12
Lipidy a bioinformatika Aplikovaná bioinformatika, Jaro 2014

Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

  • Upload
    others

  • View
    0

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

Lipidy a bioinformatika

Aplikovaná bioinformatika, Jaro 2014

Page 2: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

LIPIDY

Základní pojmy z biochemie, V. Mikeš, Katedra biochemie PřF

Masarykovy Univerzity v Brně, 2. doplněné vydání 2001

Page 3: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

LIPIDY

Klasifikační systém zahrnující

8 hlavních tříd, každá je dále

členěná

Page 4: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

http://www.lipidmaps.org/

LIPID MAPS

Page 5: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

http://www.lipidmaps.org/

LIPID MAPS

Page 6: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

LIPID MAPS

Nástroje pro MS

analýzu lipidů

Nástroje pro grafické

znázornění lipidů

Page 7: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

http://lipidbank.jp/

Page 8: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

http://www.cyberlipid.org/index.htm

1783:

Fourcroy AF introduced

alcohol to extract brain

lipids.

Page 9: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

Lipid

Glykolipidy

• Antigeny

• Receptory

• Adheze

• Lipidová část slouží k ukotvení v membráně

Lipid

Lipid

LIPIDY + SACHARIDY

Page 10: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

LIPIDY + SACHARIDY

http://www.lipidmaps.org/

• Lipopolysacharidy jsou součástí vnější membrány gramnegativních bakterií.

• Endotoxin (pyrogen, aktivace imunitního systému, poruchy srážlivosti)

Page 11: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

LIPIDY + PROTEINY

http://bioinformatics.biol.uoa.gr/PRED-LIPO/

Page 12: Lipidy a bioinformatika - Masarykova univerzita · 2014-05-13 · Lipid classification, structures and tools* Eoin Fahy , Dawn Cotter, Manish Sud and Shankar Subramaniam University

Proteiny

Sacharidy

Lipidy

Glykolipidy

Liposacharidy

Glykoproteiny

Proteoglykany

Lipoproteiny

Proteolipidy

Všechno souvisí se vším…