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MATEMÁTICAS EN LA SANGRE. Santander, Marzo 2011 Miguel A. Herrero Instituto de Matemática Interdisciplinar (IMI) Departamento de Matemática Aplicada Universidad Complutense de Madrid [email protected]

MATEMÁTICAS EN LA SANGRE. - … · La consecuencia de un buen diseño es que tal ... datos registrados acerca del estado del avión durante las ... sanguínea es un robusto mecanismo

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  • MATEMTICAS EN LA SANGRE.

    Santander, Marzo 2011

    Miguel A. Herrero

    Instituto de Matemtica Interdisciplinar (IMI)

    Departamento de Matemtica Aplicada

    Universidad Complutense de Madrid

    [email protected]

  • MATEMTICAS EN LA SANGRE

    Ejemplos y reflexiones en torno al uso de modelos matemticos en Biomedicina.

    Primer ejemplo: Vasculognesis.

    Segundo ejemplo: Coagulacin Sangunea.

    Observaciones finales .

  • PRLOGO I

    Se supone que un cientfico ha de tener un conocimiento completo y profundode algunos temas, y se espera de l que no escriba sobre ninguna materiaque no domine por completo. Ese comportamiento es considerado unacuestin de honor: noblesse oblige. Por mi parte, voy a renunciar a estegnero de noblesse , y a las obligaciones que impone. Mi excusa para ello es lasiguiente.

    Hemos heredado de nuestros antepasados un profundo anhelo deconocimiento unificado y universal .El mismo nombre de nuestras ms altasinstituciones de enseanza (Universidades) nos recuerda que, desde laantigedad y a lo largo de los siglos, hemos atribuido el mayor valor a estacaracterstica de universalidad. Sin embargo, el crecimiento en amplitud yprofundidad experimentado por todas las ramas del conocimiento en losltimos cien aos nos enfrenta a un inquietante dilema. Por un lado, nosdamos cuenta con claridad de que solo ahora estamos comenzando aacumular suficiente material para unificar la suma de lo que sabemos en untodo comn. Sin embargo , se ha hecho casi imposible para cada individuodominar algo ms que una pequea parte de ese todo.

  • Si no queremos renunciar a nuestro anhelo de conocimiento universal, noveo ms solucin a este dilema que el que alguno de nosotros se atreva aproponer una sntesis de hechos y teoras, aunque sea con unconocimiento incompleto y de segunda mano de alguna de ellas, ycorriendo el riesgo de decir tonteras .

    Y se acabaron las disculpas.

    Erwin Schrdinger : Qu es la vida? ( 1944)

    PRLOGO II

  • Dibujo de M. Malpighi (1661) Charles D. Little et al. (2000)

    PRIMER EJEMPLO:VASCULOGNESIS.El sistema vascular es el primer sistema completamente funcional quese forma durante el desarrollo embrionario .

    Dos procesos diferentes: vasculognesis y angiognesis.

  • La vasculognesis da lugar a estructuras filamentarias con longitudescaractersticas

  • Cmo explicar la formacin y el funcionamiento de este sistema?Los filsofos griegos barajaron dos hiptesis: preformacin y desarrollosucesivo (epignesis).

    Aristteles propuso el principio deepignesis (desarrollo sucesivo) paraexplicar la generacin de un sistemaextremadamente complejo. Segn estavisin, las partes de un animal se forman.

    ..unas a continuacin de otras, de formasimilar al hilado de una red

    Y las reglas que gobiernan este proceso sonsimilares a:

    mecanismos automticos, cuyas piezas seponen en movimiento mediante unaaccin externa, que a continuacin setransmite desde cada pieza a las msprximas .

    (La generacin de los animales , Libro II)

  • FORMACIN DEL SISTEMA VASCULAR: LAS REGLAS DEL JUEGO I

    Las estructuras se generan de acuerdo con un plan que se elabora y actualiza amedida que aquellas se despliegan.

    El punto de partida es un medio casi homogneo, en el que existen pequeasdiferencias espaciales (gradientes) en las concentraciones de algunas sustanciasqumicas (morfogenes).

  • FORMACIN DEL SISTEMA VASCULAR: LAS REGLAS DEL JUEGO II

    Las reglas del juego vienen impuestas por :

    - Difusin (representada a nivel microscpico por marchas aleatorias).

    - Reaccin entre molculas.

    - Mecnica de medios continuos (movimiento de fluidos, elasticidad, flujos

    migratorios).

    Idea General : Pequeas diferencias de concentraciones

    (gradientes) de sustancias en un medio inicial casi constante

    dan lugar a estructuras que crecen y se autorregulan para dar

    lugar a formas estables

    (principios de activacin e inhibicin).

  • Qu pueden aportar las Matemticas al estudio de este tipo de problemas?

    Un instrumento tcnico (un nuevo microscopio) para detectar y cuantificarrelaciones causa-efecto.

    En una situacin compleja, caracterizada por una gran cantidad deacontecimientos simultneos, se observa una secuencia de varioscomportamientos. Cul es la causa de cada uno de ellos?

    Un modelo matemtico parte de unas hiptesis bien definidas y obtieneconclusiones precisas. Estas ltimas son tanto ms claras cuanto ms simple seael modelo.

    Cmo asociar modelos simples a fenmenos complejos?: Modularidad.

  • MODULARIDAD

    http://www.andrewlipson.com/escher/waterfall.html
  • SON LOS SISTEMAS BIOLGICOS DEMASIADO COMPLEJOS PARA SER FORMULADOS EN TRMINOS MATEMTICOS?

    Un Boeing 777 es un autntico circuito volador, con 150.000 diferentessubsistemas modulares, organizados mediante protocolos no triviales para darlugar a complejas redes y sistemas de control, incluyendo unos 1.000 ordenadoresque pueden automatizar todas las funciones del vehculo

    En trminos de coste y complejidad, el 777 es fundamentalmente un vastosistema de control que da la casualidad que vuela

  • La consecuencia de un buen diseo es que tal complejidadpermanece oculta a los pasajeros, excepto cuando se utilizanlos sistemas de entretenimiento disponibles a bordo.

    Sin embargo, el nivel de actividad interno es abrumador. Por ejemplo, losdatos registrados acerca del estado del avin durante las pruebas finales deverificacin equivalen a un genoma humano por minuto.

    (Csete y Doyle, Science 295, 2000)

    El problema no es tanto la complejidad como la existencia de un propsito o funcin

  • Vasculognesis: perspectiva histrica.

    1917

    Identification of vascular precursorsF. Sabin

    ~1550 BCEEarliest known writings Erbers Papyrus

    ~350 BCE

    Basis for scientific studiesAristotle

    Detailed embryological studiesM. Malpighi

    1691

    Major contributionsto vasculogenesisW. Risau

    ~19951989

    Discovery of VEGFSenger/ N. Ferrara

    Isolation of the first angiogenic factorJ. Folkman et al

    1983

    0 2011

    1994 H. MeinhardtR-D System

    1996 J.D. MurrayPDE

    2003 L. Preziosi PDE

    2006 R. Merks CPM+PDE

    Models:

  • Preliminares : Vasculognesis I

  • Preliminares: Vasculogenesis II

    QH1- / TAL1+ cells : Endothelial Cell Precursors or Angioblast (Arrowheads)

    QH1+ / TAL1+ cells : Endothelial Cell (Arrows)

    Una revisin reciente : M.A. Herrero et al. (2009) Math. Model Methods Appl. Sci.

    Los angioblastos se agrupan en patronesreticulares Cmo se comunican entre si parahacerlo (quimiotaxis)? Qu papel juegansustancias sealizadores y el medio (matrizextracelular) en el proceso?

    La regularidad de formas y escalas sugiere laconveniencia de describir el proceso mediantemodelos matemticos.

  • n = densidad celularv = velocidad celularc = concentracin VEGF

    quimiotaxis

    Un modelo matemtico: quimiotaxis autocrina I

    clulas HUVEC in vitro

    L. Preziosi et al. (2003) Phys. Rev. Lett. / Serini et al (2003) EMBO J.

    Produccinautocrina

  • clulas HUVEC in vitro simulaciones

    Un modelo matemtico: quimiotaxis autocrina II

    L. Preziosi et al. (2003) Phys. Rev. Lett. / Serini et al (2003) EMBO J.

    El diablo acecha en los parmetros

  • Modelos hbridos (multiescala): Quimiotaxis autocrina

    autocrinaquimiotaxis

    Merks et al (2004) Lect. Notes Comput. Sc.; Merks et al (2006) Dev. Biol. Merks and Glazier (2006) Nonlinearity; Merks et al (2008) PLoS Comp Biol.

    Cellular Potts Model (clulas) PDE (VEGF)

    adhesin celular rea celular

    Un problema: para ajustar el modelo se necesitan valores no realistas de los parmetros

  • Modelos matemticos: Sealizacin paracrina o autocrina?

    Problema

    Posible solucin

    Extracellular matrix can store and protect signaling cues

    Homogeneous signal => heterogeneous pattern?

  • Modelos matemticos: Seales retenidas en la matriz extracelular

  • Formacin de la red guiada por una seal homognea mediante anclaje de seales a la matriz ECM.

    Reproduce patrn reticular mostrado por anlisis morfomtrico

    Dos escalas temporales en la dinmica percolacin rpida, remodelacin tisular lenta

    Al variar la densidad aparecen tres umbralespercolacin, mximo en interfase, mximo en longitud.

    Conclusiones y Propuestas

  • Baja densidad: Percolacin

    Densidad media : Nodos + Interfases

    Densidad alta: Lagunas + Longitud

    Tres umbrales en la densidad.

    Propiedades emergentes de la red en funcin de la densidad celular.

  • SEGUNDO EJEMPLO: COAGULACION SANGUNEA

    El proceso de coagulacin sangunea es un robusto mecanismo de seguridad delsistema vascular humano, cuyo grado de complejidad es muy alto: si se alinearantodos los vasos de un adulto, daran dos veces la vuelta a la Tierra.

    Detiene hemorragias producidas por pequeas heridas y contribuye a manteneroperativos los vasos sanguneos, ayudando a su reparacin .

    La falta de coagulacin es causa de hemofilia, una enfermedad hereditaria.

    Una actividad coagulatoria excesiva da lugar a trastornos como la CoagulacinIntravascular Diseminada (DIC), un proceso grave que es inducido por variostipos de tumores.

  • LA CASCADA DE COAGULACIN.

    FP

    A

    XIIa

    12

    11 9XI XIa

    IX

    IXa

    XII

    X

    10

    10ex

    7c

    7 VIIaB

    VII 1

    Xa

    10c

    E3

    VIIIa3

    8

    II

    2 IIa

    2c

    E4

    Va4

    5

    11b

    8'

    VIII

    V

    FM

    FG

    ...

    Guria G.T., Macroscopic structures formation in blood dynamics , Moscow (2002).

  • FORMACIN DE LA RED DE FIBRINA

  • FIBRINOLISIS: DESTRUCCIN DE LA RED DE FIBRINA

  • Cascada de coagulacin: Tipos de reacciones

    Coagulantes: Conducen a la formacion de cogulos/trombos sanguneos.

    Anticoagulantes: Detienen la coagulacin , evitando su extensin incontrolada .

    Las reacciones tienen lugar a partir de precursores inactivos (presentes en la sangre) que son activados externamente. Los correspondientes procesos de autocatlisis figuran entre los ms eficientes que se concoen en ingeniera Qumica

    Modelizacin Matemtica :- Sistemas de activacininhibicin. - Ecuaciones de polimerizacin (incluyendo coagulacin y fragmentacin).

  • MODULARIDAD

    http://www.andrewlipson.com/escher/waterfall.html
  • Esquema modular de la cascada de coagulacin sangunea

    Trombina Anti-coagulantes

    Fuente de activacin

    Amplificacin

    Fibringeno Fibrina monmeros

    Fibrina(polmeros)

  • Una aproximacin fenomenolgica:

    El sistema de reacciones que da lugar a la produccin de trombina y a su regulacin se representa por medio de un sistema (de tipo activador-inhibidor)

    para la trombina y un inhibidor genrico suyo:

    (Ataullakhanov-Guria, 98)

  • La trombina y su inhibidor

  • Esquema modular de la cascada de coagulacin sangunea

    Trombina Anti-coagulantes

    Fuente de activacin

    Amplificacin

    Fibringeno Fibrina monmeros

    Fibrina(polmeros)

  • Un modelo para la produccin de fibrina: Ecuaciones de polimerizacin de Flory y Stockmayer (hacia 1940)

    Basadas en un modelo debido a Smoluchowski (hacia 1910) y revisado por Chandrasekhar (1940)

    Inspiradas en Demcrito , hacia el siglo V AC : Todo lo que existe en el universo es fruto del azar y la necesidad..

    La funcionalidad de la fibrina es 4

  • Fragmentacin

  • Ecuaciones de polimerizacin y fragmentacin de la red de fibrina

    Los estados tempranos de la formacin de trombos corresponden a una transicin de fase (aparicin de un gel).

  • ULTRASOUND IMAGE ANALYSIS

    Ultrasound diagnostics of an iliac vein of a patient

    in National Center for Hematology, Moscow.

  • Una coagulacin patolgica puede ser desencadenada por una fuente patgena (tumor) en un tejido prximo.

  • Un problema modelo:

    relacionar la localizacin de una fuente patolgica y la nube de microtrombos inducida .

  • Coagulacin inducida externamente en un vaso: un problema con dependencia espacial.

  • OBSERVACIONES FINALES

    Las Matemticas proporcionan instrumentos para detectar y cuantificar relaciones causa-efecto, y permiten formular preguntas relevantes. Por ello los mtodos matemticos constituyen una parte importante del arsenal de un equipo interdisciplinar que estudie problemas biolgicos.

    Un modo de proceder que se ha revelado til consiste en plantear modelos simples ( mdulos ) , interconectados entre si mediante lazos de retroalimentacin, hasta reflejar estructuras complejas. La complejidad de una estructura da lugar a propiedades emergentes, que no son una simple perturbacin de las que se observan en sus componentes simples.

    Al hablar de complejidad biolgica , la existencia de funciones o propsitos establece una diferencia sustancial con la naturaleza inorgnica.

  • AGRADECIMIENTOS

    Esta presentacin describe trabajo realizado en colaboracin con :

    Alvaro Khn ( UCM) Andreas Deutsch, Walter de Back, Jrn Starruss ( Centro de Computacin

    Avanzada , Universidad de Dresde, Alemania ).

    Jose Maria Prez-Pomares, Andrea Mattiotti ( Laboratorio de Desarrollo Cardiovascular, Universidad de Mlaga ).

    Georgy Th. Guria, Ksenia Zlobina ( Centro Nacional de Hematologa, Mosc, Rusia ).

    MATEMTICAS EN LA SANGRE.Santander, Marzo 2011 MATEMTICAS EN LA SANGREPRLOGO IPRLOGO IINmero de diapositiva 5Nmero de diapositiva 6Cmo explicar la formacin y el funcionamiento de este sistema?Los filsofos griegos barajaron dos hiptesis: preformacin y desarrollosucesivo (epignesis).FORMACIN DEL SISTEMA VASCULAR: LAS REGLAS DEL JUEGO INmero de diapositiva 9Qu pueden aportar las Matemticas al estudio de este tipo de problemas?MODULARIDADNmero de diapositiva 12Nmero de diapositiva 13Vasculognesis: perspectiva histrica.Preliminares : Vasculognesis IPreliminares: Vasculogenesis IINmero de diapositiva 17Nmero de diapositiva 18Nmero de diapositiva 19Nmero de diapositiva 20Nmero de diapositiva 21Nmero de diapositiva 22Nmero de diapositiva 23SEGUNDO EJEMPLO: COAGULACION SANGUNEALA CASCADA DE COAGULACIN.FORMACIN DE LA RED DE FIBRINAFIBRINOLISIS: DESTRUCCIN DE LA RED DE FIBRINACascada de coagulacin: Tipos de reaccionesMODULARIDADEsquema modular de la cascada de coagulacin sangunea Una aproximacin fenomenolgica: El sistema de reacciones que da lugar a la produccin de trombina y a su regulacin se representa por medio de un sistema (de tipo activador-inhibidor) para la trombina y un inhibidor genrico suyo: La trombina y su inhibidorEsquema modular de la cascada de coagulacin sangunea Un modelo para la produccin de fibrina: Ecuaciones de polimerizacin de Flory y Stockmayer (hacia 1940) Basadas en un modelo debido a Smoluchowski (hacia 1910) y revisado por Chandrasekhar (1940)Inspiradas en Demcrito , hacia el siglo V AC : Todo lo que existe en el universo es fruto del azar y la necesidad.. FragmentacinEcuaciones de polimerizacin y fragmentacin de la red de fibrina ULTRASOUND IMAGE ANALYSISUna coagulacin patolgica puede ser desencadenada por una fuente patgena (tumor) en un tejido prximo.Un problema modelo: relacionar la localizacin de una fuente patolgica y la nube de microtrombos inducida . Coagulacin inducida externamente en un vaso: un problema con dependencia espacial.OBSERVACIONES FINALES AGRADECIMIENTOS