Makalah Biokimia Asam

Embed Size (px)

Citation preview

  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    1/11

    Makalah Biokimia Asam Nukleat

    May 27, 2014Uncategorized

    BAB II

    PEMBAHASAN

    1. Pengertian Asam Nukleat

    Penemuan zat yang terbukti sebagai asam deoksiribonukleat(DN! ter"adi ta#un 1$%& o'e#riedric# Miesc#er, seorang isika)an muda dai *)iss yang beker"a da'am 'aboratariumkimia +isio'ogi erman, e'i- o//e*ey'er. Miesc#er mene'iti se' dara# /uti# dengan asam#idro'at untuk mem/ero'e# inti untuk studi. *aat inti kemudian ditetesi dengan asam, enda/anyang terbentuk mengandung karbon,#ydrogen, oksigen, nitrogen, dan /ersentase tinggi

    +os+or. Miesc#er menyebut /resi/itat itu nuk'ein karena berasa' dari inti. 3emudian, saatditemukan sangat asam, namanya diuba# men"adi asam nuk'eat. Meski dia tidak ta#u,Miesc#er te'a# menemukan DN. *ete'a# itu, oo/e*ey'er mengiso'asi zat seru/a dari se'ragi, zat ini kemudian dikena' sebagai asam ribonuk'eat (N!. DN dan N ada'a#

    /o'imer nuk'eotida, atau /o'inuk'eotida (Ngi'i, 20156 2$&!.

    Pada 1&44, s)a'd 8ery, 9o'in Mac'eod, dan Mac'yn Mc9arty mendemonstrasikan ba#)aDN ada'a# mo'eku' yang memba)a in+ormasi genetic. Pada saat itu sangat sedikit yangdiketa#ui tentang struktur mo'eku' /enting ini. *e'ama bebera/a ta#un berikutnya nuk'eotida

    ber#asi' ditentukan, dan /ada 1&:5 ames D. ;atson dan rancis . 9. 9rick mengusu'kan

    mode' struktuk DN beruntai ganda (Ngi'i, 20156 2$&2&0!.sam nuk'eat ada'a# makromo'eku' yang terda/at sebagai /o'imer yang disebut

    polinukleotida. *e/erti yang diindikasikan o'e# namanya, setia/ /o'inuk'eotida terdiri atasmonomermonomer yang disebut nuk'eotida (nucleotide).*etia/ nuk'eotida tersusun dari tiga

    bagian6 basa nitrogen (nitrogenous base!, gu'a berkarbon 'ima (/entosa!, dan gugus +os+at.Nuk'eotida yang tan/a gugus +os+at disebut nuk'eosida (9am/be'', dkk. 200$6 &5!.

    Untuk mem/ero'e# asam nuk'eat da/at di'akukan ekstrasi ter#ada/ nucleoproteinter'ebi#da#u'u menggunakan 'arutan garam 1 M. 9ara 'ain untuk memisa#kan asam nuk'eat dari

    /rotein ia'a# menggunakan enzim /emeca# /rotein, misa'nya tri/sin. Denaturasi /rotein

    da'am cam/uran dengan asam nuk'eat ini da/at /u'a menyebabkan ter"adinya denaturasiasam nuk'eat itu sendiri. 'e# karena itu asam nuk'eat mengandung /entosa, maka bi'adi/anasi dengan asam su'+at akan terbentuk +u'+ura'. u'+ura' ini akan memberikan )arnamera# dengan ani'ine asetat atau )arna kuning dengan /brom+eni'#idrazina.

    2. Nukleotida dan Nukleosida

    5. Nukleotida

    Nuk'eotida ada'a# satu nuk'eosida yang berikatan dengan gugus +os+at. Di da'am mo'eku'DN atau N, nuk'eotida berikatan dengan nuk'eotida yang 'ain me'a'ui ikatan

    fosfodiester. Nuk'eotida yang mengandung deoksiribosa disebut deoksiribonukleotida,sedangkan yang mengandung ribosa disebut sebagai ribonukleotida(Ngi'i, 20156 2&5!.

    https://nadafauzannablog.wordpress.com/2014/05/27/makalah-biokimia-asam-nukleat/https://nadafauzannablog.wordpress.com/category/uncategorized/https://nadafauzannablog.wordpress.com/category/uncategorized/https://nadafauzannablog.wordpress.com/2014/05/27/makalah-biokimia-asam-nukleat/
  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    2/11

    Mo'eku' nuk'eotida terdiri atas nuk'eosida yang mengikat asam +os+at. Mo'eku' nuk'eosidaterdiri atas /entosa (deoksiribosa atau ribosa! yang mengikat suatu basa (deri8a /urin atau

    /irimidin!. adi a/abi'a suatu nuk'eo/rotein di#idro'isis sem/urna akan di#asi'kan /rotein,asam +os+at, /entosa dan basa /urin atau /irimidin (Poed"iadi, 1&&46 150!.

    Da'am a'am nuk'eosida terutama terda/at da'am bentuk ester +os+at yang disebut nuk'eotida.Nuk'eotida terda/at sebagai mo'eku' bebas atau berikatan dengan sesama nuk'eotidamembentuk asam nuk'eat. Da'am mo'eku' nuk'eotida gugus +os+at terikat o'e# /entosa /adaatom 9:(Poed"iadi, 1&&46 151!.

    nosinmono+os+at (>MP!

    Urasi' nuk'eotida

    (sam uridi'at!tau Uridinmono+os+at (UMP!

    *itidin nuk'eotida

    (sam sitidi'at!tau *itidinmono+os+at (*MP!

    ?imin nuk'eotida

    (sam timidi'at!tau ?imidinmono+os+at (?MP!

    Da'am /emba#asan se'an"utnya nama nuk'eotida ditu'is da'am bentuk singkatan sa"a se/ertiyang tertera dida'am kurung. /abi'a /entosanya deoksiribosa, maka ditamba# deoksi

    dimuka nama nuk'eotida tersebut. Misa'nya deoksiadosin monos+at atau dsingkat dMP(Poed"iadi, 1&&46 151!.

  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    3/11

    .Nuk'eosida /urin memi'iki ikatan @g'ikosida dari N& /ada basa ke 91 /ada gu'a. Da'amnuk'eosida /irimidin, ikatan ini yakni dari N1 /ada basa ke 91 /ada gu'a (Ngi'i, 20156 2&5!.

    1. Pada umumnya nuk'eosida diberi nama sesuai dengan nama basa /urin atau basa/irimidin yang membentuknya bebera/a nuk'eosida (Poed"iadi, 1&&46 150!. berikut

    ini ia'a# Nukleosida

    Di da'am struktur asam nuk'eat, /irimidin atau /urin berkaitan dengan gu'a (2deoksiDribosa atau Dribosa! membentuk suatu nukleosida. Nuk'eosida yang mengandungdeoksiribosa disebut deoksiribonukleosida, dan yang mengandung ribosa disebutribonukleosidayang membentuk dari basa /urin atau basa /irimidin dengan ribosa 6

    denin nuk'eosida tau denosin

    =uanin nuk'eosida tau =uanosin

    Urasi' nuk'eosida tau Uridin

    ?imin nuk'eosida tau ?imidin

    *itosin nuk'eosida tau *itidin

    /abi'a /entosa yang diikat ada'a# deoksiribosa, maka nama nuk'eosida diberi tamba#andeoksi dide/annya. Disam/ing 'ima "enis basa /urin atau basa /irimidin yang biasa terda/at

    /ada asam nuk'eat, ada /u'a bebera/a basa /urin dan basa /irimidin 'ain yang membentuknuk'eosida. i/oksantin dengan ribosa akan membentuk #i/oksantin nuk'eosida atau inosin.

    DN /ada bakteri ternyata mengandung #idroksimeti'sitoin. Demikian /u'a tN (trans+erN! mengandung deri8ate meti' basa /irimidin misa'nya %Ndimeti'adenin atau 2Ndimeti' guanine (Poed"iadi, 1&&46 150!.

    1. Perbedaan Nukleotida dan Nukleosida

    1. Nuk'eotida ada'a# b'ok bangunan DN atau N, dan terdiri dari

  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    4/11

    *emua rantai asam nuk'eat ber/asangan secara anti/ara'e' se/erti itu, tak /erdu'i a/aka#/asangannya ter"adi antarrantai DN, antara rantai DN dengan rantai N, atau/unantarrantai N. ?erda/at 4 macam basa organik yang membentuk /er/asangan tersebut 6adenin, sitosin, guanin, dan timin (di'ambangkan secara berturutturut dengan ,9,=, dan ?! (Dasardasar

  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    5/11

    keber'akaan tertentu. Pengamatan /enting o'e# . 9#arga++ (co'umbia uni8ersity! /ada ta#aun1&:0 memberi /etun"uk /enting mengenai struktur. 9#arga++ mengana'isis kadar basa DNdari berbagai organisme yang berbeda dan menemukan ba#)a banyaknya dan ? se'a'uekui8a'en dan banyaknya = dan 9 "uga se'a'u ekui8a'en. 9onto#nya, DN manusiamengandung sekitar 50E mau/un ? dan 20E = mau/un 9. *umber DN 'ain memberikan

    /ersentase berbeda, teta/i nisba# ter#ada/ ? dan nisba# = ter#ada/ 9 se'a'u satu (3imiarganik, 20056 :%%!.

    =ambar 2.2 *truktur sekunder DN

    *umber6 *umber6 #tt/6BB)ord/ress.com

    Makna kesetaraan ini baru nyata ta#un 1&:5, se)aktu )atson dan crick,F yang beker"abersamasama di cambrigde, >nggris, menga"ukan mode' #e'iks rangka/ untuk DN. Mereka

    menerima secara serem/ak data sinar- yang mendukung /enga"uannya tersebut dariosa'ind rank'in dan Maurice ;i'kins di Gondon (3imia rganik, 20056 :%%!.

    9iri /enting dari mode'nya ia'a# sebagai berikut 6

    1. DN terdiri atas dua rantai /o'inuk'eotida #e'iks yang menggu'ung di seke'i'ing suatusumbu.

    2. e'iks bersi+at /utarkanan, dan kedua untaian ber'a)anan menun"uk u"ung 5C danu"ung :Cnya.

    5.

  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    6/11

    3on+ormasi kese'uru#an yang di ambi' o'e# mo'eku' DN bergantung antara 'ain denganurutan basa yang sesunggu#nya. 9onto#nya, DN sintetik yang dibuat dengan unit /urina

    /irimida berse'angse'ing memi'iki kon+ormasi yang berbeda dengan DN yang dibuat darib'ok basa /urina diikuti o'e# b'ok basa /irimidina. Demikian "uga, /asangan basa ? dan =9 dengan ikatan yang berbeda dari yang dia"ukan semu'a o'e# )atson dan crick te'a#

    ditemukan (3imia rganik, 20056 :%7!.

    3eragaman da'am /erincian struktur DN meng#asi'kan mo'eku' DN dengan bengkokan,ge'ang "e/itrambut (hairpin loop!, su/erkoi', ge'ang untaiantungga', dan ba#kan menya'ib(ge'ang berikatan da'am untaian yang ke'uar dari #e'iks rangka/!. Peruba#an strukur inimenamba# ke'enturan bagaimana mo'eku' DN mam/u mengena'i dan berinteraksi dengankom/onen se' 'ainnya untuk me'aksanakan +ungsinya (3imia rganik, 20056 :%7!.

    :. Struktur !NA

    sam ribonuk'eat (ribonucleic acid! disingkat men"adi N ada'a# satu dari tiga

    makromo'eku' utama (bersama dengan DN dan /rotein! yang ber/eran /enting da'amsega'a bentuk ke#idu/an (3ey, 1&7%6 4%5!.

    sam ribonuk'eat ber/eran sebagai /emba)a ba#an genetik dan memainkan /eran utamada'am eks/resi genetik. Da'am dogma /okok (central dogma! genetika mo'eku'ar, Nmen"adi /erantara antara in+ormasi yang diba)a DN dan eks/resi +enoti/ik yangdi)u"udkan da'am bentuk /rotein(3ey, 1&7%6 4%5!.

    N terdiri atas rantaipoliribonukleotidayang basabasanya biasanya ada'a# adenine,guanine, urasi' dan sitosin. N ditemukan da'am nuc'eus mau/un sito/'asma se'. Kariasi

    bentuk N 'ebi# banyak dari DN. N memi'iki berat mo'eku' antara 2:.000 sama/aibebera/a "uta. *ebagian besar N berisi rantai /o'inuk'eutida tungga', teta/i rantai ini bisater'i/at sedemikian ru/a membentuk daera# #e'iks ganda yang mengandung /asangan basa 6 U dan =. ?erda/at tiga ti/e utama N, yakni transferN ( tN!, ribosomalN(rN!, dan messengerN (mN!. N ber/eran da'am eks/resi in+ormasi genetic.tN (Mr2:.000! ber+ungsi sebagai suatu ada/ter da'am sintesis rantai /o'i/e/tida. tNme'i/uti 1020 /ersen tota' N da'am se'. *etidaknya terda/at satu ti/e tN untuk setia/ti/e asam amino. tN memi'iki /ro/orsi nuk'eosida yang re'ati8e tinggi. Nuk'eosida inimemi'iki struktur unik, misa'nya adenine, citosin, guanine, serta urasi' yang termiti'asi atauteraseti'asi (Ngi'i, 20156 50750$!.

    =ambar 2.5 *truktur N*umber6 #tt/6BBgstatic.com

    *truktur dasar N miri/ dengan DN. N meru/akan /o'imer yang tersusun darise"um'a# nuk'eotida. *etia/ nuk'eotida memi'iki satu gugus +os+at, satu gugus /entosa, dansatu gugus basa nitrogen (basa N!. Po'imer tersusun dari ikatan berse'angse'ing antara gugus+os+at dari satu nuk'eotida dengan gugus /entosa dari nuk'eotida yang 'ain.

    sam ibonuk'eat ada'a# suatu /o'imer yang terdiri atas mo'eku'mo'eku' ribonuk'eutida.sam ribonuk'eat ini terbentuk o'e# adanya ikatan antara atom 9 nomor 5 dan atom 9 nomor: /ada mo'eku' ribose dengan /erantaraan gugus +os+at (Poed"iati, 200%6 15$!.

    http://gstatic.com/http://gstatic.com/
  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    7/11

    Meski/un banyak /ersamaannya dengan DN, N mem/unyai /erbedaan dengan DNyaitu6

    1. DN ter'etak di inti se' dan N ter'etak di inti se', sito/'asma, ribosom

    2.

  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    8/11

    4. Mo'eku N keci' ada da'am semua se'. *ebagian mo'eku' N keci' /unyaakti8itas kata'itik da'am #ubungan dengan /rotein.

  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    9/11

    2. Nuk'eotida ada'a# satu nuk'eosida yang berikatan dengan gugus +os+at. Di da'ammo'eku' DN atau N, nuk'eotida berikatan dengan nuk'eotida yang 'ain me'a'uiikatan fosfodiester. Nuk'eotida yang mengandung deoksiribosa disebutdeoksiribonukleotida, sedangkan yang mengandung ribosa disebut sebagairibonukleotida. Mo'eku' nuk'eotida terdiri atas nuk'eosida yang mengikat asam +os+at.

    Mo'eku' nuk'eosida terdiri atas /entosa (deoksiribosa atau ribosa! yang mengikatsuatu basa (deri8a /urin atau /irimidin!. adi a/abi'a suatu nuk'eo/rotein di#idro'isissem/urna akan di#asi'kan /rotein, asam +os+at, /entosa dan basa /urin atau /irimidin.

    5. Di da'am struktur asam nuk'eat, /irimidin atau /urin berkaitan dengan gu'a (2deoksiDribosa atau Dribosa! membentuk suatu nuk'eosida. Nuk'eosida yang mengandungdeoksiribosa disebut deoksiribonuk'eosida, dan yang mengandung ribosa disebutribonuk'eosida. Nuk'eosida /urin memi'iki ikatan @g'ikosida dari N& /ada basa ke91 /ada gu'a. Da'am nuk'eosida /irimidin, ikatan ini yakni dari N1 /ada basa ke 91 /ada gu'a. Pada umumnya nuk'eosida diberi nama sesuai dengan nama basa /urinatau basa /irimidin yang membentuknya

    4. =en tersusun atas asam nuk'eat yang disebut asam deoksiribonuk'eat(deo-yribonuc'eic acid, DN!. Mo'eku' tersebut ber/eran sebagai /emba)ain+ormasi genetik /ada semua organisme se'ain bebera/a "enis 8irus. sam ini ada'a#

    /o'imer yang terdiri dari mo'eku'mo'eku' deoksiribonuk'eotida yang terikat satusama 'ain, se#ingga bentuk rantai /o'inuk'eotida yang /an"ang. Mo'eku' DN yang

    /an"ang ini terbentuk o'e# ikatan antara atom 9 nomor 5 dengan atom 9 no : /adamo'eku' deoksiribosa dengan /erantaraan gugus +os+at

    :. N terdiri atas rantai /o'iribonuk'eotida yang basabasanya biasanya ada'a#adenine, guanine, urasi' dan sitosin. N ditemukan da'am nuc'eus mau/unsito/'asma se'. Kariasi bentuk N 'ebi# banyak dari DN. N memi'iki beratmo'eku' antara 2:.000 sama/ai bebera/a "uta. *ebagian besar N berisi rantai

    /o'inuk'eutida tungga', teta/i rantai ini bisa ter'i/at sedemikian ru/a membentukdaera# #e'iks ganda yang mengandung /asangan basa 6 U dan =. ?erda/at tiga ti/eutama N, yakni trans+er N ( tN!, ribosoma' N (rN!, dan messengerN (mN!. N ber/eran da'am eks/resi in+ormasi genetik. *truktur dasar Nmiri/ dengan DN. N meru/akan /o'imer yang tersusun dari se"um'a# nuk'eotida.*etia/ nuk'eotida memi'iki satu gugus +os+at, satu gugus /entosa, dan satu gugus basanitrogen (basa N!. Po'imer tersusun dari ikatan berse'angse'ing antara gugus +os+atdari satu nuk'eotida dengan gugus /entosa dari nuk'eotida yang 'ain. sam

    ibonuk'eat ada'a# suatu /o'imer yang terdiri atas mo'eku'mo'eku' ribonuk'eutida.sam ribonuk'eat ini terbentuk o'e# adanya ikatan antara atom 9 nomor 5 dan atom 9nomor : /ada mo'eku' ribose dengan /erantaraan gugus +os+at

  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    10/11

    $% Saran

    Di#ara/kan /ara ma#asis)a da/at mema#ami /engertian asam nuk'eat danstrukturnya.Meski/un begitu kami sadar akan banyaknya kekurangan da'am /embuatanmaka'a# ini, /enu'is meng#ara/kan /ara /embaca da/at memberikan kritik dan saran yangmembangun.

  • 7/23/2019 Makalah Biokimia Asam

    11/11

    Daftar Pustaka

    9am/be'', N.., dkk. (200$!.Biologi Edisi 8 Jilid . akarta6 r'angga.

    3ey, G. oe. (1&7%! .!lant Biochemistr".

    Poed"iadi, nna.,.M.*u/riyanti. (200:!.#asar-dasar Biokimia. Press