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e-Pilly TROPMaladies infectieuses tropicales
par le Collge des Universitaires de Maladies Infectieuses et Tropicales
2012dition web
www.infectiologie.com
Editions Alina Plus
e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales
e-Pilly TROP 2012
Licence dutilisation et prcautions dusageLe CMIT dcline toute responsabilit, de quelque nature quelle soit, pouvant rsulter dune ngligence ou dune mauvaise utilisation de tous produits, instruments, techniques ou concepts prsents dans cet ouvrage. Le CMIT recommande quune vrification ext-rieure intervienne pour les diagnostics, posologies et techniques.Tous droits de traduction, dadaptation et de reproduction par tous procds rservs pour tous pays. Toute reproduction ou repr-sentation intgrale ou partielle, par quelque procd que ce soit y compris le tlchargement, des pages publies dans le prsent ouvrage, faite sans lautorisation de lditeur est illicite et constitue une contrefaon. Seules sont autorises, dune part, les reproduc-tions strictement rserves lusage priv du copiste et non destines une utilisation collective, et dautre part, les courtes citations justifies par le caractre scientifique ou dinformation de luvre dans laquelle elles sont incorpores (loi du 11 mars 1957, art. 40 et 41 et Code pnal, art. 425).Des photocopies payantes peuvent tre ralises avec laccord de lditeur. Sadresser au Centre franais dexploitation du droit de copie, 3, rue Hautefeuille, 75006 Paris. Tl : 01 43 26 95 35 Fax : 01 46 34 67 19.
Copyright 2012. CMIT et Alina Plus
La loi du 11 mars 1957 interdit les copies ou reproductions destines une utilisation collective. Toute reprsentation ou reproduc-tion intgrale ou partielle faite par quelque procd que ce soit y compris le tlchargement, sans le consentement de lauteur ou ses ayants cause, est illicite et constitue une contrefaon sanctionne par les articles 425 et suivants du Code Pnal.
Le Comit de rdactionCoordonnateurs : Jean DELMONT et Eric PICHARDStphane JAURGUIBERRY, Bruno MARCHOU, Philippe PAROLA, Fabrice SIMON
Auteurs et co-auteurs ayant contribu la rdaction du e-Pilly TROPric ADEHOSSI, Khadidiatou B FALL, Bernadette BALDIN, Alain BERREBI, Antoine BERRY, Jean BEYTOUT, Elisabeth BOTELHO-NEVERS, Olivier BOUCHAUD, Michel BOUSSINESQ, Elisabeth BOUVET, Souleymane BRAH, Philippe BROUQUI, Pierre BUFFET, Dominique CHABASSE, Thibaut CHALLAN BELVAL, Jean-Philippe CHIPPAUX, Daniel CHRISTMANN, Eric DELAPORTE, Pierre DELLAMONICA, Jean DELMONT, Michel DEVELOUX, Ibrahima DIALLO, Serge HOLI, Eboi EHUI, Jean-Franois FAUCHER, Ccile FICKO, Eric GARNOTEL, Philippe GAUTRET, Pierre-Marie GIRARD, Patrick HOCHEDEZ, Patrick IMBERT, Yannick JAFFR, Stphane JAURGUIBERRY, Dominique KEROUDAN, Karine LACOMBE, Jean-Christophe LAGIER, Olivier LESENS, Frdric LUCHT, Antoine MAH, Denis MALVY, Bruno MARCHOU, Thierry MAY, Papa Saliou MBAYE, Christian MICHELET, Matthieu MILLION, Daouda MINTA, Gentiane MONSEL, Jean-Jacques MORAND, Philippe PAROLA, Olivier PATEY, Christian PERRONNE, Dominique PEYRAMOND, Gilles PIALOUX, Renaud PIARROUX, Eric PICHARD, Christian RABAUD, Valrie RABIER, Blandine RAMMAERT, Christophe RAPP, Serge RESNIKOFF, Hlne SAVINI, Fabrice SIMON, Georges SOULA, Michel STROBEL, Mariam SYLLA, Pierre TATTEVIN, Hlne THFENNE, Roland TUBIANA, Yazdan YAZDANPANAH
2 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales
Introduction
Le-Pilly TROP est un ouvrage dinfectiologie tropicale destin aux mdecins et aux tudiants en mdecine des pays francophones du Sud. La prise en compte des diffrents niveaux de la pyramide sanitaire dans ces pays le rend aussi accessible aux infirmiers des centres de sant communautaires urbains et des structures de sant intermdiaires des zones rurales. Par dfinition, les Pays En Dveloppement accroissant progressivement leurs capacits de diagnostic biologique et de traitement, les outils de prise en charge correspondent aux moyens des niveaux priphriques comme ceux des niveaux hospitaliers de rfrence.
Les pathologies infectieuses dites tropicales dpassant largement la ceinture intertropicale, de nombreux pays proches de cette zone gographique sont concerns par ces infections et par les programmes de lutte qui sont donc abords dans le cadre de la sant internationale et de la sant globale regroupant les moyens de surveillance, dalerte et de rponse des partenaires Nord-Sud, institutionnels ou privs.
Louvrage intressera aussi les mdecins et les tudiants des pays francophones du Nord amens prendre en charge les pathologies infectieuses des voyageurs et des migrants, dtailles dans des encarts ddis la fin de chacun des chapitres concerns par ces pathologies.
Les parasitoses et les mycoses occupant un place importante en infectiologie tropicale sont abordes essentiellement lorsquelles sont responsables dinfections gnrales ou posant un problme de diagnostic avec les bactrioses et les viroses.
Lutilisation de le-Pilly TROP est facilit par les renvois automatiques vers les chapitres correspondants partir de mots-cls et par des liens avec les principaux sites ou textes en ligne sur le web. Quarante-cinq cas cliniques interactifs, prsents dans latelier interactif de mdecine tropicale des Journes Nationales dInfectiologie en France depuis 10 ans, sont disponibles page 6 du sommaire et permettent un entrane-ment personnel ou une utilisation pdagogique en groupes.
Le e-Pilly TROP est un ouvrage collectif du Collge des universitaires de Maladies Infectieuses et Tropicales (CMIT) mis gratuitement la disposition des personnels de sant francophone. Il ne peut en tre fait aucun usage commercial. Sa conception et sa ralisation nont aucun lien avec dautres organismes ou avec lindustrie pharmaceutique. Le comit de rdaction a veill ce quil ny ait aucun conflit dintrt concernant les auteurs qui ont particip bnvolement la rdaction de le-Pilly TROP. Ceux-ci sont des praticiens et des enseignants en maladies infectieuses et tropicales des hpitaux franais et des spcialistes dinfectiologie tropicale des pays du Sud (voir la liste et les coordonnes des auteurs). Un complment dinformation est accessible dans les ouvrages du CMIT E. PILLY et POPI disponibles en librairie et dans lECN.Pilly accessible en ligne, ainsi que dans de nombreux autres documents dinfectiologie, sur le site www.infectiologie.com.
Lvolution de linfectiologie tropicale tant rapide et la rdaction de le-Pilly TROP couvrant lanne 2011-2012, il est recommand aux lecteurs de proposer par mail au comit de rdaction des corrections et mises jour concernant leur pays dexercice.
Le Comit de Rdaction remercie particulirement les auteurs des pays du Sud, lassociation ANOFEL, regroupant les enseignants franais de parasitologie, pour laccs liconographie du CDRom ANOFEL4, le Centre de Formation et Recherche en Mdecine et Sant Tropicales (CFRMST) pour sa mise disposition de photographies, lInstitut de Mdecine Tropicale du Service de Sant des Armes (IMTSSA, Le Pharo, Marseille) pour lutilisation dillustrations parues dans la revue Mdecine Tropicale et Madame Nathalie Pasquier-Desvignes ainsi que lquipe de Alina Plus pour la ralisation de le-Pilly TROP.
Le comit de rdaction.
Pr Jean Delmont, Marseille. [email protected]
Dr Stphane Jaurguiberry, Paris. [email protected]
Pr Bruno Marchou, Toulouse. [email protected]
Pr Philippe Parola, Marseille. [email protected]
Pr Eric Pichard, Angers. [email protected]
Pr Fabrice Simon, Marseille Armes. [email protected]
CMIT et Alina Plus
e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales
AccsLe e-Pilly TROP, ouvrage franais de rfrence en infectiologie tropicale labor sous lgide du CMIT et dit par Alina Plus, est accessible via le site internet Infectiologie.com, rubrique formation, sous-rubrique livres (http://www.infectiologie.com/site/livres.php).
Le e-Pilly TROP se prsente sous forme dun fichier pdf interactif (nom du fichier ePillyTROP.pdf) incluant lensemble des chapitres du e-Pilly TROP ainsi que 45 cas cliniques en mdecine tropicale interactifs.
Avant de dmarrer1. Cliquez sur le fichier PDF interactif ePillyTROP.pdf laide du logiciel Acrobat Reader, tlchar-
geable gratuitement depuis le site Adobe http://get.adobe.com/fr/reader/, ou autres logiciels compatibles avec Acrobat Reader. Pour information, le logiciel payant Acrobat Pro offre plus de fonctionnalits.
2. Afin doptimiser la lecture en ligne du e-pilly TROP, nous vous suggrons de mettre en place les outils suivants sur la barre doutils de votre Acrobat Reader :
affichage des signets (Cliquez sur le bouton Signets gauche du panneau de navigation ou choi-sissez Affichage > Panneaux de navigation > Signets) : les signets constituent un sommaire visuel, ils saffichent dans le navigateur situ gauche de la fentre dAcrobat Reader ;
outils pour la navigation de pages (Affichage > Barre doutils > Ajouter des outils > Barre doutils Navigation de page : cochez tous les outils) :
les boutons Page suivante et Page prcdente sont disponibles sur la barre doutils Navi-gation de pages. En regard de ces boutons, la zone de texte est galement interactive : il vous suffit de taper un numro de page et dappuyer sur Entre pour atteindre directement la page voulue ;
les boutons Vue prcdente et Vue suivante vous permettent de rechercher des pages PDF que vous avez visualises auparavant en revenant en arrire dans votre parcours de visua-lisation. En parlant de vue, il sagit de lhistorique de visualisation des pages. Si, par exemple, vous avancez et reculez dans un document, lhistorique de visualisation revient en arrire, affi-chant les pages que vous avez vues dans lordre inverse de laffichage initial. Ces boutons his-torique de visualisation apparaissent galement lintrieur du document ( ct des boutons Sommaire et Index).
recherche dinformations : servez-vous de la fentre Recherche avance (Edition > Recherche avance) ou de la barre doutils Recherche pour trouver les informations qui vous intressent dans lensemble du document et les signets.
Lindex en fin douvrage renvoit aux numros de chapitres correspondants (et non aux pages correspon-dantes). Les chapitres principaux sont indiqus en gras.
Organisation et interactivit spcifiques du e-Pilly TROPLe e-Pilly TROP comprend 5 grandes parties (cf. sommaire) repres par un code couleur qui est retrouv dans lensemble des chapitres de chaque partie :
e-Pilly TROP : mode demploi
ATTenTIOn, afin que les liens des cas cliniques en mdecine tropicale (page 6 du sommaire) soient actifs, il est indispensable de tlcharger et de ranger au pralable
le fichier ePillyTROP.pdf et le dossier Cas_cliniques_ePillyTROP dans un mme dossier.
e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales
En vert : pidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale.
En orange : Outils en infectiologie tropicale.
En bleu : Syndromes.
En rouge : Maladies.
En mauve : Infections selon le terrain.
Sur chaque page du e-Pilly TROP :
la partie et le chapitre concerns sont rappels en haut et gauche dans le bandeau suprieur ;
les boutons sommaire et index situs en haut et droite dans le bandeau suprieur permettent daccder au sommaire interactif ou lindex ;
les liens textes (mots souligns) renvoient la tte dun chapitre ;
les flches situes en haut et droite permettent de passer dune action lautre ( ne pas confondre avec les flches disponibles dans votre logiciel Acrobat ou de lecture qui permettent de passer dune page lautre). Par exemple, vous cliquez sur un lien texte de la page 28 qui vous renvoie page 234 : une fois page 234 il suffit de cliquer sur la flche de gauche pour revenir votre page initiale n 28; en cliquant sur la flche de droite vous pourrez retourner la page 234 et ainsi de suite.
Le fichier pdf interactif du e-Pilly TROP permet galement une consultation :
en e-book laide de multiples plateformes web qui mettent disposition des outils de transformation dun fichier pdf en e-book ;
sur tablette ou smartphone laide de logiciels ou solutions de lecture du format pdf (ex : Adobe Viewer ou Goodreader sur iPad).
Lutilisateur peut ainsi bnficier la fois de linteractivit spcifique ce fichier pdf interactif (sommaire, liens) et de toutes les fonctionnalits propres au logiciel Acrobat Reader ou au logiciel de lecture de le-book (recherche intgrale, modes daffichage, aller la page nX, marque-page). Par exemple, pour rechercher une thmatique qui vous intresse (ex : paludisme) vous disposez de 2 modes de recherche possible:
via le sommaire interactif : en cliquant sur le chapitre correspondant dans le sommaire (paludisme), vous irez directement la tte du chapitre correspondant (paludisme) ;
via les signets (outil dAcrobat) : les signets constituent un sommaire visuel, ils saffichent dans le navi-gateur situ gauche de la fentre dAcrobat Reader. En cliquant sur le chapitre correspondant dans le sommaire (paludisme), vous irez directement la tte du chapitre correspondant (paludisme) ;
via la recherche intgrale par mot (fonctionnalit dAcrobat ou du logiciel de lecture) : en tapant le mot recherch (paludisme), le logiciel Acrobat vous indiquera le nombre de mot paludisme rencontr dans louvrage et vous dirigera successivement tous les endroits o il se situe (visualisation en surlignage).
e-Pilly TROP : mode demploi (suite)
3 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales
Sommaire
Partie 1. pidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
001 Vocabulaire simplifi de lpidmiologie des maladies transmissibles ............................................................... 7
002 Transmission des infections ........................................................................................................................................................... 11
003 pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique ................................................................................................................................................................ 15
004 Risques infectieux des voyages et des migrations entre pays tropicaux ....................................................... 29
005 Vecteurs et lutte antivectorielle ................................................................................................................................................... 34
006 Priorits en infectiologie tropicale. Organismes impliqus dans la lutte contre les infections tropicales. Programmes nationaux et internationaux ................................................................... 47
Partie 2. Outils en infectiologie tropicale007 Apports dune dmarche anthropologique la prvention
et la prise en charge des maladies infectieuses ......................................................................................................... 56
008 Classification des principales bactries pathognes chez lhomme ................................................................. 61
009 Classification des principaux virus pathognes chez lhomme ............................................................................ 65
010 Classification des principaux parasites pathognes chez lhomme .................................................................. 67
011 Classification des principaux champignons pathognes chez lhomme ........................................................ 69
012 Technique, rsultats et interprtation des prlvements ........................................................................................... 72
013 Anti-infectieux essentiels ................................................................................................................................................................ 94
014 Antituberculeux ..................................................................................................................................................................................... 98
015 Antirtroviraux ..................................................................................................................................................................................... 102
016 Antiparasitaires ................................................................................................................................................................................... 105
017 Antifongiques ....................................................................................................................................................................................... 109
018 Antiseptiques et dsinfectants. Strilisation .................................................................................................................... 111
019 Rgles de prescription des antibiotiques ........................................................................................................................... 114
020 Traitements courts ou minute ............................................................................................................................................. 118
021 Rsistances aux antibactriens ................................................................................................................................................ 120
022 Interactions mdicamenteuses avec les anti-infectieux .......................................................................................... 126
023 Chimioprophylaxie anti-infectieuse ........................................................................................................................................ 137
024 Vaccinations. Programme largi de vaccination (PEV). Sroprvention, srothrapie ........................ 142
Partie 3. Syndromes025 Fivre aigu. Examen clinique en infectiologie tropicale ......................................................................................... 151
026 Eruptions fbriles ............................................................................................................................................................................... 157
027 Syndromes septiques, choc septique et bactrimies ............................................................................................ 166
028 Fivres hmorragiques virales ................................................................................................................................................... 170
029 Fivres prolonges, granulomatoses hpatiques ......................................................................................................... 181
030 Splnomgalies infectieuses ...................................................................................................................................................... 187
031 Adnopathies infectieuses (conduite tenir) .................................................................................................................. 190
032 Infections buccales .......................................................................................................................................................................... 194
4 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales
033 Infections respiratoires hautes : rhino-pharyngites, angines, sinusites, otites, infections ORL tropicales ................................................................................................. 204
034 Infections respiratoires basses ................................................................................................................................................. 215
035 Pleursies infectieuses ................................................................................................................................................................... 241
036 Diarrhes infectieuses .................................................................................................................................................................... 247
037 Infections et toxi-infections dorigine alimentaire ........................................................................................................ 260
038 Douleurs abdominales fbriles ................................................................................................................................................. 266
039 Ascites infectieuses ......................................................................................................................................................................... 273
040 Ictres fbriles ..................................................................................................................................................................................... 276
041 Infections urinaires communautaires ................................................................................................................................... 280
042 pidmiologie des IST ................................................................................................................................................................... 286
043 coulement urtral chez lhomme .......................................................................................................................................... 289
044 coulement vaginal .......................................................................................................................................................................... 295
045 Ulcrations gnitales ...................................................................................................................................................................... 300
046 Infections pelviennes chez la femme .................................................................................................................................... 310
047 Pricardites aigus ............................................................................................................................................................................ 315
048 Myocardites .......................................................................................................................................................................................... 320
049 Endocardites infectieuses ........................................................................................................................................................... 323
050 Mningites ............................................................................................................................................................................................. 332
051 Mningo-encphalites ................................................................................................................................................................... 345
052 Infections oculaires .......................................................................................................................................................................... 350
053 Infections par inoculation, morsures (hors rage et envenimations) ................................................................. 364
054 Envenimations ..................................................................................................................................................................................... 368
055 Infections de la peau et des tissus mous .......................................................................................................................... 382
056 Infections osto-articulaires ...................................................................................................................................................... 409
057 Interprtation de la numration sanguine. Hyperosinophilie. Syndrome mononuclosique ......... 418
Partie 4. Maladies058 Tuberculose .......................................................................................................................................................................................... 427
059 Lpre ......................................................................................................................................................................................................... 439
060 Ulcre de Buruli, infection Mycobacterium ulcerans ............................................................................................ 447
061 Trponmatoses endmiques .................................................................................................................................................. 454
062 Streptococcies et rhumatisme articulaire aigu .............................................................................................................. 458
063 Staphylococcies ................................................................................................................................................................................ 462
064 Ttanos .................................................................................................................................................................................................... 468
065 Diphtrie ................................................................................................................................................................................................... 476
066 Coqueluche ........................................................................................................................................................................................... 487
067 Fivre typhode ................................................................................................................................................................................... 492
068 Salmonelloses non typhiques ................................................................................................................................................... 497
069 Listriose ................................................................................................................................................................................................ 500
070 Infection Helicobacter pylori .................................................................................................................................................. 504
071 Shigelloses ............................................................................................................................................................................................. 511
5 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales
072 Cholra ...................................................................................................................................................................................................... 514
073 Peste ........................................................................................................................................................................................................... 518
074 Charbon ................................................................................................................................................................................................... 522
075 Brucellose .............................................................................................................................................................................................. 527
076 Leptospiroses ...................................................................................................................................................................................... 532
077 Fivres rcurrentes .......................................................................................................................................................................... 537
078 Rickettsioses ........................................................................................................................................................................................ 544
079 Fivre Q .................................................................................................................................................................................................... 554
080 Bartonelloses ....................................................................................................................................................................................... 560
081 Morve ........................................................................................................................................................................................................ 567
082 Mliodose .............................................................................................................................................................................................. 570
083 Actinomycoses - Nocardioses ................................................................................................................................................. 575
084 Infection par le VIH et SIDA ........................................................................................................................................................ 580
085 Infection par HTLV ............................................................................................................................................................................ 628
086 Hpatites virales ................................................................................................................................................................................ 630
087 Infections par les entrovirus .................................................................................................................................................... 644
088 Viroses respiratoires ........................................................................................................................................................................ 655
089 Herps (HSV-1, HSV-2) .................................................................................................................................................................. 669
090 Varicelle, zona ...................................................................................................................................................................................... 673
091 Infections par le CMV et lEBV .................................................................................................................................................. 677
092 Poxviroses ............................................................................................................................................................................................. 684
093 Infections par les papillomavirus (HPV) .............................................................................................................................. 690
094 Arboviroses ........................................................................................................................................................................................... 696
095 Infections par les Filovirus, les Arenavirus et les Hantavirus ............................................................................... 723
096 Rage ........................................................................................................................................................................................................... 734
097 Paludisme ................................................................................................................................................................................................ 740
098 Parasitoses intestinales ................................................................................................................................................................ 756
099 Amoebose tissulaire ........................................................................................................................................................................ 764
100 Gale ............................................................................................................................................................................................................ 769
101 Tungose .................................................................................................................................................................................................... 774
102 Myiases .................................................................................................................................................................................................... 777
103 Filarioses ................................................................................................................................................................................................. 783
104 Bilharzioses ou schistosomoses ............................................................................................................................................. 798
105 Maladie du sommeil ........................................................................................................................................................................ 808
106 Trypanosomose amricaine ou maladie de Chagas ................................................................................................... 816
107 Leishmanioses .................................................................................................................................................................................... 821
108 Migrations larvaires et impasses parasitaires ................................................................................................................ 833
109 Distomatoses ....................................................................................................................................................................................... 849
110 Toxoplasmose ..................................................................................................................................................................................... 853
111 Mycoses profondes tropicales ................................................................................................................................................. 857
112 Myctomes ............................................................................................................................................................................................ 888
113 Teignes ..................................................................................................................................................................................................... 891
6 e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales
Partie 5. Infections selon le terrain114 Infection et grossesse (hors VIH) ............................................................................................................................................ 897
115 Infections puerprales ................................................................................................................................................................... 903
116 Infections nonatales ..................................................................................................................................................................... 906
117 Prise en charge intgre des maladies de lenfance (PCIME) .............................................................................. 912
118 Infections et drpanocytose ....................................................................................................................................................... 917
119 Infections et diabte ........................................................................................................................................................................ 923
120 Infections chez le toxicomane .................................................................................................................................................. 928
121 Infections chez le neutropnique ............................................................................................................................................ 932
122 Infections nosocomiales ............................................................................................................................................................... 935
123 Accidents exposant un risque viral (AEV) ..................................................................................................................... 940
124 Infections transmises par la transfusion de sang ou de ses drivs .............................................................. 949
125 Infections tropicales et cancers .............................................................................................................................................. 954
Index ....................................................................................................................................................................................................................... 958
Liste et coordonnes des auteurs et co-auteurs ................................................................................ 964
Collge des universitaires des Maladies Infectieuses et Tropicales (CMIT) ..................................................................................................968
Cas cliniques en mdecine tropicaleCas N 1
Cas N 2
Cas N 3
Cas N 4
Cas N 5
Cas N 6
Cas N 7
Cas N 8
Cas N 9
Cas N 10
Cas N 11
Cas N 12
Cas N 13
Cas N 14
Cas N 15
Cas N 16
Cas N 17
Cas N 18
Cas N 19
Cas N 20
Cas N 21
Cas N 22
Cas N 23
Cas N 24
Cas N 25
Cas N 26
Cas N 27
Cas N 28
Cas N 29
Cas N 30
Cas N 31
Cas N 32
Cas N 33
Cas N 34
Cas N 35
Cas N 36
Cas N 37
Cas N 38
Cas N 39
Cas N 40
Cas N 41
Cas N 42
Cas N 43
Cas N 44
Cas N 45
e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales7
Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles
Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles
1. DfinitionsLpidmiologie (tableau 1) est ltude de la distribution des maladies et de leurs dterminants dans la popu-lation humaine. Elle permet de connatre lampleur et la distribution des phnomnes morbides, didentifier des facteurs de risque et de mesurer lefficacit des interventions.
Les maladies transmissibles sont causes par des agents infectieux qui ont la capacit de se transmettre entre individus.
Tableau 1. Les diffrents domaines dactivit de lpidmiologie
Epidmiologie descriptive
Quelle est la distribution dans le temps et dans lespace des problmes de sant au sein dune population et quelles sont les personnes concernes ? Rpondre aux trois questions qui, o et quand permet dmettre des hypothses sur le comment et le pourquoi.
Epidmiologie analytique
Existe-t-il un lien entre une exposition (facteur de risque) et la survenue dune maladie ?
Epidmiologie valuative
Les actions entreprises pour rsoudre un problme de sant publique ont-elles t efficaces ?
2. Glossaire des termes courants en pidmiologie (tableau 2)
Tableau 2. Les principaux termes courants en pidmiologie
Termes Dfinitions
Agents infectieux
Etres vivants (organismes appartenant lune des 4 familles suivantes : bactries, virus, parasites, champignons microscopiques) ou inanims (toxines), dits pathognes car susceptibles dentraner des infections ou des toxi-infections.
Biais de surveillance
Toute erreur produisant systmatiquement des estimations suprieures ou infrieures la valeur relle des paramtres tudis. Exemple : les maladies dclaration obligatoire en France ne sont pas systmatiquement notifies et leur frquence relle est ainsi sous-estime.
Contagion Pntration de lagent pathogne chez un individu rceptif. Terme issu du latin cum (avec) et tangere (toucher), il a pour synonyme contage ou contamination.
Contagiosit Capacit de lagent pathogne diffuser entre individus rceptifs.
Echantillon Sous-ensemble de la population tudie. Le choix des units qui constituent le sous-ensemble peut tre effectu par diffrentes mthodes (chantillonnage). On utilise des chantillons parce quune tude approfondie de toute la population serait impossible, trop longue et trop chre pour le niveau de prcision exig.
Endmie Persistance de cas dune maladie dans un lieu donn pendant une longue priode. Exemples : tuberculose, paludisme.
1
e-Pilly TroP 2012 - Maladies infectieuses tropicales8
Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles
Tableau 2. Les principaux termes courants en pidmiologie
Termes Dfinitions
Endmo- pidmie
Persistance de cas dune maladie dans un lieu donn pendant une longue priode avec des pisodes pidmiques. Exemple : mningite mningocoque.
Epidmie Apparition dun nombre anormalement lev de cas dune maladie, concentrs dans le temps et dans lespace. Exemples : rougeole, chikungunya, grippe.
Facteur de risque
Facteur augmentant le risque de maladie. Exemples : promiscuit et rougeole, rapport sexuel non protg et IST
Facteur protecteur
Facteur diminuant le risque de maladie. Exemples : vaccination, adduction deau potable.
Faux ngatif Un rsultat faux ngatif est un test ngatif chez un sujet malade.
Faux positif Un rsultat faux positif est un test positif chez un sujet non malade.
Immunit collective
La vaccination (ou la maladie) dun pourcentage lev de la population lui confre ce que lon appelle limmunit collective ou immunit de groupe. La couverture vaccinale ncessaire pour obtenir une immunit de groupe optimale varie selon la maladie : pour la variole, la diphtrie, la poliomylite, la rubole et les oreillons, le seuil de couverture atteindre pour crer une immunit collective est de 80-85 % ; pour la coqueluche et la rougeole, il est de 90-95 %.
Incidence Nombre de nouveaux malades dans une population au cours dune priode dtermine (la plupart du temps un an). Elle peut tre exprime sous forme dincidence cumule.
Incidence cumule
Rapport entre le nombre de nouveaux cas survenus pendant la priode dobservation et le nombre de personnes en observation et susceptibles de devenir des cas au dbut de la priode. Il sagit dune proportion et dune mesure du risque qui doit toujours tre accompagne de la mention de la dure dobservation. Exemple : 5 nouveaux cas de tuberculose dans une cohorte de 100 patients VIH+ suivis pendant 1 an ; incidence cumule = 5/100 = 5 %
Incubation (priode d)
Temps qui scoule entre la pntration de lagent pathogne et lapparition des premiers symptmes de la maladie.
Indice Fraction dont le numrateur et le dnominateur nappartiennent pas au mme ensemble. Exemple : 100 lves, 10 latrines dans une cole, soit 1 latrine pour 10 lves.
Pandmie Endmie ou pidmie qui survient dans une zone gographique trs tendue telle quun continent ou la plante entire. Exemple : grippe, infection VIH
Pouvoir invasif Capacit de multiplication et de diffusion de lagent pathogne dans lorganisme.
Pouvoir pathogne
Capacit dun agent infectieux engendrer une maladie
Prvalence Proportion de personnes prsentant lvnement de sant dans une population donne un moment donn. Elle sexprime en nombre de cas rapport une population.
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Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles
Tableau 2. Les principaux termes courants en pidmiologie
Termes Dfinitions
Prvention primaire
Ensemble des mesures visant diminuer lapparition des maladies en rduisant lexposition aux facteurs de risque lorsque cela est possible. Elle tend diminuer lincidence. Exemple : vaccination
Prvention secondaire
Ensemble des mesures visant dceler et traiter une maladie infectieuse un stade prcoce, pour influencer favorablement le pronostic du malade et rduire la transmission dans son entourage. Exemple : traitement prcoce et mesures disolement du malade.
Prvention tertiaire
Ensemble des mesures (interventions auprs du patient qui prsente des symptmes) visant rduire les consquences ultrieures de la maladie.
Proportion Rapport de deux quantits appartenant au mme ensemble et dans lequel le numrateur est inclus dans le dnominateur. Exemple : groupe de 50 filles et 100 garons. Proportion de filles dans le groupe = 50/(50+100) = 33 %
Rapport Expression la plus gnrale de la relation entre deux quantits qui peuvent indiffremment appartenir ou non au mme ensemble.
Ratio Rapport dans lequel le numrateur et le dnominateur appartiennent au mme ensemble, mais o le numrateur nest pas inclus dans le dnominateur. Exemple : groupe de 50 filles et 100 garons. Ratio de masculinit (sex-ratio) garons/filles dans le groupe = 100/50 = 2
Rservoir de germe
Endroit o lagent pathogne infectieux se multiplie et se maintient. Les diffrents rservoirs sont lhomme, lanimal et lenvironnement (eau, air, sol et surfaces).
Risque Probabilit de survenue dun vnement de sant durant une priode donne. Il est gnralement mesur par lincidence.
Sensibilit Probabilit que le rsultat dun test diagnostique soit positif chez un individu malade. Autrement dit, cest la proportion de patients rellement malades dans la population qui prsente un rsultat positif pour le test utilis (par rapport lensemble des personnes malades). Un test ayant une sensibilit leve dtecte un nombre lev dindividus vritablement malades, donc peu de faux ngatifs.
Spcificit Probabilit que le rsultat dun test diagnostique soit ngatif chez un individu non malade. Autrement dit, cest la proportion de personnes qui nont pas la maladie dans une population et qui prsentent un rsultat ngatif pour le test utilis (par rapport lensemble des personnes qui nont pas la maladie). Un test ayant une spcificit leve donne peu de faux positifs.
Stratgie dlimination
Vise rduire zro cas lincidence de la maladie, sans parvenir faire disparatre la prsence de lagent pathogne. Exemple : ttanos
Stratgie dradication
Vise rduire zro cas lincidence de la maladie et faire disparatre la prsence de lagent pathogne. Lradication ne peut tre envisage que si le rservoir du germe est strictement humain. Exemples : variole radique en 1980 ; poliomylite et dracunculose en voie dradication mondiale.
Stratgie de contrle
Vise rduire le nombre de cas et de dcs de telle sorte que la maladie ne soit plus un problme de sant publique majeur. Exemple : paludisme.
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Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
Vocabulaire simplifi de lpidmiologie desmaladies transmissibles
Tableau 2. Les principaux termes courants en pidmiologie
Termes Dfinitions
Surveillance pidmiologique
Collecte continue et systmatique, analyse et interprtation de donnes de sant essentielles pour la planification, la mise en place et lvaluation des pratiques en sant publique, troitement associe la diffusion en temps opportun de ces donnes ceux qui en ont besoin. Ltape finale du cycle de la surveillance est lapplication de ces donnes au contrle et la prvention des maladies.
Taux Rapport constitu dun numrateur reprsent par le nombre dindividus porteurs dun attribut ou prsentant un vnement dans une population (dnominateur) susceptible de prsenter cet attribut ou cet vnement, en gnral un moment ou durant une priode donne. Cest donc un rapport qui mesure la vitesse de survenue dun vnement dans une population.
Taux dattaque Proportion des personnes malades par rapport aux personnes exposes un facteur de risque reconnu. Il sagit dune mesure dincidence cumule utilise surtout au cours des pidmies.
Taux de ltalit Proportion de cas fatals lis une maladie spcifique dans une population. Il sagit dun indicateur de gravit de la maladie. Il est calcul en divisant le nombre de dcs causs par la maladie pendant une certaine priode de temps par le nombre de patients affects par la maladie durant cette mme priode.
Taux de mortalit
Mesure de la frquence de dcs dans une population. Il est calcul en divisant le nombre de dcs pour une priode donne dans une population risque.
Valeur prdictive ngative
Probabilit quune personne ayant obtenu un rsultat ngatif lors dun examen diagnostique ne soit pas malade.
Valeur prdictive positive
Probabilit quune personne ayant obtenu un rsultat positif lors dun examen diagnostique soit rellement malade.
Sites web recommands concernant ce chapitre :
Roch Giorgi, Dfinitions de termes couramment utiliss en pidmiologie et en recherche mdicale. LERTIM, Facult de Mdecine, Universit de la Mditerranehttp://cybertim.timone.univ-mrs.fr/Members/rgiorgi/DossierPublic/Enseignement/
Rseau francophone en sant publique http://www.universante.org/glossaire.php).
BDSP. Banque de Donnes en Sant Publique. Glossaire multilinguehttp://asp.bdsp.ehesp.fr/Glossaire/
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Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
Transmission des infections
Transmission des infections
La transmission dune maladie infectieuse peut se faire selon deux modes : - en dehors dun milieu de soins : infections communautaires ; - en milieu de soins : infections nosocomiales.
Lagent infectieux (bactrie, virus, parasite, champignon) peut contaminer lhomme partir de rservoirs: - milieu naturel : sol (ex : Clostridium tetani), eau (ex : Vibrio cholerae) ou air (ex : Histoplasma capsulatum) ; - animal (zoonose, ex : virus de la rage) ou homme (ex : Myxovirus influenzae) malade ou porteur sain ; - sang, produits drivs du sang ou greffons contamins (ex : VIH) ; - matriel mdical contamin (ex : VHB).
La pntration de lagent pathogne dans lorganisme se fait par diffrentes voies (tableau 1).
Un agent pathogne peut utiliser plusieurs voies de transmission. Par exemple, les fivres hmorragiques africaines peuvent se transmettre par contact troit avec un patient, par voie arienne (arosol), transconjonctivale ou parentrale. Elles peuvent tre communautaires ou nosocomiales. Leur trs haute contagiosit justifie des mesures disolement, de transport et danalyse des prlvements stricts ainsi quune protection renforce du personnel soignant.
La comprhension du mode de transmission des infections permet de proposer des mesures de protection individuelles et collectives adaptes la population rceptive, aux malades et au personnel soignant.
Les maladies hautement contagieuses ou risque dentraner des pidmies ncessitent un signalement aux autorits de sant locales et internationales selon les recommandations du Rglement Sani-taire International (RSI) (voir le lien en fin de chapitre) afin de mettre en route des mesures de protection collectives. La quarantaine est lisolement de personnes ou danimaux suspects dtre porteurs dagents infectieux transmissibles une population rceptrice. Sa dure est fonction du temps dincubation propre la maladie et elle doit respecter les droits des personnes.
Lisolement septique (figure 1) dun patient infect (malade, porteur sain ou suspect de contagiosit) vise viter quil ne transmette lagent infectieux des individus non infects et non porteurs mais rceptifs (tableau 1). Il est distinguer de lisolement protecteur (figure 1) qui vise protger des patients immu-nodprims de tout agent potentiellement infectieux (voir le chapitre Infections chez le neutropnique ).
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Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
Transmission des infections
Tableau 1. Voies de transmission des maladies infectieuses et mesures de prvention
Voie de transmission
Exemples de maladies infectieuses
Mesures de prvention concernant la population et/ou le personnel soignant
Mesures de prvention concernant les malades
Arienne: arosols gouttelettes de salive spores
Tuberculose, peste pulmonaire, mningite crbrospinale, diphtrie, coqueluche, fivreQ, lgionellose, nocardiose, lpre, SRAS, rougeole, grippe, varicelle, infection rhinovirus, adnovirus, EBV, CMV, VRS, Hantavirus; fivres hmorragiques (Arenaviridae), pneumocystose, aspergillose, cryptococcose, cocidiodomycose, histoplasmose, rhinosporidiose.
Population : port de masque, hygine des mains, dpistage des sources de contamination, dpistage et traitement des porteurs, chimioprophylaxie, vaccination.
Soignants : hygine des mains, gants, masques, blouses, lunettes de protection.
Eviction.
Port de masque jusqu larrt de la transmission.
Isolement en chambre individuelle ventile ou pression ngative.
Strilisation, incinration des excrta et des dchets dactivit de soins risques infectieux (DASRI).
Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.
Digestive Salmonelloses, shigellose, yersiniose, infection Campylobacter spp., cholra, brucellose, botulisme, listriose, E.coli entropathognes, H.pylori, C.difficile, VHA, VHE, rotavirus, astrovirus, calicivirus, coronavirus, virus ECHO et coxsackies; poliomylite, ambose, giardiose, ascaridiose, trichocphalose, oxyurose, tniasis, distomatoses, cysticercose, trichinose, dracunculose, cryptosporidiose, microsporidioses, isosporose.
Population : hygine individuelle et collective pour la prparation et la conservation des aliments, cuisson des aliments, eau potable, tout lgout, recherche et traitement des porteurs sains, recherche et viction des sources de contaminations collectives : production, conservation, distribution, commercialisation.
Soignants : port de gants, friction hydro-alcoolique des mains
Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.
Eviction.
Strilisation, incinration des excrta et des dchets dactivit de soins risques infectieux (DASRI).
Sexuelle Syphilis, gonococcie, chlamydioses gnitales, mycoplasmoses, chancre mou, donovanose, infection VIH, HPV, herps.
Utilisation de prservatifs masculins et fminins, vaccination.
Utilisation de prservatifs jusqu la gurison.
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Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
Transmission des infections
Tableau 1. Voies de transmission des maladies infectieuses et mesures de prvention
Voie de transmission
Exemples de maladies infectieuses
Mesures de prvention concernant la population et/ou le personnel soignant
Mesures de prvention concernant les malades
Verticale (mre-enfant)
Syphilis, bactrimies, rubole, infection VHB, VIH, CMV, HSV, parvovirus B19, listriose, toxoplasmose, maladie de Chagas, paludisme.
Vaccination des femmes en ge de procrer, immunothrapie, dpistage et traitement prcoce chez la femme enceinte.
Parentrale Syphilis, infections VHB, VHC, VIH, HTLV, CMV, fivres hmorragiques, maladie de Chagas, paludisme.
Dpistage chez les donneurs de sang et dorganes.
Soignants : port de gants, mesures spcifiques fivres hmorragiques et accidents dexposition au sang (AES) .
Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.
Transcutane, conjonctivale
Leptospirose, tularmie, anguillulose, ankylostomose, bilharzioses, maladie de Chagas, fivres hmorragiques.
Protection individuelle mcanique ou chimique.
Soignants : mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.
Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.
Inoculation Ttanos, tularmie, rouget du porc, pasteurellose, haverillose, Sodoku, charbon, mliodose, maladie des griffes du chat, rage, hantaviroses, fivres hmorragiques (Filoviridae), Orf, nodule des trayeurs, sporotrichose, myctomes, lobomycose, blastomycose.
Traitement prcoce des plaies, vaccination post-exposition en cas de morsure par un mammifre (rage).
Soignants : mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.
Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.
Vectorielle Peste, rickettsioses, typhus des broussailles, borrlioses, bartonelloses, arboviroses, paludisme, filarioses lymphatiques, onchocercose, loose, trypanosomose africaine, maladie de Chagas, babsiose.
Protection antivectorielle individuelle: moustiquaires, rpulsifs, insecticides.
Lutte antivectorielle collective.
Isolement des malades des vecteurs de la maladie en zone dendmie (moustiquaire).
Nosocomiale Infections entrobactries, S.aureus, P.aeruginosa, C.difficile, fivres hmorragiques.
Voir le chapitre infections iatrognes et nosocomiales .
Mesures spcifiques en cas de fivres hmorragiques.
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Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
Transmission des infections
Figure 1. Mesures disolement
Isolement protecteur : mesures avant lentre dans la chambre dun malade immunodprim
Isolement septique : - entrique - contact - respiratoire (air)mesures avant la sortie de la chambre dun malade contagieux, dun porteur sain ou dun sujet suspect de contagiosit
Site web recommand concernant ce chapitre :
Rglement Sanitaire International OMS :http://www.who.int/ihr/fr/index.html
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pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
Complexe pathogne tropicalCe complexe, individualis par le gographe Maximilien Sorre en 1933, correspond : - un espace gographique dtermin ; - un facteur de risque spcifique (exemple : agent infectieux + vecteur + hte rservoir) ; - la prsence dindividus rceptifs.
Dans cette situation, des conditions favorisantes impriment un profil pidmiologique particulier laffection en cause : pidmie, endmie, endmo-pidmie, sporadicit.
Le complexe pathogne envisage la totalit des grands dterminants de la sant : biologique, environne-mental (facteurs humains, conomiques, socio-culturels, techniques), comportemental et le systme de soins.
La trypanosomose humaine africaine illustre bien cet exemple. Lespace de risque est dtermin par la distribution des glossines.
Pour la trypanosomose Trypanosoma gambiense, lhte-rceptif et lhte-rservoir se confondent : cest lhomme. La morbidit ne peut sexprimer que sil existe des gtes adapts aux glossines (ombre, chaleur et humidit), des aires dattaque (clairires, champs, routes, pistes, voies fluviales), une densit et une rgularit de frquentation de ces aires par les hommes. Ces conditions sont rparties de manire trs htrogne. Il en rsulte une irrgularit de rpartition des foyers de trypanosomoses au sein de laire de distribution des glossines. Les modifications anthropiques, telles que la dforestation, le dveloppement de lagriculture et les migrations de populations, favorisent lclosion de nouveaux foyers si les migrants proviennent dun foyer connu et actif et importent lagent pathogne. Il existe donc une smiologie com-munautaire qui doit tre reconnue. Il faut tenir compte de lenvironnement physique et humain, au mme titre que de la smiologie clinique. La connaissance de la clinique va permettre de concevoir des soins complets et la smiologie communautaire de faire en sorte quils soient adapts et surtout continus. Il serait vain, en effet, de soigner correctement un trypanosom pour le renvoyer par la suite sexposer aux risques identiques dans son environnement. Il serait thiquement inacceptable de ne pas se proccuper de lensemble des personnes exposes aux mmes risques. La dcouverte dun cas de trypanosomose peut ventuellement conduire la dcouverte dun nouveau foyer endmique ou pidmique.
A linverse, dans le cas de la trypanosomose est-africaine Trypanosoma rhodesiense, le rservoir est constitu danimaux sauvages dont la rpartition gographique varie selon les migrations et donc sans relle notion de foyers humains. De plus, la maladie chez lhomme frappe plutt les personnes pntrant activement dans lcosystme naturel des glossines et a alors une volution dfavorable bien plus rapide que pour lespce ouest-africaine. Le complexe pathogne tropical est donc radicalement diffrent pour ces deux trypanosomoses humaines africaines.
La prise en compte du complexe pathogne a donc plusieurs intrts : - il constitue une contribution lapproche diagnostique ; - il sensibilise la notion que toute pathologie, ft-elle infectieuse, est toujours multifactorielle et, par corollaire, que sa solution ncessite la prise en charge des diffrents facteurs.
Elle permet de mieux concevoir la vulnrabilit relle la maladie. Chacun des facteurs de linfection a en effet son poids et la ngligence de certains dentre eux peut compromettre la gurison de lindividu et la scurit de lensemble de la communaut. Elle contraint la vigilance et la veille pidmiologique, permettant de dtecter, dune manire prcoce, les situations pidmiques et, ventuellement, lmer-gence de nouveaux agents pathognes.
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pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
Si le caractre multifactoriel de la trypanosomose apparat vident, il lest moins pour dautres affections transmission directe, par exemple la tuberculose. Et pourtant, lvolution de la mortalit de cette maladie dans le temps montre lvidence que la diminution de lincidence de cette mortalit a t influence autant par llvation du niveau de vie que par lavnement des antibiotiques antituberculeux. Malgr ceux-ci et leur large diffusion, laugmentation du nombre de personnes au-dessous du seuil de pauvret, dune part, et lapparition dune autre pidmie, en loccurrence celle du VIH-SIDA, dautre part, sont responsables de la recrudescence de la maladie. En 2010, la mortalit de la tuberculose tait estime 1,4 millions de per-sonnes par an. Cette frquence pourrait crotre dans les dcennies qui viennent si des mesures volontaristes et efficaces ne sont pas prises pour lutter contre ces deux facteurs majeurs de morbidit et de mortalit.
Envisager le complexe pathogne devient une exigence diagnostique et pronostique tant en mdecine indi-viduelle quen mdecine communautaire ou des collectivits, soit en urgence (mdecine des catastrophes), soit en dveloppement durable.
Lors dune dmarche diagnostique, la connaissance physiologique de lindividu (qui), de ses activits et son comportement (a fait quoi), de ses lieux de vie et de sjour (o), des temps dexposition au risque (quand), de ses contacts humains (avec qui) sont des lments indispensables et souvent clairants permettant de hirarchiser les hypothses et de choisir les examens complmentaires adapts. La connaissance de lenvironnement ainsi dfini conditionne aussi toute demande prventive.
En sant collective, la mesure du risque dans le cadre du complexe pathogne est de plus en plus prcise grce : - une meilleure typologie des dterminants de la sant (indicateurs) ; - les progrs de lpidmiologie fondamentale ; - la puissance (et les effets secondaires) des services de soins ; - une approche plus prcise de la vulnrabilit (technique, conomique, culturelle) des facteurs de risque.
Lintrt denvisager le complexe pathogne permet danticiper des risques sanitaires devant : - la rapidit des transformations anthropiques (amnagements hydro-agricoles, dforestation, urbanisation); - lampleur des mouvements migratoires (mondialisation de certaines maladies) ; - lapparition de nouvelles niches cologiques (mergence) ; - les changements climatiques ; - les nouveaux comportements (marginalisation, violence urbaine, addictions).
Les tableaux 1 12 prsentent les principales pathologies infectieuses endmiques ou pidmiques dans les grandes rgions tropicales ou subtropicales. En caractres gras sont mentionnes les pathologies particulirement frquentes dans ces rgions. Etant donn quil sagit de donnes macro-pidmiolo-giques sur de vastes surfaces continentales, il est indispensable de confirmer linformation sur la prsence de lagent pathogne lchelon du pays ou dune rgion en se rfrant au chapitre spcifique ou une source de donnes sanitaires fiables : sites de lOMS, des CDC Les agents pathognes ou infections plus spcifiques dune zone continentale sont indiqus en gras titre indicatif.
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Tableau 1. Afrique du Nord
Bactries Virus Parasites Champignons
TuberculoseLpre
Syphilis
StreptococciesPneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhodeSalmonelloses non typhiques
Listriose
Helicobacter pylori
Shigelloses
Brucellose
Charbon
Borreliose rcurrente
Cholra
Leptospirose
Rickettsioses
Fivre Q
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDA
Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS, SRAS,
Herps Varicelle, zona
CMV, EBV
Poxviroses
Papillomaviroses
West-Nile, phlbovirus
Rage
Paludisme (P. vivax)ProtozoosesHelminthoses digestives
AmboseGale
Myiases
Leishmaniose cutane
Leishmaniose viscraleHydatidoseFascioloses
Toxoplasmose
Bilharziose (Egypte)
Cryptococcose
Blastomycose
TeignesEpidermomycoses
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pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
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Tableau 2. Afrique de lOuest
Bactries Virus Parasites Champignons
TuberculoseLpre
Ulcre de BuruliSyphilisTrponmatoses endmiques
Streptococcies Pneumococcies
StaphylococciesMningocoqueTtanosDiphtrie
Coqueluche
Fivre typhodeSalmonelloses non typhiquesListriose
Helicobacter pylori
ShigellosesCholra
Charbon
Brucellose
Leptospirose
Borrliose rcurrente tique
Nocardiose et actinomycoses
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDAInfection par HTLVHpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS, Herps
Varicelle, zona
CMV, EBV
Papillomaviroses
Fivre jauneDengue,
Chikungunya
Virus de Lassa
Crime-Congo
Fivre de la valle du Rift
Hantavirus
Rage
PaludismeAmboseAutres protozooses digestivesHelminthoses intestinalesBilharziosesDracunculose
Filarioses
GaleTungose
Myiases
Trypanosomose humaine africaine
Leishmanioses cutanes Leishmaniose viscrale
Hydatidose, cysticercose, cnurose
Fascioloses
Toxoplasmose
Pentastomose
Histoplasmoses Cryptococcose
Basidiobolose
Myctomes
Teignes
Epidermomycoses
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pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
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Tableau 3. Afrique centrale
Bactries Virus Parasites Champignons
TuberculoseLpre
Ulcre de Buruli
SyphilisTrponmatoses endmiques
Streptococcies
Mningocoque Pneumococcies
Staphylococcies
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhode
Salmonelloses non typhiques
Listriose
Helicobacter pylori
Shigelloses
CholraPesteCharbon
Brucellose
Leptospirose
Borrlioses
Rickettsioses
Fivre Q
Nocardiose et actinomycoses
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDAInfection par HTLV
Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS, SRAS
Herps (HSV-1, HSV-2)
Varicelle, zona
CMV, EBV
Papillomaviroses
Fivre jauneChikungunya, ONyong Nyong, dengue, phlebovirus
Ebola, Marburg, fivre de la valle du Rift
Hantavirus
MonkeypoxRage
PaludismeProtozooses HelminthosesAmbose
Gale, tungoseMyiases
Filarioses lymphatiques, onchocercose, loase
BilharziosesMaladie du sommeilLeishmanioses cutanes
Leishmaniose viscrale
Hydatidose, cysticercose
Distomatoses
Toxoplasmose
Histoplasmoses
Cryptococcose
Blastomycose
Chromomycose
Basidiobolose
Sporotichose
Entomophtorose
Teignes
Epidermomycoses
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pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
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Tableau 4. Afrique de lEst, Madagascar
Bactries Virus Parasites Champignons
TuberculoseLpre
Syphilis
Trponmatoses endmiques
Streptococcies Pneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhode
Salmonelloses non typhiques
Listriose
Helicobacter pylori
Shigelloses
CholraPesteCharbon
Brucellose
Leptospirose
Borrlioses
Rickettsioses
Fivre Q
Nocardiose et actinomycoses
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDAInfection par HTLV
Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS,Herps (HSV-1, HSV-2)
Varicelle, zona
CMV, EBV
Poxviroses
Papillomaviroses
Fivre jaune (voir carte au chapitre Arboviroses)
Dengue, West-Nile, phlebovirus, Chikungunya
Fivre de la valle du Rift, Crime-Congo
Hantavirus
Rage
PaludismeProtozoosesHelminthosesAmboseGaleTungose
Myiases
Filarioses lymphatiques, onchocercose
Dracunculose
BilharziosesMaladie du sommeil
Leishmanioses cutanes et viscrales
Hydatidose, cysticercose
Distomatoses
Toxoplasmose
Histoplasmoses
Cryptococcose Sporotichose
Chromomycose
Blastomycose
Basidiobolose
Entomophtorose
MyctomesTeignes
Epidermomycoses
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pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
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Tableau 5. Afrique australe
Bactries Virus Parasites Champignons
TuberculoseLpre
Ulcre de Buruli
Syphilis
Trponmatoses endmiques
Streptococcies Pneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhode
Salmonelloses non typhiques
Listriose
Helicobacter pylori
Shigelloses
Cholra
Peste
Charbon
Brucellose
Leptospirose
Borrlioses
Rickettsiose africaine tiques, typhus exanthmatiqueFivre Q
Nocardiose et actinomycoses
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDAInfection par HTLV
Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS,
Herps (HSV-1, HSV-2)
Varicelle, zona
CMV, EBV
Poxviroses
Papillomaviroses
Fivre jaune (voir carte au chapitre Arboviroses ), dengue, Chikungunya
Marburg, fivre de la valle du Rift
Hantavirus
Rage
PaludismeProtozooses
Helminthoses
Ambose
Maladie du sommeil
GaleMyiases
Filarioses
BilharziosesLeishmanioses cutanes et viscrales
Hydatidose, cysticercose
Distomatoses
Toxoplasmose
Histoplasmoses, Cryptococcose, Sporotichose
Blastomycose
MyctomesTeignesEpidermomycoses
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Tableau 6. Moyen-Orient
Bactries Virus Parasites Champignons
Tuberculose
Lpre
Ulcre de Buruli
Syphilis
Trponmatoses endmiques
Streptococcies Pneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhode
Salmonelloses non typhiques
Listriose
Infection par Helicobacter pylori
Shigelloses
Cholra
Tularmie
Charbon
Brucellose
Leptospirose
Borrlioses
Rickettsioses
Fivre Q
Mliodose
Nocardiose et actinomycoses
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDA
Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS,
Herps (HSV-1, HSV-2)
Varicelle, zona
CMV, EBV
Poxviroses
Papillomaviroses
Crime-Congo, phlbovirus
Hantavirus
Rage
Paludisme (prdominance P.vivax)
Protozooses
Helminthoses
AmboseGale
Onchocercose (Ymen)
Bilharzioses
Leishmaniose cutane et viscraleHydatidose, cysticercose
Distomatoses
Toxoplasmose
Cryptococcose
Blastomycose
TeignesEpidermomycoses
Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
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pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
Tableau 7. Pninsule indienne
Bactries Virus Parasites Champignons
TuberculoseLpre
Syphilis
Trponmatoses endmiques
Streptococcies Pneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhodeSalmonelloses non typhiquesListriose
Helicobacter pylori
Shigelloses
Cholra
Peste
Charbon
BrucelloseLeptospirose
Borrlioses
Rickettsioses
Fivre Q
Mliodose
Nocardiose et actinomycoses
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDAInfection par HTLV
Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS,
Herps (HSV-1, HSV-2)
Varicelle, zona
CMV, EBV
Papillomaviroses
Dengue, Chikungunya, Kyasanur, encphalite japonaise, virus Nipah
Crime-Congo
Hantavirus
Rage
PaludismeBabsioses
Protozooses : giardioseHelminthoses
AmboseGale, tungose
Myiases
Filarioses lymphatiques
Bilharzioses
Dracunculose
Leishmanioses cutanes
Leishmaniose viscraleHydatidose, cysticercose
Distomatoses
Capillariose
Dirofilariose
Toxoplasmose
Histoplasmose amricaine Cryptococcose
Pnicilliose
Basidiobolose
Myctomes
Teignes
Epidermomycoses
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Tableau 8. Sud-est asiatique
Bactries Virus Parasites Champignons
TuberculoseLpreUlcre de Buruli (Indonsie)
Syphilis
Trponmatoses endmiques
Streptococcies Pneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhodeSalmonelloses non typhiquesListriose
Helicobacter pylori
ShigellosesCholraPeste
Charbon
Brucellose
LeptospiroseBorrlioses
Rickettsioses
Fivre Q
Mliodose
Nocardiose et actinomycoses
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDAInfection par HTLV
Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS,
Herps (HSV-1, HSV-2)
Varicelle, zona
CMV, EBV
Poxviroses
Papillomaviroses
Dengue, Chikungunya, Kyasanur, encphalite japonaise, virus Nipah
Crime-Congo
Hantavirus
Rage
PaludismeBabsioses
Protozooses : giardioseHelminthoses
AmboseGale
Tungose
Myiases
Filarioses lymphatiquesBilharzioses
Dracunculose
Leishmanioses cutanes
Leishmaniose viscraleHydatidose, cysticercose
Distomatoses
Capillariose
Dirofilariose
Toxoplasmose
Histoplasmose amricaine
Cryptococcose
Pnicilliose
Basidiobolose
Myctomes
Teignes
Epidermomycoses
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Tableau 9. Amrique andine
Bactries Virus Parasites Champignons
Tuberculose
Lpre
Ulcre de Buruli
Syphilis
Trponmatoses endmiques
Streptococcies
Pneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhode
Salmonelloses non typhiques
Listriose
Helicobacter pylori
Shigelloses
Cholra
Peste
Charbon
Brucellose
Leptospirose
Borrlioses
Rickettsioses
BartonellosesMliodose
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDA
Infection par HTLV
Hpatites viralesPoliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS,
Herps, varicelle, zona
CMV, EBV
Poxviroses
Papillomaviroses
Fivre jaune, dengue,
Encphalite Saint-Louis, Oropouche, encphalite quine vnzulienne, Mayaro
Hantavirus
Rage
Paludisme (selon altitude)
Protozooses
helminthoses
Ambose
Gale
Tungose
Myiases
Maladie de ChagasLeishmanioses cutanes, cutano-muqueuses et viscrales
DistomatosesToxoplasmose
Histoplasmose amricaine
Cryptococcose
Sporotrichose
Paracoccidiodomy-cose
Chromomycose
Teignes
Epidermomycoses
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Tableau 10. Bassin amazonien
Bactries Virus Parasites Champignons
TuberculoseLpre
Ulcre de Buruli
Syphilis
Trponmatoses endmiques
Streptococcies
Pneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhode
Salmonelloses non typhiques
Listriose
Helicobacter pylori
Shigelloses
Cholra
Peste
Charbon
Brucellose
LeptospiroseBorrlioses
Rickettsioses
Fivre Q
Bartonelloses
MliodoseGonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
Donovanose
VIH-SIDAInfection par HTLV
Hpatites virales
Poliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS,
Herps, varicelle, zona
CMV, EBV
Poxviroses
Papillomaviroses
Fivre jaune, dengue, encphalite Saint-Louis, Oropouche, encphalite quine vnzulienne, Mayaro
Hantavirus
Rage
PaludismeProtozooses
Helminthoses
Ambose
Gale
Tungose
Myiases
Maladie de ChagasLeishmanioses cutanes, cutano-muqueuses et viscrales
DistomatosesToxoplasmose notropicaleCryptosporidiose
Histoplasmose amricaine
Cryptococcose
Sporotichose
Lobomycose
Basidiobolose
Chromomycose
Paracoccidiodomy-cose
Teignes
Epidermomycoses
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pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
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Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
Tableau 11. Amrique centrale et Carabes
Bactries Virus Parasites Champignons
Tuberculose
Lpre
Syphilis
Trponmatoses endmiques
Streptococcies Pneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhode
Salmonelloses non typhiques
Listriose
Helicobacter pylori
Shigelloses
Cholra
Brucellose
Leptospirose
Borrlioses
Rickettsioses, typhus exanthmatique
Fivre Q
Gonococcie
Chancre mou
Chlamydioses
VIH-SIDA
Infection par HTLV
Hpatites virales
Poliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS,
Herps, varicelle, zona
CMV, EBV
Papillomaviroses
Dengue, Encphalite quine vnzulienne,
Hantavirus
Rage
Paludisme (surtout P.vivax)Protozooses
Helminthoses
Ambose
Gale
Tungose
Myiases
Maladie de Chagas
Leishmanioses cutanes, cutano-muqueuses et viscrales
Angiostrongylose
Histoplasmose amricaineCryptococcose
Sporotichose
Lobomycose
Coccidiodomycose
Paracoccidiodomy-cose
Basidiobolose
Myctomes
Teignes
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Epidmiologie des maladies infectieuses et tropicales. Sant internationale
pidmiologie des infections tropicales. Complexe pathogne tropical, pathologie gographique
Tableau 12. Pacifique sud
Bactries Virus Parasites Champignons
Tuberculose
Lpre
Syphilis
StreptococciesPneumococcies
Staphylococcies
Mningocoque
Ttanos
Diphtrie
Coqueluche
Fivre typhode
Salmonelloses non typhiques
Helicobacter pylori
Shigelloses
Brucellose
Leptospirose
Mliodose
VIH-SIDA
Infection par HTLV
Hpatites virales
Poliomylite, coxsackie, ECHO
Rougeole, grippe, VRS,
Herps
Varicelle, zona
CMV, EBV
Papillomaviroses
Dengue, Ross River (Australie)
Hantavirus
Rage
Paludisme
Protozooses
Helminthoses
Ambose
Gale
Myiases
Filarioses lymphatiquesLeishmanioses cutanes
Angiostrongylose
Histoplasmose amricaine
Cryptococcose
Sporotichose
Teignes
Sites web recommands concernant ce chapitre :
OMS :http://www.who.int/ith
CDC :http://www.cdc.gov/fre/
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Risques infectieux des voyages et des migrations entre pays tropicaux
1. Historique et typologie des migrations ; importance des migrations intertropicales
Les migrations humaines au cours de lhistoire ont t permanentes. Elles ont commenc ds le dbut de lhumanit puisque, partir de son berceau (probablement) de la valle du Rift, nos anctres dil y a 3 4mil-lions dannes se sont lentement dplacs vers le nord pour rejoindre les diffrents continents actuels. Lhis-toire plus rcente a galement connu des vagues de migrations massives : la fin de lempire romain puis les croisades au Moyen Age ont dplac des milliers de personnes travers lEurope et lAsie. Plus rcemment les possibilits de colonisation ont pouss les Europens vers les nouveaux mondes . Plus tard, dans la premire moiti du 20e sicle, des mouvements intra-europens se sont faits partir des pays dEurope du Sud les moins riches vers les plus riches. Parmi toutes les migrations, la plupart du temps forces par les contraintes du moment et rarement dsires, il en est une qui a eu des consquences incalculables dans les zones dorigine et dans les terres daccueil : il sagit de la traite des esclaves qui a entran le dplacement forc de quelques 20 millions de personnes lintrieur du continent africain puis des ctes africaines vers le continent amricain.
Beaucoup dexperts, et notamment le Haut Commissariat aux Rfugis, pensent que le 21e sicle sera le sicle des migrations en raison de la confluence des mcanismes poussant se dplacer, notamment lintrieur dun mme continent parfois dun mme pays. Ainsi, si les populations migrantes reprsentaient 2% du total mondial il y a 40 ans, elles en reprsentent maintenant 3 % (191 millions), ce qui correspond virtuellement au 5e pays du monde.
Les raisons qui poussent la migration sont principalement conomiques, lies des conflits (ethniques, religieux ou politiques) et, phnomne nouveau qui va se dvelopper dans les prochaines dcennies, la consquence des changements climatiques qui vont pousser des populations entires quitter leur terre en raison dinondations (lvation du niveau de la mer comme par exemple au Bengladesh ou dans beau-coup des zones ctires non montagneuses notamment des zones tropicales), de dsertification (accrois-sement de surface des grands dserts), de manque deau ou dappauvrissement extrme des sols en raison dune dforestation massive avec lessivage des sols. Ces volutions go-climatiques sont pourvoyeuses de conflits elles-mmes, sources de migrations (par exemple, la qute de leau lie lasschement du Jourdain est une des causes du conflit isralo-palestinien). Les mouvements de population ont donn lieu lorganisa-tion des migrs en diasporas qui jouent souvent un rle considrable par les liens conomiques quelles ont maintenu avec leur pays dorigine que ce soit en inter ou en intracontinental. Elles ont organis des rseaux commerciaux entre les diffrents pays o elles sont installes et le pays dorigine. Cest notamment le cas des Libanais en Afrique de lOuest ou des Indiens en Afrique de lEst. Ces liens rguliers jouent un rle mal valu mais probablement significatif dans la transmission et la diffusion de certains agents pathognes.
Aprs les migrants conomiques, les rfugis reprsentent probablement numriquement la deuxime population de migrants. Ces migrants forcs seraient 67 millions, si lon y inclut les 26 millions qui sont forcs se dplacer lintrieur de leur pays du fait de violences. Le reste se partage entre 16 millions qui quittent leur pays du fait de perscutions ou dune situation de violence gnralise et 25 millions du fait de catastrophes naturelles. Ces dplacements forcs souvent de grande ampleur et souvent un niveau sous-rgional sont relativement rcents puisquils taient pratiquement inconnus avant le vingtime sicle. Par exemple la partition de lInde a mis 15 millions de personnes sur les routes et le