Upload
others
View
4
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Inter- i intra- molekularne sile
Prof. dr. sc. Jasna Lovrić
Periodni sustav elemenata
Veze između atoma• Kovalentna
• Između nemetala • u anorganskim molekulama
(N2, H2CO3)• U organskim molekulama
(H2NCH2COOH)• Jednostruka (H-H)• Višestruka (C=O, HC=N)• Polarna
(H2O, HCl, CH3OH) • Nepolarna
(O2, CO2, H3C-CH3)
• Ionska
• Između metala i nemetala
• Polarna vezaNaCl
Koordinativna veza
• Vrsta kovalentne veze (dativna veza)• Veza se ostvaruje između atoma od kojih
samo jedan atom donira oba elektrona za ostvarivanje veze
• Kompleksi – hemoglobin (dušik iz pirolnihprstena donira elektrone željezu)
Koordinativna veza• Donori elektrona za
zajednički elektronski par mogu biti:
• Monodentatni ligandi- mogućnost vezanja na metal
samo preko jednog atoma koji nosi elektrone
• Bidentatni ligandi- mogućnost vezanja na metal
preko dva atoma koja nose elektrone
• Polidentatni ligandi(EDTA, trifosfatni ion)
- mogućnost vezanja na metal preko više atoma koja nose elektrone
CH2CH2N
:
N
C
CH2
CH2
CH2
CH2
C
CC
OO
O O
O O
O O
:
:: ::
:
: : ::
:
:
::
:
::
::
::
4 -
etilendiamintetraacetatni ionEDTA
PO O P
O
O
: :
::
:PO O
O: :
O ::
: O ::
:
O: :
:
::
:: :
5 -trifosfatni ion
POLIDENTATNI LIGANDI
Struktura hema
Kompleksi u biološkim sustavima
1. Neophodni: u pohrani i transportu kisika, prijenosu elektrona,
kao katalizatori, biotransformaciji ksenobiotika, fotosintezi
2. Primjena kompleksa u terapiji:
a) antireumatici - spojevi zlata(I)
b) antitumorsko djelovanje organo-metalnih spojeva
- kompleksi arsena, platine, germanija: metaloceni: Ti, V, Nb,
Mo, Fe, Co
c) fotodinamička terapija karcinoma - metaloporfirini lantanoida -
gadolinija i lutecija
d) kod otrovanja teškim metalima olovom i živom3. Medicinskoj dijagnostici - dendrimeri
Vodikova vezaVodikova veza
Vodikove veze u biološkim sustavima
Intermolekularne vodikove veze
(voda, alkoholi, karboksilne kiseline...)
DONOR VODIKA
AKCEPTOR VODIKA
Primjeri biološki važnih vodikovih veza
INTRAMOLEKULARNE vodikove veze
INTERMOLEKULARNE vodikove veze
Intramolekularne vodikove veze(DNA, proteini, salicilaldehid,...)
Usmjerenost vodikovih veza
ΔbH = 10 - 40 kJ / mol
ΔbH (u vodi) = 15 kJ / mol
ΔbH (u proteinima) = 8,4 - 12,6 kJ / molΔbH (C-C) = 348 kJ / mol
ΔbH (C-H) = 416 kJ / mol
JAKA vodikova veza
SLABIJA vodikova veza
Nekovalentne interakcije
• Van der Waalsove privlačne sile• Hidrofobne interakcije• Hidrofilne sile
Van der Waalsove privlačne sile
Nekovalentne interakcije
C Oδ+ δ−
+ -
C Oδ+ δ−
+ -
C Oδ+ δ−
+ -
Cδ+ δ−
+ -H
H
H
C δ−δ+
-+H
H
H
Cδ+ δ−
+ -H
H
H
dipol-dipol
dipol-inducirani dipol
inducirani dipol -
- inducirani dipol
Nekovalentne interakcije u biološkim membranama i micelama
CN C
H
(CH2)4
OH
CN C
H
CH2
OH
CN C
H
CH2
OH
NH3+ C NH2
O
CN C
H
CH2
O
H
CN C
H
CH2
OH
CN C
H
CH
OH
C
O-
O O
H
CH3CH3
Trodimenzionalna struktura proteina i njegova svojstva ovise o nekovalentnim interakcijama
Vezanje antigena naspecifično antitijelo ovisio kumulativnom efektuslabih interakcija
-vodikove veze i Van der Waalsove sile dovode do pada slobodne energije sustava i do stabilizacije molekule
Sve nekovalentne interakcije kontinuirano nastaju i nestaju.
Iako su nekovalentne interakcije slabe, unutarbiomolekula postoji mnogo takovih interakcija te suone zbog kumulativnog efekta značajne.
Stvaranje svake nekovalentne interakcije dovodi do smanjenja slobodne energije sustava a posljedica jepovećana stabilizacija molekule.
VODA - struktura i svojstva
Ukupni sadržaj vode na Zemlji1,28 x 109 km3
Ukupni sadržaj slatke vode3 x 107 km3
¾ površine Zemlje prekrivaju oceani, a ¼ čine riječni vodeni tokovi ili podzemne vode (regulacija klime)
Atmosfera može u obliku pare primiti do 4 volumna % vode
Voda može biti vezana u kristalima - kristalna voda (CuSO4 x 5 H2O, FeSO4 x 7 H2O)
• Svakom stanovniku na Zemlji pripada 46 m3
pitke vode
• Živi organizmi sadrže čak do 90 % vode
• Organizam čovjeka sadrži 45 -75 % ukupne mase
• Dnevno u respiracijskom lancu nastaje 800-900 g metaboličke vode
• Bez hrane možemo preživjeti ~ 60 dana, a bez vode desetak dana
• Termalna regulacija živih organizama
Sveprisutna voda• Stvar ili tvar• meduza• krastavci• salata• lubenica• kupus• novorođenče• odrastao muškarac• drvo (svježe)• špek• orah• papir• zrak
• Maseni udio / %9996,194,892,182,4706050205,3< 5< 1
H-O-H kut je 104,45 °
ElektronegativnostKisika 3,44Vodika 2,20
Struktura molekule vode
U vodi dolazi do 3 vrste interakcija: elektrostatske interakcije, van der Waalsove i hidrofobne interakcije
Svojstvo Voda Metanol Dimetil eterFormula H2O CH3OH H3C-O-CH3
Molekularna težina (g mol -1) 18 32 46
Gustoća ( kg L-1) 0.998 0.7914 0.713
Vrelište ( °C) 100 65 25
Volumen molekule (nm3) 0.0299 0.0420 0.107
Volumen fuzije (nm3) 0.0027 negativan negativan
Temperatura pri kojoj imamaksimalnu gustoću (K)
277 nema nema
Specifična toplina (J K-1 g-1)(J K-1 mol-1)
4.1875.2
2.5381.0
2.37109
Toplina isparavanja (kJ g-1)(kJ mol-1)
2.341.4
1.1637.1
0.4018.4
Površinska napetost (mN m-1) 72.8 22.6 16.4
Viskoznost (μPa s) 1002 550 233
Dielektrična konstanta 78.6 33.6 5.0
Dipolni moment (Cm x 1030) 6.01 5.68 4.34
Fizikalna svojstva vode
Ionizacija vode
[ ][ ][ ]OH
OHH2
-+
=cK Kc =1,82·10-16 mol dm-3 t = 25 °C
H2O H+ + OH-
PERIODA
Tv / ºC
Vodikove veze u vodi su “kratkoživuće” - 1 x 10-9 s
1. porast temp. uzrokujeporast gustoće vode
2. povišenjem temp. povećava
se kinetičko gibanje
molekula vode
- anomalija vode
Kristalna struktura leda
Svaki atom O je okružen s 4 H atoma – 2 su na udaljenosti 97 pm a 2 na 179 pm
H2O(s)→ H2O(l)
ΔH = 5,9 kJ / mol
H2O(l)→ H2O(g)
ΔH = 44 kJ / mol
Specifični toplinski kapacitet vode C(H2O) = 4,184 J/g °C
Toplinski kapacitet je količina topline koja se mora dodati ili
oduzeti tvari da bi mu se temperatura promijenila za 1 °C
1000 g vode apsorbira 4 kJ - 1 °C
•m 70 kg vode - 10000 kJ za metabolizam – smrt!
Dielektrična konstanta vode ε = 78,6
(permitivnost)
F = Q1 Q2 / ε r2
Dielektrična konstanta ili permitivnost (ε) je mjera sposobnosti tvari da smanji elektrostatske sile između dva nabijena tijela.
Što je vrijednost dielektrične konstante manja smanjenje je veće.Dielektrična konstanta za različite materijale pri 20 °C iznosi:
vakuum 1zrak 1.00058
staklo 3benzen 2.3
octena kiselina 6.2amonijak 15.5
etanol 25glicerol 56
voda 81Vrijednost dielektrične konstante opada s porastom temperature.
Voda
• H2O ⇒ amfolitH2O H+ + OH-
: O:
HHLewisova baza
Nukleofilni reagens
Voda kao otapalo• polarno otapalo za veliki broj ionskih spojeva – hidratizirani ioni
• mnoge tvari su dobro topljive u vodi zbog mogućnosti stvaranja vodikovih veza –šećeri, niži alkoholi…
• u vodi se dobro otapaju organske molekule s ionizabilnim grupama i mnoge neutralne organske molekule s polarnim funkcionalnim grupama
Topljivost tvari• Topljivost tvari je maksimalna količina tvari koja se
pri danoj temperaturi može otopiti u određenoj količini otapala, a ovisi o strukturi i svojstvima tvari kao i o tlaku (kod plinova).
• tekućine i plinovi se miješaju s vodom u različitim omjerima
• topljivost čvrstih tvari u vodi je ograničena
• otapanje može biti EGZOTERMNO i ENDOTERMNO
• čvrsta tvar se otapa dok otopina (pri danoj temperaturi) ne postane zasićena – konkrementi Ca(COO)2
Proces otapanja ionskih tvari u vodi
Na+
Cl-1. Prevladavanje privlačnih sila u krutini
2. HidratacijaOrijentacija molekula vode oko otopljene tvari
Topljivost tvari u vodi
Temperatura
topl
jivos
t, g
/100
mL
vode Većina krutina
(endotermnootapanje)
Neke krutine(egzotermnootapanje)
Plinovi npr. O2, N2
• topljivost plinova je različita obzirom na njihovu sposobnost reagiranja s vodom
• Plinovi koji kemijski NE reagiraju s vodom (O2, N2 ) pokoravaju se Henryevom zakonu –otapaju se egzotermno
• Plinovi koji kemijski reagiraju s vodom (CO2, NH3, SO2, SO3) NE pokoravaju se Henryevom zakonu – daju kiseline ili baze
OTAPANJE PLINOVA U VODI
O2
He
N2
O2
He
N2
0,5 1,0 10 20 30 40 50
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
tlak / bar temperatura / ºC
V(plin)/mLotopljeno u100 g H2O
V(plin)/mLotopljeno u100 g H2O
•O2, N2 ne reagiraju s vodom – otapaju se egzotermno
Topljivost plinova u vodi obzirom na tlak i temperaturu
Topljivost plinova u vodi obzirom na tlak
W. Henry (1775 – 1836) – topljivost plinova u tekućinama proporcionalna je parcijalnom tlaku plina
Otapanje nepolarnih molekula u vodi
•amfipatske molekule(polarni i nepolarni dio) u vodi stvaraju micele
Tjelesne tekućine(kod zdravog muškarca mase 70 kg)
• 41,4 kg vode (~ 60%; ~ 42 L) raspoređen je u 2 odjeljka pa razlikujemo izvanstaničnu i unutarstaničnu, te transcelularnu tekućinu
• Unutarstanična tekućina: ~ 67%; ~28 L• Izvanstanična tekućina: ~ 20%, ~14 L
(međustanična i krvna plazma)• Transcelularna tekućina: 1-2 L
(u sinovijalnom, peritonealnom, perikardijalnom i intraokularnom prostoru kao i cerebrosinalnilikvor)
• Probavni trakt (slina, želučani sokovi, sekret pankreasa) slije se dnevno 8 L vode
• Glavnina vode u crijevima ponovo se resorbira i prelazi u krv
• Dnevna količina mokraće iznosi 1000-1500 mL (96% vode)
Dnevni gubitak tekućine
• ~ 2,3 L pri normalnim tjelesnim aktivnostima
• 1,4 L preko mokraće• 350 mL preko kože• 350 mL preko pluća• 200 mL znojenjem i stolicom
• 6,6 L prilikom velikih tjelesnih napora