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e-Pilly TROP Maladies infectieuses tropicales par le Collège des Universitaires de Maladies Infectieuses et Tropicales 2012 édition web www.infectiologie.com Editions Alinéa Plus

Medecine Tropicale

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  • e-Pilly TROPMaladies infectieuses tropicales

    par le Collge des Universitaires de Maladies Infectieuses et Tropicales

    2012dition web

    www.infectiologie.com

    Editions Alina Plus

  • e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales

    e-Pilly TROP 2012

    Licence dutilisation et prcautions dusageLe CMIT dcline toute responsabilit, de quelque nature quelle soit, pouvant rsulter dune ngligence ou dune mauvaise utilisation de tous produits, instruments, techniques ou concepts prsents dans cet ouvrage. Le CMIT recommande quune vrification ext-rieure intervienne pour les diagnostics, posologies et techniques.Tous droits de traduction, dadaptation et de reproduction par tous procds rservs pour tous pays. Toute reproduction ou repr-sentation intgrale ou partielle, par quelque procd que ce soit y compris le tlchargement, des pages publies dans le prsent ouvrage, faite sans lautorisation de lditeur est illicite et constitue une contrefaon. Seules sont autorises, dune part, les reproduc-tions strictement rserves lusage priv du copiste et non destines une utilisation collective, et dautre part, les courtes citations justifies par le caractre scientifique ou dinformation de luvre dans laquelle elles sont incorpores (loi du 11 mars 1957, art. 40 et 41 et Code pnal, art. 425).Des photocopies payantes peuvent tre ralises avec laccord de lditeur. Sadresser au Centre franais dexploitation du droit de copie, 3, rue Hautefeuille, 75006 Paris. Tl : 01 43 26 95 35 Fax : 01 46 34 67 19.

    Copyright 2012. CMIT et Alina Plus

    La loi du 11 mars 1957 interdit les copies ou reproductions destines une utilisation collective. Toute reprsentation ou reproduc-tion intgrale ou partielle faite par quelque procd que ce soit y compris le tlchargement, sans le consentement de lauteur ou ses ayants cause, est illicite et constitue une contrefaon sanctionne par les articles 425 et suivants du Code Pnal.

    Le Comit de rdactionCoordonnateurs : Jean DELMONT et Eric PICHARDStphane JAURGUIBERRY, Bruno MARCHOU, Philippe PAROLA, Fabrice SIMON

    Auteurs et co-auteurs ayant contribu la rdaction du e-Pilly TROPric ADEHOSSI, Khadidiatou B FALL, Bernadette BALDIN, Alain BERREBI, Antoine BERRY, Jean BEYTOUT, Elisabeth BOTELHO-NEVERS, Olivier BOUCHAUD, Michel BOUSSINESQ, Elisabeth BOUVET, Souleymane BRAH, Philippe BROUQUI, Pierre BUFFET, Dominique CHABASSE, Thibaut CHALLAN BELVAL, Jean-Philippe CHIPPAUX, Daniel CHRISTMANN, Eric DELAPORTE, Pierre DELLAMONICA, Jean DELMONT, Michel DEVELOUX, Ibrahima DIALLO, Serge HOLI, Eboi EHUI, Jean-Franois FAUCHER, Ccile FICKO, Eric GARNOTEL, Philippe GAUTRET, Pierre-Marie GIRARD, Patrick HOCHEDEZ, Patrick IMBERT, Yannick JAFFR, Stphane JAURGUIBERRY, Dominique KEROUDAN, Karine LACOMBE, Jean-Christophe LAGIER, Olivier LESENS, Frdric LUCHT, Antoine MAH, Denis MALVY, Bruno MARCHOU, Thierry MAY, Papa Saliou MBAYE, Christian MICHELET, Matthieu MILLION, Daouda MINTA, Gentiane MONSEL, Jean-Jacques MORAND, Philippe PAROLA, Olivier PATEY, Christian PERRONNE, Dominique PEYRAMOND, Gilles PIALOUX, Renaud PIARROUX, Eric PICHARD, Christian RABAUD, Valrie RABIER, Blandine RAMMAERT, Christophe RAPP, Serge RESNIKOFF, Hlne SAVINI, Fabrice SIMON, Georges SOULA, Michel STROBEL, Mariam SYLLA, Pierre TATTEVIN, Hlne THFENNE, Roland TUBIANA, Yazdan YAZDANPANAH

  • 2 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales

    Introduction

    Le-Pilly TROP est un ouvrage dinfectiologie tropicale destin aux mdecins et aux tudiants en mdecine des pays francophones du Sud. La prise en compte des diffrents niveaux de la pyramide sanitaire dans ces pays le rend aussi accessible aux infirmiers des centres de sant communautaires urbains et des structures de sant intermdiaires des zones rurales. Par dfinition, les Pays En Dveloppement accroissant progressivement leurs capacits de diagnostic biologique et de traitement, les outils de prise en charge correspondent aux moyens des niveaux priphriques comme ceux des niveaux hospitaliers de rfrence.

    Les pathologies infectieuses dites tropicales dpassant largement la ceinture intertropicale, de nombreux pays proches de cette zone gographique sont concerns par ces infections et par les programmes de lutte qui sont donc abords dans le cadre de la sant internationale et de la sant globale regroupant les moyens de surveillance, dalerte et de rponse des partenaires Nord-Sud, institutionnels ou privs.

    Louvrage intressera aussi les mdecins et les tudiants des pays francophones du Nord amens prendre en charge les pathologies infectieuses des voyageurs et des migrants, dtailles dans des encarts ddis la fin de chacun des chapitres concerns par ces pathologies.

    Les parasitoses et les mycoses occupant un place importante en infectiologie tropicale sont abordes essentiellement lorsquelles sont responsables dinfections gnrales ou posant un problme de diagnostic avec les bactrioses et les viroses.

    Lutilisation de le-Pilly TROP est facilit par les renvois automatiques vers les chapitres correspondants partir de mots-cls et par des liens avec les principaux sites ou textes en ligne sur le web. Quarante-cinq cas cliniques interactifs, prsents dans latelier interactif de mdecine tropicale des Journes Nationales dInfectiologie en France depuis 10 ans, sont disponibles page 6 du sommaire et permettent un entrane-ment personnel ou une utilisation pdagogique en groupes.

    Le e-Pilly TROP est un ouvrage collectif du Collge des universitaires de Maladies Infectieuses et Tropicales (CMIT) mis gratuitement la disposition des personnels de sant francophone. Il ne peut en tre fait aucun usage commercial. Sa conception et sa ralisation nont aucun lien avec dautres organismes ou avec lindustrie pharmaceutique. Le comit de rdaction a veill ce quil ny ait aucun conflit dintrt concernant les auteurs qui ont particip bnvolement la rdaction de le-Pilly TROP. Ceux-ci sont des praticiens et des enseignants en maladies infectieuses et tropicales des hpitaux franais et des spcialistes dinfectiologie tropicale des pays du Sud (voir la liste et les coordonnes des auteurs). Un complment dinformation est accessible dans les ouvrages du CMIT E. PILLY et POPI disponibles en librairie et dans lECN.Pilly accessible en ligne, ainsi que dans de nombreux autres documents dinfectiologie, sur le site www.infectiologie.com.

    Lvolution de linfectiologie tropicale tant rapide et la rdaction de le-Pilly TROP couvrant lanne 2011-2012, il est recommand aux lecteurs de proposer par mail au comit de rdaction des corrections et mises jour concernant leur pays dexercice.

    Le Comit de Rdaction remercie particulirement les auteurs des pays du Sud, lassociation ANOFEL, regroupant les enseignants franais de parasitologie, pour laccs liconographie du CDRom ANOFEL4, le Centre de Formation et Recherche en Mdecine et Sant Tropicales (CFRMST) pour sa mise disposition de photographies, lInstitut de Mdecine Tropicale du Service de Sant des Armes (IMTSSA, Le Pharo, Marseille) pour lutilisation dillustrations parues dans la revue Mdecine Tropicale et Madame Nathalie Pasquier-Desvignes ainsi que lquipe de Alina Plus pour la ralisation de le-Pilly TROP.

    Le comit de rdaction.

    Pr Jean Delmont, Marseille. [email protected]

    Dr Stphane Jaurguiberry, Paris. [email protected]

    Pr Bruno Marchou, Toulouse. [email protected]

    Pr Philippe Parola, Marseille. [email protected]

    Pr Eric Pichard, Angers. [email protected]

    Pr Fabrice Simon, Marseille Armes. [email protected]

    CMIT et Alina Plus

  • e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales

    AccsLe e-Pilly TROP, ouvrage franais de rfrence en infectiologie tropicale labor sous lgide du CMIT et dit par Alina Plus, est accessible via le site internet Infectiologie.com, rubrique formation, sous-rubrique livres (http://www.infectiologie.com/site/livres.php).

    Le e-Pilly TROP se prsente sous forme dun fichier pdf interactif (nom du fichier ePillyTROP.pdf) incluant lensemble des chapitres du e-Pilly TROP ainsi que 45 cas cliniques en mdecine tropicale interactifs.

    Avant de dmarrer1. Cliquez sur le fichier PDF interactif ePillyTROP.pdf laide du logiciel Acrobat Reader, tlchar-

    geable gratuitement depuis le site Adobe http://get.adobe.com/fr/reader/, ou autres logiciels compatibles avec Acrobat Reader. Pour information, le logiciel payant Acrobat Pro offre plus de fonctionnalits.

    2. Afin doptimiser la lecture en ligne du e-pilly TROP, nous vous suggrons de mettre en place les outils suivants sur la barre doutils de votre Acrobat Reader :

    affichage des signets (Cliquez sur le bouton Signets gauche du panneau de navigation ou choi-sissez Affichage > Panneaux de navigation > Signets) : les signets constituent un sommaire visuel, ils saffichent dans le navigateur situ gauche de la fentre dAcrobat Reader ;

    outils pour la navigation de pages (Affichage > Barre doutils > Ajouter des outils > Barre doutils Navigation de page : cochez tous les outils) :

    les boutons Page suivante et Page prcdente sont disponibles sur la barre doutils Navi-gation de pages. En regard de ces boutons, la zone de texte est galement interactive : il vous suffit de taper un numro de page et dappuyer sur Entre pour atteindre directement la page voulue ;

    les boutons Vue prcdente et Vue suivante vous permettent de rechercher des pages PDF que vous avez visualises auparavant en revenant en arrire dans votre parcours de visua-lisation. En parlant de vue, il sagit de lhistorique de visualisation des pages. Si, par exemple, vous avancez et reculez dans un document, lhistorique de visualisation revient en arrire, affi-chant les pages que vous avez vues dans lordre inverse de laffichage initial. Ces boutons his-torique de visualisation apparaissent galement lintrieur du document ( ct des boutons Sommaire et Index).

    recherche dinformations : servez-vous de la fentre Recherche avance (Edition > Recherche avance) ou de la barre doutils Recherche pour trouver les informations qui vous intressent dans lensemble du document et les signets.

    Lindex en fin douvrage renvoit aux numros de chapitres correspondants (et non aux pages correspon-dantes). Les chapitres principaux sont indiqus en gras.

    Organisation et interactivit spcifiques du e-Pilly TROPLe e-Pilly TROP comprend 5 grandes parties (cf. sommaire) repres par un code couleur qui est retrouv dans lensemble des chapitres de chaque partie :

    e-Pilly TROP : mode demploi

    ATTenTIOn, afin que les liens des cas cliniques en mdecine tropicale (page 6 du sommaire) soient actifs, il est indispensable de tlcharger et de ranger au pralable

    le fichier ePillyTROP.pdf et le dossier Cas_cliniques_ePillyTROP dans un mme dossier.

  • e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales

    En vert : pidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale.

    En orange : Outils en infectiologie tropicale.

    En bleu : Syndromes.

    En rouge : Maladies.

    En mauve : Infections selon le terrain.

    Sur chaque page du e-Pilly TROP :

    la partie et le chapitre concerns sont rappels en haut et gauche dans le bandeau suprieur ;

    les boutons sommaire et index situs en haut et droite dans le bandeau suprieur permettent daccder au sommaire interactif ou lindex ;

    les liens textes (mots souligns) renvoient la tte dun chapitre ;

    les flches situes en haut et droite permettent de passer dune action lautre ( ne pas confondre avec les flches disponibles dans votre logiciel Acrobat ou de lecture qui permettent de passer dune page lautre). Par exemple, vous cliquez sur un lien texte de la page 28 qui vous renvoie page 234 : une fois page 234 il suffit de cliquer sur la flche de gauche pour revenir votre page initiale n 28; en cliquant sur la flche de droite vous pourrez retourner la page 234 et ainsi de suite.

    Le fichier pdf interactif du e-Pilly TROP permet galement une consultation :

    en e-book laide de multiples plateformes web qui mettent disposition des outils de transformation dun fichier pdf en e-book ;

    sur tablette ou smartphone laide de logiciels ou solutions de lecture du format pdf (ex : Adobe Viewer ou Goodreader sur iPad).

    Lutilisateur peut ainsi bnficier la fois de linteractivit spcifique ce fichier pdf interactif (sommaire, liens) et de toutes les fonctionnalits propres au logiciel Acrobat Reader ou au logiciel de lecture de le-book (recherche intgrale, modes daffichage, aller la page nX, marque-page). Par exemple, pour rechercher une thmatique qui vous intresse (ex : paludisme) vous disposez de 2 modes de recherche possible:

    via le sommaire interactif : en cliquant sur le chapitre correspondant dans le sommaire (paludisme), vous irez directement la tte du chapitre correspondant (paludisme) ;

    via les signets (outil dAcrobat) : les signets constituent un sommaire visuel, ils saffichent dans le navi-gateur situ gauche de la fentre dAcrobat Reader. En cliquant sur le chapitre correspondant dans le sommaire (paludisme), vous irez directement la tte du chapitre correspondant (paludisme) ;

    via la recherche intgrale par mot (fonctionnalit dAcrobat ou du logiciel de lecture) : en tapant le mot recherch (paludisme), le logiciel Acrobat vous indiquera le nombre de mot paludisme rencontr dans louvrage et vous dirigera successivement tous les endroits o il se situe (visualisation en surlignage).

    e-Pilly TROP : mode demploi (suite)

  • 3 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales

    Sommaire

    Partie 1. pidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    001 Vocabulaire simplifi de lpidmiologie des maladies transmissibles ............................................................... 7

    002 Transmission des infections ........................................................................................................................................................... 11

    003 pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique ................................................................................................................................................................ 15

    004 Risques infectieux des voyages et des migrations entre pays tropicaux ....................................................... 29

    005 Vecteurs et lutte antivectorielle ................................................................................................................................................... 34

    006 Priorits en infectiologie tropicale. Organismes impliqus dans la lutte contre les infections tropicales. Programmes nationaux et internationaux ................................................................... 47

    Partie 2. Outils en infectiologie tropicale007 Apports dune dmarche anthropologique la prvention

    et la prise en charge des maladies infectieuses ......................................................................................................... 56

    008 Classification des principales bactries pathognes chez lhomme ................................................................. 61

    009 Classification des principaux virus pathognes chez lhomme ............................................................................ 65

    010 Classification des principaux parasites pathognes chez lhomme .................................................................. 67

    011 Classification des principaux champignons pathognes chez lhomme ........................................................ 69

    012 Technique, rsultats et interprtation des prlvements ........................................................................................... 72

    013 Anti-infectieux essentiels ................................................................................................................................................................ 94

    014 Antituberculeux ..................................................................................................................................................................................... 98

    015 Antirtroviraux ..................................................................................................................................................................................... 102

    016 Antiparasitaires ................................................................................................................................................................................... 105

    017 Antifongiques ....................................................................................................................................................................................... 109

    018 Antiseptiques et dsinfectants. Strilisation .................................................................................................................... 111

    019 Rgles de prescription des antibiotiques ........................................................................................................................... 114

    020 Traitements courts ou minute ............................................................................................................................................. 118

    021 Rsistances aux antibactriens ................................................................................................................................................ 120

    022 Interactions mdicamenteuses avec les anti-infectieux .......................................................................................... 126

    023 Chimioprophylaxie anti-infectieuse ........................................................................................................................................ 137

    024 Vaccinations. Programme largi de vaccination (PEV). Sroprvention, srothrapie ........................ 142

    Partie 3. Syndromes025 Fivre aigu. Examen clinique en infectiologie tropicale ......................................................................................... 151

    026 Eruptions fbriles ............................................................................................................................................................................... 157

    027 Syndromes septiques, choc septique et bactrimies ............................................................................................ 166

    028 Fivres hmorragiques virales ................................................................................................................................................... 170

    029 Fivres prolonges, granulomatoses hpatiques ......................................................................................................... 181

    030 Splnomgalies infectieuses ...................................................................................................................................................... 187

    031 Adnopathies infectieuses (conduite tenir) .................................................................................................................. 190

    032 Infections buccales .......................................................................................................................................................................... 194

  • 4 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales

    033 Infections respiratoires hautes : rhino-pharyngites, angines, sinusites, otites, infections ORL tropicales ................................................................................................. 204

    034 Infections respiratoires basses ................................................................................................................................................. 215

    035 Pleursies infectieuses ................................................................................................................................................................... 241

    036 Diarrhes infectieuses .................................................................................................................................................................... 247

    037 Infections et toxi-infections dorigine alimentaire ........................................................................................................ 260

    038 Douleurs abdominales fbriles ................................................................................................................................................. 266

    039 Ascites infectieuses ......................................................................................................................................................................... 273

    040 Ictres fbriles ..................................................................................................................................................................................... 276

    041 Infections urinaires communautaires ................................................................................................................................... 280

    042 pidmiologie des IST ................................................................................................................................................................... 286

    043 coulement urtral chez lhomme .......................................................................................................................................... 289

    044 coulement vaginal .......................................................................................................................................................................... 295

    045 Ulcrations gnitales ...................................................................................................................................................................... 300

    046 Infections pelviennes chez la femme .................................................................................................................................... 310

    047 Pricardites aigus ............................................................................................................................................................................ 315

    048 Myocardites .......................................................................................................................................................................................... 320

    049 Endocardites infectieuses ........................................................................................................................................................... 323

    050 Mningites ............................................................................................................................................................................................. 332

    051 Mningo-encphalites ................................................................................................................................................................... 345

    052 Infections oculaires .......................................................................................................................................................................... 350

    053 Infections par inoculation, morsures (hors rage et envenimations) ................................................................. 364

    054 Envenimations ..................................................................................................................................................................................... 368

    055 Infections de la peau et des tissus mous .......................................................................................................................... 382

    056 Infections osto-articulaires ...................................................................................................................................................... 409

    057 Interprtation de la numration sanguine. Hyperosinophilie. Syndrome mononuclosique ......... 418

    Partie 4. Maladies058 Tuberculose .......................................................................................................................................................................................... 427

    059 Lpre ......................................................................................................................................................................................................... 439

    060 Ulcre de Buruli, infection Mycobacterium ulcerans ............................................................................................ 447

    061 Trponmatoses endmiques .................................................................................................................................................. 454

    062 Streptococcies et rhumatisme articulaire aigu .............................................................................................................. 458

    063 Staphylococcies ................................................................................................................................................................................ 462

    064 Ttanos .................................................................................................................................................................................................... 468

    065 Diphtrie ................................................................................................................................................................................................... 476

    066 Coqueluche ........................................................................................................................................................................................... 487

    067 Fivre typhode ................................................................................................................................................................................... 492

    068 Salmonelloses non typhiques ................................................................................................................................................... 497

    069 Listriose ................................................................................................................................................................................................ 500

    070 Infection Helicobacter pylori .................................................................................................................................................. 504

    071 Shigelloses ............................................................................................................................................................................................. 511

  • 5 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales

    072 Cholra ...................................................................................................................................................................................................... 514

    073 Peste ........................................................................................................................................................................................................... 518

    074 Charbon ................................................................................................................................................................................................... 522

    075 Brucellose .............................................................................................................................................................................................. 527

    076 Leptospiroses ...................................................................................................................................................................................... 532

    077 Fivres rcurrentes .......................................................................................................................................................................... 537

    078 Rickettsioses ........................................................................................................................................................................................ 544

    079 Fivre Q .................................................................................................................................................................................................... 554

    080 Bartonelloses ....................................................................................................................................................................................... 560

    081 Morve ........................................................................................................................................................................................................ 567

    082 Mliodose .............................................................................................................................................................................................. 570

    083 Actinomycoses - Nocardioses ................................................................................................................................................. 575

    084 Infection par le VIH et SIDA ........................................................................................................................................................ 580

    085 Infection par HTLV ............................................................................................................................................................................ 628

    086 Hpatites virales ................................................................................................................................................................................ 630

    087 Infections par les entrovirus .................................................................................................................................................... 644

    088 Viroses respiratoires ........................................................................................................................................................................ 655

    089 Herps (HSV-1, HSV-2) .................................................................................................................................................................. 669

    090 Varicelle, zona ...................................................................................................................................................................................... 673

    091 Infections par le CMV et lEBV .................................................................................................................................................. 677

    092 Poxviroses ............................................................................................................................................................................................. 684

    093 Infections par les papillomavirus (HPV) .............................................................................................................................. 690

    094 Arboviroses ........................................................................................................................................................................................... 696

    095 Infections par les Filovirus, les Arenavirus et les Hantavirus ............................................................................... 723

    096 Rage ........................................................................................................................................................................................................... 734

    097 Paludisme ................................................................................................................................................................................................ 740

    098 Parasitoses intestinales ................................................................................................................................................................ 756

    099 Amoebose tissulaire ........................................................................................................................................................................ 764

    100 Gale ............................................................................................................................................................................................................ 769

    101 Tungose .................................................................................................................................................................................................... 774

    102 Myiases .................................................................................................................................................................................................... 777

    103 Filarioses ................................................................................................................................................................................................. 783

    104 Bilharzioses ou schistosomoses ............................................................................................................................................. 798

    105 Maladie du sommeil ........................................................................................................................................................................ 808

    106 Trypanosomose amricaine ou maladie de Chagas ................................................................................................... 816

    107 Leishmanioses .................................................................................................................................................................................... 821

    108 Migrations larvaires et impasses parasitaires ................................................................................................................ 833

    109 Distomatoses ....................................................................................................................................................................................... 849

    110 Toxoplasmose ..................................................................................................................................................................................... 853

    111 Mycoses profondes tropicales ................................................................................................................................................. 857

    112 Myctomes ............................................................................................................................................................................................ 888

    113 Teignes ..................................................................................................................................................................................................... 891

  • 6 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales

    Partie 5. Infections selon le terrain114 Infection et grossesse (hors VIH) ............................................................................................................................................ 897

    115 Infections puerprales ................................................................................................................................................................... 903

    116 Infections nonatales ..................................................................................................................................................................... 906

    117 Prise en charge intgre des maladies de lenfance (PCIME) .............................................................................. 912

    118 Infections et drpanocytose ....................................................................................................................................................... 917

    119 Infections et diabte ........................................................................................................................................................................ 923

    120 Infections chez le toxicomane .................................................................................................................................................. 928

    121 Infections chez le neutropnique ............................................................................................................................................ 932

    122 Infections nosocomiales ............................................................................................................................................................... 935

    123 Accidents exposant un risque viral (AEV) ..................................................................................................................... 940

    124 Infections transmises par la transfusion de sang ou de ses drivs .............................................................. 949

    125 Infections tropicales et cancers .............................................................................................................................................. 954

    Index ....................................................................................................................................................................................................................... 958

    Liste et coordonnes des auteurs et co-auteurs ................................................................................ 964

    Collge des universitaires des Maladies Infectieuses et Tropicales (CMIT) ..................................................................................................968

    Cas cliniques en mdecine tropicaleCas N 1

    Cas N 2

    Cas N 3

    Cas N 4

    Cas N 5

    Cas N 6

    Cas N 7

    Cas N 8

    Cas N 9

    Cas N 10

    Cas N 11

    Cas N 12

    Cas N 13

    Cas N 14

    Cas N 15

    Cas N 16

    Cas N 17

    Cas N 18

    Cas N 19

    Cas N 20

    Cas N 21

    Cas N 22

    Cas N 23

    Cas N 24

    Cas N 25

    Cas N 26

    Cas N 27

    Cas N 28

    Cas N 29

    Cas N 30

    Cas N 31

    Cas N 32

    Cas N 33

    Cas N 34

    Cas N 35

    Cas N 36

    Cas N 37

    Cas N 38

    Cas N 39

    Cas N 40

    Cas N 41

    Cas N 42

    Cas N 43

    Cas N 44

    Cas N 45

  • e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales7

    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles

    Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles

    1. DfinitionsLpidmiologie (tableau 1) est ltude de la distribution des maladies et de leurs dterminants dans la popu-lation humaine. Elle permet de connatre lampleur et la distribution des phnomnes morbides, didentifier des facteurs de risque et de mesurer lefficacit des interventions.

    Les maladies transmissibles sont causes par des agents infectieux qui ont la capacit de se transmettre entre individus.

    Tableau 1. Les diffrents domaines dactivit de lpidmiologie

    Epidmiologie descriptive

    Quelle est la distribution dans le temps et dans lespace des problmes de sant au sein dune population et quelles sont les personnes concernes ? Rpondre aux trois questions qui, o et quand permet dmettre des hypothses sur le comment et le pourquoi.

    Epidmiologie analytique

    Existe-t-il un lien entre une exposition (facteur de risque) et la survenue dune maladie ?

    Epidmiologie valuative

    Les actions entreprises pour rsoudre un problme de sant publique ont-elles t efficaces ?

    2. Glossaire des termes courants en pidmiologie (tableau 2)

    Tableau 2. Les principaux termes courants en pidmiologie

    Termes Dfinitions

    Agents infectieux

    Etres vivants (organismes appartenant lune des 4 familles suivantes : bactries, virus, parasites, champignons microscopiques) ou inanims (toxines), dits pathognes car susceptibles dentraner des infections ou des toxi-infections.

    Biais de surveillance

    Toute erreur produisant systmatiquement des estimations suprieures ou infrieures la valeur relle des paramtres tudis. Exemple : les maladies dclaration obligatoire en France ne sont pas systmatiquement notifies et leur frquence relle est ainsi sous-estime.

    Contagion Pntration de lagent pathogne chez un individu rceptif. Terme issu du latin cum (avec) et tangere (toucher), il a pour synonyme contage ou contamination.

    Contagiosit Capacit de lagent pathogne diffuser entre individus rceptifs.

    Echantillon Sous-ensemble de la population tudie. Le choix des units qui constituent le sous-ensemble peut tre effectu par diffrentes mthodes (chantillonnage). On utilise des chantillons parce quune tude approfondie de toute la population serait impossible, trop longue et trop chre pour le niveau de prcision exig.

    Endmie Persistance de cas dune maladie dans un lieu donn pendant une longue priode. Exemples : tuberculose, paludisme.

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles

    Tableau 2. Les principaux termes courants en pidmiologie

    Termes Dfinitions

    Endmo- pidmie

    Persistance de cas dune maladie dans un lieu donn pendant une longue priode avec des pisodes pidmiques. Exemple : mningite mningocoque.

    Epidmie Apparition dun nombre anormalement lev de cas dune maladie, concentrs dans le temps et dans lespace. Exemples : rougeole, chikungunya, grippe.

    Facteur de risque

    Facteur augmentant le risque de maladie. Exemples : promiscuit et rougeole, rapport sexuel non protg et IST

    Facteur protecteur

    Facteur diminuant le risque de maladie. Exemples : vaccination, adduction deau potable.

    Faux ngatif Un rsultat faux ngatif est un test ngatif chez un sujet malade.

    Faux positif Un rsultat faux positif est un test positif chez un sujet non malade.

    Immunit collective

    La vaccination (ou la maladie) dun pourcentage lev de la population lui confre ce que lon appelle limmunit collective ou immunit de groupe. La couverture vaccinale ncessaire pour obtenir une immunit de groupe optimale varie selon la maladie : pour la variole, la diphtrie, la poliomylite, la rubole et les oreillons, le seuil de couverture atteindre pour crer une immunit collective est de 80-85 % ; pour la coqueluche et la rougeole, il est de 90-95 %.

    Incidence Nombre de nouveaux malades dans une population au cours dune priode dtermine (la plupart du temps un an). Elle peut tre exprime sous forme dincidence cumule.

    Incidence cumule

    Rapport entre le nombre de nouveaux cas survenus pendant la priode dobservation et le nombre de personnes en observation et susceptibles de devenir des cas au dbut de la priode. Il sagit dune proportion et dune mesure du risque qui doit toujours tre accompagne de la mention de la dure dobservation. Exemple : 5 nouveaux cas de tuberculose dans une cohorte de 100 patients VIH+ suivis pendant 1 an ; incidence cumule = 5/100 = 5 %

    Incubation (priode d)

    Temps qui scoule entre la pntration de lagent pathogne et lapparition des premiers symptmes de la maladie.

    Indice Fraction dont le numrateur et le dnominateur nappartiennent pas au mme ensemble. Exemple : 100 lves, 10 latrines dans une cole, soit 1 latrine pour 10 lves.

    Pandmie Endmie ou pidmie qui survient dans une zone gographique trs tendue telle quun continent ou la plante entire. Exemple : grippe, infection VIH

    Pouvoir invasif Capacit de multiplication et de diffusion de lagent pathogne dans lorganisme.

    Pouvoir pathogne

    Capacit dun agent infectieux engendrer une maladie

    Prvalence Proportion de personnes prsentant lvnement de sant dans une population donne un moment donn. Elle sexprime en nombre de cas rapport une population.

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles

    Tableau 2. Les principaux termes courants en pidmiologie

    Termes Dfinitions

    Prvention primaire

    Ensemble des mesures visant diminuer lapparition des maladies en rduisant lexposition aux facteurs de risque lorsque cela est possible. Elle tend diminuer lincidence. Exemple : vaccination

    Prvention secondaire

    Ensemble des mesures visant dceler et traiter une maladie infectieuse un stade prcoce, pour influencer favorablement le pronostic du malade et rduire la transmission dans son entourage. Exemple : traitement prcoce et mesures disolement du malade.

    Prvention tertiaire

    Ensemble des mesures (interventions auprs du patient qui prsente des symptmes) visant rduire les consquences ultrieures de la maladie.

    Proportion Rapport de deux quantits appartenant au mme ensemble et dans lequel le numrateur est inclus dans le dnominateur. Exemple : groupe de 50 filles et 100 garons. Proportion de filles dans le groupe = 50/(50+100) = 33 %

    Rapport Expression la plus gnrale de la relation entre deux quantits qui peuvent indiffremment appartenir ou non au mme ensemble.

    Ratio Rapport dans lequel le numrateur et le dnominateur appartiennent au mme ensemble, mais o le numrateur nest pas inclus dans le dnominateur. Exemple : groupe de 50 filles et 100 garons. Ratio de masculinit (sex-ratio) garons/filles dans le groupe = 100/50 = 2

    Rservoir de germe

    Endroit o lagent pathogne infectieux se multiplie et se maintient. Les diffrents rservoirs sont lhomme, lanimal et lenvironnement (eau, air, sol et surfaces).

    Risque Probabilit de survenue dun vnement de sant durant une priode donne. Il est gnralement mesur par lincidence.

    Sensibilit Probabilit que le rsultat dun test diagnostique soit positif chez un individu malade. Autrement dit, cest la proportion de patients rellement malades dans la population qui prsente un rsultat positif pour le test utilis (par rapport lensemble des personnes malades). Un test ayant une sensibilit leve dtecte un nombre lev dindividus vritablement malades, donc peu de faux ngatifs.

    Spcificit Probabilit que le rsultat dun test diagnostique soit ngatif chez un individu non malade. Autrement dit, cest la proportion de personnes qui nont pas la maladie dans une population et qui prsentent un rsultat ngatif pour le test utilis (par rapport lensemble des personnes qui nont pas la maladie). Un test ayant une spcificit leve donne peu de faux positifs.

    Stratgie dlimination

    Vise rduire zro cas lincidence de la maladie, sans parvenir faire disparatre la prsence de lagent pathogne. Exemple : ttanos

    Stratgie dradication

    Vise rduire zro cas lincidence de la maladie et faire disparatre la prsence de lagent pathogne. Lradication ne peut tre envisage que si le rservoir du germe est strictement humain. Exemples : variole radique en 1980 ; poliomylite et dracunculose en voie dradication mondiale.

    Stratgie de contrle

    Vise rduire le nombre de cas et de dcs de telle sorte que la maladie ne soit plus un problme de sant publique majeur. Exemple : paludisme.

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles

    Tableau 2. Les principaux termes courants en pidmiologie

    Termes Dfinitions

    Surveillance pidmiologique

    Collecte continue et systmatique, analyse et interprtation de donnes de sant essentielles pour la planification, la mise en place et lvaluation des pratiques en sant publique, troitement associe la diffusion en temps opportun de ces donnes ceux qui en ont besoin. Ltape finale du cycle de la surveillance est lapplication de ces donnes au contrle et la prvention des maladies.

    Taux Rapport constitu dun numrateur reprsent par le nombre dindividus porteurs dun attribut ou prsentant un vnement dans une population (dnominateur) susceptible de prsenter cet attribut ou cet vnement, en gnral un moment ou durant une priode donne. Cest donc un rapport qui mesure la vitesse de survenue dun vnement dans une population.

    Taux dattaque Proportion des personnes malades par rapport aux personnes exposes un facteur de risque reconnu. Il sagit dune mesure dincidence cumule utilise surtout au cours des pidmies.

    Taux de ltalit Proportion de cas fatals lis une maladie spcifique dans une population. Il sagit dun indicateur de gravit de la maladie. Il est calcul en divisant le nombre de dcs causs par la maladie pendant une certaine priode de temps par le nombre de patients affects par la maladie durant cette mme priode.

    Taux de mortalit

    Mesure de la frquence de dcs dans une population. Il est calcul en divisant le nombre de dcs pour une priode donne dans une population risque.

    Valeur prdictive ngative

    Probabilit quune personne ayant obtenu un rsultat ngatif lors dun examen diagnostique ne soit pas malade.

    Valeur prdictive positive

    Probabilit quune personne ayant obtenu un rsultat positif lors dun examen diagnostique soit rellement malade.

    Sites web recommands concernant ce chapitre :

    Roch Giorgi, Dfinitions de termes couramment utiliss en pidmiologie et en recherche mdicale. LERTIM, Facult de Mdecine, Universit de la Mditerranehttp://cybertim.timone.univ-mrs.fr/Members/rgiorgi/DossierPublic/Enseignement/

    Rseau francophone en sant publique http://www.universante.org/glossaire.php).

    BDSP. Banque de Donnes en Sant Publique. Glossaire multilinguehttp://asp.bdsp.ehesp.fr/Glossaire/

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    Transmission des infections

    Transmission des infections

    La transmission dune maladie infectieuse peut se faire selon deux modes : - en dehors dun milieu de soins : infections communautaires ; - en milieu de soins : infections nosocomiales.

    Lagent infectieux (bactrie, virus, parasite, champignon) peut contaminer lhomme partir de rservoirs: - milieu naturel : sol (ex : Clostridium tetani), eau (ex : Vibrio cholerae) ou air (ex : Histoplasma capsulatum) ; - animal (zoonose, ex : virus de la rage) ou homme (ex : Myxovirus influenzae) malade ou porteur sain ; - sang, produits drivs du sang ou greffons contamins (ex : VIH) ; - matriel mdical contamin (ex : VHB).

    La pntration de lagent pathogne dans lorganisme se fait par diffrentes voies (tableau 1).

    Un agent pathogne peut utiliser plusieurs voies de transmission. Par exemple, les fivres hmorragiques africaines peuvent se transmettre par contact troit avec un patient, par voie arienne (arosol), transconjonctivale ou parentrale. Elles peuvent tre communautaires ou nosocomiales. Leur trs haute contagiosit justifie des mesures disolement, de transport et danalyse des prlvements stricts ainsi quune protection renforce du personnel soignant.

    La comprhension du mode de transmission des infections permet de proposer des mesures de protection individuelles et collectives adaptes la population rceptive, aux malades et au personnel soignant.

    Les maladies hautement contagieuses ou risque dentraner des pidmies ncessitent un signalement aux autorits de sant locales et internationales selon les recommandations du Rglement Sani-taire International (RSI) (voir le lien en fin de chapitre) afin de mettre en route des mesures de protection collectives. La quarantaine est lisolement de personnes ou danimaux suspects dtre porteurs dagents infectieux transmissibles une population rceptrice. Sa dure est fonction du temps dincubation propre la maladie et elle doit respecter les droits des personnes.

    Lisolement septique (figure 1) dun patient infect (malade, porteur sain ou suspect de contagiosit) vise viter quil ne transmette lagent infectieux des individus non infects et non porteurs mais rceptifs (tableau 1). Il est distinguer de lisolement protecteur (figure 1) qui vise protger des patients immu-nodprims de tout agent potentiellement infectieux (voir le chapitre Infections chez le neutropnique ).

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    Transmission des infections

    Tableau 1. Voies de transmission des maladies infectieuses et mesures de prvention

    Voie de transmission

    Exemples de maladies infectieuses

    Mesures de prvention concernant la population et/ou le personnel soignant

    Mesures de prvention concernant les malades

    Arienne: arosols gouttelettes de salive spores

    Tuberculose, peste pulmonaire, mningite crbrospinale, diphtrie, coqueluche, fivreQ, lgionellose, nocardiose, lpre, SRAS, rougeole, grippe, varicelle, infection rhinovirus, adnovirus, EBV, CMV, VRS, Hantavirus; fivres hmorragiques (Arenaviridae), pneumocystose, aspergillose, cryptococcose, cocidiodomycose, histoplasmose, rhinosporidiose.

    Population : port de masque, hygine des mains, dpistage des sources de contamination, dpistage et traitement des porteurs, chimioprophylaxie, vaccination.

    Soignants : hygine des mains, gants, masques, blouses, lunettes de protection.

    Eviction.

    Port de masque jusqu larrt de la transmission.

    Isolement en chambre individuelle ventile ou pression ngative.

    Strilisation, incinration des excrta et des dchets dactivit de soins risques infectieux (DASRI).

    Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.

    Digestive Salmonelloses, shigellose, yersiniose, infection Campylobacter spp., cholra, brucellose, botulisme, listriose, E.coli entropathognes, H.pylori, C.difficile, VHA, VHE, rotavirus, astrovirus, calicivirus, coronavirus, virus ECHO et coxsackies; poliomylite, ambose, giardiose, ascaridiose, trichocphalose, oxyurose, tniasis, distomatoses, cysticercose, trichinose, dracunculose, cryptosporidiose, microsporidioses, isosporose.

    Population : hygine individuelle et collective pour la prparation et la conservation des aliments, cuisson des aliments, eau potable, tout lgout, recherche et traitement des porteurs sains, recherche et viction des sources de contaminations collectives : production, conservation, distribution, commercialisation.

    Soignants : port de gants, friction hydro-alcoolique des mains

    Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.

    Eviction.

    Strilisation, incinration des excrta et des dchets dactivit de soins risques infectieux (DASRI).

    Sexuelle Syphilis, gonococcie, chlamydioses gnitales, mycoplasmoses, chancre mou, donovanose, infection VIH, HPV, herps.

    Utilisation de prservatifs masculins et fminins, vaccination.

    Utilisation de prservatifs jusqu la gurison.

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    Transmission des infections

    Tableau 1. Voies de transmission des maladies infectieuses et mesures de prvention

    Voie de transmission

    Exemples de maladies infectieuses

    Mesures de prvention concernant la population et/ou le personnel soignant

    Mesures de prvention concernant les malades

    Verticale (mre-enfant)

    Syphilis, bactrimies, rubole, infection VHB, VIH, CMV, HSV, parvovirus B19, listriose, toxoplasmose, maladie de Chagas, paludisme.

    Vaccination des femmes en ge de procrer, immunothrapie, dpistage et traitement prcoce chez la femme enceinte.

    Parentrale Syphilis, infections VHB, VHC, VIH, HTLV, CMV, fivres hmorragiques, maladie de Chagas, paludisme.

    Dpistage chez les donneurs de sang et dorganes.

    Soignants : port de gants, mesures spcifiques fivres hmorragiques et accidents dexposition au sang (AES) .

    Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.

    Transcutane, conjonctivale

    Leptospirose, tularmie, anguillulose, ankylostomose, bilharzioses, maladie de Chagas, fivres hmorragiques.

    Protection individuelle mcanique ou chimique.

    Soignants : mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.

    Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.

    Inoculation Ttanos, tularmie, rouget du porc, pasteurellose, haverillose, Sodoku, charbon, mliodose, maladie des griffes du chat, rage, hantaviroses, fivres hmorragiques (Filoviridae), Orf, nodule des trayeurs, sporotrichose, myctomes, lobomycose, blastomycose.

    Traitement prcoce des plaies, vaccination post-exposition en cas de morsure par un mammifre (rage).

    Soignants : mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.

    Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.

    Vectorielle Peste, rickettsioses, typhus des broussailles, borrlioses, bartonelloses, arboviroses, paludisme, filarioses lymphatiques, onchocercose, loose, trypanosomose africaine, maladie de Chagas, babsiose.

    Protection antivectorielle individuelle: moustiquaires, rpulsifs, insecticides.

    Lutte antivectorielle collective.

    Isolement des malades des vecteurs de la maladie en zone dendmie (moustiquaire).

    Nosocomiale Infections entrobactries, S.aureus, P.aeruginosa, C.difficile, fivres hmorragiques.

    Voir le chapitre infections iatrognes et nosocomiales .

    Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    Transmission des infections

    Figure 1. Mesures disolement

    Isolement protecteur : mesures avant lentre dans la chambre dun malade immunodprim

    Isolement septique : - entrique - contact - respiratoire (air)mesures avant la sortie de la chambre dun malade contagieux, dun porteur sain ou dun sujet suspect de contagiosit

    Site web recommand concernant ce chapitre :

    Rglement Sanitaire International OMS :http://www.who.int/ihr/fr/index.html

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    Complexe pathogne tropicalCe complexe, individualis par le gographe Maximilien Sorre en 1933, correspond : - un espace gographique dtermin ; - un facteur de risque spcifique (exemple : agent infectieux + vecteur + hte rservoir) ; - la prsence dindividus rceptifs.

    Dans cette situation, des conditions favorisantes impriment un profil pidmiologique particulier laffection en cause : pidmie, endmie, endmo-pidmie, sporadicit.

    Le complexe pathogne envisage la totalit des grands dterminants de la sant : biologique, environne-mental (facteurs humains, conomiques, socio-culturels, techniques), comportemental et le systme de soins.

    La trypanosomose humaine africaine illustre bien cet exemple. Lespace de risque est dtermin par la distribution des glossines.

    Pour la trypanosomose Trypanosoma gambiense, lhte-rceptif et lhte-rservoir se confondent : cest lhomme. La morbidit ne peut sexprimer que sil existe des gtes adapts aux glossines (ombre, chaleur et humidit), des aires dattaque (clairires, champs, routes, pistes, voies fluviales), une densit et une rgularit de frquentation de ces aires par les hommes. Ces conditions sont rparties de manire trs htrogne. Il en rsulte une irrgularit de rpartition des foyers de trypanosomoses au sein de laire de distribution des glossines. Les modifications anthropiques, telles que la dforestation, le dveloppement de lagriculture et les migrations de populations, favorisent lclosion de nouveaux foyers si les migrants proviennent dun foyer connu et actif et importent lagent pathogne. Il existe donc une smiologie com-munautaire qui doit tre reconnue. Il faut tenir compte de lenvironnement physique et humain, au mme titre que de la smiologie clinique. La connaissance de la clinique va permettre de concevoir des soins complets et la smiologie communautaire de faire en sorte quils soient adapts et surtout continus. Il serait vain, en effet, de soigner correctement un trypanosom pour le renvoyer par la suite sexposer aux risques identiques dans son environnement. Il serait thiquement inacceptable de ne pas se proccuper de lensemble des personnes exposes aux mmes risques. La dcouverte dun cas de trypanosomose peut ventuellement conduire la dcouverte dun nouveau foyer endmique ou pidmique.

    A linverse, dans le cas de la trypanosomose est-africaine Trypanosoma rhodesiense, le rservoir est constitu danimaux sauvages dont la rpartition gographique varie selon les migrations et donc sans relle notion de foyers humains. De plus, la maladie chez lhomme frappe plutt les personnes pntrant activement dans lcosystme naturel des glossines et a alors une volution dfavorable bien plus rapide que pour lespce ouest-africaine. Le complexe pathogne tropical est donc radicalement diffrent pour ces deux trypanosomoses humaines africaines.

    La prise en compte du complexe pathogne a donc plusieurs intrts : - il constitue une contribution lapproche diagnostique ; - il sensibilise la notion que toute pathologie, ft-elle infectieuse, est toujours multifactorielle et, par corollaire, que sa solution ncessite la prise en charge des diffrents facteurs.

    Elle permet de mieux concevoir la vulnrabilit relle la maladie. Chacun des facteurs de linfection a en effet son poids et la ngligence de certains dentre eux peut compromettre la gurison de lindividu et la scurit de lensemble de la communaut. Elle contraint la vigilance et la veille pidmiologique, permettant de dtecter, dune manire prcoce, les situations pidmiques et, ventuellement, lmer-gence de nouveaux agents pathognes.

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    Si le caractre multifactoriel de la trypanosomose apparat vident, il lest moins pour dautres affections transmission directe, par exemple la tuberculose. Et pourtant, lvolution de la mortalit de cette maladie dans le temps montre lvidence que la diminution de lincidence de cette mortalit a t influence autant par llvation du niveau de vie que par lavnement des antibiotiques antituberculeux. Malgr ceux-ci et leur large diffusion, laugmentation du nombre de personnes au-dessous du seuil de pauvret, dune part, et lapparition dune autre pidmie, en loccurrence celle du VIH-SIDA, dautre part, sont responsables de la recrudescence de la maladie. En 2010, la mortalit de la tuberculose tait estime 1,4 millions de per-sonnes par an. Cette frquence pourrait crotre dans les dcennies qui viennent si des mesures volontaristes et efficaces ne sont pas prises pour lutter contre ces deux facteurs majeurs de morbidit et de mortalit.

    Envisager le complexe pathogne devient une exigence diagnostique et pronostique tant en mdecine indi-viduelle quen mdecine communautaire ou des collectivits, soit en urgence (mdecine des catastrophes), soit en dveloppement durable.

    Lors dune dmarche diagnostique, la connaissance physiologique de lindividu (qui), de ses activits et son comportement (a fait quoi), de ses lieux de vie et de sjour (o), des temps dexposition au risque (quand), de ses contacts humains (avec qui) sont des lments indispensables et souvent clairants permettant de hirarchiser les hypothses et de choisir les examens complmentaires adapts. La connaissance de lenvironnement ainsi dfini conditionne aussi toute demande prventive.

    En sant collective, la mesure du risque dans le cadre du complexe pathogne est de plus en plus prcise grce : - une meilleure typologie des dterminants de la sant (indicateurs) ; - les progrs de lpidmiologie fondamentale ; - la puissance (et les effets secondaires) des services de soins ; - une approche plus prcise de la vulnrabilit (technique, conomique, culturelle) des facteurs de risque.

    Lintrt denvisager le complexe pathogne permet danticiper des risques sanitaires devant : - la rapidit des transformations anthropiques (amnagements hydro-agricoles, dforestation, urbanisation); - lampleur des mouvements migratoires (mondialisation de certaines maladies) ; - lapparition de nouvelles niches cologiques (mergence) ; - les changements climatiques ; - les nouveaux comportements (marginalisation, violence urbaine, addictions).

    Les tableaux 1 12 prsentent les principales pathologies infectieuses endmiques ou pidmiques dans les grandes rgions tropicales ou subtropicales. En caractres gras sont mentionnes les pathologies particulirement frquentes dans ces rgions. Etant donn quil sagit de donnes macro-pidmiolo-giques sur de vastes surfaces continentales, il est indispensable de confirmer linformation sur la prsence de lagent pathogne lchelon du pays ou dune rgion en se rfrant au chapitre spcifique ou une source de donnes sanitaires fiables : sites de lOMS, des CDC Les agents pathognes ou infections plus spcifiques dune zone continentale sont indiqus en gras titre indicatif.

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    Tableau 1. Afrique du Nord

    Bactries Virus Parasites Champignons

    TuberculoseLpre

    Syphilis

    StreptococciesPneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhodeSalmonelloses non typhiques

    Listriose

    Helicobacter pylori

    Shigelloses

    Brucellose

    Charbon

    Borreliose rcurrente

    Cholra

    Leptospirose

    Rickettsioses

    Fivre Q

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDA

    Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS, SRAS,

    Herps Varicelle, zona

    CMV, EBV

    Poxviroses

    Papillomaviroses

    West-Nile, phlbovirus

    Rage

    Paludisme (P. vivax)ProtozoosesHelminthoses digestives

    AmboseGale

    Myiases

    Leishmaniose cutane

    Leishmaniose viscraleHydatidoseFascioloses

    Toxoplasmose

    Bilharziose (Egypte)

    Cryptococcose

    Blastomycose

    TeignesEpidermomycoses

    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

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    Tableau 2. Afrique de lOuest

    Bactries Virus Parasites Champignons

    TuberculoseLpre

    Ulcre de BuruliSyphilisTrponmatoses endmiques

    Streptococcies Pneumococcies

    StaphylococciesMningocoqueTtanosDiphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhodeSalmonelloses non typhiquesListriose

    Helicobacter pylori

    ShigellosesCholra

    Charbon

    Brucellose

    Leptospirose

    Borrliose rcurrente tique

    Nocardiose et actinomycoses

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDAInfection par HTLVHpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS, Herps

    Varicelle, zona

    CMV, EBV

    Papillomaviroses

    Fivre jauneDengue,

    Chikungunya

    Virus de Lassa

    Crime-Congo

    Fivre de la valle du Rift

    Hantavirus

    Rage

    PaludismeAmboseAutres protozooses digestivesHelminthoses intestinalesBilharziosesDracunculose

    Filarioses

    GaleTungose

    Myiases

    Trypanosomose humaine africaine

    Leishmanioses cutanes Leishmaniose viscrale

    Hydatidose, cysticercose, cnurose

    Fascioloses

    Toxoplasmose

    Pentastomose

    Histoplasmoses Cryptococcose

    Basidiobolose

    Myctomes

    Teignes

    Epidermomycoses

    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    3

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    Tableau 3. Afrique centrale

    Bactries Virus Parasites Champignons

    TuberculoseLpre

    Ulcre de Buruli

    SyphilisTrponmatoses endmiques

    Streptococcies

    Mningocoque Pneumococcies

    Staphylococcies

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhode

    Salmonelloses non typhiques

    Listriose

    Helicobacter pylori

    Shigelloses

    CholraPesteCharbon

    Brucellose

    Leptospirose

    Borrlioses

    Rickettsioses

    Fivre Q

    Nocardiose et actinomycoses

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDAInfection par HTLV

    Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS, SRAS

    Herps (HSV-1, HSV-2)

    Varicelle, zona

    CMV, EBV

    Papillomaviroses

    Fivre jauneChikungunya, ONyong Nyong, dengue, phlebovirus

    Ebola, Marburg, fivre de la valle du Rift

    Hantavirus

    MonkeypoxRage

    PaludismeProtozooses HelminthosesAmbose

    Gale, tungoseMyiases

    Filarioses lymphatiques, onchocercose, loase

    BilharziosesMaladie du sommeilLeishmanioses cutanes

    Leishmaniose viscrale

    Hydatidose, cysticercose

    Distomatoses

    Toxoplasmose

    Histoplasmoses

    Cryptococcose

    Blastomycose

    Chromomycose

    Basidiobolose

    Sporotichose

    Entomophtorose

    Teignes

    Epidermomycoses

    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    3

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    Tableau 4. Afrique de lEst, Madagascar

    Bactries Virus Parasites Champignons

    TuberculoseLpre

    Syphilis

    Trponmatoses endmiques

    Streptococcies Pneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhode

    Salmonelloses non typhiques

    Listriose

    Helicobacter pylori

    Shigelloses

    CholraPesteCharbon

    Brucellose

    Leptospirose

    Borrlioses

    Rickettsioses

    Fivre Q

    Nocardiose et actinomycoses

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDAInfection par HTLV

    Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS,Herps (HSV-1, HSV-2)

    Varicelle, zona

    CMV, EBV

    Poxviroses

    Papillomaviroses

    Fivre jaune (voir carte au chapitre Arboviroses)

    Dengue, West-Nile, phlebovirus, Chikungunya

    Fivre de la valle du Rift, Crime-Congo

    Hantavirus

    Rage

    PaludismeProtozoosesHelminthosesAmboseGaleTungose

    Myiases

    Filarioses lymphatiques, onchocercose

    Dracunculose

    BilharziosesMaladie du sommeil

    Leishmanioses cutanes et viscrales

    Hydatidose, cysticercose

    Distomatoses

    Toxoplasmose

    Histoplasmoses

    Cryptococcose Sporotichose

    Chromomycose

    Blastomycose

    Basidiobolose

    Entomophtorose

    MyctomesTeignes

    Epidermomycoses

    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    3

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    Tableau 5. Afrique australe

    Bactries Virus Parasites Champignons

    TuberculoseLpre

    Ulcre de Buruli

    Syphilis

    Trponmatoses endmiques

    Streptococcies Pneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhode

    Salmonelloses non typhiques

    Listriose

    Helicobacter pylori

    Shigelloses

    Cholra

    Peste

    Charbon

    Brucellose

    Leptospirose

    Borrlioses

    Rickettsiose africaine tiques, typhus exanthmatiqueFivre Q

    Nocardiose et actinomycoses

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDAInfection par HTLV

    Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS,

    Herps (HSV-1, HSV-2)

    Varicelle, zona

    CMV, EBV

    Poxviroses

    Papillomaviroses

    Fivre jaune (voir carte au chapitre Arboviroses ), dengue, Chikungunya

    Marburg, fivre de la valle du Rift

    Hantavirus

    Rage

    PaludismeProtozooses

    Helminthoses

    Ambose

    Maladie du sommeil

    GaleMyiases

    Filarioses

    BilharziosesLeishmanioses cutanes et viscrales

    Hydatidose, cysticercose

    Distomatoses

    Toxoplasmose

    Histoplasmoses, Cryptococcose, Sporotichose

    Blastomycose

    MyctomesTeignesEpidermomycoses

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    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

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    Tableau 6. Moyen-Orient

    Bactries Virus Parasites Champignons

    Tuberculose

    Lpre

    Ulcre de Buruli

    Syphilis

    Trponmatoses endmiques

    Streptococcies Pneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhode

    Salmonelloses non typhiques

    Listriose

    Infection par Helicobacter pylori

    Shigelloses

    Cholra

    Tularmie

    Charbon

    Brucellose

    Leptospirose

    Borrlioses

    Rickettsioses

    Fivre Q

    Mliodose

    Nocardiose et actinomycoses

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDA

    Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS,

    Herps (HSV-1, HSV-2)

    Varicelle, zona

    CMV, EBV

    Poxviroses

    Papillomaviroses

    Crime-Congo, phlbovirus

    Hantavirus

    Rage

    Paludisme (prdominance P.vivax)

    Protozooses

    Helminthoses

    AmboseGale

    Onchocercose (Ymen)

    Bilharzioses

    Leishmaniose cutane et viscraleHydatidose, cysticercose

    Distomatoses

    Toxoplasmose

    Cryptococcose

    Blastomycose

    TeignesEpidermomycoses

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    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    Tableau 7. Pninsule indienne

    Bactries Virus Parasites Champignons

    TuberculoseLpre

    Syphilis

    Trponmatoses endmiques

    Streptococcies Pneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhodeSalmonelloses non typhiquesListriose

    Helicobacter pylori

    Shigelloses

    Cholra

    Peste

    Charbon

    BrucelloseLeptospirose

    Borrlioses

    Rickettsioses

    Fivre Q

    Mliodose

    Nocardiose et actinomycoses

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDAInfection par HTLV

    Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS,

    Herps (HSV-1, HSV-2)

    Varicelle, zona

    CMV, EBV

    Papillomaviroses

    Dengue, Chikungunya, Kyasanur, encphalite japonaise, virus Nipah

    Crime-Congo

    Hantavirus

    Rage

    PaludismeBabsioses

    Protozooses : giardioseHelminthoses

    AmboseGale, tungose

    Myiases

    Filarioses lymphatiques

    Bilharzioses

    Dracunculose

    Leishmanioses cutanes

    Leishmaniose viscraleHydatidose, cysticercose

    Distomatoses

    Capillariose

    Dirofilariose

    Toxoplasmose

    Histoplasmose amricaine Cryptococcose

    Pnicilliose

    Basidiobolose

    Myctomes

    Teignes

    Epidermomycoses

    3

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    Tableau 8. Sud-est asiatique

    Bactries Virus Parasites Champignons

    TuberculoseLpreUlcre de Buruli (Indonsie)

    Syphilis

    Trponmatoses endmiques

    Streptococcies Pneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhodeSalmonelloses non typhiquesListriose

    Helicobacter pylori

    ShigellosesCholraPeste

    Charbon

    Brucellose

    LeptospiroseBorrlioses

    Rickettsioses

    Fivre Q

    Mliodose

    Nocardiose et actinomycoses

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDAInfection par HTLV

    Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS,

    Herps (HSV-1, HSV-2)

    Varicelle, zona

    CMV, EBV

    Poxviroses

    Papillomaviroses

    Dengue, Chikungunya, Kyasanur, encphalite japonaise, virus Nipah

    Crime-Congo

    Hantavirus

    Rage

    PaludismeBabsioses

    Protozooses : giardioseHelminthoses

    AmboseGale

    Tungose

    Myiases

    Filarioses lymphatiquesBilharzioses

    Dracunculose

    Leishmanioses cutanes

    Leishmaniose viscraleHydatidose, cysticercose

    Distomatoses

    Capillariose

    Dirofilariose

    Toxoplasmose

    Histoplasmose amricaine

    Cryptococcose

    Pnicilliose

    Basidiobolose

    Myctomes

    Teignes

    Epidermomycoses

    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    3

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    Tableau 9. Amrique andine

    Bactries Virus Parasites Champignons

    Tuberculose

    Lpre

    Ulcre de Buruli

    Syphilis

    Trponmatoses endmiques

    Streptococcies

    Pneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhode

    Salmonelloses non typhiques

    Listriose

    Helicobacter pylori

    Shigelloses

    Cholra

    Peste

    Charbon

    Brucellose

    Leptospirose

    Borrlioses

    Rickettsioses

    BartonellosesMliodose

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDA

    Infection par HTLV

    Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS,

    Herps, varicelle, zona

    CMV, EBV

    Poxviroses

    Papillomaviroses

    Fivre jaune, dengue,

    Encphalite Saint-Louis, Oropouche, encphalite quine vnzulienne, Mayaro

    Hantavirus

    Rage

    Paludisme (selon altitude)

    Protozooses

    helminthoses

    Ambose

    Gale

    Tungose

    Myiases

    Maladie de ChagasLeishmanioses cutanes, cutano-muqueuses et viscrales

    DistomatosesToxoplasmose

    Histoplasmose amricaine

    Cryptococcose

    Sporotrichose

    Paracoccidiodomy-cose

    Chromomycose

    Teignes

    Epidermomycoses

    3

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    Tableau 10. Bassin amazonien

    Bactries Virus Parasites Champignons

    TuberculoseLpre

    Ulcre de Buruli

    Syphilis

    Trponmatoses endmiques

    Streptococcies

    Pneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhode

    Salmonelloses non typhiques

    Listriose

    Helicobacter pylori

    Shigelloses

    Cholra

    Peste

    Charbon

    Brucellose

    LeptospiroseBorrlioses

    Rickettsioses

    Fivre Q

    Bartonelloses

    MliodoseGonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    Donovanose

    VIH-SIDAInfection par HTLV

    Hpatites virales

    Poliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS,

    Herps, varicelle, zona

    CMV, EBV

    Poxviroses

    Papillomaviroses

    Fivre jaune, dengue, encphalite Saint-Louis, Oropouche, encphalite quine vnzulienne, Mayaro

    Hantavirus

    Rage

    PaludismeProtozooses

    Helminthoses

    Ambose

    Gale

    Tungose

    Myiases

    Maladie de ChagasLeishmanioses cutanes, cutano-muqueuses et viscrales

    DistomatosesToxoplasmose notropicaleCryptosporidiose

    Histoplasmose amricaine

    Cryptococcose

    Sporotichose

    Lobomycose

    Basidiobolose

    Chromomycose

    Paracoccidiodomy-cose

    Teignes

    Epidermomycoses

    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    3

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    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    Tableau 11. Amrique centrale et Carabes

    Bactries Virus Parasites Champignons

    Tuberculose

    Lpre

    Syphilis

    Trponmatoses endmiques

    Streptococcies Pneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhode

    Salmonelloses non typhiques

    Listriose

    Helicobacter pylori

    Shigelloses

    Cholra

    Brucellose

    Leptospirose

    Borrlioses

    Rickettsioses, typhus exanthmatique

    Fivre Q

    Gonococcie

    Chancre mou

    Chlamydioses

    VIH-SIDA

    Infection par HTLV

    Hpatites virales

    Poliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS,

    Herps, varicelle, zona

    CMV, EBV

    Papillomaviroses

    Dengue, Encphalite quine vnzulienne,

    Hantavirus

    Rage

    Paludisme (surtout P.vivax)Protozooses

    Helminthoses

    Ambose

    Gale

    Tungose

    Myiases

    Maladie de Chagas

    Leishmanioses cutanes, cutano-muqueuses et viscrales

    Angiostrongylose

    Histoplasmose amricaineCryptococcose

    Sporotichose

    Lobomycose

    Coccidiodomycose

    Paracoccidiodomy-cose

    Basidiobolose

    Myctomes

    Teignes

    3

  • e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales28

    Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale

    pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique

    Tableau 12. Pacifique sud

    Bactries Virus Parasites Champignons

    Tuberculose

    Lpre

    Syphilis

    StreptococciesPneumococcies

    Staphylococcies

    Mningocoque

    Ttanos

    Diphtrie

    Coqueluche

    Fivre typhode

    Salmonelloses non typhiques

    Helicobacter pylori

    Shigelloses

    Brucellose

    Leptospirose

    Mliodose

    VIH-SIDA

    Infection par HTLV

    Hpatites virales

    Poliomylite, coxsackie, ECHO

    Rougeole, grippe, VRS,

    Herps

    Varicelle, zona

    CMV, EBV

    Papillomaviroses

    Dengue, Ross River (Australie)

    Hantavirus

    Rage

    Paludisme

    Protozooses

    Helminthoses

    Ambose

    Gale

    Myiases

    Filarioses lymphatiquesLeishmanioses cutanes

    Angiostrongylose

    Histoplasmose amricaine

    Cryptococcose

    Sporotichose

    Teignes

    Sites web recommands concernant ce chapitre :

    OMS :http://www.who.int/ith

    CDC :http://www.cdc.gov/fre/

    3

  • e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales29

    Risques infectieux des voyages et des migrations entre pays tropicaux

    1. Historique et typologie des migrations ; importance des migrations intertropicales

    Les migrations humaines au cours de lhistoire ont t permanentes. Elles ont commenc ds le dbut de lhumanit puisque, partir de son berceau (probablement) de la valle du Rift, nos anctres dil y a 3 4mil-lions dannes se sont lentement dplacs vers le nord pour rejoindre les diffrents continents actuels. Lhis-toire plus rcente a galement connu des vagues de migrations massives : la fin de lempire romain puis les croisades au Moyen Age ont dplac des milliers de personnes travers lEurope et lAsie. Plus rcemment les possibilits de colonisation ont pouss les Europens vers les nouveaux mondes . Plus tard, dans la premire moiti du 20e sicle, des mouvements intra-europens se sont faits partir des pays dEurope du Sud les moins riches vers les plus riches. Parmi toutes les migrations, la plupart du temps forces par les contraintes du moment et rarement dsires, il en est une qui a eu des consquences incalculables dans les zones dorigine et dans les terres daccueil : il sagit de la traite des esclaves qui a entran le dplacement forc de quelques 20 millions de personnes lintrieur du continent africain puis des ctes africaines vers le continent amricain.

    Beaucoup dexperts, et notamment le Haut Commissariat aux Rfugis, pensent que le 21e sicle sera le sicle des migrations en raison de la confluence des mcanismes poussant se dplacer, notamment lintrieur dun mme continent parfois dun mme pays. Ainsi, si les populations migrantes reprsentaient 2% du total mondial il y a 40 ans, elles en reprsentent maintenant 3 % (191 millions), ce qui correspond virtuellement au 5e pays du monde.

    Les raisons qui poussent la migration sont principalement conomiques, lies des conflits (ethniques, religieux ou politiques) et, phnomne nouveau qui va se dvelopper dans les prochaines dcennies, la consquence des changements climatiques qui vont pousser des populations entires quitter leur terre en raison dinondations (lvation du niveau de la mer comme par exemple au Bengladesh ou dans beau-coup des zones ctires non montagneuses notamment des zones tropicales), de dsertification (accrois-sement de surface des grands dserts), de manque deau ou dappauvrissement extrme des sols en raison dune dforestation massive avec lessivage des sols. Ces volutions go-climatiques sont pourvoyeuses de conflits elles-mmes, sources de migrations (par exemple, la qute de leau lie lasschement du Jourdain est une des causes du conflit isralo-palestinien). Les mouvements de population ont donn lieu lorganisa-tion des migrs en diasporas qui jouent souvent un rle considrable par les liens conomiques quelles ont maintenu avec leur pays dorigine que ce soit en inter ou en intracontinental. Elles ont organis des rseaux commerciaux entre les diffrents pays o elles sont installes et le pays dorigine. Cest notamment le cas des Libanais en Afrique de lOuest ou des Indiens en Afrique de lEst. Ces liens rguliers jouent un rle mal valu mais probablement significatif dans la transmission et la diffusion de certains agents pathognes.

    Aprs les migrants conomiques, les rfugis reprsentent probablement numriquement la deuxime population de migrants. Ces migrants forcs seraient 67 millions, si lon y inclut les 26 millions qui sont forcs se dplacer lintrieur de leur pays du fait de violences. Le reste se partage entre 16 millions qui quittent leur pays du fait de perscutions ou dune situation de violence gnralise et 25 millions du fait de catastrophes naturelles. Ces dplacements forcs souvent de grande ampleur et souvent un niveau sous-rgional sont relativement rcents puisquils taient pratiquement inconnus avant le vingtime sicle. Par exemple la partition de lInde a mis 15 millions de personnes sur les routes et le