Upload
others
View
6
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
Disertacion
Paraqitur nga:
Msc. Laura GJYLI
Për gradën shkencore:
DOKTOR
Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të
Durrësit, bazuar në fragmentet gjenike ribozomale specifike
Udhëhequr nga:
Prof. As. Dr. Ariola BACU
Mbrohet më datë________________ para jurisë:
1._________________________________, Kryetar
2._________________________________, Anëtar (Oponent)
3._________________________________, Anëtar (Oponent)
4._________________________________, Anëtar
5._________________________________, Anëtar
Tiranë, 2014
REPUBLIKA E SHQIPËRISË
UNIVERSITETI I TIRANËS
FAKULTETI I SHKENCAVE TË NATYRËS
DEPARTAMENTI I BIOTEKNOLOGJISË
Programi: Bioteknologji Bimore Adresa: Bulevardi “ZOG I”, Tiranë, Tel/Fax: ++ 355 4232 120; www.unitir.edu.al;fshn.edu.al
E = mc2
H2O
x
dx
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
II
"Më lejoni t'ju tregoj sekretin që më çoi drejt synimit tim:
forca ime qëndron vetëm në këmbënguljen time".
Louis Pasteur (Mikrobiololog dhe kimist francez, 1822-1895)
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
III
FALENDERIME DHE MIRËNJOHJE
Përfitoj nga rasti të shpreh falenderime dhe mirënjohje ndaj:
Departamentit të Bioteknologjisë dhe Fakultetit të Shkencave të Natyrës, Universiteti i Tiranës, që mundësuan mbarëvajtjen e doktoraturës, si pjesë e programeve
të ciklit të tretë të studimeve pranë këtij departamenti, si dhe për mbështetjen financiare
përmes projektit “Monitorimi i cilësisë së ujërave dhe gjendjes trofike të Lagunave Kunë-
Vain dhe Liqenit të Shkodrës, 2009-2011”.
Laboratorit të Akuakulturës dhe Peshkimit, Durrës, Universiteti Bujqësor i
Tiranës dhe Dr. J. Kolitari, e cila mundësoi kryerjen pranë këtij laboratori të analizave të
parametrave për vlerësimin e cilësisë së ujërave.
Prof. As. Dr. A. Bacu, Përgjegjëse e Departamentit të Bioteknologjisë, FSHN,
UT, udhëheqëse e doktoraturës. Që prej bashkëpunimit tim të parë, të suksesshëm me
profesoreshë Ariolën, si udhëheqëse e diplomës gjatë studimeve në degën Biologji 5-
vjeçar; më ka dhënë ndihmesë shkencore në metodikë, në laborator, veçanërisht në
evidentimin e pranisë së specieve pikofitoplanktonike me analiza molekulare, leximin e
kujdesshëm të këtij punimi dhe publikimeve të tjera që lidhen me të, por edhe kurajo dhe
këshilla të vazhdueshme për t’u përmirësuar dita-ditës. Faleminderit me gjithë zemër,
profesoreshë Ariola!
Dy specialistëve të laboratoreve, me të cilët pata nderin dhe fatin të punoj e mësoj
shumë gjatë këtij studimi: E. Terpo, specialiste e Lab. të Bioteknologjisë, FSHN, UT,
dhe E. Gorrenca, specialist i Lab. të Hidrokimisë, pranë Lab. të Akuakulturës dhe
Peshkimit, Durrës, UBT, të cilët dhanë pakursyer ndihmesën e tyre në mbarëvajtjen e
punës laboratorike së studimit; përkatësisht në filtrim, ekstraktim, analizimin e ADN-së
fitoplanktonike & pikofitoplanktonike (Lab. i Bioteknologjisë) dhe matjen e parametrave
fiziko-kimikë dhe biologjikë të ujërave (Lab. i Hidrokimisë).
Gjithë stafin e Departamentit të Bioteknologjisë, që më mbështetën dhe më
pritën me dashamirësi, në veçanti që të dyja Ritat, Mira, Entela, Sandra, Jaku dhe Dr.
V. Sota.
Profesorëve të mi në FSHN, UT, që dhanë kontributin e tyre në formimin tim
shkencor dhe akademik. Prof. Dr. A. Miho, për sygjerimet lidhur me hartimin e tabelës
së parametrave fiziko-kimikë dhe biologjikë si dhe shqipërimin e një pjese të emërtesave
së tyre. Prof. Dr. A. Çullaj, për sygjerimet lidhur me vlerësimin e raportit të lëndëve
ushqyese (N:P). Prof. Dr. F. Babani, për sygjerimet lidhur me formatimin e tabelave,
grafikëve dhe figurave. Prof. Dr. M. Hysko, për ndihmesën në udhëheqjen e mikrotezës
dhe eksperiencën fillestare në studimin mikrobik të ujërave detare të Gjirit të Durrësit.
Msc. S. Zerelli, për sygjerimet lidhur me përpunimet dhe interpretimet
statistikore të të dhënave. Dr. M. Shyti, për ndihmën në përpunimin e të dhënave me
programin Statistika. Dr. B. Vrenozi, për sygjerimet lidhur me formatimin e
autoreferatit.
Fatmirin, për përgatitjen e pajisjes, që mundësoi marrjen e mostrave të ujit, për
shoqërimet në ekspedita, fotografimet, së bashku me Silvanën & Blerinën, si dhe
Erjonin, për kopertinën e disertacionit.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
IV
Duke falenderuar Zotin, këtë studim ia kushtoj familjes sime, prindërve dhe motrave,
që m’u gjenden pranë në çdo moment...
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
V
PASQYRA E LËNDËS
Falenderime dhe mirënjohje III
Pasqyra e lëndës V
Parathënie X
Qëllimi i studimit XII
Shkurtime XIII
I. PIKOFITOPLANKTONI, KATEGORITË, VEÇORITË QELIZORE, NDIKIMI
I FAKTORËVE MJEDISORË MBI TO 1
1.1. Ç’është fitoplanktoni, rëndësia mjedisore e tij 1
1.2. Pikofitoplanktoni, kategoritë e tij taksonomike 1
1.2.1. Historitë evolutive të gërshetuara të Synechococcus detar dhe Prochlorococcus
marinus 3
1.2.2. Klasifikimi taksonomik i Synechococcus 6
1.2.3. Filogjeneza e Synechococcus 6
1.3. Përshkrimi dhe rëndësia e Synechococcus si përfaqësues i zgjedhur në studim 7
1.4. Struktura qelizore dhe metabolizmi 8
1.4.1. Pigmentet 8
1.4.2. Lëvizshmëria 9
1.4.3. Produktet bioaktive të Synechococcus 9
1.5. Faktorët mjedisorë që ndikojnë tek Synechococcus 10
1.5.1. Drita 10
1.5.2. Lëndët ushqyese (azoti dhe fosfori) 10
1.5.3. Temperatura 11
1.5.4. Kripshmëria 11
1.5.5. Kullotat dhe vdekja virale 12
1.5.6. Ndikimi i pranisë së metaleve të rënda dhe reagimi i Syneccococcus 12
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
VI
II. KARAKTERISTIKA TË PËRGJITHSHME MJEDISORE TË GJIRIT TË
DURRËSIT 15
2.1. Karakteristika të përgjithshme fiziko-gjeografike, klimatike, gjeomorfologjike dhe
mjedisore të Gjirit të Durrësit 15
2.1.1. Vështrim i përgjithshëm fiziko-gjeografik i Gjirit të Durrësit 15
2.1.2. Porti Detar i Durrësit 16
2.1.3. Karakteristikat klimatike dhe hidrodinamike të Gjirit të Durrësit 17
2.1.4. Morfologjia e steresë dhe e fund-detit të Gjirit të Durrësit 18
2.1.5. Komunitetet biologjike të Gjirit të Durrësit përfshirë dhe basenin e Portit Detar të
Durrësit 19
2.1.6. Zhvillimet aktuale në bregdetin e Gjirit të Durrësit 20
III. METODA TË PËRDORURA PËR EVIDENTIMIN E PRANISË SË
PIKOFITOPLANKTONIT NË MJEDISET UJORE 22
3.1. Identifikimi dhe karakterizimi i popullatave mikrobike duke përdorur flow
citometrinë 22
3.2. Vlerësimi i shkallës së rritjes së shtameve të Synechococcus detar përmes
përmbajtjes sasiore të biomolekulave 23
3.3. Analiza filogjenetike molekulare e tri shtameve Synechococcus të izoluara nga uji i
detit 24
3.4. Zbulimi i ekotipeve Prochlorococcus dhe Synechococcus me anë të përdorimit të
sekuencave të hapësirave të transkriptuara të brendshme (ITS) të 16S-23SrADN 25
IV. MATERIALE DHE METODA 27
4.1. Stacionet e marrjes së mostrave 27
4. 1.1. Koordinatat gjeografike të stacioneve të kampionimit 27
4.2. Metodika e marrjes së mostrave 28
4.3. Përcaktimi i parametrave fiziko-kimikë dhe biologjikë të mostrave të ujit 28
4.4. Filtrimi 30
4.4.1. Filtrat e nevojshëm dhe reaktivat 30
4.5. Ekstraktimi i ADN-së së fitoplanktonit dhe pikofitoplanktonit nga filtrat specifikë 31
4.6. Matja e sasisë dhe cilësisë së ADN-ve 31
4.7. Evidentimi i pranisë së specieve pikofitoplanktonike bazuar në shumëfishimin me
anë të PCR-së të fragmentit ribozomik 16S-23SrADN 32
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
VII
4.7.1. Hartimi i primerave specifikë për rajonin 16S-23S të ADN-së ribozomale të
Synechoccocus 32
4.7.2. Protokolli i shumëfishimit me anë të PCR-së 32
4.7.2.1. Mostrat e ADN-së së përdorur si model për shumëfishim 33
4.7.3. Kushtet e ciklimit 33
4.8. Elektroforetimi i produkteve të shumëfishuara, protokolli 33
4.9. Diversiteti i pikocianobaktereve marine Synechococcus dhe Prochlorococcus bazuar
në shumëfishimin me anë të PCR të rajoneve 16S-23S ITSrADN pikofitoplanktonike 34
4.9.1. Primerat e përdorur për shumëfishimin e rajoneve ITS të specieve
pikofitoplanktonike Synechococcus dhe Prochlorococcus 34
4.9.2. Protokolli i shumëfishimit me anë të PCR-së 35
4.9.2.1. Protokolli i shumëfishimit me anë të PCR-së për çiftin e primerave (ITS-af / ITS-
ar) 35
4.9.2.2. Protokolli i shumëfishimit me anë të PCR-së për çiftin e primerave (ITS-bf / ITS-
br) 36
4.9.2.3. Mostrat e ADN-së së përdorur si model për shumëfishim 36
4.9.3. Kushtet e ciklimit për çiftin e primerave (ITS-af / ITS-ar) 36
4.9.4. Kushtet e ciklimit për çiftin e primerave (ITS-bf / ITS-br) 37
4.10. Elektroforetimi i produkteve të shumëfishuara, protokolli 37
4.11. Analiza statistikore 37
V. REZULTATE DHE DISKUTIME 38
5.1. Vlerësimi i faktorëve mjedisorë që ndikojnë në praninë e pikocianobaktereve në
ujërat e Gjirit të Durrësit 38
5.1.1. Vlerësimi i faktorëve mjedisorë abiotikë (parametrat fiziko-kimikë) 38
5.1.1.1. Temperatura 38
5.1.1.2. Pehashi 41
5.1.1.3. Oksigjeni i tretur (DO) 44
5.1.1.4. Ngopja me oksigjen (DO%) 47
5.1.1.4. Kripshmëria 49
5.1.1.5. Turbullia 52
5.1.1.6. Lëndët ushqyese (azoti dhe fosfori) 55
5.1.1.6.1. Nitratet (NO3-) 55
5.1.1.6.2. Fosfatet (PO43-
) 59
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
VIII
5.1.1.6.3. Raporti N:P në vlerësimin e faktorit kufizues të prodhimtarisë parësore dhe
ndikimi në lulëzimin e algave 61
5.2 Vlerësimi i klorofilës a totale (Chl a) si faktor mjedisor biotik (parametër biologjik)
63
5.2.1. Klorofila a totale (Chl a) dhe gjendja trofike e ujërave të Gjirit të Durrësit 64
5.3. Vlerësimi sasior i ADN-së fitoplanktonike dhe prania e gjinisë Synechococcus
67
5.3.1. Vlerësimi i pastërtisë së ADN-së fitoplanktonike 67
5.3.2. Sasia e ADN-së fitoplanktonike sipas muajve 68
5.3.3. Variacioni i sasisë ADN-së fitoplanktonike sipas stinëve 70
5.3.4. Sasia e ADN-së fitoplanktonike sipas stacioneve dhe diskutime mbi ndikimin e
metaleve të rënda në rritjen e fitoplanktonit 73
5.3.5. Prania e cianobakterit Synechococcus dhe diskutime mbi ndikimin e metaleve të
rënda në rritjen e tij 76
5.3.6. Analiza e lidhjeve dhe e grupimit të parametrave dhe stacioneve marrë në studim
76
5.3.6.1. Lidhja e ADN-së fitoplanktonike me faktorët mjedisorë 76
5.3.6.2. Lidhja e faktorëve mjedisorë ndërmjet tyre 78
5.3.6.3. Analiza faktoriale dhe grupimi i parametrave të ngjashëm të stacioneve të
ngjashëm 79
5.4. Vlerësimi sasior i ADN-së pikofitoplanktonike të izoluar përmes filtrimit të dytë 82
5.4.1. Vlerësimi i pastërtisë së ADN-së pikofitoplanktonike 82
5.4.2. Vlerësimi sasior i ADN-së pikofitoplanktonike sipas muajve 83
5.4.3. Vlerësimi sasior i ADN-së pikofitoplanktonike sipas stinëve 85
5.4.4. Sasia e ADN-së pikofitoplanktonike sipas stacioneve dhe diskutime mbi ndikimin e
metaleve të rënda në rritjen e pikofitoplanktonit 86
5.4.5. Lidhja e ADN-së pikofitoplanktonike me faktorët mjedisorë 88
5.4.6. Lidhja ADN-së pikofitoplanktonike me ADN-së fitoplanktonike 90
5.5. Analiza e zonës 16-23S ITS për të vlerësuar diversitetin gjenetik të Synechococcus
dhe Prochlorococcus në Gjirin e Durrësit 91
5.5.1. Lidhja midis shumëllojshmërisë së zonës ITS dhe cilësisë së ujërave në stacionet e
monituruara 92
5.5.2. Prania e popullatave të ndryshme gjenetikisht të pikocianobaktereve të gjinisë
Synechococcus dhe diskutime mbi faktorët mjedisorë që mund të ndikojnë në
variabilitetin e këtyre pupullatave në ujërat detare 92
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
IX
VI. PËRFUNDIME 93
VII. REKOMANDIME 97
VIII. BIBLIOGRAFIA 98
PËRMBLEDHJE 118
ABSTRACT 118
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
X
PARATHËNIE
Cianobakteret janë organizma me një rëndësi të madhe ekologjike si prodhues
primarë kryesorë fitoplanktonikë, përgjegjës për gjysmën e fotosintezës në planet. Si të
tillë janë aktorë me rëndësi në funksionimin oqeanik global, në ciklin e karbonit dhe në
evoluimin e klimës (Dufresne et al., 2003; Rocap et al., 2003; Waterbury et al., 1986a;
Partensky et al., 1999b).
Cianobakteret janë një nga kategoritë e fitoplanktonit prokariotik, që gjendet në ujëra të
ëmbla rrjedhëse dhe ato detare. Ato shumëqelizore dhe fijëzore i përkasin klasave të
nanofitoplanktonit dhe mikrofitoplanktonit. Mikrofitoplanktonet si diatomet dhe
dinoflagjelatët janë zakonisht nga 20–200 µm. Kokolitoforidët dhe silikoflagjelatët janë
pjesë e nanofitoplanktonit dhe kanë përmasa nga 2–20 µm. Më të vegjëlit e fototrofëve
me përmasa 0.2–2 µm janë pikofitoplanktonet, përfshirë cianobakteret një-qelizore dhe
lloje të tjera të eukariotëve fotosintetikë (Dawes 1998; Sandifer et al., 1980).
Pikofitoplanktoni detar (qeliza < 2–3 μm në diametër) i përket kryesisht dy
gjinive të cianobaktereve, Synechochoccus dhe Prochlorococcus dhe pikoplanktonit
eukariotik (Stockner & Antia, 1986; Partensky et al., 1999b).
Synechococcus (Johnson & Sieburth, 1979; Waterbury, 1985) është cianobakteri
dominant, që përmban fikobilisomë. Është përgjithësisht më i bollshëm në zonat e pasura
me lëndë ushqyese sesa në zonat oligotrofike, dhe kontribon në fiksimin global të C, me
mbi 20% në disa zona (Li, 1994).
Ekosistemi oqeanik përfshin zona eutrofike, mezotrofike, oligotrofike dhe paraqet
një mjedis me dritë të ndërlikuar, ndaj fiziologjia e këtyre organizmave fokusohet në
aftësinë e tyre për të siguruar lëndët ushqyese në përqëndrime nën-mikromolare, dhe për
të kapur dritën në kufij intensitetesh (në një kolonë uji) dhe cilësish të ndryshme (për
shembull ujërat bregdetare kundrejt atyre oqeanike të hapura) (Scanlan, 2003).
Përveç periodicitetit ditë-natë dhe atij stinor në mjedisin me dritë diellore, ka
ndryshime shoqëruese në strukturën e kolonës së ujit, për shembull ujërat e shtresëzuara
kundrejt ujërave të mirë-përziera, të cilat gjithashtu zmadhojnë ose ndryshojnë gradientët
ushqimorë dhe dritën (Scanlan, 2003).
Nga vera drejt dimrit hasen ndryshime të një shkalle të gjerë në mjedisin jetësor të
këtyre organizmave, ndër të cilat, mund të selektohen gjenotipe “elastike”, që paraqiten
gjatë vitit të afta për t’iu përgjigjur ndryshimeve mjedisore (Scanlan, 2003).
Nivelet e ndryshme të kontributit të pikofitoplanktonit në biomasën totale
fotosintetike çojnë në përfundimin se zhvillimi i tyre nuk është një konstante globale, dhe
ndryshon sipas vendndodhjeve gjeografike. Kripshmëria, temperatura dhe
qëndrueshmëria e kolonës së ujit mund të ndikojnë në kontributin në përqindje të
pikoplanktonit në biomasën fitoplanktonike totale (Veldhuis et al., 2005).
Përgjithësisht, kripshmëria e ulët dhe temperaturat e larta shtojnë përmbajtjen e
Synechococcus si përbërës i pikofitoplanktonit (Ning et al., 2000). Përveç kripshmërisë
dhe temperaturës, penetrimi i dritës dhe lëndët ushqyese, gjithashtu ndikojnë në rritjen e
pikofitoplanktonit krahasuar me fitoplanktone të tjera më të mëdha në përmasa.
Të dhënat e flow citometrisë sugjerojnë se qelizat e Synechococcus dhe
Prochlorococcus kanë aftësi të aklimatizohen dhe rriten me eficencë më të madhe në
intensitete të ulëta të dritës (Olson et al., 1990). Kështu, eficenca e rritjes së
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
XI
cianobaktereve, rritet me uljen e intensitetit të dritës. Në vendet ku drita është e
ndryshueshme, për shëmbull, gjatë ditës, në stinë të ndryshme, apo thellësi të ndryshme,
edhe sasia e cianobaktereve do të ndryshojë. Përveç ndikimit të dritës në rritjen e
cianobaktereve ndikojnë ndjeshëm edhe lëndët ushqyese. Në oqeanet oligotrofike
dominon Prochlorococcus, ndërsa në mjediset e mbyllura bregdetare të pasura me lëndë
ushqyese dominon Synechococcus (Olson et al., 1990).
Sot, ekzistojnë mjetet molekulare të nevojshme për të vlerësuar shpërndarjen e
gjenotipeve të cianobaktereve të ujërave detare (Fuller et al., 2003).
Në këtë punim, paraqitet përdorimi i fragmenteve gjenike ribozomale tipike për
cianobakteret pikofitoplanktonike, si mjeti për evidentimin e pranisë së këtyre specieve
në ujërat e cekëta të Gjirit të Durrësit.
Gjiri i Durrësit bazuar në veçoritë natyrore dhe ato mjedisore, të imponuara nga
dora e njeriut, mund të konsiderohet si një ekosistem shumë kompleks. Nga pikëpamja
ekonomike, padyshim konsiderohet si një prej zonave më të rëndësishme të bregdetit
shqiptar, dhe si e tillë vuan njëherësh pasojat e përdorimit intensiv.
Stacionet e zgjedhura për marrjen e mostrave, gjenden në pjesë të Gjirit të Durrësit të
konsideruara si hot spot-e për shkak të kategorive të ndryshme të ndotjeve të pranishme,
si derdhje kanalesh ujërash të zeza, pranë ish pontilit të karburanteve të portit, pranë
plazheve intensive, pranë venddepozitimit të mbetjeve të ngurta, etj.
Identifikimi i pranisë së cianobaktereve pikofitoplanktonike me metoda
molekulare, u parapri nga studimi i kushteve të raportuara mjedisore në të cilat mund të
gjenden këto gjallesa, më pas nga vlerësimi i faktorëve abiotikë dhe biotikë të Gjirit të
Durrësit në gjashtë stacione, dhe analizimi në parim i mundësive për një prani të
mundshme të këtyre gjallesave në të.
Në vijim, u punua për përshtatjen e metodikës së izolimit me anë të filtrimit të
gjallesave pikofitoplanktonike nga mostrat e ujit, dhe prej tyre pastrimi i ADN-së
gjenomike totale. Sasia e ADN-së u përdor për të ndërtuar një korrelacion me parametrat
mjedisorë të ndryshueshëm (variable).
Duke përdorur si ADN model atë fitoplanktonike, u arrit të shumëfishohej
fragmenti gjenik ribosomal 16S tipik për Synechococcus me anë të PCR-së.
Meqenëse, dy speciet kryesore të pikofitoplanktonit detar Prochlorococcus dhe
Synechococcus ndajnë një ngjashmëri shumë të lartë në nivel ADN-je, u vendos të
shumëfishoheshin me anë të PCR-së disa rajone përsëritëse të gjenomave cianobakteriale
të njohura si ITS-internal transcribed spacers, gjatësia e të cilave varion në nivel
popullatash dhe është raportuar si një mënyrë efikase për të dalluar dy speciet ndërmjet
tyre. Në këtë mënyrë, raportohen të dhënat e para mbi praninë e mëse një popullate
pikofitoplanktonike në këto ujëra.
Punimi ndër të tjera, jep përfundime të rëndësishme mbi variacionin stinor të
parametrave biotikë dhe abiotikë të ujërave dhe ndërton korrelacione me variacionin e
njëkohshëm të pikofitoplanktonit duke krijuar mundësinë për të gjykuar mbi aftësitë
adaptuese të këtyre gjallesave ndaj ndryshueshmërisë së mjedisit të tyre jetësor.
Ndër veçoritë e njohura të Gjirit të Durrësit është ndotja me metale të rënda dhe
karburante, ndaj vlerësimi i sasisë së organizmave fitoplanktonike dhe
pikofitoplanktonike në stacionet me prani të theksuar të këtyre ndotësve, kontribon në
arritjen e një tjetër përfundimi të rëndësishëm mbi adaptueshmërinë e këtyre gjallesave në
kushte specifike.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
XII
QËLLIMI I STUDIMIT
Qëllimi i studimit është identifikimi i cianobakterit Synechococcus në brigjet shqiptare të
Gjirit të Durrësit, bazuar në fragmentet gjenike ribozomale specifike.
Studimi i paraqitur synon këto objektiva:
Të japë kontribut në raportimin për herë të parë të pranisë së pikocianobaktereve
prokariotike të gjinisë Synechococcus në brigjet shqiptare të Gjirit të Durrësit.
Të raportojë përdorimin e metodave molekulare të bazuara në ADN për
evidentimin e pranisë së species Synechococcus, përmes shumëfishimit të një
fragmenti gjenik ribozomal tipik për këtë specie.
Të raportojë përdorimin e përmasave të fragmenteve ITS-internal transcribed
spacers, për të gjykuar mbi diversitetin e pikocianobaktereve prokariotike në
ujërat e Gjirit të Durrësit.
Të kryejë vlerësimin sasior të biomasës pikofitoplanktonike bazuar në sasinë e
ADN-së gjenomike.
Të vlerësojë faktorët mjedisorë fiziko-kimikë dhe biologjikë si temperatura, pH,
O2 i tretur, ngopja me oksigjen e ujërave, kripshmëria, turbullia, nitratet, fosfatet,
Chl a totale, ADN-së fitoplanktonike në Gjirin e Durrësit gjatë një periudhe të
caktuar dhe t’i përdorë ato për ndërtimin e korrelacioneve, që ndihmojnë në të
kuptuarit e dinamikës së këtyre popullatave në kushtet tipike të Gjirit të Durrësit.
Të gjykojë mbi kategoritë e faktorëve fiziko-kimikë, që mund të kenë rol
përcaktues në rritjen e popullatave cianobakteriale të Gjirit të Durrësit, bazuar në
të dhënat konkrete të këtyre parametrave.
Të analizojë në mënyrë krahasuese parametrat e matur në Gjirin e Durrësit me ato
të Adriatikut Jugor dhe Detit Mesdhe si dhe të japë një përfundim përgjithësues
mbi gjendjen mjedisore në Gjirin e Durrësit, që është areali i studimit.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
XIII
SHKURTIME
dNTPs (deoxynucleoside 5’-triphosphates) deoksinukleotide
EDTA (ethylene diamine tetraacetic acid) acidi etilen diaminë tetraacetik
EtBr ethidium bromide bromur etidiumi
EtOH (ethanol) etanol
f (forward direction) kahu orar
r (reverse) kahu kundërorar
ITS (Internal transcribed spacer) hapësirë e brendshme e transkriptuar
kb (kilobases) kilobaza
bp (base pairs) çifte bazash
NaOAc (sodium acetate) acetat natriumi
OD (optical density) densideti optik
PCR polymerase chain reaction Reaksion i shumëfishimit zinxhir
rDNA (ribosomal DNA) rADN (ADN ribozomale)
tRNA (transfer RNA) tARN (ARN transporti)
SDS (sodium dodecyl sulphate) sodium dodecil sulfat
STE (sodium Tris-EDTA) sodium Tris-EDTA
TAE (Tris-acetate EDTA) Tris-acetat EDTA
TBE (Tris-borate EDTA) Tris-borat EDTA
TE (Tris-EDTA) Tris-EDTA
U unit(s) njësi enzimatike
UV rrezatim ultraviolet
NTU (nephelometric turbidity units) njësi turbiditeti nefelometrike
rRNAs (ribosomal RNA subunits) rARNs (nënnjësi ARN ribozomale)
rDNAs (ribosomal RNA subunits) rADNs (nënnjësi ADN ribozomale)
(DAPI) (4',6-diamidino-2-phenylindole) ` (4',6-diamidino-2-fenilindol)
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
1
I. PIKOFITOPLANKTONI, KATEGORITË, VEÇORITË QELIZORE, NDIKIMI
I FAKTORËVE MJEDISORË MBI TO
1.1. Ç’është fitoplanktoni, rëndësia mjedisore e tij
Një nga kategoritë e mikroorganizmave më të rëndësishëm të ekosistemeve detare është
fitoplanktoni. Ky i fundit, si një prodhues primar, luan rol të rëndësishëm në qarkullimin
e lëndës dhe rrjedhën e energjisë në ekosistemet ujore. Prania e tij shpesh kontrollon
rritjen, kapacitetin e riprodhimit dhe karakteristikat e popullatave të organizmave të tjerë
ujorë. Kështu, studimi i fitoplanktonit është thelbësor për vlerësimin e mjedisit ujor.
Gjithashtu, fitoplanktoni ndihmon në pastrimin e ujërave të ndotura apo në përmirësimin
e cilësisë së tyre, duke transformuar lëndët inorganike në substanca organike (Graham &
Wilcox, 2000).
Brenda sistemit pelagjik, algat prokariote dhe eukariote janë prodhuesit primarë kryesorë.
Përmasat qelizore të fitoplanktonit ndryshojnë më shumë se 100-herë ndërmjet kategorive
të pikoplanktonit të vogël (0.2–2 μm), nanoplanktonit (2–20 μm) dhe mikroplanktonit të
madh (20–200 μm). Fraksioni i pikoplanktonit përbëhet kryesisht nga prokariotë si
cianobakteret njëqelizore Synechococcus dhe Prochlorococcus, por gjenden edhe disa
eukariotë.
Në fraksionin e nanoplanktonit flagjelatët janë të zakonshëm, ndërsa diatomet dhe
dinoflagjelatët zakonisht dominojnë fraksionin e mikroplanktonit. Aktiviteti biologjik
lidhet ngushtë me proceset dinamike, të cilat rregullojnë furnizimin vertikal ushqimor dhe
lëvizjet e qelizave të fitoplanktonit në shtresën eufotike. Studimet e ekologjisë detare
planktonike janë fokusuar kryesisht në vlerësimin e shkallës së rritjes të përbërësve të
ekosistemeve ujore dhe si ato ndikojnë në ciklet biogjeokimike. Përbërja fitoplanktonike
konsiderohet si një bioindikator natyror, për shkak të përgjigjeve të ndërlikuara dhe të
shpejta, ndaj luhatjeve të kushteve mjedisore (Livingston, 2001).
Struktura e rrjetës ushqimore mikrobike pelagjike dhe funksionimi i saj është në një masë
të madhe e përcaktuar nga prodhuesit parësorë. Për shembull, në një sistem të dominuar
nga diatometë, një pjesë e madhe e prodhimtarisë parësore kanalizohet nëpërmjet rrjetave
ushqimore klasike ose humbet nga sistemi përmes sedimentimit (Wassmann, 1993;
Heiskanen & Kononen, 1994).
Ndërsa, në sistemet e dominuara nga cianobakteret njëqelizore, një pjesë e madhe e
energjisë dhe karbonit do të përpunohen brenda rrjetës ushqimore mikrobike dhe do të
riciklohen në zonën eufotike (Smetacek, 1985 & 2002).
Fati i prodhimtarisë parësore (kullotat, filtrimi, formimi i agregatit, sedimentimi) duket se
varet në një masë të madhe nga përmasat e qelizave. Në përgjithësi, përqëndrimet e larta
të planktonit me përmasa mikro janë të lidhura me ujëra të trazuara p.sh. rrymat detare,
frontet ose burimet si dhe përzierjet e ujërave vjeshtore, ndërsa piko dhe nanoplanktoni
dominojnë në ujërat e ndenjura, p.sh. në det të hapur ose ujërat e shtresëzuara gjatë verës
(Kiørboe, 1993). Prodhimtaria parësore, fluksi vertikal dhe rigjenerimi i lëndëve
ushqyese në një ekosistem bregdetar paraqitet në figurën 1.1.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
2
Figura 1.1. Prodhimtaria parësore, fluksi vertikal dhe rigjenerimi i lëndëve ushqyese në një
ekosistem bregdetar. Gjithashtu tregohen disa nga organizmat e përfshirë, sikurse fitoplanktoni,
zooplanktoni, nivelet më të larta ushqyese dhe organizmat bentonikë. Shigjetat e gjëra dhe të
holla tregojnë përkatësisht skenarët e fluksit vertikal të rëndësishëm dhe të papërfillshëm (A.
Keck & P. Wassmann, 1993).
1.2. Pikofitoplanktoni, kategoritë e tij taksonomike
Pikoplanktoni, në përgjithësi i njohur si plankton me madhësi 0.2–2 µm, përbëhet
kryesisht nga bakteret heterotrofe dhe pikofitoplanktoni (cianobakteret dhe
pikoeukariotët). Bakteret heterotrofe luajnë role të rëndësishëm në ciklin e elementëve
dhe dinamikën trofike në det (Azam et al., 1983). Pikofitoplanktoni është kontribuesi
kryesor në biomasën fitoplanktonike në ekosistemet oligotrofike oqeanike. Në veçanti
cianobakteret, që i përkasin gjinive Synechococcus dhe Prochlorococcus janë
komponentë të rëndësishëm të komunitetit pikofitoplanktonik në ujërat oqeanike globale
(Li et al., 1983; Karlson & Nilsson, 1991; Burkill et al., 1993; Odate, 1996).
Pikofitoplanktoni është një komponent i pranishëm në të gjitha sistemet oqeanike.
Përqëndrimi i qelizave të Prochlorococcus dhe Synechococcus në mjedise detare të
ndryshme zakonisht është vlerësuar me anë të flow-cytometri-së (Li, 1995).
Prochlorococcus, i cili është fotoautotrofi më i vogël oksigjenik (~0.6 μm në diametër),
është numerikisht i bollshëm (105 qeliza ml
-1), sidomos në oqeanin tropikal (Partensky et
al., 1999). Përgjithësisht, Prochlorococcus është organizmi më i bollshëm në zonën
eufotike të oqeanit tropikal dhe subtropikal dhe numerikisht i tejkalon grupet e tjera nga
10 deri në 100 herë (Blanchot et al., 2001).
Pikoeukariotët janë gjetur në përgjithësi gjatë gjithë zonës eufotike, pavarësisht nivelit të
dritës (Blanchot & Rodier, 1996).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
3
Prochlorococcus dhe pikoeukariotët përgjithësisht tejkalojnë Synechococcus, në mjediset
me ndriçim të dobët. Numri i Synechococcus është më i lartë atje ku Prochlorococcus
është më pak i bollshëm (Olson et al.,1990â; Partensky et al.,1996). Synechococcus është
larg numrit të madh të Prochlorococcus në gjithë mjediset, ku ato bashkëndodhen, me
përjashtim të zonave të qëndrueshme të pasura me ushqyes, sikurse zonat me rryma
ngjitëse dhe zonat bregdetare (Partensky et al., 1999a).
Synechococcus, i cili është i madh (~1–2 μm në diametër) krahasuar me
Prochlorococcus, është i shpërndarë kudo, nga deti i hapur në bregdet (Olson et al.,
1990b). Synechococcus paraqitet në përqëndrime nga pak qeliza deri në 106 qeliza ml
-1,
në gjithë zonat eufotike të oqeanit botëror (Fig. 1.2) (Waterbury et al., 1986b).
Figura 1.2. A. Synechococcus; B. Prochlorococcus (http://newscenter.lbl.gov/news-
releases/2003/08/14/genomes-of-tiny-microbes-yield-clues-to-global-climate-change).
1.2.1. Historitë evolutive të gërshetuara të Synechococcus detar dhe Prochlorococcus
marinus
Pavarësisht lidhjes së ngushtë në prejardhje të zbuluar falë analizës krahasuese të 16S
rARN, Prochlorococcus dallohet nga Synechococcus, ndër të tjera, nga një set unik i
pigmenteve fotosintetike, aparati i ndryshëm i depozititmit të dritës, përmasa më të vogla
dhe aftësi më të mira për tu rritur në ujërat oligotrofike (Partensky et al., 1999).
Nisur nga gjeni rpoC1 dhe analiza e sekuencave të brendshme të transkriptuara (ITS-
internal transcribed spacer) të 16S–23SrARN, Prochlorococcus shfaqet si një degë motër
e Synechococcus detar (Palenik & Haselkorn, 1992; Urbach et al., 1992; Rocap et al.,
2002).
Diversiteti i madh i vëzhguar brenda specieve të gjinisë Prochlorococcus, çoi në
përfshirjen e ekotipeve të shumta (grupeve të gjendura në kushte mjedisore të ndryshme,
apo bazuar në fiziologjinë e tyre), në dy ndarje të dallueshme si ekotipe të përshtatura në
intensitet të ulët drite (low-light) dhe intensitet të lartë drite (high-light) (Coleman &
Chisholm, 2007), me ndarje të mëtejshme të nëngrupeve të pastra (Fig. 1.3) (Ahlgren et
al., 2006). Edhe vetë studiuesit, që propozuan këtë ndarje gjykojnë se, megjithëse ka
korrelacione të disa parametrave mjedisorë, si lëndët ushqyese në dispozicion,
temperatura, dhe drita (Coleman & Chisholm, 2007), vërejnë se “njohja e degëve dhe
grupeve, si dhe interpretimi i tyre në dritën e faktorëve ekologjikë, varet nga shkalla e
observimit”.
Përftimi i sekuencave gjenomike nga shtamet e Synechococcus detare dhe
Prochlorococcus ka ndihmuar në të kuptuarit e evoluimit të këtyre organizmave. Është
provuar tashmë që Prochlorococcus tenton të ketë gjenomë më të vogël dhe me
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
4
përmbajtje më të ulët të GC. Pavarësisht ngjashmërisë > 96% të 16S rARN, midis (dhe
brenda) Prochlorococcus dhe Synechococcus detar, është vlerësuar ngjashmëria e
mesatares nukleotidike (ANI) dhe ngjashmëria e mesatares aminoacidike (AAI)
(Dufresne et al., 2008), të cilat rezultojnë të ndryshme. Një përjashtim nga ky konstatim
bën proteina shumë e ruajtur (hiperkonservative) e përshkruar nga Zhaxybayeva et al.
(2007). Organizimi i shumëllojshëm i gjeneve koduese për ARN-të e transportit dhe ato
ribozomike në ishuj gjenomike tipikë, sugjerojnë mundësinë e transferimit horizontal të
gjeneve apo ngjarje të lidhura me rikombinimin e tyre (Rocap et al., 2003; Coleman et
al., 2006).
Sullivan et al. (2003) zbuloi fagë, që infektonin shtame të Prochlorococcus dhe fagë, të
cilët mund të infektonin ekotipe të Prochlorococcus dhe Synechococcus detar. Studime të
mëtejshme propozuan, që rikombinimi brenda dhe midis Prochlorococcus dhe
Synechococcus mund të ndërmjetësohej nga fagët (Lindell et al., 2004; Sullivan et al.,
2005; Zeidner et al., 2005). Në veçanti, gjenet që kodojnë për komponentë të
paqëndrueshëm të makinerisë fotosintetike janë të përhapur gjerësisht midis cianofagëve
(Sullivan et al., 2006; Sharon et al., 2007; Sandaa et al., 2008, Lindell et al., 2006) dhe
janë vërejtur të shprehen gjatë infektimit (Dammeyer et al., 2008). Gjenet e angazhuara
në biosintezën e pigmentit fikobilinë të mbartur nga cianofagët, u zbulua se
trankriptoheshin pas infektimit (Sullivan et al., 2005; Weigele et al., 2007).
Sekuencimi i gjithë gjenomës së cianobaktereve (nëntë gjenoma janë aktualisht të
depozituara në GenBank) tregoi që gjenoma e fagëve përmban jo vetëm aftësi për
sintezën e pigmenteve fotosintetike të transmetuar tek gjenomat bujtëse, por gjithashtu
gjene metabolike të përfshirë në metabolizmin nukleotidik, metabolizmin karbonik,
stresin e fosfatit, dhe biosintezën lipopolisaharide (Sullivan et al., 2005; Weigele et al.,
2007). Këto zbulime mbi gjenomat e cianofagëve sugjerojnë që fagët mund të kenë rol
mjaft të rëndësishëm në përmbajtjen gjenomike të Prochlorococcus dhe Synechococcus
detar (Zhaxybayeva et al., 2009).
Ndërsa shkencëtarët kishin vetëm katër gjenoma në dispozicion (shtamet
Prochlorococcus marinus CCMP1375, CCMP1986, MIT 9313, dhe Synechococcus detar
WH8102), analizat e familjeve te tyre gjenike duke përdorur metodologji të ndryshme,
kundërshtonin filogjenezën e 16S rARN-ve përkatëse (Zhaxybayeva et al., 2004; Beiko
et al., 2005; Zhaxybayeva et al., 2006).
Të tilla mospërputhshmëri janë shënuar në analizën e gjeneve individuale sikurse gjeni
ntcA (nitrogen control gene-gjeni për kontrollin e azotit), i cili ka provuar dy forma në dy
ekotipe të Synechococcus sp. (Penno et al., 2006).
Studime të fundit ku përfshihen shumë gjenoma (Kettler et al., 2007; Dufresne et al.,
2008) janë përqëndruar mbi sinjalet filogjenetike të gjeneruara nga sekuencimi i tyre.
Analiza e familjeve të gjeneve në 11 shtame të Synechococcus detar zbuluan historinë
filogjenetike komplekse të tyre (Dufresne et al., 2008). Bazuar në analizën e dyfishtë të
gjeneve bërthamore kundrejt pemës filogjenetike të ndërtuar nga bashkimi i gjeneve të
lidhura, Dufresne et al. (2008) raportoi se 9.3% e gjeneve bërthamore kanë një histori të
lidhur me HGT (horizontal gene transfer) dhe se mjaft gjene dytësore janë të
pozicionuara në ishuj gjenomike.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
5
Figura 1.3. (A) Lidhjet evolucionare mbështetur nga shumica e 1812 gjeneve të afërta. (B) Rrjeta
e afërsisë rindërtuar nga të gjitha kuartet familiare. (C) Topologjia e pemës së rARN (Zhaxybayeva et al., 2009).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
6
1.2.2. Klasifikimi taksonomik i Synechococcus
• Mbretëria : Bacteria
• Tipi: Cyanabacteria
• Rendi: Synechococcales
• Familja: Synechococcaceae
• Gjinia: Synechococcus (Nägeli, 1849)
• Llojet: Synechococcus elongatus, Synechococcus WH 8102,etj.
Disa lloje të gjinisë Synechococcus
S. ambiguus Skuja
S. arcuatus var. calcicolus Fjerdingstad
S. bigranulatus Skuja
S. brunneolus Rabenhorst
S. caldarius Okada
S. capitatus A. E. Bailey-Watts & J.
Komárek S. carcerarius Norris
S. elongatus (Nägeli) Nägeli
S. endogloeicus F. Hindák
S. epigloeicus F. Hindák
S. ferrunginosus Wawrik
S. intermedius Gardner
S. koidzumii Yoneda
S. lividus Copeland
S. marinus Jao
S. minutissimus Negoro
S. mundulus Skuja
S. nidulans (Pringsheim) Komárek
S. rayssae Dor
S. rhodobaktron Komárek &
Anagnostidis S. roseo-persicinus Grunow
S. roseo-purpureus G. S. West
S. salinarum Komárek
S. salinus Frémy
S. sciophilus Skuja
S. sigmoideus (Moore & Carter)
Komárek S. spongiarum Usher et al.
S. subsalsus Skuja
S. sulphuricus Dor
S. vantieghemii (Pringsheim) Bourrelly
S. violaceus Grunow
S. viridissimus Copeland
S. vulcanus Copeland
1.2.3. Filogjeneza e Synechococcus
Përshkrimi filogjenetik i Synechococcus është i vështirë. Shtamet e izoluara janë
morfologjikisht mjaft të ngjashme dhe shfaqin përmbajtje G+C që varion midis 39 % në
71 % (Waterbury et al., 1986b), çka ilustron diversitetin gjenetik të këtij grupimi.
Fillimisht, u gjykua që grupi të ndahej në tre nënndarje, secila me një diapazon specifik të
përmbajtjes gjenomike G+C (Rippka & Cohen-Bazire, 1983). Vëzhgimet mbi
përmbajtjen G+C, tregojnë që Synechococcus përbëhet nga të paktën disa lloje. Manuali i
Bergey's (Herdman et al., 2001) e ndan Synechococcus në pesë grupe (ekuivalente me
gjininë) bazuar në morfologjinë, fiziologjinë dhe tiparet gjenetike.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
7
Grupi 1 përfshin fotoautotrofët obligatë, jo-të lëvizshëm, relativisht të mëdhenj (1–1.5
µm), që shfaqin tolerancë të ulët ndaj kripshmërisë. Shtamet referuese për këtë grup janë
PCC6301 (ish Anacycstis nidulans) dhe PCC6312 (Rippka et al., 1979).
Grupi 2 gjithashtu karakterizohet nga një tolerancë e ulët ndaj kripshmërisë. Qelizat janë
fotoautotrofë obligat, me mungesë të fikoeritrinës dhe janë termofilikë. Shtami referues
është PCC6715 (Dyer & Gafford, 1961).
Grupi 3 karakterizohet nga mungesa e fikoeritrinës, janë detarë eurihalinë, të aftë të
rriten si në mjediset detare dhe në ujëra të ëmbla. Shtami referues PCC7003 është
heterotrof fakultativ dhe kërkon vitaminën B12 për rritje.
Grupi 4 përmban një shtam të vetëm, PCC7335. Ky shtam është obligat detar
(Waterbury & Stanier, 1981) dhe përmban fikoeritrinë (Rippka et al., 1979).
Grupi 5 përmban nëngrupe të njohura më parë si “grupe detare A dhe B” të
Synechococcus. Këto qeliza janë vërtet detare dhe janë izoluar si në bregdet ashtu edhe
det të hapur. Gjithë shtamet janë fotoautotrofë obligatë dhe janë rreth 0.6 – 1.7 µm në
diametër. Ky grup ndahet më tej në një popullatë që përmban (nëngrupi 5.1) ose nuk
përmban fikoeritrinë (nëngrupi 5.2). Shtamet referuese janë WH8103, që përmbajnë
fikoeritrinë dhe WH5701 ato që kanë mungesë pigmenti (Waterbury et al., 1986b).
Badger et al. (2002) ka propozuar ndarjen e cianobaktereve në α-nëngrupe dhe β-
nëngrupe bazuar në tipin e rbcL (nënnjësia e madhe e ribulozë 1,5-disfosfat karboksilazë
/ oksigjenazë) gjetur në këto organizma. α-cianobakteret është gjetur se përmbajnë një
formë IA, ndërsa β-cianobakteret janë përcaktuar të përmbajnë një formë IB të këtij gjeni.
Në mbështetje të kësaj ndarjeje, Badger analizoi filogjenezën e karboksilazave, të cilat
duket se mbështesin këtë ndarje.
1.3. Përshkrimi dhe rëndësia e Synechococcus si përfaqësues i zgjedhur në studim
Synechococcus - nga greqishtja do të thotë synechos (varg) dhe kokkos (kokërr). Gjinia u
përshkrua për herë të parë në 1979 (Johnson & Sieburth, 1979; Waterbury et al., 1979)
dhe përfshin cianobaktere njëqelizore të vogla, fotosintetike, në formë sferike ose
elipsoide, që riprodhohen me ndarje binare, me mur qelizor, gram negative, shumë të
strukturuar. Kjo gjini është shumë e përhapur në mjedisin detar, por mjaft lloje gjenden
edhe në ujëra të ëmbla. Përmasat e tij variojnë ~ 1–2 μm. Synechococcus gjenden si
qeliza të vetme ose në grupe të vegjël, ose në çifte (Fig. 1.4), kryesisht në ujërat
sipërfaqësore të ndriçuara mirë, ku hasen zakonisht 1000 - 200,000 qeliza/ml (Fig. 2-4).
Gjinia Synechococcus përmban organizma të një diversiteti gjenetik të konsiderueshëm
që ndahen në nëngrupe bazuar në praninë e pigmentit shtesë fikoeritrinë (Rippka et al.,
1979; Perkins et al., 1981). Synechococcus është një nga komponentët më të rëndësishëm
të pikoplanktonit prokariotik autotrof, ku përfshihen dhe gjinia Prochlorococcus dhe
pikoplanktoni eukariotik (qeliza < 2–3 μm në diametër). Cianobakteret e gjinisë
Synechococcus, që përmbajnë fikoeritrinë, janë të shpërndarë kudo në numër të madh dhe
janë kontribuesit kryesorë në prodhimin primar dhe biomasën në një zonë të gjerë të
oqeanit botëror (Waterbury et al., 1979; Partensky et al., 1999; Agawin et al., 2000).
Pikoplanktoni është përgjegjës për gjysmën e fotosintezës në planet. Këto baktere janë si
pasojë aktorë me rëndësi në funksionimin oqeanik global, në ciklin e karbonit dhe si
pasojë në evoluimin e klimës (Dufresne et al., 2003; Rocap et al., 2003). Synechococcus
luan një rol kryesor në strukturën e rrjetës ushqimore pelagjike nëpërmjet transferimit të
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
8
energjisë brenda rrethit mikrobik dhe veçanërisht në zonat oligotrofike përmes shtresës së
flagjelatëve dhe ciliatëve heterotrofikë. Është vlerësuar që 35-100% e Synechococcus
mund të përdoret si kullotë për një ditë (Campbell & Carpenter, 1986a).
Figura 1.4. Lloje te ndryshme të gjinisë Synechococcus. A) Synechococcus elongates; B)
Synechococcus aeruginosus; C) Synechococcus sp.;D) Synechococcus major (google
images: Synechococcus photos).
1.4. Struktura qelizore dhe metabolizmi
1.4.1. Pigmentet
Pigmenti fotosintetik kryesor i Synechococcus është klorofila a, ndërsa pigmentet
shoqëruese kryesore janë fikobiliproteinat (Waterbury et al., 1979). Katër
fikobiliproteinat e zakonshme të njohura janë: alofikocianina (APC), fikocianina (PC),
fikoeritrina I (PEI), fikoeritrina II (PEII) si pigmente të depozitimit (harvesting) së dritës.
Vetia spektrale e fikobiliproteinave diktohet nga grupet prostetike të tyre, që janë
tetrapirole lineare të njohura si fikobilina. Fikobiliproteinat agregohen në një kompleks
proteinash që quhet fikobilisomë (PBS), duke i bërë fikobilinat unike midis pigmenteve
fotosintetike (Fig. 1.5) (Stanier & Cohen-Bazire, 1977).
Figura 1.5. Shpërndarja e nënnjësive proteinike në një fikobilisomë
(http://phototroph.blogspot.com/2006/12/phycobilisomes.html).
Piku i gjatësisë së valës për çdo fikobiliproteinë varet nga përbërja e kromoforëve
(molekula e kapjes së dritës) të lidhur sikurse: fikourobilina (PUB), fikoeritrobilina
(PEB) dhe fikocianobilina (PCB). Mjaft shtame Synechococcus janë izoluar në mjedise të
ndryshme detare. Ata ndahen në të paktën tre tipe bazuar në raportin PUB/PEB: tipi pa
PUB, tipi me PUB të ulët dhe tipi me PUB të lartë. PUB dhe PEB absorbojnë
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
9
respektivisht maksimalisht në 495 dhe 545 nm (Katano et al., 2004). Veç kësaj
Synechococcus gjithashtu përmban pigmentin zeaksantin (Waterbury et al., 1986b).
1.4.2. Lëvizshmëria
Lëvizshmëria notuese joflagjelare e Synechococcus detar (Waterbury et al., 1985;
Brahamsha, 1996a; Pitta & Berg, 1995; Pitta et al., 1997) përbën një nga pak tiparet
fenotipike, të cilat shfaqin lidhje filogjenetike brenda gjinisë (Toledo et al., 1999). Kjo
mënyrë lëvizjeje unike karakterizohet nga mungesa e flagjelit apo e ndonjë organeli
lëvizor të dallueshëm. Mekanizmi notues mbetet i pakuptueshëm (Brahamsha, 1999a),
megjithëse është zbuluar se për gjenerimin e shtyrjes është e nevojshme një proteinë
SwmA, nevoja për të cilën vihet re tek mutantët swmA, që humbasin aftësinë për tu
zhvendosur, ndonëse mund të gjenerojnë një moment rrotullimi (Brahamsha, 1996a).
Me interes specifik për sa i përket adaptimit, është të paktën një shtam i lëvizshëm, WH
8113, që duket të jetë kemotaktik kundrejt burimeve azotike ku përfshihen amoniaku,
nitrati, β-alanina, glicina dhe ureja (Willey & Waterbury, 1989). Një kemotaksis pozitiv i
tillë ka mundësi të lejojë shtame të lëvizshme të hyjnë në burimet lokale të pasuruara me
lëndë ushqyese, që mund të jenë veçanërisht të dukshme rreth mikroagregatëve (bora
marine) ose burimeve pikëzore që çlirojnë lëndë ushqyese. Shembull është autoliza e një
mikroorganizmi të madh, derdhjet e lëndëve organike të patretura dhe lënda ushqyese
inorganike nga vakuolat ushqimore ose ekskretimi zooplanktonik. Burime të tilla
pikëzore të lëndëve ushqyese janë raportuar të shpërndahen brenda njollave sferike pak
milimetra në diameter, që mund të mbajnë shumë baktere (Blackburn et al., 1998). Për
këto arsye, përgjatë distancave nga milimetra në centimetra, shtamet Synechococcus të
lëvizshme shfaqen të kenë një avantazh selektiv mbi homologët jo të lëvizshëm,
veçanërisht në sistemet e hapura oqeanike oligotrofike, një mjedis ky ku shtamet e
lëvizshme shfaqen si mbizotërues (Scanlan, 2003).
1.4.3. Produktet bioaktive të Synechococcus
Kontributi i organizmave detare në zbulimin e molekulave të reja bioaktive është gjithnjë
e më sfidues (Sponga et al., 1999; Skulberg, 2000). Produktet natyrore janë izoluar nga
një varietet taksonesh dhe janë testuar për aktivitete të ndryshme biologjike. Midis këtyre
taksoneve, cianobakteret konsiderohen si kandidatë të mirë për zbulimin e drogave, me
aplikime në bujqësi (Biondi et al., 2004), industri (De Philippis & Vincenzini, 1998) dhe
veçanërisht në farmaceutikë (Mundt et al., 2001).
Megjithëse, cianobakteret paraqiten kryesisht si shqetësim mjedisor ose si burim
toksinash, rreziqe natyrore (hazarde) për njeriun dhe kafshët ujore, ka mjaft për tu
studiuar mbi lëndët kimike të prodhuara nga këto organizma. Janë raportuar aktivitetet
antibakteriale, antifungale, algicide dhe citotoksike të mjaft prej tyre (Rao, 1994;
McDermott et al., 1998; Issa, 1999; Pushparaj et al., 1999; Schlegel et al., 1999;
Schaeffer & Krylov, 2000).
Roli i molekulave bioaktive tek vetë organizmi prodhues është pak i kuptuar, duke marrë
në konsideratë spektrin e gjerë të adaptimit biologjik dhe tolerancën ndaj stresit mjedisor,
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
10
të zbuluara tek cianobakteret. Disa nga këta përbërës, mund të prodhohen si një përpjekje
për t'i dhënë përparësi mbijetesës së tyre (Martins et al., 2008).
Kërkimet mbi përbërjet biologjike aktive nga cianobakteret janë fokusuar veçanërisht mbi
speciet e ujrave të ëmbla. Studimet mbi speciet detare janë shumë të kufizuara dhe lidhen
veçanërisht me format filamentoze në zonat tropikale (Schlegel et al., 1999), Detin
Balltik (Suikkanen et al., 2004) dhe Detin Mesdhe (Pushparaj et al., 1999).
Një tjetër studim ka treguar se shtamet cianobakteriale detare të gjinisë Synechocystis dhe
Synechococcus, prodhojnë substanca me efekt frenues mbi qelizat prokariotike dhe me
aktivitet apoptotik në qelizat eukariote, çka shpjegon rëndësinë e këtyre organizmave si
burime potenciale të agjentëve farmakologjikë.
Meqenëse, në ekstraktet e fituara me tretës organike dhe ekstraktet e fituara me ujë, janë
vërejtur ndryshime, mendohet se në këto qeliza përfshihen përbërje me polaritet të
ndryshëm (Martins et al., 2008).
1.5. Faktorët mjedisorë që ndikojnë tek Synechococcus
1.5.1. Drita
Synechococcus paraqitet në përqëndrime që klasifikohen nga pak qeliza për ml në 106
qeliza/ml, në pothuajse gjithë rajonet e zonës eufotike (Waterbury et al., 1986b). Ndonëse
Synechococcus ka sisteme eficiente depozituese të dritës, ai nuk funksionon si
Prochlorococcus në rrezatim tepër të ulët (Moore et al., 1995). Si pasojë nuk gjendet në
thellësinë që zë Prochlorococcus. Rritja cianobakteriale në Mesdhe paraqitet e lidhur
pozitivisht me rrezatimin (Bec et al., 2005; Modigh et al., 1996) dhe rrezatimi mund të
konsiderohet një forcë drejtuese e rëndësishme, që mbështet lulëzimin e Synechococcus.
Gjinia është pa dyshim tolerante ndaj kushteve të dritës me intensitet të lartë (Phlips et
al., 1999).
1.5.2. Lëndët ushqyese (azoti dhe fosfori)
Synechococcus është përgjithësisht më i bollshëm në mjediset e pasura me nutrientë sesa
në oqeanin oligotrofik. Ai zakonisht është larg numrit të madh të Prochlorococcus në
gjithë mjediset ku ato bashkë-ndodhen. Përjashtim nga ky rregull bëjnë zonat përherë të
pasura me lëndë ushqyese, sikurse zonat ngjitëse të ujit dhe zonat bregdetare (Partensky
et al., 1999a). Në zonat e zbrazura nga lëndët ushqyese të oqeanit, Synechococcus është i
pranishëm vetëm në përqëndrime të ulëta duke u shfaqur nga pak qeliza për ml në 4×10³
qeliza/ml (Li, 1995; Olson et al., 1990; Blanchot et al., 1992; Campbell & Vaulot, 1993;
Blanchot & Rodier, 1996).
Ka raportime, që Synechococcus është në gjendje të fiksojë azotin atmosferik (Chow &
Tabita, 1994), një avantazh ky në kushtet e lëndëve ushqyese në sasi të pakët, ku shpesh
mund të gjendet. Ndryshe nga disa lloje të cianobaktereve që fiksojnë N2 nga qeliza të
specializuara të quajtura heterociste, Synechococcus nuk ka specializim të qelizave dhe
shmang interferencën nga oksigjeni, në reaksionet e fiksimit të azotit, duke kryer fiksimin
e N2 natën, kur nivelet e O2 janë më të ulëta dhe drejtohet nga respirimi. Fiksimi i N2
sugjerohet si një faktor që mbështet lulëzimet e Synechococcus (Evans et al., 2006).
Raporti N:P varion nga 19:1 në 24:1 (Webster et al., 2001), çka nënkupton se azoti nuk
është një faktor kufizues pa patur futje të mëdha të fosforit në sistem. Kapaciteti i fiksimit
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
11
të azotit tek Synechococcus nuk ka të ngjarë të ketë ndikim të rëndësishëm në lulëzimin
dhe vazhdimësinë, përjashtuar rastin e lulëzimit të Nodularia, ku shtimi i fosforit e bën
azotin kufizues.
Zakonisht, Synechococcus gjendet në zona me sasi të lartë lëndësh ushqyese, veçanërisht
azot. Eksperimentet tregojnë se shtesat e amoniumit, stimulojnë rritjen e Synechococcus
në popullatat e përziera (Buskey et al., 2003), megjithëse Ning et al. (2000) zbuloi
popullata pikoplanktonike të rritura në praninë e ulët të lëndëve ushqimore.
Synechococcus është gjetur tepër në ujërat eutrofike (Modigh et al., 1996) dhe është
provuar se mund të përdorë komponime azoti të tretura organike (DON), sikurse ureja
(Glibert et al., 2004). Wawrik & Paul (2004) dhe Wawrik et al. (2004) kanë demostruar
qartë rëndësinë e futjes të azotit nga lumenjtë në stimulimin e lulëzimeve të algave
(përshirë Synechococcus) në ujërat bregdetare. Ka të ngjarë, që ngarkesa e lartë e azotit
(DON dhe N inorganik), së bashku me nivelet e larta të lëndëve të tjera sikurse fosfatet,
të kontribojnë në vazhdimësinë e lulëzimeve të Synechococcus.
1.5.3. Temperatura
Temperatura është padyshim një faktor mjaft i rëndësishëm në rritjen e Synechococcus.
Lidhje të rëndësishme midis shkallës së rritjes së Synechococcus dhe biomasës së
akumuluar janë raportuar nga një numër autorësh duke punuar në një mori sistemesh
(Murrell & Lores, 2004; Li, 1991; Agawin et al., 1998; Ning et al., 2000; Bec et al.,
2005). Kjo kombinohet me kapacitetin për tu përballuar me intensitet të lartë të dritës, që
do të thotë se rritja është më e lartë në verë dhe më e ulët në dimër (Agawin et al., 1998;
Modigh et al., 1996; Murrel & Lores, 2004). Rritja optimale e Synechococcus në Mesdhe
paraqitet në ~ 24 oC dhe mungon kur temperaturat e ujit janë < 11
oC (Agawin et al.,
1998). Përqëndrimi i cianobaktereve (dominuar nga Synechococcus) është më i madh kur
temperaturat e ujit janë 28 - 30 oC (Murrel & Lores, 2004). Është provuar se ka një lidhje
të fuqishme midis bio-vëllimit cianobakterial dhe temperaturës, me numër më të vogël
cianobakteresh kur temperatura bie nën ~ 20 oC (Beardall, 2008).
1.5.4. Kripshmëria
Ka raportime se kripshmëria mund të jetë një faktor kontribues në rritjen e
Synechococcus. Në Detin e Zi, ujërat bregdetare me kripësi të ulët (≤ 15 ‰) kanë
densitetin qelizor më të ulët të Synechococcus (Uysal, 2000). Murrell & Lores (2004)
raportuan që përqindja e shtameve Synechococcus të pasura me fikocianinë dhe
fikoeritrinë zvogëlohet ndjeshëm, kur kripshmëria ndryshon nga ~ 20 ‰ në 28 ‰. Perez
& Carrillo (2005) treguan një rënie të popullatave të pikoplanktonit me kripësi të ulët (<
5 ‰) krahasuar me stacionet me kripësinë më të lartë. Në kontrast, Ning et al. (2000)
raportuan lidhje pozitive të dobëta me kripshmërinë në diapazonin 20-30 ‰ dhe
popullatave Synechococcus, sado që ishin të një rëndësie të dytë krahasuar me
temperaturën. Duke pasur parasysh gradientët e kripshmërisë, kripshmëria mund të jetë
një nga nxitësit e gjenezës dhe vazhdimësisë së lulëzimeve të Synechococcus, megjithatë
efekte të tilla mund të jenë dytësore krahasuar me temperaturën. Ka të dhëna se lulëzimet
cianobateriale tregojnë një lidhje pozitive të fortë me temperaturën, por temperaturat e
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
12
larta jo domosdoshmërisht të çojnë në numër të lartë Synechococcus, nëse kripësia është e
ulët (Beardall, 2008).
1.5.5. Kullotat dhe vdekja virale
Kullotat zooplanktonike shfaqin një ndikim të madh në madhësinë e popullatave të
Synechococcus. Efektet e kullotave të zooplanktonit janë demostruar eksperimentalisht
nga Buskey et al. (2003). Presioni i dukshmëm i kullotave tek popullatat e
Synechococcus paraqitet nga Dolan & Simek (1999) dhe Kuosa (1991). Lulëzimi
mendohet se ndodh kur bie kontrolli nga lart-poshtë i herbivorëve (Beardall, 2008).
Synechococcus spp. tregojnë ndryshime të dallueshme gjatë ditë-natës në sasi, me norma
më të larta të ndarjes gjatë muzgut (Dolan & Šimek, 1999; Vaulot & Marie, 1999;
Christaki et al., 2002; Tsai et al., 2009) dhe sasi maksimale gjatë natës (Christaki et al.,
2002; Tsai et al., 2009). Christaki et al. (2002) kanë raportuar se shkalla e gëlltitjes nga
nanoflagjelatët heterotrofë (HNF) ishte më i lartë natën dhe pësonte rënie gjatë ditës. Për
më tepër, shkalla më e lartë e gëlltitjes nga nanoflagjelatët ndodhte pas ndarjes qelizore të
Synechococcus spp. (Dolan & Šimek 1999; Tsai et al., 2009). Këto rezultate janë në
përputhje me kontrollin e Synechococcus spp., nëpërmjet konsumit nga nanoflagjelatët
heterotrofikë dhe / ose të pigmentuar (Tsai et al., 2012).
Një tjetër burim potenciali i vdekjes së cianobaktereve mund të vijë nga viruset (Suttle,
2000). Cianofagët që infektojnë Synechococcus spp. janë shpesh të bollshëm në
përqëndrime, së bashku me bujtarët e tyre të mundshëm (Wang & Chen, 2004), por lizisi
viral i Synechococccus spp. nuk vëzhgohet gjithmonë ose shpeshherë është i ulët
krahasuar me lizin viral të fitoplanktonit eukariotik (Baudoux et al., 2007; 2008). Suttle
(2000) sugjeroi se infektimi viral dhe lizisi i Synechococcus spp. varion gjatë ciklit ditë-
natë, në mënyrë të ngjashme me periodicitetin e vërejtur gjatë gëlltitjes nga protistët. Kjo
mund të ndikojë në përcaktimet e vdekjes të induktuar virale.
1.5.6. Ndikimi i pranisë së metaleve të rënda dhe reagimi i Synechococcus
Cianobakteret janë grupi më i madh dhe më i shumëllojshëm i prokariotëve fotosintetikë.
Habitatet e tyre shtrihen nga mjediset e ujërave të ëmbla dhe detare në ato tokësore. Këto
qeliza kanë zhvilluar metoda natyrore për t’ju përgjigjur pranisë së metaleve si bakri,
plumbi dhe kadmiumi përmes akumulimit pasiv në qeliza, si dhe përmes lidhjes
sipërfaqësore të grupeve të ndryshme funksionale. Është zbuluar se cianobakteret
largojnë metalet e rënda nga mjedisi (Slotton et al., 1989).
Shtamet e Synechocystis spp. kanë zhvilluar një mburojë të trashë kur ekspozohen në
kushte rritjeje të stresuar nga prania e bakrit (Gardea-Torresdey et al., 1996a).
Synechococcus sp. PCC 7942 u zbulua se zotëron një transportues të bakrit të tipit ATP-
azë në membranën tilakoide (Bonilla et al., 1995). Synechococcus cedrorum 1191
paraqitet gjithashtu tolerant ndaj metaleve të rënda dhe pesticideve (Gothalwal & Bisen,
1993). Metale e rënda njihen si interferues në shumë funksione fotosintetike (Clijsters &
Van Assche, 1985; Mohanty & Mohanty, 1988; Murthy & Mohanty, 1991a, b). Ndër
metalet e rënda, që prekin rrjedhën e elektroneve gjatë fotosintezës tek bimët, është
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
13
mërkuri, i cili ndërpret rrjedhën e elektroneve nga fotosistemi (PS) II (Honeycutt &
Krogmann, 1972; Samson & Popovic, 1990), tek plastocianina (Pcy) (Katoh &
Takämiya, 1964), P700, qëndra e reaksionit PSI (Golbeck et al., 1977; Kojima et al.,
1987). Përveç kësaj, rezulton se mërkuri interferon me enzimat si NADP oksidoreduktaza
(Honeycutt & Krogmann, 1972).
Kohët e fundit, u zbulua se mërkuri në përqendrim mjaft të ulët (3 μΜ) pengon
transferimin e energjisë nga fikocianina (PC) tek Chla në qelizat e paprekura të
cianobakterit Spirulina platensis (Murthy et al., 1989; Murthy & Mohanty, 1991a, b).
Ndryshe nga Spirulina, qelizat e paprekura të Synechococcus 6301, kur ekspozohen ndaj
joneve mërkur (II) (Hg2+
) për një kohë të shkurtër (5 min), mbeten rezistente. Prandaj u
hulumtua efekti i këtij metali të rëndë mbi aktivitetet fotokimike të sferoplasteve
Synechococcus. Rezultatet treguan se mërkuri ndikon në transportin e elektroneve tek
cianobakteri. Vendi i inhibimit varet nga përqëndrimi i këtij joni (Murthy & Mohanty
1993). Cianobakteri Synechococcus sp. PCC 7942 është një prokariot fotosintetik
njëqelizor, që u nënshtrohet shumë streseve mjedisore (Webb & Sherman, 1994). Ai u
përgjigjet ndryshimeve të temperaturës, intensitetit të dritës dhe ekspozimit ndaj metaleve
të rënda përmes induktimit të sintezës së proteinës së stresit GroEL dhe proteinave
lidhëse të metaleve metalotioneinave (metallothionein). Këto proteina veprojnë së bashku
për të zvogëluar ose eliminuar dëmtimin qelizor (Ybarra & Webb, 1999).
Të gjithë organizmat duhet të kenë mekanizma, që rregullojnë akumulimin e joneve të
metaleve duke shmangur toksicitetin. Këto përfshijnë jo vetëm rezistencën ndaj metaleve,
që janë gjithmonë toksike për qelizën, si kadmiumi dhe mërkuri, por edhe rezistencën
ndaj metaleve si bakri, hekuri, zinku, që janë toksike në përqëndrime të larta, por që i
shërbejnë qelizës në përqëndrime shumë të vogla (Silver & Wauderhaug, 1992).
Ndër mekanizmat e rezistencës përmendim si vijon: qelizat mund të sintetizojnë dhe
lirojnë komponime organike si kelate me metalet (komponime komplekse) për të
reduktuar biovlefshmërinë e tyre (Clarke, 1987), ose jonet e metaleve mund të lidhen me
sipërfaqen e jashtme të qelizës. Këto forma komplekse, përgjithësisht transportohen
brënda qelizës me vështirësi. Së dyti, qelizat mund të rritin shkallën e ekskretimit të
joneve të metalit duke përdorur pompat jonike. Një metodë e tretë e rezistencës është
përmes sekuestrimit të brendshëm të metaleve. Ky është një nga mekanizmat më të
rëndësishme me anë të të cilave bakteret luftojnë ekspozimin ndaj metaleve të rënda. Në
cianobakteret prokariotike sekuestrimi i joneve të metaleve brënda qelizës kryhet nga
metallotioneinat e klasës II (Ybarra & Webb, 1998).
Në shumicën e rasteve, bakri gjendet si hidrate në ujin e detit (van den Berg et al., 1987;
Coale & Bruland, 1990; Moffett et al., 1990; Donat & van den Berg 1992; Moffett, 1995;
Kozelka & Bruland, 1998; Tang et al., 2001). Kjo është e rëndësishme, sepse toksiciteti i
bakrit është në funksion të Cu2+
të lirë dhe jo të bakrit total (Sunda & Guillard, 1976;
Anderson & Morel, 1978).
Për shkak të kompleksitetit organik, përqëndrimet e Cu2+
janë në përgjithësi poshtë 1 pM
si në det të hapur dhe në ujërat bregdetare të pandotura, edhe pse përqëndrimi total i
bakrit mund të jetë në një shkallë më të lartë në afërsi të bregdetit (Moffett et al., 1997;
Kozelka & Bruland, 1998; Tang et al., 2001). Kjo ndihmon në shpjegimin e mungesës së
ndjeshmërisë së ndryshme ndaj bakrit mes kloneve të izoluara në ujërat oqeanike dhe
atyre bregdetare (Brand et al., 1986). Në studimin e Mann et al. (2002) raportohet se
shkalla e ndarjes qelizore të Prochlorococcus ka më shumë gjasa të ndikohet nga
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
14
përqëndrimi i Cu2+
sesa tek Synechococcus, të dyja të gjetura në Detin e Sargaseve.
Kështu, sasitë në pikomole të Cu2+
mund të jenë një faktor i rëndësishëm në rregullimin e
sasisë së këtyre cianobaktereve në Detin e Sargaseve. Megjithëse, të gjitha shtamet e
Prochlorococcus paraqiten më të ndjeshëm ndaj bakrit se Synechococcus, anëtarët e
degës të përshtatur në ndriçim të lartë ishin më rezistentë sesa anëtarët e degës të
përshtatur në ndriçim të ulët. Rezultatet e eksperimenteve në terren, ku bakri shtohet në
komunitetet natyrore të cianobaktereve në përqëndrime të ndryshme, ishin në përputhje
me ndjeshmëritë e ndryshme ndaj bakrit në shtamet izoluara në natyrë. U hodh hipoteza,
se në kushtet e ujërave sipërfaqësore në kolonën e ujit shtresëzohen ekotipet bakër-
rezistente e të përshtatura në ndriçim të lartë, të ekotipeve të Prochlorococcus. Edhe pse
qelizat janë rezistente ndaj toksicitetit të bakrit, sasia e Prochlorococcus në shtresa të
cekëta, të përziera është e ulët. Kjo mund të jetë për shkak të shkallës së ndarjes qelizore
në prani të përqëndrimit të lartë të Cu2+
si dhe ndriçimit të lartë.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
15
II. KARAKTERISTIKA TË PËRGJITHSHME MJEDISORE TË GJIRIT TË
DURRËSIT
2.1. Karakteristika të përgjithshme fiziko-gjeografike, klimatike, gjeomorfologjike
dhe mjedisore të Gjirit të Durrësit
2.1.1. Vështrim i përgjithshëm fiziko-gjeografik i Gjirit të Durrësit
Gjiri i Durrësit, ndodhet ndërmjet Kepit të Selitës (Lagjit) në jug, dhe Kepit të Durrësit, i
pozicionuar 20 km larg njëri-tjetrit. Gjiri ka një shtrirje në lindje prej 7 km nga vija që
bashkon të dy kepet. Të dy kepet kanë reliev kodrinor. Kodrat më të larta janë Kalaja e
Turrës (106 m mbi nivelin e detit) dhe ajo e Karpenit (147 m mbi nivelin e detit). Si pikë
orientuese për të hyrë në Gjirin e Durrësit, është vargu kodrinor i këtij qyteti. Në jug të
kodrave, është Kepi i Durrësit (fanari 116.2 m) dhe “Kodra e Vilës”, dhe në lindje të
Durrësit është “Shkëmbi i Kavajës” (102 m), që gjendet rreth 7 km në juglindje të kepit
(Fig. 2.1) (Wilbur Smith Associates, 2003; Bi-Drilling Shpk., 2008; Arkivi i Autoritetit
Portual Durrës; http://www.apdurres.com.al).
Figura 2.1. Hartë që tregon pozicionin gjeografik të Gjirit të Durrësit midis Kepit të Lagjit dhe
Kepit të Durrësit dhe afërsia me Gjirin e Lalzit (modifikuar nga http://aca.al/wp-
content/uploads/2012/04/Albania-map.jpg).
Gjiri i Durrësit është një nga gjiret më të rëndësishme të vendit tonë. Ka një sipërfaqe
rreth 80 km2 dhe një thellësi maksimale që arrin 190-200 m. Qyteti i Durrësit ndodhet në
veri-lindje të gjirit. Në Gjirin e Durrësit derdhin ujërat e tyre të përhershme përroi i
Darçit, i Lishatit dhe ai i Agait, të cilët krahas ujit të ëmbël në sasi relativisht të vogël të
mbledhur nga kodrat përreth, depozitojnë në vijën bregdetare dhe cektinën e gjirit,
materiale të shkrifëta dhe mbetje organike. Në hyrje të Gjirit, thellësia është rreth 11 - 12
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
16
m. Izobatet 5 m kalojnë përmes gjirit, ndërsa izobati 10 m lidh të dy kepat dhe përbën
kufizimin perëndimor të Gjirit të Durrësit. Pas këtij izobati, thellësia rritet në drejtim të
detit, dhe izobati 20 m shkon paralel me atë 10 m dhe gati 1.8 milje larg. Izobati 50 m
është vetëm 2.7 milje larg atij 10 m, kurse izobatet 100 m shkojnë 28 milje larg vijës së
bregut. Në jug të zonës së Gjirit, 4 milje nga Kepi i Selitës, ndodhet “cektina e Selitës”
dhe në jug të Kepit të Durrësit, ndodhet “cektina e Talbotit”, e cila paraqet vazhdimin
jugor në det të Kepit të Durrësit (Fig. 2.1) (Wilbur Smith Associates, 2003; Bi-Drilling
Shpk, 2008; Arkivi i Autoritetit Portual Durrës; Pano et al., 1984;
http://www.apdurres.com.al).
2.1.2. Porti Detar i Durrësit
Porti i Durrësit është i pozicionuar në pjesën jug-perëndimore të qytetit të Durrësit, në
pjesën veriore të gjirit me të njëjtin emër, përgjatë vijës bregdetare me shtrirje 1.4 km, me
një sipërfaqe tokësore prej rreth 650’000 m2, sipërfaqe ujore 670’000 m
2, gjatësi kalate
2’275 m dhe thellësi kalate 7.3 -11.5 m. Gjiri i Durrësit është i mbrojtur mirë nga erërat
veri-perëndimore nga Gjiri i Lalzit si dhe nga erërat lindore dhe jug-lindore që vijnë nga
toka. Porti i Durrësit është i mbrojtur gjithashtu nga lindja dhe perëndimi nga
dallgëthyesit. Porti është i vendosur në lindje të Kepit të Durrësit, i cili siguron strehë nga
lindja deri në veri-perëndim dhe dallgëpritësi kryesor, i cili është ndërtuar në drejtimin
jug-lindor e shtyn atë strehë deri në jug (Wilbur Smith Associates, 2003; Bi-Drilling
Shpk, 2008; Arkivi i Autoritetit Portual Durrës; http://www.apdurres.com.al).
Figura 2.2. Porti Detar i Durrësit (www.updurres.com.al)
Porti mbrohet nga valëzimi prej dy moleve: moli lindor, që është ndërtuar me gurë të
hedhur në gjatësi prej 549 m me drejtim jug-perëndim dhe moli jugor, që është ndërtuar
me blloqe çimentoje me gjatësi 915 m, që shtrihet në drejtim juglindor dhe lindor. Erërat
që fryjnë janë jug, jug-perëndimore, veri dhe veri-perëndimore me shpejtësi 60 - 110
km/orë. Gjiri siguron një ankorim të sigurtë për anijet, që presin të përpunohen në port.
Pozicioni shumë i favorshëm gjeografik e bën Portin e Durrësit portin më të madh në
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
17
Shqipëri dhe ndër më të mëdhenjtë në detet Adriatik dhe Jon, dhe një nyje shumë të
rëndësishme për tregun ndërkombëtar. Porti i Durrësit, është një nga portet më të vjetra të
Europës në detin Adriatik dhe një nga kryeurat ballkanike të komunikimit të perëndimit
me lindjen dhe anasjelltas. Infrastruktura operacionale e tij përbëhet nga 11 kalata me një
thellësi kalate që varion nga 7.5 m - 11.5 m. Mallrat kryesore që përpunohen në port janë
mallrat e përgjithshme sikurse drithëra, kontenierë, minerale, etj. Porti i Durrësit mbulon
aktualisht 78 % të tregtisë detare në nivel kombëtar. Ai është gjithashtu një vendndodhje
kyçe për rrjetet e trageteve dhe tranzitin e pasagjerëve, duke i dhënë Durrësit një pozicion
strategjik në lidhje me Korridorin VIII, që do të lehtësojë tranzitin e pasagjerëve dhe
mallrave për në kontinentin europian. Kostoja e ulët operative, grupi i motivuar
menaxhues dhe shërbimet cilësore janë disa nga vlerat, që karakterizojnë Portin e
Durrësit (Wilbur Smith Associates, 2003; Bi-Drilling Shpk, 2008; Arkivi i Autoritetit
Portual Durrës; Pano et al., 1984; http://www.apdurres.com.al).
2.1.3. Karakteristikat klimatike dhe hidrodinamike të Gjirit të Durrësit
Zona klimatike e Gjirit të Durrësit i përket zonës klimatike mesdhetare. Muajt e verës
janë të thatë dhe të nxehtë dhe muajt e dimrit të lagësht dhe të ftohtë. Periudha e
lagështirës është ajo e vjeshtës së vonë dhe dimrit. Shpejtësia maksimale e vrojtuar e erës
është 40 ms-1
dhe drejtimi dominues i erërave të forta është ai jugor dhe jugperëndimor.
Ndryshimet e nivelit të detit të krijuara nga akitiviteti i rrymave detare dhe baticë-
zbaticës, erërave, etj., janë të çrregullta. Ndikimi i erërave të fuqishme, veçanërisht nga
jugu, rezulton në luhatje të mëdha amplitude të nivelit të ujit. Niveli i detit është 92 cm
mbi nivelin zero të oqeanit botëror, ndërsa ai më i ulët është – 48 cm. Amplituda e këtyre
ndryshimeve është 140 cm. Mesatarja e nivelit të detit në Gjirin e Durrësit, është 12 cm
mbi nivelin zero të detit. Batica ka një periudhë prej 12 orësh dhe është e çrregullt.
Procesi i baticës përgjatë brigjeve shqiptare është mjaft i dobët dhe luhatja ditore në
amplitudë e nivelit të ujit lëviz mesatarisht rreth 30 cm. Lartësia më e madhe e valëve
është 1.25 - 2 m. Valët që vërehen përgjatë brigjeve të detit Adriatik, formohen në det të
hapur. Këto valë shpërndahen në të gjitha drejtimet dhe vijnë në brigjet shqiptare të
deformuara nga ndikimet e batimetrisë së fund detit dhe morfologjisë së brigjeve. Rrymat
përgjatë bregut shqiptar gjenerohen nga gradienti i forcave, dukuria tidal dhe valët. Është
treguar se në Plazhin e Durrësit, rrymat janë të paqëndrueshme përsa i përket drejtimit
dhe madhësisë. Shpejtësia e rrymave të matura nuk e kalon vlerën 0.25 ms-1
dhe drejtimi
dominues është veriperëndimi.
Temperatura mesatare vjetore e ujërave sipërfaqësore është 17.8 ºC. Temperatura më e
lartë e ujit në Gjirin e Durrësit është në Korrik dhe Gusht dhe arrin afërsisht 25 ºC në
sipërfaqe dhe 15 ºC në thellësinë 70 m. Temperaturat minimale janë ndeshur në Shkurt
me rreth 10 - 11 ºC në sipërfaqe. Ulja e temperaturave të ujit me rritjen e thellësisë, është
më aktive në pjesën veriore. Kripshmëria mesatare vjetore e ujërave sipërfaqësore është
37.5 ‰. Mesatarja e kripshmërisë së ujit shkon nga 35.8 ‰ - 38.22 ‰. Kripshmëria më e
ulët është matur në Janar (rreth 35.30 ‰). Studimet kanë zbuluar se kripshmëria rritet në
raport me thellësinë e detit. Në periudhën e verës, në thellësinë 10 m, kripshmëria varion
nga 38 - 38.5 ‰ (OSI, 2002; Bi-Drilling Shpk, 2008; Pano et al., 1984; Wilbur Smith
Associates, 2003; http://www.apdurres.com.al).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
18
2.1.4. Morfologjia e steresë dhe e fund-detit të Gjirit të Durrësit
Proçeset dhe tiparet gjeomorfologjike në Gjirin e Durrësit, janë të veçanta në krahasim
me sektorë të tjerë të bregdetit Adriatik. Ato kushtëzohen nga fenomenet klimatike,
dinamika e valëve dhe aktiviteti i rrymave, struktura gjeologjike, lëvizjet e sedimenteve,
fiziogjeografia e gjirit, etj. Nga pikëpamja e moshës gjeologjike të formimit, Gjiri i
Durrësit është i ri dhe i përket zhvillimeve më të vonshme Holocenike. Krijimi i tij fillon
me rritjen e nivelit të tokës gjatë kësaj periudhe, aktivitet që vazhdon edhe sot në
modelimin e gjithë vijës bregdetare akumuluese të bregdetit Adriatik dhe të vetë Gjirit të
Durrësit. Por zhvillime të rëndësishme gjeologjike, ndodhën në periudhën post
akullnajore të Wurm -it, nga shkrirjet e akullit në Europën Veriore dhe në Kanada, për
më shumë se 12000 vjet më parë. Kjo është faza e parë e evoluimit bregdetar të Gjirit të
Durrësit. Faza e dytë fillon në fund të kësaj periudhe, 6000 vjet më parë. Sedimentet e
ardhura nga lumenjtë, përfshirë edhe lumin Genus (Shkumbini i sotëm), filluan të
depozitoheshin në breg dhe në brendësi të gjirit. Ky është fenomeni kryesor karakteristik
i kësaj periudhe. Faza e tretë i perket ditëve tona, ku dinamika e bregut po ndryshohet më
shumë nga dukuritë sekondare.
Gjiri i Durrësit është rreth 18 km i gjatë nga veriu në jug, me një vijë bregdetare për rreth
7 km drejt lindjes, me gjerësinë maksimale të tij në zonën e plazhit të Golemit. Në këtë
gji dallohen qartë dy lloje bregdeti, ai i ulët, ku mbizotërojnë proçeset e akumulimit, dhe
bregdeti i lartë, me mbizotërim të proçeseve gërryese. I pari, përfshin gjithë vijën
bregdetare, nga Ura e Dajlanit deri në Karpen, ndërsa proçeset e gërryerjes zhvillohen
kryesisht në sektorët e ngritur të Karpen - Kepi i Lagjit dhe atij në perëndim të portit,
drejt zonës së Currilave. Prania e tektonikës gjatësore dhe tërthore, shkarjet, faktori
litologjik (zhveshja në sipërfaqe e bërthamës argjilore të antiklinalit të Kryevidh -
Durrës), derdhja e hershme e lumit Shkumbin në Gjirin e Durrësit, veprimtaria e valëve të
detit, etj., përbëjnë faktorët dominues në formimin dhe evolimin e vijës bregdetare të
kësaj hapësire. Në bregdetin e ulët, format morfologjike më të spikatura janë hapësirat
plazhore, dunat ranore dhe më pak marsh-et. Në gjysmën veriore të gjirit, nga përroi i
Leshnicës e deri në Durrës, për më se një shekull ka mbizotërar gjëndja e ekuilibrit, ku
valët e detit dobësohen shumë dhe lënë aty materialin e mbartur nga kepat. Në bregdetin
e lartë relievi ngrihet deri në nivele të 100 - 150 m, deri 187 m, në veri të zonës së
Curilave, që shënon edhe lartësinë më të madhe të këtij vargu kreshtor, që është i
ndërtuar nga shkëmbenj ranoro-konglomeratik me fortësi shumë më të lartë se
shkëmbenjtë e tjerë shtrirë poshtë dhe sipër tyre. Kjo kreshtë diferencon dukshëm relievin
e steresë të kodrave të Durrësit dhe formon dy relieve krejt të ndryshme nga ana
morfologjike, në lindje dhe perëndim të saj. Balli i kreshtës në anën perëndimore, zgjatet
paralel me vijën bregdetare gati meridionalisht, në formën e një rrypi të ngushtë prej rreth
300 m. Ai paraqitet shumë më i aksidentuar se shpina e kreshtës në anën lindore dhe
është nën veprimin e aksionit detar. Nën këtë veprimtari bregdetare formohen përgjatë tij
mjaft forma, herë të formës së gjireve të vegjël ranor mjaft piktoresk, herë të bregdetit të
lartë 10-20 m, abraziv ku zhvillohen faleza, tarraca abrazive, shembje, shkarje dhe
rrëzime nga sipër të blloqeve konglomeratike, që vende - vende kapin hapësira detare
dhjetra metra në formën e “batllave”. Në zonën e Currilave, kjo kreshtë ranore-
konglomeratike zbret gradualisht nga lartësia 178.2 m për të përvijuar nën ujërat e detit
edhe për 3 - 4 km dhe formon “cektinën” e Currilave, një tarracë abrazive e “varrosur” në
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
19
perëndim të portit. Në lindje të saj, trashësia e shkëmbinjve argjilorë të dobët ndaj
errozionit, ul ndjeshëm relievin dhe vetëm kalimi në shkëmbinj alevrolito-ranorë, që janë
me qëndrueshmëri më të lartë, kanë kushtëzuar një reliev pak më të ngritur, që
pasqyrohet në kodrën e Vilës (rreth 85 m) dhe të Farit (116.2 m). Relievi zbret
gradualisht drejt qytetit nën kënde 12 – 15o, për tu njehsuar me fushën më në lindje.
Njehsimi me fushën në lindje dhe me sheshin “Taulantia” dhe detin në drejtim të jugut,
lidhen me shkaqe tektonike. Në zonën e Kryevidhit është modeluar një reliev mjaft i
aksidentuar nga zhveshja, errozioni torrencial dhe rrëshkitjet e shumta që e bëjnë atë
mjaft të veçantë nga ana morfologjike, ndërsa në atë të Currilave e më në veri, rrëshkitjet
kanë arritur deri në afërsi të kreshtës (Bi-Drilling Shpk, 2008; Arkivi i Autoritetit Portual
Durrës).
2.1.5. Komunitetet biologjike të Gjirit të Durrësit përfshirë dhe basenin e Portit
Detar të Durrësit
Sipas studimeve të kryera në kuadrin e studimit “Vlerësimi i ndikimit në mjedis i
gërmimit emergjent të Portit të Durrësit” (Wilbur Smith Associates, 2003), në hapësirat
detare të Gjirit të Durrësit, përfshirë edhe zonën e kanalit hyrës dhe vetë akuariumin
(basenin), është dokumentuar prania e katër komuniteteve biologjike: fitoplanktoni,
zooplanktoni, peshqit dhe fauna e fundit të detit. Vendi që zë Porti i Durrësit në raport me
gjirin e tij, paraqet një zonë shumë të rëndësishme duke krijuar vende të veçanta midis
bregut dhe ujërave mesdhetare të Adriatikut. Gjallesat që jetojnë këtu janë ngushtësisht të
lidhura me cilësitë e veçanta të ujërave. Shumëllojshmëria në specie fitoplanktonike ishte më e lartë në zonën e kanalit dhe në atë
bregdetare, sesa në basenin e portit. Sipas rezultateve, mbizotëronin speciet e diatomeve,
kryesisht gjinia Chaetoceros, Nitzschia dhe Rhizosolenia dhe nga ana e peridinëve, specia
Ceratium. Në zonën e basenit larmia e specieve rezultoi e ulët dhe aty u gjetën me
shumicë alga blu të gjelbra (Cyanophyceae) me gjinitë Oscillatoria dhe specie të
papërcaktuara, që tregojnë për një mjedis me ndotje të qëndrueshme. Sipas këtij studimi,
bie në sy varfëria në lloje në ujërat e territorit të akuariumit detar. Varfëria deri në
mungesë e gjallesave në këtë territor, lidhet padyshim me shkallën e lartë të ndotjes apo
papërshtatshmërisë së mbijetesës të gjallesave në mjedisin detar të Portit të Durrësit.
Gjithashtu, prania e Eutreptia lanowii Steur nga klasa e Euglenophyceae, forcon
konkluzionin për praninë e ujërave të ndotura dhe të eutrofizuara në këtë mjedis. Fundi i
basenit të portit ishte pa bimësi (Wilbur Smith Associates, 2003).
Për sa i përket zooplanktonit, ky studim ka evidentuar 23 taksone Copepoda, naupliuse
dhe stade copepodite; Harpacticoida ind.; larva trochophora dhe Polycete të grupit
Annellides; larva të Lamelibranchia dhe të grupit Mollusca. Naupliuset dhe stadet
kopepodite paraqiten të bollshme në det të hapur dhe bregdet, kurse zona e brendshme të
portit ishte e populluar nga një numër më i ulët i fazave të ciklit jetësor të llojeve
zooplanktonike. Gjithashtu, grupet Annellides (trochophora dhe Polychaeta) dhe
Mollusca (Bivalva dhe stadet larvare të grupit Gasteropoda), që në një pjesë të stadeve të
jetës e kalojnë në forma meroplanktonike si përbërës të zooplanktonit, paraqiten kryesisht
në rajonin e portit, çka tregon për nivel të lartë trofik të ujërave të basenit.
Përsa i përket studimit të zoobentosit, studimi u bazua në popullatat e bivalvëve,
gastropodëve (Mollusca), poliketëve (Annelides) dhe krustaceve (Crustacea), të cilët janë
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
20
përfaqësuesit kryesorë të komuniteteve makrozoobentonike. Rezultatet e këtij studimi
treguan se baseni i portit dhe kanalit hyrës në krahasim me zonat e tjera, karakterizohen
nga mungesa e zoobentosit. Sipas Wilbur Smith Associates (2003), kjo situatë ka shumë
të ngjarë të jetë rezultat i ndotjes së basenit me karburante, mbetje, etj., gjatë
operacioneve portuale. Thellësia relativisht e cekët e basenit të portit mund të jetë një
faktor i dytë përgjegjës për mungesën e zoobentosit. Mungesa e zoobentosit mund të vijë
edhe si rezultat i lëvizjes së anijeve të mëdha, që ndikojnë në turbullimin e ujërave të
fund-detit dhe shqetësimin e vazhdueshëm të këtyre organizmave bentonike.
Ky studim thekson se struktura e komunitetit të peshqve është mjaft e larmishme, por
mbetet problem gjuetia e jashtëligjshme dhe pa kritere. Sidomos në kohë me det të
trazuar ushtrojnë aktivitetin shumë anije me gjueti fundore duke sjellë pasoja në
ripërtëritjen e gjeneratave, pasi zihet një sasi e madhe peshqish të vegjël, nën madhësinë e
krijuar, kryesisht barbunë të vegjël (Mullidae), spalca të vogla (Sparidae).
Vlerësohet se Gjiri i Durrësit është një nga zonat më të mira për ruajtjen, strehimin dhe
ripërtëritjen e breznive, si dhe të peshqve me rëndësi ekonomike dhe llojet e rralla.
Izobatet 20 m me fund ranor dhe baltor me zhvillim të dendur të biomasës, kryesisht të
Posedonia-ve, krijojnë vend ideal për peshqit kryesisht të të vegjëlve (rekrutëve), por një
nga arsyet kryesore të pakësimit të rezervave të peshqve fundorë është gjuetia pa kriter e
zhvilluar në thellësi mjaft të vogla (20 - 50 m) të palejueshme për këto lloje peshqish. Kjo
ka çuar në dëmtimin e rezervave të rekrutëve të peshqve fundorë. Mosrespektimi i pikut
të shtimit në muajt Korrik-Gusht, kur në këtë periudhë vazhdon të gjuhet, e dëmton
brezin e ri. Disproporcioni midis anijeve, që kryejnë gjueti fundore dhe pelagjike, bën që
rezervat e pelagjikëve të mos shfrytëzohen; sepse shumë pak anije kryejnë këtë gjueti,
ndërsa ato të peshqve fundorë të kalojnë limitet e lejuara (Raport për Gjendjen e Mjedisit,
2011; Wilbur Smith Associates, 2003; Arkivi i Autoritetit Portual Durrës).
Për sa i përket basenit të portit, predominojnë llojet e familjes detritofage Mugilidae si:
Liza ramada, Liza salines, Mugis cephalus, që janë tipike për zonat eutrofike. Sparidet
dhe peshqit pelagjikë në zonën e portit lejojnë migrime më shumë në funksion të
kushteve të vështira atmosferike (Wilbur Smith Associates, 2003; Bi-Drilling Shpk,
2008; Arkivi i Autoritetit Portual Durrës).
2.1.6. Zhvillimet aktuale në bregdetin e Gjirit të Durrësit
Në gjithë segmentin harkor të Gjirit të Durrësit, pothuajse nuk gjen pjesë të tij që këto dy
dekadat e fundit të mos jetë ndjerë veprimtaria njerëzore. Padyshim, ndërtimet kanë qenë
predominuese dhe zhvillimi i turizmit dhe hotelerisë ka marrë përmasa të mëdha. Por
vende-vende, zona bregdetare është cënuar edhe nga veprimtaria shkatërruese, pasojë e
shfrytëzimit të inerteve ranore, prerjet e kurorës së gjelbër përgjatë bregdetit etj.
Urbanizimi i sektorit të plazhit të Durrësit, nga Ura e Dajlanit deri tek “blloku”, jo vetëm
që është bërë pa një plan urbanistik të studiuar dhe parapërgatitur, por ka cënuar edhe
brezin ranor. Pontile të ndërtuara pa asnjë kriter shkencor, dhe për më tepër të mbushur
me materiale inerte dhe mbeturina të ndryshme, si te“Iliria”, “Apollonia” dhe shëtitorja
“Taulantia”, jo vetëm që cënojnë estetikën e mjedisit. E njëjta praktikë urbanizimi ka
ndodhur edhe në sektorin e Shkëmbit të Kavajës dhe Golemit, ku veç dëmtimit në masë
të kurorës halore bregdetare, shfrytëzimi i brezit ranor nga ndërtimet dhe marrja e
materialit inert për ndërtim, janë edhe më të ndjeshme (Bi-Drilling Shpk, 2008).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
21
Më në jug, tej Malit të Robit, dhe deri në Karpen, zhvillimet janë sporadike, edhe për
shkak të mungesës së infrastrukturës, sidomos asaj paralele, por edhe të natyrës tip
“marsh” që ka ky sektor. Segmenti përtej Kryevidhit dhe në jug të Kepit të Lagjit deri te
“Plazhi i Gjeneralit”, ka mbetur ende i paprekur, por përbën rrezik të pësojë fatin e pjesës
tjetër të Gjirit të Durrësit (Bi-Drilling Shpk, 2008).
Ndotjet e ujërave të gjirit nga prurjet e ujërave të zeza të ujëmbledhësit të Shkallnur-
Arapaj dhe shkarkimit e tyre në zonën e Kavaleshencë-Shkëmbi Kavajës, shkarkimet e
pakontrolluara të ujërave të zeza në segmentin Port-Currila dhe hedhja e mbeturinave
urbane përgjatë bregdetit, përbëjnë aspektin më negativ mjedisor dhe me pasoja për
shëndetin e pushuesve.
Megjithatë gjatë 3-4 vitet e fundit ndotja mikrobiologjike e ujërave të plazhve është
përmirësuar dukshëm (Raport për Gjendjen e Mjedisit, 2011). Masat e marra nga
autoritetet vendore për pastrimin e plehrave, gjobitja e bizneseve që derdhin ujëra të
ndotura përgjatë bregdetit dhe inerte përgjatë bregut, ndërgjegjësimi i popullatës ka sjellë
ndikim e saj pozitiv. Gjithashtu vënia në funksionim e impiantit të përpunimit të ujërave
të zeza në Shën-Vlash, pritet të sjellë ndikim pozitiv në plazhin e Durrësit, megjithëse
mbetet ende shumë punë për përmirësimin e gjendjes mjedisore të Gjirit të Durrësit.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
22
III. METODA TË PËRDORURA PËR EVIDENTIMIN E PRANISË SË
SYNECHOCOCCUS DHE PROCHLOROCOCCUS NË MJEDISET UJORE
3.1. Identifikimi dhe karakterizimi i popullatave mikrobike duke përdorur flow
cytometrinë
Ndër vite, përcaktimet sasiore të komuniteteve bakteriale ujore, janë kryer me anë të
mikroskopisë me epifluoreshencë DAPI ose ngjyrosjes së mostrave me akridinë
portokalli (acridine orange) (Hobbie et al., 1977; Porter & Feig, 1980).
Në vitet 90, u përdor për herë të parë në oqeanografi flow cytometria (Darzynkiewicz &
Crissman, 1990; Allman et al., 1993; Fouchet et al., 1993; Troussellier et al., 1993;
Davey & Kell, 1996; Porter et al., 1997; Collier & Campbell, 1999). Kjo rezultoi, në
zbulimin e disa grupeve bakteriale bazuar në sasitë respektive të ADN-ve të evidentuara
falë fluoreshencës (Li et al., 1995; Marie et al.,1997): grupet me përmbajtje të lartë të
acideve nukleike shfaqnin sasi të lartë fluoreshence (HNA) dhe grupet me përmbajtje të
ulët të acideve nukleike sasi të ulët fluoreshence (LNA) (Gasol & Morán, 1999; Gasol et
al., 1999).
Për shkak të fluoreshencës endogjene (fotopigmenteve fluoreshente) dhe asaj ekzogjene
(ngjyrimi i ADN-së) është e mundur të dallohen qelizat e pikoplanktonit nga grimcat e
tjera në kolonën e ujit. Bakteret heterotrofe të ngjyrosura mund të dallohen nga grimcat e
tjera jo-bakteriale dhe për më tepër mund të zbulohen edhe nënpopullatat brenda një
grupi bakterial heterotrofe (Fig. 3.1, A). Qelizat pikoplanktonike autotrofe përmbajnë
pigmente të shumta, por klorofila a është përbërësi kryesor dhe burimi i vetëm i
fluoreshencës të kuqe. Kjo e fundit është faktori i përdorur për të diferencuar qelizat
autotrofe nga grimcat e tjera, kështu që qelizat bakteriale heterotrofike mund të dallohen
lehtë nga qelizat autotrofe në një paraqitje të fluoreshencës së gjelbër kundrejt të kuqes.
Më tej, fluoreshenca portokalli mund të përdoret për të zbuluar fotopigmentin e dytë
fluoreshent të rëndësishëm, fikoeritrinën. Fikoeritrina është tipike në Synechococcus spp.
dhe disa pikoeukariotë, kështu që Synechococcus, Prochlorococcus dhe pikoeukariotët
mund të dallohen në një paraqitje të fluoreshencës portokalli kundrejt të kuqes (Fig. 3.1,
B) (Šantić & Krstulović, 2012).
Flow cytometria redukton ndjeshëm kohën e nevojshme për këto përcaktime (analiza
multiparametrike e qelizave individuale); rrit nivelin e zbërthimit dhe siguron njohuri të
reja mbi strukturën dhe funksionimin e komuniteteve planktonike, që thjesht nuk mund të
merren me anë të mikroskopisë epifluoreshente tradicionale (Li et al.,1995; Marie et
al.,1996; Marie et al., 1997). Flow cytometria përdoret rutinë për analizën e mostrave
detare dhe tani është pranuar përgjithësisht si një teknikë referuese në oqeanografi për
analizimin e komuniteteve bakteriale (Monger & Landry, 1993).
Studimet e komunitetit prokariotik, në pjesën lindore të Detit Adriatik, me anë të kësaj
metode, kanë filluar në vitin 2003 (Šantić & Krstulović, 2012), për numërimin e
drejtpërdrejtë të bakterioplanktonit (Šantić et al., 2007).
Gjithashtu, flow cytometria u përdor për hulumtimin dhe karakterizimin e komunitetit
prokariotik heterotrofik (Šolić et al., 2008; Šolić et al., 2009; Šolić et al., 2010) dhe atij
autotrofik (Vilibić & Šantić, 2008; Šantić et al., 2011).
Komuniteti pikoplanktonik autotrofik, përfshirë Prochlorococcus dhe pikoeukariotët e
Adriatikut, u përshkruan për herë të parë nga Radić et al. (2009).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
23
Figura 3.1. A) Citograma dy-parametrike e prokariotëve heterotrofe; B) Citograma dy-
parametrike e prokariotëve autotrofe (Šantić & Krstulović, 2012).
3.2. Vlerësimi i shkallës së rritjes së shtameve të Synechococcus detar përmes
përmbajtjes sasiore të biomolekulave
Synechococcus spp. janë komponentë të kudogjendur dhe të bollshëm të pikoplanktonit
fotosintetik në një zonë të gjerë mjedisesh detare (Waterbury et al., 1986). Këto
cianobaktere njëqelizore dhe të afërmit e tyre Prochlorococcus spp., mund të përbëjnë një
pjesë të madhe të biomasës fotosintetike dhe të prodhimtarisë parësore, veçanërisht në
detet e hapura (Stockner & Antia, 1986; Weisse, 1993). Matja e shkallës së rritjes të
këtyre organizmave dhe e popullatave mikrobike natyrore në përgjithësi, mbeten një sfidë
e madhe për ekologët.
Për matjen e shkallës natyrore të rritjes mikrobike, ndër të tjera përdoren “treguesit”
biokimikë, që korrelojnë me shkallën e rritjes dhe mund të matin popullatën që na
intereson (Furnas, 1990). Dobia e kësaj qasjeje biokimike, do të varet nga forca e
korrelimit me shkallën e rritjes dhe nga lehtësia me të cilin mund të matet indeksi në
popullatën e interesit. Në një studim, u ekzaminua lidhja midis përmbajtjes së rARN-së
dhe shkallës së rritjes në shtamin detar Synechococcus WH8101. Qëllimi i studimit, ishte
të provohej natyra e përgjithshme e kësaj lidhjeje tek cianobakteret, krahasuar me
bakteret heterotrofike të studiuara më mirë, dhe të vlerësohej mundësia e përdorimit të
përmbajtjes së rARN-së si një tregues për shkallën e rritjes të këtij grupi të rëndësishëm
të pikoplanktonit fotosintetik (Brian & Liu, 1998).
Lidhja midis përbërjes makromolekulare të plotë (p.sh. ARN-së, ADN-së dhe përmbajtja
e proteinave) dhe shkallës së rritjes në Escherichia coli si dhe baktereve të tjera enterike
është e njohur mirë (Bremer & Dennis, 1996; Ingraham et al., 1983). Fakti, që lidhja
midis përbërjes molekulare (p.sh. ARN-së, ADN-së dhe proteinave) dhe shkallës së
rritjes së cianobaktereve mund të përshkruhen në terma të thjeshtë matematikorë dhe
shfaqen të jenë të pavarur nga faktorët mjedisorë specifikë, që përcaktojnë shkallën e
rritjes, mbështet idenë e përdorimit të përbërjes biokimike të plotë për të vlerësuar në
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
24
vend shkallën e rritjes të popullatave mikrobike natyrore (Dortch et al., 1983; Kemp et
al., 1993).
Në veçanti, përmbajtja ribozomale (ose e rARN-së) pritet të jetë e lidhur veçanërisht me
shkallën e rritjes: ribozomet veprojnë si makineri biologjike për sintezën e proteinave dhe
në gjendje të qëndrueshme (dhe duke supozuar se qarkullimi i proteinave është i
parëndësishëm), shkalla e sintezës së proteinave specifike barazohet me shkallën e rritjes
specifike (Bremer & Dennis, 1996). Prandaj, përmbajtja qelizore e rARN-së është një
kandidat i mirë si tregues biokimik për shkallën e rritjes në popullatat mikrobike natyrore
(Amann et al., 1995; Kemp et al., 1993; Kramer & Singleton, 1993).
Lidhja midis përmbajtjes qelizore të rARN-së dhe shkallës së rritjes në cianobakteret nuk
është përcaktuar. Nga studimet, është vënë re, se shkalla e rritjes lidhet me ndryshime në
ARN-në totale qelizore, kryesisht për shtameve të ujërave të ëmbla Synechococcus
PCC6301 (më parë Anacystis nidulans) (Mann & Carr, 1974; Parrott & Slater, 1980;
Utkilen, 1982).
Kështu, rritja e ARN-së qelizore raportohet të jetë eksponenciale, sigmoidale ose lineare.
Në studimin e Brian & Liu (1998) u përdorën sondat oligonukleotidike fluoreshente
16SrARN për të analizuar në mënyrë specifike përmbajtjen qelizore të rARN-së të një
shtami të izoluar bregdetar të Synechococcus, rritur me dritë të kufizuar.
3.3. Analiza filogjenetike molekulare e tri shtameve Synechococcus të izoluara nga
uji i detit
Cianobakteret, që përmbajnë fikoeritrinë, të gjinisë Synechococcus janë kontribuesit
kryesorë në prodhimin primar dhe biomasën e oqeanit botëror (Waterbury et al., 1979;
Partensky et al., 1999; Agawin et al., 2000). Pavarësisht rëndësisë, pak studime kanë
ekzaminuar lidhjet filogjenetike midis llojeve Synechococcus detar, të cilat janë
klasifikuar në tre grupe të mëdha, MC-A, MC-B, dhe MC-C (Waterbury & Rippka,
1989). Nga këto, MC-A përmban shtame Synechococcus të ndryshëm, të izoluar nga
ujërat bregdetare dhe detet e hapura, dhe klasifikimi është mirëmbështetur në
filogjenezën e hapësirave të brendshme të traskriptuara (ITS) të 16S rARN dhe 16S-23S
rARN (Rocap et al., 2002; Fuller et al., 2003). Deti i Kinës Lindore (ECS), një det kufitar
i Oqeanit Paqësor të Veriut ndikohet nga masa të ndryshme uji, duke përfshirë Rrymën
Kuroshio, Rrymën e Ngrohtë Tsushima, ujërat e ftohta të Detit të Verdhë dhe ujërat e
ëmbla nga Lumi Yangtze (Beardsley et al., 1985). Veç kësaj, ndryshimet sezonale në
rrezatimin diellor ndikojnë fuqishëm në temperaturat e ujit të (ECS) (Chen et al., 1993),
dhe ndryshimet sezonale nga shkarkimi i ujit nga lumi Yangtze ndikojnë fuqishëm në
kripësinë e zonës (Zhang et al., 1994). Ndryshimet mjedisore ndikojnë fuqishëm në
kushtet biologjike të fitoplanktonit (Guo, 1994).
Sipas studimeve të fundit, Synechococcus është grupi më dominant i pikoplanktonit
autotrofik në ECS. Gjatë periudhavetë ngrohta, Synechococcus mund të arrijë 3.0 x 104
qeliza/ml, megjithëse bollëku qelizor duket të jetë i sinkronizuar me ndryshimet në
kushtet mjedisore (Jiao et al., 2002; Noh et al., 2005).
Edhe pse ka të dhëna se një numër studimesh mbi shpërndarjen e Synechococcus në ECS
kanë përdorur flow cytometrinë, pak prej tyre janë studime taksonomike mbi këtë gjini.
Choi & Noh (2006), shqyrtuan lidhjet molekulare filogjenetike të tre shtameve
Synechococcus të izoluar nga ujërat pranë Stacionit të Kërkimit Oqeanik Ieodo (IORS)
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
25
(Fig. 3.2), me shtame të tjera të përshkruara më parë. Ky studim siguroi informacion të
rëndësishëm mbi diversitetin e Synechococcus në ECS, dhe demostroi rëndësinë e IORS
në studimin e këtij ekosistemi.
Figura 3.2. Stacioni i Kërkimit Oqeanik Ieodo (IORS) (marrë R/V Eardo, Choi & Noh, 2006).
3.4. Zbulimi i ekotipeve të Prochlorococcus dhe Synechococcus me anë të përdorimit
të sekuencave të hapësirave të transkriptuara të brendshme (ITS) të 16S-23SrADN
Prochlorococcus rezulton i lidhur ngushtë me grupin A të Synechococcus detar, bazuar
në analizën që përdor sekuencat e gjeneve të 16SrARN (16SrADN) dhe rpoC1, një
nënnjësi e ARN polimerazës e varur nga ADN-ja (Palenik & Haselkorn, 1992; Urbach et
al., 1992).
Sekuencat e 16SrADN të ekotipeve të Prochlorococcus korrelojnë me fiziologjinë e tyre.
Shtamet e ekotipeve low-B/A janë të lidhur filogjenetikisht ngushtë (99% ngjashmëri në
sekuencën 16SrADN) dhe formojnë një degë të mbështetur mirë nga vlerat e testit të
filogjenezës (Moore et al., 1998; Rocap et al., 1999; Urbach et al., 1998).
Shtamet e ekotipit high-B/A kanë një shkallë më të ulët të ngjashmërisë në sekuencën e
tyre 16SrADN (97 në 98 %) dhe nuk janë monofiletike, por formojnë të paktën tre degë
të pavarura (Rocap et al., 1999). Shtamet Prochlorococcus high-B/A kanë gjithashtu një
shkallë më të lartë të ngjashmërisë të sekuencave me grupin A të shtameve
Synechococcus detar sesa me ekotipin low-B/A. Në fakt, renditjet e degëve midis disa
shtameve Prochlorococcus high-B/A dhe grupit A të shtameve Synechococcus detar nuk
janë zgjidhur plotësisht duke përdorur sekuenca 16SrADN (Moore et al., 1998; Rocap et
al., 1999; Urbach et al., 1998). Shtamet që përfshihen në grupin A të Synechococcus
detar, janë gjenetikisht dhe fiziologjikisht të ndryshëm (Waterbury & Rippka, 1989).
Diversiteti gjenetik në grupin A të shtameve Synechococcus detar është shqyrtuar në pak
shtame duke përdorur sekuencat 16SrADN (Urbach et al., 1998) dhe më gjerësisht duke
përdorur sekuencat rpoC1 (Toledo & Palenik, 1997; Toledo et al., 1999).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
26
Në shumë eubaktere, gjenet për rARN janë organizuar në operone me gjene që kodojnë
për 16S, 23S, dhe 5SrARN të ndara nga zona të emërtuara hapësira të brendshme të
transkriptuara (ITS) (Fig. 3.3) (Gürtler & Stanisich, 1996). ITS përmbajnë motive të
antiterminimit box B-box A, të cilat parandalojnë përfundimin prematur të transkriptimit
(Berg et al., 1989) dhe gjithashtu kanë rol në mbajtjen e strukturës sekondare të rARN-së
gjatë transformimit të saj në formën e maturuar (Apirion & Miczak, 1993). Hapësira
midis gjeneve 16S-23SrARN mund të kodojë për 0, 1 ose 2 gjene tARN. Për shkak se
ITS shfaq variacion të madh të sekuencës, është përdorur në studimin e mjaft grupeve
bakteriale për të paraqitur shtamet e lidhura ngushtë (Barry et al., 1991; Christensen et
al., 1999; Leblond-Bourget et al., 1996). Sekuencat e gjenomave tregojnë se shtamet
Prochlorococcus të tipit low-B/A zotërojnë një operon të vetëm për rARN, ndërsa
shtamet Prochlorococcus të tipit high–B/A dhe shtamet e Synechococcus detar zotërojnë
dy operone identike per rRNA (http://www.jgi.doe.gov/JGI_microbial/html/index.html).
Tashmë është raportuar përdorimi i ITS si mjet filogjenetik për të identifikuar degët me të
cilat mund të paraqiten ekologjikisht popullata të dallueshme të Prochlorococcus dhe
Synechococcus. Duke shqyrtuar një diapazon të gjerë shtamesh të ndryshme
fiziologjikisht të Prochlorococcus dhe grupit A Synechococcus detar, u hodhën bazat për
studime të diversitetit gjenetik dhe shpërndarjes në terren të këtyre popullatave
cianobakteriale oqeanike dhe për të interpretuar evolucionin fenotipik dhe portretizimin e
taksonomisë së tyre (Rocap et al., 2002).
Ndryshimet e shënuara në gjatësinë e ITS u vëzhguan nga Rocap et al. (2002). Brenda
shtameve Prochlorococcus, diferencat e gjatësisë korrelonin fort me ekotipin. Shtamet
Prochlorococcus high-B/A kishin sekuenca më të gjata ITS dhe kishte një diapazon të
madh të gjatësisë midis sekuencave (Fig. 3.3). ITS në shtamet e grupeve A
Synechococcus detar varionin nga 747 bp (WH 8017) në 810 bp (WH 8103). Pjesa më e
madhe e diferencës së gjatësisë ishte në fund të hapësirës 3’ (hapësira tARNAla
-23S), që
varion nga 255 në 531 bp midis shtameve të shqyrtuara.
Figura 3.3. Shndërrimi i rARN premature në formën e maturuar rARNs tek eubakteret
(www.bio.brandeis.edu/classes/biol105/.../Lecture16.ppt ).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
27
IV. MATERIALE DHE METODA
4.1. Stacionet e marrjes së mostrave
Mostrat e ujit u morrën në gjashtë (6) stacione të Gjirit të Durrësit të njohura për nivelin e
lartë të ndotjes dhe origjinën e ndryshme të saj.
• Plazhi i Golemit - Zonë banimi dhe plazhi intensiv.
• Kanali i Plepave - Bregu pranë derdhjes së ujërave të ndotura të Kanalit të
Plepave.
• Plazhi Hekurudha - Zonë plazhi intensiv.
• Ish Pontili i Karburanteve - Kalata e ish Pontilit të Karburanteve në basenin e
Portit Detar, Durrës.
• Kanali i ujërave të qytetit të Durrësit - Bregu pranë derdhjes të kanalit të
ujërave të ndotura të qytetit të Durrësit.
• Plazhi Currila - Zonë me mbetje ndërtimore.
4.1.1. Koordinatat gjeografike të stacioneve të kampionimit
Plazhi i Golemit (PG): 41° 16' 47.66" N, 19° 30' 43.83" E.
Kanali i Plepave (KP): 41° 17' 5.69"N, 19° 30' 30.60" E.
Plazhi Hekurudha (PH): 41° 18' 7.86"N, 19° 29' 29.03" E.
Ish Pontili i Karburanteve (IPK): 41° 18' 27.87" N, 19° 27' 29.22" E.
Kanali i ujërave të qytetit të Durrësit (KUQD): 41° 18' 26.92" N, 19° 26' 46.08 " E.
Plazhi Currila (PC): 41° 19' 9.74" N, 19° 25' 50.78" E. (Koordinatat gjeografike u matën
me iPhone 4 dhe https://maps.google.com).
Figura 4.1. Stacionet e marrjes së mostrave (google earth, 2013).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
28
4.2. Metodika e marrjes së mostrave
Mostrat e ujit të detit u morën në thellësi 1 m nga sipërfaqja përmes një pajisje të
përgatitur bazuar në parimin e shishes Rutner (Fig. 4.2). Periudha e monitorimit ishte
Prill - Tetor 2011 & Qershor - Tetor 2012. Vëllimi i mostrave prej 4 l u mor për izolimin
e ADN fitoplanktonike dhe ADN pikofiplanktonike (2 l) dhe për vlerësimin e faktorëve
fiziko-kimikë dhe biologjikë (2 l). Për të gjashtë stacionet, mostrat e ujit u morën çdo
muaj në orët e mëngjesit (midis orëve 6.00 - 9.00), në shishe plastike 2-litërshe.
Temperatura e mostrave u përcaktua në vend dhe shishet plastike u transportuan me
termoboks në laborator për analiza.
U mblodhën gjithsej 42 mostra në terren gjatë vitit 2011 dhe 30 mostra gjatë 2012.
Analizat u kryen në Laboratorin e Akuakulturës dhe Peshkimit, Durrës, dhe Laboratorin e
Bioteknologjisë Molekulare, të Departamentit të Bioteknologjisë, FSHN, Universiteti i
Tiranës.
Në laboratorin e Akuakulturës dhe Peshkimit, u kryen këto analiza:
a. Pehashi (pH),
b. Oksigjeni i tretur (DO),
c. Ngopja me oksigjen (DO%),
d. Kripshmëria,
e. Turbullia,
f. Nitratet (NO3-),
g. Fosfatet (PO43-
),
h. Klorofila a totale (Chl a).
Në laboratorin e Bioteknologjisë Molekulare u realizuan:
a. filtrimi i mostrave të ujit të detit në filtra specifikë për gjallesat fitoplanktonike,
ku duhet të ishin të pranishëm gjinia Synechococcus;
b. ri-filtrimi i mostrave të ujit në filtra me porozitet të përshtatshëm për izolimin e
specieve pikofitoplanktonike të gjinisë Prochlorococcus;
c. ekstraktimi prej filtrave i ADN-së fitoplanktonike;
d. analiza spektrofotometrike e sasisë dhe cilësisë së ADN-së;
e. shumëfishimi me anë të PCR-së të rajoneve ribozomale specifike për
pikofitoplantonin Synechococcus;
f. Shumëfishimi i rajoneve ITS nga ADN-ja pikofitoplanktonike;
g. Vlerësimi i variacionit të rajoneve ITS.
4.3. Analizimi i parametrave fiziko-kimikë dhe biologjikë të mostrave të ujit
Faktorët mjedisorë u analizuan me metoda analitike standarde rekomanduar nga APHA et
al. (2005, 1998) dhe Grasshoff et al. (1999).
Temperatura, pH, DO, DO%, kripshmëria, turbullia, NO3-, PO4
3-, Chl a u matën me
aparatura përkatëse (Tab. 4.1, Fig. 4.2 & 4.3). Një provë e bardhë u përgatit për
konfirmimin e rezultateve të analizave. Vetëm temperatura u mat në vënd, ndërsa
parametrat e tjerë u matën në laboratorin e Akuakulturës dhe Peshkimit, Durrës.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
29
Ka disa metoda analitike të njohura për përcaktimin e Chl a sikurse metoda
spektrofometrike, fotometrike dhe metoda HPLC (kromatografia e lëngët me eficencë të
lartë) sipas “Summary of Literature Comparing Methods for the Analysis of Chlorophyll
in Water Samples” (2006).
Për përcaktimin e përqëndrimit të Chl a u përdor metoda fluorimetrike. Sensori për Chl a
vendosur në sondën Idromar është një fluorimetër optik, që përcakton përqëndrimin e Chl
a në një mostër uji duke rrezatuar një dritë blu (460 nm). Energjia e dritës blu absorbohet
nga Chl a dhe fluoreshon dritë të kuqe (620-715 nm). Sensori mat sasinë e dritës së kuqe
që lëshohet nga Chl a në mostrën e ujit.
Tabela 4.1. Parametrat fiziko-kimikë dhe biologjikë të matur në ujërat e Gjirit të Durrësit,
metoda e matjes, pajisjet e përdorura dhe literatura përkatëse.
Parametri Metoda Aparatura, Literatura
Temperatura (ºC) Termometri Precision ALLA FRANCE ® thermometer – Red liquid
filled (-10 +110ºC, TOTAL immersion);
multi-parameter(pH/conductivity/temperature) Hanna
Instruments,
pH Potenciometri WTW Multiline P4 pH, ORP, DO, Conductivity,
Temperature Meter, Hach Company (APHA et al.,2005,
1998; Grasshoff et al., 1999)
Oksigjeni i tretur
(DO, mg/l)
Elektrokimi me
sondë
WTW Multiline P4 pH, ORP, DO, Conductivity,
Temperature Meter, Hach Company (APHA et al., 2005,
1998, Grasshoff et al., 1999)
Ngopja me oksigjen
(DO%)
Elektrokimi me
sondë
WTW Multiline P4 pH, ORP, DO, Conductivity,
Temperature Meter, Hach Company (APHA et al., 2005,
1998)
Kripshmëria (‰) Konduktometri WTW Multiline P4 pH, ORP, DO, Conductivity,
Temperature Meter, Hach Company (APHA et al., 2005,
1998)
Turbullia (NTU) Turbidimetri HANNA instrument Microprocessor Turbidity (ISO 7027)
Nitratet (NO3-,
mg/l)
Spektrofotometri
UV-VIS
PhotoLab 6600 UV-VIS, WTW GmbH
Fosfatet, (PO43-
,
mg/l)
Spektrofotometri
UV-VIS
PhotoLab 6600 UV-VIS, WTW GmbH
Klorofila a (Chl a,
µg/l)
Fluorometri Multiparameter probe Idromar , (APHA et al., 2005, 1998)
Figura 4.2. Aparaturat e përdorura gjatë punës në Lab. e Akuakulturës dhe Peshkimit, për
përcaktimin e parametrave fiziko- kimikë & biologjikë (majtas 1- Pajisje për marrjen e ujit në
thellësi 1m; 2, 3- Precision ALLA FRANCE ® thermometer – Red liquid filled; 4, 5- WTW
Multiline P4 pH, ORP, DO, Conductivity, Temperature Meter; 6- HANNA instrument
Microprocessor Turbidity; 7- Multiparameter probe Idromar).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
30
Figura 4.3. Kitet (WTW) dhe spektrofotometri (photoLab 6600 UV-VIS) të përdorura për
përcaktimin e ushqyesve (NO3- & PO4
3-) në laboratorin e Akuakulturës dhe Peshkimit, Durrës.
4.4. Filtrimi
Në Laboratorin e Bioteknologjisë Molekulare, FSHN, UT u krye filtrimi i secilës mostër
(2 l) prej gjashtë stacioneve, në dy përsëritje, me pompë me vakuum (30-40 kPa) në filtra
GF/F Ø 47 mm. Filtri në të cilat u grumbullua materiali fitoplanktonik me përmasat mbi
0.7 µm, ku kategorizohet edhe Synecchococcus, u vendos në një tub mikrocentrifugimi,
ku në vijim u shtua 1ml STE dhe u ruajtën në -20 oC. Filtrati i marrë prej filtrimit në
filtrin GF/F, u rifiltrua në një filtër të dytë të tipit HTTP 0.4 µm me synim izolimin e
specieve pikofitoplanktonike Prochlorococcus (~0.6 µm), të cilat gjithashtu u ruajtën në -
20 oC (Fig. 4.4) (Sambrook et al., 1989).
4.4.1. Filtrat e nevojshëm dhe reaktivat
Filtrat që u përdorën për fitrimin e parë të çdo mostre uji, ishin filtra me fibra xhami
Whatman GF/F Ø 47mm me përmasa të poreve 0.7 µm.
Kurse për realizimin e filtrimit II të mostrave të ujit, u përdorën filtra membranorë
izopororikë, polikarbonat, hidrofilikë (HTTP) Ø 47mm me përmasa të poreve 0.4µm.
Reaktivat e përdorur sipas Paul (2008) ishin:
TE (10Mm Tris-HCL, 1Mm EDTA, pH 8,0);
STE (100Mm NaCl, 10Mm Tris-HCl, 1mM EDTA, pH 8,0),
3 M Sodium Acetat,
Fenol i saturuar me TE,
Kloroform : IAA, 24:1,
20% SDS.
Figura 4.4. Mjete dhe aparatura gjatë punës në laboratorin e Bioteknologjisë (ish-IKB), gjatë
proçesit të filtrimit: 1- majtas- Mostrat e ujit dërguar në lab.; 2- Pompë me vakum; 3- Filtri GF/F
Ø 47- 0.7 µm; 4- Filtri HTTP Ø 47- 0.4 µm; 5- Filtër i ruajtur në STE.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
31
4.5. Ekstraktimi i ADN-së së fitoplanktonit dhe pikofitoplanktonit nga filtrat
specifikë
Protokolli u realizua sipas Paul (2008), bazuar në studimet Pichard et al. (1993) dhe
Fuhrman et al. (1988) me modifikime të vogla.
1. Mostrat e ngrira shkrihen në banjë uji të ngrohtë.
2. Shtohet në to me kujdes 0.1 volum i 20 % SDS.
3. Zhyten tubat në ujë që vlon për 2.5 minuta.
4. Futen në akull për 1 min, e më pas centrifugohen për 10 min në shpejtësi
maksimale.
5. Mblidhet supernatanti në tuba të rinj që vendosen në akull. Shtohet 1 ml STE dhe
0.1 volum i 20 % SDS në filtra dhe pelletohen, vorteksohen, ri-vlohen, spin dhe
merret supernatanti.
6. Bashkohen supernatantet; shtohet 0.1 volum i sodium acetat 3 M, pH 7 dhe përzihet
mirë.
7. Shtohen dy volume etanol 100 %, vorteksohet, ruhet në -20 °C për 30 min.
8. Centrifugohen ne shpejtësi maksimale, derdhet supernatanti, dhe ruhen pelletet që
thahen në ajër.
9. Tretim pelletin në 0.5 ml TE.
10. Shtohet 0.5 ml fenol i ngopur me TE, pH 8, dhe vorteksohet.
11. Centrifugohet për 4 min dhe grumbullohet supernatanti.
12. Supernatanti ekstraktohet me 0.3 ml fenol dhe 0.3 ml kloroform:izoamilalkool
(24:1).
13. Centrifugohet për 4 min; mblidhet supernatanti dhe përsëriten dy hapat e fundit.
14. Ekstraktohet me 0.5 ml kloroform: izoamilakool dhe mblidhet supernatanti.
15. Shtohet 0.1 volum i sodium acetatit 3 M, pH 7, përzihen mirë. Shtohen dy volume
etanol dhe inkubohet në -20 °C për 30 min.
16. Centrifugohet për 10 minuta në shpejtësi maksimale. Derdhet supernatanti.
17. Shtohet 0,5 ml etanol 70 % i ftohtë.
18. Centrifugohet për 10 min. Derdhet supernatanti dhe thahet pelleti në ajër ( 65 °C).
19. Tretet pelleti ne 100 μl TE.
4.6. Matja e sasisë dhe cilësisë së ADN-ve
Analizat sasiore dhe cilësore të ADN- ve u vlerësuan me metodën spektrofotometrike
sipas Sambrook et al. (1989). Nga çdo mostër ADN-je u morën 10 μl dhe u holluan në
1990 μl H2O të distiluar. Prova e bardhë ishte 2000 μl H2O i distiluar. Duke përdorur
spektrofotometër UV/VIS (Fig. 4.5), u matën absorbancat, përkatësisht OD260 dhe OD280.
Figura 4.5. Mjete dhe aparatura në laboratorin e Bioteknologjisë për ekstraktimin e ADN-së dhe
matjen e ADN-së me spektrofotometër UV (4- djathtas - Spektrofotometër UV/VIS).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
32
Duke patur parasysh raportin OD260/OD280 u llogarit cilësia (pastërtia) e ADN-së, e cila
konsiderohet e pastër kur raporti ka vlera në intervalin 1.6-1.8. Sasia e ADN- së u llogarit
me formulën:
Sasia e ADN (µg/ml) = OD260 × faktori i hollimit (200) × 50 g/ml (CIMMYT, 2005;
Grazhdani, 2008).
4.7. Evidentimi i pranisë së specieve pikofitoplanktonike bazuar në shumëfishimin
me anë të PCR-së të fragmentit ribozomik 16S-23SrADN
Për të evidentuar praninë e species u përdorën një çift primerash specifikë për rajonin
16S-23SrADN të Synechoccocus dhe protokolli i i shumëfishimit me anë të PCR-së.
4.7.1. Hartimi i primerave specifikë për rajonin 16S-23S të ADN-së ribozomale të
Synechoccocus
Me synim shumëfishimin e sekuencave të gjeneve 16S-23SrADN të gjinisë
Synechoccocus u përdorën një çift primerash specifikë për këtë rajon të emërtuar HEX
dhe 16S-241R (Rocap et al., 2002), të cilët kanë rezultuar të suksesshëm në
shumëfishimin e këtij rajoni (Bacu et al., 2010, 2012).
Përbërja e këtyre primerave paraqitet si vijon:
HEX- CGT ACT ACA ATG CTA CGG
16S-241R- CYA CCT GTG TCG GTT T
4.7.2. Protokolli i shumëfishimit me anë të PCR-së
Reaksioni i shumëfishimit për një mostër (Master Mix 1X):
0.1 µl Taq Polimeraze (5U/µl)
1.6 µl MgCl2 25mM
2 µl PCR Buffer 1X
2.5 µl dNTPs 10 mM
0.25 µl Primer (Hex) 25 pmol
0.25 µl Primer (26-241R) 25 pmol
8.3 µl H2O
5 µl ADN
Volumi total 20 µl
Ky reaksion u përgatit për 24 mostrat si vijon dhe një mostër kontroll, pra u krye Master
Mix 25X.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
33
4.7.2.1. Mostrat e ADN-së së përdorur si model për shumëfishim
Për të verifikuar praninë e species pikofitoplanktonike Synechoccocus si model
shumëfishimi u përzgjodhën mostrat me sasinë dhe cilësinë më të mirë të ADN-ve të
ekstraktuara nga filtrat GF/F, të cilat u numërtuan nga 1-24 si vijon:
1. PG, Korrik 2011 (Plazh i Golemit)
2. KP, Korrik 2011 (Kanali i Plepave)
3. PH, Korrik 2011 (Plazhi Hekurudha)
4. IPK, Korrik 2011 (Ish Pontili i Karburanteve)
5. KUQD, Korrik 2011 (Kanali i ujërave të qytetit të Durrësit)
6. PC, Korrik 2011 (Plazhi Currila)
7. PG, Korrik 2012
8. KP, Korrik 2012
9. PH, Korrik 2012
10. IPK, Korrik 2012
11. KUQD, Korrik 2012
12. PC, Korrik 2012
13. PG, Shtator 2011
14. KP, Shtator 2011
15. PH, Shtator 2011
16. IPK, Shtator 2011
17. KUQD, Shtator 2011
18. PC, Shtator 2011
19. PG, Shtator 2012
20. KP, Korrik 2012
21. PH, Korrik 2012
22. IPK, Korrik 2012
23. KUQD, Korrik 2012
24. PC, Korrik 2012
4.7.3. Kushtet e ciklimit
Kushtet e amplifikimit për çiftin e primerave (Hex) / (26-241R) ishin:
94 oC për 4 min, ndjekur nga 40 cikle në 94
oC për 1 min, 52
oC për 1min dhe 72
oC për 3
min dhe shtrirja e fundit në 72 oC për 10 min.
4.8. Elektroforetimi i produkteve të shumëfishuara, protokolli
Produktet PCR-së u bënë të dukshme nën dritën UV pas elektroforezës /100 mV / 35 min
në 1.2 % gel agaroze në TBE 1X.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
34
Figura 4.6. Mjete dhe apararatura në laboratorin e Bioteknologjisë për shumëfishimin me anë të
PCR-së dhe vizualizimin e produkteve të PCR-së (2- majtas, Epperndorf MasterCycler personal,
4- Transilluminator UV, VWR GeneSmart).
4.9. Vlerësimi i diversitetit të pikocianobaktereve marine Synechococcus dhe
Prochlorococcus bazuar në shumëfishimin me anë të PCR-së të rajoneve 16S-23S
ITS rADN
Për vlerësimin e diversitetit të pikocianobaktereve marine Synechococcus dhe
Prochlorococcus u përdoren dy çifte primerash, respektivisht për dy zona variabël të ITS
dhe protokolli i shumëfishimit me anë të PCR-së për çiftin e primerave (ITS-af / ITS-ar
& ITS-bf / ITS-br).
4.9.1. Primerat e përdorur për shumëfishimin e rajoneve ITS të specieve
pikofitoplanktonike Synechococcus dhe Prochlorococcus
Për shumëfishimin e rajoneve ITS (Internal Transcribed Spacers) të specieve
pikofitoplanktonike Synechococcus dhe Prochlorococcus u përdoren dy çifte primerash,
respektivisht për dy zona variabël të ITS:
ITS-af 5’-GGA TCA CCT CCT AAC AGG GAG-3’,
ITS-ar 5’-GGA CCT CAC CCT TAT CAG GG-3’për zonën 16S tRNAIle
, dhe
ITS-bf 5’-GTT GGT AGA GCG CCT TAT CAG GG-3’
ITS-br 5’-CCG TGA GCC CTT TGT AGC TTG-3’për-tRNAAla-
23S.
Pozicionet e këtyre primerave në rajonin 16S-23SrADN pikofitoplanktonike sipas Lavin
et al. (2008) janë dizenjuar bazuar në gjenet 16S rARN dhe sekuencat ITS të 11 shtameve
Prochlorococcus dhe 7 Synechococcus (Fig. 4.7). Këta primera janë të vlefshëm në
Bankën Gjenetike me numrat hyrës të mëposhtëm:
AF115269, AF397683, AF115270, AF397702, AF115271, AF397684, AF053396,
AF397686, AF053398, AF397688, AF053399, AF397704, AF001467, AF397695,
AF001471, AF397696, AF001472, AF397678, AF397678, AF397679, AF001473,
AF397693, AY172832, AF397729, AY172833, AF397707, AY172834, AF397718,
AY172835, AF397719, AF001480, AF397728, NC_005070,AY172836, AF397710.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
35
Figura 4.7. Paraqitja skematike e operonit ARNr nga shtamet Synechococcus dhe
Prochlorococcus sipas Lavin et al. (2008), ku jepet pozicioni i lidhjes së primerave të përdorur në
këtë studim.
4.9.2. Protokolli i shumëfishimit me anë të PCR-së
4.9.2.1. Protokolli i shumëfishimit me anë të PCR-së për çiftin e primerave (ITS-af /
ITS-ar)
Reaksioni i PCR për ITS u krye sipas Lavin et al. (2008). Reaksioni i shumëfishimit për
një mostër (Master Mix 1X):
0.5 µl Taq Polimeraze (5U/µl)
3 µl MgCl2 25mM
2.5 µl PCR Buffer 1X
0.5 µl dNTPs 10 mM
0.2 µl Primer (ITS-af) 25 pmol
0.2 µl Primer (ITS-ar) 25 pmol
17.6 µl H2O
0.5 µl ADN
Volumi total 25 µl
Ky reaksion u përgatit për 9 mostrat si tek pika 4.9.2.3 dhe një mostër kontroll, pra u krye
Master Mix 10X.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
36
4.9.2.2. Protokolli i shumëfishimit me anë të PCR-së për çiftin e primerave (ITS-bf /
ITS-br)
Reaksioni i shumëfishimit për një mostër (Master Mix 1X):
0.5 µl Taq Polimeraze (5U/µl)
3 µl MgCl2 25 mM
2.5 µl PCR Buffer 1X
0.5 µl dNTPs 10 mM
0.2 µl Primer (ITS-bf) 25 pmol
0.2 µl Primer (ITS-br) 25 pmol
17.6 µl H2O
0.5 µl ADN
Volumi total 25 µl
Ky reaksion u përgatit për 9 mostrat si vijon dhe një mostër kontroll, pra u krye Master
Mix 10X.
4.9.2.3. Mostrat e ADN-së së përdorur si model për shumëfishim
Si model shumëfishimi u përzgjodhën mostrat me sasinë dhe cilësinë më të mirë të ADN-
ve të ekstraktuara nga filtrat GF/F, të cilat u numërtuan nga 1-9 si vijon:
1. PG, Korrik 2011
2. KUQD, Korrik 2011
3. PG, Shtator 2011
4. KP, Shtator 2011
5. IPK, Shtator 2011
6. KUQD, Korrik 2012
7. PG, Shtator 2012
8. KUQD, Shtator 2012
9. PC, Korrik 2012
4.9.3. Kushtet e ciklimit për çiftin e primerave (ITS-af / ITS-ar)
Kushtet e amplifikimit për çiftin e primerave (ITS-af) / (ITS-ar) ishin: 95 oC për 5 min,
ndjekur nga 28 cikle në 95 oC për 1 min, 55
oC për 1 min dhe 72
oC për 2 min dhe shtrirja
e fundit në 72 oC për 10 min.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
37
4.9.4. Kushtet e ciklimit për çiftin e primerave (ITS-bf / ITS-br)
Kushtet e amplifikimit për çiftin e primerave (ITS-bf) / (ITS-br) ishin: 95 oC për 5 min,
ndjekur nga 28 cikle në 95 oC për 1 min, 61
oC për 1min dhe 72
oC për 2 min dhe shtrirja
e fundit në 72 oC për 10 min.
4.10. Elektroforetimi i produkteve të shumëfishuara, protokolli
Produktet PCR-së për të dy çiftet e primerave (10 mostra ADN-je model për çdo aplikim)
u elektroforuan 1.5 % gel agaroze në TBE 1X në 100 mV për 15 min. Më pas u
fotografuan në Transilluminator UV për të verifikuar praninë e rajoneve ITS-a dhe ITS-b
me modifikime të përqëndrimit të xhelit.
Figura 4.8. Elekroforeza e produkteve të PCR për rajonet 16S-23SrADN ITS.
4.11. Analiza statistikore
Përveç analizës rutinë me programin Excel (2007) të të dhënave për gjetjen e
maksimumit, minimumit, mesatares, deviacionit standard dhe paraqitjen grafike të çdo
parametri të matur; vlerësimet statistikore u realizuan edhe me programin STATISTICA.
Përmes këtij programi, u realizua box plot, për të vërejtur paraqitjen grafike të vlerave
dhe shpërndarjen e tyre. Konkretisht, u përcaktuan për çdo parametër të matur të vitit
2011 dhe vitit 2012: mesorja, intervali i vlerave ku ndodhen 50 % e këtyre vlerave (midis
25 % - 75 %), kufijtë e bishtave (whiskers), pikat jashtë bishtave të kutisë, ekstremet.
Përmes këtij programi, krahas grafikëve box plot, u realizuan dhe histogramat.
Gjithashtu, u përdorën programet statistikore MegaStat.xla (2007) dhe MultiBase (2012)
për të testuar lidhjen ndërmjet parametrave fiziko-kimikë dhe biologjikë dhe ADN-së
fitoplanktonike dhe pikofitoplanktonike.
Koefiçientët e korrelacionit Pearson (p < 0.05 & p < 0.01) u matën përmes programit
MegaStat.xla (2007).
Grafikët e regresionit linear të shumëfishtë midis ADN-së fitoplanktonike dhe faktorëve
mjedisorë si dhe midis ADN-së pikofitoplanktonike dhe faktorëve mjedisorë, u realizuan
me programin MultiBase (2012).
Analiza faktoriale për parametrat e studiuar dhe grupimin e parametrave të ngjashëm e
stacioneve të ngjashëm, me anë të analizës faktoriale dhe dendogramave të ngjashmërisë,
u realizuan ITS me programin statistikor Minitab 15.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
38
V. REZULTATE DHE DISKUTIME
5.1. Vlerësimi i faktorëve mjedisorë që ndikojnë në praninë e pikocianobaktereve në
ujërat e Gjirit të Durrësit
5.1.1. Vlerësimi i faktorëve mjedisorë abiotikë (parametrat fiziko-kimikë)
Duke marrë në konsideratë rëndësinë e faktorëve mjedisorë abiotikë në biomasën,
dinamikën, diversitetin e fitoplanktonit e veçanërisht të pikofitoplanktonit, përfshirë
cianobakteret Synechococcus dhe Prochlorococcus (çështja 1.5), u studiuan këto
parametra fiziko - kimikë: temperatura, pH, kripshmëria, oksigjeni i tretur, ngopja me
oksigjen, turbullia, nitratet dhe fosfatet.
Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard i
parametrave fiziko-kimikë gjatë vitit 2011 dhe 2012 janë paraqitur në tabelat dhe grafikët
e mëposhtëm. Për një analizë më të plotë të vlerave dhe shpërndarjes së tyre gjatë
muajve, stinëve dhe viteve, të dhënat e parametrave fiziko-kimikë janë paraqitur
grafikisht me anë të box plot-eve dhe histogramave. Rezultatet e marra janë krahasuar me
standardet ndërkombëtare të ujërave detare. Bazuar në studime analoge mbi Detin
Adriatik dhe / ose Detin Mesdhe është bërë krahasimi i rezultateve të marra.
5.1.1.1. Temperatura
Vlerat e temperaturave (°C) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e Durrësit sipas muajve
dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.1 dhe grafikët 5.1 – 5.5.
Tabela 5.1. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e temperaturave (°C) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas viteve
2011 dhe 2012.
Temperatura (°C) PG KP PH IPK KUQD PC
2011
Max. 27.0 27.0 27.0 27.0 27.0 27.0
Min. 18.5 18.5 19.0 19.0 19.0 18.0
Mesatarja 23.50 23.50 23.42 23.50 23.75 23.25
Mes. Totale ± DS 23.49 ± 3.31
20
12
Max. 28.2 28.9 27.6 28 28.1 27.5
Min. 23.9 23.8 24.6 23.4 23.0 23.1
Mesatarja 26.22 26.12 26.22 25.8 25.52 25.22
Mes. Totale ± DS 25.85 ± 1.55
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Temperaturat sipërfaqësore të ujit më të larta (27 °C dhe 28.9 °C) u shënuan përkatësisht
në Shtator 2011 në të gjitha stacionet dhe Korrik 2012, në stacionin KP; ndërsa
temperaturat minimale (18 °C dhe 23 °C) përkatësisht në Maj 2011, PC dhe Tetor 2012,
KUQD. Referuar mesatareve të temperaturave të ujit për gjithë stacionet, temperaturat e
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
39
ujit ishin kryesisht të larta. Kjo ndodh, sepse temperaturat e sipërfaqes së ujit janë nën
ndikimin e temperaturave të ajrit. Temperaturat e ujit ishin pothuajse të njëjta në të gjitha
stacionet. Duke krahasuar temperaturën mesatare totale të vitit 2012 me 2011,
temperaturat në vitin 2012 ishin 2.4 °C ± 2.47 më të larta se në 2011 (Gjyli & Kolitari,
2011; Gjyli et al., 2013a, b) (Tab. 5.1, Graf. 5.1).
Grafiku 5.1. Vlerat e temperaturave (°C) të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC.
Grafiku 5.2. Box-plot i vlerave të
temperaturës (°C) për vitin 2011.
Grafiku 5.3. Histograma e vlerave të
temperaturës (°C) për vitin 2011.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
40
Grafiku 5.4. Box plot i vlerave të
temperaturës (°C) për vitin 2012. Grafiku 5.5. Histograma e vlerave të
temperaturës (°C) për vitin 2012.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.2 & 5.3) vërehen se për vitin 2011, kemi një shpërndarje
normale të vlerave të temperaturës, por vlerat rrahin majtas. Mesorja ka vlerë më të
madhe se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 20 - 26 °C. Nga
paraqitjet grafike (Graf. 5.3 & 5.4) vërehen se për vitin 2012, kemi një shpërndarje
normale të vlerave të temperaturës, por vlerat rrahin dhjathas. Mesorja ka vlerë pak më të
vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 23 - 28.9 °C. Mesorja
e temperaturës për vitin 2012 është 0.8 °C më e madhe se e vitit 2011, duke na treguar
për rritje temperature prej afro 1 °C nga viti në vit.
Referuar temperaturës maksimale të ujit në Gjirin e Durrësit në Korrik dhe Gusht që arrin
afërsisht 25 °C (OSI, 2002), vlerat e temperaturave maksimale u shënuan 2 °C më të larta
në Shtator 2011 dhe 3 °C më të larta në Korrik 2012. Kjo tregon, se temperaturat e larta
të ajrit gjatë këtyre viteve në këto muaj, japin ndikimin e tyre edhe në rritjen e
temperaturës së ujërave sipërfaqësore të bregdetit.
Duke krahasuar temperaturën e ujërave sipërfaqësore të Detit Adriatik në Verë, që ka
diapazon (22 - 24 °C) (Artegiani et al., 1997), me mesataren e vlerave të temperaturës për
muajt Qershor, Korrik, Gusht, 2011 & 2012, temperaturat e ujërave sipërfaqësore të Gjirit
të Durrësit paraqiten përkatësisht rreth 25 °C dhe 26 °C. Kjo tregon se temperaturat e
verës 2011, 2012 të Gjirit të Durrësit u paraqitën përkatësisht 1 °C dhe 2 °C më të larta se
kufiri maksimal i Detit Adriatik.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
41
Figura 5.1. Stacioni Plazhi i Golemit.
5.1.1.2. Pehashi (pH)
Vlerat e pH të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e Durrësit sipas muajve dhe përpunimi i
tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.2 dhe grafikët 5.6 – 5.10.
Tabela 5.2. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e pH të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas viteve 2011 dhe 2012.
pH PG KP PH IPK KUQD PC
2011
Max. 8.48 8.67 8.49 8.45 8.42 8.4
Min. 7.65 7.65 7.61 7.59 7.77 7.75
Mesatarja 8.10 8.18 8.16 8.15 8.17 8.14
Mes. Totale ± DS 8.15 ± 0.31
2012
Max. 8.2 8.15 8.17 8.12 8.18 8.17
Min. 7.97 8.01 8.08 8.07 8.06 8.05
Mesatarja 8.08 8.08 8.108 8.094 8.106 8.09
Mes. Totale ± DS 8.09 ± 0.05
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Vlerat e pH më të larta (8.67 dhe 8.2) u shënuan përkatësisht në Shtator 2011 në stacionin
KP dhe Gusht 2012, PG; ndërsa vlerat minimale (7.59 dhe 7.97) në Qershor 2011, IKP
dhe Shtator 2012, PG. Sipas WAC 173-201A (1997, 2011), këto vlera ishin brenda
diapazonit të pH standard (pH = 7 - 8.5) të ujërave sipërfaqësore detare, përjashtuar KP
në Shtator 2011 (Gjyli & Kolitari, 2011; Gjyli et al., 2013a, b) (Tab. 5.2, Graf. 5.6). Në
këtë stacion ka derdhje të vazhdueshme të ujërave të ndotura, sikurse derdhja e ujërave të
zeza ose bujqësore nga kodrat përreth si dhe ndërtimet përgjatë bregut të plazhit të
Golemit.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
42
Konsumi fotosintetik i CO2, sidomos në lulëzimet e algave, mund ta paraqesë pH në
nivele të larta (bazike). Kjo ndodh pasi kur CO2 konsumohet, ka më pak disocim të
H2CO3 në jone H+
(Hinga, 2002).
Duke krahasuar mesataret totale të pH të vitit 2012 me 2011, pH në 2012 ishte 0.06 ±
0.22 njësi më i ulët se në 2011, duke na informuar se pH është pothuajse në të njëjtin
nivel për të dy vitet (Gjyli et al., 2013b).
Grafiku 5.6. Vlerat e pH të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC.
Grafiku 5.7. Box plot i vlerave të
pH për vitin 2011.
Grafiku 5.8. Histograma e vlerave të
pH për vitin 2011.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
43
Grafiku 5.9. Box plot i vlerave të
pH për vitin 2012.
Grafiku 5.10. Histograma e vlerave të
pH për vitin 2012.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.7 & 5.8) vërehen se për vitin 2011, kemi një shpërndarje
normale të vlerave të pH, por vlerat rrahin majtas. Mesorja ka vlerë më të madhe se
mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 7.82 – 8.4. Nga paraqitjet
grafike (Graf. 5.9 & 5.10) vërehen se për vitin 2012, kemi një shpërndarje normale
simetrike të vlerave të pH. Mesorja ka vlerë të barabartë me mesataren, kurse 50 % e
vlerave ndodhen brenda 8.07 - 8.12. Gjithashtu për vitin 2012 vërejmë dy vlera jashtë
bishtave të kutisë, përkatësisht 7.97 në PG dhe 8.2 në PG, çka tregon se në këtë stacion
ka derdhje të vazhdueshme në det të ujërave të zeza apo ujërave të ndotura nga ndërtesat
e banimit dhe bizneset në mëngjes dhe mbrëmje. Mesorja e pH për vitin 2012 është 0.15
më e vogël se e vitit 2011.
Figura 5.2. Stacioni Kanali i Plepave.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
44
5.1.1.3. Oksigjeni i tretur (DO)
Vlerat e oksigjenit të tretur (DO, mg/l) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e Durrësit sipas
muajve dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.3 dhe grafikët 5.11 – 5.15.
Tabela 5.3. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e DO (mg/l) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas viteve 2011 dhe
2012.
DO (mg/l) PG KP PH IPK KUQD PC
20
11
Max. 7.3 7.2 7.4 7.25 7 7.68
Min. 4.81 4.33 4.6 4.1 4.3 4.5
Mesatarja 6.12 5.94 6.08 5.98 5.37 5.76
Mes. Totale ± DS 5.87 ± 1.08
2012
Max. 8.26 9.31 8.89 9.18 9.03 9.01
Min. 5.78 6.22 6.16 5.32 6.04 6.04
Mesatarja 6.97 7.50 7.31 6.87 6.93 6.95
Mes. Totale ± DS 7.09 ± 1.19
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Grafiku 5.11. Vlerat e DO (mg/l) të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC.
Vlerat e oksigjenit të tretur DO më të larta (7.68 mg/l dhe 9.31 mg/l) u shënuan
përkatësisht në Maj 2011 në stacionin PC dhe Tetor 2012 në KP; ndërsa DO minimale
(4.1 mg/l dhe 5.32 mg/l) në Korrik 2011 & 2012 të dyja në IPK. Sipas WAC 173-201A
(1997, 2011), këto vlera ishin brenda diapazonit të DO standard të ujërave sipërfaqësore
detare, klasifikuar në cilësinë e ujërave të pazakonshme (7.0 mg/l), të shkëlqyera (6.0
mg/l) dhe të mira (5.0 mg/l), përjashtuar muajin Korrik në IPK, KUQD, KP, 2011, që
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
45
përfshihen në cilësinë jo të keqe (4.0 mg/l) të kriterit të DO për jetën ujore në ujërat
detare (Gjyli & Kolitari, 2011; Gjyli et al., 2013a, b) (Tab. 5.3, Graf. 5.11).
Shkarkimet bregdetare të mbeturinave të pasura në karbon organik sikurse ujërat e zeza
apo ujërave të tjera të ndotura industriale, prodhuar në sasi të larta në qendrat e
populluara urbane, mund të reduktojnë ndjeshëm përqëndrimet e oksigjenit të tretur
(Connell & Miller, 1984).
Kjo shfaqet dukshëm në muajin Korrik IPK, ku sasia e DO paraqitet në minimumet më të
ulëta për 2011 dhe 2012, periudhë që përkon me fluksin sezonal të ankorimit të trageteve.
Kjo mund të vijë si pasojë e derdhjes së substancave organike, përfshirë hidrokarburet,
nga ujërat e ballastrës dhe mbeturinat që vijnë nga ankorimi i anijeve, të cilat presin të
përpunohen në basenin e Portit të Durrësit. Gjithashtu përqëndrimi i ulët i DO mund të
vijë nga komunikimi i vogël me detin e hapur, pasi ka vetëm një kanal hyrës-dalës për
qarkullimin e ujit të basenit me detin e hapur.
Situata paraqitet pothuajse e njëjtë me minimume < 4.5 mg/l të DO në KUQD & KP në
vitin 2011. Kjo vjen si pasojë e shkarkimit të vazhdueshëm ujërave të ndotura,
veçanërisht të ujërave të zeza në këto stacione. Duke krahasuar mesataret totale e DO të
viteve 2012 & 2011, DO i vitit 2012 ishte 1.21 mg/l ± 1.14 më e lartë se në 2011, duke na
informuar për një oksigjenim më të mirë të ujërave bregdetare gjatë vitit 2012 (Gjyli et
al., 2013b).
Grafiku 5.12. Box-plot i vlerave të
DO (mg/l) për vitin 2011.
Grafiku 5.13. Histograma e vlerave të
DO (mg/l) për vitin 2011.
Grafiku 5.14. Box-plot i vlerave të
DO (mg/l) për vitin 2012.
Grafiku 5.15. Histograma e vlerave të
DO (mg/l) për vitin 2012.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
46
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.12 & 5.13) vërehen se për vitin 2011, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të DO, por vlerat rrahin djathtas. Mesorja ka vlerë më të
vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 4.855 – 6.95 mg/l.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.14 & 5.15) vërehen se për vitin 2012, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të DO, por vlerat rrahin djathtas. Mesorja ka vlerë më të
vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 6.16 – 8.26 mg/l.
Mesorja e DO, për vitin 2012 është 1.01 mg/l më e madhe se e vitit 2011.
Nga krahasimi i mesatares së DO të basenit të Portit të Durrësit në vitin 2002 (7.565
mg/l) (Wilbur Smith Associates, 2003) me DO e IPK në vitet 2011 & 2012 (6.38 mg/l),
rezulton se sasia DO ka një zbritje prej 1.18 mg/l këto 10 vite. Pra, DO e basenit ka
kaluar këtë dekadë nga cilësia e ujërave të pazakonshme, në cilësinë e ujërave të
shkëlqyera.
Referuar DO të ujërave sipërfaqësore të Adriatikut Jugor (5.47 ml/l) (Manca et al., 2004)
konvertuar sipas ICES (International Council for the Exploration of the Sea;
http://ocean.ices.dk/Tools/UnitConversion.aspx) (1 mg/l = 0.7 ml/l) në 7.81 mg/l,
rezulton se sasia e DO për ujërat sipërfaqësore të Gjirit të Durrësit për vitet 2011 & 2012
(6.43 mg/l) u paraqit 1.38 mg/l më e ulët se e Adriatikut Jugor (Tab. 5.3, Graf. 5.11).
Prandaj DO e Adriatikut Jugor paraqitet në cilësinë e ujërave të pazakonshme, kurse Gjiri
i Durrësit në cilësinë e ujërave të shkëlqyera të kriterit të DO për jetën ujore në ujërat
detare.
Figura 5.3. Stacioni Plazhi Hekurudha.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
47
5.1.1.4. Ngopja me oksigjen (DO%)
Vlerat e ngopjes me oksigjen (DO%) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e Durrësit sipas
muajve dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.4 dhe grafikët 5.16 - 5-20.
Tabela 5.4. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e DO% (%) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas viteve 2011 dhe
2012.
(DO%) (%) PG KP PH IPK KUQD PC
20
11
Max. 89 94 91 89.3 90.1 101
Min. 69 65.5 67.3 69.5 68 64.1
Mesatarja 78.55 77.80 79.40 77.78 74.72 77.38
Mes. Totale ± DS 77.61 ± 8.63
2012
Max. 92.3 111.3 94.5 112.3 111.7 110.9
Min. 66.7 73.7 71.5 66.7 69.7 70.5
Mesatarja 80.50 88.64 82.50 83.24 81.66 82.22
Mes. Totale ± DS 83.13 ± 13.93
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Grafiku 5.16. Vlerat e DO% (%) të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH, IPK, KUQD,
PC.
Vlerat e ngopjes me oksigjen (DO%) më të larta (101 % dhe 112.3 %) u shënuan
përkatësisht në Qershor 2011 në stacionin PC dhe Shtator 2012 në IPK; ndërsa DO%
minimale (64.1 % dhe 66.7 %) në Tetor 2011, PC dhe Gusht 2012, PG & Korrik 2012,
IPK (Gjyli & Kolitari, 2011; Gjyli et al., 2013a, b) (Tab. 5.4, Graf. 5.16).
Vlerat e DO% ishin më të mëdha se 60 %, vlerë e DO% e cila konsiderohet e
përshtatshme për të mbështetur jetën ujore (EPA, 2008).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
48
Duke krahasuar mesataret totale e DO% të viteve 2012 & 2011, DO% e 2012 ishte 5.5 %
± 11.59 më e lartë sesa 2011, duke na informuar për një ngopje me oksigjen të ujërave
bregdetare më të mirë gjatë vitit 2012 (Gjyli et al., 2013b).
Grafiku 5.17. Box-plot i vlerave të
DO% (%) për vitin 2011.
Grafiku 5.18. Histograma e vlerave të
DO% (%) për vitin 2011.
Grafiku 5.19. Box-plot i vlerave të
DO% (%) për vitin 2012.
Grafiku 5.20. Histograma e vlerave të
DO% (%) për vitin 2012.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.17 & 5.18) vërehen se për vitin 2011, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të DO%, por vlerat rrahin djathtas.
Gjithashtu në Qershor të vitit 2011 vërejmë një vlerë jashtë bishtave të kutisë,
përkatësisht 101 % në PC, që tregon se në këtë stacion ka mbingopje me oksigjen të
ujërave. Mesorja ka vlerë më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda
intervalit 71.85 – 82.1 %. Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.19 & 5.20) vërehen se për vitin
2012, kemi një shpërndarje normale të vlerave të DO%, por vlerat rrahin djathtas.
Mesorja ka vlerë më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda
intervalit 66.7 – 112.3 %. Mesorja e DO%, për vitin 2012 është 2.02 % më e madhe se e
vitit 2011.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
49
Figura 5.4. Stacioni Ish Pontili i Karburanteve.
5.1.1.5. Kripshmëria
Vlerat e kripshmërisë (‰) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e Durrësit sipas muajve dhe
përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.5 dhe grafikët 5.21 - 5-25.
Tabela 5.5. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e kripshmërisë (‰) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas viteve 2011
dhe 2012.
Kripshmëria (‰) PG KP PH IPK KUQD PC
2011
Max. 37.3 37.2 37.4 37.3 37.1 37.4
Min. 36 32.2 36.8 36.8 36.8 36.7
Mesatarja 36.60 36.10 36.95 36.98 36.95 37.03
Mes. Totale ± DS 36.77 ± 0.83
2012
Max. 38.2 38.2 38.5 38.5 38.6 38.6
Min. 36.3 34.2 36.8 36.9 36 36.7
Mesatarja 37.54 36.84 37.78 37.96 37.56 37.88
Mes. Totale ± DS 37.59± 0.98
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Vlerat e kripshmërisë më të larta (37.4 ‰ dhe 38.6 ‰) u shënuan përkatësisht në Shtator
2011, PC & PH dhe Tetor 2012, KUQD & PC; ndërsa vlerat e kripshmërisë minimale
(32.2 ‰ dhe 34.2 ‰) në Shtator 2011, KP, dhe Qershor 2012, KP. Kripshmëria e ulët në
KP në Shtator 2011, por edhe Qershor, Gusht, mund të vijë nga derdhjet e ujërave të
ëmbla, përfshirë dhe ujërat e zeza nga kodrat, hotelet e bizneset përreth, në ujërat
bregdetare (Gjyli & Kolitari, 2011; Gjyli et al., 2013a, b) (Tab. 5-5, Graf. 5-21).
Mesatarja e kripshmërisë të vitit 2012 ishte 0.82 ‰ ± 0.91 më e madhe se 2011, duke
treguar që ujërat bregdetare paraqiten më të kripura gjatë vitit 2012 (Gjyli et al., 2013b).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
50
Grafiku 5.21. Vlerat e kripshmërisë (‰) të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC.
Grafiku 5.22. Box-plot i vlerave të
kripshmërisë (‰) për vitin 2011.
Grafiku 5.23. Histograma e vlerave të
kripshmërisë (‰) për vitin 2011.
Grafiku 5.24. Box-plot i vlerave të
kripshmërisë (‰) për vitin 2012.
Grafiku 5.25. Histograma e vlerave të
kripshmërisë (‰) për vitin 2012.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.22 & 5.23) vërehen se për vitin 2011, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të kripshmërisë, por vlerat rrahin majtas. Gjithashtu,
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
51
vërejmë dy vlera jashtë bishtave të kutisë, përkatësisht 36 ‰ Gusht 2011, PG, dhe 36.7
‰ Korrik 2011, PC. Kjo ndodh se ka derdhje të ujërave të ëmbla, që janë ujëra të ndotura
ose të zeza nga bizneset dhe hotelet në këto stacione. Gjithashtu vërehet edhe një pikë
ekstreme 32.2 ‰ Shtator 2011, KP që tregon pikun e ardhjes së një sasie të
konsiderueshme të ujërave të ndotura, sikurse ujërat e zeza përmes Kanalit të Plepave.
Mesorja ka vlerë më të madhe se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda
intervalit 36.8 – 37.1 ‰. Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.24 & 5.25) vërehen se për vitin
2012, kemi një shpërndarje normale të vlerave të kripshmërisë, por vlerat rrahin majtas.
Mesorja ka vlerë më të madhe se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda
intervalit 37.2 – 38.3 ‰. Gjithashtu në Qershor 2012, PG vërehet përsëri një vlerë jashtë
bishtave të kutisë (34.2‰). Mesorja e kripshmërisë për vitin 2012 është 1.1 ‰ më e
madhe se e vitit 2011.
Sipas kripshmërisë për ujërat bregdetare shqiptare (30 - 39 ‰) (Shumka, 2005), këto
vlera janë brenda diapazonit për të gjithë stacionet e studiuara. Mesatarja e kripshmërisë
të ujit për secilin stacion rezultoi brenda diapazonit të mesatares së kripshmërisë për
Gjirin e Durrësit (35.8 - 38.22 ‰) (OSI, 2002; Gjyli et al., 2013a, b). Në të dy vitet si
2011 dhe 2012, stacioni me kripshmëri më të ulët rezulton KP. Kjo tregon edhe ndikimin
e shkarkimit të ujërave të ëmbla në këtë stacion.
Referuar kripshmërisë të ujërave sipërfaqësore të Adriatikut Jugor (37.93 ‰) (Manca et
al., 2004), rezulton se kripshmëria për ujërat sipërfaqësore të Gjirit të Durrësit për vitin
2011 & 2012 (37.1 ‰) u paraqit 0.83 ‰ më e ulët se e Adriatikut Jugor (Tab. 5.5, Graf
5.21). Pra, kripshmëria e ujit të Gjirit të Durrësit është më të ulët se e ujërave
sipërfaqësore të Detit Adriatik Jugor me ndryshimin afro 1 ‰, që tregon edhe ndikimin e
shkarkimit të ujërave të ëmbla nga toka përgjatë bregut të Gjirit të Durrësit.
Figura 5.5. Stacioni Kanali i Ujërave të Qytetit të Durrësit.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
52
5.1.1.6 Turbullia
Vlerat e turbullisë (NTU) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e Durrësit sipas muajve dhe
përpunimi i tyre statistikor paraqitet në tabelën 5.6, dhe grafikët 5.26 - 5-30.
Tabela 5.6. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e turbullisë (NTU) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC gjatë viteve 2011
dhe 2012.
Turbullia (NTU) PG KP PH IPK KUQD PC
20
11
Max. 7.79 13.4 11.22 11.54 13.1 7.12
Min. 0.72 0.41 1.71 0.92 1.97 0.98
Mesatarja 3.76 5.32 4.61 3.97 4.95 3.88
Mes. Totale ± DS 4.41 ± 3.42
2012
Max. 12.44 14.77 10.15 6.37 68 11.14
Min. 2 2.8 3.01 1.01 2.48 0.32
Mesatarja 5.89 9.54 6.65 3.41 19.01 4.22
Mes. Totale ± DS 8.12 ± 12.13
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Vlerat e turbullisë më të larta (13.4 NTU dhe 68 NTU) u shënuan përkatësisht në Gusht
2011 në stacionin KP dhe Shtator 2012 në KUQD, ndërsa vlerat minimale (0.41 NTU dhe
0.32 NTU) në Tetor, 2011, KP dhe Tetor 2012, PC. Niveli tepër i lartë i turbullisë në
KUQD, përkon me derdhjen e ujërave të ndotura, përfshirë dhe ujërat e zeza në këtë
stacion, gjatë kohës kur pompat e ujit janë në aktivitetin e tyre maksimal (Gjyli &
Kolitari, 2011; Gjyli et al., 2013a, b) (Tab. 5.6, Graf. 5.26).
Grafiku 5.26. Vlerat e turbullisë (NTU) të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
53
Mesatarja e turbullisë të vitit 2012 ishte 3.71 NTU ± 8.91 (ose 1.8 herë) më e lartë se e
vitit 2011, duke treguar që ujërat bregdetare paraqiten më të turbullta gjatë vitit 2012
(Gjyli et al., 2013b). Në vitin 2011, KP renditet në krye të renditjes së stacioneve për
turbulli (5.32 NTU), kurse në fund renditet PC (3.76 NTU). Në vitin 2012, KUQD
renditet në krye të renditjes së stacioneve për turbulli (19.01 NTU), kurse në fund renditet
IPK (3.41 NTU).
Vlerat e e turbullisë për vitin 2011 paraqesin shmangie të lartë duke ju afruar mesatares,
kurse në vitin 2012, shmangia është tepër e lartë duke tejkaluar mesataren 1.5 herë.
Shkak mund të jenë ndotjet nga shkarkimet e vazhdueshme në det të ujërave me ngarkesë
të lartë lëndësh organike sikurse ujërat e zeza, veçanërisht gjatë natës dhe herët në
mëngjes (Fig. 5.7), që ndjehet nga era e rëndë përgjatë bregut. Stacionet më problematike
janë KP & KUQD. Ndërtimi i impiantit të ujërave të zeza në Shën Vlash, që pritet të
vihet në punë do ta zgjidhte përfundimisht derdhjen e ujërave të zeza të papërpunuara në
det si të zonës bregdetare nga Shkëmbi i Kavajës deri në Currila dhe të qytetit të Durrësit.
Fakt është se pjesa më e madhe e ujërave të zeza të qytetit, derdhen drejtpërdrejt në det
përmes një kanali në stacionin KUQD. Gjithashtu në këtë zonë janë të instaluara dhe
pompa shkarkimi të ujërave të ndotura, që vihen në punë në mënyrë të vazhdueshme.
Shkaqet e niveleve të larta të turbullisë jo natyrore në ujërat bregdetare mund të
rezultojnë nga ndikimi i sedimenteve të shkaktuara nga erozioni i rrymës së lumenjve apo
kanaleve. Lulëzimet e algave shpesh tregojnë për ngarkesë të tepruar të lëndëve ushqyese
dhe mund të jenë një shkak i turbullisë në sistemet eutrofike. Shkaqe të tjera të turbullisë
të lartë në ujërat bregdetare përfshijnë lëndën organike të tretur nga trajtimi i ujërave të
zeza dhe larjet nga ndërtimet pranë bregut, nga erozioni i bregut, nga gërmimet dhe
substancat e pasura me humus (http:www.ozcoasts.gov.au/indicators/turbidity.jsp).
Efekti më i drejtëpërdrejtë i rritjes së turbullisë është reduktimi i dritës në dispozicion të
fotosintezës për shkak të zvogëlimit të dritës nën ujë. Fitoplanktoni dhe makroalgat, që
pluskojnë janë konkurrentë më të mirë për dritën se bimët bentonike (përfshirë dhe
barërat e detit) (Duarte, 1995) dhe do të priren për t’i konkuruar ato kur drita bëhet
kufizuese gjatë eutrofizimit progresiv. Në këtë mënyrë, turbullia kontrollon biomasën e
fitoplanktonit (Cloern, 1987; Monbet, 1992).
Grafiku 5.27. Box-plot i vlerave të
turbullisë (NTU) për vitin 2011.
Grafiku 5.28. Histograma e vlerave të
turbullisë (NTU) për vitin 2011.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
54
Grafiku 5.29. Box-plot i vlerave të
turbullisë (NTU) për vitin 2012.
Grafiku 5.30. Histograma e vlerave të
turbullisë (NTU) për vitin 2012.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.27 & 5.28) vërehen se për vitin 2011, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të turbullisë, por vlerat rrahin djathtas. Gjithashtu vërejmë
katër vlera jashtë bishtave të kutisë përkatësisht 11.22 NTU Maj 2011, PH; 11.54 NTU,
Gusht 2011, IPK; 13.1 NTU, Gusht 2011, KUQD dhe 13.4 NTU Gusht 2011, KP. Kjo
tregon se mund të jenë derdhjet e ujërave të ndotura me ngarkesë të lartë lëndësh
organike në këto stacione, që sjellin vlera turbullie të larta. Mesorja ka vlerë më të vogël
se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brënda intervalit 1.975 – 5.355 NTU. Nga
paraqitjet grafike (Graf. 5.29 & 5.30) vërehen se për vitin 2012, kemi një shpërndarje
normale të vlerave të turbullisë, por vlerat rrahin djathtas. Vërehet një pikë ekstreme 68
NTU Shtator 2012, KUQD, që tregon pikun e derdhjes të një sasie të konsiderueshme të
ujërave të zeza kur pompat punojnë me kapacitet të plotë, zonë kjo pranë shëtitores
“Taulantia”. Mesorja ka vlerë gati 2-fish më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave
ndodhen brenda intervalit 0.32 – 14.77 NTU. Mesorja e turbullisë për vitin 2012 është
0.58 NTU më e madhe se e vitit 2011.
Figura 5.6. Stacioni Plazhi Currila.
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
55
5.1.1.7. Lëndët ushqyese (azoti dhe fosfori)
5.1.1.7.1. Nitratet (NO3-)
Vlerat e nitrateve (NO3-, mg/l) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e Durrësit sipas muajve
dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.7 dhe grafikët 5.31 – 5.35.
Tabela 5.7. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e NO3- (mg/l) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas viteve 2011 dhe
2012.
NO3- (mg/l) PG KP PH IPK KUQD PC
20
11 Max. 5.5 4.4 5.8 5.3 3.6 5.1
Min. 0.08 0.06 0.11 0.09 0.15 0.08
Mesatarja 1.89 1.48 1.80 1.68 1.50 1.85
Mes. Totale ± DS 1.70 ± 1.86
2012
Max. 1.6 1.5 1.5 2.1 1 1.8
Min. 0.6 0.8 0.4 0.7 0.5 0.3
Mesatarja 0.90 1.12 0.88 1.18 0.72 0.78
Mes. Totale ± DS 0.93± 0.45
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Grafiku 5.31. Vlerat e NO3
- (mg/l) të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC.
Vlerat e nitrateve NO3- më të larta (5.8 mg/l dhe 2.1 mg/l) u shënuan përkatësisht në Maj
2011 në stacionin PH dhe Gusht, 2012, IPK; ndërsa vlerat NO3- minimale (0.06 mg/l dhe
0.3 mg/l) në Tetor 2011, KP dhe Shtator & Tetor, 2012, PC (Tab. 5.7, Graf. 5.31).
Rezulton se në muajt Qershor, Shtator dhe Tetor 2011, vlerat e NO3- bien në nivele
shumë të ulëta, thuajse kemi një boshatisje të ngarkesës së nitrateve. Meqenëse azoti
stimulon rritjen e fitoplanktonit detar dhe është lënda ushqyese kryesore në eutrofikimin
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
56
bregdetar (Ryther & Dunstan, 1971), ka shumë mundësi që nitratet të jenë absorbuar
nga lulëzimet e algave (Gjyli & Kolitari, 2011; Gjyli et al., 2013a, b; Gjyli & Bacu,
2014).
Përqëndrimi i NO3- i vitit 2012 ishte 0.77 mg/l ± 8.9 (ose 1.8 herë) më i ulët se në 2011,
duke na informuar se niveli i nitrateve është reduktuar, duke përmirësuar situatën në këto
ujëra bregdetare. Në vitin 2011, PG renditet në krye të renditjes së stacioneve për NO3-
(1.89 mg/l), kurse në fund renditet KP (1.48 mg/l). Në vitin 2012, IPK renditet në krye të
renditjes së stacioneve për NO3- (1.18 mg/L), kurse në fund renditet KUQD (0.72 mg/l)
(Gjyli et al., 2013 b; Gjyli & Bacu, 2014).
Vlerat e NO3- për vitin 2011 paraqesin shmangie tepër të lartë duke tejkaluar mesataren.
Shkak mund të jetë ndotja nga shkarkimet e vazhdueshme në det të ujërave me ngarkesë
të lartë lëndësh organike sikurse ujërat e zeza, veçanërisht gjatë natës dhe herët në
mëngjes (Fig. 5.7).
Grafiku 5.32. Box plot i vlerave të
NO3- (mg/l) për vitin 2011.
Grafiku 5.33. Histograma e vlerave të
NO3- (mg/l) për vitin 2011.
Grafiku 5.34. Box plot i vlerave të
NO3- (mg/l) për vitin 2012.
Grafiku 5.35. Histograma e vlerave të
(NO3-) (mg/l) për vitin 2012.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.32 & 5.33) vërehen se për vitin 2011, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të (NO3-), por vlerat rrahin djathtas. Mesorja ka vlerë gati
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
57
2-fish më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 0.15 –
2.875 mg/l. Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.34 & 5.35) vërehen se për vitin 2012, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të NO3-, por vlerat rrahin djathtas. Vërehet një pikë jashtë
bishtave të kutisë në Gusht 2012, IPK (2.1 mg/l), që tregon ndotjet nga piku i aktivitetit
që ka baseni i Portit, sidomos me fluksin e madh të ankorimit të trageteve. Mesorja ka
vlerë më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 0.6 – 1.2
mg/l. Mesorja e NO3- për vitin 2012 është 0.0805 mg/l më e vogël se e vitit 2011.
Vlerat mesatare të NO3- të viteve 2012 dhe 2011 të konvertuara si NO3-N sipas ICES
(International Council for the Exploration of the Sea;
http://ocean.ices.dk/Tools/UnitConversion.aspx) (1µg NO3- / l = 0.225897 µg N / l) janë
përkatësisht, 0.21 mg/l dhe 0.38 mg/l. Duke i krahasuar me standardin e rekomanduar
NO3-N (0.1 mg/l) për ujërat sipërfaqësore në kushte natyrore (Chapman, 1996), këto
vlera konsiderohen më të larta se standardi (Gjyli et al., 2013b; Gjyli & Bacu, 2014).
Ujërat sipërfaqësorë në kushte natyrore rrallë kalojnë 0.1 mg/l si NO3-N, ujërat që
ndikohen nga aktivitetet humane përmbajnë deri në 5 mg/l si NO3-N, dhe shpesh
përmbajnë më pak se 1 mg/l NO3-N. Nivelet mbi 5 mg/l si NO3-N tregojnë ndotje me
origjinë humane ose shtazore ose rrjedhje të plehrave bujqësorë (Chapman, 1996).
Po të krahasojmë mesataren totale të NO3- të viteve 2011 & 2012 për IPK (1.4508 mg/l)
me mesataren e përqëndrimit e NO3- në basenin e Portit (0.1 mg/l) (Wilbur Smith
Associates, 2003), rezulton 14 herë më e lartë pas gati një dekade, që tregon ndikimin e
ndotjes nga aktivitetet portuale. Duke konvertuar NO3- në NO3-N kemi përkatësisht për
IPK dhe basenin e Portit 0.328 mg/l dhe 0.0226 mg/l, që tregon se para një dekade ujërat
portuale ishin në kushte natyrore sikurse deti i hapur, ndërsa tani shihet ndikimi negativ i
njeriut në mjedis (Tab. 5.9).
Po të krahasojmë mesataren totale të NO3- të viteve 2011 & 2012 (1.35 mg/l) me
mesataren e NO3- e ujërave sipërfaqësore të Detit Adriatik Jugor (0.57 mmol/m
3 = 0.0353
mg/l) konvertuar sipas ICES (International Council for the Exploration of the Sea;
http://ocean.ices.dk/Tools/UnitConversion.aspx) (1 µg NO3-/ l = 0.016128 µmol NO3
-/ l)
(Manca et al., 2004), rezulton rreth 38 herë më i lartë përqëndrimi i NO3- në ujërat
bregdetare të Gjirit të Durrësit. Duke konvertuar NO3- në NO3-N kemi përkatësisht: 0.305
mg/l në ujërat e Gjirit të Durrësit dhe 0.008 mg/l në ujërat e Detit Adriatik Jugor. Pra,
ndryshe nga ujërat bregdetare të Gjirit të Durrësit, ujërat sipërfaqësore të Detit Adriatik
Jugor, janë brenda standardit të ujërave sipërfaqësore në kushte natyrore (Tab. 5.9).
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
58
Figura 5.7/1. Kanale që derdhin ujëra të ndotura përgjatë bregut (nga e majta në të djathtë:
1 & 2 - KP; 3 - PG).
Figura 5.7/2. Kanale që derdhin ujëra të ndotura përgjatë bregut (nga e majta në të djathtë:
1 & 2 – KUQD, 3- kanal pranë zonës së Museut Arkeologjik, Durrës).
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
59
5.1.1.7.2. Fosfatet (PO43-
)
Vlerat e fosfateve (PO43-
, mg/l) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e Durrësit sipas muajve
dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.8, dhe grafikët 5.36 – 5.40.
Tabela 5.8. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e PO43-
(mg/l) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas viteve 2011 dhe
2012.
PO43-
(mg/l) PG KP PH IPK KUQD PC
20
11 Max 0.4 0.5 0.5 0.5 0.6 0.6
Min 0.026 0.019 0.034 0.022 0.029 0.026
Mesatarja 0.14 0.20 0.17 0.17 0.19 0.16
Mes. Totale ± DS 0.17 ± 0.20
2012
Max 0.26 0.41 0.26 0.34 0.34 0.24
Min 0.19 0.21 0.18 0.2 0.22 0.17
Mesatarja 0.23 0.28 0.23 0.25 0.27 0.22
Mes. Totale ± DS 0.25 ± 0.05
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Grafiku 5.36. Vlerat e PO4
3- (mg/l) të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC.
Vlerat e fosfateve (PO43-
) më të larta (0.6 mg/l dhe 0.41 mg/l) u shënuan përkatësisht në
Korrik 2011 në stacionin KUQD & PC dhe Qershor 2012 në KP; ndërsa vlerat e PO43-
minimale (0.019 mg/l dhe 0.17 mg/l) në Qershor 2011, KP dhe Tetor 2012, PC (Tab. 5.8,
Graf. 5.36). Rezulton se në muajt Maj, Qershor, Shtator (përjashtuar KP) dhe Tetor,
2011, vlerat e PO43-
bien në nivele shumë të ulëta, thuajse kemi një boshatisje të
ngarkesës së fosfateve. Kjo mund të ndodhë si rezultat i konsumimit të PO43-
ashtu
sikurse NO3- nga lulëzimi i algave (Gjyli & Kolitari, 2011; Gjyli et al., 2013a, b; Gjyli &
Bacu, 2014).
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
60
Përqëndrimi i PO43-
për 2012 ishte 0.08 mg/l ± 0.14 (ose 1.4 herë) më i lartë se 2011,
duke na informuar se niveli i PO43-
është rritur. Në vitin 2011, KP renditet në krye të
renditjes së stacioneve për PO43-
(0.20 mg/l), kurse në fund renditet PG (0.14 mg/l). Në
vitin 2012, KP paraqitet në krye të renditjes së stacioneve për PO43-
(0.28 mg/l), kurse në
fund renditet PC (0.22 mg/l). Vlerat e PO43-
për vitin 2011 paraqitet shmangie tepër të
lartë, duke tejkaluar mesataren. Shkak mund të jetë ndotja nga shkarkimet e vazhdueshme
në det të ujërave me ngarkesë të lartë lëndësh organike, sikurse ujërat e zeza, veçanërisht
gjatë natës dhe herët në mëngjes (Fig. 5.7) (Gjyli et al., 2013 b; Gjyli & Bacu, 2014).
Grafiku 5-37. Box plot i vlerave të
PO43-
(mg/l) për vitin 2011.
Grafiku 5-38. Histograma e vlerave të
PO43-
(mg/l) për vitin 2011.
Grafiku 5-39. Box plot i vlerave të
PO43-
(mg/l) për vitin 2012.
Grafiku 5-40. Histograma e vlerave të
PO43-
(mg/l) për vitin 2012.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.37 & 5.38) vërehen se për vitin 2011, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të PO43-
, por vlerat rrahin djathtas. Mesorja ka vlerë gati
4-fish më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 0.032 –
0.345 mg/l. Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.39 & 5.40) vërehet se për vitin 2012, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të PO43-
, por vlerat rrahin djathtas. Vërehet një pikë jashtë
bishtave të kutisë në Qershor 2012, KUQD dhe Gusht 2012, IPK (0.34 mg/l) dhe një pikë
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
61
ekstreme në Qershor 2012, KP (0.41 mg/l). Kjo tregon se ndotja nga derdhja e ujërave të
pasura me fosfor në det, kanë qënë shumë të mëdha në Qershor 2012 në KP. Po kështu në
Qershor 2012, edhe në KUQD ka patur derdhje të ujërave të zeza të konsiderueshme në
kohën e marrjes së mostrës. Kurse në Gusht 2012, IPK paraqet vlerë mbi normalen të
PO43-
, pasi është piku i aktivitetit që ka baseni i portit, sidomos me fluksin e madh të
ankorimit të trageteve. Mesorja ka vlerë më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave
ndodhen brenda intervalit 0.22 – 0.26 mg/l. Mesorja e PO43-
për vitin 2012 është 0.2 mg/l
më e madhe se e vitit 2011.
Vlerat mesatare të PO43-
të vitit 2012 & 2011 të konvertuara si PO4-P sipas ICES
(International Council for the Exploration of the Sea;
http://ocean.ices.dk/Tools/UnitConversion.aspx) (1µg PO43-
/ l = 0.326138 µg P / l) janë
përkatësisht, 0.081 mg/l dhe 0.055 mg/l. Duke i krahasuar me standardin e rekomanduar
PO4-P (0.005 - 0.020 mg/l) për ujërat sipërfaqësore në kushte natyrore (Chapman, 1996),
këto vlera konsiderohen më të larta se standardi (Gjyli et. al., 2013b; Gjyli & Bacu,
2014).
Po të krahasojmë mesataren totale të PO43-
të viteve 2011 & 2012 për IPK (0.206 mg/L)
me mesataren e përqëndrimit e PO43-
në basenin e Portit (0.008 mg/L) (Wilbur Smith
Associates, 2003), rezulton rreth 26 herë më e lartë pas gati një dekade, që tregon
ndikimin e ndotjes nga aktivitetet portuale. Duke konvertuar PO43-
në PO4-P, kemi
përkatësisht për IPK dhe basenin e Portit 0.067 mg/l dhe 0.0026 mg/l, që tregon se para
një dekade ujërat portuale ishin në kushte natyrore sikurse deti i hapur, ndërsa tani shihet
ndikimi negativ i njeriut.
Po të krahasojmë mesataren totale të PO43-
të viteve 2011 & 2012 (0.206 mg/l) me
mesataren e PO43-
të ujërave sipërfaqësore të Detit Adriatik Jugor (0.04 mmol/m3 =
0.0038 mg/L) sipas ICES (1µg PO43-
/ l = 0.010529 µmol PO43-
/ l) (Manca et al., 2004),
rezulton rreth 54 herë më i lartë përqëndrimi i PO43-
në ujërat bregdetare të Gjirit të
Durrësit. Duke konvertuar PO43-
në PO4-P, kemi përkatësisht: 0.0673 mg/l në ujërat e
Gjirit të Durrësit dhe 0.0012 mg/l në ujërat e Detit Adriatik Jugor. Pra ndryshe nga ujërat
bregdetare të Gjirit të Durrësit, ujërat sipërfaqësore të Detit Adriatik Jugor janë edhe më
të pastra se diapazoni i standardit të ujërave sipërfaqësorë në kushte natyrore (Tab. 5.9).
5.1.1.7.3. Raporti N:P në vlerësimin e faktorit kufizues të prodhimtarisë parësore
dhe ndikimi në lulëzimin e algave
Prodhimtaria parësore kufizohet nga lëndët ushqyese (azoti dhe fosfori); fosfori është më
shpesh faktori kufizues në ujërat e ëmbla (Schindler, 1974), ndërsa azoti është faktori
kufizues në ujërat detare (Ryther & Dunstan, 1971; Oviatt et al., 1995). Në diskutimet për
eutrofikimin bregdetar ushqyesi kryesor është azoti. Shtimet e azotit stimulojnë rritjen e
fitoplanktonit detar (Ryther & Dunstan, 1971). Në përgjithësi, shtesat e azotit si nitrate
apo amonium nxitin rritjen e fitoplanktonit (Howarth, 1988). Shtesat e fosforit kanë
ndikim të vogël. Megjithatë, ka raste kur kufizimi i fosforit gjendet zakonisht në mjedise
të kufizuara nga azoti (Granéli et al., 1990) si dhe mjedise detare të kufizuara nga fosfori
(Myers & Iverson, 1981).
Raporti N:P (quajtur “raporti Redfield”) është një indikator i rëndësishëm se cili ushqyes
kufizon eutrofikimin. Nëse raporti N:P > 16, fosfori (P) është faktori kufizues për rritjen e
algave (Redfield et al., 1963; Hodgkiss & Lu, 2004). Nëse N:P është midis 14 dhe 16,
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
62
janë të dy faktorë kufizues N & P (Koerselman & Meuleman, 1996) dhe nëse raporti N:P
< 14, tregon që azoti (N) është faktor kufizues për rritjen e algave (Redfield et. al., 1963;
Hodgkiss & Lu, 2004).
Kështu po të krahasojmë raportet e N:P (Tab. 5.9), sipas stacioneve për vitin 2011,
rezulton se PG dhe PC kanë faktor kufizues P, kurse KUQD dhe KP kanë faktor kufizues
N. Kurse PH dhe IPK kanë faktor kufizues N & P. Gjithashtu, edhe mesatarja totale N:P
e vitit 2011 rezulton e lidhur me të dy faktorët kufizues N & P. Megjithatë, duhet
theksuar se përqëndrimet e NO3-N dhe PO4
-P janë mbi standardin e lejuar për ujërat
sipërfaqësore sipas Chapman (1996).
Tabela 5.9. Mesataret e NO3- & PO4
3-, konvertimet përkatëse të NO3-N dhe PO4-P (mg/l &
mmol/l) dhe raporti N:P (mmol/l / mmol/l) sipas stacioneve PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC për
vitet 2011, 2012, 2011 & 2012 si dhe të Basenit të Portit sipas Wilbur Smith Associates (2003) e
Detit të Adriatikut Jugor sipas Manca et al. (2004).
Raporti
(N:P) NO3
-
(mg/l)
NO3-N
(mg/l)
NO3-N
(mmol/L)
PO43-
(mg/l)
PO4-P
(mg/l)
PO4-P
(mmol/l)
N:P
(NO3-N /
PO4-P)
Faktori
kufizues
2012
20
11
PG 1.89 0.4274 0.0305 0.14 0.0456 0.0015 20.75 P
KP 1.48 0.3349 0.0239 0.20 0.0653 0.0021 11.34 N
PH 1.80 0.4067 0.0290 0.17 0.0548 0.0018 16.41 N & P
IPK 1.68 0.3787 0.0270 0.17 0.0564 0.0018 14.86 N & P
KUQD 1.50 0.3398 0.0243 0.19 0.0632 0.0020 11.90 N
PC 1.85 0.4168 0.0298 0.16 0.0512 0.0017 18.00 P
Mes. totale 1.70 0.3840 0.0274 0.17 0.0554 0.0018 15.32 N & P
PG 0.90 0.2033 0.0145 0.23 0.0763 0.0025 5.89 N
KP 1.12 0.2530 0.0181 0.28 0.0913 0.0029 6.13 N
PH 0.88 0.1988 0.0142 0.23 0.0757 0.0024 5.81 N
IPK 1.18 0.2666 0.0190 0.25 0.0802 0.0026 7.35 N
KUQD 0.72 0.1626 0.0116 0.27 0.0887 0.0029 4.05 N
PC 0.78 0.1762 0.0126 0.22 0.0724 0.0023 5.38 N
Mes. totale 0.93 0.2101 0.0150 0.25 0.0808 0.0026 5.75 N
2011 & 2012 Mes. totale 1.3501 0.3050 0.0218 0.206 0.0673 0.0022 10.02 N
2011 & 2012 IPK 1.4508 0.3277 0.0234 0.206 0.0672 0.0022 10.78 N
Bas. Port 0.10 0.0226 0.0016 0.008 0.0026 0.00008 19.15 P
Det.Adriat. 0.0353 0.0080 0.0006 0.0038 0.0012 0.00004 14.23 N & P
Legjenda: Mes. Totale = Mesatarja Totale, Bas. Port = Baseni i Portit Detar, Durrës, Det. Adriat. = Deti
Adriatik Jugor.
Po të krahasojmë raportet N:P, sipas stacioneve për vitin 2012, rezulton se faktori
kufizues është N për të gjitha stacionet, madje edhe për mesataren totale të raportit N:P.
Kjo tregon se lulëzimi i algave për vitin 2012 është i lidhur me sasinë e azotit në
dispozicion.
Po të krasojmë mesataren totale N:P të vitit 2011 me vitin 2012, rezulton se ky raport
zvogëlohet dukshëm, duke kaluar nga faktori kufizues N & P, në faktor kufizues N për
rritjen e algave. Kjo mund të vijë për faktin se zvogëlohet përqëndrimi i NO3-N gjatë vitit
2012.
Duke krahasuar mesataren totale N:P, gjatë viteve 2011 & 2012 të Gjirit të Durrësit
(10.02) me mesataren e Detit Adriatik Jugor (14.23) (Manca et al., 2004), rezulton se
faktori kufizues në Gjirin e Durrësit është N, kurse për Detin Adriatik Jugor faktorë
kufizues janë N & P. Por, duhet theksuar se në Gjirin e Durrësit përqëndrimet NO3-N &
PO4-P janë mbi standardet e lejuara për ujërat sipërfaqësore, kurse në Detin Adriatik
Jugor përqëndrimet NO3-N & PO4
-P paraqiten brenda standardeve për ujërat
sipërfaqësore në kushte natyrore sipas Chapman (1996).
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
63
Po të krahasojmë mesataren N:P e IPK të viteve 2011 & 2012 (10.78) me mesataren N:P
të basenit të Portit (Wilbur Smith Associates, 2003) (19.15), rezulton se faktor kufizues
në IPK është N, kurse në basenin e Portit është P. Por, duhet theksuar se përqëndrimet e
NO3-N & PO4
-P janë mbi standardet e lejuara për ujërat sipërfaqësore në IPK, kurse në
basenin e Portit përqëndrimet paraqiten brenda standardeve për ujërat sipërfaqësore në
kushte natyrore sipas Chapman (1996) (Tab. 5.9).
Gjithashtu duhet theksuar se nëse N është faktor kufizues për rritjen e algave, duhen
përjashtuar algat blu të gjelbra (cianobakteret), që fiksojnë azotin atmosferik. Si rezultat,
algat blu-të gjelbra mund të rriten në përqëndrime të ulëta azoti, që kufizojnë rritjen e
llojeve të tjera të algave dhe përqëndrimet e larta të fosforit mund të rritin dendësinë e
cianobaktereve. Në këtë kuptim algat blu të gjelbra janë të kufizuara nga P (Sharpley et
al., 1984, 1995; Tiessen, 1995; Gjyli & Bacu, 2014).
5.2. Vlerësimi i klorofilës a totale (Chl a) si faktor mjedisor biotik (parametër
biologjik)
Klorofila a totale (Chl a) është një parametër i përdorur për vlerësimin e biomasës
fitoplanktonike dhe prodhimit primar. Për shkak të pranisë së saj në të gjitha qelizat
fitoplanktonike dhe përcaktimin e saj të shpejtë dhe të lehtë krahasuar me biomasën e
algave dhe prodhimin primar, Chl a përfshihet në listën e indikatorëve të eutrofizimit
brenda Direktivës të Sistemit Europian Ujor dhe Direktivës të Strategjisë Detare (Vasiliu
et al., 2010).
Përqëndrimi i Chl a si përfaqësim i biomasës fitoplanktonike paraqitet si shumë e
monovinil-klorofilës a, që gjendet tek shumica e organizmave fotosintetikë, dhe divinil-
klorofilës a, lidhur në mënyrë specifike me cianobakterin e gjinisë Prochlorococcus.
Dallimi midis këtyre dy pigmenteve siguron informacionin kryesor rreth strukturave të
komunitetit në ujërat oligotrofike, ku Prochlorococcus shpesh paraqet më shumë se 50%
të Chl a (Partensky et al., 1996; Mackey et al., 2002).
Mostrat e ujit të detit për të vlerësuar Chl a janë marrë në të gjashtë stationet: PG, KP,
PH, IPK, KUQD, PC.
Stacionet e ujërave bregdetare u monitoruan për çdo muaj për periudhën Maj-Tetor 2011
dhe Qershor-Tetor 2012. Për vitin 2011 në terren u mblodhën 36 mostra dhe për vitin
2012, 30 mostra për matjen e Chl a. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale e
(Chl a) dhe deviacioni standard sipas viteve 2011 & 2012, janë paraqitur në tabelën 5.10
dhe grafikun 5.41. Gjithashtu të dhënat për Chl a janë paraqitur përmes box plot-eve 5.42
& 5.44 dhe histogramave 5.43 & 5.45 për kuptuar shpërndarjen e saj. Rezultatet e marra
janë krahasuar me standardet ndërkombëtare të ujërave detare. Bazuar në studime
analoge mbi Detin Adriatik dhe / ose Detin Mesdhe është bërë krahasimi i rezultateve të
marra.
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
64
5.2.1. Klorofila a totale (Chl a) dhe gjendja trofike e ujërave të Gjirit të Durrësit
Vlerat e klorofilës a totale (Chl a, µg/l) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e Durrësit sipas
muajve dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.10 dhe grafikët 5.41 - 5-45.
Tabela 5.10. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e Chl a (µg/l) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas viteve 2011 dhe
2012.
Chl a (µg/l) PG KP PH IPK KUQD PC
20
11 Max 70.66 70.31 70.32 87.69 71.9 55.3
Min 23.7 14.11 29.5 26.8 33.5 14.81
Mesatarja 47.22 41.14 49.72 56.28 53.11 28.75
Mes. Totale ± DS 46.04 ± 19.04
2012
Max 31.65 35.41 33.72 28.12 39.57 25.83
Min 11.79 12.37 8.45 10.38 13.43 6.92
Mesatarja 21.91 24.47 21.27 20.55 26.44 16.26
Mes. Totale ± DS 21.82 ± 8.99
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Grafiku 5.41. Vlerat e Chl a (µg/l) të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH, IPK, KUQD,
PC dhe kufjtë sipas klasave ushqyese.
Përqëndrimet e Chl a më të larta (87.69 µg/l dhe 39.57 µg/l) u shënuan përkatësisht në
Qershor 2011 në stacionin IPK dhe Shtator 2012 në KUQD; ndërsa përqëndrimet
minimale (14.11 µg/l dhe 6.92 µg/l) në Qershor 2011, KP dhe Qershor 2012, PC (Tab.
5.10, Graf. 5.41) (Gjyli & Kolitari, 2010; Gjyli et al., 2013a, b; Gjyli & Bacu, 2014).
Mesatarja e Chl a për vitin 2012 ishte 24.22 µg/l ± 0.91 (ose 2.1 herë) më e vogël se
2011, duke treguar se gjendja ushqyese e ujërave bregdetare është zvogëluar dukshëm.
Në vitin 2011, IPK paraqitet në krye të renditjes së stacioneve për Chl a (56.28 µg/l),
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
65
kurse në fund renditet PC (28.75 µg/l). Në vitin 2012, KUQD renditet në krye të renditjes
së stacioneve për Chl a (26.44 µg/l), kurse në fund renditet PC (16.26 µg/l) (Gjyli &
Bacu, 2014).
Grafiku 5.42. Box plot i vlerave të
Chl a (µg/l) për vitin 2011.
Grafiku 5.43. Histograma e vlerave të
Chl a (µg/l) për vitin 2011.
Grafiku 5.44. Box plot i vlerave të
Chl a (µg/l) për vitin 2012.
Grafiku 5.45. Histograma e vlerave të Chl a (µg/l) për vitin 2012.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.42 & 5.43) vërehen se për vitin 2011, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të Chl a, por vlerat rrahin majtas. Mesorja ka vlerë më të
madhe se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 30.4 – 62.44 µg/l.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.44 & 5.45) vërehen se për vitin 2012, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të Chl a, por vlerat rrahin djathtas. Mesorja ka vlerë më të
vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 15.59 – 28.78 µg/l.
Mesorja e Chl a, për vitin 2012 është më e vogël se e vitit 2011.
Gjendja e ujërave bregdetare të Gjirit të Durrësit është përmirësuar në vitin 2012. Mund
të ketë dhënë ndikimin e vet vendosja e filtrave të posaçëm në KP gjatë 2012. Gjithashtu
mund të ketë dhënë ndikimin e vet zbatimi me vendosmëri i ligjit për mbrojtjen e mjedisit
nga autoritetet vendore me gjobitjen ose bllokimin e aktiviteteve të atyre subjekteve të
Gjyli L. (2014). Identikifimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
66
ndërtesave të banimit, hoteleve dhe bizneseve që derdhin ujëra të ndotura, përfshirë dhe
ujëra të zeza gjatë sezonit të plazhit të vitit 2012 (Gjyli et al., 2013b; Gjyli & Bacu,
2014).
Sipas Håkanson et al. (2007), sistemet e ujërave bregdetare të niveleve të ndryshme
trofike bazuar në përmbajtjen e Chl a (modifikuar nga OECD, 1982; Håkanson &
Jansson, 1983; Wallin et al., 1992), klasifikohen në katër klasa ushqyese: oligotrofike
(Chl a < 2 µg/l), mezotrofike (2 – 6 µg/l), eutrofike (6 – 20 µg/l), hipertrofike (> 20 µg/l).
Zonat eutrofike janë zona me prodhimtari të lartë parësore, për shkak të ushqyesve me
tepricë që bëhen subjekt i lulëzimit të algave, rezultojnë në cilësi të dobët të ujit. Kur
rritet shumë numri i algave dhe prodhojnë biotoksina, rezultojnë me lulëzim të algave të
dëmshme (HABs) sipas UNEP/MAP (2012).
Të gjithë stacionet kategorizohen në klasën hipertrofike për të dy vitet, përjashtuar PC në
klasën eutrofike për vitin 2012. Ujërat e zeza mbeten burimi kryesor i ndotjes së ujit,
veçanërisht shtimi i ngarkesës me lëndë ushqyese sjell lulëzimin e algave që shpie në
pakësimin e oksigjenit në ujë. Trajtimi i ujërave të zeza dhe menaxhimi i hedhjes së
mbeturinave duhet që jetë me prioritet të lartë. Vënia në funksionim e impiantit të
përpunimit të ujërave të zeza në Shën Vlash do ta përmirësojë dukshëm gjendjen trofike
të ujërave bregdetare, për të kaluar nga klasa hipertrofike në klasën eutrofike,
mezotrofike apo oligotrofike (Gjyli et al., 2013a, b; Gjyli & Bacu, 2014).
Sipas EPA (2008), ujërat hipertrofike janë shumë të pasura me ushqyes dhe
karakterizohen nga lulëzime të algave dhe trasparencë të ulët.
Mesatarja Chl a në Gjirin e Durrësit për vitet 2011 & 2012, (35.03 µg/L) është gati 175
herë më e madhe se mesatarja ndër vite e Detit Mesdhe (<0.2 µg/l) (Siokou-Frangou et
al., 2010), i cili përfshihet në klasën oligotrofike.
Krahasuar me ujërat sipërfaqësore të Detit Adriatik Jugor, ku sipas përqëndrimit mesatar
të Chl a në Gusht në vitet 1997-1998 (0.27 µg/l) (Boldrin et al., 2002), përfshihen në
klasën oligotrofike; kurse ujërat e bregdetit të Gjirit të Durrësit në Gusht në vitet 2011 &
2012 (42.78 µg/l) përfshihen në klasën hipertrofike.
Në ujërat bregdetare sipërfaqësore të Gjirit të Kotorrit në Mal të Zi, përqëndrimet e Chl a
variojnë nga 0.12 – 9.30 µg/l për periudhën Shkurt 2008 – Dhjetor 2010 (Krivokapić et
al., 2010). Ujërat e Gjirit të Kotorrit, kur Chl a arrin vlera maksimale, kalojnë nga klasa
oligotrofike deri në atë eutrofike; ndryshe nga ujërat e Gjirit të Durrësit, që paraqiten në
klasën eutrofike dhe hipertrofike.
Referuar ujërave bregdetare sipërfaqësore të Gjirit të Vlorës në Maj, 2007, Chl a ka
mesataren 0.25 µg/l, duke u paraqitur në nivel oligotrofik (Mangoni et al., 2011). Kjo
tregon ndikimin negativ në cilësinë e ujërave, që sjell derdhja e ujërave të pasura me
lëndë ushqyese në ujërat Gjirit e Durrësit.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
67
5.3. Vlerësimi sasior i ADN-së fitoplanktonike dhe prania e gjinisë Synechococcus
Fakti që lidhja midis përbërjes molekulare (p.sh. ARN-së, ADN-së dhe proteinave) dhe
shkallës së rritjes se cianobaktereve mund të përshkruhen në terma të thjeshtë
matematikorë dhe shfaqen të jenë të pavarur nga faktorët mjedisorë specifikë, që
përcaktojnë shkallën e rritjes. Prandaj mbështetet ideja e përdorimit të përbërjes
biokimike të plotë për të vlerësuar në vend shkallën e rritjes të popullatave mikrobike
natyrore (Dortch et al., 1983; Kemp et al., 1993). Meqenëse sasia e ADN-së për qelizë të
fitoplanktonit është nje parametër i pandryshueshëm nën ndikimin e kushteve mjedisore,
bën që matja e sasisë të ADN-së fitoplanktonike në ujërat e Gjirit të Durrësit të jetë një
nga parametrat më të sigurt për vlerësimin sasior të biomasës së fitoplanktonit. Matja e
këtij parametri ofron informacion mbi sasinë për volum uji të qelizave të fitoplanktonit,
pavarësisht nga intensiteti i aktivitetit biologjik të këtyre qelizave (Bacu et al., 2010).
Matja e sasisë ADN-së për volum uji, do të tregojë vlera në përpjestim të drejtë me sasinë
reale të fitoplanktonit, në një periudhë të caktuar, në kushte të caktuara mjedisore, duke
mundësuar evidentimin e ndryshimeve të sasisë së biomasës fitoplanktonike në Gjirin e
Durrësit. Mostrat e ujit të detit për të vlerësuar sasinë e ADN-së fitoplanktonike si dhe
praninë e gjinisë Synechococcus janë marrë në gjashtë stationet: PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC, për çdo muaj për periudhën Prill – Tetor, 2011 dhe Qershor – Tetor, 2012.
Për vitin 2011 dhe 2012, u mblodhën në terren përkatësisht 42 mostra dhe 30 mostra.
Vlerësimi sasior i ADN-së fitoplanktonike, u krye sipas muajve, stinëve, viteve dhe
stacioneve. Për një analizë më të plotë të vlerave dhe shpërndarjes së ADN-së
fitoplanktonike, të dhënat u përpunuan përmes box plot-eve dhe histogramave.
U evidentua prania e gjinisë Synechococcus përmes shumëfishimit të sekuencës gjenike
16SrARN. Gjithashtu është analizuar ndikimi i metaleve të rënda në rritjen e
Synechococcus dhe fitoplanktonit. U realizua lidhja midis ADN-së fitoplanktonike dhe
faktorëve mjedisorë, si dhe faktorëve mjedisorë me njëri-tjetrin, si dhe analiza faktoriale
dhe grupimit të parametrave dhe stacioneve të ngjashëm.
5.3.1. Vlerësimi i pastërtisë së ADN-së fitoplanktonike
ADN-ja e ekstraktuar nga fitoplanktoni i siguruar në filtrimin e parë të mostrave të ujit të
detit, u analizua për cilësinë (pastërtinë) dhe sasinë. Përcaktimet spektrofotometrike të
ADN-së fitoplanktonike sipas stacioneve PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC, në periudhën
Prill - Tetor, 2011 & Qershor – Tetor, 2012; rezultuan në raporte OD260/OD280 1.6 - 1.8
dhe më të vogla se 1.6. Vlerat më të vogla se 1.6 tregojnë praninë e proteinave dhe / ose
absorberëve të tjerë , ndaj dhe u bë purifikimi i acideve nukleike (CIMMYT, 2005;
Grazhdani, 2008).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
68
5.3.2. Sasia e ADN-së fitoplanktonike sipas muajve
Vlerat e ADN-së fitoplanktonike (ADN fitopl., µg/ml) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin
e Durrësit sipas muajve dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.11 dhe
grafikët 5.46 – 5.50.
Tabela 5.11. Maksimumi, minimumi, mesatarja, mesatarja totale dhe deviacioni standard për
vlerat e ADN fitopl. (µg/ml) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas viteve
2011 dhe 2012.
ADN fitopl. (µg/ml) PG KP PH IPK KUQD PC
20
11
Max. 470 676 400 350 626 370
Min. 138 147 158 132 137 167
Mesatarja 266.42 313.09 251.53 238.01 302.81 249.37
Mes. Totale ± DS 270.20 ± 118.44
2012
Max. 160 133 143 140 189 150
Min. 60 60 60 40 62 30
Mesatarja 102.00 98.67 104.73 86.12 116.14 88.87
Mes. Totale ± DS 99.42 ± 40.52
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = mesatarja totale, DS = deviacioni
standard.
Grafiku 5.46. Përqëndrimi i ADN fitopl. (µg/ml) matur sipas muajve në stacionet: PG, KP, PH,
IPK, KUQD, PC.
Përqëndrimet e ADN-së fitoplanktonike (ADN fitopl.) më të larta (676 µg/ml dhe 189
µg/ml) u shënuan përkatësisht në Shtator 2011 në stacionin KP dhe Gusht 2012, KUQD;
ndërsa vlerat minimale (132 µg/ml dhe 30 µg/ml) përkatësisht në Prill 2011, IPK dhe
Tetor 2012, PC. Përveç vlerës maksimale në Shtator 2011, KP, vërejmë vlera të larta në
Gusht 2011 përkatësisht në KUQD (626 µg/mL) si dhe PG (470 µg/ml) (Gjyli et al.,
2013a, b) (Tab. 5.11, Graf. 5.46). Këto vlera maksimale të ADN fitopl. korrelojnë me
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
69
derdhjen e ujërave të ndotura, zakonisht derdhjen e ujërave të zeza nga hotelet e bizneset
si dhe kodrat përreth gjatë bregut të Gjirit të Durrësit, si dhe prurjet e ujërave të zeza të
papërpunuara të ujëmbledhësit Shkallnur-Arapaj dhe shkarkimit të tyre në zonën e bregut
Kavaleshencë-Shkëmbi i Kavajës.
Kanali i Plepave derdh vazhdimisht ujëra të zeza direkt në det dhe një aromë e rëndë
ndjehet në stacionin KP. Gjithashtu edhe stacioni KUQD paraqet të njëjtën problematikë
të derdhjes së ujërave të ndotura të qytetit të Durrësit, veçanërisht nga kodër Vila dhe
bizneset përreth bregut. Ujërat e zeza vërehen qartë kur vihen në punë pompat, që i
shkarkojnë ato të patrajtuara drejtpërdrejtë në det.
Ndërsa, mesatarja e ADN fitopl. për vitin 2012 ishte 170.78 µg/ml ± 88.52 (ose 2.7 herë)
më e vogël se 2011 (Gjyli et al., 2013b).
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.47 & 5.48) vërehen se për vitin 2011, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të ADN fitopl., por vlerat rrahin djathtas. Mesorja ka vlerë
më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 188.89 – 330
µg/ml. Vërehen dy pika jashtë bishtave të kutisë në Shtator 2011, KP (676 µg/mL) dhe
Gusht 2011, KUQD (626 µg/ml). Mund të jetë ndotja e ujërave detare të ngarkuara me
lëndë ushqyese, që sjell këtë rritje tepër të lartë të biomasës së fitoplanktonit.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.49 & 5.50) vërehen se për vitin 2012, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të ADN fitopl., por vlerat rrahin djathtas. Mesorja ka vlerë
më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 70 – 133.33
µg/ml. Mesorja e ADN fitopl., për vitin 2012 është 164.6 µg/ml më e vogël se e vitit
2011. Kjo konfirmon faktin se sasia e biomasës së fitoplanktonit është zvogëluar nga viti
2011 në vitin 2012.
Grafiku 5.47. Box plot i vlerave të
ADN fitopl. (µg/ml) për vitin 2011. Grafiku 5.48. Histograma e vlerave të
ADN fitopl. (µg/ml) për vitin 2011.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
70
Grafiku 5.49. Box plot i vlerave të
ADN fitopl. (µg/ml) për vitin 2012. Grafiku 5.50. Histograma e vlerave të
ADN fitopl. (µg/ml) për vitin 2012.
5.3.3. Variacioni i sasisë ADN-së fitoplanktonike sipas stinëve
Vlerat e ADN-së fitoplanktonike (ADN fitopl., µg/ml) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin
e Durrësit sipas stinëve dhe përpunimi i tyre statistikor, paraqiten në tabelat 5.12 & 5.15
dhe grafikët 5.51 - 5.53.
Tabela 5.12. Maksimumi, minimumi, dhe mesatarja për vlerat e ADN fitopl. (µg/ml) në stacionet
PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas stinëve Pranverë, Verë dhe Vjeshtë, 2011 & Verë dhe
Vjeshtë, 2012.
ADN fitopl.
(µg/ml) Pranverë '11 Verë '11 Vjeshtë '11 Verë '12 Vjeshtë '12
PG 162 314 300 113 85
KP 158 300 488 121 65
PH 174 264 310 128 70
IPK 147 264 290 114 45
KUQD 163 375 335 146 71
PC 173 280 280 114 51
Max. 174 375 488 146 85
Min. 147 264 280 113 45
Mesatarja 162.73 299.44 333.82 122.69 64.51
Legjenda: Max = maksimumi, Min = minimum.
Duke ju referuar mesatareve të sasisë së ADN fitopl. sipas stinëve të studiuara, Pranverë,
Verë & Vjeshtë 2011 si dhe Verë & Vjeshtë 2012, rezulton se stina më e bollshme është
Vjeshta 2011 (333.82 µg/ml), kurse stina me e varfër është Vjeshta 2012 (64.51 µg/ml).
Në Pranverën e vitit 2011, vlera maksimale e ADN fitopl. rezultoi në PH (174 µg/ml),
kurse vlera minimale në IPK (147 µg/ml) (Gjyli et al., 2013a).
Në Verën 2011, vlera maksimale e ADN fitopl. rezultoi në KUQD (375 µg/ml), kurse
vlera minimale në PH & IPK (264 µg/ml) (Gjyli et al., 2013a). Ndërsa në Verën 2012,
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
71
vlera maksimale e ADN fitopl. rezultoi në KUQD (146 µg/mL), kurse vlera minimale në
PG (113 µg/ml). Duke krahasuar Verën 2012 me Verën 2011, vërejmë se sasia e ADN
fitopl. është 2.4 herë më e vogël, duke konfirmuar zvogëlim të biomasës fitoplanktonike.
Në Vjeshtën 2011, vlera maksimale e ADN fitopl. u shënua në KP (488 µg/ml), kurse
vlera minimale në PC (280 µg/ml) (Gjyli et al., 2013a). Ndërsa në Vjeshtën 2012, vlera
maksimale u shënua në PG (85 µg/ml), kurse vlera minimale në IPK (45 µg/ml).
Duke krahasuar Vjeshtën 2012 me Vjeshtën 2011, vërejmë se sasia e ADN fitopl. është
5.2 herë më e vogël, çka tregon se biomasa fitoplantonike ka rënë dukshëm. Masat e
marra nga autoritet vendore lidhur me ndotjet nga ujërat e ndotura mund të ketë dhënë
impakin e vet (Tab. 5.12, Graf. 5.51).
Grafiku 5.51. Vlerat e ADN fitopl. (µg/ml) të matura sipas stinëve Pranverë, Verë & Vjeshtë
2011 dhe Verë & Vjeshtë 2012 në stacionet: PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC.
Tabela 5.13. Maksimumi, minimumi, dhe mesatarja për vlerat e ADN fitopl. (µg/ml) në stacionet
ADN fitopl. të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas stinëve Pranverë, Verë
dhe Vjeshtë për të dy vitet së bashku.
ADN fitopl. (µg/ml) Pranverë Verë Vjeshtë
PG 162 214 193
KP 158 211 276
PH 174 196 190
IPK 147 189 168
KUQD 163 261 203
PC 173 197 165
Max. 174 261 276
Min. 147 189 165
Mesatarja 162.73 211.07 199.17
Legjenda: Max = maksimumi, Min = minimumi.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
72
Në Pranverë, vlera maksimale e ADN fitopl. rezultoi në PH (174 µg/ml), kurse vlera
minimale në IPK (147 µg/ml) (Gjyli et al., 2013a).
Në Verë, vlera maksimale e ADN fitopl. rezultoi në KUQD (261 µg/ml), kurse vlera
minimale në IPK (189 µg/ml).
Në Vjeshtë, vlera maksimale e ADN fitopl. rezultoi në KP (276 µg/ml), kurse vlera
minimale në PC (165 µg/ml) (Tab. 5.13, Graf. 5.52).
Grafiku 5.52. Vlerat e ADN fitopl. (µg/ml) sipas stinëve për të dy vitet së bashku 2011 & 2012,
në stacionet: PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC.
Sasia në përqindje e ADN fitopl. (Tab. 5.13, Graf. 5.53) ishte më e lartë në Verë (37 %),
kurse në Verë dhe Pranverë ishte më e ulët, respektivisht 35 % dhe 28 %. Kjo konfirmon
që stina e Verës paraqet kushtet mjedisore më të mira për të prodhuar biomasë
fitoplanktoni, përfshirë biomasën e pikofitoplanktonit në ujërat e Gjirit të Durrësit.
Grafiku 5.53. Shpërndarja e sasisë së ADN fitopl. në përqindje sipas stinëve për vitet 2011 &
2012 dhe për të gjitha stacionet: PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
73
5.3.4. Sasia e ADN-së fitoplanktonike sipas stacioneve dhe diskutime mbi ndikimin e
metaleve të rënda në rritjen e fitoplanktonit
Vlerat e ADN-së fitoplanktonike (ADN fitopl.) të ujërave sipërfaqësore në Gjirin e
Durrësit sipas stacioneve dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën 5.14 dhe
grafikët 5.54 – 5.56.
Tabela 5.14. Sasia e ADN fitopl. mesatare sipas stacioneve PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC, për
vitet 2011, 2012 dhe 2011 & 2012.
ADN fitopl.
(µg/ml) PG KP PH IPK KUQD PC Max Min
Mes.
Totale
Mes. 2011 266.42 313.09 251.53 238.01 302.81 249.37 313.09 238.01 270.20
Mes. 2012 102.00 98.67 104.73 86.12 116.14 88.87 116.14 86.12 99.42
Mes.
2011&2012 197.91 223.75 190.36 174.72 225.03 182.50 225.03 174.72 199.04
Legjenda: Mes. = Mesatarja
Në vitin 2011, KP rezultoi me përqindjen më të lartë të ADN fitopl. me 19.3 % dhe më
pas rezultoi KUQD me 18.7 %. Më pas renditen PG, PH, dhe në fund PC & IPK
përkatësisht me 15.4 % dhe 14.7 % (Tab. 5.14, Graf. 5.54). Kjo konfirmon faktin se
derdhja e ujërave të ndotura, përfshirë dhe ujërave të zeza të pasura me lëndë ushqyese në
stacionet KP dhe KUQD, shpien në një nivel më të lartë të ADN fitopl. sesa stacionet e
tjera (Gjyli et al., 2013a).
Grafiku 5.54. Shpërndarja e sasisë së ADN fitopl. (%) sipas stacioneve PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC për vitin 2011.
Për vitin 2012, KUQD rezultoi me përqindjen më të lartë të ADN fitopl. me 19.5 %,
pastaj renditen PH, PG, KP, dhe në fund renditen PC & IPK përkatësisht me 14.9 % dhe
14.4 % (Tab. 5.14, Graf. 5.55) (Gjyli et al., 2013b).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
74
Grafiku 5.55. Shpërndarja e sasisë së ADN fitopl. (%) sipas stacioneve PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC për vitin 2012.
Në vitet 2011 & 2012, KUQD renditet në vendin e parë përsa i përket mesatares së ADN
fitopl. me 18.8%, kurse në vendin e dytë KP me 18.7 %. Më pas renditen PG, PH dhe në
fund PC & IPK përkatësisht me 17.9 % dhe 14.6 % (Tab. 5.14, Graf. 5.56).
Grafiku 5.56. Shpërndarja e sasisë së ADN fitopl. (%) sipas stacioneve PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC për vitet 2011 & 2012.
Mesatarja më e lartë në përqindje për ADN fitopl. në vitin 2011, 2012 si dhe 2011 &
2012 rezultoi në KUQD dhe KP.
Duke krahasuar përmbajtjen e ADN fitopl. të vitit 2012 me vitin 2011, si dhe për të dyja
vitet së bashku për secilin stacion (Tab. 5.14, Graf. 5.54 – 5.56), vëzhgojmë se KP
renditet në vendin e katërt në 2012, ndërsa në 2011 në vendin e parë, kurse për të dyja
vitet së bashku 2011 & 2012 në vendin e dytë.
Në marrjen e këtyre rezultateve në këtë stacion ka ndikuar vendosja e filtrave të
përshtatshëm në grykëderdhjen e kanalit të Plepave, gjatë sezonit të plazhit për vitin 2012
ose vendosja e gjobave nga autoritetet lokale për ato hotele apo biznese, që derdhin ujëra
të ndotura përfshirë dhe ujërat e zeza përgjatë bregut të Gjirit të Durrësit, veçanërisht në
zonën e Golemit.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
75
Në vitin 2012, KUQD renditet në vendin e parë për përmbajtjen e ADN fitopl, në vitin
2011 në vendin e dytë, kurse në vitet 2011 & 2012 në vendin e parë (Tab. 5.14, Graf.
5.54 – 5.56). Pasurimi i këtij stacioni me lëndë ushqyese nga derdhjet e ujërave të
ndotura, përfshirë dhe ujërat e zeza të qytetit të Durrësit, veçanërisht nga zona Kodër
Vilë, mund të jetë arsyeja e nivelit të lartë të fitoplanktonit krahasuar me stacionet e tjera
(Gjyli et al., 2013b).
Mesatarja më e ulët në përqindje për ADN fitopl. në vitin 2011, 2012 si dhe vitet 2011 &
2012 paraqitet në IPK. Inhibimi i rritjes së baktereve heterotrofe vërehet në të njëjtin
stacion të basenit të Portit të Durrësit (Gjyli & Mukli, 2010). Bakteret heterotrofe
(emërtuar: "baktere"), konsiderohen së bashku me pikofitoplanktonin si pikoplankton
(Azam et al., 1983). Ky inhibimi mund të vijë si rezultat i ndotjeve nga lëndë kimike
sikurse nafta, vaji, metalet e rënda. Niveli i lartë i metaleve të rënda në basen mund të jetë
një arsye që pengon rritjen e fitoplanktonit. Kjo situatë është e ngjashme edhe në
stacionin PC, pasi ky stacion renditet gjithmonë i parafundit, pra pas IPK si për vitin
2011, 2012 dhe 2011 & 2012(Gjyli et al., 2013b).
Referuar studimeve të mëparshme për metalet e rënda (Wilbur Smith Associates, 2003;
Abeshi et al., 2008) të sedimenteve në basenin e Portit e Durrësit dhe sedimenteve e të
ujit në zonën e Currilave, krahasuar me nivelet e Detit Mesdhe dhe Detit Adriatik
(UNEP), nivelet e metaleve të rënda në stacionet IPK dhe PC paraqiten si më poshtë.
Në IPK nivelet janë: Hg 0.098 mg/kg, Pb 69.28 mg/kg, Cu 28.62 mg/kg, Cd 0.27 mg/kg,
Cr 224.57 mg/kg, Ni 185.43 mg/kg, Mn 596.05 mg/kg, Zn 78.19 mg/kg, Fe 27982.7
mg/kg.
Në PC nivelet janë: Hg 0.101 mg/kg, Cd 0.079 mg/kg, Pb 21.13 mg/kg, Cr 114.21 mg/kg.
Për Hg nivelet në sediment janë të njëjta ose pak më të mëdha se niveli bazë i Hg për
Detin Mesdhe (0.100 mg/kg) në IPK dhe PC.
Për Cd nivelet janë respektivisht 1.8 herë më të larta dhe 1.9 herë më të ulëta se niveli
bazë i Cd për Detin Mesdhe (0.15 mg/kg) në IPK dhe PC.
Për Pb nivelet në IPK dhe PC janë respektivisht 2.7 herë më të mëdha dhe 1.2 herë më të
vogla se niveli bazë i Pb për Detin Mesdhe (25 mg/kg).
Për Cr nivelet në IPK dhe PC janë respektivisht 3.7 dhe 1.9 herë më të mëdha sesa nivelet
e sedimenteve për Detin Adriatik (60 mg/kg).
Për Cd niveli është 1.7 herë më i madh sesa niveli bazë (0.047 mg/kg në Detin Adriatik)
në stacionin PC.
Për Pb niveli është 2.4 herë më i madh sesa niveli bazë (8.76 mg/kg në Detin Adriatik) në
stacionin PC.
Në PC metalet e rënda në ujë janë: Hg 0.041 µg/l, Cd 0.122 µg/l, Pb 0.60 µg/l, Cr 0.66
µg/l.
Vlerat e Cd dhe Pb në PC janë brenda diapazonit të niveleve bazë për Detin Mesdhe
(përkatësisht 0.002 - 0.90 µg/l dhe 0.016 – 20.5 µg/l).
Bazuar në këto studime të Wilbur Smith Associates (2003) dhe Abeshi et al. (2008) për
metalet e rënda mund të themi se: IPK ka nivel më të lartë metalesh të rënda se PC.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
76
Nivelet e metaleve të rënda në IPK & PC janë më të mëdha se niveli bazë në sedimentet e
Detit Mesdhe dhe Detit Adriatik, përjashtuar vlerat e Cd dhe Pb në stacionin PC, që janë
më të larta se niveli bazë në Detin Adriatik, por nuk janë më të larta se niveli bazë i tyre
në Detin Mesdhe. Gjithashtu vlerat e Cd dhe Pb në ujë për PC janë brenda diapazonit të
vlerave për Detin Mesdhe (Gjyli et al., 2013b).
5.3.5. Prania e cianobakterit Synechococcus dhe diskutime mbi ndikimin e metaleve
të rënda në rritjen e tij
Rezultatet e shumëfishimit tregojnë që pikofitoplanktoni prokariotik Synechococcus
paraqitet i pranishëm në të gjashtë stacionet e marrjes së mostrave (Fig. 5.8). Ky produkt
ishte 400-450 bp dhe u prodhua me sukses. Kjo konfirmon faktin se metalet e rënda të
pranishme në basenin e Portit të Durrësit (IPK) dhe në zonën e Currilave (PC) mbi
nivelin bazë të lejuar (Wilbur Smith Associates, 2003; Abeshi et al., 2008), nuk pengojnë
rritjen e cianobakterit Synechococcus dhe se ky cianobakter përmban mekanizma
mbrojtës kundër ekspozimit të metaleve të rënda në mjedis (Gjyli et al., 2013b; Gjyli &
Bacu, in press; Bacu et al., 2013).
Por megjithatë, sasia ADN-së fitoplanktonike në këto dy stacione paraqitet më e ulët
krahasuar me stacionet e tjera. Po kështu sasia e pikozooplanktonit (bakteret
“heterotrofe” dhe total koliformët) në IPK ka rezultuar në nivele shumë të ulëta, që
tregon për inhibim të rritjes së fitoplanktonit dhe pikozooplanktonit nën ndikimin e
pranisë së nivelit të lartë të metaleve të rënda (Gjyli et al., 2013a, b; Gjyli & Mukli,
2010).
Figura 5.8. Produktet e PCR të fragmenteve ribozomale nga shtamet cianobakteriale të
Synechoccocus amplifikuar nga ADN-ja fitoplanktonike në të gjitha stacionet.
Legjenda: Nga e majta në të djathtë: M = Marker 1 kbp; 1 = PG; 2= KP, 3 = PH; 4 = IPK; 5 = KUQD; 6 =
PC, M = Marker 1 kbp.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
77
5.3.6. Analiza e lidhjeve dhe e grupimit të parametrave dhe stacioneve marrë në
studim
5.3.6.1. Lidhja e ADN-së fitoplanktonike me faktorët mjedisorë
Sipas analizës së regresionit linear të shumëfishtë midis variablit të varur të ADN-së
fitoplanktonike dhe variableve të pavarur Chl a dhe faktorëve mjedisorë abiotik
(temperatura, pH, oksigjeni i tretur, ngopja me oksigjen, kripshmëria, turbullia, nitratet,
fosfatet) studiuar për gjithë mostrat në vitet 2011 – 2012, koefiçienti i përcaktimit rezultoi
R2 = 0.75 (p-value ≤ 0.01) (Graf. 5.57). Kjo do të thotë se 75% e variacionit të ADN-së
fitoplanktonike mund të shpjegohet me anë të variacionit të faktorëve mjedisorë (Gjyli et
al., 2013b).
Kjo vlerë e koefiçientit të përcaktimit tregon se lidhja e ADN-së fitoplanktonike (ADN
fitopl.) me faktorët mjedisorë është e fortë (http://bold-ed.com/corr.htm).
R² = 0.748
-100
0
100
200
300
400
500
600
700
800
-200 0 200 400 600 800
Obse
rved
Valu
e
Predicted Value
Grafiku 5.57. Regresioni linear i shumëfishtë midis ADN fitopl. dhe faktorëve
mjedisorë.
ADN fitopl. lidhet me këta faktorë mjedisorë, nisur nga matrica e korrelacionit ku gjejmë
koefiçientin e korrelacionit (r - Pearson) dhe besueshmërinë statistikore (p-value ≤ 0.05),
si dhe bazuar në interpretimin e vlerës së koefiçientit të korrelacionit
(http://faculty.quinnipiac.edu/libarts/polsci/statistics.html):
pH (r = 0.49, p-value ≤ 0.01), Chl a (r = 0.42, p-value ≤ 0.01) paraqesin lidhje të fortë
pozitive me ADN fitopl. Kripshmëria (r = - 0.6, p-value ≤ 0.01) dhe DO (r = - 0.5, p-
value ≤ 0.01) paraqesin lidhje të fortë negative, ndërsa DO% (r = - 0.33, p-value ≤ 0.01),
paraqet lidhje të moderuar negative me ADN fitopl. Shpjegohet kështu variacioni i ADN
fitopl. në ujërat e Gjirit të Durrësit (Tab. 5.15) (Gjyli et al., 2013b).
Lidhja pozitive e fortë midis ADN fitopl. dhe Chl a, tregon se fitoplanktoni lidhet
drejtpërdrejtë me Chl a, pasi përqëndrimi i Chl a është një indikator i biomasës së
fitoplanktonit në ujërat bregdetare (www.ozcoasts.gov.au/indicators/chlorophyll_a.jsp).
Konsumi fotosintetik i dioksidit të karbonit, sidomos në lulëzimet e algave mund të
çojë në nivele të larta (bazike) të pH (Hinga, 2002). Kjo mund të jetë arsyeja që ka
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
78
lidhje pozitive të fortë midis ADN fitopl. dhe pH. Koefiçienti i korrelacionit Pearson
tregon një korrelacion të fortë negativ midis ADN fitopl. dhe kripshmërisë, që do të thotë
sa më e lartë kripshmëria, aq më pak ka lulëzim të fitoplanktonit. Referuar faktit se
Synechococcus ndodhet në sasi më të lartë në mjedise me kripësi të ulët (Partensky et al.,
1999a), mund të jetë arsyeja që ekziston kjo lidhje e fortë me kripshmërinë.
Koefiçienti i korrelacionit Pearson tregon një korrelacion të fortë negativ midis ADN
fitopl. dhe DO.
Lulëzimi algave mund të rezultojë në një fluks masiv të lëndës organike në sediment
(eutrofikim). Dekompozimi i lëndës organike nga mikroorganizmat aerobë çon në një
përshpejtim të konsumit të oksigjenit, dhe shterim potencial të oksigjenit në ujërat e
poshtme (http://www.ozcoasts.gov.au/indicators/dissolved_oxygen.jsp).
Korrelacion i moderuar negativ midis ADN fitopl. dhe DO%, lidhet me faktin se DO me
DO% paraqet lidhje mjaft të fortë pozitive.
Tabela 5.15. Matrica e korrelacionit ku shprehen koefiçientët e korrelacionit Pearson ndërmjet
parametrave: temperatura (T), pehashi (pH), oksigjeni i tretur (DO), ngopja me oksigjen (DO%),
kripshmëria (Sal.), turbullia (Turb.), nitratet (NO3-), fosfatet (PO4
3-), ADN fitoplanktonike
(ADN).
T pH DO DO% Sal. Turb. NO3
- PO4
3- Chl a ADN
T 1.000
pH .133 1.000
O2 .090 -.264 1.000
%O2 .213 -.425 .700 1.000
Sal .136 -.174 .357 .298 1.000
Turb .066 -.124 .297 .356 .068 1.000
NO3- -.503 -.253 -.005 -.154 -.162 .064 1.000
PO43-
.384 .410 -.216 -.107 -.144 .124 .105 1.000
Chla -.297 -.141 -.201 -.019 -.157 .046 .351 -.183 1.000
ADN -.134 .486 -.498 -.328 -.599 -.123 .059 .105 .423 1.000
Legjenda:
5.3.6.2. Lidhja e faktorëve mjedisorë ndërmjet tyre
Referuar matricës së korrelacionit (Tab. 5.15), gjejmë koefiçientët e korrelacionit
ndërmjet faktorëve mjedisorë. Chl a paraqet lidhje të moderuar negative me
temperaturën, që tregon se temperaturat nga 18 - 29 ºC, zvogëlojnë përqëndrimet e Chl a.
Chl a paraqet lidhje të moderuar pozitive me NO3-. Kjo tregon se me rritjen e
përqëndrimit të NO3-, rritet edhe përqëndrimi i Chl a. Pra NO3
- mbeten faktori kufizues,
që përcakton rritjen e përqëndrimit të Chl a. Të dy këta faktorë përcaktojnë edhe trofinë e
ujërave bregdetare të Gjirit të Durrësit.
PO43-
paraqesin lidhje të moderuar pozitive me temperaturën, kurse me pH lidhje të fortë
pozitive, që do të thotë se ngarkesat e larta të ujërave me PO43-
, sjellin rritjen e vlerave të
66 sample size
± .242 critical value .05 (two-tail)
± .315 critical value .01 (two-tail)
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
79
pH. Arsyeja mund të jetë lulëzimi i algave kur ka ngarkesa të ujërave me fosfate. Kjo
sjell dhe konsumin e dioksidit të karbonit, që çon në nivele të larta (bazike) të pH.
NO3- përveç lidhjes të moderuar pozitive me Chl a, paraqesin lidhje të fortë negative me
temperaturën, që tregon sa më e ulët temperatura aq më shumë rritet përqëndrimi i NO3-
dhe kundërta. NO3- paraqesin lidhje negative të dobët me pH.
Turbullia paraqet lidhje të moderuar pozitive me oksigjenin e tretur dhe lidhje të
moderuar pozitive me ngopjen me oksigjen. Kjo tregon se rritja e turbullisë mund të
sjellë rritje të oksigjenit të tretur në ujë.
Kripshmëria paraqet lidhje pozitive të moderuar me DO dhe lidhje pozitive të moderuar
me DO%.
DO paraqet lidhje të dobët negative me pH. DO% lidhet me lidhje të fortë negative me
pH. Arsyeja mund të jetë dekompozimi i lëndës organike në prani të oksigjenit, që rrit
sasinë e dioksidit të karbonit të tretur në ujë, gjithashtu rritet sasia H+ dhe kjo sjell uljen e
pH.
DO lidhet me DO% me lidhje mjaft të fortë pozitive, pasi sa më shumë të rritet tretja e
oksigjenit në ujë, aq më shumë ngopet uji me oksigjen.
5.3.6.3. Analiza faktoriale dhe grupimi i parametrave të ngjashëm të stacioneve të
ngjashëm
Nga të dhënat e marra gjatë studimit të ujërave sipërfaqësore të Gjirit të Durrësit, arrijmë
në përfundimin se nga dhjetë faktorë të studiuar, pesë faktorë ndikojnë më tepër në
variabilitetin e të dhënave në nivelin 74% (Graf. 5.58). Faktorët e tjerë kanë ndikim më të
vogël.
Grafiku 5.58. Analiza faktoriale për dhjetë parametrat e studiuar gjatë dy viteve të marrjes së
mostrave: temperatura (T), pehashi (pH), oksigjeni i tretur (DO), ngopja me oksigjen (DO%),
kripshmëria (Sal.), turbullia (Turb.), nitratet (NO3-), fosfatet (PO4
3-), ADN fitoplanktonike
(ADN).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
80
Grafiku 5.59. Analiza faktoriale për dhjetë parametrat e studiuar gjatë dy viteve të marrjes së
mostrave: temperatura, pH, DO = O2, DO% = O2%, saliniteti = kripshmëria, turbiditeti= turbullia,
NO3-, PO4
3-, ADN-ja fitoplanktonike = ADN fitopl., duke përdorur mundësinë maksimale dhe
rrotullimin.
Nga analiza faktoriale për dhjetë parametrat e studiuar, duke përdorur mundësinë
maksimale dhe rrotullimin, rezulton se:
Faktori i parë sipas analizës faktoriale, që përdor mundësinë maksimale dhe rrotullimin
përcaktohet nga karaktetistikat e Gjirit të Durrësit, që janë DO dhe DO% si dhe
kripshmëria, që janë në përpjestim të zhdrejtë me rritjen e ADN-së fitoplanktonike.
Faktori i dytë përcaktohet nga kushtet klimatike sikurse temperatura, por edhe fosfatet &
pH, që janë në përpjestim të zhdrejtë me ndotjet e ujërave që sjellin nitrate, të cilat nxitin
dhe rritjen e përqëndrimit të Chl a (Fig. 5.59).
Nga dendograma e ngjashmërisë (Graf. 5.60) evidentojmë se parametrat e përcaktuara
ndahen në dy grupe të mëdha.
Grafiku 5.60. Dendograma e ngjashmërisë midis parametrave të studiuar gjatë dy viteve të
marrjes së mostrave: temperatura, pH, DO = O2, DO% = O2%, saliniteti = kripshmëria,
turbiditeti= turbullia, NO3-, PO4
3-, ADN-ja fitoplanktonike = ADN fitopl.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
81
Në grupin e parë përfshihen: nëngrupi I, ADN-ja fitoplanktonike, pH, Chl a, PO43-
,
temperatura dhe nëngrupi II, NO3-.
ADN fitopl., pH, Chl a, PO43-
si dhe temperatura kanë lidhje relativisht të ngushtë midis
tyre.
Temperaturat e ujit ndryshojnë për shkak të ndryshimit të kushteve atmosferike sikurse
ndriçimi diellor, përveç rrymave dhe hidrodinamikës lokale.
Kurse ngarkesa me PO43-
në ujë vjen nga dinamika e ujërave, temperatura e lartë e
ujërave, por edhe zgjerimi i aktivitetit human, që ka rritur dukshëm ngarkesën me lëndë
ushqyese. Ndotja e ujërave bregdetare si rrjedhojë e zgjerimit të aktivitetit human,
përfshirë derdhja e ujërat e zeza të papërpunuara në det si dhe eutrofikimi, temperaturat e
larta, sjellin ngarkesa të larta me PO43-
. Të dyja këta faktorë, temperatura dhe PO43-
japin
ndikimin e tyre edhe në rritjen e pH, ADN fitopl. dhe Chl a.
Ngarkesa e lartë e ujërave me NO3-, varet nga ndotja e ujërave bregdetare, veçanërisht me
ujëra të zeza, ndaj dhe NO3- qëndrojnë si nëngrup më vete.
Në grupin e dytë përfshihen: nëngrupi III, DO, DO%; nëngrupi IV, kripshmëria dhe
nëngrupi V, turbullia.
Faktorët DO dhe DO% paraqiten të lidhur ngushtë me njëri-tjetrin. Kripshmëria dhe
turbullia shqafin një lidhje të moderuar pozitive me DO & DO%, por që ndikohen nga
faktorë të tjerë, sikurse kushtet klimatike, hidrodinamika, etj. Por, një ndikim të madh ka
faktori antropogjen, që sjell edhe herë pas here ndryshime të dukshme të këtyre
parametrave, nga derdhja e ujërave të ndotura drejtpërdrejt në det.
Grafiku 5.61. Dendograma e ngjashmërisë të gjashtë stationeve bazuar në parametrat biotikë dhe
abiotikë të studiuar: PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC.
Nga dendograma e ngjashmërisë (Graf. 5.61) evidentojmë se katër stacionet PG, IPK, PC
dhe PH paraqesin ngjashmëri në funksion të parametrave të përcaktuara.
Kurse stacionet KP & KUQD nuk kanë ngjashmëri në funksion të parametrave të
përcaktuara. Si rrjedhim paraqesin një ndryshim më të madh në karakteristika, krahasuar
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
82
me stacionet e tjera. Kjo për arsyen se ndikimi i faktorit antropogjen është shumë më i
theksuar në këto dy stacionet nga derdhja e vazhdueshme e ujërave të zeza të
papërpunuara përmes kanaleve të dallueshme në det. Kanali i Plepave në stacionin KP
mbledh ujërat e ndotura përfshirë ujërat e zeza të zonës së Golemit, si zonë banimi
tashmë e mbipopulluar në sezonin veror. Kanali i ujërave të qytetit të Durrësit në
stacionin KUQD mbledh ujërat e ndotura, përfshirë ujërat e zeza të qytetit të Durrësit.
5.4. Vlerësimi sasior i ADN-së pikofitoplanktonike të izoluar përmes filtrimit të dytë
Sikurse në çështjen 5.3, fakti që lidhja midis përbërjes molekulare (p.sh. ARN-së, ADN-
së dhe proteinave) dhe shkallës së rritjes së cianobaktereve mund të përshkruhen në terma
të thjeshtë matematikorë dhe shfaqen të jenë të pavarur nga faktorët mjedisorë specifikë,
që përcaktojnë shkallën e rritjes, mbështet idenë e përdorimit të përbërjes biokimike të
plotë për të vlerësuar në vend shkallën e rritjes të popullatave mikrobike natyrore (Dortch
et al., 1983; Kemp et al., 1993). Meqënëse sasia e ADN-së për qelizë të
pikofitoplanktonit, është një parametër i pandryshueshëm nën ndikimin e kushteve
mjedisore, bën që matja e sasisë të ADN-së pikofitoplanktonike (ADN pikofitopl.) në
ujërat e Gjirit të Durrësit të jetë një nga parametrat më të sigurt për vlerësimin sasior të
biomasës së pikofitoplanktonit, pavarësisht nga intensiteti i aktivitetit biologjik të këtyre
qelizave (Bacu et al., 2010). Matja e sasisë ADN-së për volum uji, do të tregojë vlera në
përpjestim të drejtë me sasinë reale të pikofitoplanktonit në një periudhë të caktuar, në
kushte të caktuara mjedisore, duke mundësuar evidentimin e ndryshimeve të sasisë së
biomasës pikofitoplanktonike në Gjirin e Durrësit. Mostrat e ujit për të vlerësuar sasinë e
ADN pikofitopl. (0.4 µm < pikofitoplankton < 0.7 µm) ku mundësohet izolimi i
cianobakterit së gjinisë Prochlorococcus, janë marrë nga gjashtë stationet: PG, KP, PH,
IPK, KUQD, PC, për çdo muaj për periudhën Prill - Tetor 2011. Për vitin 2011 në terren
u mblodhën 42 mostra për matjen e ADN pikofitopl.
U analizua vlerësimi sasior i ADN pikofitopl. sipas muajve, stinëve, viteve dhe
stacioneve paraqitur në tabela 5.16 – 5.18. dhe grafikët 5.62 – 5.66. Për një analizë më të
plotë të vlerave dhe shpërndarjes së ADN pikofitopl., të dhënat janë paraqitur përmes box
plot-it (Graf. 5.63) dhe histogramës (Graf. 5.64).
U analizua ndikimi i metaleve të rënda në rritjen e pikofitoplanktonit. U realizua lidhja
midis ADN pikofitopl. dhe faktorëve mjedisorë si dhe lidhja e ADN pikofitopl. me ADN-
në fitoplanktonike.
5.4.1. Vlerësimi i pastërtisë së ADN-së pikofitoplanktonike
ADN-ja e ekstraktuar nga pikofitoplanktoni i siguruar në filtrimin II të mostrave të ujit të
detit, u analizua për cilësinë (pastërtinë) dhe sasinë. Përcaktimet spektrofotometrike të
ADN pikofitopl. sipas stacioneve PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC, në periudhën Prill -
Tetor, 2011; rezultuan në raporte OD260/OD280 1.6 - 1.8 dhe më të vogla se 1.6. Vlerat më
të vogla se 1.6 tregojnë praninë e proteinave dhe / ose absorberë të tjerë UV, prandaj dhe
u bë purifikimi i acideve nukleike (CIMMYT, 2005; Grazhdani, 2008).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
83
5.4.2. Vlerësimi sasior i ADN-së pikofitoplanktonike sipas muajve
Vlerat e ADN-së pikofitoplanktonike (ADN pikofitopl. µg/ml) të ujërave sipërfaqësore
në Gjirin e Durrësit sipas muajve dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën
5.16 dhe grafikët 5.62 - 5-64.
Tabela 5.16. Maksimumi, minimumi, mesatarja dhe mesatarja totale dhe deviacioni standard për
ADN pikofitopl. (µg/ml) të matura në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC sipas vitit 2011.
ADN pikofit. (µg/ml) PG KP PH IPK KUQD PC
20
11
Max. 310 455 460 500 400 240
Min. 144 137 179 162 158 144
Mesatarja 230.69 268.56 278.99 292.45 263.93 201.84
Mes. Totale ± DS 256.08 ± 94.71
Legjenda: Max. = maksimumi, Min. = minimum, Mes. Totale = Mesatarja Totale, DS = deviacioni
standard.
Vlerat e ADN pikofitopl. më të larta (500 µg/ml) u shënua përkatësisht në Shtator 2011
në stacionin IPK; ndërsa vlera minimale (137 µg/ml) në Maj 2011, KP. Përveç vlerës
maksimale në IPK, po në muajin Shtator vërejmë vlera të larta edhe në PH (460 µg/ml),
KP (455 µg/ml) dhe KUQD (400 µg/ml), kurse PC ka pikun jo vetëm në Shtator, por
edhe Gusht (240 µg/ml).
Këto vlera maksimale të ADN pikofitopl. vërtetojnë faktin se në Shtator paraqiten kushtet
më të mira për zhvillimin e pikofitoplanktonit.
Duke krahasuar mesataren e ADN pikofitopl. për gjithë stacionet (256.08 µg/ml), me
ADN-në fitoplanktonike (ADN fitoplankt.) për të njëjtin vit (270.20 µg/ml) (Tab. 5.11,
Graf. 5.46), del se sasia e ADN pikofitopl. është 1.06 herë më e vogël se ADN fitoplankt.
Kjo tregon se sasia e ADN pikofitopl. ëshë pothuajse e njëjtë me sasinë e ADN
fitoplankt. gjatë vitit 2011 (Tab. 5.16, Graf. 5.62).
Grafiku 5.62. Vlerat e ADN pikofitopl. (µg/ml) të matura sipas muajve në stacionet: PG, KP,
PH, IPK, KUQD, PC.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
84
Grafiku 5.63. Box plot i vlerave të
ADN pikofitopl. (µg/ml) për vitin 2011. Grafiku 5.64. Histograma e vlerave të
ADN pikofitopl. (µg/ml) për vitin 2011.
Nga paraqitjet grafike (Graf. 5.63 & 5.64) vërehen se për vitin 2011, kemi një
shpërndarje normale të vlerave të ADN pikofitopl., por vlerat rrahin djathtas. Mesorja ka
vlerë më të vogël se mesatarja, kurse 50 % e vlerave ndodhen brenda intervalit 182.74 –
300 µg/ml.
Vërehet një pikë jashtë bishtave të kutisë në Shtator 2011, IPK (500 µg/ml). Rritja tepër e
lartë e biomasës së pikofitoplanktonit në këtë stacion mund të jetë nga ndotjet e ujërave
detare të ngarkuara me lëndë ushqyese në basenin e portit, për shkak të fluksit të
lëvizjeve të trageteve në këtë periudhë.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
85
5.4.3. Vlerësimi sasior i ADN-së pikofitoplanktonike sipas stinëve
Vlerat e ADN-së pikofitoplanktonike (ADN pikofitopl. µg/ml) të ujërave sipërfaqësore
në Gjirin e Durrësit sipas stinëve dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në tabelën
5.17 dhe grafikët 5.65 & 5.66. Për krahasimin e ADN pikofitopl. me ADN-në
fitoplanktonike (>0.7 µm) është paraqitur grafiku 5.67.
Tabela 5.17. Maksimumi, minimum, mesatarja, deviacioni standard, dhe koeficienti i variacionit
dhe mesatarja për vlerat e ADN pikofitopl. (µg/ml), në stacionet PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC
sipas stinëve Pranverë, Verë dhe Vjeshtë, 2011.
ADN pikofit. (µg/ml) Pranverë Verë Vjeshtë
PG 152 257 270
KP 147 297 348
PH 186 251 414
IPK 172 307 390
KUQD 173 294 310
PC 156 210 235
Max 186 307 414
Min 147 210 235
Mesatarja 164.52 269.30 327.80
Legjenda: Max = maksimumi, Min = minimum.
Grafiku 5.65. Vlerat e ADN pikofitopl. (µg/ml) sipas stinëve për vitin 2011, në stacionet PG,
KP, PH, IPK, KUQD, PC.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
86
Në Pranverë, vlera maksimale e ADN pikofitopl. u shënua në PH (186 µg/ml), kurse
vlera minimale në PK (147 µg/ml) (Tab. 5.17, Graf. 5.65).
Në Verë, vlera maksimale u shënua në IPK (307 µg/ml), kurse vlera minimale në PC
(210 µg/ml).
Në Vjeshtë, vlera maksimale u shënua në PH (414 µg/ml), kurse vlera minimale në PC
(235 µg/ml).
Grafiku 5.66. Shpërndarja e sasisë së ADN pikofitopl. (%) sipas stinëve për vitin 2011 për të
gjitha stacionet: PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC.
Grafiku 5.67. Shpërndarja e sasisë së ADN fitopl. (%) sipas stinëve për vitin 2011 për të gjitha
stacionet: PG, KP, PH, IPK, KUQD, PC.
Sasia në përqindje e ADN pikofitopl. (Tab. 5.19, Graf. 5.20,) ishte më e lartë në Vjeshtë
(43 %), kurse në Verë dhe Vjeshtë më e ulët, përkatësisht 35 % dhe 22 %.
Po kështu sasia në përqindje e ADN fitopl. për vitin 2011 ishte më lartë në Vjeshtë (42
%), kurse në Verë dhe Vjeshtë ishte më e ulët, përkatësisht 38 % dhe 20 %. Kjo
konfirmon që stina e Vjeshtës 2011, paraqet kushtet mjedisore më të mira për të prodhuar
biomasë fitoplanktoni (> 0.7 µm), përfshirë edhe biomasën e pikoplanktonit, sikurse
pikocianobakteret Synechococcus si dhe pikoplanktoni që izolohet nga filtrimi i dytë (0.4
µm < pikofitoplankton < 0.7 µm) i ujërave të Gjirit të Durrësit. Stina më e varfër me
ADN pikofitopl. dhe ADN fitopl., rezultoi Pranvera.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
87
5.4.4. Sasia e ADN-së pikofitoplanktonike sipas stacioneve dhe diskutime mbi
ndikimin e metaleve të rënda në rritjen e pikofitoplanktonit
Vlerat e ADN-së pikofitoplanktonike (ADN pikofitopl. µg/ml) të ujërave sipërfaqësore
në Gjirin e Durrësit sipas sipas stacioneve dhe përpunimi i tyre statistikor paraqiten në
tabelën 5.18 dhe grafikun 5.68.
Tabela 5.18. Sasia e ADN pikofitopl. mesatare (µg/ml) sipas stacioneve PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC dhe mesatarja totale për vitin 2011.
ADN pikofit.
(µg/ml) PG KP PH IPK KUQD PC Max Min
Mes.
Totale
Mesatarja
2011 230.69 268.56 278.99 292.45 263.93 201.84 292.45 201.84 256.08
Legjenda: Mes. Totale = mesatarja totale
Mesataren më të lartë në përqindje të ADN pikofitopl. e ka IPK me 19.0 %. Më pas
renditen PH (18.2 %), KP, KUQD, PG dhe në fund PC me 13.1 % (Tab. 5.18, Graf.
5.68).
Ndryshe nga mesataret në përqindje të ADN-së fitoplanktonike (ADN fitopl.), KP dhe
KUQD kanë mesataret më të larta në përqindje, përkatësisht me 19.3 % dhe 18.7 %. Më
pas renditen PG, PH, PC dhe në fund 14.7 % IPK. Referuar edhe vitit 2012, por edhe të
dyja viteve së bashku 2011 & 2012 për ADN fitopl. rezulton se në fund renditet IPK
(Tab. 5.14, Graf. 5.54 – 5.56).
Pra, ADN pikofitopl. paraqet maksimumin në IPK ndryshe nga ADN fitopl., që paraqet
minimumin në këtë stacion, edhe pse ky stacion ka nivel të lartë metalesh të rënda
referuar çështjes 5.3.4. Një ndër arsyet mund të jetë se baseni i Portit të Durrësit është
vazhdim i detit të hapur me thellësi të konsiderueshme ndryshe nga stacionet e tjera.
Grafiku 5.68. Përqindja e ADN pikofitopl. (%) në vitin 2011 sipas stacioneve: PG, KP, PH, IPK,
KUQD, PC.
Pikofitoplanktoni i detit të hapur konsideruar si zonë oligotrofike, dominohet
përgjithësisht nga Prochlorococcus (Partensky et al., 1999). Ky pikofitoplankton mund të
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
88
vijë drejtëpërdrejtë nga rrymat që futen nga deti i hapur në basen, pavarësisht se baseni ka
nivel të lartë të metaleve të rënda, sipas Wilbur Smith Associates (2003).
Kurse PC ka përqindjen më të ulët të ADN pikofitopl. Edhe ADN fitopl. zë vendin e
parafundit në PC. Kjo tregon se metalet e rënda të pranishme në këtë stacion (Abeshi et
al., 2008), mund pengojnë zhvillimin e pikoplanktonit në filtrimin e dytë, ku pjesë e
rëndësishmë është cianobakteri Prochlorococcus.
5.4.5. Lidhja e ADN-së pikofitoplanktonike me faktorët mjedisorë
Sipas analizës së regresionit linear të shumëfishtë midis variablit të varur (ADN-së
pikofitoplanktonike) dhe variablave të pavarur (Chl a dhe faktorëve mjedisorë abiotik:
temperatura, kripshmëria, pH, oksigjeni i tretur, ngopja me oksigjen, turbullia, nitratet,
fosfatet) studiuar për gjithë mostrat gjatë 2011, koefiçienti i përcaktimit rezultoi R2 =
0.73 (p-value ≤ 0.01) (Graf. 5.69).
Kjo do të thotë se 73% e variacionit të ADN-së pikofitoplanktonike (ADN pikofitopl.)
mund të shpjegohet me anë të variacionit të faktorëve mjedisorë.
Kjo vlerë e koefiçientit të përcaktimit tregon se lidhja e ADN pikofitopl. me faktorët
mjedisorë është e fortë (http://bold-ed.com/corr.htm). ADN pikofitopl. lidhet me këto
faktorë mjedisorë, nisur nga koefiçienti i korrelacionit r (Pearson) dhe besueshmëria
statistikore (p-value ≤ 0.05), si dhe bazuar në interpretimin e vlerës së koefiçientit të
korrelacionit (http://faculty.quinnipiac.edu/libarts/polsci/statistics.html):
Temperatura (r = 0.49, p-value ≤ 0.01), pH (r = 0.63, p-value ≤ 0.01), paraqesin lidhje të
fortë pozitive me ADN pikofitopl., kurse NO3- (r = - 0.41, p-value ≤ 0.05) paraqesin
lidhje të fortë negative me ADN pikofitopl., (Tab. 5.19). Kështu shpjegohet variacioni i
ADN pikofitopl. në ujërat e Gjirit të Durrësit.
R² = 0.732
0
100
200
300
400
500
600
0 100 200 300 400 500
Obs
erve
d Va
lue
Predicted Value
Grafiku 5.69. Regresioni linear i shumëfishtë midis ADN-së pikofitoplanktonike dhe faktorëve
mjedisorë.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
89
Lidhja e fortë pozitive midis ADN pikofitopl. dhe temperaturës, tregon se ndryshimet
kohore të sasisë së pikofitoplanktonit, ku përfshihet Prochloroccocus lidhen në
përpjestim të drejtë me temperaturën. Pra, sa më e lartë temperatura, aq më shumë rritet
biomasa e pikofitoplanktonit në ujërat bregdetare.
Fotosinteza dhe frymëmarrja aerobe, rritja, riprodhimi, metabolizmi dhe lëvishmëria e
organizmave ndikohen nga ndryshimet e temperaturës së ujit. Shkalla e reaksioneve
biokimike zakonisht dyfishohet kur temperatura rritet me 10 oC brenda diapazonit të
tolerancës së një organizmi të caktuar
(http://www.ozcoasts.gov.au/indicators/temperature.jsp).
Konsumi fotosintetik i dioksidit të karbonit, sidomos në lulëzimet e algave mund të
çojë në nivele të larta (bazike) të pH (Hinga, 2002). Kjo mund të jetë arsyeja e një
lidhjeje pozitive të fortë midis ADN pikofitoplanktonike dhe pH.
Koefiçienti i korrelacionit Pearson tregon një korrelacion të fortë negativ midis ADN
pikofitopl. dhe përmbajtjes së NO3- në ujë, që do të thotë sa më i lartë përqëndrimi i NO3
-
aq më pak rritje dhe lulëzim të pikofitoplanktonit.
Pavarësisht nga paqartësitë sugjerohet se ka të paktën një lidhje midis përqëndrimeve të
azotit në mjedis dhe sasisë të Synechococcus (Blanchot et al., 1992, Partensky et al.,
1999a) dhe një lidhje të kundërt me Prochlorococcus (Campbell & Vaulot, 1993) në
zonat e sipërme eufotike, ku drita nuk është e kufizuar.
Tabela 5.19. Koeficientët e korrelacionit midis ADN pikofitopl. dhe faktorëve mjedisorë.
T pH O2 %O2 Sal Turb. NO3
- PO4
3- Chl a
ADN .490 .631 -.032 -.158 -.233 .089 -.412 .268 -.022
Legjenda:
± .329 critical value .05 (two-tail)
± .424 critical value .01 (two-tail)
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
90
5.4.6. Lidhja e ADN-së pikofitoplanktonike me ADN-në fitoplanktonike
Duke shqyrtuar lidhjen midis ADN-së pikofitoplanktonike me ADN fitoplanktonike
totale (Graf. 5.70), rezulton se koefiçienti i korrelacionit Pearson është r = 0.66, (R2 =
0.437). Kjo tregon se lidhja midis ADN pikofitopl. dhe ADN fitopl. është e fortë pozitive
(http://faculty.quinnipiac.edu/libarts/polsci/statistics.html).
y = 0.528x + 113.2R² = 0.437
0
100
200
300
400
500
600
0 200 400 600 800
AD
N p
ikof
itopl
ankt
onik
e
ADN f itoplanktonike
Grafiku 5-70. Regresioni linear midis midis ADN-së pikofitoplanktonike (0.4-0.7 µm) dhe
ADN-së fitoplanktonike (> 0.7 µm).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
91
5.5. Analiza e zonës 16-23S ITS për të vlerësuar diversitetin gjenetik të
Synechococcus dhe Prochlorococcus në Gjirin e Durrësit
Një ndër qëllimet më të rëndësishme të këtij studimi, ishte të vlerësonim diversitetin
cianobakterial duke përdorur sekuencat ITS. Kjo është realizuar duke bazuar në
variabilitetin e zonave 16-23S ITS dhe përdorimin e tyre si veçori dalluese e gjenotipeve
të ndryshme të Prochlorococcus dhe Synechococcus (Rocap et al., 2002; Lavin et al.,
2008). Shumëfishimi me anë të PCR-së i rajoneve 16S-23SrADN ITS
pikofitoplanktonike rezultoi me produkt të bollshëm si për ITS-a dhe ITS-b (Fig. 5-9),
zona të operonit bakterial. ITS-a e shumëfishuar u paraqit me katër banda, përkatësisht:
1000 bp, 900 pb, 800 bp dhe 300 bp. ITS-b e shumëfishuar u paraqit me tri banda,
përkatësisht 550 bp, 400 bp dhe 250 bp. Prania e bandave të ndryshme të ITS është
raportuar në ujëra të ëmbla dhe detare nga disa studime (Rocap et al., 2002; Lavin et al.,
2008). Këto rezultate provojnë se në brigjet e Gjirit të Durrësit rriten popullata të
ndryshme të pikofitoplanktonit prokariotik, Synechococcus dhe Prochloroccocus, rajonet
ITS të të cilave përmbajnë më shumë se një variant, konkretisht 4 rajone ITS-a dhe 3
rajone ITS-b. Prania e këtyre popullatave të ndryshme edhe në kushtet e ndotjes nga
karburantet, metalet e rënda, derdhjet e mbetjeve urbane e atyre ndërtimore, dëshmon për
përshtatjen e këtyre specieve ndaj kushteve jo të favorshme mjedisore. Fragmentet ITS-a
ose ITS-b u shumëfishuan në të gjithë stacionet, me përjashtim të fragmentit ITS-b 250
bp, që u gjet vetëm në stacionin KP (Fig. 5.10) (Gjyli & Bacu, 2014).
Figura 5.9. Produktet e PCR ITS-b të fragmenteve ribozomale nga shtamet cianobakteriale të
Synechoccocus amplifikuar nga ADN-ja fitoplanktonike.
Legjenda: M = Markeri 1kbp; 1 = PG (Korrik 2011); 2= KUQD (Korrik 2011); 3 = PG (Shtator 2011); 4 =
KP (Shtator 2011); 5 = IPK (Shtator 2011); 6 = KUQD (Korrik 2012); 7 = PG (Shtator 2012).
Përmasat e
produkteve
550 bp
400 bp
250 bp
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
92
5.5.1. Lidhja midis shumëllojshmërisë së zonës ITS dhe cilësisë së ujërave në
stacionet e monituruara
KP është stacioni me popullatat më të ndryshme të Synechococccus sipas bandave të
zonave ITS të shumëfishuara të ADN-së ribozomale të tyre. Dy nga tri zonat ITS-b të
shumëfishuara (përkatësisht 550 bp, and 400 bp) ishin të pranishme në gjithë stationet,
kurse zona e tretë vetëm në mostrat e KP (250 bp). Në 2011, KP ishte në fund të
stacioneve për nivelin e NO3-, veçanërisht me përqëndrim minimal në Shtator (0.07 mg/l)
and Tetor (0.06 mg/l) (Tab. 5.7, Graf. 5.31). Duket se ka një korrelacion negativ midis
përqëndrimit të nitrateve dhe diversitetit të popullatave Synechococcus spp. Megjithatë në
2011, KP është në krye të stacioneve për nivelin e PO43-
, veçanërisht në Shtator (Tab. 5.8,
Graf. 5.36). Gjatë këtij muaji ka patur derdhje në sasi të mëdha të ujërave të ndotura,
sidomos ujëra të zeza nga zona e Golemit (Fig. 5.7). Në Shtator ka një pik të sezonit të
plazhit që fillon prej Gushtit. Për më tepër, gjatë muajve të vjeshtës ka një zbaticë të detit,
që sjell më tepër ujë të ëmbël sesa ujë deti në këtë stacion. Këto së bashku me ngarkesat
shtesë në fosfate, mund të jenë një arsye për lulëzimin e algave në KP. Sipas të dhënave
tona, në këtë stacion ka korrelacion pozitiv midis fosforit dhe diversitetit të popullatave të
Synechococcus. Në lidhje me indikatorin e tretë të cilësisë së ujërave, Chl a, niveli trofik i
KP, vlerësuar në klasën hipertrofike, nuk e bën të dallueshëm KP nga stacionet e tjera.
Sipas të dhënave tona (Tab. 5.10, Graf. 5.41), nuk ka korrelacion të dukshëm midis
përmbajtjes së Chl a dhe diversitetit gjenetik të bazuar në zonat ITS të
pikocianobaktereve (Gjyli & Bacu, 2014).
5.5.2. Prania e popullatave të ndryshme gjenetikisht të pikocianobaktereve të gjinisë
Synechococcus dhe diskutime mbi faktorët mjedisorë që mund të ndikojnë në
variabilitetin e këtyre pupullatave në ujërat detare
Prania e popullatave të ndryshme të pikocianobaktereve të gjinisë Synechococcus u
inverstigua në gjashtë stacione të Gjirit të Durrësit, bazuar në fragmentet në zonat 16-23S
ITS, sipas skemës së organizimit të operonit cianobakterial të Rocap et al. (2002). Katër
rajone të ITS-a dhe tri rajone të ITS-b u shumëfishuan. Fragmentet e ITS-a nuk mund të
dallojnë midis popullatave, sepse ishin të pranishme në gjithë stacionet e marrjes së
mostrave. Fragmenet ITS-b u zbuluan përkatësisht, dy fragmentet më të mëdha në gjithë
stacionet, dhe e treta vetëm në KP. Faktorët që mund të kenë ndikuar në këtë variabilitet
në popullatën e stacioneve të ndryshme mund të jenë: ngarkesat e larta në fosfate në
stacionin KP, ngarkesat e ulëta të nitrateve në KP, zbatica e detit, e cila sjell më tepër ujë
të ëmbël sesa ujë deti në këtë stacion krahasuar me stacionet e tjera. Rezultate e
mësipërme janë në përputhje me raportime të tjera (Sharpley et al., 1984, 1995; Tiessen,
1995, Lavin et al., 2008, Rocap et al., 2002), të cilat raportojnë praninë e zonave ITS të
ndryshme në operonin cianobakterial rADN, dhe mbështesin konkluzionin se këto
organizma mund të rriten në përqëndrime të ulëta azoti, sepse fiksojnë azotin atmosferik,
edhe pse azoti është faktor limitues për rritjen e algave. Ashtu sikurse përqëndrimi i lartë
i fosforit mund të rrisë dendësinë dhe diversitetin e popullatave cianobakteriale (Gjyli &
Bacu, 2014).
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
93
VI. PËRFUNDIME
• Në këtë punim për herë të parë raportohet zbulimi i pranisë së pikocianobaktereve
marine Synechococcus dhe Prochlorococcus në Gjirin e Durrësit, bazuar në
sekuencat 16S-23S të ARN-ve ribozomale tipike për këto specie.
• Shumëfishimi me anë të PCR-së i sekuencave të 16S-23SrADN ITS, rezultoi i
suksesshëm dhe tregoi se në ujërat bregdetare të Gjirit të Durrësit cianobakteri
Synechococcus është i pranishëm dhe ka diversitet gjenetik të popullatave të tij.
Diversitet gjenetik më i madh i Synechococcus në Kanalin i Plepave (KP),
mbështet konkluzionin se cianobakteret mund të rriten në përqëndrime të ulëta
azoti, sepse fiksojnë azotin atmosferik, edhe pse azoti është faktor limitues për
rritjen e algave; dhe se përqëndrimi i lartë i fosforit mund të rrisë dendësinë dhe
diversitetin e popullatave cianobakteriale.
• Punimi provon se për evidentimin e pranisë së specieve pikofitoplanktonike, për
të cilat nevojiten pajisje të avancuara të mikroskopisë si flow-cytometri, një
metodë konkurruese mjaft efikase dhe e sigurt është ajo e bazuar në ADN-në e
specieve të synuara.
• Pavarësisht pranisë të metaleve të rënda, cianobakteri Synechococcus u zbulua në
gjithë stacionet e Gjirit të Durrësit, përfshirë ujërat e stacionit të ish-Pontilit të
Karburanteve (IPK) në basenin e Portit të Durrësit dhe Zonës së Currilave (PC).
Kjo konfirmon faktin se Synechococcus ka zhvilluar mekanizma mbrojtës kundër
metaleve të rënda deri në një përqëndrim të caktuar, pasi stacioni me nivel më të
ulët të ADN-së fitoplanktonike, rrjedhimisht me nivelin më të ulët të biomasës
fitoplanktonike, rezultoi IPK në basenin e Portit të Durrësit. Në këtë zonë, ka
inhibim të rritjes, që mund të vijë si rezultat i ndotjes nga nafta, vaji dhe metalet e
rënda.
• Stacionet me sasinë më të madhe të ADN-së fitoplanktonike, rezultuan bregu
pranë derdhjes së kanalit ujërave të zeza të qytetit të Durrësit dhe bregu pranë
derdhjes së ujërave të ndotura të Kanalit të Plepave. Këto rezultate nxjerrin në pah
ndikimin që kanë derdhjet e ujërave të ndotura, përfshirë ujërat e zeza, në
zhvillimin e fitoplanktonit si prodhimtari parësore.
• Stina e Verës paraqet kushtet mjedisore më të mira për rritjen e fitoplanktonit,
përfshirë pikofitoplanktonin në ujërat e Gjirit të Durrësit.
• Korrelacioni midis ADN-së fitoplanktonike, Chl a dhe faktorëve mjedisorë është i
lartë. Veçanërisht pH, Chl a, kripshmëria, oksigjeni i tretur dhe ngopja me
oksigjen, shpjegojnë më së shumti dinamikën e fitoplanktonit në ujërat
bregdetare.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
94
• Fraksioni i ADN-së pikofitoplanktonike, 0.4 < pikofitoplankton < 0.7 µm, nga ku
mund të izolohet cianobakteri Prochlorococcus, paraqet korrelacion të fortë me
faktorët mjedisorë, por lidhet më së shumti me temperaturën, pH dhe me nitratet.
• Katër stacionet PG, IPK, PC dhe PH paraqesin ngjashmëri në parametra të
caktuara, ndërsa stacionet KP dhe KUQD rezultojnë me vlera të shmangura,
veçanërisht të parametrave: pH, DO, kripshmërisë, turbullisë, NO3-, PO4
3-, ADN-
së fitoplanktonike. Ndikimi i faktorëve antropogjenikë është shumë më i theksuar
në këto dy stacione, ku ka derdhje të vazhdueshme të ujërave të zeza të
papërpunuara përmes kanaleve të dallueshme. Kanali i Plepave në stacionin KP
mbledh ujërat e ndotura, përfshirë ujërat e zeza të zonës së Golemit, të
mbipopulluar në sezonin veror si dhe prurje nga ujërat e zeza të ujëmbledhësit të
Shkallnur-Arapaj. Kanali i ujërave të qytetit të Durrësit në stacionin KUQD
mbledh ujërat e ndotura, përfshirë ujërat e zeza të qytetit të Durrësit.
• Temperaturat për periudhën e studimit 2011-2012, rezultuan në diapazonin 18 -
28.9 °C. Nga krahasimi i rezultateve midis dy viteve u vu re se temperatura në
vitin 2012 ishte rreth 2 °C më e lartë se ajo e vitit 2011. Këtë tendencë e
raportojnë dhe krahasimet me Artegiani et al. (1997), që pëshkruan temperaturën
sipërfaqësore të detit Adriatik në Verë, si edhe OSI (2002), që përshkruan
temperaturën maksimale të ujit në Gjirin e Durrësit.
• Sipas standardeve ndërkombëtare për ujërat sipërfaqësore detare (WAC 173-
201A, 1997, 2011), vlerat e pH (7.59 - 8.67) ishin brenda diapazonit të pH
standard të ujërave sipërfaqësore detare, përjashtuar KP në Shtator, 2011. pH ishte
pothuajse në të njëjtin nivel për të dy vitet.
• Sipas standardeve ndërkombëtare për ujërat sipërfaqësore detare, vlerat e DO (4.1
- 9.31 mg/l) ishin brenda diapazonit të DO standard, përjashtuar muajin Korrik
2011 në IPK, KUQD, KP, 2011, që përfshihen në cilësinë jo të keqe të kriterit të
DO për jetën ujore në ujërat detare (4.0 mg/l). Stacioni IPK, shfaq vlerat minimale
për vitet 2011 dhe 2012. Kjo mund të vijë si pasojë e derdhjes së substancave
organike, përfshirë hidrokarburet, nga ujërat e ballastrës dhe mbeturinat që vijnë
nga ankorimi i anijeve, të cilat presin të përpunohen në basenin e Portit të
Durrësit. Një shkak tjetër mund të jetë komunikimi i vogël me detin e hapur, pasi
ka vetëm një kanal hyrës-dalës për qarkullimin e ujit të basenit me detin e hapur.
DO e vitit 2012 ishte rreth 1 mg/l më e lartë se në 2011, duke na informuar për një
oksigjenim më të mirë të ujërave bregdetare gjatë vitit 2012. Këtë dekadë DO e
basenit ka zbritur nga cilësia e ujërave të pazakonshme, në cilësinë e ujërave të
shkëlqyera. DO e Adriatikut Jugor paraqitet në cilësinë e ujërave të pazakonshme,
kurse Gjiri i Durrësit në cilësinë e ujërave të shkëlqyera.
• Vlerat e DO% (64.1 - 112.3 %) ishin më të mëdha se 60 %, vlerë e konsideruar e
përshtatshme për të mbështetur jetën ujore. DO% e 2012 ishte 6 % më e lartë sesa
gjatë 2011, çka do të thotë një ngopje me oksigjen të ujërave bregdetare më të
madhe gjatë vitit 2012.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
95
• Kripshmëria gjatë vitit 2012 ishte rreth 1 ‰ më e madhe se gjatë 2011. Vlerat e
kripshmërisë (32.2 - 38.6 ‰) për të gjithë stacionet ishin brenda diapazonit të
kripshmërisë të ujërave bregdetare shqiptare (30 - 39 ‰). Mesatarja e
kripshmërisë të ujit për secilin stacion rezultoi brenda diapazonit të mesatares së
kripshmërisë për Gjirin e Durrësit (35.8 - 38.22 ‰). Kripshmëria e ujit të Gjirit të
Durrësit ishte rreth 1 ‰ më të ulët se e ujërave sipërfaqësore të Detit Adriatik
Jugor, që tregon ndikimin e shkarkimit të ujërave të ëmbla nga toka përgjatë
bregut të Gjirit të Durrësit.
• Turbullia gjatë vitit 2012 ishte 1.8 herë më e lartë se e vitit 2011. Diapazoni i
vlerave rezultoi mjaft i ndryshueshëm (0.32 - 68 NTU). Shkak mund të jetë
ndotjet nga shkarkimet e vazhdueshme në det të ujërave me ngarkesë të lartë
lëndësh organike sikurse ujërat e zeza, veçanërisht gjatë natës dhe herët në
mëngjes, që ndjehet nga era e rëndë përgjatë bregut. Stacionet më problematike
janë KP dhe KUQD.
• Përqëndrimi i NO3- gjatë vitit 2012 (0.93 mg/l) ishte 1.8 herë më i ulët se gjatë
2011 (1.70 mg/l), duke përmirësuar situatën e ujërave bregdetare. Duke e
krahasuar me standardin e rekomanduar NO3-N (0.1 mg/l) për ujërat sipërfaqësore
në kushte natyrore (Chapman, 1996), këto vlera konsiderohen më të larta se
standardi. Para një dekade ujërat portuale ishin në kushte natyrore sikurse deti i
hapur (Wilbur Smith Associates, 2003), ndërsa tani vihet re ndikimi i njeriut.
Ndryshe nga ujërat bregdetare të Gjirit të Durrësit, ujërat sipërfaqësore të Detit
Adriatik Jugor (Manca et al., 2004), janë brenda standardit për NO3-N të ujërat
sipërfaqësore në kushte natyrore.
• Përqëndrimi i fosfateve gjatë 2012 (0.25 mg/l) ishte 1.4 herë më i lartë se gjatë
2011 (0.17 mg/l). Duke e krahasuar me standardin e rekomanduar (PO4-P) për
ujërat sipërfaqësore në kushte natyrore (Chapman, 1996), këto vlera konsiderohen
më të larta se standardi. Ndryshe nga ujërat bregdetare të Gjirit të Durrësit, ujërat
sipërfaqësore të Detit Adriatik Jugor (Manca et al., 2004), janë brenda standardit
për PO4-P të ujërave sipërfaqësore në kushte natyrore.
• Po të krasojmë mesataren totale të vitit 2011 me vitin 2012 për N:P, rezulton se
ky raport zvogëlohet dukshëm, duke kaluar nga faktori kufizues N dhe P, në
faktorin kufizues N për rritjen e algave. Kjo mund të vijë për faktin se zvogëlohet
përqëndrimi i NO3-N gjatë vitit 2012. Duke krahasuar mesataren totale N:P 2011
& 2012 (10.02) në Gjirin e Durrësit me mesataren e Detit Adriatik Jugor (14.23)
(Manca et. al., 2004), rezulton se faktori kufizues në Gjirin e Durrësit është N,
kurse për Detin Adriatik Jugor faktorë kufizues janë N dhe P. Por, duhet theksuar
se në Gjirin e Durrësit përqëndrimet NO3-N dhe PO4-P janë mbi standardin e
lejuar për ujërat sipërfaqësore, kurse në Detin Adriatik Jugor përqëndrimet
paraqiten brenda standardeve.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
96
• Mesatarja e Chl a gjatë vitit 2012 (21.82 µg/l) ishte 2.1 herë më e vogël se gjatë
2011 (46.04 µg/l), duke treguar se gjendja ushqyese e ujërave bregdetare është
zvogëluar dukshëm. Për këtë, mund të ketë ndikuar vendosja e filtrave të posaçëm
në KP gjatë verës së vitit 2012.
• Të gjithë stacionet kategorizohen në nivel hipertrofik për të dy vitet, përjashtuar
PC, që është në gjendje eutrofike për vitin 2012. Ujërat e zeza mbeten burimi
kryesor i ndotjes së ujit, veçanërisht shtimit i ngarkesës me lëndë ushqyese, që
sjell dhe lulëzimin e algave.
• Mesatarja Chl a në Gjirin e Durrësit për vitet 2011 & 2012, (35.03 µg/L) është më
e madhe se mesatarja ndër vite e Detit Mesdhe (<0.2 µg/l) (Siokou-Frangou et al.,
2010), i cili përfshihet në klasën oligotrofike. Deti Adriatik Jugor referuar
përqëndrimit mesatar të Chl a në Gusht vitet 1997-1998, (Boldrin et al., 2002),
përfshihet në nivelin e trofisë të tipit oligotrofik, ndryshe nga ujërat e bregdetit të
Gjirit të Durrësit në Gusht, që paraqiten të tipit hipertrofik. Ujërat bregdetare
sipërfaqësore të Gjirit të Kotorrit në Mal të Zi për periudhën Shkurt, 2008 -
Dhjetor 2010, (Krivokapić et al., 2010) paraqiten më pak trofike duke kaluar nga
klasa oligotrofike deri në atë eutrofike, kur Chl a arrin vlera maksimale, ndryshe
nga ujërat e Gjirit të Durrësit që paraqiten eutrofike dhe hipertrofike. Referuar
ujërave bregdetare sipërfaqësore të Gjirit të Vlorës në Maj, 2007, Chl a paraqitet
në nivel oligotrofik (Mangoni et al., 2011). Kjo tregon impaktin negativ në
cilësinë e ujërave që sjell derdhja pa kriter e ujërave të ndotura pasuruar me lëndë
ushqyese në Gjirin e Durrësit.
• Bazuar përfundimet si më sipër, gjykojmë se vlerësimi i gjendjes mjedisore të
ujërave bregdetare meriton të kryhet duke marrë në kosideratë si faktorët fiziko-
kimikë edhe ata biologjikë, të cilët shfaqin një dinamikë jo gjithmonë të
parashikueshme, falë adaptimeve fiziologjike dhe shfaqjes së formave gjenetike të
reja.
• Gjithashtu, gjykojmë se korrelacioni i lartë ndërmjet faktorëve biologjike, si Chl a
dhe ADN-së fitoplanktonike, dhe lidhja me nivelin e trofisë, i bën të dy këta
indikatorë të vlefshëm për vlerësimin e shëndetit të ujërave bregdetare.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
97
VII. REKOMANDIME
• Ndërtimi i tubacioneve parësore e dytësore për ujërat e zeza dhe menaxhimi i
mbledhjes dhe përpunimit të mbeturinave, duhet të jetë me prioritet të lartë nga
autoritetet dhe komuniteti, përgjatë gjithë vijës bregdetare për qytetin e Durrësit,
që nga Golemi deri në Currila.
• Vënia në funksionim sa më shpejt e impiantit të përpunimit të ujërave të zeza në
Shën Vlash, do ta përmirësojë dukshëm nivelin trofik të ujërave bregdetare, për të
kaluar nga niveli hipertrofik në ato më ulëta eutrofike, pse jo mezotrofik dhe
oligotrofik.
• Ndërgjegjësimi i popullatës rezidente dhe tranzitore (pushuesit) përgjatë bregdetit
të Gjirit të Durrësit me fletëpalosje dhe takime me kominitetin e gjithë zonës,
duhet të realizohet nga autoritetet vendore, qendrore dhe organizata për mbrojtjen
e mjedisit, përfshirë dhe vullnetarizmin për nevojën emergjente jo vetëm të
pastrimit të bregdetit; por edhe mbrojtjen e tij si pasuri natyrore kombëtare e
domosdoshme në zhvillimin e turizmit, ruajtjen e biodiversitetit e shëndetit
human pranë ujërave të brigjeve.
• Zbatimi me vendosmëri i ligjit për mbrojtjen e mjedisit nga autoritetet vendore,
me gjobitjen ose bllokimin e aktiviteteve të atyre subjekteve të ndërtesave të
banimit, hoteleve dhe bizneseve, që derdhin ujëra të ndotura, përfshirë dhe ujërat
e zeza gjatë sezonit të plazhit.
• Monitorimi i vazhdueshëm i gjendjes mjedisore të ujërave bregdetare lidhur me
ndotjen mikrobiologjike dhe parametrat e tjerë fiziko-kimikë dhe biologjikë të
Gjirit të Durrësit.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
98
VIII. BIBLIOGRAFIA
Abeshi J., Dhakali L., Adhami M., Canaj E. (2008). Evaluation of heavy metals in
water and sediments of Adriatic Sea, Natura Montenegrina, 7(2): 475-486.
Agawin N. S. R. A., Duarte C. M., Agustí S. (2000). Nutrient and tem perature
control of the contribution of picoplankton to phytoplankton biom ass and production.
Limnol. Oceanogr., 45: 591-600.
Agawin N. S. R., Duarte C. M., Agusti S. (1998). Growth and abundance of
Synechococcus sp. in a Mediterranean Bay: seasonality and relationship with
temperature. Marine Ecology Progress Series 170: 45-53.
Ahlgren N. A., Rocap G., Chisholm S.W. (2006). Measurement of
Prochlorococcus ecotypes using real-time polymerase chain reaction reveals different
abundances of genotypes with similar light physiologies. Environ Microbiol. 8:441–
454.
Allman R., Manchee R., Lloyd D. (1993). Flow cytometric analysis of
heterogeneousbacterial populations. In 27-47. Flow cytometry in microbiology. D.
Lloyd (ed.). pp. Springer-Verlag, London, United Kingdom.
Amann R. I., Ludwig W., Schleifer K. H. (1995). Phylogenetic identification and
in situ detection of individual cells without cultivation. Microbiol. Rev. 59: 143–169.
Anderson D. M. & Morel F. M. M. (1978). Copper sensitivity of Gonyaulax
tamarensis. Limnol. Oceanogr. 23: 283–295.
APHA., AWWA., WEF. (2005). Standard Methods for the Examination of Water and
Wastewater, 21st ed. American Public Health Association, Washington D.C.
APHA., AWWA., WPCF. (1998). Standard Methods for the Examination of
Water and Wastewater. 20th edn., American Public Health Association, American
Water Works Association, Water Pollution Control Federation, Washington, D. C.
Apirion D. & Miczak A. (1993). RNA processing in prokaryotic cells. BioEssays
15: 113–120.
Arkivi i Autoritetit Portual Durrës.
Artegiani A., Paschini E., Russo A., Bregant D., Raicich F., Pinardi N. (1997).
The Adriatic Sea General Circulation. Part I: Air–Sea Interactions and Water Mass
Structure (PDF). Journal of Physical Oceanography (American Meteorological
Society), 27(8): 1492–1514.
Azam F., Fenchel T., Field J. G., Gray J. S., Meyer-Reil L. A., Thingstad F.
(1983). The ecological role of water-column microbes in the sea. Mar Ecol Prog Ser
10: 257–263.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
99
Bacu A., Babani F., Gjyli L. (2010). Preliminary results on the presence of
cyanobacteria Synechococcus in the Lagoon Waters of Northwestern Albania and
Lake of Shkodra, Proceedings of BALWOIS, Ohrid, Republic of Macedonia, 25-29
May 2010.
Bacu A., Babani F., Uku S., Malollari I. (2012). PCR based identification of the
presence of Aureococcus and Synechoccocus in the waters of lagoon ecosystem of
Kune-Vain, Albania. Journal of Environmental Protection and Ecology, Vol. 13 (2),
p. 651-660; ISSN 1311-5065.
Bacu. A., Babani F., Gjyli L. (2013). Does the trophy state of polluted areas have
impact on the presence of picophytoplankton species? - Case study in marine coastal
waters of Durrës Bay, Albania. International Journal of Ecosystems & Ecology
Science - IJEES, Vol. 3/1. ISSN 2224-4980.
Badger M. R., Hanson D., Price G. D. (2002). "Evolution and diversity of CO2
concentrating mechanism in cyanobacteria". Functional Plant Biology 29: 161–175.
Barry T., Colleran G., Glennon M., Dunican L. R., Gannon F. (1991). The
16S/23S ribosomal spacer region as a target for DNA probes to identify eubacteria.
PCR Methods Appl. 1: 51–56.
Baudoux A. C., Veldhuis M. J. W., Noordeloos A. A. M., van Noort G.,
Brussaard C. P. D. (2008). Estimates of virus- vs. grazing induced mortality of
picophytoplankton in the North Sea during summer. Aquat Microb Ecol. 52: 69−82.
Baudoux A. C., Veldhuis M. J. W., Witte H. J., Brussaard C. P. D. (2007).
Viruses as mortality agents of picophytoplankton in the deep chlorophyll maximum
layer during IRONAGES III. Limnol Oceanogr. 52: 2519−2529.
Beardall J. (2008). Blooms of Synechococcus: An analysis of the problem
worldwide and possible causative factors in relation to nuisance blooms in the
Gippsland Lakes. A report prepared for the Gippsland Lakes Taskforce.
Beardsley R. C., Limeburner R., Yu H., Cannon G.A. (1985). Discharge of the
Changjiang (Yangtze River) into the East China Sea. Cont. Shelf Res., 4: 57-76.
Bec B., Husseini-Ratrema J., Collos Y., Souchu P., Vaquet A. (2005). Phytoplankton
seasonal dynamics in a Mediterranean coastal lagoon: emphasis on the picoeukaryote
community. Journal of Plankton Research 27: 881-894.
Beiko R. G., Harlow T. J., Ragan M. A. (2005). Highways of gene sharing in
prokaryotes. Proc Natl Acad Sci USA. 102: 14332–14337.
Berg K. L., Squires C., Squires C. L. (1989). Ribosomal RNA operon
antitermination. Function of leader and spacer region box B-box A sequences and
their conservation in diverse microorganisms. J. Mol. Biol. 209: 345–358.
Bi-Drilling Shpk. (2008). Vlerësimi i Ndikimit në Mjedis i Terminalit të Ri të
Trageteve në Autoritetin Portual, Durrës, pp. 39-60.
Biondi N., Piccardi R., Margheri M. C., Rodolfi L., Smith G.D., Tredici M. R.
(2004). Evaluation of Nostoc strain ATCC 53789 as a potential source of natural
pesticides. Appl. Environ. Microbiol., 70: 3313-3320.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
100
Blackburn N., Fenchel T., Mitchell J. (1998). Microscale nutrient patches in
planktonic habitats shown by chemotactic bacteria. Science 282: 2254-2256.
Blanchot J. & Rodier M. (1996). Picophytoplankton abundance and biomass in
the western tropical Pacific Ocean during the 1992 El Nino year: results from flow
cytometry. Deep Sea Research I 43: 877-895.
Blanchot J., Andre J.M., Navarette C., Neveux J., Radenac M. H. (2001).
Picophytoplankton in the equatorial Pacific: vertical distributions in the warm pool
and in the high nutrient low chlorophyll conditions. Deep Sea Reasearch I 48: 297-
314.
Blanchot J., Rodier M., LeBouteiller A. (1992). Effect of El Niño Southern
Oscillation events on the distribution and abundance of phytoplankton in the Western
Pacific Tropical Ocean along 165°E. J. Plank. Res 14: 137–156.
Boldrin A., Miserocchi S., Rabitti S., Turchetto M. M., Balboni V., Socal G.
(2002). Particulate matter in the southern Adriatic and Ionian Sea: characterisation
and downward fluxes. Journal of Marine Systems 33-34: 389-410.
Bonilla I., Bolanos L., Mateo P. (1995). Interaction of Boron and Calcium in the
cyanobacteria Anabaena and Synechococcus, Physiol. Plant., 94: 31-36.
Brahamsha B. (1996a). An abundant cell-surface polypeptide is required for
swimming by the nonflagellated marine cyanobacterium Synechococcus. Proc. Natl.
Acad. Sci. 93: 6504-6509.
Brahamsha, B. (1999a). Non-flagellar swimming in marine Synechococcus. J.
Mol. Microbiol. Biotechnol. 1: 59-62.
Brand L. E., Sunda W. G., Guillard R. R. L. (1986). Reduction of marine
phytoplankton reproduction rates by copper and cadmium. J. Exp. Mar. Biol. Ecol.
96: 225–250.
Bremer H. & Dennis P. P. (1996). Modulation of chemical composition and other
parameters of the cell by growth rate, p. 1553–1569. In F. C. Neidhardt, R. Curtiss
III, J. L. Ingraham, E. C. C. Lin, K. B. Low, B. Magasanik, W. S. Reznikoff, M.
Riley, M. Schaechter, and H. E. Umbarger (ed.), Escherichia coli and Salmonella:
cellular and molecular biology, 2nd
ed. ASM Press, Washington, D.C.
Brian J. & Liu Y. C. (1998). Growth rate regulation of rRNA content of a marine
Synechococcus (cyanobacterium) strain. Journal: Applied and Environmental
Microbiology - AEM, 64, (9): 3346-3351.
Burkill P. H., Leakey R. J. G., Owens N. J. P., Mantoura R. F. C. (1993).
Synechococcus and its importance to the microbial food web of the northwestern
Indian Ocean. Deep-Sea Res Part II, 40: 773–782.
Buskey E. J., Deyoe H., Jochem F. J., Villareal T. A. (2003). Effects of
mesozooplankton removal and ammonium addition on planktonic trophic structure
during a bloom of the Texas „brown tide‟: a mesocosm study. Journal of Plankton
Research 25: 215-228.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
101
Campbell L. & Carpenter E. J. (1986a). Estimating the grazing pressure of
heterotrophic nanoplankton on Synechococcus sp. using the seawater dilution and
selective inhibitor techniques. Mar. Ecol. Prog. Ser. 33, 121-129.
Campbell L. & Vaulot D. (1993). Photosynthetic picoplankton community
structure in the stubtropical North Pacific Ocean new Hawaii (station ALOHA). Deep
Sea Research I, 40: 2043-2060.
Chapman D. (1996). Water Quality Assessments - A Guide to the Use of Biota,
Sediments and Water in Environmental Monitoring, Second Edition, Published on
behalf of UNESCO, WHO, and UNEP.Chapman and Hall, London.
Chen S., He W., Yao S., Zang S. (1993). A classification of hydrological climate
seasons in the China Seas. Acta Oceanol.Sin., 12: 63-78.
Choi D. H. & Noh J. H. (2006). Molecular phylogenetic analyses of three
Synechococcus strains isolated from seawater near the ieodo ocean research station.
Ocean Science Journal, 41 (4): 315-318.
Chow T-J. & Tabita, F. R. (1994). Reciprocal Light-Dark Transcriptional Control
of nif and rbc expression and light-dependent post-translational control of nitrogenase
activity in Synechococcus sp. Strain RF-1. Journal of Bacteriology 176: 6281-6285.
Christaki U., Courties C., Karayanni H., Giannakouron A., Maravelias C.,
Kormas A. K., Lebaron P. (2002). Dynamic characteristics of Prochlorococcus and
Synechococcus consumption by bacterivorous nanoflagellates. Microb Ecol 43:
341−352.
Christensen H., Jorgensen K., Olsen J. E. (1999). Differentiation of
Campylobacter coli and C. jejuni by length and DNA sequence of the 16S-23S rRNA
internal spacer region. Microbiology 145: 99–105.
CIMMYT. (2005). Laboratory Protocols: CIMMYT Applied Molecular Genetics
Laboratory. Third Edition. Mexico, D.F.: CIMMYT.
Clarke S. E. (1987). Induction of siderophore activity in Anabaena species and its
moderation of copper toxicity. Applied and Environmental Microbiology. 53(5): 917-
922.
Clijsters Η. & Van Assche F. (1985). Inhibition of photosynthesis by heavy
metals; Photosynth. Res. 7: 31–41.
Cloern J. E. (1987). Turbidity as a control on phytoplankton biomass and
productivity in estuaries. Continental Shelf Research 7(11/12): 1367-1381.
Coale K. H. & Bruland K. W. (1990). Spatial and temporal variability in copper
complexation in the North Pacific. Deep-Sea Res. 47: 317–336.
Coleman M. L. & Chisholm S.W. (2007). Code and context: Prochlorococcus as a
model for cross-scale biology. Trends Microbiol. 15: 398–407.
Coleman M. L., Sullivan M. B., Steglich C., DeLong E. F., Chisholm S. W.
(2006). Genomic islands and the ecology and evolution of Prochlorococcus. Science.
311: 1768–1770.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
102
Collier J. L. & Campbell L. (1999). Flow cytometry in molecular aquatic ecology.
Hydrobiologia. 401: 33–53.
Connell D. W. & Miller G. J. (1984). Chemistry and Ecotoxicology of Pollution,
John Wiley & Sons, Inc., New York.
Dammeyer T., Bagby S. C., Sullivan M. B., Chisholm S. W., Frankenberg-
Dinkel N. (2008). Efficient phage-mediated pigment biosynthesis in oceanic
cyanobacteria. Curr Biol., 18: 442–448.
Darzynkiewicz Z. & Crissman H. A. (1990). Preface. In: Methods in Cell Biology
Vol. 33. Flow Cytometry. Z. Darzynkiewicz and H.A. Crissman, (eds.). pp, 15-17.
Academic
Davey H. & Kell D. (1996). Flow cytometry and cell sorting of heterogeneous
microbial populations: the importance of single-cell analysis. Microbiol. Rev. 60:
641-696.
Dawes C. J. (1998). Marine Botany. 2nd edition. John Wiley and Sons Inc., New
York, NY.
De Philippis R. & Vincenzini M. (1998). Exocellular polysaccharides from
cyanobacteria and their possible applications. FEMS Microbiol. Rev. 22: 151-175.
Dolan J. R. & Simek K. (1999). Diel Periodicity in Synechococcus Populations
and Grazing by Heterotrophic Nanoflagellates: Analysis of Food Vacuole. Limnology
and Oceanography, 44: 1565-1570.
Donat J. R. & van den Berg C. M. G. (1992). A new cathodic stripping
voltammetric method for determining organic copper complexation in seawater. Mar.
Chem. 38: 69–90.
Dortch Q., Roberts T. L., Clayton J. R., Ahmed S. I. (1983). RNA/DNA ratios
and DNA concentrations as indicators of growth rate and biomass in planktonic
marine organisms. Mar. Ecol. Prog. Ser. 13: 61–71.
Duarte C. M. (1995). Submerged aquatic vegetation in relation to different
nutrient regimes. Ophelia 41: 87-112.
Dufresne A., Ostrowski M., Scanlan D.J., Garczarek L., Mazard S., Palenik B.P.,
Paulsen I.T., Tandeau de Marsac N., Wincker P., Dossat C., Ferriera S., Johnson J.,
Post A.F., Hess W. R., Partensky F. (2008). Unraveling the genomic mosaic of a
ubiquitous genus of marine cyanobacteria. Genome Biol9: R90.
Dufresne A., Salanoubat M., Partensky F., Artiguenave F., Axmann I. M., Barbe
V., Duprat S., Galperin M. Y., Koonin E. V., Le Gall F., Makarova K. S., Ostrowski
M., Oztas S., Robert C., Rogozin I. B., Scanlan D. J., Tandeau de Marsac N.,
Weissenbach J., Wincker P., Wolf Y. I., Hess W. R. (2003). Genome sequence of the
cyanobacterium Prochlorococcus marinus SS120, a nearly minimal oxyphototrophic
genome. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100: 10020–10025.
Dyer D. L. & Gafford R. D. (1961). Some characteristics of a thermophilic blue-
green alga. Science 134: 616–617.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
103
EPA. (2008). Water Quality in Ireland 2004 – 2006. The quality of estuarine and
coastal waters, Chapter four p. 4-11. Environmental Protection Agency, Wexford
2008.
Evans S. L., Anderson W. T., Jochem F. J. (2006). Spatial variability in Florida
Bay particulate organic matter composition: combining flow cytometry with stable
isotope analyses. Hydrobiologia 569:151–165.
Fouchet P., Jayat C., Hechard Y., Ratinaud M. H., Frelat G. (1993). Recent
advances in flow cytometry in fundamental and applied microbiology. Biochem. Cell
Biol. 78: 95–109.
Fuhrman J. A., Comeau D. E., Hagstrom A., Chan A. M. (1988). Extraction from
natural planktonic microorganisms of DNA suitable for molecular biological studies,
Appl. Environ. Microbiol., 54: 1426–1429.
Fuller N. J., Marie D., Partensky F., Vaulot D., Post A.F., Scanlan D.J. (2003).
Clade-specific 16S ribosomal DNA oligonucleotides reveal the predominance of a
single marine Synechococcus clade throughout a stratified water column in the Red
Sea. Appl. Environ. Microbiol., 69: 2430-2443.
Furnas M. J. (1990). In situ growth rates of marine phytoplankton: approaches to
measurement, community and species growth rates. J. Plankton Res. 12: 1117–1151.
Gardea-Torresdey J. L., Arenas J. L., Webb R., Tiemann K., Gonzalez J. (1996a).
Uptake of Metal Ions from Solution by Inactivated Cells of Cyanobacteria.
Proceedings for 1996, HSRC-WERC Joint Conference of the Environment, pp. 48-
58.
Gasol J. M. & Morán X. A. G. (1999). Effects of filtration on bacterial activity
and picoplankton community structure as assessed by flow cytometry. Aquat. Microb.
Ecol. 16: 251–264.
Gasol J.M., Zweifel U.L., Peters F., Furhman J.A., Hagström Å. (1999).
Significance of size and nucleic acid content heterogeneity as assessed by flow
cytometry in natural planktonic bacteria. Appl. Environ. Microbiol. 65: 4475–4483.
Gjyli L. & Kolitari J. (2011). Variation of Phytoplankton Biomass as Chlorophyll
a in coastal waters of Durres. Proceedings of International Conference
Biotechnological Development, 20-21 November 2011, Tirana, Albanian. BSHN
(UT), 2011, Special: 247-255. ISSN: 224-1779.
Gjyli L. & Mukli L. (2010). Assessment of water microbiologic pollution in
Durres‟s Marine Harbour basin, ALBANIA. Journal of Life Sciences, USA, 2010: 4
(4, 29), 32-39, ISSN: 1934-7391.
Gjyli L., Bacu A., Kolitari J., Gjyli S. (2013a). Primarily results of phytoplankton
and variation to environmental factors in Durres‟s Bay coastal waters (Albania).
Journal of Microbiology, Biotechnology and Food Sciences, JMBFS, 3 (2): 132-136.
ISSN: 1338-5178.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
104
Gjyli L., Bacu A., Kolitari J., Gjyli S. (2013b). Dynamics of picophytoplankton
and presence of cyanobacteria Synechoccocus in coastal waters of Durrës Bay
(Albania). Albanian j. agric. sci. (AJAS), 2013, 12 (4): 585-592. ISSN: 2218-2020.
Gjyli L. & Bacu A. (2014). Preliminary correlation between the quality of the
waters and 16-23S rDNA-ITS diversity of Synechococcus populations at Durres Bay.
The Albanian Journal of Natural and Technical Sciences, (AJNTS), 36 (1): (in press).
ISSN: 2074-0867.
Glibert P. M., Heil C. A., Hollander D., Revilla M., Hoare A., Alexander J.,
Murasko S. (2004). Evidence for dissolved organic nitrogen and phosphorus uptake
during a cyanobacterial bloom in Florida Bay. Marine Ecology Progress Series 280:
73– 83.
Golbeck J. Η., Stephen L., San-Pietro A. (1977). Isolation and characterization of
sub-chloroplast particle enriched in iron-sulphur protein and Ρ 700; Arch. Biochem.
Biophys. 178: 140–150.
Gothalwal R. & Bisen P. S. (1993). Isolation and Physiological Characterization
of Synechooccus cedrorum 1191 Strain Tolerant to Heavy Metals and Pesticides,
Biology and Env. Sci., 6, pp. 187-194.
Graham L. E. & Wilcox L.W. (2000). Algae. Prentice Hall, New Jersey, U.S.A.,
11: 573-574.
Granéli E., Wallstrom K., Larsson U., Granéli W., Elmgren R. (1990). Nutrient
limitation of primary production in the Baltic Sea area. Ambio 19: 142–151.
Grasshoff K., Kremling M., Ehrhardt M. (1999). Methods of Seawater Analysis.
Third Completely Revised and Extended Edition, Verlag Chemie, Weinheim,
Germany.
Grazhdani A. (2008). Praktika të bioteknologjisë molekulare. Shtëpia botuese
Dituria, Tiranë, ISBN 978-99943-46-39-4.
Guo Y. J. (1994). Primary productivity and phytoplankton in China Seas. p. 227-
242. In: Oceanology of China Seas, ed. by D. Zhou, Y.B. Liang and C.K. Zeng.
Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, The Netherlands.
Gürtler, V. & Stanisich V. (1996). New approaches to typing and identification of
bacteria using the 16S-23S rDNA spacer region. Microbiology 142: 3–16.
Håkanson L. & Jansson M. (1983). Principles of lake Sedimentology. Springer,
Berlin, 316 p.
Håkanson L., Bryhn A. C., Brenckner T. (2007). Operational Effect Variables and
Functional Ecosystem Classifications – a Review on Empirical Models for Aquatic
Systems along a Salinity Gradient. Internat. Rev. Hydrobiol., 92(3): 334 p.
Heiskanen A.S. & Kononen K. (1994). Sedimentation of vernal and late summer
phytoplankton communities in the coastal Baltic Sea. Arch. Hydrobiol., 131: 175-198.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
105
Herdman M., Castenholz R.W., Waterbury J.B., Rippka R. (2001).
Synechococcus. In: Garrity GM (ed) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology,
2nd ed., Volume One. Springer, New York: 508-512.
Hinga K. R. (2002). Effects of pH on coastal marine phytoplankton, Marine
Ecology Progress Series 238, 281-300.
Hobbie J.E., Daley R.J. Jasper S. (1977). Use of nucleopore filters for counting
bacteria by epifluorescence microscopy. Appl.Environ.Microbiol. 33: 1225-1228.
Hodgkiss I. J. & Lu S. H., (2004). The effects of nutrients and their ratios on
phytoplankton aboundance in Junk Bay, Hong Kong. Hydrobiologia, 512 (1-3): 215-
229.
Honeycutt R. C. & Krogmann D. W. (1972). Inhibition of chloroplast reactions
with phenylmercuric acetate; Plant Physiol., 49: 376–380.
Howarth R. W. (1988). Nutrient limitation of net primary production in marine
ecosystems. Ann. Rev. Ecol. Syst. 19: 89–110.
http://bold-ed.com/corr.htm
http://faculty.quinnipiac.edu/libarts/polsci/statistics.html
http://www.apdurres.com.al
http://www.jgi.doe.gov/JGI_microbial/html/index.html
http://www.ozcoasts.gov.au/indicators/dissolved_oxygen.jsp
http:www.ozcoasts.gov.au/indicators/turbidity.jsp
https://maps.google.com
ICES. International Council for the Exploration of the Sea (ICES). Conseil
International pour l'Exploration de la Mer (CIEM).
http://ocean.ices.dk/Tools/UnitConversion.aspx
Ingraham J. L., Maaløe O., Neidhardt F. C. (1983). Growth of the bacterial cell.
Sinauer Associates, Inc., Sunderland, Mass.
Issa A. A. (1999). Antibiotic production by the cyanobacteria Oscillatoria
angustissima and Calothrix parietina. Environ. Toxicol. Pharmacol., 8, 33-37.
Jiao N., Yang Y., Koshikawa H., Watanabe M. (2002). Influence of hydrographic
conditions on picoplankton distribution in the East China Sea. Aqua. Microb. Ecol.,
30, 37-48.
Jiao, N., Y. Yang, N. Hong, Y. Ma, S. Harada, H. Koshikawa, and M. Watanabe.
2005. Dynamics of autotrophic picoplankton and heterotrophic bacteria in the East
China Sea. Cont. Shelf Res., 25: 1265-1279.
Johnson P. M. and Sieburth J. M. (1979). Chroococcoid cyanobacteria in the sea:
a ubiquitous and diverse phototrophic biomass. Limnology and Oceanography 24 (5):
928–935.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
106
Karlson B. & Nilsson P. (1991). Seasonal distribution of picoplanktonic
cyanobacteria of Synechococcus type in the eastern Skagerrak. Ophelia 34: 171–179.
Katano T., Hirose M., Nakano S. (2004). Discrimination of two phycoerythrin -
pigment types of Synechococcus and their seasonal succession in the Uwa Sea.
Microbes Environ., 19 (1): 7-12.
Katoh S. & Takämiya A. (1964). Nature of Copper-protein binding in spinach
plastocyanin; J. Biochem., 55: 378–387.
Kemp P. F., Lee S., LaRoche J. (1993). Estimating the growth rate of slowly
growing marine bacteria from RNA content. Appl. Environ. Microbiol. 59: 2594–
2601.
Kettler G. C., Martiny A. C., Huang K., et al. (2007). Patterns and implications of
gene gain and loss in the evolution of Prochlorococcus. PLoS Genet. 3: e231.
Kiørboe T. (1993). Turbulence, phytoplankton cell size, and the structure of
pelagic food webs. Adv. Mar. Biol., 29: 1-72.
Koerselman W. & Meuleman A. F. M. (1996). The vegetation N:P ratio: a new
tool to detect the nature of nutrient limitation. Journal of applied Ecology, 33: 1441-
1450.
Kojima Υ., Hiyama Τ., Sakurai Η. (1987). Effects of mercurials on iron-sulfur
centres of photosystem I of Anacystis nidulans; in Progress in photosynthesis
research (ed.) J Biggins (Amsterdam: Nijhoff/Junk Publishers) Vol. 2, pp. 57-60.
Kozelka P. B. & Bruland K. W. (1998). Chemical speciation of dissolved Cu, Zn,
Cd, Pb in Narragansett Bay, Rhode Island. Mar. Chem. 60: 267–282.
Kramer J. G. & Singleton F. L. (1993). Measurement of rRNA variations in
natural communities of microorganisms on the southeastern U.S. continental shelf.
Appl. Environ. Microbiol. 59: 2430–2436.
Krivokapić S., Pestorić B., Drakulović D., Krivokapić M. (2010). Temporal
variavility of phytoplankton biomass last two years (2008-2010) in Kotor Bay,
Natura Montenegrina, 9(3): 275-280.
Kuosa H. (1991). Picoplanktonic algae in the northern Baltic Sea: seasonal
dynamics and flagellate grazing. Mar. Ecol. Prog. Ser., 73: 269-276.
Lavin P., Gómez P., González B., Ulloa O. (2008). Diversity of marine
picocyanobacteria Prochloroccus and Synechococcus assessed by terminal restriction
fragment length polymorphisms of 16-23S rRNA internal transcribed spacer
sequences, Revista Chilena de Historia Natural, 1988, 81: 515-53.
Leblond-Bourget N., Philippe H., Mangin I., Decaris B. (1996). 16S rRNA and
16S to 23S internal transcribed spacer sequence analyses reveal inter- and
intraspecific Bifidobacterium phylogeny. Int. J. Syst. Bacteriol. 46: 102–111.
Li W. K. W. (1994). Primary production of prochlorophytes, cyanobacteria, and
eukaryotic ultraphytoplankton: measurements from flow cytometric sorting. Limnol.
Oceanogr. 39: 169-175.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
107
Li W. K. W. (1995). Composition of ultraphytoplankton in the central North
Atlantic, Mar Ecol Prog Ser., 122: 1–8.
Li W. K. W. (1998). Annual average abundance of heterotrophic bacteria and
Synechococcus in surface ocean waters. Limnology & Oceanography, 43: 1746-1753.
Li W. K. W., Jellett J. F., Dickie P. M. (1995). DNA distribution in planktonic
bacteria stained with TOTO or TO-PRO.Limnol Oceanogr. 40: 1485–1495.
Li W. K. W., Subba Rao D. V., Harrison W. G., Smith J. C., Cullen J. J., Irwin B.,
Platt T. (1983). Autotrophic picoplankton in the tropical ocean. Science 219: 292–
295.
Lindell D., Sullivan M. B., Johnson Z. I., Tolonen A.C., Rohwer F., Chisholm
S.W. (2004). Transfer of photosynthesis genes to and from Prochlorococcus viruses.
Proc Natl Acad Sci USA 101: 11013–11018.
Livingston R. J. (2001). Eutrophication Processes in Coastal Systems. CRC Press,
Boca Raton.
Mackey D. J., Blanchot J., Higgins H. W., Neveux J. (2002). Phytoplankton
abundances and community structure in the equatorial Pacific, Deep-Sea Research
Part II, 49: 2561–2582.
Manca B., Burca M., Giorgetti A., Coatanoan C., Garcia M. J., Iona A. (2004).
Physical and biochemical averaged vertical profiles in the Mediterranean regions: an
important tool to trace the climatology of water masses and to validate incoming data
from operational oceanography. Journal of Marine Systems, 48: 83–116.
Mangoni O., Margiotta F., Saggiomo M., Santarpia I.,Bullidon G., Saggiomo V.
(2011). Tropic Characterization of the pelagic Ecosystem in Vlora Bay (Albania),
Journal of Coastal Research, 58: 67-79.
Mann E. L., Ahlgren N., Moffett J. W, Chisholm S. W. (2002). Copper toxicity and
cyanobacteria ecology in the Sargasso Sea; Limnol. Oceanogr., 47(4): 976–988.
Mann N. & Carr N. G. (1974). Control of macromolecular composition and cell
division in the blue-green alga Anacystis nidulans. J. Gen. Microbiol. 83: 399–405.
Marie D., Partensky F., Jacquet S., Vaulot D. (1997). Enumeration and cell cycle
analysis of natural populations of marine picoplankton by flow cytometry using the
nucleic acid stain SYBR Green I. Appl. Environ. Microb. 63: 186-193.
Marie D., Vaulot D., Partensky F. (1996). Application of the novel nucleic acid
dyes YOYO-1, YO-PRO-1, and PicoGreen for flow cytometric analysis of marine
prokaryotes. Appl Environ Microbiol. 62:1649–1655.
Martins R. F., Ramos M. F., Herfindal L., Sous J. A., Skarven K., Vasconcelos
V.M. (2008). Antimicrobial and cytotoxic assessment of marine cyanobacteria -
Synechocystis and Synechococcus. Mar. Drugs, 6: 1-11.
McDermott C. M., Nho C. W., Howard W., Holton B. (1998). The cyanobacterial
toxin, Microcystin-LR, can induce apoptosis in a variety of cell types. Toxicon, 36:
1981-1996.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
108
MEGASTAT. XLA for windows 2007. Getting Started with MegaStat ® J. B.
Orris Butler University, 2007.
Microsoft Office Excel 2007, http://office.microsoft.com
Minitab 15, http://minitab.en.softonic.com/
Modigh M., Saggiomo V., d‟ Alcalà M. R. (1996). Conservative features of
picoplankton in a Mediterranean eutrophic area, the Bay of Naples. Journal of
Plankton Research 18: 87-95.
Moffett J. W. (1995). Temporal and spatial variability of copper complexation by
strong chelators in the Sargasso Sea. Deep- Sea Res. 42: 1273–1295.
Moffett J. W., Brand L. E., Croot P. L., Barbeau K. A. (1997). Cu speciation and
cyanobacterial distribution in harbors subject to anthropogenic Cu inputs. Limnol.
Oceanogr. 42: 789–799.
Moffett J. W., Zika R. G., Brand L. E. (1990). Distribution and potential sources
and sinks of copper chelators in the Sargasso Sea. Deep-Sea Res. 37: 27–36.
Mohanty Ν. & Mohanty Ρ. (1988). Cation effects on primary processes of
photosynthesis; in Advances in frontier areas of plant biochemistry (eds) R Singh and
S Κ Sawhney (New Delhi: Printice Hall of India) pp. 1–18.
Monbet Y. (1992). Control of phytoplankton biomass in estuaries: A comparative
analysis of microtidal and macrotidal estuaries. Estuaries 15(4): 563-571.
Monger B.C. & Landry M. R. (1993). Flow cytometric analysis of marine bacteria
with Hoechst 33342. Appl. Environ. Microbiol., 59: 905–911.
Moore L. R., Rocap G., Chisholm S. W. (1998). Physiology and molecular
phylogeny of coexisting Prochlorococcus ecotypes. Nature 393: 464–467.
Moore L.R., Goericke, R., Chisholm, S. (1995). Comparative physiology of
Synechcoccus and Prochlorococcus: influence of lght and temperature on growth,
pigments, fluorescence and absorptive properties. Marine Ecology Progress Series
116: 259-275.
MULTIBASE 2012 for Windows 2007. Multibase includes Principal Component
Analysis (PCA), Partial Least Squares (PLS), Cluster Analysis, Box-WhiskerPlot,
ROC curve, and several data-mining tools, 2012,
http://www.numericaldynamics.com.
Mundt S., Kreitlow S., Nowotny A., Effmert U. (2001). Biochemical and
pharmacological investigations of selected cyanobacteria. Int. J. Hyg. Environ.
Health, 203: 327-334.
Murrell M. C. & Lores E. M. (2004). Phytoplankton and zooplankton seasonal
dynamics in a subtropical estuary: importance of cyanobacteria. Journal of Plankton
Research 26: 371-382.
Murthy S. D. S. & Mohanty Ρ. (1991a). Mercury induces alteration of energy
transfer in phycobilisomes by selectively affecting the pigment protein, phycocyanin
in the cyanobacterium Spirulina platensis; Plant Cell Physiol. 32: 231-237.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
109
Murthy S. D. S. & Mohanty Ρ. (1991b). Inhibitory effects of heavy metal ions on
bioenergetic processes of photosynthesis; in Trends in bioenergetics and
biotechnological processes (eds) G S Singhal and Τ Rama Sarma (New Delhi: Today
and Tomorrow Publishers) pp. 185-196.
Murthy S. D. S. & Mohanty Ρ. (1993). Mercury ions inhibit photosynthetic
electron transport at multiple sites in the cyanobacterium Synechococcus 6301, J.
Biosci., 18 (3): 355-360.
Murthy S. D. S., Sabat S. C., Mohanty Ρ. (1989). Mercury induced inhibition of
photosystem II activity and changes in the emission of fluorescence from
phycobilisome in intact cells of the cyanobacterium Spirulina platensis; Plant Cell
Physiol., 30: 1153–1157.
Myers V. B. & Iverson R.L. (1981). Phosphorus and nitrogen limited
phytoplankton productivity in northeastern Gulf of Mexico coastal waters. In:
Neilson, B.J. and L.E. Cronin, eds. Estuaries and Nutrients. Humana Press, Clifton,
New Jersey, pp. 569-582.
Ning X., Cloern J. E., Cole, B. E. (2000). Spatial and temporal variability of
picocyanobacteria Synechococcus sp. in San Francisco Bay, Limnology and
Oceanography 45: 695-702.
Noh J. H., Yoo S. J., Lee J.A., Kim H. C., Lee J. H. (2005). Phytoplankton in the
waters of the Ieodo Ocean Research Station determined by microscopy, flow
cytometry, HPLC pigment data and remote sensing. Ocean & Polar Res., 27: 397-
417.
Odate T. (1996). Abundance and size composition of the summer phytoplankton
communities in the western North Pacific Ocean, the Bering Sea, and the Gulf of
Alaska. J. Oceanogr., 52: 335–351.
OECD. (1982). Eutrophication of waters. Monitoring, assessment and control.
OECD, Paris, 154 p.
Olson R. J , Chisholm S. W., Zettler E. R., Altabet M. A., Dusenberry J. A.
(1990a). Spatial and temporal distributions of Prochlorophytes in the North Atlantic
Ocean. Deep Sea Research I., 37: 1033-1051.
Olson R. J., Chisholm S. W., Zettler E. R., Armbrust E. V. (1990b). Pigments,
size, and distribution of Synechococcus in the North Atlantic and Pacific Oceans.
Limnol Oceanogr., 35: 45–58.
OSI (2002). Marine Survey Report, Ocean Surveys, Inc. May, 2002.
Oviatt C., Doering P., Nowiclu B., Reed L., Cole J., Frithsen J. (1995). An
ecosystem level experiment on nutrient limitation in temperate coastal marine
environments. Mar. Ecol. Prog. Ser., 116: 171-179.
Palenik B. & Haselkorn R. (1992). Multiple evolutionary origins of
prochlorophytes, the chlorophyll b-containing prokaryotes. Nature. 355: 265–267.
Pano N., Selenica A., Puka V., Hysi B. (1984). Hidrologjia e Shqipërisë. Ist.
Hidromet., Ak. Shk. Tiranë: pp. 360-386.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
110
Parrott L. M., & Slater J. H. (1980). The DNA, RNA and protein composition of
the cyanobacterium Anacystis nidulans grown in light- and carbon dioxide-limited
chemostats. Arch. Microbiol., 127: 53–58.
Partensky F., Blanchot J., Lantoine F., Neveux J., Marie D. (1996). Vertical
structure of picophytoplankton at different trophic sites of the tropical northeastern
Atlantic Ocean, Deep-Sea Research Part I, 43 (8): 1191–1213.
Partensky F., Blanchot J., Vaulot D. (1999a). Differential distribution and ecology
of Prochlorococcus and Synechococcus in oceanic waters: a review. In: Charpy L,
Larkum AWD (eds) Marine cyanobacteria. no. NS 19. Bulletin de l'Institut
Oceanographique Monaco, 19. Musee oceanographique, Monaco, p 457-475.
Partensky F., Hess W. R., Vaulot D. (1999b). Prochlorococcus, a Marine
Photosynthetic Prokaryote of Global Significance. Microbiology and Molecular
Biology Reviews Mar., (1): 106–127.
Paul J. (2008). Phytoplankton DNA extraction. Text Book, 2008.
Penno S., Lindell D., Post A. F. (2006). Diversity of Synechococcus and
Prochlorococcus populations determined from DNA sequences of the N-regulatory
gene ntcA. Environ Microbiol., 8:1200–1211.
Perez M. C. & Carrillo A. (2005). Picocyanobacteria distribution in the Ebro
Estuary (Spain) Acta Bot. Croat., 64: 237–246.
Perkins F. O., Haas L. W., Phillips D. E., Webb K. L. (1981). "Ultrastructure of a
marine Synechococcus possessing spinae". Canadian Journal of Microbiology 27 (3):
318–329.
Phlips E. J., Badylak S., Lynch T. C. (1999). Blooms of the picoplanktonic
cyanobacterium Synechococcus in Florida Bay, a subtropical inner-shelf lagoon.
Limnol. Oceanogr., 14: 1166-1 175.
Pichard S. L., Fricher M. E., Paul J. H. (1993). Ribulose bisphosphate carboxylase
gene expression in subtropical marine phytoplankton populations, Mar. Ecol. Prog.
Ser., 1993, 101: 55-65.
Partensky F., Blanchot J., Lantoine F., Neveux J., Marie D. (1996). Vertical
Structure of Picophytoplankton at Different Trophic Sites of the Tropical
Northeastern Atlantic Ocean. Deep Sea Research I., 43 (8): 1191–1213.
Pitta T. P. & Berg, H.C. (1995). Self-electrophoresis is not the mechanism for
motility in swimming cyanobacteria. J. Bacteriol. 177: 5701-5703.
Pitta, T. P., Sherwood, E. E., Kobel, A. M., and Berg, H. C. (1997). Calcium is
required for swimming by the nonflagellated cyanobacterium Synechococcus strain
WH 8113. J. Bacteriol. 179: 2524-2528.
Porter J., Deere D., Hardman M., Edwards C., Pickup R. (1997). Go with the
flow: use of flow cytometry in environmental microbiology. FEMS Microbiol. Ecol.
24: 93–101.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
111
Porter K. G. & Feig Y. S. (1980). The use of DAPI for identifying and counting
aquatic microflora. Limnol. Oceanogr., 25: 943-948.
Pushparaj B., Pelosi E., Juttner F. (1999). Toxicological analysis of the marine
cyanobacterium Nodularia harveyana. J. Appl. Phycol., 10: 527-530.
Radić T., Šilović T., Šantić D., Fuks D., Mičić M. (2009). Preliminary flow
cytometric analyses of phototrophic pico-and nanoplankton communities in the
Northern Adriatic. Fresen. Environ. Bull. 18: 715-724.
Rao C. S. V. R. (1994). Antimicrobial activity of cyanobacteria. I. J. Mar. Scien.,
23, 55-56.
Raport për Gjendjen e Mjedisit (2011). Botim i Ministrisë së Mjedisit, Pyjeve dhe
Administrimit të Ujërave. Tiranë, 2012. “Monitorimi i rezervës së peshqve fundorë në
ujërat detare” pp. 209-217; 115-144.
Redfield A. C., Ketchum B. H., Richards F. A., (1963). The Influence of
Organisms on the Composition of Seawater. In: Hill, M.N. (Ed.), The Sea. Volume 2.
Wiley-Interscience, New York, p. 26-77.
Rippka R. & Cohen-Bazire G. (1983). The Cyanobacteriales: a legitimate order
based on type strains Cyanobacterium stanieri?. Annals of Microbiology 134B: 21–
36.
Rippka R., Deruelles J., Waterbury J. B., Herdman M., Stanier R. Y. (1979).
Generic assignments, strains histories and properties of pure cultures of
cyanobacteria. Society for General Microbiology 111: 1–61.
Rocap G., Distel D. L., Waterbury J. B., Chisholm S. J. (2002). Resolution of
Prochlorococcus and Synechococcus ecotypes by using 16S-23S Ribosomal DNA
Internal Transcribed Spacer Sequences, Applied and Environmental Microbiology,
2002, 68: 1180-1191.
Rocap G., Larimer F. W., Lamerdin J., Malfatti S., Chain P., Ahlgren N. A.,
Arellano A., Coleman M., Hauser L., Hess W. R., et al. (2003). Genome divergence
in two Prochlorococcus ecotypes reflects oceanic niche differentiation. Nature 424:
1042–1047.
Rocap G., Moore L. R., Chishom S. W. (1999). Molecular phylogeny of
Prochlorococcus ecotypes, p. 107–116. In L. Charpy and A. W. D. Larkum (ed.),
Marine cyanobacteria. Bulletin de l’Institut Océanographique, Monaco, Special Issue
19.
Ryther J. H. & Dunstan W. M. (1971) Nitrogen, phosphorus and eutrophication in
the coastal marine environment. Science 171:1008-1013.
Sambrook J., Fritsch F. F., Maniatis T. (1989). Molecular Cloning. A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press. New York, 2nd. edn, 1989, ISBN-10:
0879693096; ISBN-13: 978-0879693091.
Samson G. & Popovic R. (1990). Inhibitory effects of mercury on photosystem II
photochemistry in Dunaliella tertiolecta under in vivo conditions; J. Photochem.
Photobiol., B5: 303-310.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
112
Sandaa R. A., Clokie M., Mann N. H. (2008). Photosynthetic genes in viral
populations with a large genomic size range from Norwegian coastal waters. FEMS
Microbiol Ecol. 63: 2–11.
Sandifer P. A., Miglarese J. V., Calder D. R., Manzi J. J., Barclay L. A. (1980).
Ecological characterization of the sea island coastal region of South Carolina and
Georgia. Vol. III: Biological features of the characterization area. U.S. Fish and
Wildlife Service, Office of Biological Services, Washington, DC. FWS/OBS-79/42.
Šantić D. & Krstulović N. (2012). Identification and Characterisation of
Microbial Populations Using Flow Cytometry in the Adriatic Sea, Flow Cytometry -
Recent Perspectives, M.Sc. Ingrid Schmid (Ed.), ISBN: 978-953-51-0626-5, InTech,
Available. http://www.intechopen.com/books/flow-cytometry-recentperspectives/
identification-and-characterisation-of-microbial-populations-using-flow-cytometry-
in-the-adriati
Šantić D., Krstulović N., Šolić M. (2007). Comparison of flow cytometric and
epifluorescent counting methods for marine heterotrophic bacteria. Acta Adriatic. 48:
107-114.
Šantić D., Krstulović N., Šolić M., Mladen, Kušpilić G. (2011). Distribution of
Synechococcus and Prochlorococcus in the central Adriatic Sea. Acta Adriatic. 52:
101-113.
Scanlan D. J. (2003). Physiological diversity and niche adaptation in marine
Synechococcus. Department of Biological Sciences, University of Warwick, Gibbet
Hill Road, Coventry, CV4 7AL. Advances in Microbial Physiology 47: 1-64.
Schaeffer D. J. & Krylov V.S. (2000). Anti-HIV activity of extracts and
compounds from algae and cyanobacteria. Ecotoxicol. Environ. Saf., 45: 208-227.
Schindler D. W. (1974). Eutrophication and recovery in expenmental lakes.
Science 184: 897-899.
Schlegel I., Doan N. T., Chazal N., Smith G. D. (1999). Antibiotic activity of new
cyanobacterial isolates from Australia and Asia against green algae and
cyanobacteria. J. Appl. Phycol., 10: 471- 479.
Sharon I., Tzahor S., Williamson S., Shmoish M., Man-Aharonovich D., Rusch D.
B., et al. (2007). Viral photosynthetic reaction center genes and transcripts in the
marine environment. ISME J. 1: 492–501.
Sharpley A. N., Hedley M. J., Sibbesen E., Hillbricht-Ilkowska A., House W.A.,
Ryszkowski L. (1995). Phosphorus transfers from terrestrial to aquatic ecosystems;
Chapter 11, In Phosphorus in the Global Environment: transfers, cycles and
management; Tiessen, H.(ed.); John Wiley and Sons, Chichester.
Sharpley A. N., Jones C. A., Grey C., Cole C. V. (1984). A simplified soil and
plant phosphorus model II: Prediction of labile, organic and sorbed phosphorus. Soil
Science Society of America Journal 48: 805–809.
Shumka S. (2005). Hidrobiologjia, (University text in Albanian with 324 pages,
Publishing House “Erik”, Tiranë, 2005.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
113
Silver S. & Wauderhaug M. (1992). Gene regulation of plasmid- and
chromosome- determined inorganic ion transport in bacteria. Microbiological
Reviews. 56: 195-264.
Siokou-Frangou I., Christaki U., Mazzocchi M. G., Montresor M., Ribera
d‟Alcal´a M., Vaqu´e D., Zingone A. (2010). Plankton in the open Mediterranean
Sea: a review, Biogeosciences, 7: 1543–1586.
Skulberg O. M. (2000). Microalgae as a source of bioactive molecules –
experience from cyanophyte research. J. Appl. Phycol., 12: 341-348.
Slotton D. G., Goldman C. R., Frank A. (1989). Commercially Grown Spirulina
Found to Contain Low Levels of Mercury and Lead, Nutrition Reports International,
40 (2): 1165-1172.
Smetacek V.S. (1985). Role of sinking in diatoms life-history cycles: ecological,
evolutionary and geological significance. Mar. Biol., 84: 239-251.
Smetacek V.S. (2002). Microbial food webs. The ocean's veil. Nature 419 (6907):
565.
Šolić M., Krstulović N., Kušpilić G., Ninčević Gladan Ţ., Bojanić N., Šestanović
S., Šantić D., Ordulj M. (2010). Changes in microbial food web structure in response
to changed environmental trophic status: A case study of the Vranjic Basin (Adriatic
Sea). Mar. Environ. Res.70: 239-249.
Šolić M., Krstulović N., Vilibić I., Bojanić N., Kušpilić G., Šestanović S., Šantić
D., Ordulj M. (2009). Variability in the bottom-up and top-down control of bacteria
on trophic and temporal scale in the middle Adriatic Sea. Aquat. Microb. Ecol. 58:
15–29.
Šolić M., Krstulović N., Vilibić I., Kušpilić G., Šestanović S., Šantić D., Ordulj
M. (2008). The role of water mass dynamics in controlling bacterial abundance and
production in the middle Adriatic Sea. Mar. Environ. Res. 65: 388-404.
Sponga F., Cavaletti L., Lazzarini A., Borghi A., Ciciliato I., Losi D., Marinelli F.
(1999). Biodiversity of potentials of marine-derived microorganisms. J. Biotechnol.,
70: 65-69.
Stanier R. Y. & Cohen-Bazire G. (1977). Phototrophic prokaryotes: the
cyanobacteria. Annual Review of Microbiology 31: 255–274.
STATISTICA, http://www.statsoft.com/
Stockner J. G. & Antia N. J. (1986). Algal picoplankton from marine and
freshwater ecoysystems: a multidisciplinary perspective. Can. J. Fish. Aquat. Sci., 43:
2472-2503.
Suikkanen S., Fistarol G. O., Graneli E. (2004). Allelopathic effects of the Baltic
Cyanobacteria Nodularia spumigena, Aphanizomenon flos-aquae and Anabaena
lemmermannii on algal monocultures. J. Exp. Mar. Biol. Ecol., 308: 85-101.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
114
Sullivan M. B., Coleman M.L., Weigele P., Rohwer F., Chisholm S. W. (2005).
Three Prochlorococcus cyanophage genomes: signature features and ecological
interpretations. PLoS Biol. 3: e144.
Sullivan M. B., Lindell D., Lee J. A., Thompson L. R., Bielaski. J. (2006).
Prevalence and evolution of core photosystem II genes in marine cyanobacterial
viruses and their hosts. PLoS Biol. 4: e234.
Sullivan M. B., Waterbury J. B., Chisholm S. W. (2003). Cyanophages infecting
the oceanic cyanobacterium Prochlorococcus. Nature. 424: 1047–1051.
Summary of Literature Comparing Methods for the Analysis of Chlorophyll in
Water Samples (2006). Submitted 12/13/06 for EPA Contract# 68-C-04-006,
prepared for USEPA, Office of Science and Technology, Health and Ecological
Criteria Division.
Sunda W. G. & Guillard R. R. L. (1976). The relationships between cupric ion
activity and the toxicity of copper to phytoplankton. J. Mar. Res. 34: 511–529.
Suttle C. A. (2000). Cyanophages and their role in the ecology of cyanobacteria.
In: Whitton PM (ed) The ecology of cyanobacteria: their diversity in time and space.
Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, pp. 563–589.
Tang D., Warnken K. W., Santschi P. H. (2001). Organic complexation of copper
in surface waters of Galveston Bay. Limnol. Oceanogr. 46: 321–330.
Tiessen H. (ed.). (1995). Phosphorus in the Global Environment: Transfers,
Cycles and Management; Scientific Committee on Problems of the Environment
(SCOPE) 54; John Wiley and Sons, Chichester.
Toledo G. & Palenik B. (1997). Synechococcus diversity in the California Current
as seen by RNA polymerase (rpoC1) gene sequences of isolated strains. Appl.
Environ. Microbiol. 63: 4298–4303.
Toledo G., Palenik B., Brahamsha B. (1999). Swimming marine Synechococcus
strains with widely different photosynthetic pigment ratios form a monophyletic
group. Appl. Environ. Microbiol. 65: 5247-5251.
Troussellier M., Courties C. Vaquer A. (1993). Recent applications of flow
cytometry in aquatic microbial ecology. Biol. Cell. 78: 111–121.
Tsai A. Y., Chin W. M., Chiang K. P. (2009). Diel patterns of grazing by
pigmented nanoflagellates on Synechococcus spp. in the coastal ecosystem of
subtropical western Pacific. Hydrobiologia 636: 249−256.
Tsai A-Y, Gong G-C, Sanders R.W. Chiang K-C., Huang J-K., Chan Y-F. (2012).
Viral lysis and nanoflagellate grazing as factors controlling diel variations of
Synechococcus spp. summer abundance in coastal waters of Taiwan. Aquatic
Microbial Ecology 66: 159-167.
UNEP. Programi i Kombeve të Bashkuara (UNEP). Seria e raporteve finale Nr.
18, 132.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
115
UNEP/MAP. (2012). State of the Mediterranean Marine and Coastal
Environment, UNEP/MAP – Barcelona Convention, Athens.
Urbach E., Distel D., Scanlan D. J., Waterbury J. B, Chisholm S. W. (1998).
Rapid diversification of marine picophytoplankton with dissimilar light harvesting
structures inferred from sequences of Prochlorococcus and Synechococcus
(Cyanobacteria). J. Mol. Evol. 46: 188–201.
Urbach E., Robertson D., Chisholm S. W. (1992). Multiple evolutionary origins
of prochlorophytes within the cyanobacterial radiation. Nature 355: 267–270.
Utkilen H. C. (1982). Magnesium-limited growth of the cyanobacterium
Anacystis nidulans. J. Gen. Microbiol. 128: 1849–1862.
Uysal Z. (2000). Pigments, size and distribution of Synechococcus spp. in the
Black Sea. Journal of Marine Systems 24: 313–326. ).
van den Berg M. G., Merks G. A., Duursma E. K. (1987). Organic complexation
and its control of the dissolved concentrations of copper and zinc in the Scheldt
Estuary. Estuar.
Vasiliu D., Gomoiu M. T., Boicenco L., Lazar L., Timofte F. (2010). Chlorophyll
a distribution in the Romanian Black Sea inner shelf waters in 2009; Geo-Eco-Marina
16: 19-28.
Vaulot D. & Marie D. (1999). Diel variability of photosynthetic picoplankton in
the equatorial Pacific. J Geophys Res., 104: 3297−3310.
Veldhuis M. J. W., Timmermans K. R., Croot P., Van Der Wagt B. (2005).
Picophytoplankton; a comparative study of their biochemical composition and
photosynthetic properties. J Sea Res., 53: 7–24.
Vilibić I. & Šantić D. (2008). Deep water ventilation traced by Synechococcus
cyanobacteria. Ocean Dyn., 58: 119-125.
WAC 173-201A. (1997). Water Quality Standards for Surface Waters of the State
of Washington, Washington State Code Chapter 173-201A WAC, Washington State
Department of Ecology, 1997.
WAC 173-201A. (2011). Water Quality Standards for Surface Waters of the State
of Washington, Washington State Code Chapter 173-201A WAC, Washington State
Department of Ecology 2011.
Wallin M., Håkanson L., Persson J. (1992). Load models for nutrients in coastal
areas, especially from fish farms (in Swedish with English summary). Nordiska
ministerrådet., 502: 207 p.
Wang K. & Chen F. (2004). Genetic diversity and population dynamics of
cyanophage communities in the Chesapeake Bay. Aquat. Microb. Ecol. 34: 105−116.
Wassmann P. (1993). Regulation of vertical export of particulate organic matter
from the euphotic zone by planktonic heterotrophs in eutrophicated aquatic
environments. Mar. Pollut. Bull. 26: 636-643.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
116
Waterbury J. B. & Rippka R. (1989). Subsection I. Order Chroococcales
Wettstein 1924, Emend. Rippka et al., 1979, p. 1728–1745. In J. T. Staley, M. P.
Bryant, N. Pfennig, and J. G. Holt (ed.), Bergey‟s manual of systematic bacteriology,
vol. 3. Williams and Wilkins, Baltimore, Md.
Waterbury J. B. & Stanier R. Y. (1981). Isolation and growth of cyanobacteria
from marine and hypersaline environments. in Starr, Stulp, Truper, Balows,
Schleeper. The prokaryotes: a handbook on habitats, isolation, and identification of
bacteria, Vol 1. Springer-Verlag, Berlin. pp. 221–223. ISBN 0-38-708871-
7.Waterbury J. B. (1985). Discrimination between types of pigments in marine
Synechococcus spp. by scanning spectroscopy, epifluorescence microscopy, and flow
cytometry. Limnol. Oceanogr. 30: 1303-1315.
Waterbury J. B. & Rippka R. (1989). Subsection I. Order Chroococcales
Wettstein 1924, emend. Rippka et al. 1979. p. 1728-1746. In Bergey‟s Manual of
Systematic Bacteriology, ed by J.T. Staley, M.P. Bryant, N. Pfennig, and J.G. Holt.
Lippincott Williams & Wilkins, Baltimore, MD.
Waterbury J. B., Watson S. W., Guillard R. R. L., Bland L. E. (1979). Widespread
occurrence of a unicellular, marine, planktonic, cyanobacterium. Nature, 277: 293-
294.
Waterbury J. B., Watson S. W., Valois F. W., Franks D. G. (1986). Biological and
ecological characterization of the marine unicellular cyanobacteria Synechococcus.
Can. Bull. Fish. Aquat. Sci. 214: 71–120.
Waterbury J. B., Willey J. M., Franks D. G., Valois F. W., Watson, S. W. (1985).
A cyanobacterium capable of swimming motility. Science 230: 74-76.
Wawrik B. & Paul J. H. (2004). Phytoplankton community structure and
productivity along the axis of the Mississippi River plume in oligotrophic Gulf of
Mexico waters. Aquatic Microbial Ecology 35: 185-196.
Wawrik B., Paul J. H., Bronk D. A., John, D., Gray M. (2004). High rates of
ammonium recycling drive phytoplankton productivity in the offshore Mississippi
River plume. Aquatic Microbial Ecoloy 35: 175-184.
Webb R. & Sherman L. A. (1994). The cyanobacterial heat-shock response and
the molecular chaperones. 751-767 in D. Bryant (ed.) The Molecular Biology of
Cyanobacteria.
Webster I. T., Parslow J. S., Grayson R. B., Molloy R. P., Andrewartha J., Sakov
P., Tan K. S., Walker S. J., Wallace, B. B. (2001). Gippsland Lakes Environmental
Study: Assessing Options for Improving Water Quality and Ecological Function.
CSIRO, Glen Osmond.
Weigele P. R., Pope W. H., Pedulla M. L., Houtz J. M., Smith A. L., Conway J.
F., King J., Hatfull G.F., Lawrence J. G., Hendrix R.W. (2007). Genomic and
structural analysis of Syn9, a cyanophage infecting marine Prochlorococcus and
Synechococcus. Environ. Microbiol. 9: 1675-1695.
Weisse T. (1993). Dynamics of autotrophic picoplankton in marine and
freshwater ecosystems. Adv. Microb. Ecol. 13: 327–370.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
117
Wilbur Smith Associates. (2003). Vlerësimi i ndikimit në mjedis i gërmimit
emergjent të Portit të Durrësit, (shqip dhe anglisht), TEC Infrastructure Consulants,
pp: 94-99; 108-119; 120-121, shtojca 3.
Willey J. M. & Waterbury J. B. (1989). Chemotaxis toward nitrogenous
compounds by swimming strains of marine Synechococcus spp. Appl. Environ.
Microbiol. 55: 1888-1894.
www.ozcoasts.gov.au/indicators/chlorophyll_a.jsp
Ybarra G. R. & Webb R. (1998). Differential responses of GroEL and
metallothionein genes to divalent cations and the oxyanions of arsenic in the
cyanobacterium Synechococcus sp. Strain PCC7942. Proceedings of the 1998
Conference on Hazardous Waste Research held in Snow Bird Ski & Resort, Snow
Bird Utah, May 19-21, 1998.
Ybarra G. R. & Webb R. (1999). Effects of divalent metal cations and resistance
mechanisms of the cyanobacterium Synechococcus sp. strain PCC 7942. J Hazard
Substance Res., 2: 1–8.
Zeidner G., Bielawski J. P., Shmoish M., Scanlan D.J., Sabehi G., Beja, O.
(2005). Potential photosynthesis gene recombination between Prochlorococcus and
Synechococcus via viral intermediates. Environ Microbiol. 7: 1505–1513.
Zhang J., Huang W. W., Liu M. G. (1994). Geochemistry of major Chinese river–
estuary systems. p. 179-188. In: Oceanology of China Seas, ed by D. Zhou, Y.B.
Liang, and C.K. Zeng. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, The Netherlands.
Zhaxybayeva O., Doolittle W.F., Papke R.T., Gogarten J. P. (2009). Intertwined
evolutionary histories of marine Synechococcus and Prochlorococcus marinus.
Genome Biol. Evol. 1: 325–339.
Zhaxybayeva O., Gogarten J. P. (2004). Cladogenesis, coalescence and the
evolution of the three domains of life. Trends Genet. 20: 182–187.
Zhaxybayeva O., Gogarten J. P., Doolittle W. F. (2007). A hyper-conserved
protein in Prochlorococcus and marine Synechococcus. FEMS Microbiol Lett. 274:
30–34.
Zhaxybayeva O., Gogarten J.P., Charlebois R.L., Doolittle W.F., Papke R.T.
(2006). Phylogenetic analyses of cyanobacterial genomes: quantification of horizontal
gene transfer events. Genome Res. 16: 1099–1108.
Gjyli L. (2014). Identifikimi i cianobakterit Synechococcus në ujërat e Gjirit të Durrësit, bazuar në
fragmentet gjenike ribozomale specifike
118
PËRMBLEDHJE
Gjinia Synechococcus përfshin organizma me diversitet gjenetik të konsiderueshëm, që klasifikohen në grupe bazuar në diversitetin filogjenetik, në praninë e pigmentit ndihmës fikoeritrinë, dhe më vonë bazuar në diversitetin përmasor të hapësirave
të brendshme të transkriptuara (ITS).
Pas raportimit të pranisë së specieve cianobakteriale në ujërat e disa lagunave të Shqipërise, bazuar në amplifikimin me anë të PCR-së të sekuencave të ADN-së ribozomale specifike, synimi i parë i këtij studimi ishte evidentimi i pranisë së species
Synechococcus në ujërat bregdetare të Gjirit të Durrësit në gjashtë stacione, që paraqiten si hot-spot-e lidhur me kategoritë e
ndotjeve të pranishme, bazuar në shumëfishimin e ADN-së ribozomale 16-23S. Edhe operoni ribozomal, i cili tek prokariotët përbëhet përgjithësisht nga gjenet ribozomale 16 dhe 23SrARN të veçuara nga sekuencat ITS (internal transcripted spacer), merr
pjesë në evoluimin e ngadaltë të gjeneve bakteriale. Meqenëse, zona ITS shfaq variacion përmasor të sekuencës, ky fakt është
përdorur për të përcaktuar lidhjet filogjenetike ndërmjet shtameve të afërta.
Së dyti, në këtë studim u punua për të vlerësuar diversitetin gjenetik të popullatave të pikocianobaktereve të gjinisë
Synechococcus në gjashtë stacionet e Gjirit të Durrësit, nëpërmjet analizës së gjatësisë të sekuencave 16-23S ITS.
Pas hulumtimit për praninë e specieve pikofitoplanktonike, u punua për ndërtimin e korrelacioneve të mundshme midis
cilësisë së ujërave dhe diversitetit në nivel gjenetik ndërmjet popullatave të Synechococcus.
Me qëllim vlerësimin e cilësisë se ujërave, klorofila a (Chl a), azoti (si NO3-) dhe fosfori (si PO4
3-) u matën nga Prilli – Tetor
2011, dhe nga Qershori në Tetor 2012, dhe u ndërtuan korrelacionet midis faktorëve fiziko-kimikë dhe biologjikë, në ndihmë të interpretimit të rezultateve.
Rezultatet provuan që specia pikofitoplanktonike në studim është e pranishme në zonën e marrjes së mostrave. Nga
shumëfishimi i ADN-së ribozomale 16-13S specifike për Synechococcus dhe Prochloroccocus, të cilët ndajnë ngjashmëri gjenetike të lartë, dhe nga rezultatet mbi praninë e Chl a dhe ADN-së fitoplanktonike, u arrit në përfundimin se cilësia aktuale
jo e kënaqshme e ujërave, nuk ka çuar në zhdukjen e tyre. Prania e popullatave të ndryshme të pikocianobaktereve të gjinisë
Synechococcus u zbulua bazuar në dimensionet e sekuencave 16-23S ITS. Katër fragmente të ITS-a dhe tre të ITS-b u shumëfishuan. Fragmentet ITS-a ishin të pranishme në të gjithë stacionet e
marrjes së mostrave ndaj nuk mund të përdoreshin për të dalluar ndërmjet popullatave në stacione të ndryshme. Fragmentet ITS-
b përkatësisht dy fragmente, u izoluan në gjithë stacionet, dhe i treti vetëm në stacionin KP. Faktorët që mund të kenë ndikuar në këtë shumëllojshmëri, mund të jenë përqëndrimi më i lartë i fosfateve, nitrateve dhe zbatica, e cila sjell më tepër ujë të ëmbël
sesa ujë deti në KP, duke krijuar një situatë të ndryshme krahasuar me stacionet e tjera. Rezultatet si më lart mbështesin konkluzionin që këta organizma mund të rriten në përqëndrime të ulëta azoti, edhe nëse është faktor kufizues, dhe se
përqëndrimet e larta të fosforit, mund të rritin dendësinë dhe diversitetin e popullatave cianobakteriale. Prania e metaleve të
rënda dhe burimeve të tjera të ndotjes të identifikuara në këtë studim, janë përdorur për të plotësuar më mirë kuadrin e nivelit të cilësisë së ujërave në Gjirin e Durrësit dhe për të interpretuar të dhënat molekulare të marra deri më tani.
Fjalë kyçe: Gjiri i Durrësit, pikofitoplankton, 16-23SrARN ITS, faktorë biotikë dhe abiotikë, gjendja trofike.
ABSTRACT
Genus Synechococcus gathers organisms of considerable genetic diversity, which are classified into groups based on their
physiological diversity, on the presence of the accessory pigment phycoerythrine, and lately, on the diversity of the 16S-23SrDNA internal transcribed spacer (ITS) regions.
After the report on the presence of cyanobacterial species at the lagoonary waters of Albania, based on PCR amplification
of species-specific ribosomal DNA regions, the first aim of this study was to detect the presence of Synechococcus spp. in
coastal waters of Bay of Durres at six stations, which represent hot-spots regarding the categories of pollutions present, based
on the amplification of their 16S-23S ribosomal DNA.
The ribosomal operon, which in prokaryotes is generally composed of 16S and 23S ribosomal RNA (rRNA) genes, separated by an internal transcribed spacer (ITS) regions, is part of the slowly evolving bacterial set of genes. Because the ITS exhibits a great
deal of length and sequence variation, it has been used in many bacterial groups to delineate closely related strains.
Second, we worked on the evaluation of the genetic divergence of populations of picocyanobacteria of genus
Synechococcus at six stations of Durres Bay, through the analysis of the length of the amplified 16-23S ITS regions.
After having investigated the presence of picophytoplankton species, we worked on a possible correlation between the
quality of waters, and the genetic level of diversity among populations of Synechococcus. In order to evaluate the quality of waters, chlorophyll a (Chl a), nitrogen (as NO3
-), and phosphorus (as PO43-) were measured monthly from April - October 2011,
and from June - October 2012, and correlations were build among the physico-chemical and biological factors in order to
interpret the results. Results prove that picophytoplanktonic species are present at sampling area. From the amplification of the 16S-23S ribosomal
DNA specific for Synechococcus and Prochloroccocus, which share a high level of genetic similarity, and from the results on the
amount of Chl a and phytoplankton DNA, we conclude that the present quality of waters, which is not satisfying, has not
affected them to extinction. The presence of genetically different populations of picocyanobacteria of genus Synechococcus
was investigated based at the dimensions of 16-23S ITS regions.
Four regions of ITS-a and three of ITS-b were amplified. The ITS-a fragments could not discriminate among the populations, because were present at all stations of sampling. The ITS-b fragments were found respectively, two biggest fragments at all
stations, and the third one only at ChP. Factors which may have influenced these variabilities could be higher phosphate loads,
lower nitrate loads, and low tide of the sea, which brings more fresh water than marine water at ChP creating an different situation compared to other stations. The above results support the conclusion that these organisms can grow in low
concentrations of nitrogen even if it is a limiting growth factor, and that high concentrations of phosphorus can increase density
and diversity of cyanobacterial populations. Meanwhile, the presence of heavy metals and other sources of pollution identified in this study, were used to create a better view on the quality of waters at the Bay of Durres and to interpret the molecular data
achieved so far.
Key words: Durres Bay, picophytoplankton, 16-23SrRNA ITS, abiotic and biotic factors, trophic status.