Modélisation moléculaire

Les outils de la librairie de molécules

Un bref historiqueO 1989 : RasMolO 1998 : ChimeO 2002 : RasTopO 2004 : Librairie de moléculesO 2005 : Jmol remplace Chime dans la

librairieO 2007 : MinUSc et fichiers CIFO 2010 : Librairie interactive (clé

concours)O 2012 : Scribmol (construction de

molécules)

Quelles nouveautés ?O Types de données utilisables et donc

objets étudiablesO Traitements applicables aux

moléculesO Ergonomie des outils, conception

des logiciels (interface Homme/Machine)

O Nouvelles déterminations (veille scientifique)

O Structures minéralesO « Petites » moléculesO Cryo-microscopie

électronique 3DO Conservation de

séquences et autres annotations (domaines, localisation des membranes…)

Utiliser de nouvelles données

Réaliser de nouveaux traitements

O Superposer automatiquement des modèles

O Démonter des modèles

O Calculer des surfaces

O Déterminer les interactions non covalentes (hydrophobes,…)

Ergonomie et interfaces

O Visualiser les actions de l’utilisateur : sélection, survol d’un résidu, calcul en cours

O Conserver le travail réalisé : cacher au lieu de restreindre

O Garder le sens de l’orientation : centrer les rotations sur l’affichage

O Donner du sens : informer sur la signification des représentations (légendes, informations)

L’informatique dans le nuage

O Les applications sont disponibles en ligne : pas d’installation, utilisation hors les murs possible

O Les données utilisables et le travail réalisé sont stockés sur le serveur. Pas de manipulation de fichiers.

O Les documents sont échangeables entre utilisateurs

O Les statistiques informent en direct sur les usages