40
Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakit MK. Kultur Jaringan (Biologi Sem 6) Paramita Cahyaningrum Kuswandi (email : [email protected]) FMIPA UNY 2014

Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

  • Upload
    doanque

  • View
    265

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Induksi Tanaman Haploid dan

Tanaman Bebas Penyakit

MK. Kultur Jaringan (Biologi Sem 6)

Paramita Cahyaningrum Kuswandi(email : [email protected])

FMIPA UNY2014

Page 2: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

TEKNIK KULTUR JARINGAN…

• Dapat menghasilkan :

–Tanaman haploid, triploid

–Tanaman bebas penyakit

2Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 3: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

I. TANAMAN HAPLOID

3Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 4: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

PRODUKSI TANAMAN HAPLOID

• Pada reproduksi secara seksual, jumlahkromosom akan menjadi ½ saat pembentukangamet (meiosis)

• Jika meiosis terjadi pada tanamn diploid, makamenghasilkan gamet dengan 1 set kromosom(n = x).

• Jika sel tersebut tumbuh menjadi suatutanaman tanpa fertilisasi maka dinamakantanaman monoploid

4Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 5: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

• Jika terjadi pada tanaman tetraploid, maka menghasilkan gamet dengan 2n = 2x

• Jika sel tersebut tumbuh menjadi suatu tanaman tanpa fertilisasi, dinamakan dihaploid

5Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 6: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Manfaat tanaman haploid

1. Homosigositas dicapai dalam waktu yang lebih singkat. Menguntungkan bagi plant breeder karena mempersingkat waktu untuk mendapat varietas baru

• Pola segregasi gen lebih mudah diamati

• Menghasilkan homosigot untuk tanaman yg self-inkompatibel

• Memperpendek generasi selfing untuk mencapai homosigot

6Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 7: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

2. Memperpendek pencapaian tingkat homosigotpada tanaman dengan fase juvenil yang panjang

3. Menghasilkan hibrid F1 yang murni / homogen

4. Untuk studi tanaman poliploid pada level ploidiyang lebih rendah

5. Tanaman haploid akan menguntungkan bagimutation breeder yang ingin menghasilkanrecessive mutation ( A menjadi a )

7Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 8: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

6. Menghasilkan tanaman jantan. Misal padaAsparagus officinalis, tanaman betina XX, tanaman jantan XY. Jika haploid dihasilkan darianther tanaman jantan dengan gen Y kemudiandigandakan maka menghasilkan YY (super male plants).

7. Aplikasi kolkisin secara in vitro lebih mudah danmenghasilkan direct homosigot

8. Haploid protoplast lebih mudah digunakan untuksomatic hybridization daripada diploid protoplasts

8Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 9: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Produksi haploid in vivo

• Secara umum sangat sedikit jumlahnya

• Biasanya pada tanaman dengan biji yang mengandung 2 embrio

• Karena pembentukan embrio bisa dengan kromosom n-n atau 2n-n

9Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 10: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Induksi haploid in vivo

1. Gynogenesis

2. Androgenesis

3. Genome elimination

4. Semigamy

5. Chemical treatment

6. Temperature shock

7. Irradiation

10Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 11: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

1. Gynogenesis

• Perkembangan sel telur yang tidak dibuahi karena polinasi tidak terjadi akibat :

• Polen abortive (akibat radiasi)

• Alien pollen (dari spesies atau genus lain)

• Endosperm harus terbentuk supaya embrio tidak aborsi

11Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 12: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

2. Androgenesis

• Nukleus sel telur tereliminasi atau inactivated sebelum pembuahan

• Sehingga individu haploid muncul karena sel telur hanya akan mengandung nukleus jantan dari hasil pembuahan

12Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 13: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

3. Genome elimination

• Biasanya terjadi karena persilangan interspecific atau intergeneric

• Pembuahan terjadi tapi salah satu genome dieliminasi/dihilangkan

• Sehingga menghasilkan embrio hanya dengan 1 set genom – menjadi haploid

13Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 14: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

4. Semigamy

• Nukleus sel telur dan nukleus polen melakukan pembelahan secara independen

• Menghasilkan haploid chimera

14Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 15: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

5. Chemical treatment

• Dengan toluene blue, maleic hydrazide,nitrous oxide, atau colchicine

• Chloramphenicol dan para-fluor-phenylalanine, kromosom dapat dihilangkan

15Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 16: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

6. Temperature shocks

• Suhu yang tinggi atau rendah

7. Irradiation

• X – rays

• UV light

16Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 17: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Eksplan

• Anther

• Pollen grains

• Inflorescences

• Embryo culture

• Pseudo fertilization (pollination in vitro with alien pollen)

• Unfertilized ovules

17Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 18: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Advantage of pollen grain culture

1) Tanpa adanya jaringan diploid (septum, anther wall, tapetum), maka mengurangi munculnya individu diploid

2) Tanpa anther tidak ada yang menghalangi dalam penyerapan nutrisi

3) Tanpa anther tidak ada senyawa penghambat seperti ABA dan senyawa toksik

18Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 19: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

4) Tanpa pembentukan kalus di anther, tidak akan terbentuk chimer

5 ) Dari satu polen bisa terbentuk embrio

6 ) Pollen grains lebih cocok untuk mutation research dan genetic manipulation

7 ) Pembentukan embrio dapat dilihat lebih jelas dengan pollen grain drpada anther

19Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 20: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Pertumbuhan pollen memerlukan teknik khusus

• Pertumbuhan awal anther

• Ekstraksi pollen

• Perawatan

20Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 21: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

2 metode induksi tanaman haploid dari anther

• Direct : embrio muncul secara langsung dari pollen grain (microspores)

• Indirectly : kalus berkembang dari pollen grain kemudian tumbuh embrio dan tunas adventif

21Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 22: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Pemilihan anther

• Tergantung fase perkembangannya

• Menurut Heberle-Bors (1985), waktu untuk isolasi anther (dan pollen) tergantung pada fase perkembangan yang dipengaruhi oleh banyak faktor

• 3 fase : P-grain (embryonic pollen grains) maturation, normal pollen grain maturation, and anther wall maturation

22Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 23: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

• Ciri morfologis tanaman / bunga untuk pengambilan anther tergantung pada spesies yang akan diteliti

• Dunwell (1985) mengatakan bahwa isolasi anther akan effektif saat mengandung microspores pada fase antara pelepasan dari tetrad dan mitosis pollen yang pertama

23Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 24: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Kultur anther : haploid, chimera, ploidy

• Terjadi abnormalitas saat pembentukan gamet/meiosis

• Regenerasi septum dan dinding anther sehingga muncul individu 2n

• Terjadi spontaneous doubling

24Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 25: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Faktor-faktor yang berpengaruh

• Pre-treatment : suhu, cutting of anther wall

• Genotype and age of donor plant

• Komposisi nutrisi pada media

• Physical factors (cahaya, suhu, CO2 )

Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014 25

Page 26: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Kesulitan dalam induksi haploid secara in vitro

1. Kadang tidak terjadi pertumbuhan dan perkembangan embrio

2. Kadang muncul diploid dan tetraploid

3. Munculnya diploid dapat dikurangi dengan kultur polen tapi teknik sulit dilakukan

4. Pengambilan fase perkembangan anther harus pada fase mikrospora haploid

5. Adanya peluang muncul albino

Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014 26

Page 27: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014 27

6. Secara ekonomis tidak menguntungkan karena teknik sulit dan keberhasilan rendah

7. Jika haploid tercampur dengan diploid atau poliploid maka haploid akan kalah bersaing

8. Pembentukan kalus yang tidak diinginkan

9. Seleksi haploid kadang lama. Tapi sekarang ada marker DNA

10. Penggandaan haploid kadang memunculkan homosigot yang tidak diinginkan

Page 28: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

II. PRODUCTION OF DISEASE-FREE PLANTS

28Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 29: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

History

• 1934 : White menunjukkan bahwa tobacco mosaic virus (TMV) tersebar secara tidak merata di akar tembakau

• 1949 : Limasset dan Cornuet menunjukkan distribusi yang tidak merata di tunas tembakau.

• Tapi kemudian dibuktikan bahwa ujung akar atau tunas masih mengandung virus

29Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 30: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

• 1952 : Morel dan Martin mengisolasi secara in vitro meristem apikal dahlia yang terinfeksi dengan virus untuk menghasilkan tanaman bebas virus

• Muncul beberapa penelitian dan teori untuk menjelaskan adanya perbedaan antara meristem dan bagian lain yang menyebabkan serangan virus yang tidak merata pada tanaman

30Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 31: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Why virus is unevenly ditributed in plants

• Sel meristem lebih aktif membelah, memerlukan lebih banyak protein sintesis

• Di meristem tidak ada vascular elements dan plasmodesmata

• Kemungkinan pengaruh hormon auksin dan sitokinin

• Adanya inhibitor

31Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 32: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Production of virus free plants

Virus infected plant

Heat treatment

Meristem culture

Shoot formation

Rooting of shoots

Further propagation of virus free plants

Elite mother plants (virus free)

Virus testing

Transfer of plants to soil

Virus testing

32Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 33: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Metode yang digunakan

1. Heat treatment and meristem culture

2. Adventitious shoot formation followed by meristem culture

3. Virus free plants produced from callus and protoplasts

4. Micrografting

33Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 34: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

1. Heat treatment and meristem culture

• Perlakuan suhu selama beberapa hari untuk mengurangi jumlah virus sebelum dilakukan kultur meristem

34Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 35: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

2. Adventitious shoot formation

• Induksi pembentukan tunas dari bagian tanaman yang tidak terinfeksi

• Dari tunas tersebut kultur meristem dilakukan untuk produksi tanaman bebas virus

35Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 36: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

3. Induction from callus and protoplast

• Kalus yang disub kultur beberapa kali akan menjadi bebas virus ( Cooper, 1962)

• Kalus diberi perlakuan suhu

• Isolasi protoplast dari bagian daun / tanaman yang tidak terinfeksi

• Tidak dianjurkan karena kemungkinan besar terjadi mutasi

36Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 37: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

4. Micrografting

• Biasanya untuk tanaman berkayu

• Jika sulit dilakukan kultur meristem atau induksi tunas maka meristem langsung disambung pada batang bawah (rootstock) yang sehat / tidak terinfeksi virus

37Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 38: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Virus identification

• Test plants : cairan dari tanaman yang diuji dioleskan pada tanaman uji (test plants). Memerlukan waktu yang lama dan jumlah tanaman yang banyak

• Mikroskop elektron : mahal karena perlu alat spesifik dan personnel yang sudah terlatih

• Serology : uji denganmelihat antibodi yang terbentuk. Pada tanaman biasanya dengan uji ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay)

38Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 39: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Produksi tanaman bebas bakteri dan fungi

• Juga menggunakan kultur meristem

• Media dengan nutrisi tinggi digunakan untuk melihat tanaman terinfeksi atau tidak

• Metode sama dengan produksi tanaman bebas virus

39Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014

Page 40: Induksi Tanaman Haploid dan Tanaman Bebas Penyakitstaffnew.uny.ac.id/upload/197810222010122001/pendidikan/mita-2tan... · Kultur anther : haploid, chimera, ploidy •Terjadi abnormalitas

Next week

Kultur dan fusi protoplast : manfaat dan contoh aplikasi pada tanaman ……

Paramita C. Kuswandi/FMIPA UNY/2014 40