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Elsa Poupardin / Strasbourg Mars 2012 Gérer ses références bibliographiques avec Zotero A partir du travail de Marie Laure Malingre

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Elsa Poupardin / StrasbourgMars 2012

Gérer ses références bibliographiques avec Zotero

A partir du travail de Marie Laure Malingre

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Plan Présentation / Installation / Interface Récupérer des références, les organiser, créer une

bibliographie, tri et recherche, Plugin d’insertion pour traitement de texte Captures web export, marqueurs Compte Zotero en ligne : Fonctions collaboratives

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Quels besoins ? Importer automatiquement des lots de références résultant de recherches

documentaires (bases de données ou pages web)

Exploiter facilement de gros corpus de références

Récupérer ses références pour la rédaction d’un travail scientifique (citations, bibliographie en fin d’article) pour l’élaboration rapide d’une bibliographie, d’un produit documentaire

spécifique (liste des publications d’un établissement, d’un labo, listes d’acquisition, etc.)

Pouvoir appliquer à ses références un style de présentation conforme aux normes (thèse, revues scientifiques)

Faire une saisie unique des données et adapter ensuite en fonction de la publication à éditer

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Les outils de bibliographieDeux types d’outils de gestion de bibliographie :

Outils en « local » : Bibus (gratuit), biblioexpress (gratuit), Zotero (gratuit), Jabref (gratuit), OOo (gratuit), … Endnote, Refmanager…

Outils en « ligne » : Basilic (gratuit) CiteULike (gratuit) Connotea (gratuit) refworks, Wikindx, WizFolio Web 2.0. EndNote Web, Zotero 3.0

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Qu’est-ce que Zotero ?

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Téléchargement de la version 3.0 Depuis la version 2, synchronisation

et accès aux références en ligne via un serveur Avec Firefox 6

Annonce du 22/09/2010 : « Zotero Everywhere »

Zotero indépendant API / gestion web et mobiles de

bibliothèques Zotero « ZoteroCommons »

Une extension (plugin) de Firefox À partir de la version 2 de Firefox

Open source : logiciel libre et gratuit

Lancé en octobre 2006 par le Centre for History and New Media) de l’Université  George Mason (USA)

Soutenu par divers organismes, dont la Andrew W. Mellon Foundation

Un outil de gestion de références et de signetsSite de référence : http://www.zotero.org

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Prérequis logiciels Zotero nécessite l’installation du navigateur Firefox. Flock et

Netscape sont aussi compatibles, pas Internet Explorer ni Opera

Pour Windows, Mac, ou Linux

Pour Chrome : Zotero Standalone

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Quelques ressources sur Zotero Le site de Zotero, http://www.zotero.org

En particulier fr/quick start guide

Le blog francophone de Zotero, http://zotero.hypotheses.org Manuel Zotero (Hospices Civils de Lyon), http://portaildoc.chu-

lyon.fr/hcldoc/uploads/media/manuel_Zotero.pdf Fiche Zotero / ECLORE, http://www.projet-plume.org/ressource/eclore FAQ Zotero / URFIST de Nice, http://wiki-

urfist.unice.fr/wiki_urfist/index.php/ZOTERO_un_Logiciel_de_bibliographie_2.0

Supports pédagogiques (nombreux sur Slideshare) Perrine Helly, http://www.slideshare.net/phelly/zotero-formation-de-

formateurs François Magnan, http://www.urfist.cict.fr/IMG/ppt_zotero.ppt …

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Qu’est-ce que Zotero ?

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Premières références Zotero

Récupération de références

Ex : requête « téléphonie mobile » sur ScienceDirect ou sur le SUDOC, (http://www.sudoc.

abes.fr/)

Récupération d’un lot de références : cliquer sur le dossier

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Premières références Zotero Récupération de références

Sélectionner les références que l’on souhaite récupérer

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Premières références Zotero. Récupération de références

Récupération du fichier PDF associé à la référence

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Des problèmes pour récupérer les références ?

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Problème : Pas d’icône zotero dans la barre d’adresse Échec de l’enregistrement

Ex : Dans ScienceDirect

Une solution : Enregistrer les résultats sous forme d’un fichier au format RIS ou BibTeX Importer ensuite le fichier dans Zotero Si dans les Préférences, on a coché « Utiliser Zotero pour les fichiers RIS/ Refer

téléchargés », on aura un import automatique dans Zotero

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L’interface de travail de Zotero

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L’interface de Zotero : en 3 panneaux

La bibliothèque et ses collections

La liste des références d’une collection donnée

Le détail de la référence sélectionnée

+ la barre d’outils et le panneau des marqueurs

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L’interface de travail de Zotero

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Bibliothèque et ses

collections

Liste des signets / références Une référence

Panneau des

marqueurs

+ Requêtes

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L’interface de travail de Zotero La barre d’outils

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L’interface de travail de Zotero

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La barre d’outils Créer une nouvelle collection (ou une sous-collection)

Créer un nouveau groupe

Actions : Importer, exporter une bibliothèque, créer une chronologie, gérer les préférences …

Nouvel élément : créer un type de document et faire le lien vers le fichier de texte intégral

Créer un nouvel élément à partir de la page courante = à partir de la page ouverte dans le navigateur en utilisant les métadonnées du site; une capture d’écran est liée à la notice

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L’interface de travail de Zotero

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Créer une référence à partir de l’identifiant du document (ISBN, DOI ou PMID)

Créer une note Indépendante Liée à une référence

Attacher Une capture de la page courante Le lien vers la page courante Une copie d’un fichier Le lien vers le fichier

Recherche dans la base Recherche avancée Boîte de recherche simple

Synchronisation des données avec le serveur Zotero

Passage en mode plein écran

Fermeture de l’interface Zotero

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Importer des références

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Sites « Zotero compatibles » : voir http://www.zotero.org/translators ex : ScienceDirect, Google Scholar et Books, PubMed, Amazon, Revues.org,

Citeseer, Bases Ebsco Host, SUDOC … Plateformes de partage de références comme CiteUlike Icone dans la barre d’adresse

Sites partiellement compatibles (ex : HAL)

Récupération sur les sites compatibles de références multiples (en cliquant sur le dossier jaune dans barre

d’adresse)

référence par référence (en cliquant sur l’icône de document)

Source des images :

Maire - AgroParisTech-Engref, Montpellier

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Importer des références

Import d’un ensemble de références

Import de références individualisées

Alimenter la base en choisissant diverses sources

Importer refs à partir d'un pdfTélécharger un fichier pdf.

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Créer une entrée dans Zotero.Clique droit de la souris sur l’élément et choisir Retrieve Metadata from PDF.Cette fonctionnalité ne marchera que si le créateur du pdf a structuré son document

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Importer des références

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Références de pages web

Création d’un élément à partir de la page web courante (métadonnées)

Capture d’écran État de la page à un moment donné

Choisir la collection adéquate

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Importer des références

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Références de pages web

Attacher à une référence existante : Une capture de la page courante Un lien vers la page courante La copie d’un fichier local Le lien vers un fichier

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Manipuler les captures de pages web

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Il est possible d’annoter et de surligner les captures web

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Exercices de capture de références

Trouver et classer entre 20 et 50 références. Catalogue du Sudoc, rechercher des (références de…) articles de

périodiques, livres, matériel audio-visuel, de thèses Capturer des références sur la librairie Amazon, ou autre

catalogue de votre choix : Revue.org, Youtube, Flickr, etc... Comment faire sur FNAC ou GIBERT ? Veiller à vérifier les références finales...

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Exercices de capture de documents Sur archivesic, tel thèses (ou autres sites compatibles) et sur des sites non

compatibles :http://alor.univ-montp3.fr/cerce/r8/a.c.htm et www.melissa.ens-cachan.fr/spip.php?rubrique160

récupérer des docs. pdf, (avec leurs références) en testant les différentes méthodes de récupération : avec document ouvert, ou en le téléchargeant sur l'ordinateur, puis le stocker dans zotero

Faites de simples liens vers des pages web Au total, 5 documents récupérés avec leurs références et 5 liens

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Importer des références

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Importer des fichiers de références depuis d’autres logiciels

Ex : formats RIS, bibteX

Utiliser le menu Actions > Importer, après avoir fait une procédure d’export de fichier sous l’autre outil bibliographique

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Créer et manipuler des références

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Une référence complète : onglet info

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Créer et manipuler des références Créer une nouvelle référence

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Créer et manipuler des références

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La référence

Onglet Info = les différents éléments de la référence Localiser : résolveur de lien Afficher … : la capture d’écran, le fichier, la page

Onglets Marqueurs = possibilité d’apposer des tags (mots clés libres) sur une référence

Onglet Connexe = possibilité de faire un lien entre deux éléments (référence, notes)

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Créer et manipuler des références

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La référence

Bouton « Afficher » / Onglet Info Afficher : Afficher le fichier, Afficher la page ou la capture d’écran liés à une

référence

Bouton « Localiser » / Onglet Info Pour lancer le résolveur de lien OpenURL à partir des données

bibliographiques de l’élément Voir les préférences générales de Zotero pour le paramétrage du serveur de

résolution

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Créer et manipuler des références

Menu déroulant

34 types de références

Les types de référence

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Créer et manipuler des références Ensemble de champs pour chaque type de référence

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Créer et manipuler des références

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Entrée manuelle de nouveaux éléments et / ou modification des éléments importés

Zone de modification des éléments

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Créer et manipuler des références

Modifier une référence

Modification d’un champ

Ajout de données supplémentaires

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Classer, organiser, gérer ses références Ma bibliothèque

Contient toutes les références

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Classer, organiser, gérer ses références

36

Gestion des collections de la bibliothèque Créer une collection / des

sous-collections Nouvelle sous-collection Renommer la collection Supprimer la collection Exporter la collection Classer les références

Clic droit

C’est la collection sélectionnée qui reçoit les références importées Déplacement d’éléments par glisser-

déposer dans une collection

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Classer, organiser, gérer ses références

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Gestion de la base personnelle

Modification de références Gestion du texte intégral Recherche dans la base Tri des notices Ajout de notes de lecture Ajout de tags (marqueurs) Export de la bibliothèque de références Lien de deux notices

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Classer, organiser, gérer ses références Enrichir ses références : annoter ses collections de références

Ajouter un tag

Afficher les tags et

rechercher par tag

38

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Classer, organiser, gérer ses références

39

Créer une note indépendante ou liée à une référence

Zone de création de la note

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Classer, organiser, gérer ses références

40

Capturer la page courante : page figée

Enregistrer le lien vers la page courante : l’URL de la page

Stocker une copie du fichier : lien plus pérenne (stockage dans un sous-répertoire du dossier système de zotero

Lien vers un fichier : lien vers fichier stocké en local (Mes documents, bureau)

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Classer, organiser, gérer ses références

41

Glisser / Déposer du PDF sous la référence sélectionnée

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Classer, organiser, gérer ses références

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Recherche dans la bibliothèque de références

Fenêtre de recherche avancée,

accessible par la barre d’outils

Possibilité d’enregistrer la recherche

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L’interface de travail de Zotero

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Actions > Préférences dans la barre d’outils

1er onglet : Préférences générales

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L’interface de travail de Zotero

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Actions > Préférences dans la barre d’outils

2ème onglet : Sync, pour synchroniser les données de la bibliothèque sur le serveur Zotero et créer une bibliothèque en ligne

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L’interface de travail de Zotero

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Actions > Préférences dans la barre d’outils

3ème onglet : Recherche, pour l’indexation et la gestion des documents en texte intégral

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L’interface de travail de Zotero

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Actions > Préférences dans la barre d’outils

4ème onglet : Exportation, pour paramétrer les options de copie rapide et l’encodage des caractères

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L’interface de travail de Zotero

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Actions > Préférences dans la barre d’outils

5ème onglet : Styles, pour choisir les styles à afficher par défaut dans le gestionnaire de bibliographie

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L’interface de travail de Zotero

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Actions > Préférences dans la barre d’outils

6ème onglet : pour définir des proxies

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L’interface de travail de Zotero

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Actions > Préférences dans la barre d’outils

7ème onglet : Raccourcis clavier

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L’interface de travail de Zotero

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Actions > Préférences dans la barre d’outils

8ème onglet : Préférences avancées

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Sauver vos données

On peut faire une sauvegarde de la bibliothèque dans le format Zotero RDF mais cela ne donne pas une copie exacte de votre

base.Il est préférable de localiser votre bibliothèque Zotero

(Préférences Avancées), de fermer Firefox et de copier les données de votre répertoire Zotero vers un emplacement de

sauvegarde, de préférence sur un autre périphérique de stockage.

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Styles bibliographiques et Zotero

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AvertissementIl conviendra avant tout de bien cerner les besoins en terme de présentation de références bibliographiques...Il faudra trouver le style proposé par Zotero le plus proche de ces besoins

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Deux genres de styles de citation gérés par Zotero

a) Styles de citation au format auteur date. Sources citées dans le texte, généralement entre parenthèses, avec nom de l’auteur et date de publication.

=> Une bibliographie finale complète les références en fin du document (ordre alphabétique nom d'auteur)

En Afrique, le paludisme est responsable de la mort de plus d'un million de personnes à chaque année. Lutter contre ce fléau demande la concertation de plusieurs intervenants. (Organisation mondiale de la santé, 2000, p. 5-7) par

ex.

54

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1/Numéros dans le corps du texte

2/ Citations : références biblio. de la page ou de la section classés selon ordre d'apparition dans le texte 3/ Bibliographie complète et

finale55

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b) Styles de citation avec numérotation proposés par Zotero

Eléments 1 et 2 (cf diapo précédente)Chicago Manual of Style : note without bibliographyModern Humanities Research Association (Note without Bibliography)

Eléments 1 et 2 et 3(cf diapo précédente)Modern Humanities Research Association (Note with Bibliography)Chicago Manual of Style : full note with bibliographyChicago Manual of Style : note with bibliography

Eléments 1 et 3 (cf diapo précédente) American Medical Association IEEE National Library of medecine Nature Journal

Biblio finale classée selon ordre alpha. auteurs

Biblio finale classée selon ordre apparition dans le texte

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a) Styles au format (auteur date) proposés par Zotero

American Political Association American Psychological Association American Sociological Association Chicago Manual of Style author date format Harvard reference format 1 (author date) Modern Langage Association

Quelques styles français : https://www.zotero.org/trac/ticket/1216Ou sur http://zotero.hypotheses.org/category/styles

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Produire une bibliographie

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Générer automatiquement une bibliographie

En utilisant le menu contextuelà partir de la collection souhaitée (clic droit) :« Créer une bibliographie… »

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Produire une bibliographie

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Formater sa bibliographie Utilisation des styles fournis par Zotero

Enregistrement en format RTF

ou HTML

Voir dans les préférences le style par défaut

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Produire une bibliographie

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Produire une bibliographie

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Pour chercher d’autres styles dans le Répertoire Zotero de Styles Pour récupérer un

style stocké en local

Le Gestionnaire de styles

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Produire une bibliographie

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Styles Zotero

Choix de styles par défaut dans l’interface (15 styles)

Voir aussi http://www.zotero.org/styles Possibilité d’installer d’autres styles Aperçu du style en positionnant la souris sur le lien

Pas d’interface graphique de modification ou de création de style

Création de style avec le langage CSL Le générateur CSL de Zotero : chrome://zotero/content/tools/csledit.xul Utilisation possible aussi de Simple Style Generator

http://www.somwhere.org/csl/ Projet de styles francophones de Zotero :

https://www.zotero.org/trac/ticket/1216

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Produire un rapport

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Option du menu contextuel : « générer un rapport à partir de la collection

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Styles supplémentaires site Zotero Des nouveaux styles sont proposés sur une page de dépôt :

http://www.zotero.org/styles : ils s’installent automatiquement (clic sur Install)

Passer le curseur de la souris sur ces styles permet d'avoir un aperçu du style..

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Endnote propose de télécharger, à l'adresse http://www.endnote.com/support/enstyles-terms.aspdes styles, légalement réservés aux utilisateurs d'Endnote

Techniquement , ces fichiers de style peuvent être utilisés par Zotero : Préférences, puis

choisir

Styles supplémentaires site Endnote

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Créer un style personnalisé Réservé à un public averti. Pb de compatibilité des CSL

Possible cependant : Pour cela Utiliser un langage XML : le CSL (Citation Style Language) voir

dev.zotero.org/creating_citation_styles Puis enregistrer le code produit sous l’extension CSL, ouvrir le fichier

CSL (préférences/styles) : le nouveau style s’intègrera

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Zotero et Word ou Open-Office

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Utiliser Zotero dans Word ou Open Office Citer dans un traitement de texte depuis Zotero

Barre d’outils Zotero dans Word

Editer une référence

Insérer une référence

Créer la bibliographie

Editer la bibliographie

Modifier les préférences du document

Rafraîchir l’affichage des

références

Supprimer les codes

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Exercice Chercher le bon style, comprenez-vous les différentes

catégories de style de Zotero ? Pour les exercices, choisir un style « avec bibliographie » Dans un document word, insérer plusieurs citations, les

modifier, Constituer une bibliographie finale, puis la modifier Changez de style en cours de route Insertion de sources multiples Se servir de l’éditeur de citation (Clic sur montrer l’éditeur

lors de l’insertion d’une citation)

69

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Classer, organiser, gérer ses références Créer une chronologie

Menu Actions

70

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Exporter la bibliothèque

Menu Actions > Exporter la bibliothèque

Formats d’export : Zotero RDF, MODS, RIS, Refer / BibiX,

Unqualified Dublin Core RDF, Wikipedia Citation Templates, BibTeX

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Version 3.0

Création d’un compte sur le serveur Zotero Accès à My Library Groupes Zotero People

Possibilité de synchroniser ses références

Partage des références

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Utiliser Zotero en ligne

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Fonctions collaboratives : Zotero 3.0La synchronisation :

Synchronisation de la bibliothèque / serveur Zotero

Sauvegarde et consultation en ligne via le site web et compte utilisateur zotero

Synchronisation des documents attachés avec un serveur WebDav / Zotero

Ex Dropbox: http://db.tt/smlfWcY

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Bouton de synchronisation

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Synchronisation des données

Paramétrage de la synchronisation

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La bibliothèque en ligne

Gratuit jusqu’à 100mb

Attention : problème des PDF partagés en public

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Création de groupes

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Paramétrage du groupe

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Définition du groupe :

Nom Description Statut Disciplines concernées Logo, image Page web Commentaires

Gestion des membres

Options pour la gestion de la bibliothèque

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Un exemple : la bibliothèque du groupe Boîte à outils (pour les historiens)

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Groupes Zotero

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Création de groupes privés ou publics / interaction avec les bibliothèques propres à des groupes définis

Réseaux de personnes

Suivi de bibliothèques publiques par flux RSS

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Edition et modification des styles ZoteroDate 10 février 2011

Un des principal reproche que l’on peut faire à Zotero, contrairement à un logiciel comme Bibus, concerne l’édition et la modification des styles de publication existants afin de réaliser son “propre” style. Il existe un utilitaire qui permet de personnaliser une feuille de style déjà existante. Il faut pour cela utiliser un outil local dans Firefox en tapant “chrome://zotero/content/tools/csledit.xul” dans la barre d’adresse pour permettre l’édition et la modification d’un style pré-existant… Vous trouverez plus de détails dans un tutoriel à l’adresse suivante

http://www.thomaslienhard.fr/TutorielZotero.html

J’en profite pour signaler également un autre outil très utile: “chrome://zotero/content/tools/cslpreview.xul”, toujours à taper dans la barre d’adresse de Zotero, qui permet de visualiser dans une même fenêtre une ou plusieurs références bibliographiques dans tous les styles disponibles dans son propre Zotero.