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Investigadores españoles descubren el papel de RAB7 en la formación del melanoma La rapamicina revela su potencial para la terapia génica de enfermedades hematológicas Una mutación en el gen VPS35 asociada al Párkinson altera el reciclaje de proteínas en la célula Reconstrucción de la historia genética de una célula
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Geneacutetica Meacutedica News
MedigenePress SL Volumen 1 Nuacutemero 2 15 Julio 2014
Investigadores espantildeoles descubren el papel de RAB7 en la formacioacuten del melanoma
La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades hematoloacutegicas
Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de proteiacutenas en la ceacutelula
Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula
Imagen cortesiacutea de wwwbcd3dcom
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 1
revistageneticamedicacom
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Equipo de Geneacutetica Meacutedica News
Direccioacuten Dr Manuel Peacuterez Alonso Redaccioacuten y edicioacuten Dr Amparo Tolosa Gestioacuten Loreto Crespo Marketing y presencia en Internet Vicent Ferrer
Geneacutetica Meacutedica News
MedigenePress SL sus trabajadores y colaboradores no asumen ninguna responsabilidad derivada del uso incorrecto de la informacioacuten facilitada en la paacutegina web
revistageneticamedicacom y en el boletiacuten de noticias Geneacutetica Meacutedica News o de la presencia de errores u omisiones La mencioacuten de cualquier meacutetodo terapia
tratamiento o servicio no debe ser considerado una garantiacutea para su utilizacioacuten El contenido de Geneacutetica Meacutedica News tiene una uacutenica finalidad informativa De‐
terminar el tratamiento adecuado para un paciente es responsabilidad de los meacutedicos y facultativos El contenido de la publicacioacuten Geneacutetica Meacutedica News no es en
modo alguno sustituto del consejo proporcionado por personal profesional de la salud cualificado MedigenePress SL recomienda consultar de forma indepen‐
diente otras fuentes asiacute como a otros profesionales antes de confiar en la fiabilidad de un tratamiento
Geneacutetica Meacutedica News nace con el objetivo de comunicar los uacuteltimos avances en el aacuterea de la Ge‐neacutetica Meacutedica y Medicina Genoacutemica novedades en el desarrollo de teacutecnicas geneacuteticas de diagnoacutes‐tico estudios de los procesos moleculares que intervienen en las enfermedades humanas meacutetodos de informacioacuten y asesoramiento a pacientes afectados por enfermedades de componente heredi‐tario cursos y congresos Con esta iniciativa confiamos en promover la comprensioacuten y el intereacutes por la geneacutetica meacutedica entre los profesionales de la salud asiacute como entre los investigadores del aacuterea de la Biomedicina Del mis‐mo modo invitamos a los investigadores y centros de investigacioacuten a difundir sus resultados y compartir informacioacuten sobre cursos y congresos del aacuterea utilizando este canal de comunicacioacuten
Geneacutetica Meacutedica News
La presente obra estaacute bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento 40 Internacional
Comiteacute Editorial
Dra Mordf Joseacute Calasanz Abinzano Catedraacutetica de Universidad Departamento de Bioquiacutemica y Geneacutetica Directora del Servicio de Anaacutelisis Geneacuteticos Universidad de Navarra Dr Juan Cruz Cigudosa Jefe de grupo de Citogeneacutetica Molecular Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegi‐cas Dra Roser Gonzaacutelez Catedraacutetica de Geneacutetica Departamento de Geneacutetica Universitat de Barcelona Dr Adolfo Loacutepez de Munain Arregui Jefe de seccioacuten del Servicio de Neurologiacutea Hospital Universitario Donostia Director de Investigacioacuten del Aacuterea de Neuro‐ciencias del Instituto Biodonostia
Dr Joseacute Antonio Loacutepez Guerrero Jefe Cliacutenico del Laboratorio de Biologiacutea Mole‐cular Fundacioacuten del Instituto Valenciano de Oncolo‐giacutea (IVO) Dr Joseacute Mariacutea Millaacuten Facultativo de la Unidad de Geneacutetica del Insti‐tuto de Investigacioacuten Sanitaria IIS‐La Fe Director Adjunto del CIBERER‐Biobank Investigador CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER) Dra Mordf Dolores Moltoacute Profesora titular de Universidad Departamento de Geneacutetica de la Universitat de Valegravencia Investigadora CIBER de Salud Mental (CIBERSAM)
2 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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En este nuacutemero
Geneacutetica Meacutedica News
bull Investigadores espantildeoles descubren el papel de RAB7 en la formacioacuten del
melanoma | 5
bull La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades
hematoloacutegicas | 6
bull Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de
proteiacutenas en la ceacutelula | 7
bull Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula | 8
bull La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan
insulina | 9
bull Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas | 10
bull El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina | 11
bull Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos | 12
bull Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro | 13
bull El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes | 15
bull Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca | 16
bull Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo | 17
bull Microbioma el otro genoma del ser humano | 18
bull Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica | 19
bull Noticias Breves | 20
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 3
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Tiacutetulo Propio de la Universidad de Valencia
Dirigido a Titulados o graduados en Medicina Farmacia Biolo-giacutea Quiacutemica Bioquiacutemica Biotecnologiacutea Enfermeriacutea o cual-quier tiacutetulo en Ciencias de la Salud Estudiantes de uacuteltimo cur-so de las carreras previamente indicadas
Nordm de creacuteditos 45 creacuteditos
Preinscripcioacuten Hasta septiembre de 2014
Duracioacuten 12 semanas
Inicio y lugar Curso Presencial 25 de Septiembre de 2014 en fundacioacuten Universidad-Empresa de Valencia ADEIT
Investigadores del Centro Nacional de Investigacio‐
nes Oncoloacutegicas en colaboracioacuten con el Memorial
Sloan Ketterin Cancer Center de Nueva York y el Hos‐
pital 12 de Octubre en Madrid han identificado maacutes
de 40 genes que definen el grado de agresividad del
melanoma y lo distinguen de otros caacutenceres de mal
pronoacutestico
El trabajo dirigido por Mariacutea Soengas combina dife‐
rentes viacuteas para encontrar las moleacuteculas clave que
definen este tipo de caacutencer aproximacioacuten geneacutetica
anaacutelisis bioinformaacuteticos y caracterizacioacuten funcional
de las rutas implicadas en la formacioacuten del melano‐
ma Los investigadores compararon 900 liacuteneas celu‐
lares de hasta 35 tipos tumorales y encontraron que
muchos de los genes cuya expresioacuten aumenta en el
melanoma estaacuten implicados en la formacioacuten de en‐
dosomas vesiacuteculas mediante las cuales las ceacutelulas
tumorales incorporan componentes del entorno y
obtienen energiacutea a partir su degradacioacuten
Entre estos genes relacionados con la formacioacuten de
endosomas los investigadores descubrieron el papel
criacutetico que realiza la proteiacutena RAB7 (RAB7A member
RAS oncogene family) en las ceacutelulas del melanoma
RAB7 es una proteiacutena implicada en la formacioacuten y
degradacioacuten de lisosomas (vesiacuteculas de digestioacuten
celulares) cuyo gen codificante se localiza en una
regioacuten cromosoacutemica frecuentemente alterada en
melanoma Sin embargo no existiacutean evidencias pre‐
vias de un papel importante de la proteiacutena en la for‐
macioacuten de tumores Con este estudio el equipo de
Mariacutea Soengas ha determinado que en presencia de
altas concentraciones de RAB7 la autodigestioacuten ce‐
lular se muestra muy activa lo que permite a las ceacutelu‐
las tumorales obtener energiacutea dividirse y proliferar
Sin embargo cuando los niveles de RAB7 se reducen
se produce un cambio fenotiacutepico en las ceacutelulas que
favorece su diseminacioacuten por el organismo iniciando
el proceso de metaacutestasis
Estos resultados tienen gran relevancia tanto a nivel
baacutesico para determinar los procesos moleculares
que intervienen en la formacioacuten y evolucioacuten del mela‐
noma e identificar sus puntos deacutebiles como a nivel
cliacutenico doacutende la cantidad de RAB7 presente en el
tumor cutaacuteneo puede informar sobre el riesgo a
desarrollar metaacutestasis
Por uacuteltimo la participacioacuten de RAB7 y su importancia
en el control de los endosomas permiten entender el
mecanismo de accioacuten de BO‐110 agente basado en
nanopartiacuteculas de ARN y desarrollado en el mismo
grupo de investigacioacuten de Mariacutea Soengas que resulta
letal para las ceacutelulas del melanoma y otros tumores
ldquoSabiacuteamos coacutemo nuestros nanocomplejos actuacutean
dentro de las ceacutelulas tumorales pero no coacutemo se in‐
corporan selectivamente en ellasrdquo indica Soengas
El tamantildeo del compuesto hace necesario que las ceacute‐
lulas formen endosomas para incorporarlo Como la
formacioacuten de endosomas es muy activa en las ceacutelulas
tumorales las nanopartiacuteculas soacutelo seraacuten incorpora‐
das por este tipo de ceacutelulas y no por las ceacutelulas nor‐
males adyacentes que evitaraacuten por tanto sus efec‐
tos toacutexicos
Referencia Alonso‐Curbelo D et al RAB7 Controls
Melanoma Progression by Exploiting a Lineage‐
Specific Wiring of the Endo‐ lysosomal Path‐
way Cancer Cell 26 1‐16 July 14 2014 http
dxdoiorg101016jccr201404030
Fuente cnioes
Investigadores espantildeoles descubren el papel de RAB7 en la formacioacuten del melanoma
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 5
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El trasplante de ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas mo‐
dificadas geneacuteticamente supone una terapia muy
prometedora para el tratamiento de las enfermeda‐
des geneacuteticas de la sangre el VIH o la leucemia La
modificacioacuten de las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas
se lleva a cabo utilizando lentivirus inactivados que
introducen los genes de intereacutes en las ceacutelulas en un
proceso similar a la infeccioacuten llevada a cabo por la
forma activa de este tipo de virus con la diferencia
de que en lugar de integrar genes relacionados con
la patogenicidad del virus lo que se integra en el ge‐
noma de la ceacutelula hueacutesped son genes destinados a
expresarse con fines terapeacuteuticos Todo ello sin pro‐
vocar una respuesta inmune
El eacutexito de la terapia geacutenica mediante el uso de ceacutelu‐
las madre hematopoyeacuteticas modificadas radica en
dos puntos clave la eficiencia en la transferencia e
incorporacioacuten de los genes en las ceacutelulas proceso
que involucra a los mencionados virus inactivados y
que se realiza fuera del organismo y el manteni‐
miento de las propiedades bioloacutegicas de las ceacutelulas
madre utilizadas para que al ser introducidas en el
paciente se dividan y den lugar a nuevas ceacutelulas que
expresen el gen de intereacutes
Investigadores del The Scripps Research Institute han
descubierto que el faacutermaco rapamicina utilizado
normalmente para retrasar el crecimiento del caacutencer
o prevenir el rechazo de trasplantes aumenta la in‐
corporacioacuten del ADN en las ceacutelulas madre hematopo‐
yeacuteticas sin alterar sus caracteriacutesticas
o comportamiento
El equipo del The Scripps Research Institute dirigido
por Bruce Torbett demostroacute que la rapamicina au‐
menta la eficiencia de la terapia geacutenica con lentivirus
en ceacutelulas del cordoacuten umbilical humano y en ceacutelulas
madre hematopoyeacuteticas de ratoacuten y que lo hace me‐
diante la inhibicioacuten de la ruta molecular mTOR Ade‐
maacutes la rapamicina previene la diferenciacioacuten de las
ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas lo que resulta criacuteti‐
co no soacutelo para poder amplificar las ceacutelulas modifica‐
das y obtener la cantidad necesaria para el trata‐
miento sino que tambieacuten facilita el trabajo de los
cientiacuteficos reduciendo la limitacioacuten de tiempo que
teniacutean desde la extraccioacuten de las ceacutelulas madre hasta
que tras su modificacioacuten las ceacutelulas estaban prepa‐
radas para introducirse en el organismo receptor
ldquoQueriacuteamos estar seguros de que las condiciones que
usaacutebamos preservaban las ceacutelulas madre por lo que
si las trasplantaacutebamos de nuevo a nuestros animales
modelo se comportariacutean como las ceacutelulas madre ori‐
ginalesrdquo indica Torbett
A falta de iniciar los estudios precliacutenicos con otros
modelos animales para confirmar la seguridad y efec‐
tividad del meacutetodo antes de ser utilizado en huma‐
nos los resultados obtenidos resultan muy positivos
y los autores del trabajo confiacutean en que la utilizacioacuten
de la rapamicina durante la modificacioacuten geneacutetica de
las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas pueda llegar a ser
utilizada a nivel cliacutenico ldquoNuestros meacutetodos podriacutean
reducir los costes y la cantidad de preparacioacuten que
supone la modificacioacuten de las ceacutelulas madre sanguiacute‐
neas para la terapia geacutenica utilizando vectores vira‐
les Esto hariacutea la terapia geacutenica accesible a maacutes pa‐
cientesrdquo indica Cathy Wang coautora del trabajo
Una ventaja es que el faacutermaco rapamicina ya se utili‐
za en la praacutectica cliacutenica por lo que su uso en humanos
ya estaacute aprobado
Referencia Wang CX et al Rapamycin relieves lenti‐
viral vector transduction resistance in human and
mouse hematopoietic stem cells Blood 2014 Jun 9
pii blood‐2013‐12‐546218
Fuentehttpwwwscrippsedunewsandviews
e_20140630torbetthtml
La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades hematoloacutegicas
Geneacutetica Meacutedica News
6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de proteiacutenas en la ceacutelula
Geneacutetica Meacutedica News
Un estudio colaborativo de la Universidad de Bristol
el Centro Meacutedico de la Universidad de Texas South‐
western y la Cliacutenica Mayo revela que una mutacioacuten
en el gen VPS35 asociada a la enfermedad de Parkin‐
son altera una ruta de transporte de proteiacutenas en la
ceacutelula
El gen VPS35 (vacuolar protein sorting 35 homolog)
codifica para un componente del retroacutemero comple‐
jo proteico responsable del reciclaje de los receptores
de la membrana de los endosomas (vesiacuteculas mem‐
branosas de la ceacutelula que proporcionan un espacio
donde distribuir diferentes compuestos antes de su
degradacioacuten por los lisosomas) hacia la membrana
celular o del aparato de Golgi Estudios previos ha‐
biacutean identificado mutaciones en el gen asociadas a
formas esporaacutedicas de Paacuterkinson con herencia de
tipo autosoacutemica dominante Sin embargo los efec‐
tos de estas mutaciones no habiacutean sido totalmente
caracterizados
El equipo de investigadores observoacute que la presencia
de la forma mutante de VPS35 D620N que presenta
un cambio de aminoaacutecido en su estructura primaria
daba lugar a una alteracioacuten en el reciclaje de los en‐
dosomas destinados al aparato de Golgi mantenieacuten‐
dose intacto el de aquellos dirigidos a la membrana
plasmaacutetica Ademaacutes la comparacioacuten de las proteiacutenas
de la ceacutelula que interaccionan con la forma mutante y
las que interaccionan con la forma natural de VPS35
reveloacute que el efecto principal de la mutacioacuten es una
disminucioacuten en la afinidad de VPS35 con FAM21
(family with sequence similarity 21) componente del
complejo WASH (Wiskott‐Aldrich siacutendrome and SCAR
homolog) que regula el reciclaje de los endosomas
hacia el aparato de Golgi y que como consecuencia
de la menor interaccioacuten entre sus componentes este
complejo no funcionaba de modo correcto
El profesor Peter Cullen director del trabajo ha ma‐
nifestado que el descubrimiento de los defectos mo‐
leculares asociados a la mutacioacuten en VPS35 ofrece un
camino muy interesante para la investigacioacuten de las
causas del Paacuterkinson y apunta al retroacutemero como
una potencial diana terapeacuteutica para el disentildeo de
faacutermacos destinados a combatir eacutesta y otras enfer‐
medades neurodegenerativas
Referencia McGough IJ et al Retromer Binding to
FAM21 and the WASH Complex Is Perturbed by the
Parkinson Disease‐Linked VPS35(D620N) Mutation
Curr Biol 2014 Jun 25 pii S0960‐9822(14)00740‐4
doi 101016jcub201406024
Fuentehttpwwwbristolacuknews2014june
parkinsons‐researchhtml
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 7
revistageneticamedicacom
Traacutefico vesicular en el interior de la ceacutelula
Imagen Judith Stoffer (Image and Video Galery NIH)
Todas las ceacutelulas de un ser humano provienen de una
uacutenica ceacutelula original que a traveacutes de sucesivas divi‐
siones va dando lugar a los diferentes linajes celula‐
res y tejidos A lo largo de la vida de un individuo sus
ceacutelulas acumulan mutaciones en el material geneacuteti‐
co denominadas mutaciones somaacuteticas debido a
que no proceden de sus padres Estas mutaciones
constituyen un registro molecular de los antepasados
de cada ceacutelula y pueden ser utilizadas para recons‐
truir su historia
Un equipo de investigadores del Wellcome Trust San‐
ger Institute en el Reino Unido en colaboracioacuten con
otros centros internacionales acaba de publicar en la
revista Nature la reconstruccioacuten de las divisiones y
mutaciones ocurridas en un conjunto de linajes celu‐
lares de ratoacuten desde el estadiacuteo embrionario hasta la
edad adulta
Los investigadores tomaron ceacutelulas individuales del
estoacutemago intestino delgado e intestino grueso de
dos ratones adultos y las crecieron hasta obtener liacute‐
neas clonales que proporcionaran suficiente ADN
para su anaacutelisis Entonces secuenciaron el genoma
completo de las 25 lineas clonales obtenidas asiacute co‐
mo el ADN extraiacutedo de la cola de los ratones La
comparacioacuten del genoma de cada liacutenea clonal con el
genoma de ratoacuten de referencia permitioacute identificar
las mutaciones somaacuteticas que se habiacutean acumulado
en cada linaje y la comparacioacuten entre los genomas de
las liacuteneas clonales permitioacute tras diferen‐
tes aproximaciones computacionales obtener un aacuter‐
bol filogeneacutetico que reflejara los cambios geneacuteticos
producidos desde los estadiacuteos embrionarios hasta las
ceacutelulas del tejido adulto
El anaacutelisis de la reconstruccioacuten proporciona diferen‐
tes conclusiones La primera de ellas es que las ceacutelu‐
las hijas obtenidas en las divisiones celulares del em‐
brioacuten temprano no contribuyen siempre de la misma
manera en los tejidos adultos Otra conclusioacuten es que
los diferentes tejidos adquieren diferente frecuencia
de mutaciones somaacuteticas algo que puede ser expli‐
cado por una diferente tasa de mutacioacuten en los teji‐
dos o por diferencias en la tasa de divisioacuten de los lina‐
jes desde la fertilizacioacuten del oacutevulo Por uacuteltimo en es‐
te estudio los investigadores obtienen liacuteneas clona‐
les a partir de ceacutelulas individuales pero es de esperar
que en el futuro las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten per‐
mitan secuenciar el genoma de una uacutenica ceacutelula de
forma que se puedan obtener filogenias celulares
precisas
Las implicaciones del estudio son importantes El
registro de mutaciones somaacuteticas puede reflejar la
evolucioacuten de las ceacutelulas normales a ceacutelulas cancero‐
sas asiacute como proporcionar informacioacuten sobre el
desarrollo de diferentes tejidos Sam Behjati primer
autor del trabajo lo expresa de la siguiente manera
ldquoSi podemos entender coacutemo mutan las ceacutelulas nor‐
males sanas conforme se van dividiendo a lo largo
de la vida de una persona ganaremos un conoci‐
miento fundamental de como difieren de las ceacutelulas
del caacutencerrdquo
Referencia Behjati S et al Genome sequencing of
normal cells reveals developmental lineages and muta‐
tional processes Nature 2014 DOI101038
nature13448
Fuentehttpswwwsangeracukabout
press2014140629html
Geneacutetica Meacutedica News
Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula
8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una de las aproximaciones terapeacuteuticas maacutes atractivas
para el tratamiento de la diabetes es la obtencioacuten de ceacutelu‐
las productoras de insulina que puedan ser trasplantadas
a los pacientes para compensar la falta de funcioacuten de sus
propias ceacutelulas La mayor parte de los esfuerzos para pro‐
ducir estas factoriacuteas celulares de insulina se ha concentra‐
do en la utilizacioacuten de ceacutelulas madre bien embrionarias
bien de pluripotencia inducida para diferenciarlas en ceacutelu‐
las beta‐pancreaacuteticas con resultados que si bien son pro‐
metedores no terminan de reunir todas las caracteriacutesti‐
cas funcionales necesarias
Esta semana investigadores del Naomi Berrie Diabetes
Center de la Universidad de Columbia EEUU han publi‐
cado un trabajo con un planteamiento diferente han con‐
seguido mediante la inactivacioacuten de un uacutenico gen el gen
FOXO1 (forkhead box O1) que ceacutelulas gastrointestinales
humanas produzcan insulina
La idea no es nueva ya que el mismo equipo de investiga‐
dores consiguioacute hace dos antildeos que ceacutelulas del intestino de
ratoacuten liberaran insulina en respuesta a los niveles de glu‐
cosa y que ademaacutes normalizaran la concentracioacuten de
glucosa en sangre en ratones modelo para la diabetes Sin
embargo faltaba llevar a cabo la prueba de concepto que
demostrara la efectividad del meacutetodo en humanos ldquoAl
mostrar que las ceacutelulas humanas pueden responder del
mismo modo que las ceacutelulas de ratoacuten hemos despejado
un obstaacuteculo y podemos seguir adelante para intentar
convertir este tratamiento en una realidadrdquo ha comenta‐
do Domenico Accili director del trabajo
La utilizacioacuten de ceacutelulas gastrointestinales y no de otro
tipo no fue una decisioacuten tomada al azar Evidencias pre‐
vias indicaban que las ceacutelulas endocrinas pancreaacuteticas y
enteacutericas pueden convertirse en diferentes tipos celula‐
res posiblemente mediante su desdiferenciacioacuten Antes
de iniciar el experimento de inactivacioacuten del gen el equi‐
po de Accili identificoacute su presencia en el intestino hu‐
mano y observoacute que de forma similar al ratoacuten el gen es
especiacutefico de los progenitores de las ceacutelulas endocrinas y
ceacutelulas positivas para serotonina Para ver el efecto de la
inhibicioacuten de FOXO1 en humanos el equipo generoacute orga‐
noides intestinales pequentildeas reacuteplicas del intestino que
reproducen sus caracteriacutesticas funcionales a partir de
ceacutelulas madre pluripotenciales inducidas humanas La
inactivacioacuten del gen FOXO1 en estos organoides derivoacute en
la transformacioacuten de las ceacutelulas en ceacutelulas productoras de
insulina y lo que es maacutes importante la liberacioacuten de insu‐
lina se produciacutea en las condiciones fisioloacutegicas adecuadas
es decir en respuesta a los niveles de glucosa
Los resultados obtenidos en el estudio ofrecen una viacutea
interesante para generar grandes cantidades de ceacutelulas
productoras de insulina que podriacutean ser trasplantadas en
pacientes diabeacuteticos No obstante el objetivo principal de
los autores es conseguir la inhibicioacuten de FOXO1 in vivo en
el propio paciente para transformar directa y especiacutefica‐
mente las ceacutelulas endocrinas del intestino en ceacutelulas pro‐
ductoras de insulina De momento ya estaacuten buscando un
faacutermaco capaz de inhibir FOXO1 en las ceacutelulas gastroin‐
testinales
Referencia Bouchi R et al FOXO1 inhibition yields fun‐
ctional insulin‐producing cells in human gut organoid cultu‐
res Nature Communications 5 2014 DOI101038
ncomms5242
Fuente httpnewsroomcumccolumbiaedu
Geneacutetica Meacutedica News
La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan insulina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 9
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
Geneacutetica Meacutedica News
Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
Geneacutetica Meacutedica News
El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
revistageneticamedicacom
Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
Geneacutetica Meacutedica News
Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
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14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
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El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
Geneacutetica Meacutedica News
Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
Geneacutetica Meacutedica News
Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
Geneacutetica Meacutedica News
Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
Geneacutetica Meacutedica News
22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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Geneacutetica Meacutedica News
La presente obra estaacute bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento 40 Internacional
Comiteacute Editorial
Dra Mordf Joseacute Calasanz Abinzano Catedraacutetica de Universidad Departamento de Bioquiacutemica y Geneacutetica Directora del Servicio de Anaacutelisis Geneacuteticos Universidad de Navarra Dr Juan Cruz Cigudosa Jefe de grupo de Citogeneacutetica Molecular Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegi‐cas Dra Roser Gonzaacutelez Catedraacutetica de Geneacutetica Departamento de Geneacutetica Universitat de Barcelona Dr Adolfo Loacutepez de Munain Arregui Jefe de seccioacuten del Servicio de Neurologiacutea Hospital Universitario Donostia Director de Investigacioacuten del Aacuterea de Neuro‐ciencias del Instituto Biodonostia
Dr Joseacute Antonio Loacutepez Guerrero Jefe Cliacutenico del Laboratorio de Biologiacutea Mole‐cular Fundacioacuten del Instituto Valenciano de Oncolo‐giacutea (IVO) Dr Joseacute Mariacutea Millaacuten Facultativo de la Unidad de Geneacutetica del Insti‐tuto de Investigacioacuten Sanitaria IIS‐La Fe Director Adjunto del CIBERER‐Biobank Investigador CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER) Dra Mordf Dolores Moltoacute Profesora titular de Universidad Departamento de Geneacutetica de la Universitat de Valegravencia Investigadora CIBER de Salud Mental (CIBERSAM)
2 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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En este nuacutemero
Geneacutetica Meacutedica News
bull Investigadores espantildeoles descubren el papel de RAB7 en la formacioacuten del
melanoma | 5
bull La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades
hematoloacutegicas | 6
bull Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de
proteiacutenas en la ceacutelula | 7
bull Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula | 8
bull La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan
insulina | 9
bull Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas | 10
bull El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina | 11
bull Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos | 12
bull Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro | 13
bull El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes | 15
bull Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca | 16
bull Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo | 17
bull Microbioma el otro genoma del ser humano | 18
bull Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica | 19
bull Noticias Breves | 20
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 3
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4 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Tiacutetulo Propio de la Universidad de Valencia
Dirigido a Titulados o graduados en Medicina Farmacia Biolo-giacutea Quiacutemica Bioquiacutemica Biotecnologiacutea Enfermeriacutea o cual-quier tiacutetulo en Ciencias de la Salud Estudiantes de uacuteltimo cur-so de las carreras previamente indicadas
Nordm de creacuteditos 45 creacuteditos
Preinscripcioacuten Hasta septiembre de 2014
Duracioacuten 12 semanas
Inicio y lugar Curso Presencial 25 de Septiembre de 2014 en fundacioacuten Universidad-Empresa de Valencia ADEIT
Investigadores del Centro Nacional de Investigacio‐
nes Oncoloacutegicas en colaboracioacuten con el Memorial
Sloan Ketterin Cancer Center de Nueva York y el Hos‐
pital 12 de Octubre en Madrid han identificado maacutes
de 40 genes que definen el grado de agresividad del
melanoma y lo distinguen de otros caacutenceres de mal
pronoacutestico
El trabajo dirigido por Mariacutea Soengas combina dife‐
rentes viacuteas para encontrar las moleacuteculas clave que
definen este tipo de caacutencer aproximacioacuten geneacutetica
anaacutelisis bioinformaacuteticos y caracterizacioacuten funcional
de las rutas implicadas en la formacioacuten del melano‐
ma Los investigadores compararon 900 liacuteneas celu‐
lares de hasta 35 tipos tumorales y encontraron que
muchos de los genes cuya expresioacuten aumenta en el
melanoma estaacuten implicados en la formacioacuten de en‐
dosomas vesiacuteculas mediante las cuales las ceacutelulas
tumorales incorporan componentes del entorno y
obtienen energiacutea a partir su degradacioacuten
Entre estos genes relacionados con la formacioacuten de
endosomas los investigadores descubrieron el papel
criacutetico que realiza la proteiacutena RAB7 (RAB7A member
RAS oncogene family) en las ceacutelulas del melanoma
RAB7 es una proteiacutena implicada en la formacioacuten y
degradacioacuten de lisosomas (vesiacuteculas de digestioacuten
celulares) cuyo gen codificante se localiza en una
regioacuten cromosoacutemica frecuentemente alterada en
melanoma Sin embargo no existiacutean evidencias pre‐
vias de un papel importante de la proteiacutena en la for‐
macioacuten de tumores Con este estudio el equipo de
Mariacutea Soengas ha determinado que en presencia de
altas concentraciones de RAB7 la autodigestioacuten ce‐
lular se muestra muy activa lo que permite a las ceacutelu‐
las tumorales obtener energiacutea dividirse y proliferar
Sin embargo cuando los niveles de RAB7 se reducen
se produce un cambio fenotiacutepico en las ceacutelulas que
favorece su diseminacioacuten por el organismo iniciando
el proceso de metaacutestasis
Estos resultados tienen gran relevancia tanto a nivel
baacutesico para determinar los procesos moleculares
que intervienen en la formacioacuten y evolucioacuten del mela‐
noma e identificar sus puntos deacutebiles como a nivel
cliacutenico doacutende la cantidad de RAB7 presente en el
tumor cutaacuteneo puede informar sobre el riesgo a
desarrollar metaacutestasis
Por uacuteltimo la participacioacuten de RAB7 y su importancia
en el control de los endosomas permiten entender el
mecanismo de accioacuten de BO‐110 agente basado en
nanopartiacuteculas de ARN y desarrollado en el mismo
grupo de investigacioacuten de Mariacutea Soengas que resulta
letal para las ceacutelulas del melanoma y otros tumores
ldquoSabiacuteamos coacutemo nuestros nanocomplejos actuacutean
dentro de las ceacutelulas tumorales pero no coacutemo se in‐
corporan selectivamente en ellasrdquo indica Soengas
El tamantildeo del compuesto hace necesario que las ceacute‐
lulas formen endosomas para incorporarlo Como la
formacioacuten de endosomas es muy activa en las ceacutelulas
tumorales las nanopartiacuteculas soacutelo seraacuten incorpora‐
das por este tipo de ceacutelulas y no por las ceacutelulas nor‐
males adyacentes que evitaraacuten por tanto sus efec‐
tos toacutexicos
Referencia Alonso‐Curbelo D et al RAB7 Controls
Melanoma Progression by Exploiting a Lineage‐
Specific Wiring of the Endo‐ lysosomal Path‐
way Cancer Cell 26 1‐16 July 14 2014 http
dxdoiorg101016jccr201404030
Fuente cnioes
Investigadores espantildeoles descubren el papel de RAB7 en la formacioacuten del melanoma
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 5
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El trasplante de ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas mo‐
dificadas geneacuteticamente supone una terapia muy
prometedora para el tratamiento de las enfermeda‐
des geneacuteticas de la sangre el VIH o la leucemia La
modificacioacuten de las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas
se lleva a cabo utilizando lentivirus inactivados que
introducen los genes de intereacutes en las ceacutelulas en un
proceso similar a la infeccioacuten llevada a cabo por la
forma activa de este tipo de virus con la diferencia
de que en lugar de integrar genes relacionados con
la patogenicidad del virus lo que se integra en el ge‐
noma de la ceacutelula hueacutesped son genes destinados a
expresarse con fines terapeacuteuticos Todo ello sin pro‐
vocar una respuesta inmune
El eacutexito de la terapia geacutenica mediante el uso de ceacutelu‐
las madre hematopoyeacuteticas modificadas radica en
dos puntos clave la eficiencia en la transferencia e
incorporacioacuten de los genes en las ceacutelulas proceso
que involucra a los mencionados virus inactivados y
que se realiza fuera del organismo y el manteni‐
miento de las propiedades bioloacutegicas de las ceacutelulas
madre utilizadas para que al ser introducidas en el
paciente se dividan y den lugar a nuevas ceacutelulas que
expresen el gen de intereacutes
Investigadores del The Scripps Research Institute han
descubierto que el faacutermaco rapamicina utilizado
normalmente para retrasar el crecimiento del caacutencer
o prevenir el rechazo de trasplantes aumenta la in‐
corporacioacuten del ADN en las ceacutelulas madre hematopo‐
yeacuteticas sin alterar sus caracteriacutesticas
o comportamiento
El equipo del The Scripps Research Institute dirigido
por Bruce Torbett demostroacute que la rapamicina au‐
menta la eficiencia de la terapia geacutenica con lentivirus
en ceacutelulas del cordoacuten umbilical humano y en ceacutelulas
madre hematopoyeacuteticas de ratoacuten y que lo hace me‐
diante la inhibicioacuten de la ruta molecular mTOR Ade‐
maacutes la rapamicina previene la diferenciacioacuten de las
ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas lo que resulta criacuteti‐
co no soacutelo para poder amplificar las ceacutelulas modifica‐
das y obtener la cantidad necesaria para el trata‐
miento sino que tambieacuten facilita el trabajo de los
cientiacuteficos reduciendo la limitacioacuten de tiempo que
teniacutean desde la extraccioacuten de las ceacutelulas madre hasta
que tras su modificacioacuten las ceacutelulas estaban prepa‐
radas para introducirse en el organismo receptor
ldquoQueriacuteamos estar seguros de que las condiciones que
usaacutebamos preservaban las ceacutelulas madre por lo que
si las trasplantaacutebamos de nuevo a nuestros animales
modelo se comportariacutean como las ceacutelulas madre ori‐
ginalesrdquo indica Torbett
A falta de iniciar los estudios precliacutenicos con otros
modelos animales para confirmar la seguridad y efec‐
tividad del meacutetodo antes de ser utilizado en huma‐
nos los resultados obtenidos resultan muy positivos
y los autores del trabajo confiacutean en que la utilizacioacuten
de la rapamicina durante la modificacioacuten geneacutetica de
las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas pueda llegar a ser
utilizada a nivel cliacutenico ldquoNuestros meacutetodos podriacutean
reducir los costes y la cantidad de preparacioacuten que
supone la modificacioacuten de las ceacutelulas madre sanguiacute‐
neas para la terapia geacutenica utilizando vectores vira‐
les Esto hariacutea la terapia geacutenica accesible a maacutes pa‐
cientesrdquo indica Cathy Wang coautora del trabajo
Una ventaja es que el faacutermaco rapamicina ya se utili‐
za en la praacutectica cliacutenica por lo que su uso en humanos
ya estaacute aprobado
Referencia Wang CX et al Rapamycin relieves lenti‐
viral vector transduction resistance in human and
mouse hematopoietic stem cells Blood 2014 Jun 9
pii blood‐2013‐12‐546218
Fuentehttpwwwscrippsedunewsandviews
e_20140630torbetthtml
La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades hematoloacutegicas
Geneacutetica Meacutedica News
6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de proteiacutenas en la ceacutelula
Geneacutetica Meacutedica News
Un estudio colaborativo de la Universidad de Bristol
el Centro Meacutedico de la Universidad de Texas South‐
western y la Cliacutenica Mayo revela que una mutacioacuten
en el gen VPS35 asociada a la enfermedad de Parkin‐
son altera una ruta de transporte de proteiacutenas en la
ceacutelula
El gen VPS35 (vacuolar protein sorting 35 homolog)
codifica para un componente del retroacutemero comple‐
jo proteico responsable del reciclaje de los receptores
de la membrana de los endosomas (vesiacuteculas mem‐
branosas de la ceacutelula que proporcionan un espacio
donde distribuir diferentes compuestos antes de su
degradacioacuten por los lisosomas) hacia la membrana
celular o del aparato de Golgi Estudios previos ha‐
biacutean identificado mutaciones en el gen asociadas a
formas esporaacutedicas de Paacuterkinson con herencia de
tipo autosoacutemica dominante Sin embargo los efec‐
tos de estas mutaciones no habiacutean sido totalmente
caracterizados
El equipo de investigadores observoacute que la presencia
de la forma mutante de VPS35 D620N que presenta
un cambio de aminoaacutecido en su estructura primaria
daba lugar a una alteracioacuten en el reciclaje de los en‐
dosomas destinados al aparato de Golgi mantenieacuten‐
dose intacto el de aquellos dirigidos a la membrana
plasmaacutetica Ademaacutes la comparacioacuten de las proteiacutenas
de la ceacutelula que interaccionan con la forma mutante y
las que interaccionan con la forma natural de VPS35
reveloacute que el efecto principal de la mutacioacuten es una
disminucioacuten en la afinidad de VPS35 con FAM21
(family with sequence similarity 21) componente del
complejo WASH (Wiskott‐Aldrich siacutendrome and SCAR
homolog) que regula el reciclaje de los endosomas
hacia el aparato de Golgi y que como consecuencia
de la menor interaccioacuten entre sus componentes este
complejo no funcionaba de modo correcto
El profesor Peter Cullen director del trabajo ha ma‐
nifestado que el descubrimiento de los defectos mo‐
leculares asociados a la mutacioacuten en VPS35 ofrece un
camino muy interesante para la investigacioacuten de las
causas del Paacuterkinson y apunta al retroacutemero como
una potencial diana terapeacuteutica para el disentildeo de
faacutermacos destinados a combatir eacutesta y otras enfer‐
medades neurodegenerativas
Referencia McGough IJ et al Retromer Binding to
FAM21 and the WASH Complex Is Perturbed by the
Parkinson Disease‐Linked VPS35(D620N) Mutation
Curr Biol 2014 Jun 25 pii S0960‐9822(14)00740‐4
doi 101016jcub201406024
Fuentehttpwwwbristolacuknews2014june
parkinsons‐researchhtml
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 7
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Traacutefico vesicular en el interior de la ceacutelula
Imagen Judith Stoffer (Image and Video Galery NIH)
Todas las ceacutelulas de un ser humano provienen de una
uacutenica ceacutelula original que a traveacutes de sucesivas divi‐
siones va dando lugar a los diferentes linajes celula‐
res y tejidos A lo largo de la vida de un individuo sus
ceacutelulas acumulan mutaciones en el material geneacuteti‐
co denominadas mutaciones somaacuteticas debido a
que no proceden de sus padres Estas mutaciones
constituyen un registro molecular de los antepasados
de cada ceacutelula y pueden ser utilizadas para recons‐
truir su historia
Un equipo de investigadores del Wellcome Trust San‐
ger Institute en el Reino Unido en colaboracioacuten con
otros centros internacionales acaba de publicar en la
revista Nature la reconstruccioacuten de las divisiones y
mutaciones ocurridas en un conjunto de linajes celu‐
lares de ratoacuten desde el estadiacuteo embrionario hasta la
edad adulta
Los investigadores tomaron ceacutelulas individuales del
estoacutemago intestino delgado e intestino grueso de
dos ratones adultos y las crecieron hasta obtener liacute‐
neas clonales que proporcionaran suficiente ADN
para su anaacutelisis Entonces secuenciaron el genoma
completo de las 25 lineas clonales obtenidas asiacute co‐
mo el ADN extraiacutedo de la cola de los ratones La
comparacioacuten del genoma de cada liacutenea clonal con el
genoma de ratoacuten de referencia permitioacute identificar
las mutaciones somaacuteticas que se habiacutean acumulado
en cada linaje y la comparacioacuten entre los genomas de
las liacuteneas clonales permitioacute tras diferen‐
tes aproximaciones computacionales obtener un aacuter‐
bol filogeneacutetico que reflejara los cambios geneacuteticos
producidos desde los estadiacuteos embrionarios hasta las
ceacutelulas del tejido adulto
El anaacutelisis de la reconstruccioacuten proporciona diferen‐
tes conclusiones La primera de ellas es que las ceacutelu‐
las hijas obtenidas en las divisiones celulares del em‐
brioacuten temprano no contribuyen siempre de la misma
manera en los tejidos adultos Otra conclusioacuten es que
los diferentes tejidos adquieren diferente frecuencia
de mutaciones somaacuteticas algo que puede ser expli‐
cado por una diferente tasa de mutacioacuten en los teji‐
dos o por diferencias en la tasa de divisioacuten de los lina‐
jes desde la fertilizacioacuten del oacutevulo Por uacuteltimo en es‐
te estudio los investigadores obtienen liacuteneas clona‐
les a partir de ceacutelulas individuales pero es de esperar
que en el futuro las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten per‐
mitan secuenciar el genoma de una uacutenica ceacutelula de
forma que se puedan obtener filogenias celulares
precisas
Las implicaciones del estudio son importantes El
registro de mutaciones somaacuteticas puede reflejar la
evolucioacuten de las ceacutelulas normales a ceacutelulas cancero‐
sas asiacute como proporcionar informacioacuten sobre el
desarrollo de diferentes tejidos Sam Behjati primer
autor del trabajo lo expresa de la siguiente manera
ldquoSi podemos entender coacutemo mutan las ceacutelulas nor‐
males sanas conforme se van dividiendo a lo largo
de la vida de una persona ganaremos un conoci‐
miento fundamental de como difieren de las ceacutelulas
del caacutencerrdquo
Referencia Behjati S et al Genome sequencing of
normal cells reveals developmental lineages and muta‐
tional processes Nature 2014 DOI101038
nature13448
Fuentehttpswwwsangeracukabout
press2014140629html
Geneacutetica Meacutedica News
Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula
8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una de las aproximaciones terapeacuteuticas maacutes atractivas
para el tratamiento de la diabetes es la obtencioacuten de ceacutelu‐
las productoras de insulina que puedan ser trasplantadas
a los pacientes para compensar la falta de funcioacuten de sus
propias ceacutelulas La mayor parte de los esfuerzos para pro‐
ducir estas factoriacuteas celulares de insulina se ha concentra‐
do en la utilizacioacuten de ceacutelulas madre bien embrionarias
bien de pluripotencia inducida para diferenciarlas en ceacutelu‐
las beta‐pancreaacuteticas con resultados que si bien son pro‐
metedores no terminan de reunir todas las caracteriacutesti‐
cas funcionales necesarias
Esta semana investigadores del Naomi Berrie Diabetes
Center de la Universidad de Columbia EEUU han publi‐
cado un trabajo con un planteamiento diferente han con‐
seguido mediante la inactivacioacuten de un uacutenico gen el gen
FOXO1 (forkhead box O1) que ceacutelulas gastrointestinales
humanas produzcan insulina
La idea no es nueva ya que el mismo equipo de investiga‐
dores consiguioacute hace dos antildeos que ceacutelulas del intestino de
ratoacuten liberaran insulina en respuesta a los niveles de glu‐
cosa y que ademaacutes normalizaran la concentracioacuten de
glucosa en sangre en ratones modelo para la diabetes Sin
embargo faltaba llevar a cabo la prueba de concepto que
demostrara la efectividad del meacutetodo en humanos ldquoAl
mostrar que las ceacutelulas humanas pueden responder del
mismo modo que las ceacutelulas de ratoacuten hemos despejado
un obstaacuteculo y podemos seguir adelante para intentar
convertir este tratamiento en una realidadrdquo ha comenta‐
do Domenico Accili director del trabajo
La utilizacioacuten de ceacutelulas gastrointestinales y no de otro
tipo no fue una decisioacuten tomada al azar Evidencias pre‐
vias indicaban que las ceacutelulas endocrinas pancreaacuteticas y
enteacutericas pueden convertirse en diferentes tipos celula‐
res posiblemente mediante su desdiferenciacioacuten Antes
de iniciar el experimento de inactivacioacuten del gen el equi‐
po de Accili identificoacute su presencia en el intestino hu‐
mano y observoacute que de forma similar al ratoacuten el gen es
especiacutefico de los progenitores de las ceacutelulas endocrinas y
ceacutelulas positivas para serotonina Para ver el efecto de la
inhibicioacuten de FOXO1 en humanos el equipo generoacute orga‐
noides intestinales pequentildeas reacuteplicas del intestino que
reproducen sus caracteriacutesticas funcionales a partir de
ceacutelulas madre pluripotenciales inducidas humanas La
inactivacioacuten del gen FOXO1 en estos organoides derivoacute en
la transformacioacuten de las ceacutelulas en ceacutelulas productoras de
insulina y lo que es maacutes importante la liberacioacuten de insu‐
lina se produciacutea en las condiciones fisioloacutegicas adecuadas
es decir en respuesta a los niveles de glucosa
Los resultados obtenidos en el estudio ofrecen una viacutea
interesante para generar grandes cantidades de ceacutelulas
productoras de insulina que podriacutean ser trasplantadas en
pacientes diabeacuteticos No obstante el objetivo principal de
los autores es conseguir la inhibicioacuten de FOXO1 in vivo en
el propio paciente para transformar directa y especiacutefica‐
mente las ceacutelulas endocrinas del intestino en ceacutelulas pro‐
ductoras de insulina De momento ya estaacuten buscando un
faacutermaco capaz de inhibir FOXO1 en las ceacutelulas gastroin‐
testinales
Referencia Bouchi R et al FOXO1 inhibition yields fun‐
ctional insulin‐producing cells in human gut organoid cultu‐
res Nature Communications 5 2014 DOI101038
ncomms5242
Fuente httpnewsroomcumccolumbiaedu
Geneacutetica Meacutedica News
La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan insulina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 9
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
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Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
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El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
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Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
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Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
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14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
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El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
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Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
Geneacutetica Meacutedica News
Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
Geneacutetica Meacutedica News
Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
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Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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En este nuacutemero
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bull Investigadores espantildeoles descubren el papel de RAB7 en la formacioacuten del
melanoma | 5
bull La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades
hematoloacutegicas | 6
bull Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de
proteiacutenas en la ceacutelula | 7
bull Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula | 8
bull La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan
insulina | 9
bull Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas | 10
bull El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina | 11
bull Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos | 12
bull Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro | 13
bull El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes | 15
bull Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca | 16
bull Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo | 17
bull Microbioma el otro genoma del ser humano | 18
bull Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica | 19
bull Noticias Breves | 20
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 3
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4 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Tiacutetulo Propio de la Universidad de Valencia
Dirigido a Titulados o graduados en Medicina Farmacia Biolo-giacutea Quiacutemica Bioquiacutemica Biotecnologiacutea Enfermeriacutea o cual-quier tiacutetulo en Ciencias de la Salud Estudiantes de uacuteltimo cur-so de las carreras previamente indicadas
Nordm de creacuteditos 45 creacuteditos
Preinscripcioacuten Hasta septiembre de 2014
Duracioacuten 12 semanas
Inicio y lugar Curso Presencial 25 de Septiembre de 2014 en fundacioacuten Universidad-Empresa de Valencia ADEIT
Investigadores del Centro Nacional de Investigacio‐
nes Oncoloacutegicas en colaboracioacuten con el Memorial
Sloan Ketterin Cancer Center de Nueva York y el Hos‐
pital 12 de Octubre en Madrid han identificado maacutes
de 40 genes que definen el grado de agresividad del
melanoma y lo distinguen de otros caacutenceres de mal
pronoacutestico
El trabajo dirigido por Mariacutea Soengas combina dife‐
rentes viacuteas para encontrar las moleacuteculas clave que
definen este tipo de caacutencer aproximacioacuten geneacutetica
anaacutelisis bioinformaacuteticos y caracterizacioacuten funcional
de las rutas implicadas en la formacioacuten del melano‐
ma Los investigadores compararon 900 liacuteneas celu‐
lares de hasta 35 tipos tumorales y encontraron que
muchos de los genes cuya expresioacuten aumenta en el
melanoma estaacuten implicados en la formacioacuten de en‐
dosomas vesiacuteculas mediante las cuales las ceacutelulas
tumorales incorporan componentes del entorno y
obtienen energiacutea a partir su degradacioacuten
Entre estos genes relacionados con la formacioacuten de
endosomas los investigadores descubrieron el papel
criacutetico que realiza la proteiacutena RAB7 (RAB7A member
RAS oncogene family) en las ceacutelulas del melanoma
RAB7 es una proteiacutena implicada en la formacioacuten y
degradacioacuten de lisosomas (vesiacuteculas de digestioacuten
celulares) cuyo gen codificante se localiza en una
regioacuten cromosoacutemica frecuentemente alterada en
melanoma Sin embargo no existiacutean evidencias pre‐
vias de un papel importante de la proteiacutena en la for‐
macioacuten de tumores Con este estudio el equipo de
Mariacutea Soengas ha determinado que en presencia de
altas concentraciones de RAB7 la autodigestioacuten ce‐
lular se muestra muy activa lo que permite a las ceacutelu‐
las tumorales obtener energiacutea dividirse y proliferar
Sin embargo cuando los niveles de RAB7 se reducen
se produce un cambio fenotiacutepico en las ceacutelulas que
favorece su diseminacioacuten por el organismo iniciando
el proceso de metaacutestasis
Estos resultados tienen gran relevancia tanto a nivel
baacutesico para determinar los procesos moleculares
que intervienen en la formacioacuten y evolucioacuten del mela‐
noma e identificar sus puntos deacutebiles como a nivel
cliacutenico doacutende la cantidad de RAB7 presente en el
tumor cutaacuteneo puede informar sobre el riesgo a
desarrollar metaacutestasis
Por uacuteltimo la participacioacuten de RAB7 y su importancia
en el control de los endosomas permiten entender el
mecanismo de accioacuten de BO‐110 agente basado en
nanopartiacuteculas de ARN y desarrollado en el mismo
grupo de investigacioacuten de Mariacutea Soengas que resulta
letal para las ceacutelulas del melanoma y otros tumores
ldquoSabiacuteamos coacutemo nuestros nanocomplejos actuacutean
dentro de las ceacutelulas tumorales pero no coacutemo se in‐
corporan selectivamente en ellasrdquo indica Soengas
El tamantildeo del compuesto hace necesario que las ceacute‐
lulas formen endosomas para incorporarlo Como la
formacioacuten de endosomas es muy activa en las ceacutelulas
tumorales las nanopartiacuteculas soacutelo seraacuten incorpora‐
das por este tipo de ceacutelulas y no por las ceacutelulas nor‐
males adyacentes que evitaraacuten por tanto sus efec‐
tos toacutexicos
Referencia Alonso‐Curbelo D et al RAB7 Controls
Melanoma Progression by Exploiting a Lineage‐
Specific Wiring of the Endo‐ lysosomal Path‐
way Cancer Cell 26 1‐16 July 14 2014 http
dxdoiorg101016jccr201404030
Fuente cnioes
Investigadores espantildeoles descubren el papel de RAB7 en la formacioacuten del melanoma
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 5
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El trasplante de ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas mo‐
dificadas geneacuteticamente supone una terapia muy
prometedora para el tratamiento de las enfermeda‐
des geneacuteticas de la sangre el VIH o la leucemia La
modificacioacuten de las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas
se lleva a cabo utilizando lentivirus inactivados que
introducen los genes de intereacutes en las ceacutelulas en un
proceso similar a la infeccioacuten llevada a cabo por la
forma activa de este tipo de virus con la diferencia
de que en lugar de integrar genes relacionados con
la patogenicidad del virus lo que se integra en el ge‐
noma de la ceacutelula hueacutesped son genes destinados a
expresarse con fines terapeacuteuticos Todo ello sin pro‐
vocar una respuesta inmune
El eacutexito de la terapia geacutenica mediante el uso de ceacutelu‐
las madre hematopoyeacuteticas modificadas radica en
dos puntos clave la eficiencia en la transferencia e
incorporacioacuten de los genes en las ceacutelulas proceso
que involucra a los mencionados virus inactivados y
que se realiza fuera del organismo y el manteni‐
miento de las propiedades bioloacutegicas de las ceacutelulas
madre utilizadas para que al ser introducidas en el
paciente se dividan y den lugar a nuevas ceacutelulas que
expresen el gen de intereacutes
Investigadores del The Scripps Research Institute han
descubierto que el faacutermaco rapamicina utilizado
normalmente para retrasar el crecimiento del caacutencer
o prevenir el rechazo de trasplantes aumenta la in‐
corporacioacuten del ADN en las ceacutelulas madre hematopo‐
yeacuteticas sin alterar sus caracteriacutesticas
o comportamiento
El equipo del The Scripps Research Institute dirigido
por Bruce Torbett demostroacute que la rapamicina au‐
menta la eficiencia de la terapia geacutenica con lentivirus
en ceacutelulas del cordoacuten umbilical humano y en ceacutelulas
madre hematopoyeacuteticas de ratoacuten y que lo hace me‐
diante la inhibicioacuten de la ruta molecular mTOR Ade‐
maacutes la rapamicina previene la diferenciacioacuten de las
ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas lo que resulta criacuteti‐
co no soacutelo para poder amplificar las ceacutelulas modifica‐
das y obtener la cantidad necesaria para el trata‐
miento sino que tambieacuten facilita el trabajo de los
cientiacuteficos reduciendo la limitacioacuten de tiempo que
teniacutean desde la extraccioacuten de las ceacutelulas madre hasta
que tras su modificacioacuten las ceacutelulas estaban prepa‐
radas para introducirse en el organismo receptor
ldquoQueriacuteamos estar seguros de que las condiciones que
usaacutebamos preservaban las ceacutelulas madre por lo que
si las trasplantaacutebamos de nuevo a nuestros animales
modelo se comportariacutean como las ceacutelulas madre ori‐
ginalesrdquo indica Torbett
A falta de iniciar los estudios precliacutenicos con otros
modelos animales para confirmar la seguridad y efec‐
tividad del meacutetodo antes de ser utilizado en huma‐
nos los resultados obtenidos resultan muy positivos
y los autores del trabajo confiacutean en que la utilizacioacuten
de la rapamicina durante la modificacioacuten geneacutetica de
las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas pueda llegar a ser
utilizada a nivel cliacutenico ldquoNuestros meacutetodos podriacutean
reducir los costes y la cantidad de preparacioacuten que
supone la modificacioacuten de las ceacutelulas madre sanguiacute‐
neas para la terapia geacutenica utilizando vectores vira‐
les Esto hariacutea la terapia geacutenica accesible a maacutes pa‐
cientesrdquo indica Cathy Wang coautora del trabajo
Una ventaja es que el faacutermaco rapamicina ya se utili‐
za en la praacutectica cliacutenica por lo que su uso en humanos
ya estaacute aprobado
Referencia Wang CX et al Rapamycin relieves lenti‐
viral vector transduction resistance in human and
mouse hematopoietic stem cells Blood 2014 Jun 9
pii blood‐2013‐12‐546218
Fuentehttpwwwscrippsedunewsandviews
e_20140630torbetthtml
La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades hematoloacutegicas
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Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de proteiacutenas en la ceacutelula
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Un estudio colaborativo de la Universidad de Bristol
el Centro Meacutedico de la Universidad de Texas South‐
western y la Cliacutenica Mayo revela que una mutacioacuten
en el gen VPS35 asociada a la enfermedad de Parkin‐
son altera una ruta de transporte de proteiacutenas en la
ceacutelula
El gen VPS35 (vacuolar protein sorting 35 homolog)
codifica para un componente del retroacutemero comple‐
jo proteico responsable del reciclaje de los receptores
de la membrana de los endosomas (vesiacuteculas mem‐
branosas de la ceacutelula que proporcionan un espacio
donde distribuir diferentes compuestos antes de su
degradacioacuten por los lisosomas) hacia la membrana
celular o del aparato de Golgi Estudios previos ha‐
biacutean identificado mutaciones en el gen asociadas a
formas esporaacutedicas de Paacuterkinson con herencia de
tipo autosoacutemica dominante Sin embargo los efec‐
tos de estas mutaciones no habiacutean sido totalmente
caracterizados
El equipo de investigadores observoacute que la presencia
de la forma mutante de VPS35 D620N que presenta
un cambio de aminoaacutecido en su estructura primaria
daba lugar a una alteracioacuten en el reciclaje de los en‐
dosomas destinados al aparato de Golgi mantenieacuten‐
dose intacto el de aquellos dirigidos a la membrana
plasmaacutetica Ademaacutes la comparacioacuten de las proteiacutenas
de la ceacutelula que interaccionan con la forma mutante y
las que interaccionan con la forma natural de VPS35
reveloacute que el efecto principal de la mutacioacuten es una
disminucioacuten en la afinidad de VPS35 con FAM21
(family with sequence similarity 21) componente del
complejo WASH (Wiskott‐Aldrich siacutendrome and SCAR
homolog) que regula el reciclaje de los endosomas
hacia el aparato de Golgi y que como consecuencia
de la menor interaccioacuten entre sus componentes este
complejo no funcionaba de modo correcto
El profesor Peter Cullen director del trabajo ha ma‐
nifestado que el descubrimiento de los defectos mo‐
leculares asociados a la mutacioacuten en VPS35 ofrece un
camino muy interesante para la investigacioacuten de las
causas del Paacuterkinson y apunta al retroacutemero como
una potencial diana terapeacuteutica para el disentildeo de
faacutermacos destinados a combatir eacutesta y otras enfer‐
medades neurodegenerativas
Referencia McGough IJ et al Retromer Binding to
FAM21 and the WASH Complex Is Perturbed by the
Parkinson Disease‐Linked VPS35(D620N) Mutation
Curr Biol 2014 Jun 25 pii S0960‐9822(14)00740‐4
doi 101016jcub201406024
Fuentehttpwwwbristolacuknews2014june
parkinsons‐researchhtml
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 7
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Traacutefico vesicular en el interior de la ceacutelula
Imagen Judith Stoffer (Image and Video Galery NIH)
Todas las ceacutelulas de un ser humano provienen de una
uacutenica ceacutelula original que a traveacutes de sucesivas divi‐
siones va dando lugar a los diferentes linajes celula‐
res y tejidos A lo largo de la vida de un individuo sus
ceacutelulas acumulan mutaciones en el material geneacuteti‐
co denominadas mutaciones somaacuteticas debido a
que no proceden de sus padres Estas mutaciones
constituyen un registro molecular de los antepasados
de cada ceacutelula y pueden ser utilizadas para recons‐
truir su historia
Un equipo de investigadores del Wellcome Trust San‐
ger Institute en el Reino Unido en colaboracioacuten con
otros centros internacionales acaba de publicar en la
revista Nature la reconstruccioacuten de las divisiones y
mutaciones ocurridas en un conjunto de linajes celu‐
lares de ratoacuten desde el estadiacuteo embrionario hasta la
edad adulta
Los investigadores tomaron ceacutelulas individuales del
estoacutemago intestino delgado e intestino grueso de
dos ratones adultos y las crecieron hasta obtener liacute‐
neas clonales que proporcionaran suficiente ADN
para su anaacutelisis Entonces secuenciaron el genoma
completo de las 25 lineas clonales obtenidas asiacute co‐
mo el ADN extraiacutedo de la cola de los ratones La
comparacioacuten del genoma de cada liacutenea clonal con el
genoma de ratoacuten de referencia permitioacute identificar
las mutaciones somaacuteticas que se habiacutean acumulado
en cada linaje y la comparacioacuten entre los genomas de
las liacuteneas clonales permitioacute tras diferen‐
tes aproximaciones computacionales obtener un aacuter‐
bol filogeneacutetico que reflejara los cambios geneacuteticos
producidos desde los estadiacuteos embrionarios hasta las
ceacutelulas del tejido adulto
El anaacutelisis de la reconstruccioacuten proporciona diferen‐
tes conclusiones La primera de ellas es que las ceacutelu‐
las hijas obtenidas en las divisiones celulares del em‐
brioacuten temprano no contribuyen siempre de la misma
manera en los tejidos adultos Otra conclusioacuten es que
los diferentes tejidos adquieren diferente frecuencia
de mutaciones somaacuteticas algo que puede ser expli‐
cado por una diferente tasa de mutacioacuten en los teji‐
dos o por diferencias en la tasa de divisioacuten de los lina‐
jes desde la fertilizacioacuten del oacutevulo Por uacuteltimo en es‐
te estudio los investigadores obtienen liacuteneas clona‐
les a partir de ceacutelulas individuales pero es de esperar
que en el futuro las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten per‐
mitan secuenciar el genoma de una uacutenica ceacutelula de
forma que se puedan obtener filogenias celulares
precisas
Las implicaciones del estudio son importantes El
registro de mutaciones somaacuteticas puede reflejar la
evolucioacuten de las ceacutelulas normales a ceacutelulas cancero‐
sas asiacute como proporcionar informacioacuten sobre el
desarrollo de diferentes tejidos Sam Behjati primer
autor del trabajo lo expresa de la siguiente manera
ldquoSi podemos entender coacutemo mutan las ceacutelulas nor‐
males sanas conforme se van dividiendo a lo largo
de la vida de una persona ganaremos un conoci‐
miento fundamental de como difieren de las ceacutelulas
del caacutencerrdquo
Referencia Behjati S et al Genome sequencing of
normal cells reveals developmental lineages and muta‐
tional processes Nature 2014 DOI101038
nature13448
Fuentehttpswwwsangeracukabout
press2014140629html
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Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula
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Una de las aproximaciones terapeacuteuticas maacutes atractivas
para el tratamiento de la diabetes es la obtencioacuten de ceacutelu‐
las productoras de insulina que puedan ser trasplantadas
a los pacientes para compensar la falta de funcioacuten de sus
propias ceacutelulas La mayor parte de los esfuerzos para pro‐
ducir estas factoriacuteas celulares de insulina se ha concentra‐
do en la utilizacioacuten de ceacutelulas madre bien embrionarias
bien de pluripotencia inducida para diferenciarlas en ceacutelu‐
las beta‐pancreaacuteticas con resultados que si bien son pro‐
metedores no terminan de reunir todas las caracteriacutesti‐
cas funcionales necesarias
Esta semana investigadores del Naomi Berrie Diabetes
Center de la Universidad de Columbia EEUU han publi‐
cado un trabajo con un planteamiento diferente han con‐
seguido mediante la inactivacioacuten de un uacutenico gen el gen
FOXO1 (forkhead box O1) que ceacutelulas gastrointestinales
humanas produzcan insulina
La idea no es nueva ya que el mismo equipo de investiga‐
dores consiguioacute hace dos antildeos que ceacutelulas del intestino de
ratoacuten liberaran insulina en respuesta a los niveles de glu‐
cosa y que ademaacutes normalizaran la concentracioacuten de
glucosa en sangre en ratones modelo para la diabetes Sin
embargo faltaba llevar a cabo la prueba de concepto que
demostrara la efectividad del meacutetodo en humanos ldquoAl
mostrar que las ceacutelulas humanas pueden responder del
mismo modo que las ceacutelulas de ratoacuten hemos despejado
un obstaacuteculo y podemos seguir adelante para intentar
convertir este tratamiento en una realidadrdquo ha comenta‐
do Domenico Accili director del trabajo
La utilizacioacuten de ceacutelulas gastrointestinales y no de otro
tipo no fue una decisioacuten tomada al azar Evidencias pre‐
vias indicaban que las ceacutelulas endocrinas pancreaacuteticas y
enteacutericas pueden convertirse en diferentes tipos celula‐
res posiblemente mediante su desdiferenciacioacuten Antes
de iniciar el experimento de inactivacioacuten del gen el equi‐
po de Accili identificoacute su presencia en el intestino hu‐
mano y observoacute que de forma similar al ratoacuten el gen es
especiacutefico de los progenitores de las ceacutelulas endocrinas y
ceacutelulas positivas para serotonina Para ver el efecto de la
inhibicioacuten de FOXO1 en humanos el equipo generoacute orga‐
noides intestinales pequentildeas reacuteplicas del intestino que
reproducen sus caracteriacutesticas funcionales a partir de
ceacutelulas madre pluripotenciales inducidas humanas La
inactivacioacuten del gen FOXO1 en estos organoides derivoacute en
la transformacioacuten de las ceacutelulas en ceacutelulas productoras de
insulina y lo que es maacutes importante la liberacioacuten de insu‐
lina se produciacutea en las condiciones fisioloacutegicas adecuadas
es decir en respuesta a los niveles de glucosa
Los resultados obtenidos en el estudio ofrecen una viacutea
interesante para generar grandes cantidades de ceacutelulas
productoras de insulina que podriacutean ser trasplantadas en
pacientes diabeacuteticos No obstante el objetivo principal de
los autores es conseguir la inhibicioacuten de FOXO1 in vivo en
el propio paciente para transformar directa y especiacutefica‐
mente las ceacutelulas endocrinas del intestino en ceacutelulas pro‐
ductoras de insulina De momento ya estaacuten buscando un
faacutermaco capaz de inhibir FOXO1 en las ceacutelulas gastroin‐
testinales
Referencia Bouchi R et al FOXO1 inhibition yields fun‐
ctional insulin‐producing cells in human gut organoid cultu‐
res Nature Communications 5 2014 DOI101038
ncomms5242
Fuente httpnewsroomcumccolumbiaedu
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La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan insulina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 9
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
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Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
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El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
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Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
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Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
Geneacutetica Meacutedica News
El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
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Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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4 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Tiacutetulo Propio de la Universidad de Valencia
Dirigido a Titulados o graduados en Medicina Farmacia Biolo-giacutea Quiacutemica Bioquiacutemica Biotecnologiacutea Enfermeriacutea o cual-quier tiacutetulo en Ciencias de la Salud Estudiantes de uacuteltimo cur-so de las carreras previamente indicadas
Nordm de creacuteditos 45 creacuteditos
Preinscripcioacuten Hasta septiembre de 2014
Duracioacuten 12 semanas
Inicio y lugar Curso Presencial 25 de Septiembre de 2014 en fundacioacuten Universidad-Empresa de Valencia ADEIT
Investigadores del Centro Nacional de Investigacio‐
nes Oncoloacutegicas en colaboracioacuten con el Memorial
Sloan Ketterin Cancer Center de Nueva York y el Hos‐
pital 12 de Octubre en Madrid han identificado maacutes
de 40 genes que definen el grado de agresividad del
melanoma y lo distinguen de otros caacutenceres de mal
pronoacutestico
El trabajo dirigido por Mariacutea Soengas combina dife‐
rentes viacuteas para encontrar las moleacuteculas clave que
definen este tipo de caacutencer aproximacioacuten geneacutetica
anaacutelisis bioinformaacuteticos y caracterizacioacuten funcional
de las rutas implicadas en la formacioacuten del melano‐
ma Los investigadores compararon 900 liacuteneas celu‐
lares de hasta 35 tipos tumorales y encontraron que
muchos de los genes cuya expresioacuten aumenta en el
melanoma estaacuten implicados en la formacioacuten de en‐
dosomas vesiacuteculas mediante las cuales las ceacutelulas
tumorales incorporan componentes del entorno y
obtienen energiacutea a partir su degradacioacuten
Entre estos genes relacionados con la formacioacuten de
endosomas los investigadores descubrieron el papel
criacutetico que realiza la proteiacutena RAB7 (RAB7A member
RAS oncogene family) en las ceacutelulas del melanoma
RAB7 es una proteiacutena implicada en la formacioacuten y
degradacioacuten de lisosomas (vesiacuteculas de digestioacuten
celulares) cuyo gen codificante se localiza en una
regioacuten cromosoacutemica frecuentemente alterada en
melanoma Sin embargo no existiacutean evidencias pre‐
vias de un papel importante de la proteiacutena en la for‐
macioacuten de tumores Con este estudio el equipo de
Mariacutea Soengas ha determinado que en presencia de
altas concentraciones de RAB7 la autodigestioacuten ce‐
lular se muestra muy activa lo que permite a las ceacutelu‐
las tumorales obtener energiacutea dividirse y proliferar
Sin embargo cuando los niveles de RAB7 se reducen
se produce un cambio fenotiacutepico en las ceacutelulas que
favorece su diseminacioacuten por el organismo iniciando
el proceso de metaacutestasis
Estos resultados tienen gran relevancia tanto a nivel
baacutesico para determinar los procesos moleculares
que intervienen en la formacioacuten y evolucioacuten del mela‐
noma e identificar sus puntos deacutebiles como a nivel
cliacutenico doacutende la cantidad de RAB7 presente en el
tumor cutaacuteneo puede informar sobre el riesgo a
desarrollar metaacutestasis
Por uacuteltimo la participacioacuten de RAB7 y su importancia
en el control de los endosomas permiten entender el
mecanismo de accioacuten de BO‐110 agente basado en
nanopartiacuteculas de ARN y desarrollado en el mismo
grupo de investigacioacuten de Mariacutea Soengas que resulta
letal para las ceacutelulas del melanoma y otros tumores
ldquoSabiacuteamos coacutemo nuestros nanocomplejos actuacutean
dentro de las ceacutelulas tumorales pero no coacutemo se in‐
corporan selectivamente en ellasrdquo indica Soengas
El tamantildeo del compuesto hace necesario que las ceacute‐
lulas formen endosomas para incorporarlo Como la
formacioacuten de endosomas es muy activa en las ceacutelulas
tumorales las nanopartiacuteculas soacutelo seraacuten incorpora‐
das por este tipo de ceacutelulas y no por las ceacutelulas nor‐
males adyacentes que evitaraacuten por tanto sus efec‐
tos toacutexicos
Referencia Alonso‐Curbelo D et al RAB7 Controls
Melanoma Progression by Exploiting a Lineage‐
Specific Wiring of the Endo‐ lysosomal Path‐
way Cancer Cell 26 1‐16 July 14 2014 http
dxdoiorg101016jccr201404030
Fuente cnioes
Investigadores espantildeoles descubren el papel de RAB7 en la formacioacuten del melanoma
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 5
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El trasplante de ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas mo‐
dificadas geneacuteticamente supone una terapia muy
prometedora para el tratamiento de las enfermeda‐
des geneacuteticas de la sangre el VIH o la leucemia La
modificacioacuten de las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas
se lleva a cabo utilizando lentivirus inactivados que
introducen los genes de intereacutes en las ceacutelulas en un
proceso similar a la infeccioacuten llevada a cabo por la
forma activa de este tipo de virus con la diferencia
de que en lugar de integrar genes relacionados con
la patogenicidad del virus lo que se integra en el ge‐
noma de la ceacutelula hueacutesped son genes destinados a
expresarse con fines terapeacuteuticos Todo ello sin pro‐
vocar una respuesta inmune
El eacutexito de la terapia geacutenica mediante el uso de ceacutelu‐
las madre hematopoyeacuteticas modificadas radica en
dos puntos clave la eficiencia en la transferencia e
incorporacioacuten de los genes en las ceacutelulas proceso
que involucra a los mencionados virus inactivados y
que se realiza fuera del organismo y el manteni‐
miento de las propiedades bioloacutegicas de las ceacutelulas
madre utilizadas para que al ser introducidas en el
paciente se dividan y den lugar a nuevas ceacutelulas que
expresen el gen de intereacutes
Investigadores del The Scripps Research Institute han
descubierto que el faacutermaco rapamicina utilizado
normalmente para retrasar el crecimiento del caacutencer
o prevenir el rechazo de trasplantes aumenta la in‐
corporacioacuten del ADN en las ceacutelulas madre hematopo‐
yeacuteticas sin alterar sus caracteriacutesticas
o comportamiento
El equipo del The Scripps Research Institute dirigido
por Bruce Torbett demostroacute que la rapamicina au‐
menta la eficiencia de la terapia geacutenica con lentivirus
en ceacutelulas del cordoacuten umbilical humano y en ceacutelulas
madre hematopoyeacuteticas de ratoacuten y que lo hace me‐
diante la inhibicioacuten de la ruta molecular mTOR Ade‐
maacutes la rapamicina previene la diferenciacioacuten de las
ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas lo que resulta criacuteti‐
co no soacutelo para poder amplificar las ceacutelulas modifica‐
das y obtener la cantidad necesaria para el trata‐
miento sino que tambieacuten facilita el trabajo de los
cientiacuteficos reduciendo la limitacioacuten de tiempo que
teniacutean desde la extraccioacuten de las ceacutelulas madre hasta
que tras su modificacioacuten las ceacutelulas estaban prepa‐
radas para introducirse en el organismo receptor
ldquoQueriacuteamos estar seguros de que las condiciones que
usaacutebamos preservaban las ceacutelulas madre por lo que
si las trasplantaacutebamos de nuevo a nuestros animales
modelo se comportariacutean como las ceacutelulas madre ori‐
ginalesrdquo indica Torbett
A falta de iniciar los estudios precliacutenicos con otros
modelos animales para confirmar la seguridad y efec‐
tividad del meacutetodo antes de ser utilizado en huma‐
nos los resultados obtenidos resultan muy positivos
y los autores del trabajo confiacutean en que la utilizacioacuten
de la rapamicina durante la modificacioacuten geneacutetica de
las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas pueda llegar a ser
utilizada a nivel cliacutenico ldquoNuestros meacutetodos podriacutean
reducir los costes y la cantidad de preparacioacuten que
supone la modificacioacuten de las ceacutelulas madre sanguiacute‐
neas para la terapia geacutenica utilizando vectores vira‐
les Esto hariacutea la terapia geacutenica accesible a maacutes pa‐
cientesrdquo indica Cathy Wang coautora del trabajo
Una ventaja es que el faacutermaco rapamicina ya se utili‐
za en la praacutectica cliacutenica por lo que su uso en humanos
ya estaacute aprobado
Referencia Wang CX et al Rapamycin relieves lenti‐
viral vector transduction resistance in human and
mouse hematopoietic stem cells Blood 2014 Jun 9
pii blood‐2013‐12‐546218
Fuentehttpwwwscrippsedunewsandviews
e_20140630torbetthtml
La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades hematoloacutegicas
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6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de proteiacutenas en la ceacutelula
Geneacutetica Meacutedica News
Un estudio colaborativo de la Universidad de Bristol
el Centro Meacutedico de la Universidad de Texas South‐
western y la Cliacutenica Mayo revela que una mutacioacuten
en el gen VPS35 asociada a la enfermedad de Parkin‐
son altera una ruta de transporte de proteiacutenas en la
ceacutelula
El gen VPS35 (vacuolar protein sorting 35 homolog)
codifica para un componente del retroacutemero comple‐
jo proteico responsable del reciclaje de los receptores
de la membrana de los endosomas (vesiacuteculas mem‐
branosas de la ceacutelula que proporcionan un espacio
donde distribuir diferentes compuestos antes de su
degradacioacuten por los lisosomas) hacia la membrana
celular o del aparato de Golgi Estudios previos ha‐
biacutean identificado mutaciones en el gen asociadas a
formas esporaacutedicas de Paacuterkinson con herencia de
tipo autosoacutemica dominante Sin embargo los efec‐
tos de estas mutaciones no habiacutean sido totalmente
caracterizados
El equipo de investigadores observoacute que la presencia
de la forma mutante de VPS35 D620N que presenta
un cambio de aminoaacutecido en su estructura primaria
daba lugar a una alteracioacuten en el reciclaje de los en‐
dosomas destinados al aparato de Golgi mantenieacuten‐
dose intacto el de aquellos dirigidos a la membrana
plasmaacutetica Ademaacutes la comparacioacuten de las proteiacutenas
de la ceacutelula que interaccionan con la forma mutante y
las que interaccionan con la forma natural de VPS35
reveloacute que el efecto principal de la mutacioacuten es una
disminucioacuten en la afinidad de VPS35 con FAM21
(family with sequence similarity 21) componente del
complejo WASH (Wiskott‐Aldrich siacutendrome and SCAR
homolog) que regula el reciclaje de los endosomas
hacia el aparato de Golgi y que como consecuencia
de la menor interaccioacuten entre sus componentes este
complejo no funcionaba de modo correcto
El profesor Peter Cullen director del trabajo ha ma‐
nifestado que el descubrimiento de los defectos mo‐
leculares asociados a la mutacioacuten en VPS35 ofrece un
camino muy interesante para la investigacioacuten de las
causas del Paacuterkinson y apunta al retroacutemero como
una potencial diana terapeacuteutica para el disentildeo de
faacutermacos destinados a combatir eacutesta y otras enfer‐
medades neurodegenerativas
Referencia McGough IJ et al Retromer Binding to
FAM21 and the WASH Complex Is Perturbed by the
Parkinson Disease‐Linked VPS35(D620N) Mutation
Curr Biol 2014 Jun 25 pii S0960‐9822(14)00740‐4
doi 101016jcub201406024
Fuentehttpwwwbristolacuknews2014june
parkinsons‐researchhtml
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 7
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Traacutefico vesicular en el interior de la ceacutelula
Imagen Judith Stoffer (Image and Video Galery NIH)
Todas las ceacutelulas de un ser humano provienen de una
uacutenica ceacutelula original que a traveacutes de sucesivas divi‐
siones va dando lugar a los diferentes linajes celula‐
res y tejidos A lo largo de la vida de un individuo sus
ceacutelulas acumulan mutaciones en el material geneacuteti‐
co denominadas mutaciones somaacuteticas debido a
que no proceden de sus padres Estas mutaciones
constituyen un registro molecular de los antepasados
de cada ceacutelula y pueden ser utilizadas para recons‐
truir su historia
Un equipo de investigadores del Wellcome Trust San‐
ger Institute en el Reino Unido en colaboracioacuten con
otros centros internacionales acaba de publicar en la
revista Nature la reconstruccioacuten de las divisiones y
mutaciones ocurridas en un conjunto de linajes celu‐
lares de ratoacuten desde el estadiacuteo embrionario hasta la
edad adulta
Los investigadores tomaron ceacutelulas individuales del
estoacutemago intestino delgado e intestino grueso de
dos ratones adultos y las crecieron hasta obtener liacute‐
neas clonales que proporcionaran suficiente ADN
para su anaacutelisis Entonces secuenciaron el genoma
completo de las 25 lineas clonales obtenidas asiacute co‐
mo el ADN extraiacutedo de la cola de los ratones La
comparacioacuten del genoma de cada liacutenea clonal con el
genoma de ratoacuten de referencia permitioacute identificar
las mutaciones somaacuteticas que se habiacutean acumulado
en cada linaje y la comparacioacuten entre los genomas de
las liacuteneas clonales permitioacute tras diferen‐
tes aproximaciones computacionales obtener un aacuter‐
bol filogeneacutetico que reflejara los cambios geneacuteticos
producidos desde los estadiacuteos embrionarios hasta las
ceacutelulas del tejido adulto
El anaacutelisis de la reconstruccioacuten proporciona diferen‐
tes conclusiones La primera de ellas es que las ceacutelu‐
las hijas obtenidas en las divisiones celulares del em‐
brioacuten temprano no contribuyen siempre de la misma
manera en los tejidos adultos Otra conclusioacuten es que
los diferentes tejidos adquieren diferente frecuencia
de mutaciones somaacuteticas algo que puede ser expli‐
cado por una diferente tasa de mutacioacuten en los teji‐
dos o por diferencias en la tasa de divisioacuten de los lina‐
jes desde la fertilizacioacuten del oacutevulo Por uacuteltimo en es‐
te estudio los investigadores obtienen liacuteneas clona‐
les a partir de ceacutelulas individuales pero es de esperar
que en el futuro las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten per‐
mitan secuenciar el genoma de una uacutenica ceacutelula de
forma que se puedan obtener filogenias celulares
precisas
Las implicaciones del estudio son importantes El
registro de mutaciones somaacuteticas puede reflejar la
evolucioacuten de las ceacutelulas normales a ceacutelulas cancero‐
sas asiacute como proporcionar informacioacuten sobre el
desarrollo de diferentes tejidos Sam Behjati primer
autor del trabajo lo expresa de la siguiente manera
ldquoSi podemos entender coacutemo mutan las ceacutelulas nor‐
males sanas conforme se van dividiendo a lo largo
de la vida de una persona ganaremos un conoci‐
miento fundamental de como difieren de las ceacutelulas
del caacutencerrdquo
Referencia Behjati S et al Genome sequencing of
normal cells reveals developmental lineages and muta‐
tional processes Nature 2014 DOI101038
nature13448
Fuentehttpswwwsangeracukabout
press2014140629html
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Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula
8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una de las aproximaciones terapeacuteuticas maacutes atractivas
para el tratamiento de la diabetes es la obtencioacuten de ceacutelu‐
las productoras de insulina que puedan ser trasplantadas
a los pacientes para compensar la falta de funcioacuten de sus
propias ceacutelulas La mayor parte de los esfuerzos para pro‐
ducir estas factoriacuteas celulares de insulina se ha concentra‐
do en la utilizacioacuten de ceacutelulas madre bien embrionarias
bien de pluripotencia inducida para diferenciarlas en ceacutelu‐
las beta‐pancreaacuteticas con resultados que si bien son pro‐
metedores no terminan de reunir todas las caracteriacutesti‐
cas funcionales necesarias
Esta semana investigadores del Naomi Berrie Diabetes
Center de la Universidad de Columbia EEUU han publi‐
cado un trabajo con un planteamiento diferente han con‐
seguido mediante la inactivacioacuten de un uacutenico gen el gen
FOXO1 (forkhead box O1) que ceacutelulas gastrointestinales
humanas produzcan insulina
La idea no es nueva ya que el mismo equipo de investiga‐
dores consiguioacute hace dos antildeos que ceacutelulas del intestino de
ratoacuten liberaran insulina en respuesta a los niveles de glu‐
cosa y que ademaacutes normalizaran la concentracioacuten de
glucosa en sangre en ratones modelo para la diabetes Sin
embargo faltaba llevar a cabo la prueba de concepto que
demostrara la efectividad del meacutetodo en humanos ldquoAl
mostrar que las ceacutelulas humanas pueden responder del
mismo modo que las ceacutelulas de ratoacuten hemos despejado
un obstaacuteculo y podemos seguir adelante para intentar
convertir este tratamiento en una realidadrdquo ha comenta‐
do Domenico Accili director del trabajo
La utilizacioacuten de ceacutelulas gastrointestinales y no de otro
tipo no fue una decisioacuten tomada al azar Evidencias pre‐
vias indicaban que las ceacutelulas endocrinas pancreaacuteticas y
enteacutericas pueden convertirse en diferentes tipos celula‐
res posiblemente mediante su desdiferenciacioacuten Antes
de iniciar el experimento de inactivacioacuten del gen el equi‐
po de Accili identificoacute su presencia en el intestino hu‐
mano y observoacute que de forma similar al ratoacuten el gen es
especiacutefico de los progenitores de las ceacutelulas endocrinas y
ceacutelulas positivas para serotonina Para ver el efecto de la
inhibicioacuten de FOXO1 en humanos el equipo generoacute orga‐
noides intestinales pequentildeas reacuteplicas del intestino que
reproducen sus caracteriacutesticas funcionales a partir de
ceacutelulas madre pluripotenciales inducidas humanas La
inactivacioacuten del gen FOXO1 en estos organoides derivoacute en
la transformacioacuten de las ceacutelulas en ceacutelulas productoras de
insulina y lo que es maacutes importante la liberacioacuten de insu‐
lina se produciacutea en las condiciones fisioloacutegicas adecuadas
es decir en respuesta a los niveles de glucosa
Los resultados obtenidos en el estudio ofrecen una viacutea
interesante para generar grandes cantidades de ceacutelulas
productoras de insulina que podriacutean ser trasplantadas en
pacientes diabeacuteticos No obstante el objetivo principal de
los autores es conseguir la inhibicioacuten de FOXO1 in vivo en
el propio paciente para transformar directa y especiacutefica‐
mente las ceacutelulas endocrinas del intestino en ceacutelulas pro‐
ductoras de insulina De momento ya estaacuten buscando un
faacutermaco capaz de inhibir FOXO1 en las ceacutelulas gastroin‐
testinales
Referencia Bouchi R et al FOXO1 inhibition yields fun‐
ctional insulin‐producing cells in human gut organoid cultu‐
res Nature Communications 5 2014 DOI101038
ncomms5242
Fuente httpnewsroomcumccolumbiaedu
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La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan insulina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 9
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
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Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
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El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
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Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
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Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
Geneacutetica Meacutedica News
14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
Geneacutetica Meacutedica News
El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
Geneacutetica Meacutedica News
Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
Geneacutetica Meacutedica News
Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
revistageneticamedicacom
La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
revistageneticamedicacom
Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
Geneacutetica Meacutedica News
22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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Investigadores del Centro Nacional de Investigacio‐
nes Oncoloacutegicas en colaboracioacuten con el Memorial
Sloan Ketterin Cancer Center de Nueva York y el Hos‐
pital 12 de Octubre en Madrid han identificado maacutes
de 40 genes que definen el grado de agresividad del
melanoma y lo distinguen de otros caacutenceres de mal
pronoacutestico
El trabajo dirigido por Mariacutea Soengas combina dife‐
rentes viacuteas para encontrar las moleacuteculas clave que
definen este tipo de caacutencer aproximacioacuten geneacutetica
anaacutelisis bioinformaacuteticos y caracterizacioacuten funcional
de las rutas implicadas en la formacioacuten del melano‐
ma Los investigadores compararon 900 liacuteneas celu‐
lares de hasta 35 tipos tumorales y encontraron que
muchos de los genes cuya expresioacuten aumenta en el
melanoma estaacuten implicados en la formacioacuten de en‐
dosomas vesiacuteculas mediante las cuales las ceacutelulas
tumorales incorporan componentes del entorno y
obtienen energiacutea a partir su degradacioacuten
Entre estos genes relacionados con la formacioacuten de
endosomas los investigadores descubrieron el papel
criacutetico que realiza la proteiacutena RAB7 (RAB7A member
RAS oncogene family) en las ceacutelulas del melanoma
RAB7 es una proteiacutena implicada en la formacioacuten y
degradacioacuten de lisosomas (vesiacuteculas de digestioacuten
celulares) cuyo gen codificante se localiza en una
regioacuten cromosoacutemica frecuentemente alterada en
melanoma Sin embargo no existiacutean evidencias pre‐
vias de un papel importante de la proteiacutena en la for‐
macioacuten de tumores Con este estudio el equipo de
Mariacutea Soengas ha determinado que en presencia de
altas concentraciones de RAB7 la autodigestioacuten ce‐
lular se muestra muy activa lo que permite a las ceacutelu‐
las tumorales obtener energiacutea dividirse y proliferar
Sin embargo cuando los niveles de RAB7 se reducen
se produce un cambio fenotiacutepico en las ceacutelulas que
favorece su diseminacioacuten por el organismo iniciando
el proceso de metaacutestasis
Estos resultados tienen gran relevancia tanto a nivel
baacutesico para determinar los procesos moleculares
que intervienen en la formacioacuten y evolucioacuten del mela‐
noma e identificar sus puntos deacutebiles como a nivel
cliacutenico doacutende la cantidad de RAB7 presente en el
tumor cutaacuteneo puede informar sobre el riesgo a
desarrollar metaacutestasis
Por uacuteltimo la participacioacuten de RAB7 y su importancia
en el control de los endosomas permiten entender el
mecanismo de accioacuten de BO‐110 agente basado en
nanopartiacuteculas de ARN y desarrollado en el mismo
grupo de investigacioacuten de Mariacutea Soengas que resulta
letal para las ceacutelulas del melanoma y otros tumores
ldquoSabiacuteamos coacutemo nuestros nanocomplejos actuacutean
dentro de las ceacutelulas tumorales pero no coacutemo se in‐
corporan selectivamente en ellasrdquo indica Soengas
El tamantildeo del compuesto hace necesario que las ceacute‐
lulas formen endosomas para incorporarlo Como la
formacioacuten de endosomas es muy activa en las ceacutelulas
tumorales las nanopartiacuteculas soacutelo seraacuten incorpora‐
das por este tipo de ceacutelulas y no por las ceacutelulas nor‐
males adyacentes que evitaraacuten por tanto sus efec‐
tos toacutexicos
Referencia Alonso‐Curbelo D et al RAB7 Controls
Melanoma Progression by Exploiting a Lineage‐
Specific Wiring of the Endo‐ lysosomal Path‐
way Cancer Cell 26 1‐16 July 14 2014 http
dxdoiorg101016jccr201404030
Fuente cnioes
Investigadores espantildeoles descubren el papel de RAB7 en la formacioacuten del melanoma
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 5
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El trasplante de ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas mo‐
dificadas geneacuteticamente supone una terapia muy
prometedora para el tratamiento de las enfermeda‐
des geneacuteticas de la sangre el VIH o la leucemia La
modificacioacuten de las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas
se lleva a cabo utilizando lentivirus inactivados que
introducen los genes de intereacutes en las ceacutelulas en un
proceso similar a la infeccioacuten llevada a cabo por la
forma activa de este tipo de virus con la diferencia
de que en lugar de integrar genes relacionados con
la patogenicidad del virus lo que se integra en el ge‐
noma de la ceacutelula hueacutesped son genes destinados a
expresarse con fines terapeacuteuticos Todo ello sin pro‐
vocar una respuesta inmune
El eacutexito de la terapia geacutenica mediante el uso de ceacutelu‐
las madre hematopoyeacuteticas modificadas radica en
dos puntos clave la eficiencia en la transferencia e
incorporacioacuten de los genes en las ceacutelulas proceso
que involucra a los mencionados virus inactivados y
que se realiza fuera del organismo y el manteni‐
miento de las propiedades bioloacutegicas de las ceacutelulas
madre utilizadas para que al ser introducidas en el
paciente se dividan y den lugar a nuevas ceacutelulas que
expresen el gen de intereacutes
Investigadores del The Scripps Research Institute han
descubierto que el faacutermaco rapamicina utilizado
normalmente para retrasar el crecimiento del caacutencer
o prevenir el rechazo de trasplantes aumenta la in‐
corporacioacuten del ADN en las ceacutelulas madre hematopo‐
yeacuteticas sin alterar sus caracteriacutesticas
o comportamiento
El equipo del The Scripps Research Institute dirigido
por Bruce Torbett demostroacute que la rapamicina au‐
menta la eficiencia de la terapia geacutenica con lentivirus
en ceacutelulas del cordoacuten umbilical humano y en ceacutelulas
madre hematopoyeacuteticas de ratoacuten y que lo hace me‐
diante la inhibicioacuten de la ruta molecular mTOR Ade‐
maacutes la rapamicina previene la diferenciacioacuten de las
ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas lo que resulta criacuteti‐
co no soacutelo para poder amplificar las ceacutelulas modifica‐
das y obtener la cantidad necesaria para el trata‐
miento sino que tambieacuten facilita el trabajo de los
cientiacuteficos reduciendo la limitacioacuten de tiempo que
teniacutean desde la extraccioacuten de las ceacutelulas madre hasta
que tras su modificacioacuten las ceacutelulas estaban prepa‐
radas para introducirse en el organismo receptor
ldquoQueriacuteamos estar seguros de que las condiciones que
usaacutebamos preservaban las ceacutelulas madre por lo que
si las trasplantaacutebamos de nuevo a nuestros animales
modelo se comportariacutean como las ceacutelulas madre ori‐
ginalesrdquo indica Torbett
A falta de iniciar los estudios precliacutenicos con otros
modelos animales para confirmar la seguridad y efec‐
tividad del meacutetodo antes de ser utilizado en huma‐
nos los resultados obtenidos resultan muy positivos
y los autores del trabajo confiacutean en que la utilizacioacuten
de la rapamicina durante la modificacioacuten geneacutetica de
las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas pueda llegar a ser
utilizada a nivel cliacutenico ldquoNuestros meacutetodos podriacutean
reducir los costes y la cantidad de preparacioacuten que
supone la modificacioacuten de las ceacutelulas madre sanguiacute‐
neas para la terapia geacutenica utilizando vectores vira‐
les Esto hariacutea la terapia geacutenica accesible a maacutes pa‐
cientesrdquo indica Cathy Wang coautora del trabajo
Una ventaja es que el faacutermaco rapamicina ya se utili‐
za en la praacutectica cliacutenica por lo que su uso en humanos
ya estaacute aprobado
Referencia Wang CX et al Rapamycin relieves lenti‐
viral vector transduction resistance in human and
mouse hematopoietic stem cells Blood 2014 Jun 9
pii blood‐2013‐12‐546218
Fuentehttpwwwscrippsedunewsandviews
e_20140630torbetthtml
La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades hematoloacutegicas
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6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de proteiacutenas en la ceacutelula
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Un estudio colaborativo de la Universidad de Bristol
el Centro Meacutedico de la Universidad de Texas South‐
western y la Cliacutenica Mayo revela que una mutacioacuten
en el gen VPS35 asociada a la enfermedad de Parkin‐
son altera una ruta de transporte de proteiacutenas en la
ceacutelula
El gen VPS35 (vacuolar protein sorting 35 homolog)
codifica para un componente del retroacutemero comple‐
jo proteico responsable del reciclaje de los receptores
de la membrana de los endosomas (vesiacuteculas mem‐
branosas de la ceacutelula que proporcionan un espacio
donde distribuir diferentes compuestos antes de su
degradacioacuten por los lisosomas) hacia la membrana
celular o del aparato de Golgi Estudios previos ha‐
biacutean identificado mutaciones en el gen asociadas a
formas esporaacutedicas de Paacuterkinson con herencia de
tipo autosoacutemica dominante Sin embargo los efec‐
tos de estas mutaciones no habiacutean sido totalmente
caracterizados
El equipo de investigadores observoacute que la presencia
de la forma mutante de VPS35 D620N que presenta
un cambio de aminoaacutecido en su estructura primaria
daba lugar a una alteracioacuten en el reciclaje de los en‐
dosomas destinados al aparato de Golgi mantenieacuten‐
dose intacto el de aquellos dirigidos a la membrana
plasmaacutetica Ademaacutes la comparacioacuten de las proteiacutenas
de la ceacutelula que interaccionan con la forma mutante y
las que interaccionan con la forma natural de VPS35
reveloacute que el efecto principal de la mutacioacuten es una
disminucioacuten en la afinidad de VPS35 con FAM21
(family with sequence similarity 21) componente del
complejo WASH (Wiskott‐Aldrich siacutendrome and SCAR
homolog) que regula el reciclaje de los endosomas
hacia el aparato de Golgi y que como consecuencia
de la menor interaccioacuten entre sus componentes este
complejo no funcionaba de modo correcto
El profesor Peter Cullen director del trabajo ha ma‐
nifestado que el descubrimiento de los defectos mo‐
leculares asociados a la mutacioacuten en VPS35 ofrece un
camino muy interesante para la investigacioacuten de las
causas del Paacuterkinson y apunta al retroacutemero como
una potencial diana terapeacuteutica para el disentildeo de
faacutermacos destinados a combatir eacutesta y otras enfer‐
medades neurodegenerativas
Referencia McGough IJ et al Retromer Binding to
FAM21 and the WASH Complex Is Perturbed by the
Parkinson Disease‐Linked VPS35(D620N) Mutation
Curr Biol 2014 Jun 25 pii S0960‐9822(14)00740‐4
doi 101016jcub201406024
Fuentehttpwwwbristolacuknews2014june
parkinsons‐researchhtml
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 7
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Traacutefico vesicular en el interior de la ceacutelula
Imagen Judith Stoffer (Image and Video Galery NIH)
Todas las ceacutelulas de un ser humano provienen de una
uacutenica ceacutelula original que a traveacutes de sucesivas divi‐
siones va dando lugar a los diferentes linajes celula‐
res y tejidos A lo largo de la vida de un individuo sus
ceacutelulas acumulan mutaciones en el material geneacuteti‐
co denominadas mutaciones somaacuteticas debido a
que no proceden de sus padres Estas mutaciones
constituyen un registro molecular de los antepasados
de cada ceacutelula y pueden ser utilizadas para recons‐
truir su historia
Un equipo de investigadores del Wellcome Trust San‐
ger Institute en el Reino Unido en colaboracioacuten con
otros centros internacionales acaba de publicar en la
revista Nature la reconstruccioacuten de las divisiones y
mutaciones ocurridas en un conjunto de linajes celu‐
lares de ratoacuten desde el estadiacuteo embrionario hasta la
edad adulta
Los investigadores tomaron ceacutelulas individuales del
estoacutemago intestino delgado e intestino grueso de
dos ratones adultos y las crecieron hasta obtener liacute‐
neas clonales que proporcionaran suficiente ADN
para su anaacutelisis Entonces secuenciaron el genoma
completo de las 25 lineas clonales obtenidas asiacute co‐
mo el ADN extraiacutedo de la cola de los ratones La
comparacioacuten del genoma de cada liacutenea clonal con el
genoma de ratoacuten de referencia permitioacute identificar
las mutaciones somaacuteticas que se habiacutean acumulado
en cada linaje y la comparacioacuten entre los genomas de
las liacuteneas clonales permitioacute tras diferen‐
tes aproximaciones computacionales obtener un aacuter‐
bol filogeneacutetico que reflejara los cambios geneacuteticos
producidos desde los estadiacuteos embrionarios hasta las
ceacutelulas del tejido adulto
El anaacutelisis de la reconstruccioacuten proporciona diferen‐
tes conclusiones La primera de ellas es que las ceacutelu‐
las hijas obtenidas en las divisiones celulares del em‐
brioacuten temprano no contribuyen siempre de la misma
manera en los tejidos adultos Otra conclusioacuten es que
los diferentes tejidos adquieren diferente frecuencia
de mutaciones somaacuteticas algo que puede ser expli‐
cado por una diferente tasa de mutacioacuten en los teji‐
dos o por diferencias en la tasa de divisioacuten de los lina‐
jes desde la fertilizacioacuten del oacutevulo Por uacuteltimo en es‐
te estudio los investigadores obtienen liacuteneas clona‐
les a partir de ceacutelulas individuales pero es de esperar
que en el futuro las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten per‐
mitan secuenciar el genoma de una uacutenica ceacutelula de
forma que se puedan obtener filogenias celulares
precisas
Las implicaciones del estudio son importantes El
registro de mutaciones somaacuteticas puede reflejar la
evolucioacuten de las ceacutelulas normales a ceacutelulas cancero‐
sas asiacute como proporcionar informacioacuten sobre el
desarrollo de diferentes tejidos Sam Behjati primer
autor del trabajo lo expresa de la siguiente manera
ldquoSi podemos entender coacutemo mutan las ceacutelulas nor‐
males sanas conforme se van dividiendo a lo largo
de la vida de una persona ganaremos un conoci‐
miento fundamental de como difieren de las ceacutelulas
del caacutencerrdquo
Referencia Behjati S et al Genome sequencing of
normal cells reveals developmental lineages and muta‐
tional processes Nature 2014 DOI101038
nature13448
Fuentehttpswwwsangeracukabout
press2014140629html
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Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula
8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una de las aproximaciones terapeacuteuticas maacutes atractivas
para el tratamiento de la diabetes es la obtencioacuten de ceacutelu‐
las productoras de insulina que puedan ser trasplantadas
a los pacientes para compensar la falta de funcioacuten de sus
propias ceacutelulas La mayor parte de los esfuerzos para pro‐
ducir estas factoriacuteas celulares de insulina se ha concentra‐
do en la utilizacioacuten de ceacutelulas madre bien embrionarias
bien de pluripotencia inducida para diferenciarlas en ceacutelu‐
las beta‐pancreaacuteticas con resultados que si bien son pro‐
metedores no terminan de reunir todas las caracteriacutesti‐
cas funcionales necesarias
Esta semana investigadores del Naomi Berrie Diabetes
Center de la Universidad de Columbia EEUU han publi‐
cado un trabajo con un planteamiento diferente han con‐
seguido mediante la inactivacioacuten de un uacutenico gen el gen
FOXO1 (forkhead box O1) que ceacutelulas gastrointestinales
humanas produzcan insulina
La idea no es nueva ya que el mismo equipo de investiga‐
dores consiguioacute hace dos antildeos que ceacutelulas del intestino de
ratoacuten liberaran insulina en respuesta a los niveles de glu‐
cosa y que ademaacutes normalizaran la concentracioacuten de
glucosa en sangre en ratones modelo para la diabetes Sin
embargo faltaba llevar a cabo la prueba de concepto que
demostrara la efectividad del meacutetodo en humanos ldquoAl
mostrar que las ceacutelulas humanas pueden responder del
mismo modo que las ceacutelulas de ratoacuten hemos despejado
un obstaacuteculo y podemos seguir adelante para intentar
convertir este tratamiento en una realidadrdquo ha comenta‐
do Domenico Accili director del trabajo
La utilizacioacuten de ceacutelulas gastrointestinales y no de otro
tipo no fue una decisioacuten tomada al azar Evidencias pre‐
vias indicaban que las ceacutelulas endocrinas pancreaacuteticas y
enteacutericas pueden convertirse en diferentes tipos celula‐
res posiblemente mediante su desdiferenciacioacuten Antes
de iniciar el experimento de inactivacioacuten del gen el equi‐
po de Accili identificoacute su presencia en el intestino hu‐
mano y observoacute que de forma similar al ratoacuten el gen es
especiacutefico de los progenitores de las ceacutelulas endocrinas y
ceacutelulas positivas para serotonina Para ver el efecto de la
inhibicioacuten de FOXO1 en humanos el equipo generoacute orga‐
noides intestinales pequentildeas reacuteplicas del intestino que
reproducen sus caracteriacutesticas funcionales a partir de
ceacutelulas madre pluripotenciales inducidas humanas La
inactivacioacuten del gen FOXO1 en estos organoides derivoacute en
la transformacioacuten de las ceacutelulas en ceacutelulas productoras de
insulina y lo que es maacutes importante la liberacioacuten de insu‐
lina se produciacutea en las condiciones fisioloacutegicas adecuadas
es decir en respuesta a los niveles de glucosa
Los resultados obtenidos en el estudio ofrecen una viacutea
interesante para generar grandes cantidades de ceacutelulas
productoras de insulina que podriacutean ser trasplantadas en
pacientes diabeacuteticos No obstante el objetivo principal de
los autores es conseguir la inhibicioacuten de FOXO1 in vivo en
el propio paciente para transformar directa y especiacutefica‐
mente las ceacutelulas endocrinas del intestino en ceacutelulas pro‐
ductoras de insulina De momento ya estaacuten buscando un
faacutermaco capaz de inhibir FOXO1 en las ceacutelulas gastroin‐
testinales
Referencia Bouchi R et al FOXO1 inhibition yields fun‐
ctional insulin‐producing cells in human gut organoid cultu‐
res Nature Communications 5 2014 DOI101038
ncomms5242
Fuente httpnewsroomcumccolumbiaedu
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La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan insulina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 9
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
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Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
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El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
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Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
Geneacutetica Meacutedica News
Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
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El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
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Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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El trasplante de ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas mo‐
dificadas geneacuteticamente supone una terapia muy
prometedora para el tratamiento de las enfermeda‐
des geneacuteticas de la sangre el VIH o la leucemia La
modificacioacuten de las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas
se lleva a cabo utilizando lentivirus inactivados que
introducen los genes de intereacutes en las ceacutelulas en un
proceso similar a la infeccioacuten llevada a cabo por la
forma activa de este tipo de virus con la diferencia
de que en lugar de integrar genes relacionados con
la patogenicidad del virus lo que se integra en el ge‐
noma de la ceacutelula hueacutesped son genes destinados a
expresarse con fines terapeacuteuticos Todo ello sin pro‐
vocar una respuesta inmune
El eacutexito de la terapia geacutenica mediante el uso de ceacutelu‐
las madre hematopoyeacuteticas modificadas radica en
dos puntos clave la eficiencia en la transferencia e
incorporacioacuten de los genes en las ceacutelulas proceso
que involucra a los mencionados virus inactivados y
que se realiza fuera del organismo y el manteni‐
miento de las propiedades bioloacutegicas de las ceacutelulas
madre utilizadas para que al ser introducidas en el
paciente se dividan y den lugar a nuevas ceacutelulas que
expresen el gen de intereacutes
Investigadores del The Scripps Research Institute han
descubierto que el faacutermaco rapamicina utilizado
normalmente para retrasar el crecimiento del caacutencer
o prevenir el rechazo de trasplantes aumenta la in‐
corporacioacuten del ADN en las ceacutelulas madre hematopo‐
yeacuteticas sin alterar sus caracteriacutesticas
o comportamiento
El equipo del The Scripps Research Institute dirigido
por Bruce Torbett demostroacute que la rapamicina au‐
menta la eficiencia de la terapia geacutenica con lentivirus
en ceacutelulas del cordoacuten umbilical humano y en ceacutelulas
madre hematopoyeacuteticas de ratoacuten y que lo hace me‐
diante la inhibicioacuten de la ruta molecular mTOR Ade‐
maacutes la rapamicina previene la diferenciacioacuten de las
ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas lo que resulta criacuteti‐
co no soacutelo para poder amplificar las ceacutelulas modifica‐
das y obtener la cantidad necesaria para el trata‐
miento sino que tambieacuten facilita el trabajo de los
cientiacuteficos reduciendo la limitacioacuten de tiempo que
teniacutean desde la extraccioacuten de las ceacutelulas madre hasta
que tras su modificacioacuten las ceacutelulas estaban prepa‐
radas para introducirse en el organismo receptor
ldquoQueriacuteamos estar seguros de que las condiciones que
usaacutebamos preservaban las ceacutelulas madre por lo que
si las trasplantaacutebamos de nuevo a nuestros animales
modelo se comportariacutean como las ceacutelulas madre ori‐
ginalesrdquo indica Torbett
A falta de iniciar los estudios precliacutenicos con otros
modelos animales para confirmar la seguridad y efec‐
tividad del meacutetodo antes de ser utilizado en huma‐
nos los resultados obtenidos resultan muy positivos
y los autores del trabajo confiacutean en que la utilizacioacuten
de la rapamicina durante la modificacioacuten geneacutetica de
las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas pueda llegar a ser
utilizada a nivel cliacutenico ldquoNuestros meacutetodos podriacutean
reducir los costes y la cantidad de preparacioacuten que
supone la modificacioacuten de las ceacutelulas madre sanguiacute‐
neas para la terapia geacutenica utilizando vectores vira‐
les Esto hariacutea la terapia geacutenica accesible a maacutes pa‐
cientesrdquo indica Cathy Wang coautora del trabajo
Una ventaja es que el faacutermaco rapamicina ya se utili‐
za en la praacutectica cliacutenica por lo que su uso en humanos
ya estaacute aprobado
Referencia Wang CX et al Rapamycin relieves lenti‐
viral vector transduction resistance in human and
mouse hematopoietic stem cells Blood 2014 Jun 9
pii blood‐2013‐12‐546218
Fuentehttpwwwscrippsedunewsandviews
e_20140630torbetthtml
La rapamicina revela su potencial para la terapia geacutenica de enfermedades hematoloacutegicas
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6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de proteiacutenas en la ceacutelula
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Un estudio colaborativo de la Universidad de Bristol
el Centro Meacutedico de la Universidad de Texas South‐
western y la Cliacutenica Mayo revela que una mutacioacuten
en el gen VPS35 asociada a la enfermedad de Parkin‐
son altera una ruta de transporte de proteiacutenas en la
ceacutelula
El gen VPS35 (vacuolar protein sorting 35 homolog)
codifica para un componente del retroacutemero comple‐
jo proteico responsable del reciclaje de los receptores
de la membrana de los endosomas (vesiacuteculas mem‐
branosas de la ceacutelula que proporcionan un espacio
donde distribuir diferentes compuestos antes de su
degradacioacuten por los lisosomas) hacia la membrana
celular o del aparato de Golgi Estudios previos ha‐
biacutean identificado mutaciones en el gen asociadas a
formas esporaacutedicas de Paacuterkinson con herencia de
tipo autosoacutemica dominante Sin embargo los efec‐
tos de estas mutaciones no habiacutean sido totalmente
caracterizados
El equipo de investigadores observoacute que la presencia
de la forma mutante de VPS35 D620N que presenta
un cambio de aminoaacutecido en su estructura primaria
daba lugar a una alteracioacuten en el reciclaje de los en‐
dosomas destinados al aparato de Golgi mantenieacuten‐
dose intacto el de aquellos dirigidos a la membrana
plasmaacutetica Ademaacutes la comparacioacuten de las proteiacutenas
de la ceacutelula que interaccionan con la forma mutante y
las que interaccionan con la forma natural de VPS35
reveloacute que el efecto principal de la mutacioacuten es una
disminucioacuten en la afinidad de VPS35 con FAM21
(family with sequence similarity 21) componente del
complejo WASH (Wiskott‐Aldrich siacutendrome and SCAR
homolog) que regula el reciclaje de los endosomas
hacia el aparato de Golgi y que como consecuencia
de la menor interaccioacuten entre sus componentes este
complejo no funcionaba de modo correcto
El profesor Peter Cullen director del trabajo ha ma‐
nifestado que el descubrimiento de los defectos mo‐
leculares asociados a la mutacioacuten en VPS35 ofrece un
camino muy interesante para la investigacioacuten de las
causas del Paacuterkinson y apunta al retroacutemero como
una potencial diana terapeacuteutica para el disentildeo de
faacutermacos destinados a combatir eacutesta y otras enfer‐
medades neurodegenerativas
Referencia McGough IJ et al Retromer Binding to
FAM21 and the WASH Complex Is Perturbed by the
Parkinson Disease‐Linked VPS35(D620N) Mutation
Curr Biol 2014 Jun 25 pii S0960‐9822(14)00740‐4
doi 101016jcub201406024
Fuentehttpwwwbristolacuknews2014june
parkinsons‐researchhtml
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 7
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Traacutefico vesicular en el interior de la ceacutelula
Imagen Judith Stoffer (Image and Video Galery NIH)
Todas las ceacutelulas de un ser humano provienen de una
uacutenica ceacutelula original que a traveacutes de sucesivas divi‐
siones va dando lugar a los diferentes linajes celula‐
res y tejidos A lo largo de la vida de un individuo sus
ceacutelulas acumulan mutaciones en el material geneacuteti‐
co denominadas mutaciones somaacuteticas debido a
que no proceden de sus padres Estas mutaciones
constituyen un registro molecular de los antepasados
de cada ceacutelula y pueden ser utilizadas para recons‐
truir su historia
Un equipo de investigadores del Wellcome Trust San‐
ger Institute en el Reino Unido en colaboracioacuten con
otros centros internacionales acaba de publicar en la
revista Nature la reconstruccioacuten de las divisiones y
mutaciones ocurridas en un conjunto de linajes celu‐
lares de ratoacuten desde el estadiacuteo embrionario hasta la
edad adulta
Los investigadores tomaron ceacutelulas individuales del
estoacutemago intestino delgado e intestino grueso de
dos ratones adultos y las crecieron hasta obtener liacute‐
neas clonales que proporcionaran suficiente ADN
para su anaacutelisis Entonces secuenciaron el genoma
completo de las 25 lineas clonales obtenidas asiacute co‐
mo el ADN extraiacutedo de la cola de los ratones La
comparacioacuten del genoma de cada liacutenea clonal con el
genoma de ratoacuten de referencia permitioacute identificar
las mutaciones somaacuteticas que se habiacutean acumulado
en cada linaje y la comparacioacuten entre los genomas de
las liacuteneas clonales permitioacute tras diferen‐
tes aproximaciones computacionales obtener un aacuter‐
bol filogeneacutetico que reflejara los cambios geneacuteticos
producidos desde los estadiacuteos embrionarios hasta las
ceacutelulas del tejido adulto
El anaacutelisis de la reconstruccioacuten proporciona diferen‐
tes conclusiones La primera de ellas es que las ceacutelu‐
las hijas obtenidas en las divisiones celulares del em‐
brioacuten temprano no contribuyen siempre de la misma
manera en los tejidos adultos Otra conclusioacuten es que
los diferentes tejidos adquieren diferente frecuencia
de mutaciones somaacuteticas algo que puede ser expli‐
cado por una diferente tasa de mutacioacuten en los teji‐
dos o por diferencias en la tasa de divisioacuten de los lina‐
jes desde la fertilizacioacuten del oacutevulo Por uacuteltimo en es‐
te estudio los investigadores obtienen liacuteneas clona‐
les a partir de ceacutelulas individuales pero es de esperar
que en el futuro las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten per‐
mitan secuenciar el genoma de una uacutenica ceacutelula de
forma que se puedan obtener filogenias celulares
precisas
Las implicaciones del estudio son importantes El
registro de mutaciones somaacuteticas puede reflejar la
evolucioacuten de las ceacutelulas normales a ceacutelulas cancero‐
sas asiacute como proporcionar informacioacuten sobre el
desarrollo de diferentes tejidos Sam Behjati primer
autor del trabajo lo expresa de la siguiente manera
ldquoSi podemos entender coacutemo mutan las ceacutelulas nor‐
males sanas conforme se van dividiendo a lo largo
de la vida de una persona ganaremos un conoci‐
miento fundamental de como difieren de las ceacutelulas
del caacutencerrdquo
Referencia Behjati S et al Genome sequencing of
normal cells reveals developmental lineages and muta‐
tional processes Nature 2014 DOI101038
nature13448
Fuentehttpswwwsangeracukabout
press2014140629html
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Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula
8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una de las aproximaciones terapeacuteuticas maacutes atractivas
para el tratamiento de la diabetes es la obtencioacuten de ceacutelu‐
las productoras de insulina que puedan ser trasplantadas
a los pacientes para compensar la falta de funcioacuten de sus
propias ceacutelulas La mayor parte de los esfuerzos para pro‐
ducir estas factoriacuteas celulares de insulina se ha concentra‐
do en la utilizacioacuten de ceacutelulas madre bien embrionarias
bien de pluripotencia inducida para diferenciarlas en ceacutelu‐
las beta‐pancreaacuteticas con resultados que si bien son pro‐
metedores no terminan de reunir todas las caracteriacutesti‐
cas funcionales necesarias
Esta semana investigadores del Naomi Berrie Diabetes
Center de la Universidad de Columbia EEUU han publi‐
cado un trabajo con un planteamiento diferente han con‐
seguido mediante la inactivacioacuten de un uacutenico gen el gen
FOXO1 (forkhead box O1) que ceacutelulas gastrointestinales
humanas produzcan insulina
La idea no es nueva ya que el mismo equipo de investiga‐
dores consiguioacute hace dos antildeos que ceacutelulas del intestino de
ratoacuten liberaran insulina en respuesta a los niveles de glu‐
cosa y que ademaacutes normalizaran la concentracioacuten de
glucosa en sangre en ratones modelo para la diabetes Sin
embargo faltaba llevar a cabo la prueba de concepto que
demostrara la efectividad del meacutetodo en humanos ldquoAl
mostrar que las ceacutelulas humanas pueden responder del
mismo modo que las ceacutelulas de ratoacuten hemos despejado
un obstaacuteculo y podemos seguir adelante para intentar
convertir este tratamiento en una realidadrdquo ha comenta‐
do Domenico Accili director del trabajo
La utilizacioacuten de ceacutelulas gastrointestinales y no de otro
tipo no fue una decisioacuten tomada al azar Evidencias pre‐
vias indicaban que las ceacutelulas endocrinas pancreaacuteticas y
enteacutericas pueden convertirse en diferentes tipos celula‐
res posiblemente mediante su desdiferenciacioacuten Antes
de iniciar el experimento de inactivacioacuten del gen el equi‐
po de Accili identificoacute su presencia en el intestino hu‐
mano y observoacute que de forma similar al ratoacuten el gen es
especiacutefico de los progenitores de las ceacutelulas endocrinas y
ceacutelulas positivas para serotonina Para ver el efecto de la
inhibicioacuten de FOXO1 en humanos el equipo generoacute orga‐
noides intestinales pequentildeas reacuteplicas del intestino que
reproducen sus caracteriacutesticas funcionales a partir de
ceacutelulas madre pluripotenciales inducidas humanas La
inactivacioacuten del gen FOXO1 en estos organoides derivoacute en
la transformacioacuten de las ceacutelulas en ceacutelulas productoras de
insulina y lo que es maacutes importante la liberacioacuten de insu‐
lina se produciacutea en las condiciones fisioloacutegicas adecuadas
es decir en respuesta a los niveles de glucosa
Los resultados obtenidos en el estudio ofrecen una viacutea
interesante para generar grandes cantidades de ceacutelulas
productoras de insulina que podriacutean ser trasplantadas en
pacientes diabeacuteticos No obstante el objetivo principal de
los autores es conseguir la inhibicioacuten de FOXO1 in vivo en
el propio paciente para transformar directa y especiacutefica‐
mente las ceacutelulas endocrinas del intestino en ceacutelulas pro‐
ductoras de insulina De momento ya estaacuten buscando un
faacutermaco capaz de inhibir FOXO1 en las ceacutelulas gastroin‐
testinales
Referencia Bouchi R et al FOXO1 inhibition yields fun‐
ctional insulin‐producing cells in human gut organoid cultu‐
res Nature Communications 5 2014 DOI101038
ncomms5242
Fuente httpnewsroomcumccolumbiaedu
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La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan insulina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 9
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
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Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
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El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
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Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
Geneacutetica Meacutedica News
Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
Geneacutetica Meacutedica News
Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
Geneacutetica Meacutedica News
14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
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El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
Geneacutetica Meacutedica News
Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
Geneacutetica Meacutedica News
Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
Geneacutetica Meacutedica News
Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
revistageneticamedicacom
La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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Una mutacioacuten en el gen VPS35 asociada al Paacuterkinson altera el reciclaje de proteiacutenas en la ceacutelula
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Un estudio colaborativo de la Universidad de Bristol
el Centro Meacutedico de la Universidad de Texas South‐
western y la Cliacutenica Mayo revela que una mutacioacuten
en el gen VPS35 asociada a la enfermedad de Parkin‐
son altera una ruta de transporte de proteiacutenas en la
ceacutelula
El gen VPS35 (vacuolar protein sorting 35 homolog)
codifica para un componente del retroacutemero comple‐
jo proteico responsable del reciclaje de los receptores
de la membrana de los endosomas (vesiacuteculas mem‐
branosas de la ceacutelula que proporcionan un espacio
donde distribuir diferentes compuestos antes de su
degradacioacuten por los lisosomas) hacia la membrana
celular o del aparato de Golgi Estudios previos ha‐
biacutean identificado mutaciones en el gen asociadas a
formas esporaacutedicas de Paacuterkinson con herencia de
tipo autosoacutemica dominante Sin embargo los efec‐
tos de estas mutaciones no habiacutean sido totalmente
caracterizados
El equipo de investigadores observoacute que la presencia
de la forma mutante de VPS35 D620N que presenta
un cambio de aminoaacutecido en su estructura primaria
daba lugar a una alteracioacuten en el reciclaje de los en‐
dosomas destinados al aparato de Golgi mantenieacuten‐
dose intacto el de aquellos dirigidos a la membrana
plasmaacutetica Ademaacutes la comparacioacuten de las proteiacutenas
de la ceacutelula que interaccionan con la forma mutante y
las que interaccionan con la forma natural de VPS35
reveloacute que el efecto principal de la mutacioacuten es una
disminucioacuten en la afinidad de VPS35 con FAM21
(family with sequence similarity 21) componente del
complejo WASH (Wiskott‐Aldrich siacutendrome and SCAR
homolog) que regula el reciclaje de los endosomas
hacia el aparato de Golgi y que como consecuencia
de la menor interaccioacuten entre sus componentes este
complejo no funcionaba de modo correcto
El profesor Peter Cullen director del trabajo ha ma‐
nifestado que el descubrimiento de los defectos mo‐
leculares asociados a la mutacioacuten en VPS35 ofrece un
camino muy interesante para la investigacioacuten de las
causas del Paacuterkinson y apunta al retroacutemero como
una potencial diana terapeacuteutica para el disentildeo de
faacutermacos destinados a combatir eacutesta y otras enfer‐
medades neurodegenerativas
Referencia McGough IJ et al Retromer Binding to
FAM21 and the WASH Complex Is Perturbed by the
Parkinson Disease‐Linked VPS35(D620N) Mutation
Curr Biol 2014 Jun 25 pii S0960‐9822(14)00740‐4
doi 101016jcub201406024
Fuentehttpwwwbristolacuknews2014june
parkinsons‐researchhtml
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Traacutefico vesicular en el interior de la ceacutelula
Imagen Judith Stoffer (Image and Video Galery NIH)
Todas las ceacutelulas de un ser humano provienen de una
uacutenica ceacutelula original que a traveacutes de sucesivas divi‐
siones va dando lugar a los diferentes linajes celula‐
res y tejidos A lo largo de la vida de un individuo sus
ceacutelulas acumulan mutaciones en el material geneacuteti‐
co denominadas mutaciones somaacuteticas debido a
que no proceden de sus padres Estas mutaciones
constituyen un registro molecular de los antepasados
de cada ceacutelula y pueden ser utilizadas para recons‐
truir su historia
Un equipo de investigadores del Wellcome Trust San‐
ger Institute en el Reino Unido en colaboracioacuten con
otros centros internacionales acaba de publicar en la
revista Nature la reconstruccioacuten de las divisiones y
mutaciones ocurridas en un conjunto de linajes celu‐
lares de ratoacuten desde el estadiacuteo embrionario hasta la
edad adulta
Los investigadores tomaron ceacutelulas individuales del
estoacutemago intestino delgado e intestino grueso de
dos ratones adultos y las crecieron hasta obtener liacute‐
neas clonales que proporcionaran suficiente ADN
para su anaacutelisis Entonces secuenciaron el genoma
completo de las 25 lineas clonales obtenidas asiacute co‐
mo el ADN extraiacutedo de la cola de los ratones La
comparacioacuten del genoma de cada liacutenea clonal con el
genoma de ratoacuten de referencia permitioacute identificar
las mutaciones somaacuteticas que se habiacutean acumulado
en cada linaje y la comparacioacuten entre los genomas de
las liacuteneas clonales permitioacute tras diferen‐
tes aproximaciones computacionales obtener un aacuter‐
bol filogeneacutetico que reflejara los cambios geneacuteticos
producidos desde los estadiacuteos embrionarios hasta las
ceacutelulas del tejido adulto
El anaacutelisis de la reconstruccioacuten proporciona diferen‐
tes conclusiones La primera de ellas es que las ceacutelu‐
las hijas obtenidas en las divisiones celulares del em‐
brioacuten temprano no contribuyen siempre de la misma
manera en los tejidos adultos Otra conclusioacuten es que
los diferentes tejidos adquieren diferente frecuencia
de mutaciones somaacuteticas algo que puede ser expli‐
cado por una diferente tasa de mutacioacuten en los teji‐
dos o por diferencias en la tasa de divisioacuten de los lina‐
jes desde la fertilizacioacuten del oacutevulo Por uacuteltimo en es‐
te estudio los investigadores obtienen liacuteneas clona‐
les a partir de ceacutelulas individuales pero es de esperar
que en el futuro las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten per‐
mitan secuenciar el genoma de una uacutenica ceacutelula de
forma que se puedan obtener filogenias celulares
precisas
Las implicaciones del estudio son importantes El
registro de mutaciones somaacuteticas puede reflejar la
evolucioacuten de las ceacutelulas normales a ceacutelulas cancero‐
sas asiacute como proporcionar informacioacuten sobre el
desarrollo de diferentes tejidos Sam Behjati primer
autor del trabajo lo expresa de la siguiente manera
ldquoSi podemos entender coacutemo mutan las ceacutelulas nor‐
males sanas conforme se van dividiendo a lo largo
de la vida de una persona ganaremos un conoci‐
miento fundamental de como difieren de las ceacutelulas
del caacutencerrdquo
Referencia Behjati S et al Genome sequencing of
normal cells reveals developmental lineages and muta‐
tional processes Nature 2014 DOI101038
nature13448
Fuentehttpswwwsangeracukabout
press2014140629html
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Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula
8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una de las aproximaciones terapeacuteuticas maacutes atractivas
para el tratamiento de la diabetes es la obtencioacuten de ceacutelu‐
las productoras de insulina que puedan ser trasplantadas
a los pacientes para compensar la falta de funcioacuten de sus
propias ceacutelulas La mayor parte de los esfuerzos para pro‐
ducir estas factoriacuteas celulares de insulina se ha concentra‐
do en la utilizacioacuten de ceacutelulas madre bien embrionarias
bien de pluripotencia inducida para diferenciarlas en ceacutelu‐
las beta‐pancreaacuteticas con resultados que si bien son pro‐
metedores no terminan de reunir todas las caracteriacutesti‐
cas funcionales necesarias
Esta semana investigadores del Naomi Berrie Diabetes
Center de la Universidad de Columbia EEUU han publi‐
cado un trabajo con un planteamiento diferente han con‐
seguido mediante la inactivacioacuten de un uacutenico gen el gen
FOXO1 (forkhead box O1) que ceacutelulas gastrointestinales
humanas produzcan insulina
La idea no es nueva ya que el mismo equipo de investiga‐
dores consiguioacute hace dos antildeos que ceacutelulas del intestino de
ratoacuten liberaran insulina en respuesta a los niveles de glu‐
cosa y que ademaacutes normalizaran la concentracioacuten de
glucosa en sangre en ratones modelo para la diabetes Sin
embargo faltaba llevar a cabo la prueba de concepto que
demostrara la efectividad del meacutetodo en humanos ldquoAl
mostrar que las ceacutelulas humanas pueden responder del
mismo modo que las ceacutelulas de ratoacuten hemos despejado
un obstaacuteculo y podemos seguir adelante para intentar
convertir este tratamiento en una realidadrdquo ha comenta‐
do Domenico Accili director del trabajo
La utilizacioacuten de ceacutelulas gastrointestinales y no de otro
tipo no fue una decisioacuten tomada al azar Evidencias pre‐
vias indicaban que las ceacutelulas endocrinas pancreaacuteticas y
enteacutericas pueden convertirse en diferentes tipos celula‐
res posiblemente mediante su desdiferenciacioacuten Antes
de iniciar el experimento de inactivacioacuten del gen el equi‐
po de Accili identificoacute su presencia en el intestino hu‐
mano y observoacute que de forma similar al ratoacuten el gen es
especiacutefico de los progenitores de las ceacutelulas endocrinas y
ceacutelulas positivas para serotonina Para ver el efecto de la
inhibicioacuten de FOXO1 en humanos el equipo generoacute orga‐
noides intestinales pequentildeas reacuteplicas del intestino que
reproducen sus caracteriacutesticas funcionales a partir de
ceacutelulas madre pluripotenciales inducidas humanas La
inactivacioacuten del gen FOXO1 en estos organoides derivoacute en
la transformacioacuten de las ceacutelulas en ceacutelulas productoras de
insulina y lo que es maacutes importante la liberacioacuten de insu‐
lina se produciacutea en las condiciones fisioloacutegicas adecuadas
es decir en respuesta a los niveles de glucosa
Los resultados obtenidos en el estudio ofrecen una viacutea
interesante para generar grandes cantidades de ceacutelulas
productoras de insulina que podriacutean ser trasplantadas en
pacientes diabeacuteticos No obstante el objetivo principal de
los autores es conseguir la inhibicioacuten de FOXO1 in vivo en
el propio paciente para transformar directa y especiacutefica‐
mente las ceacutelulas endocrinas del intestino en ceacutelulas pro‐
ductoras de insulina De momento ya estaacuten buscando un
faacutermaco capaz de inhibir FOXO1 en las ceacutelulas gastroin‐
testinales
Referencia Bouchi R et al FOXO1 inhibition yields fun‐
ctional insulin‐producing cells in human gut organoid cultu‐
res Nature Communications 5 2014 DOI101038
ncomms5242
Fuente httpnewsroomcumccolumbiaedu
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La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan insulina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 9
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
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Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
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El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
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Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
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Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
Geneacutetica Meacutedica News
14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
Geneacutetica Meacutedica News
El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
Geneacutetica Meacutedica News
Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
Geneacutetica Meacutedica News
Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
revistageneticamedicacom
La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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Todas las ceacutelulas de un ser humano provienen de una
uacutenica ceacutelula original que a traveacutes de sucesivas divi‐
siones va dando lugar a los diferentes linajes celula‐
res y tejidos A lo largo de la vida de un individuo sus
ceacutelulas acumulan mutaciones en el material geneacuteti‐
co denominadas mutaciones somaacuteticas debido a
que no proceden de sus padres Estas mutaciones
constituyen un registro molecular de los antepasados
de cada ceacutelula y pueden ser utilizadas para recons‐
truir su historia
Un equipo de investigadores del Wellcome Trust San‐
ger Institute en el Reino Unido en colaboracioacuten con
otros centros internacionales acaba de publicar en la
revista Nature la reconstruccioacuten de las divisiones y
mutaciones ocurridas en un conjunto de linajes celu‐
lares de ratoacuten desde el estadiacuteo embrionario hasta la
edad adulta
Los investigadores tomaron ceacutelulas individuales del
estoacutemago intestino delgado e intestino grueso de
dos ratones adultos y las crecieron hasta obtener liacute‐
neas clonales que proporcionaran suficiente ADN
para su anaacutelisis Entonces secuenciaron el genoma
completo de las 25 lineas clonales obtenidas asiacute co‐
mo el ADN extraiacutedo de la cola de los ratones La
comparacioacuten del genoma de cada liacutenea clonal con el
genoma de ratoacuten de referencia permitioacute identificar
las mutaciones somaacuteticas que se habiacutean acumulado
en cada linaje y la comparacioacuten entre los genomas de
las liacuteneas clonales permitioacute tras diferen‐
tes aproximaciones computacionales obtener un aacuter‐
bol filogeneacutetico que reflejara los cambios geneacuteticos
producidos desde los estadiacuteos embrionarios hasta las
ceacutelulas del tejido adulto
El anaacutelisis de la reconstruccioacuten proporciona diferen‐
tes conclusiones La primera de ellas es que las ceacutelu‐
las hijas obtenidas en las divisiones celulares del em‐
brioacuten temprano no contribuyen siempre de la misma
manera en los tejidos adultos Otra conclusioacuten es que
los diferentes tejidos adquieren diferente frecuencia
de mutaciones somaacuteticas algo que puede ser expli‐
cado por una diferente tasa de mutacioacuten en los teji‐
dos o por diferencias en la tasa de divisioacuten de los lina‐
jes desde la fertilizacioacuten del oacutevulo Por uacuteltimo en es‐
te estudio los investigadores obtienen liacuteneas clona‐
les a partir de ceacutelulas individuales pero es de esperar
que en el futuro las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten per‐
mitan secuenciar el genoma de una uacutenica ceacutelula de
forma que se puedan obtener filogenias celulares
precisas
Las implicaciones del estudio son importantes El
registro de mutaciones somaacuteticas puede reflejar la
evolucioacuten de las ceacutelulas normales a ceacutelulas cancero‐
sas asiacute como proporcionar informacioacuten sobre el
desarrollo de diferentes tejidos Sam Behjati primer
autor del trabajo lo expresa de la siguiente manera
ldquoSi podemos entender coacutemo mutan las ceacutelulas nor‐
males sanas conforme se van dividiendo a lo largo
de la vida de una persona ganaremos un conoci‐
miento fundamental de como difieren de las ceacutelulas
del caacutencerrdquo
Referencia Behjati S et al Genome sequencing of
normal cells reveals developmental lineages and muta‐
tional processes Nature 2014 DOI101038
nature13448
Fuentehttpswwwsangeracukabout
press2014140629html
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Reconstruccioacuten de la historia geneacutetica de una ceacutelula
8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Una de las aproximaciones terapeacuteuticas maacutes atractivas
para el tratamiento de la diabetes es la obtencioacuten de ceacutelu‐
las productoras de insulina que puedan ser trasplantadas
a los pacientes para compensar la falta de funcioacuten de sus
propias ceacutelulas La mayor parte de los esfuerzos para pro‐
ducir estas factoriacuteas celulares de insulina se ha concentra‐
do en la utilizacioacuten de ceacutelulas madre bien embrionarias
bien de pluripotencia inducida para diferenciarlas en ceacutelu‐
las beta‐pancreaacuteticas con resultados que si bien son pro‐
metedores no terminan de reunir todas las caracteriacutesti‐
cas funcionales necesarias
Esta semana investigadores del Naomi Berrie Diabetes
Center de la Universidad de Columbia EEUU han publi‐
cado un trabajo con un planteamiento diferente han con‐
seguido mediante la inactivacioacuten de un uacutenico gen el gen
FOXO1 (forkhead box O1) que ceacutelulas gastrointestinales
humanas produzcan insulina
La idea no es nueva ya que el mismo equipo de investiga‐
dores consiguioacute hace dos antildeos que ceacutelulas del intestino de
ratoacuten liberaran insulina en respuesta a los niveles de glu‐
cosa y que ademaacutes normalizaran la concentracioacuten de
glucosa en sangre en ratones modelo para la diabetes Sin
embargo faltaba llevar a cabo la prueba de concepto que
demostrara la efectividad del meacutetodo en humanos ldquoAl
mostrar que las ceacutelulas humanas pueden responder del
mismo modo que las ceacutelulas de ratoacuten hemos despejado
un obstaacuteculo y podemos seguir adelante para intentar
convertir este tratamiento en una realidadrdquo ha comenta‐
do Domenico Accili director del trabajo
La utilizacioacuten de ceacutelulas gastrointestinales y no de otro
tipo no fue una decisioacuten tomada al azar Evidencias pre‐
vias indicaban que las ceacutelulas endocrinas pancreaacuteticas y
enteacutericas pueden convertirse en diferentes tipos celula‐
res posiblemente mediante su desdiferenciacioacuten Antes
de iniciar el experimento de inactivacioacuten del gen el equi‐
po de Accili identificoacute su presencia en el intestino hu‐
mano y observoacute que de forma similar al ratoacuten el gen es
especiacutefico de los progenitores de las ceacutelulas endocrinas y
ceacutelulas positivas para serotonina Para ver el efecto de la
inhibicioacuten de FOXO1 en humanos el equipo generoacute orga‐
noides intestinales pequentildeas reacuteplicas del intestino que
reproducen sus caracteriacutesticas funcionales a partir de
ceacutelulas madre pluripotenciales inducidas humanas La
inactivacioacuten del gen FOXO1 en estos organoides derivoacute en
la transformacioacuten de las ceacutelulas en ceacutelulas productoras de
insulina y lo que es maacutes importante la liberacioacuten de insu‐
lina se produciacutea en las condiciones fisioloacutegicas adecuadas
es decir en respuesta a los niveles de glucosa
Los resultados obtenidos en el estudio ofrecen una viacutea
interesante para generar grandes cantidades de ceacutelulas
productoras de insulina que podriacutean ser trasplantadas en
pacientes diabeacuteticos No obstante el objetivo principal de
los autores es conseguir la inhibicioacuten de FOXO1 in vivo en
el propio paciente para transformar directa y especiacutefica‐
mente las ceacutelulas endocrinas del intestino en ceacutelulas pro‐
ductoras de insulina De momento ya estaacuten buscando un
faacutermaco capaz de inhibir FOXO1 en las ceacutelulas gastroin‐
testinales
Referencia Bouchi R et al FOXO1 inhibition yields fun‐
ctional insulin‐producing cells in human gut organoid cultu‐
res Nature Communications 5 2014 DOI101038
ncomms5242
Fuente httpnewsroomcumccolumbiaedu
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La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan insulina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 9
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
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Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
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El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
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Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
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Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
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El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
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Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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Una de las aproximaciones terapeacuteuticas maacutes atractivas
para el tratamiento de la diabetes es la obtencioacuten de ceacutelu‐
las productoras de insulina que puedan ser trasplantadas
a los pacientes para compensar la falta de funcioacuten de sus
propias ceacutelulas La mayor parte de los esfuerzos para pro‐
ducir estas factoriacuteas celulares de insulina se ha concentra‐
do en la utilizacioacuten de ceacutelulas madre bien embrionarias
bien de pluripotencia inducida para diferenciarlas en ceacutelu‐
las beta‐pancreaacuteticas con resultados que si bien son pro‐
metedores no terminan de reunir todas las caracteriacutesti‐
cas funcionales necesarias
Esta semana investigadores del Naomi Berrie Diabetes
Center de la Universidad de Columbia EEUU han publi‐
cado un trabajo con un planteamiento diferente han con‐
seguido mediante la inactivacioacuten de un uacutenico gen el gen
FOXO1 (forkhead box O1) que ceacutelulas gastrointestinales
humanas produzcan insulina
La idea no es nueva ya que el mismo equipo de investiga‐
dores consiguioacute hace dos antildeos que ceacutelulas del intestino de
ratoacuten liberaran insulina en respuesta a los niveles de glu‐
cosa y que ademaacutes normalizaran la concentracioacuten de
glucosa en sangre en ratones modelo para la diabetes Sin
embargo faltaba llevar a cabo la prueba de concepto que
demostrara la efectividad del meacutetodo en humanos ldquoAl
mostrar que las ceacutelulas humanas pueden responder del
mismo modo que las ceacutelulas de ratoacuten hemos despejado
un obstaacuteculo y podemos seguir adelante para intentar
convertir este tratamiento en una realidadrdquo ha comenta‐
do Domenico Accili director del trabajo
La utilizacioacuten de ceacutelulas gastrointestinales y no de otro
tipo no fue una decisioacuten tomada al azar Evidencias pre‐
vias indicaban que las ceacutelulas endocrinas pancreaacuteticas y
enteacutericas pueden convertirse en diferentes tipos celula‐
res posiblemente mediante su desdiferenciacioacuten Antes
de iniciar el experimento de inactivacioacuten del gen el equi‐
po de Accili identificoacute su presencia en el intestino hu‐
mano y observoacute que de forma similar al ratoacuten el gen es
especiacutefico de los progenitores de las ceacutelulas endocrinas y
ceacutelulas positivas para serotonina Para ver el efecto de la
inhibicioacuten de FOXO1 en humanos el equipo generoacute orga‐
noides intestinales pequentildeas reacuteplicas del intestino que
reproducen sus caracteriacutesticas funcionales a partir de
ceacutelulas madre pluripotenciales inducidas humanas La
inactivacioacuten del gen FOXO1 en estos organoides derivoacute en
la transformacioacuten de las ceacutelulas en ceacutelulas productoras de
insulina y lo que es maacutes importante la liberacioacuten de insu‐
lina se produciacutea en las condiciones fisioloacutegicas adecuadas
es decir en respuesta a los niveles de glucosa
Los resultados obtenidos en el estudio ofrecen una viacutea
interesante para generar grandes cantidades de ceacutelulas
productoras de insulina que podriacutean ser trasplantadas en
pacientes diabeacuteticos No obstante el objetivo principal de
los autores es conseguir la inhibicioacuten de FOXO1 in vivo en
el propio paciente para transformar directa y especiacutefica‐
mente las ceacutelulas endocrinas del intestino en ceacutelulas pro‐
ductoras de insulina De momento ya estaacuten buscando un
faacutermaco capaz de inhibir FOXO1 en las ceacutelulas gastroin‐
testinales
Referencia Bouchi R et al FOXO1 inhibition yields fun‐
ctional insulin‐producing cells in human gut organoid cultu‐
res Nature Communications 5 2014 DOI101038
ncomms5242
Fuente httpnewsroomcumccolumbiaedu
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La inactivacioacuten de un gen hace que ceacutelulas gastrointestinales produzcan insulina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 9
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
Geneacutetica Meacutedica News
Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
Geneacutetica Meacutedica News
El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
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Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
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Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
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14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
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El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
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Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
Geneacutetica Meacutedica News
Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
revistageneticamedicacom
La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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Investigadores del Whitehead Institute en Massachu‐
setts EEUU han llevado a cabo modificaciones ge‐
neacuteticas y enzimaacuteticas de los eritrocitos de la sangre
que hacen posible el transporte de compuestos de
intereacutes a localizaciones especiacuteficas del organismo
El meacutetodo se aprovecha de algunas de las caracteriacutes‐
ticas de los eritrocitos que los convierten en un exce‐
lente medio para desarrollar aplicaciones terapeacuteuti‐
cas En primer lugar los eritrocitos son un tipo celular
muy abundante que se distribuye y circula por gran
parte del organismo Ademaacutes su vida media es ex‐
tensa alcanzando hasta 120 diacuteas en humanos y 50 en
ratoacuten Por uacuteltimo los eritrocitos maduros carecen de
nuacutecleo por lo que si se modifican geneacuteticamente las
ceacutelulas precursoras de los eritrocitos tras su diferen‐
ciacioacuten y peacuterdida del nuacutecleo (con su correspondiente
material hereditario) no quedan rastros de las altera‐
ciones geneacuteticas introducidas
Teniendo en cuenta estas caracteriacutesticas los investi‐
gadores introdujeron en ceacutelulas precursoras de eri‐
trocitos genes que expresaran proteiacutenas de la super‐
ficie modificadas Al madurar los eritrocitos estas
proteiacutenas permaneciacutean en la membrana donde eran
sometidas a otra modificacioacuten enzimaacutetica consisten‐
te en el establecimiento de un enlace covalente entre
la proteiacutena de superficie y una sustancia de eleccioacuten
que podriacutea ser un anticuerpo un faacutermaco una antito‐
xina o una sonda para utilizarse en diagnoacutestico entre
otras posibilidades Los eritrocitos disentildeados con
anticuerpos especiacuteficos tienen el potencial de poder
quedar retenidos en determinadas localizaciones del
cuerpo lo que permitiriacutea tener como diana a pobla‐
ciones de ceacutelulas concretas
El meacutetodo probado en ratones y ceacutelulas humanas
permite disentildear eritrocitos modificados con cualquier
componente en condiciones nativas y con un riesgo
miacutenimo de dantildear su estructura en el proceso
Las aplicaciones resultan sorprendentes Eritrocitos
fabricados con moleacuteculas terapeacuteuticas en su interior
y moacutedulos de especificidad celular en su membrana
podriacutean distribuir su contenido a tejidos o localizacio‐
nes especiacuteficas O en el caso de incluir por ejemplo
sondas de imagen permitir llevar a cabo diagnoacutesti‐
cos O con anticuerpos en su superficie podriacutean utili‐
zarse para neutralizar toxinas en el organismo
El meacutetodo ha llamado la atencioacuten de la Agencia de
Proyectos de Investigacioacuten Avanzada en Defensa
(DARPA en sus siglas en ingleacutes) del Gobierno Militar
de los EEUU la cual estaacute apoyando la investigacioacuten
con el objetivo de desarrollar tratamientos o vacunas
frente a armas bioloacutegicas
ldquoQueriacuteamos crear eritrocitos de elevado valor que no
transportaran simplemente oxiacutegenordquo ha manifesta‐
do Harvey Lodish director del trabajo junto a Hidde
Ploegh ldquoHemos establecido la tecnologiacutea para crear
eritrocitos de ratoacuten y humanos en cultivo que pueden
expresar lo que queramos y potencialmente ser utili‐
zados con fines terapeacuteuticos o de diagnoacutesticordquo
Referencia Shi J et alEngineered red blood cells as
carriers for systemic delivery of a wide array of functio‐
nal probes Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun 30 pii
201409861
Fuentehttpwimitedunewsarchive2014
engineered‐red‐blood‐cells‐could‐carry‐precious‐
therapeutic‐cargo
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Eritrocitos de disentildeo con funciones terapeacuteuticas
10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
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El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
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Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
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Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
Geneacutetica Meacutedica News
14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
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El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
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Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
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Noticias breves
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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Los oligodendrocitos constituyen el tipo celular del
sistema nervioso central encargado de producir la
mielina sustancia que recubre los axones neurona‐
les y permite la transmisioacuten de los impulsos nervio‐
sos Cuando el recubrimiento de mielina se altera la
transmisioacuten de sentildeales entre las neuronas es defec‐
tuosa lo que puede dar lugar a enfermedades como
la esclerosis muacuteltiple Una de las terapias potencia‐
les para este tipo de enfermedades es el trasplante
de ceacutelulas productoras de mielina Sin embargo los
meacutetodos de diferenciacioacuten de ceacutelulas madre actua‐
les tienen muchas limitaciones y obtener suficientes
ceacutelulas para ser trasplantadas es una tarea laboriosa
y poco eficiente
Investigadores de la Universidad de Buffalo EEUU
han identificado un gen cuya actividad induce la di‐
ferenciacioacuten de progenitores neurales en precurso‐
res de oligodendrocitos resultado que tiene implica‐
ciones importantes en el desarrollo de terapias para
las enfermedades humanas que cursan con desmieli‐
nizacioacuten
Mediante anaacutelisis de microarrays y comparacioacuten de
los perfiles de expresioacuten de ceacutelulas progenitoras
neurales y ceacutelulas progenitoras de oligodendrocitos
los investigadores identificaron 10 factores de trans‐
cripcioacuten expresados exclusivamente en las ceacutelulas
precursoras de los oligodendrocitos A continuacioacuten
introdujeron los genes correspondientes a esos fac‐
tores de transcripcioacuten en progenitores neurales pa‐
ra determinar cuaacuteles de ellos convertiacutean las ceacutelulas
progenitoras neurales en progenitores de oligoden‐
drocitos De los 10 uacutenicamente el gen SOX10 (SRY
sex determining regioacuten y‐box 10) indujo la transfor‐
macioacuten Ademaacutes SOX10 tambieacuten es capaz de acele‐
rar la diferenciacioacuten de los precursores en oligoden‐
drocitos lo cual es relevante ya que uno de los pro‐
blemas de la esclerosis muacuteltiple es que las ceacutelulas
quedan paralizadas en el proceso de diferenciacioacuten
ldquoEn la esclerosis muacuteltiple en primer lugar el sistema
inmune ataca el cerebro pero el eacuteste es incapaz de
repararse de forma efectivardquo explica Fraser Sim
director del trabajo ldquoSi pudieacuteramos acelerar la eta‐
pa de regeneracioacuten facilitando la formacioacuten de oli‐
godendrocitos quizaacutes podriacuteamos mantener a los
pacientes en un estadiacuteo de regresioacuten de la esclerosis
muacuteltiple menos devastador que los estadiacuteos poste‐
riores de progresioacuten de la enfermedadrdquo
Referencia Wang J et al Transcription factor induc‐
tion of human oligodendrocyte progenitor fate and
differentiation Proc Natl Acad Sci U S A 2014 Jun
30 pii 201408295
Fuentehttpwwwbuffaloedunews
releases201406038html
Geneacutetica Meacutedica News
El gen SOX10 clave para la formacioacuten de mielina
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 11
revistageneticamedicacom
Imagen National Institute on Aging [Public domain] via Wikimedia Commons
Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
Geneacutetica Meacutedica News
Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
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14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
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El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
Geneacutetica Meacutedica News
Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
Geneacutetica Meacutedica News
Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
Geneacutetica Meacutedica News
Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
Geneacutetica Meacutedica News
22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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Las tecnologiacuteas de secuenciacioacuten de uacuteltima genera‐
cioacuten han revolucionado el campo de la geneacutetica al
permitir la obtencioacuten de genomas en tiempo y a pre‐
cios cada vez maacutes reducidos No obstante estas teacutec‐
nicas mantienen todaviacutea ciertas limitaciones como la
compleja y cara instrumentacioacuten o el hecho de gene‐
rar lecturas muy cortas de las secuencias que requie‐
ren elevados tiempos de anaacutelisis
La secuenciacioacuten mediante nanoporos se presentoacute
como una alternativa hace algunos antildeos pero debido
a diversos problemas teacutecnicos las promesas de una
secuenciacioacuten barata raacutepida con lecturas extensas y
aparataje simple no se han hecho realidad Aun asiacute
todo parece indicar que cada vez estaacuten maacutes cerca
Un equipo de la Universidad de Washington EEUU
ha conseguido mediante esta teacutecnica secuenciar de
forma robusta el genoma del bacterioacutefago Phi‐X174
obteniendo secuencias de una longitud de hasta
4500 nucleoacutetidos (frente a los 50‐150 de las teacutecnicas
de secuenciacioacuten de uacuteltima generacioacuten)
La teacutecnica de secuenciacioacuten mediante nanoporos se
basa en la utilizacioacuten de poros de diaacutemetro de 1 na‐
noacutemetro tamantildeo suficiente para el paso de una he‐
bra de ADN Los poros se insertan en una membrana
que separa dos soluciones creando canales que co‐
munican ambas soluciones Cuando se aplica un pe‐
quentildeo voltaje a traveacutes de la membrana los iones de
la solucioacuten fluyen a traveacutes del poro y el ADN cargado
negativamente es atraiacutedo hacia el poro Al entrar en
eacuteste las cadenas sencillas de ADN bloquean parte
del flujo de iones en una fraccioacuten que depende de la
identidad de los nucleoacutetidos
Debido a la dificultad de identificar cada uno de los
nucleoacutetidos por separado los investigadores caracte‐
rizaron la sentildeal obtenida por todas las combinacio‐
nes posibles de los 4 nucleoacutetidos que conforman el
ADN (256 combinaciones en total) y crearon algorit‐
mos que asignaban los cambios de corriente genera‐
dos por un segmento de ADN a los cambios de co‐
rriente esperados seguacuten las secuencias de las bases
de datos
Aunque el meacutetodo uacutenicamente permite secuenciar
fragmentos conocidos de ADN y no da informacioacuten
sobre la secuenciacioacuten de novo el hecho de imple‐
mentarse en un laboratorio de pequentildeo tamantildeo y
con instrumentos de bajo coste experimental apunta
a que mejorando algunas de sus caracteriacutesticas la
secuenciacioacuten mediante nanoporos todaviacutea tiene
mucho que aportar
ldquoEsta es la primera vez que alguien muestra que los
nanoporos pueden ser utilizados para generar firmas
interpretables de secuencias de ADN muy largas
desde genomas reales Es un gran paso hacia adelan‐
terdquo ha manifestado Jay Shendure coautor del traba‐
jo publicado en Nature Biotechnology
Diferentes empresas se han interesado en los uacuteltimos
antildeos en el desarrollo de la secuenciacioacuten mediante
nanoporos y mantienen licencias para su utilizacioacuten
como Oxford Nanopore Technologies Agilent Labora‐
tories Noblegen o Genia Queda por ver si estos re‐
cientes resultados contribuyen al lanzamiento de
nuevos avances en esta tecnologiacutea
Referencia Laszlo AH et al Decoding long nanopore
sequencing reads of natural DNA Nat Biotechnol
2014 Jun 25 doi101038nbt2950
Fuentehttpwwwwashingtonedu
news20140626nanopore‐technique‐rapidly‐
decodes‐long‐dna‐strands
Geneacutetica Meacutedica News
Un paso hacia adelante para la secuenciacioacuten mediante nanoporos
12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 13
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
Geneacutetica Meacutedica News
14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
Geneacutetica Meacutedica News
El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
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Noticias breves
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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Los cambios en el nuacutemero de copias de la regioacuten
cromosoacutemica 15q112 son un factor de riesgo para la
esquizofrenia y el autismo Con el objetivo de deter‐
minar las causas por las que esta regioacuten es importan‐
te en enfermedades de tipo psiquiaacutetrico un equipo
de la Universidad de John Hopkins en EEUU ha
analizado los efectos de tener una uacutenica copia de
15q112 en ceacutelulas pluripotenciales inducidas huma‐
nas e identificado el papel del gen CYFIP1
(cytoplasmic FMR1 interacting protein) en el desarro‐
llo del cerebro
Para determinar el efecto de la delecioacuten de 15q112
en ceacutelulas nerviosas humanas los investigadores
tomaron ceacutelulas de la piel de individuos que presen‐
taban una uacutenica copia de la regioacuten cromosoacutemica
15q112 en lugar de las dos habituales y las repro‐
gramaron en ceacutelulas progenitoras neurales Normal‐
mente este tipo celular crece formando rosetas or‐
denadas sin embargo en las ceacutelulas con la delecioacuten
en 15q112 lo que se observoacute fue la presencia de de‐
fectos en las uniones adherens entre las ceacutelulas y
alteraciones en la polaridad celular
Esto indicaba que uno o maacutes genes localizados en la
regioacuten 15q112 participan en los procesos que con‐
trolan la polaridad y mantienen las uniones de tipo
adherens entre las ceacutelulas Entre los genes de la re‐
gioacuten se encuentra CYFIP1 que codifica para un re‐
gulador del complejo WAVE implicado en la forma‐
cioacuten de filamentos de actina Los investigadores ob‐
servaron que las ceacutelulas con una uacutenica copia de
15q112 presentaban no soacutelo niveles reducidos de
CYFIP1 sino tambieacuten de WAVE2 (WAS protein fa‐
mily member 2) otro componente del complejo
WAVE y ademaacutes la recuperacioacuten de los niveles nor‐
males de expresioacuten de CYFIP1 rescataba el fenotipo
lo que en conjunto indicaba que los defectos obser‐
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Gen CYFIP1 esquizofrenia y desarrollo del cerebro
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
Geneacutetica Meacutedica News
El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
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Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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vados en las ceacutelulas se debiacutean a la desestabilizacioacuten
del complejo WAVE
Para validar la hipoacutetesis en un contexto fisioloacutegico
maacutes complejo el equipo analizoacute la funcioacuten de CYFIP1
en un modelo de ratoacuten En primer lugar se observoacute
que en la corteza cerebral en desarrollo CYFIP1 se
expresa en el extremo apical de las ceacutelulas gliales ra‐
diales ceacutelulas del sistema nervioso bipolares que diri‐
gen la migracioacuten de los precursores neuronales du‐
rante la formacioacuten de la corteza cerebral La inactiva‐
cioacuten de CYFIP1 en este tipo celular provocoacute que tanto
las ceacutelulas gliales radiales como su descendencia
mostraran una distribucioacuten desorganizada provo‐
cando la alteracioacuten de las capas corticales del cere‐
bro algo criacutetico para el correcto funcionamiento del
cerebro Asiacute los investigadores concluyeron que los
defectos observados en la localizacioacuten de las ceacutelulas
y la alteracioacuten de las uniones entre ellas se debiacutean a
defectos de la ruta de sentildealizacioacuten mediada por CY‐
FIP1 y WAVE en las ceacutelulas gliales radiales En estas
la correcta formacioacuten del citoesqueleto se ve altera‐
da en ausencia de CYFIP1 lo que hace que las unio‐
nes adherens o puntos de contacto del citoesqueleto
entre dos ceacutelulas sea defectuosa
Por uacuteltimo el equipo de investigadores analizoacute datos
procedentes de estudios de asociacioacuten del genoma
completo para determinar si habiacutea asociacioacuten entre
polimorfismos de la ruta CYFIP1‐WAVE con la esqui‐
zofrenia A pesar de no encontrar dicha asociacioacuten siacute
se detectoacute una interaccioacuten importante entre polimor‐
fismos del gen CYFIP1 y del gen ACTR2Apr2 (ARP2
actin related protein 2 homolog) tambieacuten mediador
de la sentildealizacioacuten WAVE que combina‐
dos incrementan el riesgo a desarrollar esquizofre‐
nia
Ademaacutes del aporte a la investigacioacuten de las bases
bioacutelogicas de la esquizofrenia los resultados y con‐
clusiones reflejados en el trabajo publicado en Cell
Stem Cell muestran la viabilidad de utilizar ceacutelulas
madre pluripotenciales inducidas humanas en el es‐
tudio de enfermedades psiquiaacutetricas como punto de
partida para identificar mecanismos o rutas molecu‐
lares implicados en las mismas antes de validar los
resultados en animales modelo Los autores comien‐
zan analizando una modificacioacuten geneacutetica en un sis‐
tema humano simple (cultivo celular de ceacutelulas ma‐
dre pluripotenciales) lo validan en un modelo de ra‐
toacuten y contrastan los resultados obtenidos en un siste‐
ma humano complejo (anaacutelisis del genoma de pa‐
cientes para una determinada enfermedad psiquiaacutetri‐
ca)
Referencia Yoon KJ et al Modeling a Genetic Risk for
Schizophrenia in iPSCs and Mice Reveals Neural Stem
Cell Deficits Associated with Adherens Junctions and
Polarity Cell Stem Cell 2014 Jul 315(1)79‐91 doi
101016jstem201405003
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14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
Fuente cnioes
Geneacutetica Meacutedica News
El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
revistageneticamedicacom
Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
Geneacutetica Meacutedica News
Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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Desde la publicacioacuten del primer borrador del geno‐
ma humano el nuacutemero de genes que se traducen en
proteiacutenas o genes codificantes ha sido objeto de
intenso estudio Las primeras estimas redujeron de
100000 a 30000 genes cantidad que ha ido siendo
revisada y disminuyendo cada vez maacutes
La uacuteltima reduccioacuten es fruto de un trabajo del Centro
Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas liderado
por Alfonso Valencia y Michael Tress que estima en
19000 el nuacutemero de genes que codifican proteiacutenas
El estudio publicado en Human Molecular Genetics
tambieacuten concluye que el origen de praacutecticamente
todos estos genes es anterior a la aparicioacuten de los
primates esto es hace maacutes de 50 millones de antildeos
Los investigadores recopilaron a partir de diferentes
trabajos y bases de datos proteoacutemicas la informa‐
cioacuten relativa a los peacuteptidos aislados de los distintos
tejidos y tipos celulares del cuerpo humano y los
contrastaron con los genes anotados del genoma
humano De este modo pudieron estimar que cerca
de 1900 genes anotados en el genoma humano de
referencia GENCODE 19 son genes no codificantes
o pseudogenes (copias no funcionales de genes) y
encontraron 58 genes que sin estar anotados codi‐
ficaban para proteiacutenas
Los resultados obtenidos tienen implicaciones im‐
portantes En primer lugar a nivel evolutivo los da‐
tos indican que maacutes de un 95 de los genes se re‐
montan a los metazoos organismos pluricelulares
de hace cientos de miles de antildeos La cantidad as‐
ciende a maacutes del 99 para genes con un origen an‐
terior a la aparicioacuten de los primates hace 50 millo‐
nes de antildeos No obstante conviene tener en cuenta
que gran parte de la complejidad de los organismos
superiores no estaacute determinada por el nuacutemero de
genes que codifican proteiacutenas sino por los mecanis‐
mos de regulacioacuten y control de la expresioacuten o activi‐
dad proteica
A nivel de anotacioacuten del genoma la nueva reduccioacuten
en el nuacutemero de genes deberaacute ser incorporada en las
bases de datos por lo que seraacute necesario redefinir
toda la cartografiacutea del genoma humano Teniendo
en cuenta que eacuteste es una referencia para los geno‐
mas de otras especies el genoma humano permitiraacute
la revisioacuten y anotacioacuten maacutes precisa de otros geno‐
mas
Por uacuteltimo puesto que la anotacioacuten del genoma hu‐
mano y las bases de datos asociadas se utilizan en
numerosos proyectos de investigacioacuten los cambios
introducidos con cada nueva anotacioacuten pueden te‐
ner un impacto importante en el desarrollo de los
mismos
Referencia Ezkurdia I et al Multiple evidence
strands suggest that there may be as few as 19 000
human protein‐coding genes Hum Mol Genet 2014
Jun 16 pii ddu309
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El genoma humano es reducido a 19000 genes codificantes
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 15
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
NEJMoa1313977
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Geneacutetica y ambiente en el riesgo a desarrollar enfermedad celiacuteaca
16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Imagen Jonathan Bailey (National Human Genome Research Institute)
Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
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Noticias breves
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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Determinados haplotipos en los genes que codifican
para los antiacutegenos leucocitarios (HLA en sus siglas en
ingleacutes) se presentan con elevada frecuencia en pa‐
cientes con enfermedad celiacuteaca Sin embargo debi‐
do a que estos haplotipos se encuentran tambieacuten en
la poblacioacuten general su presencia no es suficiente
para el diagnoacutestico
Un estudio multinacional ha analizado la incidencia
de la enfermedad celiacuteaca y la autoinmunidad asocia‐
da en maacutes de 6000 nintildeos identificados como porta‐
dores de los haplotipos de riesgo DR3‐DQ2 o DR4‐
DQ8 en los genes HLA Los resultados se publican en
el New England Journal of Medicine
Los investigadores encontraron que los nintildeos con
una copia del haplotipo DR3‐DQ2 y especialmente
los homocigotos con dos copias tienen un riesgo
elevado de desarrollar enfermedad celiacuteaca y autoin‐
munidad asociada de forma temprana en la nintildeez
Aproximadamente un 26 de los homocigotos
desarrollaron autoinmunidad de la enfermedad celiacutea‐
ca antes de los 5 antildeos
El estudio confirma resultados previos y apunta a
identificar de forma temprana a los nintildeos con eleva‐
do riesgo a desarrollar la enfermedad celiaca con el
objetivo de poder llevar a cabo un seguimiento estre‐
cho de los mismos y controlar la aparicioacuten de la en‐
fermedad
El trabajo tambieacuten muestra diferencias en el riesgo a
desarrollar la enfermedad celiacuteaca en funcioacuten del ori‐
gen geograacutefico de los individuos Al comparar entre
individuos de los diferentes paiacuteses analizados Esta‐
dos Unidos Finlandia Alemania y Suecia el riesgo a
ser celiacuteaco se duplicaba en eacuteste uacuteltimo Los investiga‐
dores destacan por tanto la importancia de entender
la enfermedad celiacuteaca como una enfermedad multi‐
factorial en la que interaccionan factores geneacuteticos y
ambientales Por ejemplo diferentes estudios apun‐
tan a la duracioacuten de la lactancia materna o la edad de
exposicioacuten al gluten como factores a tener en cuenta
Referencia Liu E et al Risk of pediatric celiac disease
according to HLA haplotype and country N Engl J
Med 2014 Jul 3371(1)42‐9 doi 101056
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Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
Geneacutetica Meacutedica News
Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 17
revistageneticamedicacom
En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
Geneacutetica Meacutedica News
Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
Geneacutetica Meacutedica News
Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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Los trastornos del espectro del autismo (TEA) englo‐
ban un conjunto de siacutendromes del neurodesarrollo
caracterizado por las dificultades en la comunica‐
cioacuten los deacuteficits en habilidades sociales comporta‐
mientos repetitivos o estereotipados e incluso pro‐
blemas cognitivos en algunos casos La heterogenei‐
dad del fenotipo unido a la complejidad geneacutetica
dificulta el estudio de las bases bioloacutegicas de la en‐
fermedad Los esfuerzos para definir subtipos que
permitan estudiar los mecanismos bioloacutegicos aso‐
ciados no han sido todo lo satisfactorios que se es‐
peraba en cuanto a la caracterizacioacuten geneacutetica de la
enfermedad y hasta la fecha maacutes de 800 genes han
sido considerados como candidatos para su desarro‐
llo
Un trabajo colaborativo entre diferentes grupos de
investigacioacuten publicado en Cell aborda el problema
de la identificacioacuten de subtipos en el TEA de una ma‐
nera diferente planteando que una definicioacuten geneacute‐
tica de subtipos de TEA proporcione una mayor in‐
formacioacuten sobre las bases moleculares de la enfer‐
medad y que ademaacutes dicha informacioacuten pueda tener
utilidad cliacutenica
Para ello los investigadores seleccionaron un gen
previamente asociado al TEA el gen CHD8 (cadherin
8 type 2) que codifica para una proteiacutena de mem‐
brana de la familia de las cadherinas y media la ad‐
hesioacuten celular como candidato a definir un subtipo
especiacutefico En una muestra de maacutes de 6000 pacien‐
tes con TEA se identificaron 15 mutaciones indepen‐
dientes en el gen ninguna de las cuales se encontra‐
ba en los 8000 controles analizados Entonces se
llevoacute a cabo un anaacutelisis cliacutenico detallado de los 15
pacientes portadores de las mutaciones para deter‐
minar si la alteracioacuten del gen CHD8 definiacutea un fenoti‐
po especiacutefico dentro del espectro autista En efecto
los pacientes compartiacutean ciertas caracteriacutesticas es‐
peciacuteficas como rasgos faciales determinados ma‐
crocefalia o constipacioacuten
El anaacutelisis de mutaciones en el gen chd8 en un mo‐
delo de pez zebra mostroacute caracteriacutesticas similares a
las observadas en humanos como el aumento en el
tamantildeo de la cabeza o alteraciones en la motilidad
gastrointestinal debidas a la reduccioacuten en el nuacutemero
de neuronas enteacutericas confirmando la implicacioacuten
del gen en dichos procesos
Los resultados del estudio confirman la utilidad del
planteamiento Mutaciones en el gen CHD8 previa‐
mente asociado a TEA definen un subtipo que no
hubiera podido ser delimitado en base a los siacutento‐
mas Ademaacutes aportan informacioacuten importante para
el seguimiento de los pacientes Los dos pacientes
mayores de 40 antildeos con mutaciones en el gen CHD8
desarrollaron tumores Este gen se ha asociado al
riesgo a padecer caacutencer colorrectal por lo que los
autores apuntan a la importancia de mantener el
seguimiento de los pacientes de TEA con mutacio‐
nes en el gen CHD8 para detectar posibles signos de
este caacutencer de forma temprana
De poder estratificarse de forma geneacutetica los tras‐
tornos del espectro autista se podriacutea llevar a cabo
un control maacutes adecuado para los pacientes asiacute co‐
mo un mejor disentildeo de los ensayos cliacutenicos o posi‐
bles tratamientos para cada caso
Referencia Bernier R et al Disruptive CHD8 Muta‐
tions Define a Subtype of Autism Early in Develop‐
ment Cell 2014 Jul 3 pii S0092‐8674(14)00749‐1
doi 101016jcell201406017
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Mutaciones en el gen CHD8 definen un subtipo de autismo
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En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
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Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
Geneacutetica Meacutedica News
Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
revistageneticamedicacom
La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
revistageneticamedicacom
Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
Geneacutetica Meacutedica News
22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
revistageneticamedicacom
En nuestros intestinos residen billones de ceacutelulas mi‐
crobianas con las que estamos en permanente inter‐
accioacuten A esta comunidad constituida por distintos
tipos de bacterias eucariotas y virus se le denomina
microbioma y participa en diversas funciones como
la obtencioacuten de energiacutea absorcioacuten de carbohidratos
no digeridos por el sistema digestivo humano o el
desarrollo de la inmunidad teniendo un papel clave
en la salud y la enfermedad de los seres humanos
Por lo tanto conocer y caracterizar la composicioacuten
del microbioma es una herramienta de vital impor‐
tancia para entender parte del funcionamiento de
nuestro organismo Su estudio y caracterizacioacuten no
es sencillo ya que muchos de los microorganismos
del intestino no pueden ser cultivados fuera de eacutel Sin
embargo lo que siacute se puede analizar a partir de
muestras fecales es su material hereditario Asiacute di‐
ferentes aproximaciones metagenoacutemicas basadas
en el anaacutelisis del genoma de los organismos residen‐
tes en el sistema digestivo estudian las relaciones
entre los integrantes del microbioma y su respuesta
ante determinados factores
Para este tipo de anaacutelisis los cataacutelogos de genes de
referencia del microbioma intestinal humano son
cruciales Mediante estas bibliotecas los investiga‐
dores pueden comparar las lecturas del ADN obteni‐
das en las muestras e identificar y cuantificar las es‐
pecies presentes Los dos principales cataacutelogos Me‐
taHIT y HMP estaacuten basados en muestras de indivi‐
duos europeos y americanos pero su contenido es
limitado
En el uacuteltimo nuacutemero de Nature Biotechnology y gra‐
cias al esfuerzo combinado de maacutes de 25 centros de
investigacioacuten se ha publicado un trabajo sobre la
elaboracioacuten del cataacutelogo de genes de referencia del
microbioma humano del intestino maacutes completo
hasta la fecha En eacutel los investigadores completaron
el cataacutelogo MetaHIT antildeadiendo 250 muestras euro‐
peas maacutes casi 400 muestras chinas y maacutes de un cen‐
tenar de muestras americanas El cataacutelogo incluye
casi 10 millones de genes no redundantes y estaacute muy
proacuteximo a alcanzar la saturacioacuten es decir a incluir
toda la informacioacuten sobre la funcioacuten de los genes del
microbioma
Los anaacutelisis muestran diferencias en la microbiota de
las diferentes poblaciones en aspectos como el meta‐
bolismo de los nutrientes y la detoxificacioacuten xenobioacute‐
tica que pueden haberse ido modelando con la dieta
y el ambiente de dichas poblaciones No obstante la
diferente arquitectura geneacutetica de las poblaciones no
se descarta completamente
La informacioacuten contenida en el cataacutelogo puede visua‐
lizarse en el sitio web httpmetagenomicscn Y
para la diversidad microbiana no recogida en este
cataacutelogo asiacute como la identificacioacuten de nuevos micro‐
organismos en el mismo nuacutemero de Nature Biotech‐
nology un equipo de la Universidad Teacutecnica de Dina‐
marca describe un meacutetodo para identificar y ensam‐
blar el material geneacutetico sin recurrir a los genomas de
referencia
Al igual que el genoma contenido en las ceacutelulas hu‐
manas la informacioacuten obtenida del microbioma
acerca a los investigadores a entender la variabilidad
entre poblaciones y su influencia en la salud y la en‐
fermedad
Referencias
Li J et al An integrated catalog of reference genes in
the human gut microbiome Nat Biotechnol 2014 Jul
6 doi 101038nbt2942
Nielsen HB et al Identification and assembly of ge‐
nomes and genetic elements in complex metagenomic
samples without using reference genomes Nat Bio‐
technol 2014 Jul 6 doi 101038nbt2939
Geneacutetica Meacutedica News
Microbioma el otro genoma del ser humano
18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
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Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
revistageneticamedicacom
Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
Geneacutetica Meacutedica News
22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
revistageneticamedicacom
Michael F Murray director de Genoacutemica Cliacutenica en el
Instituto de Medicina Genoacutemica de Geisinger
Pennsylvania EEUU ha hablado en una entrevista
publicada en Genome Medicine sobre la necesidad de
educar a los profesionales de la salud en el aacuterea de la
genoacutemica
Ante la pregunta de si la educacioacuten genoacutemica de los
meacutedicos es adecuada en la actualidad Murray co‐
menta coacutemo a pesar de los recientes esfuerzos en
favorecer la educacioacuten e intereacutes en la medicina ge‐
noacutemica por parte de los profesionales meacutedicos no
existe un protocolo estandarizado de educacioacuten en
la materia Los programas formativos llegan uacutenica‐
mente a un pequentildeo porcentaje de personas y toda‐
viacutea queda una masa importante de la comunidad
que no conoce suficientemente la materia Ademaacutes
este tipo de conocimientos no son requeridos por lo
que en muchos casos los meacutedicos no sienten la ne‐
cesidad de profundizar o entrenarse en el aacuterea de la
genoacutemica Esto se refleja en el hecho de que los co‐
nocimientos en genoacutemica variacutean ostensiblemente
seguacuten la especialidad meacutedica Oncoacutelogos pediatras
obstetricias y patoacutelogos son el grupo profesional
que mayores aplicaciones pueden obtener a partir
de la geneacutetica y la genoacutemica por lo que es de espe‐
rar que constituyan el grupo profesional mejor edu‐
cado en genoacutemica con excepcioacuten de los especialistas
en geneacutetica cliacutenica
Murray propone diferentes formas en las que se po‐
driacutea potenciar o integrar la formacioacuten en genoacutemica
en la praacutectica diaria de los profesionales de la salud
como por ejemplo proporcionar creacuteditos de forma‐
cioacuten continuada o incorporar preguntas sobre genoacute‐
mica en los exaacutemenes de certificacioacuten meacutedica
Para responder a coacutemo podraacuten los meacutedicos afrontar
la adquisicioacuten de tanta informacioacuten nueva Murray
se apoya en la gran capacidad de aprendizaje y
adaptabilidad de los meacutedicos que en los uacuteltimos
tiempos se han tenido que adaptar entre otros
avances a nuevas formas de proporcionar cuidados
a los pacientes afectados por caacutencer o ciertas enfer‐
medades infecciosas Ademaacutes dada la raacutepida y con‐
tinua evolucioacuten de la genoacutemica junto con las demaacutes
oacutemicas el proceso de educacioacuten en genoacutemica para
los profesionales de la salud debe de ser continuo
Por uacuteltimo Murray recuerda que el conocimiento e
interpretacioacuten de la informacioacuten genoacutemica en medi‐
cina debe ir siempre acompantildeado de una base soacuteli‐
da de las implicaciones eacuteticas legales y sociales aso‐
ciadas
Referencia Murray MF Education physicians in the
era of genomic medicine Genome Medicine 2014
645 doi101186gm564
Geneacutetica Meacutedica News
Medicina genoacutemica un reto para la formacioacuten meacutedica
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 19
revistageneticamedicacom
La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
Geneacutetica Meacutedica News
Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
revistageneticamedicacom
Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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La historia familiar es un factor de riesgo mucho
mayor que el estilo de vida para el desarrollo de
caacutencer de mama de proacutestata o caacutencer colorrectal
Zoumlller B et al Familial transmission of prostate breast
and colorectal cancer in adoptees is related to cancer in
biological but not in adoptive parents A nationwide
family study Eur J Cancer 2014 Jun 18 pii S0959‐
8049(14)00717‐5 doi 101016jejca201405018
Un estudio geneacutetico indica que el aumento en el
iacutendice de masa corporal aumenta el riesgo de asma
en la infancia
Granell R et al Effects of BMI Fat Mass and Lean
Mass on Asthma in Childhood A Mendelian Randomi‐
zation Study PLoS Med 2014 Jul 111(7)e1001669
doi 101371journalpmed1001669 eCollection 2014
Jul
Investigadores del Departamento de Geneacutetica de
la Universitat de Barcelona y del Instituto de Bio‐
medicina de la Universidad de Barcelona describen
la funcioacuten clave de la proteiacutena JNK en la regenera‐
cioacuten de tejidos
Almuedo‐Castillo M et al JNK Controls the Onset of
Mitosis in Planarian Stem Cells and Triggers Apoptotic
Cell Death Required for Regeneration and Remodeling
PLoS Genet 2014 Jun 1210(6)e1004400 doi
101371journalpgen1004400
La secuenciacioacuten de exomas ha mejorado la capa‐
cidad de identificar mutaciones geneacuteticas en pa‐
cientes con defectos bioquiacutemicos que afectan a los
complejos de la cadena respiratoria mitocondrial
Taylor RW et al Use of Whole‐Exome Sequencing to
Determine the Genetic Basis of Multiple Mitochondrial
Respiratory Chain Complex Deficiencies JAMA
2014312(1)68‐77 doi101001jama20147184
Un estudio de la Universidad de California Santa
Barbara revela el papel del gen Pttg1 en la organi‐
zacioacuten y localizacioacuten de un tipo de neurona en el
sistema nervioso
Keeley PW et al Pituitary tumor‐transforming gene 1
regulates the patterning of retinal mosaics Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jun 24111(25)9295‐300 doi
101073pnas1323543111
Un anaacutelisis genoacutemico de la Cliacutenica Mayo en EEUU
revela 31 genes clave para el crecimiento y expan‐
sioacuten del caacutencer de rintildeoacuten
Von Roemeling CA et al Functional genomics identi‐
fies novel genes essential for clear cell renal cell carci‐
noma tumor cell proliferation and migration Oncotar‐
get 2014 Jun 12
Un equipo del Instituto Max Planck de Bioquiacutemica
en Martinsried Alemania identifica una proteiacutena
Wss1 que defiende al ADN y permite la duplica‐
cioacuten del genoma
Stingele J et al A DNA‐Dependent Protease Involved
in DNA‐Protein Crosslink Repair Cell 2014 Jul 3 pii
S0092‐8674(14)00746‐6 doi 101016
jcell201404053
Investigadores de la Universidad de Bonn Alema‐
nia en colaboracioacuten con otros centros de investi‐
gacioacuten encuentran que variaciones comunes en la
regioacuten genoacutemica del receptor de las ceacutelulas presen‐
tadoras de antiacutegenos leucocitarios HLA‐DQ estaacuten
fuertemente asociadas al riesgo de acalasia tras‐
torno que altera la motilidad del esoacutefago
Gockel I et al Common variants in the HLA‐DQ region
confer susceptibility to idiopathic achalasia Nat
Genet 2014 Jul 6 doi 101038ng3029
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Noticias breves
20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
Geneacutetica Meacutedica News
2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
revistageneticamedicacom
Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
Geneacutetica Meacutedica News
22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 1 | Nuacutem 2 | 2014
revistageneticamedicacom
cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 23
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Un estudio en el que participa el equipo de investi‐
gacioacuten de Joseacute Manuel Garciacutea Verdugo de la Uni‐
versitat de Valegravencia identifica mutaciones en el
gen C2CD3 en dos familias con siacutendrome oral‐
facial‐digital y muestra que C2CD3 se localiza en el
extremo distal de los centriolos y regula su elon‐
gacioacuten
Thauvin‐Robinet C et al The oral‐facial‐digital syn‐
drome gene C2CD3 encodes a positive regulator of
centriole elongation Nat Genet 2014 Jul 6 doi
101038ng3031
Investigadores de la Universidad de Northwes‐
tern en EEUU muestran que en planarias el gen
zic‐1 permite a las ceacutelulas madre regenerar cabeza
tras la decapitacioacuten
Vaacutesquez‐Doorman C Petersen CP zic‐1 Expression
in Planarian Neoblasts after Injury Controls Anterior
Pole Regeneration PLoS Genet 2014 Jul 310
(7)e1004452 doi 101371journalpgen1004452
Investigadores de la Universidad de Copenhagen
describen el primer caso donde mutaciones en el
gen que codifica para el transportador de la dopa‐
mina son responsables de la aparicioacuten de parkin‐
sonismo temprano en adultos
Hansen FH et al Missense dopamine transporter mu‐
tations associate with adult parkinsonism and ADHD
J Clin Invest 2014 Jul 1124(7)3107‐20 doi 101172
JCI73778
Un trabajo de la Universidad de California San
Diego EEUU demuestra que la proteiacutena ciclina D
reguladora de la progresioacuten del ciclo celular y con‐
siderada promotora del caacutencer durante mucho
tiempo activa supresores de tumores en lugar de
inactivarlos como se pensaba
Narasimha AM et al Cyclin D activates the Rb tumor
suppressor by mono‐phosphorylation Elife 2014 May
29e02872 doi 107554eLife02872
Un equipo de la Universidad de California San Die‐
go EEUU identifica un nuevo biomarcador que
predice si el tipo de caacutencer cerebral maacutes frecuente
el glioblastoma responderaacute a la quimioterapia
Kushwaha D et al A genome‐wide miRNA screen re‐
vealed miR‐603 as a MGMT‐regulating miRNA in glio‐
blastomas Oncotarget 2014 May 14
El gen ABCB5 es necesario para el desarrollo y re‐
paracioacuten de la coacuternea
Ksander BR et al ABCB5 is a limbal stem cell gene
required for corneal development and repair Nature
2014 doi101038nature13426
Una plataforma de rastreo de compuestos tera‐
peacuteuticos para la esclerosis muacuteltiple publicada en
Nature Medicine
Mei F et al Micropillar arrays as a high‐throughput
screening platform for therapeutics in multiple sclero‐
sis Nat Med 2014 Jul 6 doi 101038nm3618
La peacuterdida de la proteiacutena p62 en las ceacutelulas y teji‐
do que rodea un tumor puede aumentar su creci‐
miento y progresioacuten
Valencia T et al Metabolic Reprogramming of Stro‐
mal Fibroblasts through p62‐mTORC1 Signaling Pro‐
motes Inflammation and Tumorigenesis Cancer Cell
2014 DOI 101016jccr201405004
Un equipo de la Universidad de Stanford analiza
los perfiles de liacutepidos asociados a los linfomas con
sobreexpresioacuten del encogen MYC
Eberlin LS et al Alteration of the lipid profile in lym‐
phomas induced by MYC overexpression Proc Natl
Acad Sci U S A 2014 Jul 3 pii 201409778
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2014 | Nuacutem2 | Vol 1 | Geneacutetica Meacutedica News | 21
revistageneticamedicacom
Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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Metabolismo y regulacioacuten del ADN La misma ma‐
quinaria celular que obtiene energiacutea a partir de los
carbohidratos de la dieta puede ser utilizada para
la regulacioacuten geacutenica El complejo piruvato deshi‐
drogenada es criacutetico para la regulacioacuten de histonas
a traveacutes de la produccioacuten de acetil‐CoA en el nuacute‐
cleo
Sutendra G et al A Nuclear Pyruvate Dehydrogenase
Complex Is Important for the Generation of Acetyl‐CoA
and Histone Acetylation Cell 2014 Jul 3158(1)84‐97
doi 101016jcell201404046
Mutaciones en el gen EXOSC8 alteran el procesado
del ARNm y provocan la mielinizacioacuten anormal del
sistema nervioso causando atrofia muscular espi‐
nal e hipoplasia cerebelar
Boczonadi V et al EXOSC8 muta ons alter mRNA me-tabolism and cause hypomyelina on with spinal mus-cular atrophy and cerebellar hypoplasia Nat Com‐mun 2014 Jul 354287 Un estudio descifra el mecanismo mediante el cual
las proteiacutenas MAT alfa 2 y MAT beta interaccionan
y favorecen la reproduccioacuten de las ceacutelulas tumora‐
les en los caacutenceres de hiacutegado y colon
Murray B et al Structure and function study of the
complex that synthesiszes S‐adenosylmethionine IU‐
CrJ 2014 1 240‐249 doi101107S2052252514012585
Investigadores de The Cancer Genome Atlas
(TCGA) Research Network han identificado nuevas
mutaciones en la ruta de sentildealizacioacuten RTKRAS
RAF en el adenocarcinoma de pulmoacuten
Baylin SB et al Comprehensive molecular profiling of
lung adenocarcinoma Nature July 9 2014 DOI
101038nature13385
Las ceacutelulas madre hematopoyeacuteticas acumulan da‐
ntildeos el ADN con la edad que son reparados al entrar
en el ciclo celular
Beerman I et al Quiescent Hematopoietic Stem Cells
Accumulate DNA Damage during Aging that Is Re‐
paired upon Entry into Cell Cycle Cell Stem Cell 2014
Jul 315(1)37‐50 doi 101016jstem201404016
El grupo de Cristalografiacutea de Macromoleacuteculas del
Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegicas ha
conseguido reprogramar la unioacuten al ADN de una
proteiacutena para reconducirla hacia regiones especiacutefi‐
cas del genoma
Stella S et al BuD a helix‐loop‐helix DNA‐binding do‐
main for genome modification Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 2014 Jul 170(Pt 7)2042‐52 doi 101107
S1399004714011183
Un estudio revela que el VIH‐1 infecta de forma
maacutes eficaz si contiene una secuencia concreta en
su material geneacutetico
Carlson JM et al Selection bias at the heterosexual
HIV‐1 transmission bottleneck Science 11 July 2014
Vol 345 DOI 101126science1254031
Un estudio publicado en el Journal of Clinical Inves‐
tigation muestra que pacientes con la enfermedad
de Crohn tienen la expresioacuten de los genes DUOX2 y
APOA1 alterada y una comunidad intestinal micro‐
biana diferente
Haberman Y et al Pediatric Crohn disease patients
exhibit specific ileal transcriptome and microbiome sig‐
nature J Clin Invest 2014 Jul 8 pii 75436 doi
101172JCI75436
Investigadores de la Universidad de Liverpool
identifican mutaciones en el gen ZNF46 en pacien‐
tes con queratoconos una enfermedad degenera‐
tiva de la coacuternea
Lechner J et al Enrichment of pathogenic alleles in the
brittle cornea gene ZNF469 in keratoconus Hum Mol
Genet 2014 Jun 3 pii ddu253
Un estudio del Icahn School of Medicine at Mount
Sinai y la Universidad de Harvard en el que partici‐
pan investigadores del IDIBAPS sugiere que una
mutacioacuten en la enzima isocitrato deshidrogenasa
ne las ceacutelulas progenitoras del hiacutegado promueve la
progresioacuten del colangiocarcinoma segunda neo‐
plasia hepaacutetica maacutes frecuente Los resultados ofre‐
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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cen una nueva diana terapeacuteutica para el trata‐
miento de este caacutencer
Saha SK et al Mutant IDH inhibits HNF‐4α to block
hepatocyte differentiation and promote biliary caacutencer
Nature 2014 doi101038nature13441
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