi mereka tidakdigunakan, dan terbentuk kembali

setelah reaksi

Katalis meningkatkan laju reaksi

tetapi tidak merubah kesetimbanganrasio reaktan-produk, karena reaksibolak-baliknya dipercepat dengan

cara yang sama

8/17/2019 enzim 3.ppt

14/28

May 16, 2016   14

Enzim berperan sebagai  kataliskarena enzim mampu menurunkanenergi bebas pengaktif padasebuah reaksi,  dengan carameningkatkan energi bebas

ground state  dan menurunkanenergi bebas transisi

8/17/2019 enzim 3.ppt

15/28

May 16, 2016   1"

(nergi bebas

Tidak dikatalisis en)im

Dikatalisis en)im

ubstrat

5roduk

8/17/2019 enzim 3.ppt

16/28

May 16, 2016   16

Sisi katalitik Enzim biasanya berupa

lekukan/kantung dekat denganpermukaan enzim

Sisi katalitik enzim  terdiri dari duakomponen yaitu binding site  dangugus katalitik (biasanya beruparantai asam amino dan/atau kofaktoryang dapat berperan sebagai katalis)

aktor yang paling menentukandalam katalisis adalah interaksilangsung antara enzim dan substrat

8/17/2019 enzim 3.ppt

17/28

May 16, 2016   1

Penghambatan Aktivitas Enzim

!nhibitor  adalah setiap agensia yangmenurunkan kecepatan reaksi yangdikatalisis oleh enzim

 "ika penghambatan bersifat irre#ersibel,senya$a penghambatnya disebutinacti#ator%

&cti#ator adalah agensia lain yangdapat meningkatkan e'siensi enzim

8/17/2019 enzim 3.ppt

18/28

May 16, 2016   1/

Macam inhibitor

!nhibitor irre#ersibel  adalah inhibitoryang membentuk ikatan ko#alendengan enzim atau yangmendenaturasi enzim

!nhibitor re#ersibel  adalah inhibitoryang membentuk ikatan non-ko#alen

yang lemah dengan sebuah enzimyang efeknya dapat berupapenghambatan kompetitif, non

kompetitif atau campuran

8/17/2019 enzim 3.ppt

19/28

May 16, 2016   1

enghambatan kompetitif   adalah

penghambatan yang terjadi karenainhibitor berikatan dengan sisi aktifdengan a'nitas yang sama atau lebihbesar dari substrat

enghambatan non-kompetitif  adalah jika inhibitor tidak bersaing dengansubstrat untuk berikatan dengan sisi

aktif 

enghambatan campuran  adalahpenghambatan yang terjadi akibat

terjadinya kompleks substrat, enzim

8/17/2019 enzim 3.ppt

20/28

May 16, 2016   20

Pengaruh pH pada reaksi yangdikalisis enzim

Enzim sangat sensistif terhadap p* karena gugus katalisis biasanya dapatdiionisasi, dan gugus tersebut hanyaaktif pada satu jenis ionisasi% p* jugaberpengaruh terhadap perubahan

konformasi polipeptida%

8/17/2019 enzim 3.ppt

21/28

May 16, 2016   21

Pengaruh suhu pada reaksi yangdikalisis enzim

+aju kecepatan reaksi yang dikatalisisoleh enzim meningkat secaraeksponensial dengan meningkatnyasuhu, namun karena enzim adalahprotein, ada faktor lain yang berperanyaitu denaturasi

8/17/2019 enzim 3.ppt

22/28

May 16, 2016   22

Faktor lain yang berpengaruhpada reaksi yang dikalisis

enzim (1)

engaruh peningkatan konsentrasisubstrat% Sampai batas tertentupeningkatan konsentrasi substrat akanmeningkatkan laju reaksi%

engaruh peningkatan konsentrasiensim% ada kondisi substrat berlebih,penambahan enzim akan meningkatkanlaju reaksi secara linier

8/17/2019 enzim 3.ppt

23/28

May 16, 2016   23

Faktor lain yang berpengaruhpada reaksi yang dikalisis enzim

()

engaruh zat-zat yang mengendapkan

protein% Setiap zat yang mampumengendapkan protein akanmenghambat akti#itas enzim

engaruh lamanya reaksi% ada a$alnyaterjadi hubungan linier antara $aktu danproduk, tetapi pada akhirnya akti#itasenzim menurun

8/17/2019 enzim 3.ppt

24/28

May 16, 2016   24

!egulasi aktivitas enzim (1)

1" #ontrol konsentrasi enzim"  "umlahenzim dalam sel dipengaruhi oleh lajusintesis dan degradasi enzim%

" #ompartementasi"  Enzim danakti#itas katalisis yang berbedamungkin berada pada tempat yang

berbeda di dalam sel%

8/17/2019 enzim 3.ppt

25/28

May 16, 2016   2"

!egulasi aktivitas enzim ()

$" Modi%kasi kovalen"  &dalah kontrolakti#itas enzim oleh adanyaphosphorilasi dan adenilisasi

&" Penghambatan umpan balik"  "ikaproduk akhir reaksi meningkat, makalaju pembentukan produk tersebut

menurun

8/17/2019 enzim 3.ppt

26/28

May 16, 2016   26

#ekhususan enzim

Kekhususan ikatan

Kekhususan gugusan

Kekhususan gugusan dan ikatan Kekhususan stereo

8/17/2019 enzim 3.ppt

27/28

May 16, 2016   2

#lasi%kasi enzim enzim (1)

*idrolisis (menggunakan air)

& *.* &* .*

% enambahan/embelahan& &

elepasan air,pelepasan/penambahan 0.

1%  2ransferase

& 0 &0

 2rans fosforilase, transaminase

8/17/2019 enzim 3.ppt

28/28

M 16 2016 2/

#lasi%kasi enzim enzim ()

3% !somerase

&0 &0

4% 5ehidrogenase&*  & (*)

6% .ksidase

&* 7 .  & *.

*  .  *.