データベース活用のための基礎知識医学系データベースの概要かったら、その文献データに付与された統制語で検索する複数の検索集合をつくる（件数・内容を確認）

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概要

２０２０年度

大学院基盤医科学実習「文献検索」

データベース活用のための基礎知識医学系データベースの概要

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基盤医科学実習「文献検索」の目的

医学系データベースの特徴を理解し、研究に必要な文献情報を効率よく引き出すスキルを習得する

データベースを検索して得た情報をもとに、論文を入手する方法を知る

はじめに

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基盤医科学実習「文献検索」

講義一覧

1. 概要

2. 医中誌Web

3. PubMed

4. Web of Science, JCR

5. OPAC 文献の取り寄せ

＊質問があればNUCTのチャット機能で問合せください！

はじめに

各動画の途中に「小テスト」が出題されます。NUCTで回答をしてください。

4

名古屋大学医学部図書館のサイト

https://www.med.nagoya-u.ac.jp/medlib/

よく使うデータベースへのリンク

はじめに

過去の講習会の資料など

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概要

１．データベース活用のための基礎知識

２．医学系データベースの概要

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１．データベース活用のための基礎知識

1-1 検索の方針

1-2 検索語入力の留意点

1-3 論理演算

1-4 部分一致（truncation）

1-5 シソーラス（thesaurus）①同義語の整理 ②関連語の組織化

1-6 自動マッピング機能

1-7 検索のコツ

前提：漏れとノイズ

漏れ：検索結果に必要としている論文や本が含まれていないこと

ノイズ：検索結果に必要としていない論文や本が含まれていること

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所蔵データ

ノイズ

漏れ

必要論文検索結果

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1-1 検索の方針

PICO…リサーチクエスチョンを定式化することができる枠組み

例「小児期に発症した成人喘息患者に対して、ステロイド剤の吸入は症状を緩和するか？」

P（Patient）:喘息・成人

I（Intervention）:ステロイド剤・吸入

C（comparison):他の治療

O（outcome）:予後

1. データベース活用のための基礎知識

⇒検索

⇒検索

AND

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1-2 検索語入力の留意点

異なる表記形

癌－がん－ガン, tumor－tumour

同義語＝言い換え

癌－悪性腫瘍, cancer－ tumor

語尾変化

biology－biological, kid－kids


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1-3 論理演算

AND（論理積）

A AND B

OR （論理和）

A OR B

NOT（論理差）

A NOT B

BA

BA

BA


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1-4 部分一致（truncation）

検索語（自然語）の一部を入力すると、同じ文字列をもつ文献を検索できる

＊、？、＄などの記号を前後に付与

前方一致代謝＊代謝異常

中間一致＊代謝＊基礎代謝量

後方一致＊代謝基礎代謝

※記号はデータベースによって異なるので注意する

医中誌Webのように記号付与が不要なデータベースもある


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1-5 シソーラス（thesaurus）

データベースが持つ一種の類語集

同義語を「統制語」に統一する

階層構造を持つ

上位語－下位語

文献データは、シソーラスに基づいた統制語を付与されている

主なデータベースのシソーラス

PubMed・・・「MeSH」 Medical SubjectHeadings

医中誌Web・・・「シソーラス用語」


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1-5 シソーラスの効果 ① 同義語の整理

統制語

Neoplasms

文献上の表現

CancerTumor

Neoplasm

MeSH

MeSHの例

統制語を使って検索することにより、言葉の表現の違いによる「検索もれ」を防ぐ


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階層構造をもつ

位置づけを知ることにより、的確な統制語がわかる

下位の概念も一括して検索できる(オプション）

MeSHの階層構造（Tree Structures)

Neoplasms by Site ［部位による…］

Thoracic Neoplasms ［胸部…］

Respiratory Tract Neoplasms ［気道…］

Lung Neoplasms ［肺…］

Bronchial Neoplasms ［気管支…］

Multiple Pulmonary Nodules ［多発性肺結節…］

1-5 シソーラスの効果 ② 関連語の組織化

上位

下位


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1-6 自動マッピング機能

シソーラスを持つデータベース特有の機能で自然語検索による「検索もれ」を防ぐ

自然語を入力すると、システムが自動的に適切な統制語を案内する(マッピング）

自然語と統制語の論理和検索になる

シソーラスにない場合は自然語単独で検索される


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1-7 検索のコツ

検索を進めるときは多い→ 少ないへ

検索結果０（ゼロ）件！→入力誤りでは？

精度の高い検索をするためにはシソーラスを活用する

自然語でとりあえず検索 → 検索結果で統制語を確認 → 統制語で再検索


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2-1 概要

2-2 データベースへのアクセスとガイド

2-3 実習を行わないデータベースの紹介① EBM関連のデータベース UpToDate

② EBM関連のデータベース Cochrane Collection

③ EBSCOhost で利用できる他のデータベース

④ 日本の論文をさがす CiNii Articles

⑤ 大学図書館の本をさがす CiNii Books

⑥ 学術文献専用の無料サーチエンジン Google Scholar


20引用文献

ImpactFactor

論文記事

MEDLINE etc

日本語

MEDLINEのインターネット版早い

← ↓ Web of Science と EBSCO から利用

EBM関連

CochraneCollection

最善の患者治療を支援

2-1 概要２．医学系データベースの概要

自宅からでも入手ＯＫ

名古屋大学電子ジャーナル・アクセスサービス

フルテキスト入手

http://sfx.nul.nagoya-u.ac.jp/nagoya?sid=Entrez:PubMed&id=pmid:21623910

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2-2 データベースへのアクセスとガイド ①

過去の講習会の資料など

よく使うデータベースへのリンク

https://www.med.nagoya-u.ac.jp/medlib/


22

2-2 データベースへのアクセスとガイド ②

http://www.nul.nagoya-u.ac.jp/index.html

①②


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2-2 データベースへのアクセスとガイド ③

①


②

③

http://www.nul.nagoya-u.ac.jp/guide/gsheets/index.html

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２－３実習を行わないデータベースの紹介①

EBM関連のデータベース UpToDate 1

日常の診療で生じる臨床上の疑問に対して、最新のエビデンスを使用し、具体的で実用的な回答を素早く容易に得るための臨床支援ツール

25の専門分野にわたる11,000件以上の臨床レビューには、9,500件を超える格付け推奨治療法が提供されている

（鶴舞キャンパス内のみ利用可）

https://www.uptodate.com/contents/search


26


①


UpToDate 2

②

27

UpToDate 3 検索画面

アカウントを取得する場合「登録」ボタンをクリック

検索語を入力して検索ボタンをクリック



28

UpToDate 4 検索結果画面


結果を展開する


29

UpToDate 5 トピックの表示例



30

UpToDate 6 トピックの参考文献からフルテキスト入手

①

②

PubMed、PubMedID

PDF

③

④



31

UpToDate 7 トピックで「図表」を表示

① ③

②



32

EBM関連のデータベース Cochrane Collection 1

Cochrane共同計画は、1992年イギリスの国民保健サービスの一環として始まった、治療・予防に関する医療技術を評価するプロジェクト

Cochrane Collectionは、共同計画が作成するデータベースで、EBM（Evidence BasedMedicine）の実践を支援するデータベース

厳選されたデータのみで、収録件数は多くない

http://search.ebscohost.com/


２－３実習を行わないデータベースの紹介②

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Cochrane Database of Systematic Reviews

システマティック･レビュー（ある医学的介入について、エビデンスを明らかにするために、一定基準で、世界中から論文を収集し、批判的評価、要約、公表するための方法）のフルテキストが入手できる

年４回更新

Cochrane Clinical Answers CDSRの質の高いエビデンスをQ&A形式で簡潔にまとめたもの

Cochrane Central Register of Controlled Trials 比較臨床試験の論文書誌情報データベース

Cochrane Methodology Register 比較臨床試験の方法に関する書誌データベース

Cochrane Collection 24つのデータベースが利用できます



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１．研究テーマの設定

２．研究結果を漏れなく収集

３．各研究の妥当性の評価

４．アブストラクトフォームに要約

５．メタアナリシスによる統計学的解析

６．結果の解釈

７．編集と定期的更新

システマティックレビューの手順

注：メタアナリシス（メタ分析）とは、過去に行われた複数の研究結果を統合して、より信頼性の高い結果を求めること、またはそのための手法や統計解析のこと



Cochrane Collection 3

36




37

①利用したいデータベースをチェック（複数選択可）

②続行ボタンをクリック




①

②

38

Cochrane Collection 6Cochrane Database of Systematic Reviewsの検索

検索語を入力して「検索」ボタンをクリック



39

Cochrane Collection 7検索結果からフルテキストを入手

①


「全文へのリンク」にチェック

③

②


PDF

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EBSCOhost で利用できる他の主なデータベース

MEDLINE （1809年～）

医学、看護学、薬学、歯学など医学系

PubMedと収録データ（5,600誌以上）はほぼ同じ。タイムラグあり

Academic Search Premier （1975 年以前のPDFも

利用可能）

4,600 を超える学術誌の全文

＊複数のデータベースの同時検索も可能

▼ 詳しい検索方法「EBSCOhost2.0 検索ガイド」

http://www.nul.nagoya-u.ac.jp/db/guide-ebsco.pdf


２－３実習を行わないデータベースの紹介③

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日本の論文をさがす CiNii Articles 1

学術論文データベース

学協会刊行物・大学研究紀要・国立国会図書館の雑誌記事索引

データベースなどの学術論文情報が検索できる

※ 医学分野の学術商業誌は収録対象外

収録件数：約 2,150万件(2019.3現在）

検索結果からフルテキストの入手可能（一部有料）

https://ci.nii.ac.jp/


２－３実習を行わないデータベースの紹介④

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CiNii Articles 2 検索画面と結果一覧

フルテキストへのリンク

など

②

①

③



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CiNii Articles 3 検索結果からフルテキストを入手

①



②

③

45

大学図書館の本をさがす CiNii Books

https://ci.nii.ac.jp/books/

切り替え①

② ③

全国の大学図書館等の所蔵情報が分かる


２－３実習を行わないデータベースの紹介⑤

46

学術文献専用の無料サーチエンジン Google Scholar

https://scholar.google.co.jp/


２－３実習を行わないデータベースの紹介⑥

①被引用数が表示される

フルテキストへのリンク

②

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以上で「概要」を終わります。

質問があればNUCTのフォーラムに投稿してください。

Documents

データベース活用のための基礎知識 医学系データベースの概要かったら、その文献データに付与された統制語で検索する 複数の検索集合をつくる（件数・内容を確認）

データベース活用のための基礎知識医学系データベースの概要かったら、その文献データに付与された統制語で検索する複数の検索集合をつくる（件数・内容を確認）