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LAS ENZIMAS Las enzimas actúan como un catalizadores biológicos Todas las reacciones celulares están catalizadas por enzimas BIOCATALIZADORES. Si no fuera así, las reacciones se producirían muy lentamente debido a la estabilidad de las biomoléculas. Se las denomina de la siguiente manera Son proteínas de estructura terciaria o cuaternaria Se indica el nombre del sustrato sobre el que actúa. Se añade el cambio que le produce. Terminación asa. Así, por ejemplo, la enzima que polimeriza el ADN a partir de sus monómeros es la ADN polimerasa. Catálisis: proceso de aceleración de una reacción química por efecto de un catalizador. Casi todas son de naturaleza proteica aunque hay algunas que no; ARN catalíticos y anticuerpos catalíticos

LAS ENZIMAS...DE ENZIMAS 1. Compartimentación celular: La presencia de orgánulos celulares permite la concentración de las enzimas que actúan en una ruta metabólica, mejorando

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LAS ENZIMAS

Las enzimas actúan como un catalizadores biológicos

Todas las reacciones celulares están catalizadas por enzimas

BIOCATALIZADORES.

Si no fuera así, las reacciones se producirían muy lentamente debido a la estabilidad de las

biomoléculas.

Se las denomina de la siguiente manera

Son proteínas de estructura terciaria o cuaternaria

Se indica el nombre del sustrato sobre el que actúa.

Se añade el cambio que le produce.

Terminación –asa.

Así, por ejemplo, la enzima que polimeriza el ADN a partir de sus monómeros es la

ADN polimerasa.

Catálisis: proceso de aceleración de una reacción química por efecto de un

catalizador.

Casi todas son de naturaleza proteica aunque hay algunas que no; ARN catalíticos y

anticuerpos catalíticos

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Clasificación de las enzimas (I)

D-GLUCOSA-6-FOSFATO D-GLUCOSA + FOSFATO

ÁCIDO

ASPÁRTICO

ÁCIDO

CETOGLUTÁRICOÁCIDO OXALACÉTICO

ÁCIDO

GLUTÁMICO

ÁCIDO PIRÚVICO ACETALDEHÍDO

Glucosa-6-fosfatasa

Piruvato-

descarboxilasa

Aspartato-

aminotransferasa

HIDROLASAS

Catalizan reacciones

de hidrólisis con

intervención del agua

LIASAS

Catalizan la adición de

grupos funcionales diversos

TRANSFERASAS

O QUINASAS

Catalizan la transferencia

de grupos funcionales o

radicales entre moléculas

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Clasificación de las enzimas (II)

DIHIDROXIACETONA-3-FOSFATO GLICERALDEHÍDO-3-FOSFATO

ACETIL COENZIMA A MALONIL COENZIMA A

ÁCIDO OXALACÉTICO ÁCIDO MÁLICO

Triosafosfato-

isomerasa

Malato-

deshidrogenasa

AcetilCoA

carboxilasa

ISOMERASAS

Catalizan reacciones de

transformación de

moléculas en sus isómeros.

OXIDORREDUCTASAS

Catalizan reacciones

de oxidorreducción.

SINTETASAS O LIGASAS Catalizan la síntesis de moléculas con hidrólisis de ATP.

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Enzima inactiva

sustrato

Enzima

productos

Coenzima

Centro activo

Mecanismo de actuación

enzimática:

1) Se forma un complejo: enzima-

substrato o substratos.

2) Se une la coenzima a este

complejo.

3) Los restos de los aminoácidos

que configuran el centro activo

catalizan el proceso. Para ello

debilitan los enlaces

necesarios para que la

reacción química se lleve a

cabo a baja temperatura y no

se necesite una elevada

energía de activación.

4) Los productos de la reacción

se separan del centro activo y

la enzima se recupera intacta

para nuevas catálisis.

5) Las coenzimas colaboran en el

proceso; bien aportando

energía (ATP), electrones

(NADH/NADPH) o en otras

funciones relacionadas con la

catálisis enzimática

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PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS

TODAS las de las proteínas y además…

Gran actividad catalítica: aumentan la velocidad de reacción 106-1014 veces. No alteran el equilibrio y una vez finalizada quedan libres y listas para actuar.

Especificidad: actúan sobre uno o pocos sustratos para catalizar una transformación química

Actúan en condiciones de pH y temperatura suaves

Su actividad es regulable (estímulos intra o extracelulares)

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ESPECIFICIDAD

De acción; una enzima solo media una reacción que sufra ese sustrato no todas.

De sustrato: Cada enzima actúa sobre un sustrato o un número reducido

❖ Absoluta: actúa sobre un solo sustrato

❖De grupo: transforma sustratos que presenten un determinado enlace

❖Estereoquímica: si actúa en formas o L o D

MODELO LLAVE CERRADURA/AJUSTE INDUCIDO

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Mecanismo de acción enzimática (III)

Enzima

Sustrato

Enzima

Sustrato

MODELO DE LLAVE-CERRADURA MODELO DE ENCAJE INDUCIDO

Complejo

enzima- sustrato

El centro activo tiene la misma forma antes y

después de la unión con el sustratoEl centro activo modifica ligeramente su

forma durante la unión con el sustrato

En ambos casos, la unión de una

enzima con su sustrato es

altamente específica

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ESTRUCTURA DE LAS ENZIMAS

Los cofactores se clasifican atendiendo a su naturaleza química y a su grado de unión al

apoenzima

Muchas enzimas son holoenzimassAPOENZIMA Fracción protéica

COFACTOR Fracción prostética

ACTIVADORES INORGÁNICOS Iones metálicos unidos permanentemente al apoenzima

COENZIMAS Molécula orgánica compleja + frecuentemente una vitamina

Sufren una reacción reversible

ATP ADP + PPosteriormente se regeneran

El apoenzima determina la especificidad de la reacción.

Apoenzima y cofactor por separado son inactivos.

Un cofactor puede constituir diferentes holoenzimas

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ELEMENTOS DE UNA REACCIÓN ENZIMÁTICA

EL CENTRO ACTIVO DEL

ENZIMA

Es una pequeña porción del

enzima.

Es una equidad tridimensional

en la que encaja el SUSTRATO

Molecula(s) que va a

transformar el enzima

ESPECIFICIDAD

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REACCIÓN ENZIMÁTICA

COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO: alcanza el estado

activado o de transición

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Mecanismo de acción enzimática (II)

Enzima (E)Sustratos (S)

Complejo

enzima-sustrato

(ES)

Enzima (E)

(no se modifica)

Productos (P)

E + S → ES → E + P

Centro activo del enzima

Aminoácidos de unión

Aminoácidos catalíticos

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Mecanismo de acción enzimática

En

erg

ía

Progreso de la reacción

Variación

de la

energía

Energía de activación

con la enzima

Energía de activación

sin la enzima

Energía de

los productos

Energía de

los reactivos

Las enzimas actúan como un catalizador:

Disminuyen la energía de activación.

No cambian el signo ni la cuantía de la

variación de energía libre.

No modifican el equilibrio de la reacción.

Aceleran la llegada del equilibrio.

Al finalizar la reacción quedan libres y

pueden reutilizarse.

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Modelo comparativo de la disminución de la energía de activación por la acción de la enzima.

Enzima

Substrato

Producto

1) La reacción no se produce pues hace falta una energía de activación para que transcurra espontáneamente.

2) La enzima disminuye o elimina la energía de activación necesaria y la reacción transcurre espontáneamente.

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Cinética de la reacción enzimática

Vmáx

1

2Vmáx

La velocidad de una reacción enzimática aumenta de forma lineal a medida que

aumenta la concentración de sustrato en el medio.

Afinidad y saturación son

inversamente proporcionales.

Una enzima con alta afinidad tiene una

Km baja y se satura muy pronto.

Una enzima con poca afinidad tiene

una Km alta y tarda más en saturarse

La concentración de sustrato a la que

la velocidad de reacción es la mitad de

la velocidad máxima es la constante

de Michaelis (Km).

El valor de Km también indica la

afinidad de la enzima por el sustrato.

Km

Cuando se alcanza una determinada velocidad de reacción (Vmax), ésta ya no aumenta

aunque sigua incrementándose la concentración de sustrato. Se dice, entonces que la

enzima está saturada.

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FACTORES QUE INFLUYEN EN LA CINÉTICA

AQUELLOS QUE DESNATURALIZAN PROTEÍNAS

I n h i b i d o r e s

• pH – Concepto pH óptimo

• Temperatura – Temperatura óptima

• Sustancias químicas

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INHIBICIÓN ENZIMÁTICA

Son sustancias que disminuyen, neutralizan o regulan la actividad enzimática.

son

INHIBIDORES

IRREVERSIBLES REVERSIBLES

El inhibidor se une covalentemente al enzima y lo inutiliza permanentemente

COMPETITIVA

NO COMPETITIVA

(suelen ser

venenos)

Unión del I al centro activo

Unión del I al un lugar

diferente al centro activo

(alosterismo)

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Regulación de la actividad enzimática

Inhibidores

INHIBICIÓN IRREVERSIBLE

El inhibidor se une al centro activo del enzima de manera permanente

Enzima Inhibidor

Muchos venenos actúan como inhibidores irreversibles

KCN (cianuro potásico)Citocromo oxidasa Se detiene la respiración celular

Muerte por asfixia inmediata(Enzima respiratoria) (Veneno)

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INHIBICIÓN competitiva

El inhibidor competitivo se une al centro activo del enzima.

En una inhibición competitiva se puede alcanzar la misma velocidad máxima aumentando la concentración de sustrato.

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Regulación de la actividad enzimática

Inhibidores

Sustrato

Inhibidor

Enzima

Inhibidor unido

a la enzima

Los sustratos no

pueden unirse al

centro activo

Sustancias que detienen la actividad de la enzima, impidiendo, por tanto la formación de productos

INHIBICIÓN REVERSIBLE

REVERSIBLE COMPETITIVA

Cuando el inhibidor

desaparece, el enzima

recupera su función normal

El inhibidor ocupa el centro activo del enzima, por lo que el sustrato no puede unirse

COMPLEJO ENZIMA-INHIBIDOR

E-I

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INHIBICIÓN no competitiva

El inhibidor no competitivo se une a un lugar diferente del centro activo y también puede hacerlo al complejo enzima-sustrato.

La Km se mantiene constante en presencia del I no competitivo.(Es característico de los enzimas alostéricos)

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Regulación de la actividad enzimática

Inhibidores

TIPOS DE INHIBICIÓN REVERSIBLE

REVERSIBLE NO COMPETITIVA

El inhibidor ocupa un segundo centro activo del enzima. El sustrato puede unirse o no, pero no se lleva

a cabo la reacción

El inhibidor se encuentra en su

centro activo, el sustrato no

puede unirse

Segundo

centro activo

COMPLEJO ENZIMA-INHIBIDOR

E-I

El inhibidor se encuentra en su

centro activo El sustrato puede

unirse pero no se produce la

reacción

COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO-INHIBIDOR

E-S-I

Inhibidor

Enzima

Sustrato

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COMPARATIVA

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INHIBICIÓN acompetitiva

El inhibidor acompetitvo sólo se une al complejo enzima-sustrato.

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REGULACIÓN POR SÍNTESIS

El enzima se produce en la cantidad y en el momento que se necesita y se

degrada rápidamente al finalizar su acción

REGULACIÓN SOBRE SU ACTIVIDAD

La enzima presenta dos conformaciones, activa e inactiva cuya

transformación se produce por unión de un ligando

ENZIMAS MODIFICADOS COVALENTEMENTE

Fosforilado/no fosforilado (quinasa/fosfatasa)

ENZIMAS ALOSTÉRICOS

Modificación por unión de un ligando

OTROS TIPOS DE REGULACIÓN

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Los enzimas alostéricos son capaces de adoptar al

menos dos conformaciones diferentes y estables; una

activa y otra inactiva.

El paso de una a otra suele estar inducido por la

unión de ciertas moléculas llamadas ligandos o

efectores a determinados lugares de la

enzima(distintos al centro catalítico) que son

conocidos como centros reguladores

ENZIMAS ALOSTÉRICOS

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Los inhibidores alostéricos se unen a una zona de la enzima y cambian la configuración del centro activo de tal manera que impiden que el sustrato se pueda unir a él.

sustrato

inhibidor

Enzima inactiva

Enzima activa

Inhibición alostérica.

Sin inhibidor

con inhibidor

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Inhibición alostérica

Ligando Centro

regulador

Sustrato

SustratoCentros activos

modificados

Ligando unido al

centro regulador

Enzima

activa

Los sustratos

no pueden

unirse al

centro activo

Enzima

inactiva

Modulación negativa: unido la enzima es inactiva. Suelen ser los productos

(señal de “ya hay suficiente”)

Modulación positiva: la unión aumenta la actividad. Suele ser el sustrato (evita acumulación)

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REGULACIÓN POR PRODUCTO FINAL

La L-isoleucina es un inhibidor competitivo de la treonina deshidratasa

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OTROS TIPOS DE REGULACIÓN

CIMÓGENOS

• Son enzimas que se secretan inactivos.

• Una vez expulsados se activan llevan a cabo su función.

• Es un mecanismo de protección.

• Ejemplos:– Pepsinógeno

– Tripsinógeno

– Procarboxipeptidasa

– Procolágeno

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MECANISMOS PARA MEJORAR EFICACIA DE ENZIMAS

1. Compartimentación celular: La presencia de orgánulos celulares permite

la concentración de las enzimas que actúan en una ruta metabólica, mejorando

la eficacia del proceso.

2. Reacciones en cascada: Son reacciones en las que la el producto de la

misma actúa de catalizador de la siguiente reacción, y de la misma forma el

producto de esta segunda reacción catalizaría la tercera reacción. Por ejemplo

esto sucede en la coagulación de la sangre o en la reacción inmunitaria del

complemento.

3. Complejos multienzimáticos: Consiste en la agrupación de las enzimas

que actúan en una ruta metabólica. La reacción se favorece ya que el producto

de la primera reacción sirve de sustrato para la segunda y así sucesivamente,

debido a la proximidad entre S y E.

4. Isozimas: Son variedades de la misma enzima. Son enzimas que tienen el

mismo sustrato y realizan la misma reacción en diferentes tejidos (lactato-

deshidrogenasa de músculos y corazón)

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1. Indica los valores de pH para los cuales dos enzimas tienen la misma

velocidad de reacción.

2. Determina el intervalo del pH para el cual tiene actividad catalítica las

tres enzimas, pero con velocidades de reacción distintas.

3. Para valores máximos de acidez , ¿cuál es la enzima con mayor

actividad catalítica?

4. ¿Qué valores y qué unidades se emplean para representar la velocidad

de reacción?.

5. Si el pH de la sangre es 7'3 , razona qué enzimas podrían presentar

actividad catalítica en el plasma sanguíneo.

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Basándonos en los cambios ocurridos al aumentar la concentración de sustrato, ¿Cómo podría saber si la inhibición de una enzima está siendo producida por un inhibidor competitivo o por uno no competitivo?

Describa y explique cómo afecta a la velocidad de reacción enzimática y a la afinidad de una enzima por el sustrato las inhibiciones competitiva y no competitiva. Represente gráficamente la respuesta.