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Elsa Poupardin / StrasbourgMars 2012
Gérer ses références bibliographiques avec Zotero
A partir du travail de Marie Laure Malingre
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Plan Présentation / Installation / Interface Récupérer des références, les organiser, créer une
bibliographie, tri et recherche, Plugin d’insertion pour traitement de texte Captures web export, marqueurs Compte Zotero en ligne : Fonctions collaboratives
Quels besoins ? Importer automatiquement des lots de références résultant de recherches
documentaires (bases de données ou pages web)
Exploiter facilement de gros corpus de références
Récupérer ses références pour la rédaction d’un travail scientifique (citations, bibliographie en fin d’article) pour l’élaboration rapide d’une bibliographie, d’un produit documentaire
spécifique (liste des publications d’un établissement, d’un labo, listes d’acquisition, etc.)
Pouvoir appliquer à ses références un style de présentation conforme aux normes (thèse, revues scientifiques)
Faire une saisie unique des données et adapter ensuite en fonction de la publication à éditer
3
Les outils de bibliographieDeux types d’outils de gestion de bibliographie :
Outils en « local » : Bibus (gratuit), biblioexpress (gratuit), Zotero (gratuit), Jabref (gratuit), OOo (gratuit), … Endnote, Refmanager…
Outils en « ligne » : Basilic (gratuit) CiteULike (gratuit) Connotea (gratuit) refworks, Wikindx, WizFolio Web 2.0. EndNote Web, Zotero 3.0
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Qu’est-ce que Zotero ?
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Téléchargement de la version 3.0 Depuis la version 2, synchronisation
et accès aux références en ligne via un serveur Avec Firefox 6
Annonce du 22/09/2010 : « Zotero Everywhere »
Zotero indépendant API / gestion web et mobiles de
bibliothèques Zotero « ZoteroCommons »
Une extension (plugin) de Firefox À partir de la version 2 de Firefox
Open source : logiciel libre et gratuit
Lancé en octobre 2006 par le Centre for History and New Media) de l’Université George Mason (USA)
Soutenu par divers organismes, dont la Andrew W. Mellon Foundation
Un outil de gestion de références et de signetsSite de référence : http://www.zotero.org
Prérequis logiciels Zotero nécessite l’installation du navigateur Firefox. Flock et
Netscape sont aussi compatibles, pas Internet Explorer ni Opera
Pour Windows, Mac, ou Linux
Pour Chrome : Zotero Standalone
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Quelques ressources sur Zotero Le site de Zotero, http://www.zotero.org
En particulier fr/quick start guide
Le blog francophone de Zotero, http://zotero.hypotheses.org Manuel Zotero (Hospices Civils de Lyon), http://portaildoc.chu-
lyon.fr/hcldoc/uploads/media/manuel_Zotero.pdf Fiche Zotero / ECLORE, http://www.projet-plume.org/ressource/eclore FAQ Zotero / URFIST de Nice, http://wiki-
urfist.unice.fr/wiki_urfist/index.php/ZOTERO_un_Logiciel_de_bibliographie_2.0
Supports pédagogiques (nombreux sur Slideshare) Perrine Helly, http://www.slideshare.net/phelly/zotero-formation-de-
formateurs François Magnan, http://www.urfist.cict.fr/IMG/ppt_zotero.ppt …
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Qu’est-ce que Zotero ?
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Premières références Zotero
Récupération de références
Ex : requête « téléphonie mobile » sur ScienceDirect ou sur le SUDOC, (http://www.sudoc.
abes.fr/)
Récupération d’un lot de références : cliquer sur le dossier
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Premières références Zotero Récupération de références
Sélectionner les références que l’on souhaite récupérer
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Premières références Zotero. Récupération de références
Récupération du fichier PDF associé à la référence
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Des problèmes pour récupérer les références ?
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Problème : Pas d’icône zotero dans la barre d’adresse Échec de l’enregistrement
Ex : Dans ScienceDirect
Une solution : Enregistrer les résultats sous forme d’un fichier au format RIS ou BibTeX Importer ensuite le fichier dans Zotero Si dans les Préférences, on a coché « Utiliser Zotero pour les fichiers RIS/ Refer
téléchargés », on aura un import automatique dans Zotero
L’interface de travail de Zotero
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L’interface de Zotero : en 3 panneaux
La bibliothèque et ses collections
La liste des références d’une collection donnée
Le détail de la référence sélectionnée
+ la barre d’outils et le panneau des marqueurs
L’interface de travail de Zotero
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Bibliothèque et ses
collections
Liste des signets / références Une référence
Panneau des
marqueurs
+ Requêtes
L’interface de travail de Zotero La barre d’outils
16
L’interface de travail de Zotero
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La barre d’outils Créer une nouvelle collection (ou une sous-collection)
Créer un nouveau groupe
Actions : Importer, exporter une bibliothèque, créer une chronologie, gérer les préférences …
Nouvel élément : créer un type de document et faire le lien vers le fichier de texte intégral
Créer un nouvel élément à partir de la page courante = à partir de la page ouverte dans le navigateur en utilisant les métadonnées du site; une capture d’écran est liée à la notice
L’interface de travail de Zotero
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Créer une référence à partir de l’identifiant du document (ISBN, DOI ou PMID)
Créer une note Indépendante Liée à une référence
Attacher Une capture de la page courante Le lien vers la page courante Une copie d’un fichier Le lien vers le fichier
Recherche dans la base Recherche avancée Boîte de recherche simple
Synchronisation des données avec le serveur Zotero
Passage en mode plein écran
Fermeture de l’interface Zotero
Importer des références
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Sites « Zotero compatibles » : voir http://www.zotero.org/translators ex : ScienceDirect, Google Scholar et Books, PubMed, Amazon, Revues.org,
Citeseer, Bases Ebsco Host, SUDOC … Plateformes de partage de références comme CiteUlike Icone dans la barre d’adresse
Sites partiellement compatibles (ex : HAL)
Récupération sur les sites compatibles de références multiples (en cliquant sur le dossier jaune dans barre
d’adresse)
référence par référence (en cliquant sur l’icône de document)
Source des images :
Maire - AgroParisTech-Engref, Montpellier
Importer des références
Import d’un ensemble de références
Import de références individualisées
Alimenter la base en choisissant diverses sources
Importer refs à partir d'un pdfTélécharger un fichier pdf.
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Créer une entrée dans Zotero.Clique droit de la souris sur l’élément et choisir Retrieve Metadata from PDF.Cette fonctionnalité ne marchera que si le créateur du pdf a structuré son document
Importer des références
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Références de pages web
Création d’un élément à partir de la page web courante (métadonnées)
Capture d’écran État de la page à un moment donné
Choisir la collection adéquate
Importer des références
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Références de pages web
Attacher à une référence existante : Une capture de la page courante Un lien vers la page courante La copie d’un fichier local Le lien vers un fichier
Manipuler les captures de pages web
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Il est possible d’annoter et de surligner les captures web
Exercices de capture de références
Trouver et classer entre 20 et 50 références. Catalogue du Sudoc, rechercher des (références de…) articles de
périodiques, livres, matériel audio-visuel, de thèses Capturer des références sur la librairie Amazon, ou autre
catalogue de votre choix : Revue.org, Youtube, Flickr, etc... Comment faire sur FNAC ou GIBERT ? Veiller à vérifier les références finales...
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Exercices de capture de documents Sur archivesic, tel thèses (ou autres sites compatibles) et sur des sites non
compatibles :http://alor.univ-montp3.fr/cerce/r8/a.c.htm et www.melissa.ens-cachan.fr/spip.php?rubrique160
récupérer des docs. pdf, (avec leurs références) en testant les différentes méthodes de récupération : avec document ouvert, ou en le téléchargeant sur l'ordinateur, puis le stocker dans zotero
Faites de simples liens vers des pages web Au total, 5 documents récupérés avec leurs références et 5 liens
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Importer des références
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Importer des fichiers de références depuis d’autres logiciels
Ex : formats RIS, bibteX
Utiliser le menu Actions > Importer, après avoir fait une procédure d’export de fichier sous l’autre outil bibliographique
Créer et manipuler des références
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Une référence complète : onglet info
Créer et manipuler des références Créer une nouvelle référence
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Créer et manipuler des références
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La référence
Onglet Info = les différents éléments de la référence Localiser : résolveur de lien Afficher … : la capture d’écran, le fichier, la page
Onglets Marqueurs = possibilité d’apposer des tags (mots clés libres) sur une référence
Onglet Connexe = possibilité de faire un lien entre deux éléments (référence, notes)
Créer et manipuler des références
30
La référence
Bouton « Afficher » / Onglet Info Afficher : Afficher le fichier, Afficher la page ou la capture d’écran liés à une
référence
Bouton « Localiser » / Onglet Info Pour lancer le résolveur de lien OpenURL à partir des données
bibliographiques de l’élément Voir les préférences générales de Zotero pour le paramétrage du serveur de
résolution
Créer et manipuler des références
Menu déroulant
34 types de références
Les types de référence
31
Créer et manipuler des références Ensemble de champs pour chaque type de référence
32
Créer et manipuler des références
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Entrée manuelle de nouveaux éléments et / ou modification des éléments importés
Zone de modification des éléments
Créer et manipuler des références
Modifier une référence
Modification d’un champ
Ajout de données supplémentaires
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Classer, organiser, gérer ses références Ma bibliothèque
Contient toutes les références
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Classer, organiser, gérer ses références
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Gestion des collections de la bibliothèque Créer une collection / des
sous-collections Nouvelle sous-collection Renommer la collection Supprimer la collection Exporter la collection Classer les références
Clic droit
C’est la collection sélectionnée qui reçoit les références importées Déplacement d’éléments par glisser-
déposer dans une collection
Classer, organiser, gérer ses références
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Gestion de la base personnelle
Modification de références Gestion du texte intégral Recherche dans la base Tri des notices Ajout de notes de lecture Ajout de tags (marqueurs) Export de la bibliothèque de références Lien de deux notices
Classer, organiser, gérer ses références Enrichir ses références : annoter ses collections de références
Ajouter un tag
Afficher les tags et
rechercher par tag
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Classer, organiser, gérer ses références
39
Créer une note indépendante ou liée à une référence
Zone de création de la note
Classer, organiser, gérer ses références
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Capturer la page courante : page figée
Enregistrer le lien vers la page courante : l’URL de la page
Stocker une copie du fichier : lien plus pérenne (stockage dans un sous-répertoire du dossier système de zotero
Lien vers un fichier : lien vers fichier stocké en local (Mes documents, bureau)
Classer, organiser, gérer ses références
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Glisser / Déposer du PDF sous la référence sélectionnée
Classer, organiser, gérer ses références
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Recherche dans la bibliothèque de références
Fenêtre de recherche avancée,
accessible par la barre d’outils
Possibilité d’enregistrer la recherche
L’interface de travail de Zotero
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Actions > Préférences dans la barre d’outils
1er onglet : Préférences générales
L’interface de travail de Zotero
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Actions > Préférences dans la barre d’outils
2ème onglet : Sync, pour synchroniser les données de la bibliothèque sur le serveur Zotero et créer une bibliothèque en ligne
L’interface de travail de Zotero
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Actions > Préférences dans la barre d’outils
3ème onglet : Recherche, pour l’indexation et la gestion des documents en texte intégral
L’interface de travail de Zotero
46
Actions > Préférences dans la barre d’outils
4ème onglet : Exportation, pour paramétrer les options de copie rapide et l’encodage des caractères
L’interface de travail de Zotero
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Actions > Préférences dans la barre d’outils
5ème onglet : Styles, pour choisir les styles à afficher par défaut dans le gestionnaire de bibliographie
L’interface de travail de Zotero
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Actions > Préférences dans la barre d’outils
6ème onglet : pour définir des proxies
L’interface de travail de Zotero
49
Actions > Préférences dans la barre d’outils
7ème onglet : Raccourcis clavier
L’interface de travail de Zotero
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Actions > Préférences dans la barre d’outils
8ème onglet : Préférences avancées
Sauver vos données
On peut faire une sauvegarde de la bibliothèque dans le format Zotero RDF mais cela ne donne pas une copie exacte de votre
base.Il est préférable de localiser votre bibliothèque Zotero
(Préférences Avancées), de fermer Firefox et de copier les données de votre répertoire Zotero vers un emplacement de
sauvegarde, de préférence sur un autre périphérique de stockage.
Styles bibliographiques et Zotero
AvertissementIl conviendra avant tout de bien cerner les besoins en terme de présentation de références bibliographiques...Il faudra trouver le style proposé par Zotero le plus proche de ces besoins
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Deux genres de styles de citation gérés par Zotero
a) Styles de citation au format auteur date. Sources citées dans le texte, généralement entre parenthèses, avec nom de l’auteur et date de publication.
=> Une bibliographie finale complète les références en fin du document (ordre alphabétique nom d'auteur)
En Afrique, le paludisme est responsable de la mort de plus d'un million de personnes à chaque année. Lutter contre ce fléau demande la concertation de plusieurs intervenants. (Organisation mondiale de la santé, 2000, p. 5-7) par
ex.
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1/Numéros dans le corps du texte
2/ Citations : références biblio. de la page ou de la section classés selon ordre d'apparition dans le texte 3/ Bibliographie complète et
finale55
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b) Styles de citation avec numérotation proposés par Zotero
Eléments 1 et 2 (cf diapo précédente)Chicago Manual of Style : note without bibliographyModern Humanities Research Association (Note without Bibliography)
Eléments 1 et 2 et 3(cf diapo précédente)Modern Humanities Research Association (Note with Bibliography)Chicago Manual of Style : full note with bibliographyChicago Manual of Style : note with bibliography
Eléments 1 et 3 (cf diapo précédente) American Medical Association IEEE National Library of medecine Nature Journal
Biblio finale classée selon ordre alpha. auteurs
Biblio finale classée selon ordre apparition dans le texte
a) Styles au format (auteur date) proposés par Zotero
American Political Association American Psychological Association American Sociological Association Chicago Manual of Style author date format Harvard reference format 1 (author date) Modern Langage Association
Quelques styles français : https://www.zotero.org/trac/ticket/1216Ou sur http://zotero.hypotheses.org/category/styles
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Produire une bibliographie
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Générer automatiquement une bibliographie
En utilisant le menu contextuelà partir de la collection souhaitée (clic droit) :« Créer une bibliographie… »
Produire une bibliographie
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Formater sa bibliographie Utilisation des styles fournis par Zotero
Enregistrement en format RTF
ou HTML
Voir dans les préférences le style par défaut
Produire une bibliographie
60
Produire une bibliographie
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Pour chercher d’autres styles dans le Répertoire Zotero de Styles Pour récupérer un
style stocké en local
Le Gestionnaire de styles
Produire une bibliographie
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Styles Zotero
Choix de styles par défaut dans l’interface (15 styles)
Voir aussi http://www.zotero.org/styles Possibilité d’installer d’autres styles Aperçu du style en positionnant la souris sur le lien
Pas d’interface graphique de modification ou de création de style
Création de style avec le langage CSL Le générateur CSL de Zotero : chrome://zotero/content/tools/csledit.xul Utilisation possible aussi de Simple Style Generator
http://www.somwhere.org/csl/ Projet de styles francophones de Zotero :
https://www.zotero.org/trac/ticket/1216
Produire un rapport
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Option du menu contextuel : « générer un rapport à partir de la collection
Styles supplémentaires site Zotero Des nouveaux styles sont proposés sur une page de dépôt :
http://www.zotero.org/styles : ils s’installent automatiquement (clic sur Install)
Passer le curseur de la souris sur ces styles permet d'avoir un aperçu du style..
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Endnote propose de télécharger, à l'adresse http://www.endnote.com/support/enstyles-terms.aspdes styles, légalement réservés aux utilisateurs d'Endnote
Techniquement , ces fichiers de style peuvent être utilisés par Zotero : Préférences, puis
choisir
Styles supplémentaires site Endnote
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Créer un style personnalisé Réservé à un public averti. Pb de compatibilité des CSL
Possible cependant : Pour cela Utiliser un langage XML : le CSL (Citation Style Language) voir
dev.zotero.org/creating_citation_styles Puis enregistrer le code produit sous l’extension CSL, ouvrir le fichier
CSL (préférences/styles) : le nouveau style s’intègrera
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Zotero et Word ou Open-Office
Utiliser Zotero dans Word ou Open Office Citer dans un traitement de texte depuis Zotero
Barre d’outils Zotero dans Word
Editer une référence
Insérer une référence
Créer la bibliographie
Editer la bibliographie
Modifier les préférences du document
Rafraîchir l’affichage des
références
Supprimer les codes
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Exercice Chercher le bon style, comprenez-vous les différentes
catégories de style de Zotero ? Pour les exercices, choisir un style « avec bibliographie » Dans un document word, insérer plusieurs citations, les
modifier, Constituer une bibliographie finale, puis la modifier Changez de style en cours de route Insertion de sources multiples Se servir de l’éditeur de citation (Clic sur montrer l’éditeur
lors de l’insertion d’une citation)
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Classer, organiser, gérer ses références Créer une chronologie
Menu Actions
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Exporter la bibliothèque
Menu Actions > Exporter la bibliothèque
Formats d’export : Zotero RDF, MODS, RIS, Refer / BibiX,
Unqualified Dublin Core RDF, Wikipedia Citation Templates, BibTeX
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Utiliser Zotero en ligne
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Version 3.0
Création d’un compte sur le serveur Zotero Accès à My Library Groupes Zotero People
Possibilité de synchroniser ses références
Partage des références
Utiliser Zotero en ligne
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Fonctions collaboratives : Zotero 3.0La synchronisation :
Synchronisation de la bibliothèque / serveur Zotero
Sauvegarde et consultation en ligne via le site web et compte utilisateur zotero
Synchronisation des documents attachés avec un serveur WebDav / Zotero
Ex Dropbox: http://db.tt/smlfWcY
Utiliser Zotero en ligne
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Bouton de synchronisation
Utiliser Zotero en ligne
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Synchronisation des données
Paramétrage de la synchronisation
Utiliser Zotero en ligne
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La bibliothèque en ligne
Gratuit jusqu’à 100mb
Attention : problème des PDF partagés en public
Utiliser Zotero en ligne
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Création de groupes
Utiliser Zotero en ligne
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Paramétrage du groupe
Utiliser Zotero en ligne
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Définition du groupe :
Nom Description Statut Disciplines concernées Logo, image Page web Commentaires
Gestion des membres
Options pour la gestion de la bibliothèque
Utiliser Zotero en ligne
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Un exemple : la bibliothèque du groupe Boîte à outils (pour les historiens)
Utiliser Zotero en ligne
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Groupes Zotero
Utiliser Zotero en ligne
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Création de groupes privés ou publics / interaction avec les bibliothèques propres à des groupes définis
Réseaux de personnes
Suivi de bibliothèques publiques par flux RSS
Edition et modification des styles ZoteroDate 10 février 2011
Un des principal reproche que l’on peut faire à Zotero, contrairement à un logiciel comme Bibus, concerne l’édition et la modification des styles de publication existants afin de réaliser son “propre” style. Il existe un utilitaire qui permet de personnaliser une feuille de style déjà existante. Il faut pour cela utiliser un outil local dans Firefox en tapant “chrome://zotero/content/tools/csledit.xul” dans la barre d’adresse pour permettre l’édition et la modification d’un style pré-existant… Vous trouverez plus de détails dans un tutoriel à l’adresse suivante
http://www.thomaslienhard.fr/TutorielZotero.html
J’en profite pour signaler également un autre outil très utile: “chrome://zotero/content/tools/cslpreview.xul”, toujours à taper dans la barre d’adresse de Zotero, qui permet de visualiser dans une même fenêtre une ou plusieurs références bibliographiques dans tous les styles disponibles dans son propre Zotero.